CONSANGUINIDAD Y DEPRESION ENDOGAMICA

Material de apoyo al Curso de Zootecnia

Elly Ana Navajas Diciembre 1996

INDICE Pgina I. II. INTRODUCCN .......................................................................................... 1 CONSANGUINIDAD Y SU CLCULO EN BASE A GENEALOGAS .......... 2 A. Definicin de consanguinidad ................................................................ 2 B. Clculos en base a la informacin genealgica....................................... 3 III. EFECTO DEL TAMAO POBLACIONAL SOBRE LA CONSANGUINIDAD. 3 A. Tamao poblacional y tasa de consanguinidad........................................ 4 B. Tamao efectivo de la poblacin................................................................ 6 1. Nmero de machos y hembras.............................................................. 7 EJEMPLO 1............................................................................................ 8 EJEMPLO 2...........................................................................................10 C. Tamao efectivo anual de la poblacin y tasa de consanguinidad anual...............................................................10 EJEMPLO 3..........................................................................................11 D. Otros factores que alejan a las poblaciones reales de las condiciones ideales...................................................................................................... 12 1. Tamao familiar.................................................................................. 12 2. Seleccin............................................................................................. 13 E. Sntesis..................................................................................................... 14 IV. CONSANGUINIDAD Y HOMOCIGOCIS ........................................................... 15 A. Tasa de consanguinidad ...........................................................................17 B. Sntesis......................................................................................................19 V. CONSECUENCIAS DEL INCREMENTO EN LA HOMOCIGOCIS POR CONSANGUINIDAD........................................................................................... 20 A. Genes letales y otras anormalidades ...................................................... 20 B. Efecto sobre las medias poblacionales.................................................... 20 C. Sntesis.................................................................................................... 24 VI. BIBLIOGRAFA CONSULTADA......................................................................... 25

I.

INTRODUCCIN

En la primera parte del curso de Zootecnia se ha puesto nfasis sobre el componente aditivo (A), en el cual se basa la seleccin. En la segunda parte de este curso cobran importancia los efectos genticos no aditivos (D + I), como base de otras dos estrategias de mejora gentica: la endocra o apareamiento entre individuos emparentados y exocra o cruzamientos. El cruzamiento entre animales emparentados o cra consangunea ha sido utilizado como intencionalmente en la cra animal con distintos objetivos. Un caso es su uso para mantener sus animales emparentados con aquellos que consideran de mayor valor, buscando el parecido entre padres e hijos lo cual es ms fcilmente lograble en caractersticas determinadas por pocos genes. Tambin ha sido empleada a nivel de la formacin de razas, con la intensin de fijas o uniformizar las caractersticas de la raza en cuestin. La cra consangunea a travs del proceso de diferenciacin de lneas o familias a partir de la poblacin original, ha sido utilizada para crear lneas dentro de razas buscando seleccionar entre lneas aprovechando las posibles diferencias en caracteres importantes que existan entre ellas. A nivel de la investigacin se gener una importante expectativa sobre la utilizacin de la consanguinidad como herramienta para crear diversidad gentica y sobre la utilizacin de dicha diversidad entre lneas endocriadas a travs del cruzamiento. Dickerson (1973) en su revisin sobre consanguinidad y heterosis, seala que no estaran claras las ventajas del cruzamiento entre lneas endocriadas, en relacin al cruzamiento de razas puras, dado los altos costos de desarrollar y probar lneas endocriadas. En las especies animales de inters productivo, como bovinos y ovinos, y a diferencia de lo que sucede en vegetales como el maz, la formacin de lneas endocriadas es un proceso lento y costoso. Por un lado debido a que resulta mucho ms caro mantener un animal que una planta, a lo que se agrega que muchas lneas se pierden debido a los efectos negativos de la consanguinidad. Adems alcanzar determinado grado de consanguinidad en animales lleva mucho ms tiempo debido a dos causas: el tipo de apareamiento posible en animales lleva a incrementos en consanguinidad menores por generacin de los que se puede lograr en vegetales a travs de la autofecundacin, el mayor intervalo generacional en animales.

Esto ha llevado a que la cra consangunea como estrategia de mejora gentica en bovinos ovinos haya perdido importancia en las ltimas dcadas. Dado los efectos negativos de la consanguinidad y su contraposicin con los objetivos buscados a travs de la seleccin, es un fenmeno que debemos tener presente y conocer, de manera de poder mantenerlo bajo control.

II.

CONSANGUINIDAD Y SU CCULO EN BASE A GENEALOGAS En este captulo se retomarn algunos puntos de la clase sobre PARENTESCO Y CONSANGUINIDAD, con el objetivo de rever algunos conceptos claves. A. Definicin de consanguinidad La consanguinidad es el resultado del apareamiento entre animales emparentados, es decir que posee por lo menos un antepasado comn y su magnitud es determinada a travs del coeficiente de consanguinidad. Como ya ha sido visto, el coeficiente de consanguinidad de un individuo X (Fx) es la probabilidad de que X en un locus determinado posea dos alelos idnticos por ascendencia. Se calcula en base a la siguiente expresin:

