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Introdução
Embora considerando que não existam diferenças fundamentais nas leis que
regem o comportamento dos sistemas vivos e inertes, a complexidade e diversidade dos
sistemas biológicos nem sempre tem permitido a aplicação pura e simples de conceitos
e métodos que foram desenvolvidos para o estudo dos sistemas inertes. Entretanto,
como veremos durante o curso, alguns conceitos da física molecular, da química e da
físico-química, assim como da termodinâmica, se revelaram extremamente úteis no
estudo de propriedades fundamentais dos sistemas biológicos.
H He
Li Be B C N O F Ne
Na Mg Al Si P S Cl Ar
K Ca Se Ti V Cr Mn Fe Co Ni Cuu Zn Ga Ge As Se Br Kr
Rb Sr Y Zr Nb Mo Tc Ru Rh Pd Ag Cd In Sn Sb Te I Xe
Cs Ba La Hf Ta W Re Os Ir Pt Au Hg Tl Pb Bi Po At Rn
Fr Ra Ac
Uma ligação química covalente é definida como sendo a ligação em que pelo
menos um elétron é compartilhado entre dois átomos vizinhos. Interações iônicas são
possíveis quando um átomo, inicialmente neutro, cede um ou mais elétrons a outro
átomo, tornando-se eletricamente positivo enquanto o átomo aceitador torna-se
eletricamente negativo. Outras interações de origem elétrica e magnética são possíveis
entre átomos vizinhos ou próximos. Uma ligação entre dois átomos será covalente ou
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iônica dependendo do caráter dos átomos em questão. Dois átomos não-metálicos irão
formar, em geral, uma ligação covalente. Um metal e um não-metal irão formar, em
geral, uma ligação iônica. O átomo de hidrogênio deve ser visto como um caso
particular, e forma, por exemplo, ligações covalentes com o carbono e o oxigênio.
As moléculas são formadas por átomos unidos por ligações químicas covalentes.
Nestas ligações os elétrons compartilhados são capazes de percorrer órbitas envolvendo
os átomos ligados, estas órbitas compartilhadas são denominadas de orbitais
moleculares. É interessante notar que os orbitais moleculares são direcionados no
espaço definindo uma orientação precisa das ligações químicas no espaço
tridimensional.
H2 H2O
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As moléculas biológicas são formadas por átomos leves da tabela periódica (C,
H, O, N, P, S). Alguns metais, em geral na forma de íons, estão invariavelmente
presentes nas células (Na, K, Ca, Mg). Outros metais mais pesados (Fe, Zn, etc.),
embora em pequenas quantidades, desempenham um papel importante para muitos
organismos. Os átomos de oxigênio e hidrogênio, principalmente devido ao alto
conteúdo de água nas células, são os mais abundantes nos sistemas biológicos.
Aminoácidos:
Onde R representa o grupo específico de cada aminoácido. Note que na fórmula acima,
embora a molécula seja globalmente neutra, os grupos NM3+ e COO- exibem cargas
opostas formando o que se denomina um zwiterion. Os resíduos de amino ácidos
podem se apresentar em formas iônicas ou não, assumindo diferentes comportamentos
físico-químicos, como veremos adiante.
Ácidos Nucleicos
Carbohidratos
Lipídios
3. Interações moleculares
Os ítens ii), iii), iv) e v) podem ser discutidos a partir do i). Vamos discutir então
este ítem em mais detalhe.
Uma teoria mais recente parte da idéia de formação de cavidades nos líquidos
necessárias para solubilizar uma mólecula de um certo tamanho. Neste modelo, a
energia de solubilização é separada em duas partes uma das quais dá conta da formação
de cavidades e outra diz respeito às interações entre soluto e solvente. Este modelo tem
fornecido estimativas numéricas muito boas para solubilidade de gases, e mesmo
moléculas maiores, em diversos líquidos. Pode ser mostrado que moléculas menores
irão gerar com menos facilidade cavidades de tamanhos maiores, o que pode ser
intuitivamente compreendido.
Neste modelo, a baixa solubilidade da água é explicada pelo fato de a água ser
uma molécula pequena, formando, como discutido no parágrafo anterior, cavidades de
tamanho menor. Assim, como a parte relativa à energia de interação entre água e as
chamadas substâncias hidrofóbicas é pequena, predomina a parte da energia de
formação de cavidades.
Muito provavelmente, uma teoria futura tratará de englobar aspectos destas duas
hipóteses mais populares. Existem ainda outros modelos e nuances, os quais não serão
considerados nestas notas.