Magister ilmu agama islam (terakreditasi: B)

Visi: Menjadi lembaga pendidikan pascasarjana yang modern dan unggul dalam
bidang studi Islam dan pengembangan ilmu pengetahuan berlandaskan Islam
untuk kemaslahatan umat.

Misi: Menyelenggarakan pendidikan di bidang Islamic Studies pada tingkat

pascasarjana yang modern berlandaskan Islam, baik yang berwawasan

kewahyuan maupun sosial kemanusiaan.
Tujuan PPs-MSI UMY bertujuan menghasilkan lulusan yang memiliki kemampuan:
1. Melakukan pengkajian tentang Islamic Studies secara substantif dan
metodologis yang berorientasi pada pemecahan persoalan masyarakat masa
kini dan mendatang.
2. Melahirkan akademisi dan praktisi bergelar Master yang mampu melakukan
integrasi antara Islam dan Ilmu Pengetahuan atau internalisasi nilai-nilai Islam
ke dalam Ilmu Pengetahuan, sehingga mampu memberikan pencerahan
keIslaman dan keilmuan secara integratif dan komprehensif.