FX = (1/ 2) n1i + n 2i +1 (1 + FAi )

i =1
siendo : Fx el coeficiente de consanguinidad del individuo X n1 el nmero de generaciones entre el padre de X y el antecesor comn n2 el nmero de generaciones entre la madre de X y el antecesor comn FA la consanguinidad de cada antepasado comn Ai p nmero de vas La sumatoria corresponde a cada antepasado comn y cada va de conexin entre los padres de X y el antepasado comn. La expresin anterior, como fuera desarrollado en clases anteriores, es equivalente a: FX = 1/2.aBC siendo aBCel parentesco aditivo entre los padres de X, en este caso simbolizados como B y C. En la medida de que dos animales sean parientes comparten una proporcin de genes en comn que provienen del antepasado en comn. Como consecuencia del apareamiento entre parientes la progenie, que ser consangunea, tendr una mayor proporcin de genes idnticos que si sus padres no estn emparentados, lo cual lleva a una mayor homocigosis. B. Clculos en base a la informacin genealgica La informacin genealgica nos permite conocer para cada animal de una poblacin cuales fueron sus progenitores. En base a esta informacin podemos calcular el
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parentesco entre cualquier par de individuos y determinar la consanguinidad de cada animal, siendo ambas medidas relativas a la poblacin base, la cu al est generalmente definida por los animales ms antiguos de los cuales se carece de informacin sobre sus progenitores, y que por lo tanto asumimos no emparentados y de consanguinidad nula. La genealoga puede ser utilizada para calcular el coeficiente de consanguinidad en base a dos mtodos distintos. Uno de ellos es el diagrama de pasos. Este mtodo se basa en el trazado de eslabones entre los genes cuya probabilidad de ser idnticos por ascendencia se desea conocer y cada antecesor comn que exista en el rbol genealgico. Este mtodo, muy ilustrativo en casos sencillos, se vuelve muy engorroso en caso de genealogas complejas, ya que es necesario la identificacin de los antepasados comunes y la determinacin de los sucesivos pasos de mltiples cadenas. Esto hace muy complejo llevar adelante los clculos correspondientes. El segundo mtodo es el mtodo tabular, el cual se basa en el parentesco aditivo y en el cual se evita la identificacin de todas las vas de conexin para cada uno de los individuos. Esto lleva a que permite calcular el parentesco entre todos los animales en reproduccin y la consanguinidad de su progenie, con menor probabilidad de error. Dado el alto grado de sistematizacin de este mtodo, se han construido estrategias computacionales para su utilizacin. III. EFECTO DEL TAMAO POBLACIONAL SOBRE LA CONSANGUINDAD Al ser la consanguinidad el resultado del cruzamiento de animales emparentados, sta puede darse en cualquier rodeo independientemente del tamao del mismo, sea cerrado o abierto, si el criador aparea intencionalmente animales que son parientes entre s. Dado los efectos negativos de la consanguinidad en el comportamiento productivo podra pensarse adems en evitar la consanguinidad manejando el tipo de apareamiento a realizar. Pero si bien a travs del manejo del sistema de apareamiento en un rodeo cerrado se logra retardar la consanguinidad en el corto plazo y reducir la variabilidad del coeficiente de consanguinidad en la poblacin, en el largo plazo en poblaciones finitas resulta inevitable. Pero si se introducen animales de otro origen no relacionado, su progenie tendr consanguinidad nula recuperndose parte de la heterocigosis perdida. A. Tamao poblacional y tasa de consanguinidad No obstante, en trminos generales, restricciones en el tamao de las poblaciones o rodeos cerrados lleva a que sea mayor la probabilidad de que ocurran apareamientos entre parientes. Cuanto menor sea el nmero de progenitores mayor va a ser la tasa de consanguinidad.

La relacin entre la tasa de consanguinidad (DF) y el tamao de una poblacin, definida como ideal, que se compone de N individuos de cra es: F = 1/2N

Una poblacin ideal es una poblacin en la cual cualquier gameta tiene la misma probabilidad de unirse con cualquiera. Es decir que podramos definirla como una poblacin cerrada, sin inmigracin ni emigracin, compuesta por N individuos diploides que producen igual nmero de gametas cada uno y en el cual los apareamientos son al azar. Para deducir la expresin anterior consideramos las siguientes tres generaciones de una poblacin, segn se ilustra en el diagrama de la Figura 1. FIGURA 1 Generacin I Fl = 0 Abuelos Paternos Abuelas Abuelos Paternas Maternos Abuelas Maternas

Generacin II Fll = 0

Padres

Madres

Generacin III Flll = ???

Como puede observarse la generacin l est compuesta por los machos y hembras, que denominamos abuelos y abuelas maternas y paternas. Estos individuos darn origen a la generacin ll integradas por los padres y madres de la generacin lll. En base al rbol genealgico del diagrama podemos decir que no existen individuos consanguneos ni en la generacin l, ni en la ll. Es decir que la consanguinidad promedio de las generaciones l y ll ser nula La generacin lll est compuesta por un conjunto de individuos, denominados genricamente como Z. Para que un individuo cualquiera (Z) de la generacin lll sea consanguneo deber cumplirse que sus padres estn emparentados. Esto sera posible por dos formas: 1. que el abuelo materno y el abuelo paterno sean en realidad el mismo individuo. 2. que la abuela materna y la abuela paterna sean la misma hembra.

Consideraremos la primera alternativa. Supongamos que la generacin l est integrada por M nmero de machos. La probabilidad de que ambos abuelos sean el mismo macho est dada pro el producto de dos probabilidades: la probabilidad que el abuelo paterno sea un macho de la generacin l, cuyo valor es 1, y la probabilidad de que un macho tomado al azar de la generacin l (compuesta por un nmero M de machos) sea el mismo macho que el abuelo paterno, cuyo valor es 1/M. Es decir que la probabilidad de que el abuelo materno y paterno sea el mismo animal es: 1 x 1/M Si un individuo tiene un nico abuelo, es equivalente a decir que sus progenitores son medios hermanos. Si esto es as la consanguinidad de dicho individuo es 1/8. Fz = (1/2)n1 + n2 + 1 (1 + Fabuelo) Fz = (1/2)1 + 1 + 1 (1 + 0) = (1/2)3 = 1/8 La consanguinidad de Z estar dada por el coeficiente de consanguinidad suponiendo que el abuelo materno y el abuelo paterno son en realidad el mismo individuo, multiplicado por la probabilidad de ocurrencia del supuesto realizado, es decir que efectivamente el abuelo materno y abuelo paterno sea el mismo animal. Por lo tanto la consanguinidad de Z ser igual a: 1/8 x 1/M Si se realiza el mismo razonamiento para la alternativa de que Z sea consanguneo porque su abuela paterna y su abuela materna es la misma hembra, obtendremos que la consanguinidad de Z debido a esta alternativa ser: 1/8 x 1/H siendo H el nmero de hembras en la generacin l. Si consideramos las dos posibles vas por la cual un individuo Z cualquiera de la generacin lll pueda ser consanguneo obtenemos que el coeficiente de consanguinidad ser: Fz = 1/8M + 1/8H Como se haba indicado anteriormente la consanguinidad de la generacin ll es cero, por lo cual la tasa de consanguinidad (F) ser igual a: F = F lll F ll = 1/8M + 1/8H

