SOFTWARE STATISTIC

SOFTWARE STATISTIC
x . Criterii de alegere a software-ului statistic
pentru biostatistica medical
x . Caracteristicile soft-ului statistic actual
x . Principii de lucru cu un program statistic
x . Clasificarea software-lui statistic
x . Prezentarea unor programe statistice
aplicabile n domeniul medical

Criterii de alegere ale

software-ului statistic
Procedeele i modelele statistice care
intervin n domeniul medical
Functiunile software-ului statistic
Resursele hard disponibile.

Procedee utilizate n statistica

descriptiv
Prezentarea datelor statistice (tabele de
frecvene, grafice, diagrame)
Calculul indicilor epidemiologici (rate, raii,
proporii)
Calculul msurilor de tendin central i
dispersie (media, mediana, modul, valoarea
central, variaia, deviaia standard,
coeficientul de variaie, etc)
Corelatii

Procedee utilizate n statistica

analitic
Estimarea parametrilor statistici (limite de
ncredere
pentru
medii,
indici
epidemiologici, frecvene, etc)
Aplicarea unor teste statistice (testul Z,
testul T (Student), testul Hi-ptrat, testul
Fisher,
testul
ANOVA,
teste
pentru
comparaii perechi, teste neparametrice
Determinarea i analiza funciilor de
regresie
Analiza supravieuirii
5

Caracteristici ale softwareului statistic actual

Componentele principale ale unui
software statistic sunt:
x . Un sistem de gestiune al bazelor de date
statistice (fiierelor de date)
x . Un sistem de proceduri statistice
x . Un sistem de reprezentare grafic a
datelor statistice
. Un mediu de dezvoltare de programe.

Caracteristici ale softwareului statistic actual

x . Interactivitatea dintre program i utilizator
x . Interaciunea cu alte programe statistice
(importul i exportul de date)
x . Posibilitile de realizare a unor aplicaii
complexe prin programarea etapelor de
prelucrare statistic
x . Asistarea utilizatorului n decizia statistic
x . Posibilitile de reutilizare a rezultatelor

Principii de lucru cu un
program statistic
0. Elaborarea protocolului de studiu

Precizarea populatiei tinta

Determinarea variabilelor si scalelor lor
Determinarea esantioanelor
Fixarea obiectivelor (ipoteze de verificat)

1. Elaborarea planului de prelucrri statistice

Scrierea unui program care sa efectueze prelucrarile
statistice

2. Culegerea i validarea datelor sau importul datelor

3. Efectuarea prelucrrilor statistice
4. Interpretarea rezultatelor i utilizarea lor prin
integrarea lor n alte documente

Clasificarea software-lui
statistic
x . Software statistic specializat pentru
domeniul biomedical .Exemple: EPIINFO,
BIOSTAT
x . Software statistic general. Exemple:
- SPSS sub WINDOWS
- SYSTAT sub WINDOWS
- STATISTICA sub WINDOWS
x . Faciliti statistice incluse n software cu
destinaii diverse (tabele de calcul, sisteme
de gestiune a bazelor de date, etc.)
Exemple: EXCEL, WORKS

EPIINFO
Destinaie i autori

EPIINFO a fost promovat de ctre OMS i a fost creat la

CDC (Center for Disease Control and Prevention) din
Atlanta, SUA
Cuprinde: (i) procesor de texte, (ii) un sistem de
gestiune a bazelor de date, (iii) un sistem de programe
statistice.
Aceste componente comunic ntre ele i lucreaz integrat.
In prezent se afl n funciune versiunea 6 a acestui
program.
10

EPIINFO

EPIINFO ofer trei nivele de faciliti de lucru:

Nivelul elementar de lucru sau primul
nivel de utilizare (linie de comanda)
Nivelul avansat de lucru (programe de
prelucrari statistice)
Nivelul al treilea de lucru de realizare a
aplicaiilor informatice complexe

