STRUKTUR DAN

FUNGSI PROTEIN
Retno Sintowati, dr. MSc.

SINTESIS PROTEIN
PROTEIN ADALAH POLIMER DARI ASAM AMINO
PERHATIKAN TEORI DOGMA SENTRAL, PRODUK
AKHIR GEN ADALAH PROTEIN
DNA SEBAGAI MATERI GENETIK
mRNA SEBAGAI PEMBAWA INFORMASI GENETIK
SINTESIS PROTEIN TERJADI DI RIBOSOM
mRNA MEMBAWA CODON, SEDANGKAN tRNAMEMBAWA ANTI CODON
PESANAN ASAM AMINO DIKODE OLEH CODON
mRNA
ASAM AMINO YANG SATU DENGAN YANG LAIN
DIRANGKAI DENGAN IKATAN PEPTIDA
START CODON SELALU DIMULAI DENGAN
METIONIN DAN DIAKHIRI DENGAN STOP CODON

MACAM DAN FUNGSI

PROTEIN
1. Protein Regulator /

Bioregulator( Hormon)
2. Biokatalisator ( Enzim )
3. Protein Transport: Hb, Alb,
Lipoprotein, Transferin, protein
integral membran
4. Protein Kontraktil: aktin dan
miosin
5. Protein Struktural:
kolagen,tubulin,keratin,glikopro
tein

Protein memiliki 4 tingkat struktur yang

berbeda :
1.Struktur primer : urutan linear asam amino
dalam rantai polipeptida
2.Struktur sekunder (mencakup heliks- dan
lembar-) : t.a daerah2 lokal rantai polipeptida
yg mpy konformasi reguler yg distabilkan oleh
ikatan hidrogen
3.Struktur tersier : konformasi 3 dimensi total dr
keseluruhan rantai polipeptida (mencakup
heliks-, lembar- dan daerah berbtk globuler)
4.Struktur kuartener : konformasi 3 dimensi
suatu protein multisubunit yg t.a sejumlah
rantai polipeptida disatukan oleh interaksi
nonkovalen berupa interaksi elektrostatik,
hidrofobik, dan ikatan hidrogen.

Muatan pada protein

Muatan protein disebabkan oleh
rantai sisi residu AA.
Krn muatannya, protein dpt
bermigrasi dlm suatu medan listrik.
Sifat ini digunakan utk memisahkan
& mengidentifikasi protein.

Pelipatan protein
Struktur primer menentukan konformasi 3
dimensi suatu protein.
Jenis rantai sisi msg2 residu AA menentukan
bgmn rantai mengadakan lipatan2 hingga
membentuk struktur asli.
Stlh pelipatan, residu sistein akan
membentuk ikatan disulfida.
Konformasi asli bs rusak/denaturasi dg
pemanasan, pH ekstrim, penambahan bahan
kimia misal urea
Jika dikembalikan kondisi faali, akan
membentuk konformasi semula

Modifikasi pasca translasi

Sesudah sintesis protein lengkap, residu AA ttt
mengalami modifikasi kimiawi seperti :
Fosforilasi pd residu serin, treonin, tirosin
Penambahan asam lemak, ADP ribose, gugus metil,
asetil
Penambahan karbohidrat, tu/ protein yg berhub dg
permukaan sel, melalui glikosilasi serin, treonin,
asparagin

Hubungan antara struktur & fungsi protein

Hb transport oksigen
Ig, kolagen, insulin, heksokinase, dll

 Protein didlm sel berada dlm keadaan asli (native state)

Panas, asam, dan bahan lain menyebab protein
tdenaturasi,yi konformasi 3 dimensinya terbuka /hilang
Dalam kead asli alami di dlm sel, byk protein berikatan dg
substansi lain (ion , molekul kompleks) mis. Koenzim.
Berbagai protein yg berbeda dpt disusun dr hanya 20 AA
di mana AA ini akan saling berikatan dlm banyak
kombinasi yg berbeda.
Perbed dlm urutan/sekuen AA pd rantai polipeptoda
menyebabkan pembentukan struktur 3 dimensi yg
berbeda shg fungsinya jg berbeda.
Polipetida merupakan peptida dengan lebih dari 10 asam
amino.