Es decir que la tasa de consanguinidad es dependiente del nmero de machos y de hembras de la poblacin. Qu sucede si es una poblacin ideal ? Si suponemos que la poblacin considerada, con N nmero de reproductores totales, tiene igual nmero de machos y de hembras (condicin que cumple una poblacin ideal) podemos plantear las siguientes igualdades: M = nmero de machos = N/2 H = nmero de hembras = N/2 Sustituyendo en la expresin anterior obtenemos que la tasa de consanguinidad (F) es: F = 2/8N + 2/8H = 4/8N F = 1/2N (expresin 1)

Es decir que la tasa de consanguinidad en una poblacin ideal, con igual nmero de hembras y machos, se puede estimar con el nmero total de individuos en base a la expresin 1. B1. Tamao efectivo de la poblacin

En las poblaciones reales existe un alejamiento de la condicin de ideal, por lo cual la evaluacin del incremento de la consanguinidad en una poblacin requiere del tamao efectivo (Ne). Esta es una mejor medida que el nmero total de animales de cra como indicador de la tasa de consanguinidad de una poblacin El tamao efectivo de una poblacin es el nmero de individuos que determinara cierto incremento en consanguinidad, si la poblacin fuera ideal.

Por lo tanto, en una poblacin ideal su tamao efectivo (Ne) coincide con su tamao real (N). La relacin entre la variacin en la consanguinidad de una poblacin y su tamao efectivo es: F = 1/2Ne (expresin 2)

Es decir que el incremento de la consanguinidad promedio de una poblacin cerrada es el inverso del doble del tamao efectivo.

1. Nmero de machos y hembras La situacin comn en los rodeos, y que los aleja de la condicin ideal, es que el nmero de hembras y de machos no sea el mismo. Ello determina que la probabilidad de que se apareen parientes en un rodeo de 50 hembras y 50 machos, no sea la misma que en otro con solo un macho, aunque ambos tengan 100 individuos. Cmo calculamos Ne considerando que el nmero de machos no es igual al nmero de hembras? Lo que buscamos conocer es cuntos progenitores en total en una poblacin ideal producirn la misma tasa de consanguinidad con una poblacin con M machos y H hembras. Para ello debemos igualar las siguientes expresiones: F = 1/2N F = 1/8M + 1/8H Por lo tanto: 1/2N = 1/8M + 1/8H donde N es ahora el tamao efectivo, Ne. Operando con la igualdad anterior obtenemos que el tamao efectivo es igual a: Ne = 4 MH / (M + H) (expresin 3)

en la cual M y H son el nmero de machos y hembras usados por generacin, respectivamente. Siendo la tasa de consanguinidad inversa al doble del tamao efectivo se puede expresar como: F = M + H / (8 M H) (expresin 4)

La magnitud del tamao efectivo, y por lo tanto de la variacin en la consanguinidad, va a ser dependiente del sexo menos numeroso. A nivel de produccin el nmero de machos es mucho menor que el de hembras, por lo cual una buena aproximacin a la variacin de la consanguinidad se logra considerando solamente el nmero de machos. Es decir que la tasa de consanguinidad es equivalente a: F = 1/8M (aproximacin) (expresin 5)

EJEMPLO 1. Consideremos el Caso 1 del Cuadro 1, que se refiere a una poblacin compuesta por 100 reproductores en total e igual nmero de hembras (H) que de machos (M). Es decir que se cumple la siguiente relacin: M = H = N/2 = 50 Si calculamos el tamao efectivo (Ne), en base a la expresin 3, observamos que Ne es de 100 animales. Por lo tanto se cumple que el Ne es igual a N cuando el nmero de machos es igual al nmero de hembras, es decir cuando nos referimos a una poblacin ideal. La tasa de consanguinidad ser: F = 1/2 x 100 = 0.005 Si suponemos ahora que la poblacin tienen 100 individuos en total, pero que se utiliza aproximadamente un 4% de machos (Caso 2), tendremos que: M = 4 machos H = 96 hembras En esta situacin, en funcin de lo expuesto anteriormente, es necesario calcular el tamao efectivo para estimar la tasa de consanguinidad. En base a la expresin 3, el tamao efectivo es en este casi equivalente a: Ne = 4 x 4 x 96 / 4 + 96 = 15 y la tasa de consanguinidad ser: F = 1/2 x 15 = 0.03 A pesar de que la poblacin del Caso 2 est formada por 100 animales, dado el nmero de hembras y de machos su tamao efectivo es de 15 animales. Es decir, dada la estructura definida, la tasa de consanguinidad por generacin es equivalente a la que producira una poblacin ideal compuesta por 15 animales en total. Como puede observarse la tasa de consanguinidad estimada es superior en el caso 2 que en el 1

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Cuadro 1: Tamao efectivo y Tasa de Consanguinidad por generacin para tres poblaciones (Ejemplo 1) DESCRIPCION DE LA POBLACION Caso 1: H = 50 hembras M = 50 machos Caso 2: H = 96 hembras M = 4 machos Caso 3: H = 960 hembras M = 40 machos Caso 4: H = 980 hembras M = 20 machos Tamao efectivo Ne N = 100 animales 100 15 N = 1000 animales 154 78 Tasa de consanguinidad F 5.0 x 10-3 0.03