11

Lansarea i structura lui Epiinfo 6

In mod obinuit, activarea pachetului
EPIINFO versiunea 6 se face prin lansarea
programului EPI6 din directorul C:\ EPI6.
Dup lansare, EPIINFO deschide o fereastr
n care apar meniurile pachetului:
PROGRAMS TUTORIALS EXAMPLES
MANUAL FILE EDIT
Abandonarea lucrului cu un program se face
cu tasta F10

12

13

Meniul PROGRAMS
EPED word procesor - procesorul de texte
(creaz chestionare)
ENTER data sistemul de gestiune al bazelor de
date Epi (creaz, actualizeaz, restructureaz baze de
date Epi)
ANALYSIS of data analiza de date (statistic
descriptiv, teste statistice, manipularea bazelor de
date EPIINFO, reprezentri grafice)
14

Meniul PROGRAMS
CHECK customize enter
asigura controlul
intrrilor de date, realizarea bazelor de date nlnuite
IMPORT files import de date culese cu alte pachete
de programe (Dbase, Lotus, etc)
EXPORT files convertirea bazelor de date Epi
pentru a fi utilizate de alte pachete de programe
(Dbase, SPSS, Lotus, Statpac, SAS etc)
MERGE files combinri i manipulri de baze de
date Epi
15

Meniul PROGRAMS
STATCALC calculator
prelucrri statistice
epidemiologice CSAMPLE analyze surveysanaliza
datelor din eantioane complexe de supraveghere
EPITABLE calculator
calcule statistice epidemiologice
EPINUT anthropometry analiza datelor de nutriie i
antropometrice
VALIDATE duplicate enter
validri i comparaii de
baze de date
QUIT
abandonarea lucrului cu Epiinfo
16

Procesorul de texte EPED

editarea unor documente de tip text (rapoarte, memorii, etc),

crearea chestionarelor de culegere a datelor (epidemiologice),

fiiere .QES, care furnizeaz structura bazelor de date EPI i
permit crearea i lucrul cu aceste baze de date,
scrierea programelor Epiinfo (de exemplu, utiliznd limbajul de
comenzi admis de ANALYSIS)
- generarea automat prin tehnica hipertextului n mod
interactiv a unor documente de tip text, cum ar fi, de exemplu,
chestionarele epidemiologice standard, proiecte de investigaii
epidemice sau a unor rapoarte standard epidemiologice.

17

18

Crearea si structura chestionarelor

Fisier cu extensia .QES
Comentarii
Cimpuri
nume cimp
descriptor cimp

text <A
>
numeric
# # #.# #
data calendaristica
<MM/DD/YY>
logic <Y>
telefon <phonemum>
cod automat de identificare <idnum>

19

Crearea si structura chestionarelor

CHESTIONAR PENTRU STUDIUL AFECTIUNII DE DIABET

V rugm s completai urmtoarele rubrici cu datele

corespunztoare:
Nume <A
>
Prenume <A
>
Data nasterii <DD/MM/YY> Data consultatiei <DD/MM/YY>

Sex <A>
Ocupatie <A
>
Glicozurie # # #.# #
Glicemie # # #.# #
Tensiune arteriala : Sistolica # # # Diastolica # # #

Bolnav <Y>
20

Programul ENTER
Crearea bazelor de date Epi (.REC) i introducerea
datelor n bazele de date Epiinfo se poate realiza utiliznd
programul "ENTER " i un chestionar anterior creat.
Modulul ENTER permite, de asemenea, actualizarea
unei baze de date EPIINFO ct i trecerea de la o
nregistrare activ la alta.
Programul ENTER permite i restructurarea unei baze
de date create anterior cu ajutorul unui nou fiier
chestionar.
21