ASAM-ASAM AMINO YANG

TERDAPAT
DALAM PROTEIN
Asam amino rantai
sampingalifatik
Glisin (Gly) = G
Valin (Val) = V
Alanin (Ala) = A
Leusin (Leu) = L
Isoleusin (Ile) = I
Asam amino rantai
sampingsulfur
Sistein (Cys) = C
Metionin (Met) = M
Asam amino rantai
sampinggugus hidrosil
(OH)
Serin (Ser) = S
Treonin (Tgr) = T
Tirosin (Tyr) = Y

Asam amino rantai samping

gugus asidik dan amida
Asam aspartat (Asp) = D
Asparagin (Asn) = N
Asam glutamat (Glu) = E
Glutamin (Gln) = Q
Asam amino rantai
sampinggugus alkalis
Arginin (Arg) = R
Lisin (Lys) = K
Histidin (His) = H *
Asam amino rantai
samping
mengandungcincin
aromatika
Histidin (His) = H
Tirosin (Tyr) = Y *
Fenilalanin (Phe) = F
Triptofan (Trp) = W

Asam
aminosiklik
Prolin (Pro) = P

KOLAGEN
Kolagen membentuk 25% total protein
mamalia yang menggambarkan
keanekaragaman struktur jaringan yang
menandai struktur sekunder protein fibrosa
vertebrata.
Kolagen terdapat pada:
a.Tendon: struktur yang sangat asimetris
dengan kekuatan melawan regangan yang
tinggi.
b.Kulit: membentuk serabut yang terpintal,
longgar, dan fleksibel.
c.Gigi dan kulit: mengandung suatu polimer
kalsium fosfat.
d.Kornea mata

Contoh:
Defesiensi vitamin C berat: enzim prolil dan lisil
hidroksilase menjadi inaktif sehingga tropokolagen
tidak membentuk ikatan silang kovalen. Secara klinis
disebut Penyakit Scorbut dengan gambaran klinik
berupa perdarahan gusi, kesembuhan luka yang jelek
hingga dapat menyebabkan kematian.
Defisiensi tembaga dalam diet yang berperan pada
pembentukan enzim lisil hidroksilase. Secara klinis
disebut Penyakit Menkes dengan gambaran klinis
berupa rambut keriting dan kusut (Kinky hair),
retardasi pertumbuhan.
Gangguan pada gen pengkode kolagen sehingga
biosintesis kolagen terganggu dapat menyebabkan
Osteogenesis imperfekta.
Defek gen yang mengkode -prokolagen, prokolgen Npeptidase atau lisil hidroksilase, menyebabkan

Structure levels in
proteins
primarystructure
aminoacidsequence
secondarystructure
spatialarrangementofaminoacidswithinapoly
peptidechain(helix,sheet,unstructuredturns)
tertiarystructure
spatialarrangementofsecondarystructuralelements
quaterystructure
subunitinteractions

Amino acids are

constituents of proteins

thereareabout20proteinogenicaminoacids

Proteins are Made of AAs

Connected by Peptide Bonds

Ikatan peptida bersifat ikatan rangkap spt 2 lembar kertas

yang dilem
arti dipeptida, tripeptida, jml AA & ikt pep
Pada praktikum: berwarna ungu

 STRUKTUR PROTEIN

Cell membrane structure

Protein pada membran sel

Protein transport pada

membran sel

Nicotinic Acetylcholine
Receptor

Thyroid hormone receptor

(TR)

Epinephrine (adrenaline)
receptor

Insulin receptor

A model of
myoglobin at low
resolution.
Only the -carbon
atoms are shown.
The -helical regions
are named A through
H. (Based on
Dickerson RE in:
The Proteins, 2nd ed.
Vol 2. Neurath H
[editor]. Academic
Press, 1964.
Reproduced with

Crystals of human insulin

Crystals of human insulin.

Insulin is a protein hormone, crucial for
maintaining blood sugar at appropriate
levels.
Chains of amino acids in a specific
sequence (the primary structure) define a
protein like insulin. These chains fold into
well-defined structures (the tertiary
structure) in this case a single insulin
molecule. Such structures assemble with
other chains to form arrays such as the
complex of six insulin molecules shown at
the far right (the quarternary structure).
These arrays can often be induced to form
well-defined crystals (photo at left),
which allows determination of these
structures in detail.

PROTEIN BIOREGULATOR
(HORMON)
Sebagian besar hormon adalah peptida

Contoh hormon polipeptida :

ACTH
Angiotensin I, II
Gastrin
Insulin, glukagon
Kalsitonin
Kolesistokinin
GH, MSH, OT, PTH, PRL, ADH
Hormon derivat amin/ asam amino tunggal :
Katekolamin EPINEFRIN, NOREPINEFRIN , DOPAMIN
(dr tirosin)
T3 dan T4 (dr tirosin)

Kelainan Hb Hb S (sickle cell anemia)

Rantai -globin : residu valin
(hidrofobik) mengantikan glutamat
(hidrofilik)

Manifestasi klinis

HbA

HbS

deoxyHbS polymerizes into filaments