3.2 x 10-3 6.4 x 10-3

Tomemos ahora el Caso 3 del Cuadro 1, en el cual si bien se utiliza un 4% de machos, el nmero total de reproductores es de 1000 animales. Como puede observarse en Ne es mayor, y por lo tanto la tasa de consanguinidad menor, a la estimada en el Caso 2. En el Caso 4, a pesar de mantener el nmero total de reproductores incambiado en relacin al caso anterior la reduccin en el nmero de machos lleva a un importante descenso del tamao efectivo, con el consiguiente aumento en la tasa de consanguinidad. Como fuera desarrollado el tamao efectivo, podemos estimar la tasa de consanguinidad tomando en cuenta que las poblaciones reales no poseen igual nmero de hembras que de machos, condicin que si cumplen las poblaciones definidas como ideales. Los casos propuestos permiten visualizar que el Ne permite comparar poblaciones con diferentes estructuras en trminos e la tasa de consanguinidad esperada. EJEMPLO 2. Partamos ahora de que se quiere establecer un rodeo de una raza criolla en el cual se desea que la tasa de consanguinidad no supere el 0.005 por generacin. Por lo tanto en base a la expresin 2 podemos calcular que el tamao efectivo no puede superar los 100 animales, para poder cumplir con el objetivo planteado:

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0.005 = 1/2 x Ne Ne = 1/2 x 0.005 = 100 Consideremos dos situaciones: 1. que cuentan con 70 vacas de esta raza criolla 2. que se cuenta con 210 vacas criollas. Pero, cuntos machos se requieren para mantener el tamao efectivo en 100 animales? Utilizando la expresin 3 podemos llegar a la respuesta para ambas situaciones: 1. 100 = 3 x M x 70 / M + 70 100 M + 7000 = 280 M M = nmero de machos = 7000/180 = 39 2. 100 = 4 x M x 210 / M + 210 100 M + 21000 = 840 M

M = nmero de machos = 21000/740 = 28 C. Tamao efectivo anual de la poblacin y tasa de consanguinidad anual Las frmulas para el clculo de la tasa de consanguinidad y tamao efectivo que se han presentado hasta el momento son generacionales. Por lo tanto permiten calcular la tasa de consanguinidad por generacin. La tasa de consanguinidad anual, simbolizada como Fa es igual a: Fa = 1/2 Nea (expresin 6)

donde Nea es el tamao efectivo anual de la poblacin. Para calcular el tamao efectivo en trminos anuales debemos considerar en nmero de machos (m) y de hembras (h) que ingresan por ao a nuestra poblacin y el intervalo generacional promedio entre hembras y machos (IG): Nea = 4 m h IG2 / m + h (expresin 7)

Es decir que la tasa de consanguinidad anual puede expresarse directamente como: Fa = 1/8 m IG2 + 1/8 h IG2 (expresin 8)

donde m y h son las cantidades de padres y madres que se incorporan cada ao y IG es el intervalo generacional.

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En este caso tambin es vlida la estimacin aproximada a la tasa de consanguinidad, tomando en cuenta solamente los machos, por lo cual: Fa = 1/8 m IG2 EJEMPLO 3 Supongamos la siguiente estructura para un rodeo de 600 vacas, en el cual se utiliza un 3% de toros: Edad al parto 3 aos 4 aos 5 aos 6 aos 7 aos 8 aos Total Nmero de Vacas 100 100 100 100 100 100 600 Toros 2 aos 3 aos 4 aos Total 6 6 6 18 (aproximacin) (expresin 9)

En base a esta informacin sabemos que: m = nmero de machos que ingresan por ao es 6, h = nmero de hembras que ingresan por ao es 100. Adems podemos calcular el intervalo generacional promedio (IG): IGpromedio = (IG machos + IG hembras) / 2 = (5.5 + 3) / 2 = 4.25 Por lo tanto el Nea = 4 x 6 x 100 x (4.25)2 / (6 + 100) Nea = 409 animales La tasa de consanguinidad es fa = 1/2 x 409 Fa = 1.22 x 10-3 Al tiempo se decide modificar el porcentaje de machos, reducindolo a la mitad pero se conserva la misma estructura de edades. Por lo tanto tendremos : Toros 2 aos 3 aos 4 aos TOTAL 3 3 3 9

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Esta modificacin llevar a un cambio en el Nea: Nea = 4 x 3 x 100 x (4.25)2 / 3 + 100 Nea = 210 animales Esta reduccin en el tamao efectivo llevar a un aumento en la tasa de consanguinidad anual que pasar a ser: Fa = 1/2 x 210 = 2.4 x 10-3 Es decir que un uso ms intensivo de los machos, que desde el punto de vista de la mejora gentica permitira un mayor progreso, lleva a un incremento de la tasa de consanguinidad anual. D. Otros factores que alejan a las poblaciones reales de las condiciones ideales Existen en la realidad diversos factores que alejan a las poblaciones de las condiciones ideales. Uno de ellos es la existencia de distinta proporcin de machos y hembras, la cual ya fue descripta. A continuacin se desarrolla en forma breve el efecto del tamao familiar y la seleccin sobre el tamao efectivo. 1. Tamao familiar Otro elemento que resulta necesario tomar en cuenta en relacin al tamao efectivo y por lo tanto sobre la tasa de consanguinidad, es el efecto del tamao familiar. Bajo condiciones ideales se supone que cada padre tiene igual oportunidad de contribuir a la siguiente generacin. Sin embargo, el nmero de descendientes de cada padre que sobreviven para dejar descendientes puede variar en forma importante, ya sea por causas accidentales o por seleccin artificial. El tamao efectivo considerando este aspecto se calcula de la siguiente manera (Hill, 1979): Ne = 8N / VkM + VkH + 4 siendo VkM y VkH las varianzas del tamao familiar para machos y para hembras, respectivamente. Como puede deducirse de la expresin anterior, la existencia de diferencias entre los progenitores en su habilidad reproductiva llevar a un incremento en la varianza del tamao familiar y una reduccin en el tamao efectivo. Bajo un programa de seleccin, el nmero de descendientes de los distintos padres debe ser diferente, lo que hace que el tamao efectivo ser menor que el nmero de animales de cra existentes. Acorde con esto las frmulas de clculo del tamao efectivo y de la tasa de consanguinidad en base al nmero de hembras y machos de la poblacin, son vlidas en ausencia de seleccin direccional, es decir cuando los reemplazos son elegidos y
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apareados al azar. De no ser as, el tamao efectivo es en realidad menor, y en consecuencia se estara subestimando el incremento en la consanguinidad. 2.

