ASAM AMINO,

PROTEIN
&
ASAM NUKLEAT
Kuliah Biomedik 1
Fakultas Kedokteran
Universitas Tarumanagara
MAKANAN NORMAL



campuran kompleks
bahan-bahan tumbuhan dan
binatang

PROTEIN, LEMAK,
KARBOHIDRAT
DEFINISI
PROTEIN PROTEIOS
Il
Pertama
POLIAMIDA

Asam-asam amino = 20 macam

STRUKTUR UMUM
H
2
N CH C
R
OH
O
H
2
N CH
C
R
OH
O
+
H
3
N CH C
R
O
-
O
ION DIPOLAR
ZWITTER ION
RANTAI SAMPING
R = alifatik gly, ala, val, leu, ile, pro
R = hidrosiklik ser, thr
R = aromatik phe, tyr, trp
R = asam asp, glu
R = amida asn, gln
R = basa lys, arg, his
R = mengand. S cys, met
KONFIGURASI
ALANIN = ALA

CH
3
C
NH
3

+
COO
-
H
pKa =
pKb =
2,3
9,7
H
COOH C
NH
3

+
CH
3
OH
-
H
+
H
COO
-
C
NH
3

+
CH
3
OH
-
H
+
H
COO
-
C
NH
2

CH
3
2,3 9,7
+ 1 0 -1


pI = ( 2,3 + 9,7) = 6
ASAM AMINO PROTEIN
- ALANIN m/ Co Enzym A (asetilasa)
d/ as, pantotenat vitamin
C C CO
2
-


NH
3
+
TAURIN t.d/ sel, terikat pd as. Empedu
C C SO
3
-
diturunkan dari sistein
TAURO CHOLAT
NH
3
+

ASAM AMINO PROTEIN
As. g - AMINO BUTIRAT (GABA)
C C C CO
2
-
m/ decarboksilasi A.
GLUTAMAT
NH
3
+
d/ jar. Otak, ragi, bakteri

As. g - AMINO ISO BUTIRAT m/ hasil
H
3
N
+
C C CO
2
-
katabolisme pirimidin d/ otot tnt

CH
3

Penentuan a.a.
kromatografi daya partisi a.a terhadap
fasa diam dan fasa gerak
mikrobiologi mikroorganisme
kolorimetri perband. warna p. suatu Rx.

REAKSI WARNA


Rx warna asam amino
NAMA PEREAKSI a.a. WARNA
NIN-HIDRIN Nin-hidrin Ungu
Ruheman
NITRO
PRUSID
Na-nitroprusid/
NH
4
OH
encer

SISTEIN Merah
HOPKINS-
COLE
As. glioksilat/
H
2
SO
4

TRIPTOFAN Ungu
MILLON HgNO
3
/ HNO
3
TIROSIN Merah
KSANTO
PROTEIN
HONO
2

pekat
Tir, trp, phe
(inti benzen)
Kuning
SAKAGUCHI Alfa-naftol + Na-
hipoklorit
ARGININ Merah
SULLIVAN Na-naftokuinon-
1,2-sulfonat-4
SISTEIN Merah
Rx warna asam amino
NAMA PEREAKSI a.a. WARNA
SULLIVAN Na-naftokuinon-
1,2-sulfonat-4
SISTEIN Merah
PAULY Na-hipoklorit,
As.Sulfanilat yang
didiazokan d. basa
TIROSIN
HISTIDIN
Merah
EHRLICH p-dime-amino-
benzaldehid/ HCl
12N
TRIPTOFAN Biru
FOLIN-
CASCALTEU
As. fosfomolibdo-
tungstat
TIROSIN Merah
PEPTIDA

H
2
N CH C
R
1
OH
O
H
2
N CH C
R
2
OH
O
+
a.a.
1
a.a
2
H
2
N CH C
R
1
O
H
N
CH C
R
2
OH
O
Residu N
Ikatan
peptida
Residu C
TATA NAMA
INA IL
Dari ujung kiri kanan, atau ujung C
ujung C

Glutation = - glutamil sisteil glisin
Glu - cys - gly
TRF = piroglutamil-histidil-prolinamida
N
H
CH C
CH
2
O
H
2
C
C O HN CH C
CH
2
O
N
NH
N
C
NH
2
O
PENENTUAN STRUKTUR
PEPTIDA
JENIS DAN BANYAK ASAM AMINO
(AMINO ACID ANALYZER).
URUTAN ASAM AMINO
ANALISIS RESIDU UJUNG N
1. PEREAKSI SANGER 2,4-
DINITROFLUOROBENZEN (DNP)
FLUORO BEREAKSI DENGAN
GUGUS NH
2
PADA RANTAI
2. PEREAKSI EDMAN FENIL
ISOTIOSIANAT
PENANDAAN DAN PEMBEBASAN AA
UJUNG N HETEROSIKLIK
FENILTIOHIDANTOIN + A A BERIKUT

PEMUTUS POLIPEPTIDA SPESIFIK
ENZIM PROTEOLITIK
ENZIM PROTEOLITIK
No
.
PEREAKSI SISI PEMUTUS
1. KIMOTRIPSIN Phe, Tyr, Trp
2. PEPSIN Tyr, Phe, Trp
3. TERMOLISIN Ile, Leu, Val
4. TRIPSIN Lys, Arg
5. SIANOGEN BROMIDA (CNBr) Met
6. KARBOKSI PEPTIDASE ASAM AMINO
UJUNG C
PROTEIN POLIAMIDA PEPTIDA
PROTEIN POLIAMIDA PEPTIDA
> 100 a.a. < 100 a.a.