22

23

Componenta ANALYSIS
Componenta ANALYSIS realizeaz prelucrri statistice
asupra datelor statistice cuprinse n baze de date .REC:
- Calculeaz statistici descriptive (frecvene, tabele de
contingen, media, variaia, mediana, modulul, cvartilele,
valorile extreme).
- Determin i efectuiaz o serie de analize statistice specifice
domeniului epidemiologiei (odd ratio, riscul relativ, limite de
ncredere pentru odd ratio i riscul relativ, valoarea
probabilitii p asociat tabelului, analize stratificate cu tehnica
Mantel-Haenszel, analize n studii caz-control pereche).
24

Componenta ANALYSIS
Componenta ANALYSIS realizeaz prelucrri statistice
asupra datelor statistice cuprinse n baze de date .REC :
- Efectueaz anumite teste statistice parametrice i neparametrice
(ANOVA-unidimensional i Kruskal-Wallis, Student, Student
perechi, Hi-ptrat, analize de regresie multiliniar).
- Realizeaz reprezentri grafice statistice (histograme, diagrame
de dispersie (scatter) i drepte de regresie, diagrame bar, pie i
line). Acestea pot fi salvate (ca fiiere bitmap sau metafile) i
integrate apoi n documente de tip text, care accept includerea
de grafic (de exemplu, Word sub WINDOWS).

25

26

27

28

Componenta ANALYSIS
Operaiuni asupra datelor din fiierele .REC:
- selectarea articolelor bazei de date utiliznd condiii
specificate,
- sortarea sau listarea articolelor,
- efectuarea de operaii logice i matematice asupra unei
variabile i introducerea rezultatului ntr-o nou variabil,
- afiarea rezultatelor pe ecran sau la imprimant ori
nregistrarea lor pe disc.

29

Componenta ANALYSIS
Pentru lansarea unei comenzi, trebuie construit o linie de comand
numit i instruciune ANALYSIS. Dup construirea ei instruciunea
este lansat n execuie prin <Enter>.
In linia curent de comand, de regul, pot fi introduse n
conformitate cu sintaxa comenzii, n ordine:

- cuvintele cheie specifice comenzii,

- parametrii comenzii,

- opiuni asociate comenzii.

30

31

Componenta ANALYSIS
In mod concret, n ANALYSIS se pot
adopta trei sisteme de lucru:

- prin tastarea instruciunilor,

- prin construirea asistat a instruciunilor,

- prin includerea instruciunilor n programe.

32

Componenta ANALYSIS

Realizarea unei aplicaii n Analysis

Lucrul cu o baz de date Epi, n care se efectuiaz doar prelucrri statistice,

implic :
1. Deschiderea bazei de date.
2. Vizualizarea coninutului bazei de date sau obinerea unor liste cu
coninutul unor cmpuri.
3. Efectuarea unor corecii i actualizri n baza de date.
4. Dirijarea rezultatelor. Deosebit de eficient este dirijarea rezultatelor ntrunul sau mai multe fiiere. In acest fel rezultatele obinute pot fi editate cu editorul
EPED, pot fi tiprite, sau incluse n diferite documente text (studii medicale,
rapoarte medicale, etc).
5. Prelucrarea statistic.

33

Componenta ANALYSIS
Realizarea unei aplicaii n Analysis
1. Deschiderea unei baze de date
READ nume-fiier.REC
READ c:\diabet.rec

2. Dirijarea rezultatelor
ROUTE <nume-fiier>.TXT sau PRINTER sau
SCREEEN
ROUTE REZULTAT.TXT
34

Componenta ANALYSIS
Realizarea unei aplicaii n Analysis
3. Vizionarea, verificarea, actualizarea datelor
LIST <variabile>
LIST PRENUME SEX glicemie bolnav stres greutate

BROWSE <variabile>
UPDATE <variabile>
Vizionarea sub forma de tabel si modificarea
datelor
UPDATE
35

Componenta ANALYSIS
Realizarea unei aplicaii n Analysis
4. Manipularea variabilelor
SELECT <conditie>
SELECT bolnav=Y

5. Comenzi statistice
Calculul
unui
unidimensional

tabele

de

frecvente

FREQ <variabila>
FREQ bolnav
36

Componenta ANALYSIS
Realizarea unei aplicaii n Analysis
- Aplicarea testelor ANOVA, Student, KruskalWallis
MEANS <variabila numerica de analizat> <variabila de grupare>