Seleccin Pero la seleccin acta reduciendo el tamao efectivo de la poblacin ms all del descenso causado por los diferentes tamaos de progenie. Esto se debe a que la seleccin determina que la reproduccin est restringida a unos pocos animales los cuales pertenecen a unas pocas familias que descienden de unos pocos individuos superiores. Robertson (1961), citado por Pirchner (1969) y Lpez-Fanjul (1989), propuso la siguiente relacin entre el tamao actual (N) y el tamao efectivo (Ne) en presencia de seleccin: N / Ne = 1 + 4 it siendo i la intensidad de seleccin y t la correlacin interclase, la cual es funcin de la heredabilidad. Es decir que a un tamao actual dado, el tamao efectivo se ver ms reducido cuanto mayor sea la intensidad de seleccin aplicada y la heredabilidad de la caracterstica. Adems la utilizacin combinada de la informacin familiar lleva a seleccionar ms individuos de las mejores familias, sumndose este efecto en la reduccin del tamao poblacional. El uso eficiente de la informacin familiar a travs de los ndices de seleccin o de la metodologa BLUP lleva en consecuencia a reducciones considerables en el tamao poblacional. Esto adquiere mayor relevancia en la medida de que si bien permite aumentar el progreso gentico en el corto plazo, ste est asociado a aumentos en la consanguinidad. Como consecuencia la ganancia gentica en el largo plazo desciende ya que la consanguinidad lleva a reducciones en la supervivencia y a prdidas en la variacin gentica. E. Sntesis En sntesis la tasa de consanguinidad en poblaciones cerradas es dependiente del tamao poblacional ya que la probabilidad de ocurrencia del apareamiento entre parientes es mayor cuento menos numerosa es la poblacin. El tamao efectivo permite predecir la tasa de consanguinidad promedio de una poblacin, considerando el clculo del mismo las condiciones que la alejan de las condiciones ideales. La tasa de consanguinidad es inversa el doble del tamao efectivo de una poblacin. A efectos de este curso ha sido desarrollado principalmente el efecto de diferentes proporciones de hembras y machos, y se ha descrito en forma ms general la influencia de distintos tamaos familiares y de la seleccin. Como fuera sealado la seleccin reduce el tamao efectivo, lo cual lleva a mayores niveles de consanguinidad. Esto, como se ver ms adelante, repercute en el progreso gentico a obtener. En consecuencia en los ltimos aos se han desarrollado estudios tericos sobre el diseo de programas de seleccin que

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permitan maximizar la respuesta a la seleccin, minimizando la tasa de consanguinidad.

IV.

CONSANGUINIDAD Y HOMOCIGOSIS

El principal efecto de la consanguinidad es aumentar la probabilidad de que un determinado individuo herede el mismo material gentico del padre y de la madre. Es decir, que si un individuo posee genes iguales por ascendencia en un locus ser homocigota para ese locus. La consanguinidad entonces tender a aumentar la homocigosis par ese locus, siendo el coeficiente de consanguinidad reflejo de la misma. Pero, cabe aclarar que el coeficiente de consanguinidad no mide la homocigosis en trminos absolutos. Permite si cuantificar el grado en que un individuo es menos heterocigota que aquellos con consanguinidad igual a cero. Si in individuo tiene coeficiente de consanguinidad cero implica que tiene el mismo nivel de heterocigosis que los integrantes de la poblacin base. Si el coeficiente de consanguinidad de un segundo animal es 0.3, quiere decir que es 30% menos heterocigoto que el individuo cuyo coeficiente de consanguinidad era nulo. Se desprende de lo dicho anteriormente que la consanguinidad permite compara los niveles de heterocigosis entre individuos cuya genealoga pueden seguirse hacia la misma poblacin base. En trminos poblacionales, si partimos de una poblacin base que tiene 50% de heterocigosis, un valor promedio de consanguinidad de 0.20 en una determinada generacin implica que un 20% de los loci que se encontraban en estado heterocigota en la poblacin base, han pasado a ser homocigota. La consanguinidad en poblaciones grandes no altera las frecuencias gnicas pero modifica las frecuencias genotpicas, al aumentar la frecuencia de los homocigotas y en contrapartida reduce la frecuencia de heterocigotas. El caso ms sencillo para visualizar este fenmeno es el caso de la autofecundacin, considerando lo que sucede en un locus y dos alelos (A, a) (Cuadro 2). En el ejemplo del Cuadro 2, se parte de una poblacin compuesta por 1000 individuos heterocigotas. Es decir que en la poblacin base el porcentaje de heterocigotas es de 100%, siendo la frecuencia de ambos alelos, A (p) y a (q) (Cuadro 2).

