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polignica
Abril 2013
Los caracteres complejos son variantes entre los individuos en la secuencia del DNA, los cuales contribuyen entre otras cosas a la susceptibilidad a enfermedades, manifestaciones clnicas o respuesta a una terapia. Sin embargo los mecanismos que controlan la expresin de un fenotipo adems se ser variantes en secuencia, tambin participan en la expresin de genes por medio de: - Modificacin a las histonas - Micro RNAs - Modificaciones postraduccionales -Secuencias no codificantes largas - Epigentica -Variantes de corte y empalme -Factores ambientales
Una porcin importante de la variacin en la secuencia del DNA entre los Individuos es debido a diferencias en un slo nucletido. Estas diferencias son los SNPs. Los Genome-wide association studies exploran el genoma en busca de SNPs que sean comunes en una poblacin en particular que posee una caracterstica por ejemplo: una enfermedad.
3.2 X 109
23500
4 X 106
3.5 X 106 10000 103 - 105 50-100 30
Variantes de novo
SVs: deleciones, inserciones, duplicaciones y rearreglos de fragmentos grandes de DN A que pueden incrementar o disminuir el nmero de copias de genes ( CN Vs) .
LA ESTATURA ES UNA DE LAS CARACTERSTICAS VISIBLES HUMANAS FACIL DE MEDIR CON PRESICIN
Los varones Duch han incrementado su estatura ms de 20 cm en 150 aos. Este hecho demuestra que existen factores no genticos que influyen la estatura. Anteriormente se pensaba que la estatura se deba en un 60 a 80 % a factores genticos mientras que el 20 al 40 se poda atribuir a factores ambientales, principalmente la nutricin de la variacin se debe a diferencias genticas.
En estudios de GWAS se han identificado un total de 180 variantes genticas que podran influenciar la estatura. La estatura de un individuo es el resultado de procesos de crecimiento y desarrollo y no slo el incremento en la longitud del hueso.
A t ravs de est udios de GWA S se han asociado 4 4 genes en la det erminacin de la est at ura y se pueden agrupar en :
a) Transduccin de seal: genes import ant es para el crecimient o del esquelet o y desarrollo. La mayora act an en la placa de crecimient o ( e cart lago en el ex t remo del hueso) : I HH ( indian hedgehog) , PTCH1 ( pat ched 1 ) y HHI P ( hedge int eract ing prot ein) . b) Prot enas morfognicas del hueso: BM P2 ,BM P6 y GDF5 y sus reguladores.
c) Component es de la mat riz ex t racelular : - A grecn: prot eoglicano component e est ruct ural del cart lago. - Prot enas est abilizadoras de la ECM : fibulina 5 y fibulina 3 que se unen a: a) Fibras elst icas. b) M embranas basales. c) Component es t urnover de la mat riz. d) Est ruct ura de la cromat ina y regulacin: - DOT1 -lik e: hist ona met il t ransfersa. - Sex comb. - Prot enas no hist onas involucradas en remodelacin de cromat ina.
e) Genes de la regulacin del ciclo celular y la mit osis - CDK6 : cinasa dependient e de ciclina, G1 M. - CDK5 y A bl ( CA BLES1 prot ena que se une a CDKs) . - Complejo I promot or de anafase ( A N A PC1 3 ) . - Subunidad reguladora del complejo de la condensina ( N CA PG) . Se requiere para la condensacin de los cromosomas despus de int erfase. f) Represores t ranscripcionales
Regulador
Las regiones rojas y rosas representan bandas que se han ligado con la estatura en estudios de ligamiento de todo el genoma. Las lneas azules representan loci que se han asociado de GWAS
SNP
Crom
Gen
Patologa
El estudio del color de los ojos humanos como una caracterstica fsica se basa en el desarrollo, morfologa, qumica y genes que regulan una estructura conocida como iris. El iris caf tiene melanocitos abundantes y melanina en la capa del borde anterior y en el estroma mientras que el iris azul contiene muy poca melanina.
Cuando la luz atraviesa estas capas relativamente libres de melanina, las fibras de colgena de la superficie reflejan las longitudes de onda corta azules hacia la superficie.
SNPs
CNV/SV
Micro RNAs
Medio externo
Modificaciones al DNA
Un fenotipo complejo
Modificaciones postraduccionales