MEANS GLICEMIE BOLNAV

- Aplicarea testului Hi-patrat
TABLES STRES BOLNAV
- Calculul functiei de regresie
REGRESS glicemie greutate
37

Componenta ANALYSIS
* Deschide baza de date CARDIO.REC de pe discheta A:
READ A:\CARDIO.REC
* Dirijeaza rezultatele in fisierul CARDIO.TXT
ROUTE A:\CARDIO.TXT
* Realizeaza lista ceruta
LIST NUME PROFESIE MASAVS TENSART SEX BOLNAV STRES
* Selecteaza doar cazurile de boala
SELECT BOLNAV = Y
* Calculeaza frecventa imbolnavirii pe profesii
FREQ PROFESIE
* Dirijeaza iesirea la monitor
ROUTE SCREEN
* Curata ecranul
CLS

38

Componenta ANALYSIS
* Prezinta histograma
HISTOGRAM PROFESIE
* Face o pauza pentru examinarea histogramei
PAUSE
* Redirijeaza rezultatele in fisierul CARDIO.TXT
ROUTE A:\CARDIO.TXT
* Selecteaza din nou toate cazurile
SELECT
* Aplica testul Student pentru comparatia mediilor masei ventricolului
* sting la bolnavi si sanatosi
MEANS MASAVS BOLNAV
* Calculeaza coeficientul de corelatie dintre cele doua variabile
REGRESS MASAVS TENSART
* Determina daca stresul este factor de risc pentru imbolnavire
TABLES STRES BOLNAV

39

Componenta Statcalc
1. Analiza unor tabele de contingen 2x2 pn
la 2x10. STATCALC aplic testele Hi-ptrat i
Fisher, determin riscul relativ, calculeaz
limite de ncredere pentru riscul relativ i
efectuiaz analize stratificate.
2. Calcularea taliei eantioanelor necesare n
studiile de supraveghere a unei populaii sau
pentru studiul diferenei ntre dou proporii.
40

Componenta EPITABLE
Prin meniul Describe se pot determina intervalele
de ncredere n jurul unor valori estimate ale unor proporii,
medii sau mediane cu un risc a specificat n meniul Setup.

Meniul Compare permite efectuarea unor comparaii

statistice ntre proporii, medii i variaii utiliznd teste
statistice adecvate. Elementele comparate precum i ali
parametri necesari se introduc interactiv, iar rezultatele sunt
imediat afiate la monitor. Acestea pot fi salvate i editate.

41

Componenta EPITABLE
Meniul Study servete la evaluarea
asocierilor n studiile medicale de tip cohort i cazcontrol. Sunt prezentate cteva metode de msurare
a eficienei vaccinrii. Pot fi efectuate i determinri
ale parametrilor pentru anumite studii de screening.

Meniul Sample servete la calculul

dimensiunii eantioanelor pentru diferite studii
epidemiologice

42

Componenta EPITABLE

Meniul
Probability
determin
probabiliti pentru diferite distribuii care intervin
frecvent n inferena statistic:

Hi-ptrat,
Student t,
normal Z,
binomial,
Poisson.
43

Componenta CSAMPLE
CSAMPLE - reprezint o component statistic a
lui EPIINFO utilizat n analiza statistic a datelor
pentru proiecte de supraveghere complexe, lund n
considerare sisteme de eantionare de tip cluster, cu
stratificare i ponderi.