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Cuadro 2: Modificacin de la estructura genotpica de una poblacin apareamientos consanguneos (un locus con dos alelos, autofecundacin). Cantidad de individuos segn Genotipo AA Aa aa 1000 250 500 250 375 250 375 413 175 413 . . . 500 0 500 Frecuencia genotipos homocigotas 0 0.50 0.75 0.85 . 1 Frecuencia genotipos heterocigotas 1 0.50 0.25 0.125 . 0 Frecuencias gnicas p q 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 . . 0.5 0.5

Generacin 0 1 2 3 . 6

Por autofecundacin, la descendencia resultante (generacin l) estar integrada por 250 individuos AA, 250 individuos aa, y 500 que son Aa. Por lo tanto, el porcentaje de genotipos heterocigotas y de homocigotas es del 50%. Es decir que se observa una reduccin de los heterocigotas a una tasa de 0.5 (F), con aumento en los homocigotas a la misma tasa. La mitad de estos genotipos homocigotas son AA y la otra mitad aa. Este proceso se mantiene generacin a generacin, observndose una reduccin de los genotipos heterocigotas y un incremento e aquellos que son homocigotas. Si observamos las frecuencias gnicas, stas ha n permanecido sin modificaciones, siendo en todas las generaciones de 0.5 para ambos alelos. En la sexta generacin la poblacin ha quedado compuesta solamente por genotipos homocigotas, de los cuales el 50% son dominantes y el otro 50% recesivos. En funcin de la consanguinidad (F), y conociendo las frecuencias gnicas iniciales en una poblacin base en equilibrio Hardy-Weimberg, podemos expresar la frecuencia de los genotipos como se plantea a continuacin: Frecuencias en una Generacin con Consanguinidad F Frecuencia en Cambio por Poblacin base consanguinidad p2 2pq q2 +pqF -2pqF +pqF

Genotipos AA Aa aa

Como se haba visto la consanguinidad lleva a una reduccin en la proporcin de los genotipos heterocigotas. El trmino 2pqF representa la magnitud de dicha reduccin, la cual depender del nivel d consanguinidad (F).

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El incremento de los homocigotas (AA y aa) es de la misma magnitud que la reduccin de los heterocigotas (+2pqF). Sin embargo como se haba ejemplificado anteriormente (ver Cuadros 1 y 2), la mitad son AA y la otra mitad aa. A. Tasa de Consanguinidad La tasa de consanguinidad (F) nos permite calcular el coeficiente de consanguinidad de una generacin cualquiera. Como se sealara anteriormente este coeficiente nos indica el incremento en homocigosis en relacin a la poblacin base. Sin embargo la homocigosis en una generacin no es proporcional a F. Esto se debe a que el incremento de homocigotas existentes en la generacin anterior. Tomemos nuevamente el ejemplo de la autofecundacin (pero ver ahora el Cuadro 3). Partimos de una poblacin base (G0) integrada por heterocigotas, en la cual el coeficiente de consanguinidad es cero. Dado que el sistema de apareamiento considerado es la autofecundacin, la F es de 0.5. El nivel de homocigosis de la generacin 1 ser 0.5 de la proporcin de heterocigotas de la generacin anterior que es del 100%. Es decir que en la primera generacin el F ser de 0.5, lo cual nos indica que tendremos un incremento del 50% de homocigotas en relacin al nivel existente en la poblacin base, desde un punto de vista de los heterocigotas una reduccin del50%. El incremento de homocigotas entre la generacin 1 y 2 estar dada por el producto entre la tasa de consanguinidad y la proporcin de heterocigotas presentes en la generacin 1: F2 F1 = F (1 F1) donde 1 F1 representa la proporcin de heterocigotas existentes en la generacin 1. Por lo tanto el producto F (1 F1), nos indica la proporcin adicional de individuos homocigotas que tendremos en la generacin 2: F (1 F1) = 0.5 (1 0.5) = 0.25 Entonces la generacin 2 tendr un 25% ms de individuos homocigotas en relacin a la generacin anterior.

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Cuadro 3: Consanguinidad por generacin en una poblacin con autofecundacin (F = 0.5). Generacin 1 0 1 1 0.5 Proporcin 0 0 0.5 Consanguinidad por generacin F = 0.5 F0 = 0 F1 - F0 = F(1-0) = F = 0.5 F1 = 0.5 F2 - F1 = F(1-F1) = 0.5 (1-0.5) = 0.25 F2 = 0.25 + 0.5=0.75 F3 - F2 = F(1-F2) = 0.5(1-0.75) = 0.125 F3 = 0.75+0.125 = 0.875

0.25

0.75

0.125

0.875

F6-F5 = F(1-F5) = 0.5(1-0.969) = 0.0155 F6 = 0.969+0.0155 1

La consanguinidad de la generacin 2 (F2) estar dada por la consanguinidad en la generacin anterior ms la proporcin adicional de individuos consanguneos: F2 = F (1 F1) + F1 Para el caso particular de este ejemplo F2 es 0.75: F2 = 0.5 (1 0.5) + 0.5 = 0.75 Es decir que la poblacin en la generacin 2, hay un incremento en la homocigosis del 75% en relacin a la poblacin base. En trminos generales entonces podemos calcular el coeficiente de consanguinidad de una generacin t (F1) en relacin a la consanguinidad de la generacin anterior t-1 (Ft1) en base a la expresin: Ft = F (1 Ft-1) + Ft-1 El aumento de los homocigotas o tasa de consanguinidad (F) depende del parentesco entre los animales, siendo mayor cuanto ms emparentados sean los individuos que se crucen.

