BIOLOGI MOLEKULER

BIOSINTESIS PROTEIN
Oleh:

BAGIAN BIOKIMIA
FAKULTAS KEDOKTERAN UNS
2008

MAKNA SINTESIS PROTEIN

MEKANISME ANTIBIOTIK DALAM
MEMBUNUH BAKTERI DENGAN
MENGHAMBAT SINTESIS PROTEIN
DINDING BAKTERI
ANTIBIOTIK ADA YANG BERSIFAT
SELEKTIF MENGHAMBAT SINTESIS
PROTEIN DINDING BAKTERI SAJA,
TETAPI ADA YG MENGHAMBAT
KEDUANYA

Dogma of molecular biology

Produk akhir gen adalah protein

Structureofeucaryoticcells
lysosomes

nucleus
nucleolus
sEPR
cytoplasm

cellmembrane
mitochondria
rEPR(ribosomes)
centrosome
Golgi

Fungsiorganelasel
organelle

major functions

cell membrane
nucleus
nucleolus
centrosome
cytoplasm
mitochondria
ribosomes
lysosomes
rEPR
sEPR
Golgi

cell integrity, signal transduction

replication, transcription
ribosome synthesis (subunits)
cell division
metabolic pathways, signaling
ATP synthesis, DNA
protein synthesis
intracellular degradation
protein synthesis (export)
lipid synthesis, membranogenesis
protein transport (addressing)

Structureofmammaliangenes
REGUL
ATION

STRUCTURE
I1

REGUL
ATION

E1

Eexons(coding)
Iintrons(noncoding)

I2
E2

E3
promoter
enhancer
silencer

Structural parameters of a gene

and of a mRNA (comparison)
Gene
5flankingregion,structuralpart,3flankingregion
exons(coding)andintrons(noncoding)
norealstart,norealstop

cDNA(mRNA)
5UTR,codingregion,3UTR
nouncodingregionbetweenstartandstop
start(capsite)andstop(polyAtail)

Processes involved in gene

transcription
start

DNA

E1

E2

transcription+capping

stop

E3
polyA
signal

termination
signals

CAP
premRNA

polyadenylation
AAAAAA

mRNA

splicing
start

AAAAA
stop

Jenis RNA
ribosomalRNA(rRNA)
5S,5.8S(160bp),18S(2000bp)and28S(5000bp)RNA
ribosomestructure
transferRNA(tRNA)
smallRNAspecieswithcharacteristicsecondarystructure
(anticodon,aminoacidbinding)
aminoacidtransfer
messengerRNA(mRNA)
matrixforproteinsynthesisattheribosome,different
length
translation

Struktur mRNA
gene
E1

I1

E2

I2

E3

3
PAS

premRNA
AUG
(start)
mRNA

splicingsites
PAS

CAP
5UTR
start

UGA
(stop)

TR

AAAAAAA
3UTR
stop

Struktur mRNA jadi

CAP

regulatoryparts
5UTR
start
codon

structuralpart
TR

3UTR AAAAA
stop
codon

Genetic code
degeneratedcode:

stop
stop

severaltripletscodeforoneaminoacid,
onlymethionine(start)hasjust1codon

stop

Bahasa
Bahasagen
gen
bersifat
bersifat
universal
universal

KODON ATAU SANDI GENETIK

TRIPEL NUKLEOTIDA

LIHAT VCD SINTESIS

PROTEIN
DARI MCB
DARI SI NTESIS PROTEIN LEHNINGER 2000
DARI HRN YAHYA

BIOSINTESIS PROTEIN
PERHATIKAN TEORI DOGMA SENTRAL, PRODUK AKHIR

GEN ADALAH PROTEIN

DNA SEBAGAI MATERI GENETIK
mRNA SEBAGAI PEMBAWA INFORMASI GENETIK
SINTESIS PROTEIN TERJADI DI RIBOSOM
mRNA MEMBAWA CODON, SEDANGKAN tRNA-MEMBAWA
ANTI CODON
PESANAN ASAM AMINO DIKODE OLEH CODON mRNA
ASAM AMINO YANG SATU DENGAN YANG LAIN
DIRANGKAI DENGAN IKATAN PEPTIDA
START CODON SELALU DIMULAI DENGAN METIONIN
DAN SINTESIS PROTEIN DIAKHIRI DENGAN STOP CODON

TABEL KODON

Amplification of Message by Translation

From 1 spliced mRNA molecule many protein molecules are made.

SINTESIS PROTEIN SELALU DIMULAI

DENGAN METIONIN

TERMINASI DENGAN STOP CODON

Structure levels in proteins

primarystructure
aminoacidsequence
secondarystructure
spatialarrangementofaminoacidswithinapoly
peptidechain(helix,sheet,unstructuredturns)
tertiarystructure
spatialarrangementofsecondarystructuralelements
quaterystructure
subunitinteractions

Amino acids are constituents of

proteins

thereareabout20proteinogenicaminoacids

Proteins are Made of AAs Connected

by Peptide Bonds

Ikatan peptida bersifat ikatan rangkap

spt 2 lembar kertas yang dilem (SRTLH)
arti dipeptida, tripeptida, jml AA & ikt pep
Pada praktikum: berwarna ungu

I M UN O BLOTI N G
kDa

kDa Koloni yg mengeksp

protein rekombinan
diimunobloting dg Ab
poliklonal thd Prot sol T.
gondii

97,4 kDa
84,0 kDa
66,0 kDa
55,0 kDa
45,0 kDa
29,0 kDa
20,1 kDa
14,2 kDa
1

Pita prot rek gb pita

berbeda dg prot non rek,
28
intensitas warna
berbeda,yg dominan prot
rek dg BM 28 kDa yg
merup hasil eksp cDNA

Gambar 6. Hasil elektroforesis protein dari biakan E.coli rekombinan pembawa

gen penyandi protein solubel 28 kDa (GRA2) T. gondii yang diimunobloting dengan
antibodi poliklonal terhadap protein solubel takizoit T. gondii.
1. protein standar, 2. lisat protein dari E.coli dengan pewarnaan amidoblack,
4, 5, 6 dan 7 adalah hasil imunobloting protein dari klon rekombinan, sedang
3 adalah protein dari klon berwarna biru ( bukan rekombinan)

APLIKASI KLINIS
WESTERN BLOT UNTUK DIAGNOSIS
HIV

 STRUKTUR PROTEIN

Proteins Form Complex 20 Structures

R Groups define the
behavior of an amino
acid and the structure
a protein domain folds
into.

Acidic
Basic
Neutral
Hydrophobic
Hydrophilic
Electrostatic

MACAM DAN FUNGSI

PROTEIN
1. Protein Regulator /
2.
3.
4.
5.
6.

Bioregulator( Hormon)
Biokatalisator ( Enzim )
Protein Transport: Hb, Alb,
Lipoprotein,Transferin
Protein Kontraktil: aktin dan miosin
Protein Struktural:
kolagen,tubulin,keratin,glikopr
Protein Pelindung: Ig, interferon,
perforin,IL

HEALTH
HEALTH is
is better
better
than
than WEALTH
WEALTH

Biomol:
Biomol:Dx
Dxdini,
dini,patogenesis,
patogenesis,
protein
proteinkandidat
kandidatvaksin
vaksindan
dantx
txgen
gen

Thank you for

your kind
attentions ..

TERIMA KASIH