44

Componenta EPINUT
EPINUT - permite calculul unor indici antropometrici pe
baza unor informaii individuale privind sexul, vrsta,
greutatea i nlimea, cum ar fi: nlimea pentru o vrst
(height -for-age HA), greutatea raportat la vrst (weightfor-age WA) greutatea raportat la nlime (weight-forheight WH). Acest program poate fi utilizat att la nivelul
individului ct i la nivelul unei populaii. O nrutire a
unor indici antropometrici n timp ar putea fi o indicaie
privind o situaie de boal i/sau o deficien n nutriie cu
consecine serioase asupra sntii.
45

BIOSTAT
BIOSTAT - este destinat analizei de date n
medicina clinic. Acest program funcioneaz
sub sistemul de operare MS-DOS, i nu cere
dect resurse hard i soft standard (hard disk,
RAM 1 Mb).

46

BIOSTAT
El posed un sistem simplu de meniuri cu
care pot fi activate cele cinci componente
principale ale sale:
x.
x.
x.
x.
x.

Biostatistics
Decision Analysis
Clinical Trials
Meta-analyse
Literature search

47

SYSTAT
SYSTAT - este un software statistic general comercial
realizat sub WINDOWS, versiunea 5.01, de ctre firma
SYSTAT din Evanston, IL USA.
Resurse hard i soft necesare. El poate rula sub Microsoft
WINDOWS versiunea 3.1, sau ulterioar. Cere o memorie
RAM de cel puin 4 Mb, i un spaiu pe HD de cel puin 8
Mb pentru instalare. Pentru lucrul eficient, un mouse i
procesorul matematic sunt recomandabile s existe n
configuraie, dar nu sunt absolut necesare
48

SYSTAT
Meniul Stats cuprinde comenzi pentru:
x . Analiza datelor (Cluster analysis)
x . Corelaii (Pearson, Spearman, etc)
x . Testarea ipotezelor statistice (Anova, Student)
x . Analiza de regresie multiliniar
x . Modele de regresie neliniare
x . Teste neparametrice (Kruskal-Wallis, WaldWolfowitz, Wilcoxon, Kolmogorov -Smirnov)
x . Analiza seriilor de timp
x . Calculul tabelelor de frecvene.

49

STATISTICA
STATISTICA este un software statistic
general
comercial
realizat
sub
WINDOWS, versiunea 4.3, de ctre firma
StatSoft USA.
Resurse hard i soft necesare. El poate rula sub
Microsoft WINDOWS 95, sau o versiune ulterioar.
Cere o memorie RAM de cel puin 16 Mb, i un
spaiu pe HD de cel puin 15 Mb pentru instalare.
50

STATISTICA
STATISTICA are cteva regimuri de lucru
fiecare posednd ferestre de aplicaie
specifice:

Spreadsheet
Scrollsheet
Graph
Text /Output
Megafile Manager
51

STATISTICA
Meniul Analysis cuprinde comenzi pentru:
1. Prelucrri statistice de baz: statistica descriptiv, corelaii,
testul Student (t-test) pentru eantioane independente i pentru
eantioane perechi, statistici desriptive pentru grupuri, tabele
de frecvene, tabele de contingen, statistici n tabele de
contingen, calculator probabilistic.
2. Analiz ANOVA/MANOVA: analiz de covarian
(ANCOVA), analiz de contrast, design multivariat
(MANOVA/MANCOVA), etc.

52

STATISTICA
Meniul Analysis cuprinde comenzi pentru:
3. Analiz canonic: regresii neliniare (i polinomiale),
analiz de regresie multipl, calculul valorilor de
predicie, analiz rezidual, regresie multipl segmentar.
4. Analiz Cluster
5. Analiz Discriminant
6. Planificarea experimentelor
7. Analiz factorial
53

STATISTICA
Meniul Analysis cuprinde comenzi pentru:
8. Regresii liniare
9. Analiz Log-Liniar
10. Modele neliniare : regresie logistic,
regresie probit, regresie cu cretere
exponenial,etc.