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En caso extremo es el de la autofecundacin, en el cual la reduccin de los heterocigotas es a una tasa de 0.5 por generacin. En el caso de apareamientos sistemticos entre hermanos enteros y medios hermanos la tasa de consanguinidad es 0.25 y 0.125, respectivamente (Cuadro 4). Cuadro 4: Evolucin consanguneos. de la consanguinidad entre tipos de apareamientos

Generacin 1 2 3 4 5

Auto-fecundacin 0.500 0.750 0.875 0.938 0.969

Tipo de parentesco Hermanos enteros 0.250 0.375 0.500 0.594 0.674

Medio hermanos 0.125 0.219 0.395 0.381 0.449

Como puede observarse la evolucin en la consanguinidad esperada por generacin es ms lenta al disminuir la tasa de consanguinidad. A menor parentesco la homocigosis aumenta ms lentamente, por lo tanto la homocigosis total se logra en generaciones ms avanzadas. Como se sealara la tasa de consanguinidad nos permite cuantificar en trminos relativos el incremento en los niveles de homocigosis. Se refiere siempre a la poblacin base de la cual se parte. Esto es vlido tanto al analizar la evolucin de la consanguinidad promedio calculada en base a la informacin genealgica, o en base al tamao efectivo. La heterocigosis perdida por consanguinidad no puede ser recuperar si los apareamientos son dentro de la misma poblacin. Puede ser aumentada solamente por la introduccin de individuos de afuera de la poblacin, es decir por outcrossing. B. Sntesis La consanguinidad lleva una reduccin de los genotipos heterocigotas y a un incremento en aquellos homocigotas, sin afectar las frecuencias gnicas en el caso de poblaciones grandes. La tasa de consanguinidad (F) nos indica el aumento en consanguinidad en una generacin en proporcin del grado de heterocigosis presente en la generacin anterior. La tasa de consanguinidad depende del grado de parentesco entre los animales, siendo ms lento el incremento en homocigosis a menor parentesco. El incremento de los homocigotas, o disminucin de heterocigotas es relativo a la poblacin base siendo esto cierto tanto al analizar la evolucin de la consanguinidad promedio en base a la genealgica, o en base al tamao efectivo.

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V CONSECUENCIAS CONSANGUINIDAD

DEL

INCREMENTO

EN

LA

HOMOCIGOSIS

POR

El aumento de la homocigosis, como resultado del apareamiento entre parientes. se refleja en distintas formas. A continuacin se tratarn dos de ellas. A. Genes letales y otras anormalidades Al aumentar la frecuencia de los homocigotas la consanguinidad permite la expresin fenotpica de genes que producen distintos tipos de anormalidades y que incluso pueden determinar la muerte. Estos genes son en general recesivos, y suelen estar encubiertos por sus alelos dominantes. Los genes que determinan la muerte del feto durante la preez o al nacimiento, son denominados letales. Los genes semiletales o subletales son aquellos que producen la muerte poco tiempo despus del nacimiento, a edades jvenes. Adems existe un tercer tipo de genes llamados perjudiciales que son los que producen alteraciones que reducen el vigor y la viabilidad de los animales. Tomemos el ejemplo desarrollado por Van Vleck (1993), para el caso de la malformacin denominada Pata de Mula. Asumiendo que la frecuencia del gen recesivo para est malformacin es q = 1/100, en una poblacin bajo equilibrio HardyWeimberg, la frecuencia de genotipos que presente este defecto sera q2 + pqF. Por lo tanto en las condiciones planteadas, la frecuencia de homocigotas recesivos es: (0.01)2 + (0.01)(0.99)0,25 = 2.6 x 10-3. Es decir que la probabilidad de tener un ternero con pata de mula a partir del apareamiento entre hermanos enteros es 26 veces mayor. B. Efecto sobre las medias poblacionales El aumento de la homocigosis lleva al descenso de las medias poblacionales para distintas caractersticas, aunque no todas son afectadas en la misma magnitud. Esto queda de manifiesto a travs de las reducciones de la capacidad reproductiva, as como en la eficiencia fisiolgica y productiva de los individuos. Esta disminucin en rendimiento es tambin llamada depresin endogmica. Este fenmeno se da para caracteres afectados por dominancia y sobredominancia, es decir en los cuales el valor del heterocigota sea mayor que el punto medio entre los dos homocigotas. La media genotpica de una poblacin se puede calcular a travs de la sumatoria de los productos entre el valor y la frecuencia de los distintos genotipos. Se considera un para de alelos A y a, cuyas frecuencias son p y q. Los valores de los genotipos, expresados como desvos del valor medio entre los dos homocigotas, se presentan a continuacin en una recta:

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aa -a

Aa 0 d

AA +a

En el Cuadro 5 se presentan las frecuencias y los valores genotpicos en una poblacin con coeficiente de consanguinidad F, considerando el par de alelos A y a. Se puede comprobar observando el Cuadro 5 que las nuevas frecuencias de los genotipos AA y aa estn dadas por la frecuencia original ms la mitad de la reduccin de los heterocigotas. Para el genotipo Aa la reduccin de la frecuencia ser funcin de la frecuencia inicial y del valor del coeficiente de consanguinidad. Cuadro 5: Cambios de las frecuencias genotpicas debido a la consanguinidad. Genotipos AA Aa aa Frecuencia + Cambio por consanguinidad p2 2pq q2 + + pqF 2pqF pqF Valor Genotpico +a d -a

La media en una poblacin consangunea (MF) para una caracterstica determinada por un par de alelos es: MF = a (p2 + Fpq) + 2pqd (1 F) a (q2 + Fpq) MF = a (p-q) + 2pqd (1 F) La media de la poblacin no consangunea (MO) es equivalente a: MO = a(p-q) + 2dpq entonces la media de la poblacin consangunea tambin se puede expresar como: MF = MO 2dpqF En el caso de una caracterstica determinada por varios loci (sin efectos epistticos), para calcular la media de la poblacin con consanguinidad F se debe tomar en cuenta el aporte de cada uno de los loci, es decir: MF = MO 2Fdpq siendo : MF MO F d la media de la poblacin bajo consanguinidad la media de la poblacin inicial la sumatoria de la contribucin de cada uno de los loci el coeficiente de consanguinidad el desvo de la dominancia

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p q

la frecuencia del gen dominante la frecuencia del gen recesivo.