H2O
a. a.a. Prot. Sederhana
a.a. + bukan a.a. Prot. Majemuk

hem, k.h., l, as. nukleat

SIFAT-SIFAT PROTEIN
1. LARUT DENATURASI
BER (-) KELARUTAN
HILANGNYA KEAKTIFAN ENZIM,
HORMON
# DIHABLURKAN KEMBALI


PERUB. STR.
PEMECAHAN IKATAN

KOAGULASI DENATURASI PERMANEN
SIFAT-SIFAT PROTEIN
2. KOLOID HIDROFIL
( -NH2, -COOH, -OH )


3. AMFOTER

4. PROTEIN (-) mengikat KATION
PROTEIN (+) mengikat ANION
5. BERDIALISIS


6. Rx. PRESIPITASI:
As. Mineral <<< mengendap, >>> larut
Basa H2O mengendap
Pereaksi alkaloid mengendap. Bila pH = pI
(trikloro asetat, as. tanat, dll)
garam dr. logam berat, mengendap tgt. PH, suhu,
e-lit
alkohol, mengendap, >>> efektif pada pI
pemanasan koagulasi # larut
suhu eff. 38 oC - 75 oC

KLASIFIKASI PROTEIN TUGAS
a. PROTEIN SERAT pembentuk otot, kulit, rambut,
(Fibrous protein) dinding pembuluh darah,
tdd. Molekul yang panjang, erat
dan larut

Contoh:
Kolagen jar. Penyambung kaya OH-prolin
Elastin urat & pembuluh darah
Keratin rambut, kuku, bulu burung kaya sistein & sistin
KLASIFIKASI PROTEIN TUGAS
b. PROTEIN GLOBULAR melakukan berbagai fungsi
(tipe fungsional) larut d. air

Contoh:
Hb pembawa oksigen ke sel
Insulin berperan dalam metabolisme karbohidrat
Antibodi membentuk protein asing menjadi tidak aktif
Fibrinogen memb. serat2 tdk larut yg menggump. darah
Hormon membawa pesan keseluruh tubuh
KLASIFIKASI PROTEIN TUGAS
ENZIM KATALIS BIOLOGIK
HORMON PEMBAWA BERITA KIMIA
PROT. TRANSPOR PEMBAWA
MOLEKUL KECIL
PROT. CADANGAN ,
Seperti : Kasein susu
Ovalbumin putih telur
KLASIFIKASI PROTEIN TUGAS
PROTEIN KONYUGASI bersenyawa dengan non
(conyugate protein) protein
Contoh: - as nukleat nukleo protein
- > 4% karbohidrat muko protein
- < 4% karbohidrat gliko protein
- lipid lipoprotein
pospolipid
kolesterol

- zat warna kromo protein
- asam pospat fosfo protein
- ion logam metalo protein

STRUKTUR PROTEIN
STRUKTUR PRIMER
m/ rentetan a.a. molekul protein, akibat ik. PEPTIDA
PENENTU IDENTITAS PROTEIN

STRUKTUR SEKUNDER
Ik. HIDROGEN
Ik. DISULFIDA MELILITNYA RANTAI POLIPEPTIDA
STRUKTUR TERSIER

Ik. HIDROGEN
GAYA VAN DER WALLS PELIPATAN LAPISAN

STRUKTUR KUARTERNER SEP. BOLA-BOLA

ASAM NUKLEAT
ASAM NUKLEAT
(DNA , RNA)
polimer

NUKLEOTIDA


BASA NITROGEN NUKLEOSIDA
1 UNIT GULA NUKLEOTIDA
1 GUGUS FOSFAT
ik. Kovalen

hetero atom pada P & P dari C 1 pada Gula
Misal nukleosida:
ADENIN + D.2 DEOKSI RIBOSA
9
1'
5'
N
N
N
N
NH
2
O
H OH
H H
H H
HO
Misal Nukleotida pirimidin:
URIDIN TRIPOSPAT(UTP)
O
NH
O
O N
O
OH OH
H H
H
H
O P
O
-
O
P
O
O
O
-
P
O
HO
O
-
1'
2'
3'
4'
5'
NUKLEOTIDA MONOPOSPAT
UTAMA

NUKLEOTIDA NAMABASA UNSUR NUKLEOSIDA
RIBO
NUKLEOTIDA
- AMP
- GMP
- CMP
- UMP
ADENIN
GUANIN
SITOSIN
URASIL
ADENOSIN
GUANOSIN
SITIDIN
URIDIN
DEOKSI RIBO
NUKLEOTIDA
- d AMP
- d GMP
- d CMP
- d TMP
ADENIN
GUANIN
SITOSIN
TIMIN
deoksi ADENOSIN
deoksi GUANOSIN
deoksi SITIDIN
deoksi TIMIDIN