Tugas Resume Mata Kuliah Genetika 1

Kelas / Off : H 2014

Kelompok 11
Nama Kelompok :
Isfatun Chasanah
(140342603465)
Yanis Kurnia Basitoh (140342604027)
Plasmid dan Episome
Materi genetik pada bakteri disimpan dalam suatu kromosom utama,ditambah dalam
banyak kasus, juga disimpan dalam satu sampai beberapa molekul DNA ekstrakromosomal
atau mini kromosom yang disebut plasmid. Menurut definisi, plasmid adalah replicon (unit
materi genetik yang mampu melakukan replikasi secara independen) yang diwariskan secara
stabil (dipertahankan tanpa seleksi tertentu) dalam keadaan ekstra kromosom. Kebanyakan
tetapi tidak semua, plasmid yang dibuang, yaitu karena plasmid tersebut tidak lagi diperlukan
untuk kelangsungan hidup sel dimana plasmid tersebut berada. Pada banyak kasus,
bagaimanapun juga, plasmid sangat penting pada kondisi lingkungan tertentu, seperti dengan
keberadaan antibiotik.
Pentingnya plasmid menjadi semakin diakui selama dua dekade terakhir. Plasmid telah
diidentifikasi di hampir semua strain bakteri yang diuji. Plasmid memiliki signifikansi besar
di dua hal yaitu :
(1) Resistensi terhadapat berbagai antibiotik dan obat-obatan pada bakteri patogen
(2) Kestabilan pada mikroorganisme yang penting bagi industri
Pada Streptococcus lactis dan bakteri terkait yang digunakan dalam proses pengolahan
keju, beberapa plasmid telah diidentifikasi dan terbukti membawa gen yang mengkode enzim
penting yang digunakan dalam proses fermentasi pada pembuatan keju. Pengamatan tersebut
menjelaskan sebagian hal, yaitu mengapa keju "permulaan budaya" dari bakteri yang tidak
stabil dan harus sering dibuang, serta biaya yang cukup besar untuk industri pembuatan keju.
Tiga jenis utama dari plasmid yang telah diteliti secara luas yaitu :
(1) F dan F plasmid, yaitu faktor yang berpengaruh dalam proses konjugasi
(2) R plasmid (disebut juga RTF atau Resistance Transfer Factor) yaitu plasmid yang
membawa gen yang memiliki sifat resisten terhadap antibiotik atau obat-obatan
antibakteri lainnya
(3) Col plasmid (disebut juga faktor coliciogenic), yaitu plasmid yang mengkode colicins,
yang merupakan sejenis protein pembunuh bagi sel-sel E. coli yang sensitif

Palsmids juga ditemukan pada bakteri yang mengkodekan bakteriosin selain colicins.
Sebagai contoh, plasmid yang diketahui mengkode vibriocins, adalah protein yang
membunuh sel-sel Vibrio cholerae yang sensitif. Plasmid-plasmid tersebut bersifat analog
dengan plasmid Col. Dalam beberapa hal, kromosom yang terdapat pada mitokondria dan
kloroplas pada eukariot juga sesuai dengan definisi plasmid. Plasmid dapat dibagi menjadi
dua kelompok berdasarkan keikutsertaannya dalam memperantarai proses konjugasi.
Conjugative atau transmissible plasmid memperantarai transfer DNA melalui konjugasi.
Semua F dan F plasmid banyak R plasmid dan beberapa Col plasmid merupakan plasmid
jenis ini. Nonconjugative atau nontransmible plasmid merupakan plasmid yang tidak
memperantarai transfer DNA melalui konjugasi. Banyak dari R dan Col plasmid bersifat
nonconjugative.
Beberapa plasmid seperti faktor F juga dapat dikategorikan sebagai elemen genetic
yang disebut dengan episome. Episome adalah elemen genetic yang dapat bereplikasi pada
salah satu dari dua bentuk yang berbeda yaitu :
(1) Sebagai bagian yang terintegrasi dari kromosom utama, atau
(2) Sebagai elemen genetik yang independen terhadap kromosom utama.
Istilah plasmid dan episom bukan merupakan sinonim. Kebanyakan plasmid tidak terdapat
dalam keadaan yang terintegrasi dan tidak juga episom. Sama halnya banyak fag kromosom
yang berubah-ubah, seperti fag genom A, yang episomes tetapi tidak plasmid.
Kemajuan spektakuler telah dibuat dalam pemahaman kita tentang struktur dan sifat
plasmid dan episomes selama dua dekade terakhir. Banyak dari sifat mereka sekarang
diketahui bergantung pada kehadiran urutan DNA pendek yang disebut elemen IS atau urutan
penyisipan. Elemen IS ini juga hadir dalam kromosom inang utama. Urutan pendek ini (dari
sekitar 800 sampai sekitar 1400 pasang nukleotida panjang) adalah transposabel, yaitu,
mereka dapat berpindah dari satu posisi ke posisi lain dalam kromosom, atau berpindah dari
satu kromosom ke kromosom yang berbeda. Selain itu, elemen IS memediasi rekombinasi
antara unsur-unsur genetik yang dinyatakan nonhomolog di mana mereka berada. Bukti
tersebut menunjukkan bahwa elemen IS memediasi integrasi episomes ke kromosom inang.
Hal ini terlihat jelas dalam kasus integrasi E.coli K12 F plasmid (F factor) selama
pembentukan Hfr (gambar 8.20).
Pertama, empat IS elemen yang akan ekstensif ditandai dan urutan -ISI, IS2, IS3 dan IS4adalah 768, 1327, 1300, dan 1426 nukleotida berpasangan yang panjang. Beberapa elemen IS
lainnya kemudian diidentifikasi, ditandai, dan dalam beberapa kasus sequencing.