La magnitud del cambio de la media consangunea, respecto a la poblacin original est dada por le expresin 2Fdpq . Por lo tanto la reduccin de la media poblacional o reduccin endogmica depende de:

nivel de consanguinidad de la poblacin, expresado por el coeficiente de consanguinidad (F). las frecuencias gnicas iniciales de la poblacin, por lo cual la magnitud de la depresin endogmica puede variar entre poblaciones para una caracterstica determinada y a un nivel dado de F. La depresin ser mxima, con los dems factores constantes, cuando el producto pxq sea mximo lo cual se cumple cuando p = q = 0.5. Esto indica que la depresin ser mxima cuando los niveles de heterocigosis de la poblacin base son mximos. la magnitud de los desvos de dominancia, debiendo existir dominancia direccional en las caractersticas determinadas por ms de un locus, es decir que la dominancia en los loci tenga una direccin predominante. En el caso de que en una caracterstica determinada los valores de d para los distintos loci involucrados se cancelen (d = 0), se puede deducir que aunque exista consanguinidad, la depresin endogmica para esa caracterstica ser nula. Lo mismo, en el caso de un locus si el valor genotpico del heterocigota es el promedio de los valores de los homocigotas (d = 0).

Los cambios en la media de una poblacin consangunea varan de acuerdo al tipo de accin gnica en la caracterstica que se trate. Si la accin gnica es aditiva con o sin interaccin episttica el valor de la media global no se ver modificada con la consanguinidad. Pero si al menos uno de los loci muestra accin gnica del tipo dominante con o sin interacciones epistticas (aditiva x aditiva, aditiva x dominante, etc.) la media global cambia linealmente con el valor de F. Esto implica que la depresin por consanguinidad no tiene la misma magnitud para las diferentes caractersticas, siendo mayor para las que presenten mayores desvos por dominancia. En trminos generales en caracteres de menor heredabilidad, en los cuales los componentes de dominancia y epistasis tienen mayor importancia, la depresin endogmica es mayor. Pero este tipo de relaciones entre comportamiento y nivel de consanguinidad es vlido en ausencia de seleccin contra aquellos de peor comportamiento que sern los ms consanguneos. Si los individuos homocigotas ven reducidos su comportamiento productivo, no sern seleccionados como padres para la siguiente generacin o su contribucin ser menor a la de los heterocigotas. Esto lleva a que la homocigosis real sea menor a la estimada por el coeficiente de consanguinidad (F) en base a la informacin de pedigr o el tamao poblacional, por lo cual el efecto de la consanguinidad puede ser subestimado. Adems sise descartan animales por la presencia de defectos o por su bajo comportamiento, el nivel de productividad de los que permanecen pueden no ser

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representativo de la poblacin consangunea, lo cual afectara la estimacin de la depresin por consanguinidad. Sin embargo, la depresin endogmica puede ser uno de los principales factores en reducir la respuesta a la seleccin. Tomemos un rodeo cerrado de ganado de carne en el cual se ha definido un plan de mejora gentica por seleccin con el objetivo de aumentar el peso al destete. La estructura de dicho rodeo es la definida en el Ejemplo 2 (pgina), compuesto por 600 vientres y en el cual se utiliza 1.5% de toros. El porcentaje de destete en este rodeo es de 75%. Sabiendo que la heredabilidad para peso al destete es de 0.30 y su desvo fenotpico de 18kg, podemos calcular el progreso gentico anual esperado: proporcin de seleccin de machos: 3 / 225 = 0.01, entonces la intensidad de seleccin en machos es 2.663. proporcin de seleccin de hembras: 100 / 225 = 0.44, entonces la intensidad de seleccin en hembras es 0.896. la intensidad de seleccin promedio es 1.78. Progreso gentico anual esperado : 1.78 x 0.3 x 18/4.25 = 2.26kg. En base a lo calculado en el Ejemplo 3, la tasa de consanguinidad en dicho rodeo es de 2.4 x 10-3. Un reciente trabajo estim que la depresin endogmica en peso al destete es de 0.5 kg/ 1%F. Es decir que en este rodeo cabra esperar una reduccin en la media de peso al destete de: (2.4 x 10-3) x 100 x 0.5 = 0.12 kg Esta reduccin en la media de la poblacin se opone al cambio deseado por seleccin, por lo tanto el progreso gentico real va a ser menor al estimado. En este caso hipottico el progreso gentico neto ser: 2.26 0.12 = 2.14kg. Esto hace necesario tomar en cuenta la consanguinidad como forma de minimizar las prdidas en progreso gentico ocasionadas por la depresin endogmica. C. Sntesis El aumento en homocigosis causado por la consanguinidad incrementa la expresin de genes deletreos recesivos. La reduccin de la proporcin de los genotipos heterocigotas, o aumento de los homocigotas, explica la reduccin de la media gentica de una poblacin bajo consanguinidad. La depresin endogmica es la reduccin de la media poblacional de una caracterstica por consanguinidad. La depresin por consanguinidad vara segn la caracterstica, dependiendo del tipo de accin gnica de la misma. Se da en caracteres afectados por dominancia, siendo mayor a mayor valor de d. En trminos generales aquellas caractersticas con baja heredabilidad presentan mayores depresiones por consanguinidad. En cambio en la media depende del nivel de consanguinidad, cambiando linealmente con el coeficiente de consanguinidad (F).

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Considerando una caracterstica y un nivel de F, la depresin endogmica variar segn la poblacin. La depresin endogmica se opone a los objetivos de la seleccin, siendo uno de los principales factores que reducen la respuesta a la seleccin. Esto se debe tanto a la influencia sobre las caractersticas que deseamos mejorar genticamente, como a su efecto negativo sobre reproduccin y sobrevivencia.

V.

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