54

STATISTICA
Meniul Analysis cuprinde comenzi pentru:
11. Statistic neparametric: Corelaii neparametrice
(Spearman R, Kendall Tau, Gamma), teste de
comparaie a dou grupuri (Wald-Wolfowitz, MannWhitney, Kolmogorov-Smirnov), teste de comparaie a
grupurilor multiple (Kruskal-Wallis ANOVA), testul
Medianei, compararea a dou variabile (Sign test,
Wilcoxon matched pairs test), compararea mai multor
variabile ( testul Friedman i Kendall de concordan,
Cochran test), ajustarea distribution .
55

STATISTICA
Meniul Analysis cuprinde comenzi pentru:
12. Analiza de proces
13 Control de calitate
14. Analiza de fiabilitate
14. Analiza de supravieuire: analiza tabelelor de
supravieuire, metoda Kaplan-Meier, compararea
supravieuirii n dou sau k eantioane, modele de
regresie pentru date cenzurate.
15. Serii de timp i predicii

56

STATISTICA
Limbajul de comenzi al programului STATISTICA
Limbajul SCL poate fi utilizat pentru dezvoltarea de aplicaii
statistice care pot fi executate n mod repetat, ct i pentru dezvoltarea
de programe pentru persoane care nu sunt familiare cu STATISTICA.

FILE = "C:\CARDIO\DIABET.STA"
PRINTER= FILE C:\CARDIO\DIABET.REZ
DESC VARS=ALL
CORR VARS=ALL/PAIRWISE

57

SPSS sub Windows

SPSS sub Windows este un program
statistic complex comercial realizat de
SPSS Inc, n 1994.

Resurse hard i soft: Funcionnd sub Windows

acest software statistic poate funciona doar n
prezena sistemului de operare grafic Windows
versiunea 3.1 sau ulterioar i pentru o funcionare
corespunztoare cere o memorie RAM de cel puin 8
Mb, hard disk, mouse.
58

SPSS sub Windows

Dintre procedurile statistice ce pot fi aplicate n SPSS sub
Windows menionm:

- calculul statisticilor descriptive, a unor tabele de frecvene

- comparaii de medii
- aplicarea modelelor ANOVA
- determinarea unor corelaii
- analiza de regresie (liniare, neliniare, etc)
- clasificare
- teste neparametrice
- analiza seriilor de timp
- curbe de supravieuire.
59

EXCEL
Procedurile statistice se pot lansa din
meniul Tools prin comanda Data Analysis:
- teste ANOVA

- corelaii
- covariana
- statistici descriptive
- testul Fisher pentru comparaia a dou variaii
- analiza Fourier
- histograme
- generarea de numere aleatoare

60

EXCEL
Procedurile statistice se pot lansa din
meniul Tools prin comanda Data
Analysis:
- eantionare
- testul T al lui Student
- testul Z

61

EXCEL
Funcii predefinite pentru domeniul statisticii:
AVERAGE - pentru calculul mediei aritmetice
GEOMEAN - pentru calculul mediei geometice
HARMEAN - pentru calculul mediei armonice
MEDIAN pentru determinarea medianei
MODE pentru determinarea valorii modale
FREQUENCY pentru calculul frecvenelor valorilor din anumite
clase de frecvene
RAND i RANDBETWEEN pentru generarea de numere aleatoare

62

EXCEL
Funcii predefinite pentru domeniul statisticii:

VAR pentru calculul variaiei

STDEV pentru calculul abaterii standard
CONFIDENCE pentru determinarea intervalului de ncredere al
mediei
QUARTILE pentru determinarea cvartilelor unei serii de date
PERCENTILE - pentru determinarea percentilelor unei serii de
date
KURT - pentru determinarea coeficientului de kurtosis al unei
serii de date
SKEW - pentru determinarea coeficientului de asimetrie
(skewness) al unei serii de date

63

EXCEL
Funcii predefinite pentru domeniul statisticii:
CORREL - pentru determinarea coeficientului de corelaie al
unei serii de date bidimensionale
COVAR - pentru determinarea coeficientului de covarian al
unei serii de date bidimensionale
BINOMDIST, CHIDIST, NORMDIST, POISSON furnizeaz
distribuiile de probabilitate binomial, Hi-ptrat, normal,
Poisson.

64