Kromosom E.coli K12 ternyata berisi delapan salinan IS1 dan lima salinan IS2, ditambah
satu atau lebih salinan IS3 dan IS4. E.coli K12 faktor F mengandung satu salinan IS2 dan dua
salinan IS3 (gambar 8.20). Posisi dari elemen IS di berbagai faktor F dan kromosom dari
berbagai strain E.coli diyakini untuk menentukan lokasi integrasi faktor F selama
pembentukan Hfr strain (gambar 8.20).

Gambar 8.20
(a) Penyingkatan peta genetik dari E. coli K12 F faktor (F plasmid) dan (b) penggambaran IS
penggabungan elemen-mediasi dari F faktor selama pembentukan Hfr. (a) Lingkaran dalam
menunjukkan lokasi satu elemen IS2 dan dua elemen IS3. Jarak yang diberikan sampai pada
lingkaran dalam yaitu dalam kilobase (1000 unit nukleotida-pair). E. coli K12 faktor F adalah
94.500 nukleotida berpasangan yang panjang. Lokasi perkiraan dari 13 gen yang terlibat
dalam transfer kromosom (gen tra), asal transfer (ori), gen yang diperlukan untuk replikasi
(gen rep), dan gen yang terlibat dalam penghambatan pertumbuhan F

bakteriofag tertentu

seperti fag T7 (phi, untuk penghambatan, gen) yang ditunjukkan di lingkaran luar. Sisi
rekombinasi dengan kromosom inang selama integrasi ditunjukkan oleh panah untuk tiga
strain Hfr. Perhatikan bahwa sisi tersebut bertepatan dengan lokasi yang dikenal dari tiga
elemen IS. (b) Mekanisme anjuran integrasi faktor F dimediasi oleh homologi dari elemen IS
dalam kromosom dan faktor F. Hasil integrasi seperti dalam faktor F yang diapit oleh elemen
IS yang identik ketika kovalen dimasukkan ke dalam kromosom dari sel Hfr.

Pertanyaan :
1. Bagaimana peranan plasmid terhadap berbagai antibiotik dan obat-obatan pada bakteri
patogen ?
Jawab :
Plasmid yang berperan dalam hal tersebut yaitu R plasmid (disebut juga RTF atau
Resistance Transfer Factor) yaitu plasmid yang membawa gen yang memiliki sifat resisten
terhadap antibiotik atau obat-obatan antibakteri lainnya, Sejumlah perbedaan gen-gen
resisten-antibiotik dapat dibawa oleh faktor R. Plasmid R100 disusun oleh 90 kpb yang
membawa gen resisten untuk sulfonamid, streptomisin/spektinomisin, asam fusidat,
kloramfenikol, tetrasiklin dan pembawa gen resisten terhadap merkuri. R100 dapat berpindah
diantara bakteri enterik dari genus Escherichia, Klebsiella, Proteus, Salmonella, dan Shigella,
tetapi tidak akan berpindah ke bakteri nonenterik Pseudomonas. Juga telah diketahui bahwaa
faktor R dengan gen resisten terhadap kanamisin, penisilin, tetrasikliin, dan neomisin.
Beberapa elemen resisten obat pada faktor R merupakan elemen yang dapat bergerak, dan
dapat digunakan dalam mutagenesis transposon.
2. Apa sajakah aplikasi plasmid dalam kehidupan sehari-hari?
Jawab :

Untuk membuat organisme transgenik dengan memperkenalkan gen yang bermanfaat ke

dalam sel inang.

Membuat dan hemat biaya produksi massal antibiotik dapat dicapai dengan
menggabungkan vektor ekspresi untuk antibiotik dalam sel mikroba. Demikian pula,

biomolekul lainnya juga dapat diproduksi.

Digunakan untuk mengelola terapi gen, yaitu teknik yang digunakan untuk memperbaiki
gen yang cacat yang bertanggung jawab untuk pengembangan penyakit.