ЭКОЛОГИИ
И.С. Захаров, А.В. Пожаров, Т.В. Гурская, А.Д. Финогенов
УЧЕБНОЕ ПОСОБИЕ
Министерство Российской Федерации по связи и информатизации
Санкт-Петербургский государственный университет телекоммуникаций
им. проф. М.А. Бонч-Бруевича
Содержание:
Введение
3.1. Оптические
3.1.1 Денситометрические
3.1.2. Колометрические
3.1.3. Спектрометрические
3.1.4. Турбидиметрические и нефелометрические
3.1.5. Рефлектрометрические
3.1.6. Рефрактометрические
3.1.7. Флуктуационные
3.1.8. Флуктуационно - корреляционные
3.1.9. Биолюминометрические
3.1.10. Жидкокристаллические
3.2. Электрохимические
3.2.1. Кондуктометрические
3.2.2. Потенциометрические
3.2.3. Амперометрические
3.3. Гравиметрические
3.4. Калориметрические
3.5. Радиоактивные
3.6. Микроаналитические
3.7. Миктромеханические
Заключение
Приложение
Литература
1. Свойства живого вещества, используемые в
биосенсорных системах (БСС)
1.1. Единство организации
Применение БСС в медицине и экологии возможно в первую очередь благодаря тому, что
разные формы живого обладают единством структурного строения, обмена веществ,
систем жизнеобеспечения и приспособления к окружающей среде.
S + F = P + F,
(1)
Для понимания принципа БСС важно отметить, что субстрат и продукт обладают
различными физико-химическими свойствами (перекись водорода и вода с кислородом).
Для каждой реакции существует свой диапазон кислотности среды, в границах которого
скорость катализа максимальна. Окружающей средой для ферментов может быть как
внешняя среда, так и внутренняя среда живых организмов.
Эффект аккумуляции. Если вещество или элемент из внешней среды способны замещать
другое вещество в обменных процессах, то возникает эффект аккумуляции. Например,
ионы алюминия могут замещать кальций в составе костной ткани, что приводит к
хрупкости костей. Поэтому в современных химических методиках определения
элементного состава среды микроорганизмы используются для концентрирования и
выделения микроэлементов из разбавленных растворов. Плесневые грибы применяют для
избирательного поглощения золота из хлоридных растворов, а также для очистки
растворов от ионов меди, цинка, железа [52].
cвет
(2)
свет
(3)
(4)
Азот очень важен для плодородия почвы, но внесенный в виде химических веществ, он
плохо усваивается растениями. Нитрифицирующие бактерии являются природными
преобразователями азота из неорганической формы в органическую. Бактерии-
нитрификаторы также выполняют в природе важную роль переработчиков аммиака,
образующегося при разложении отмершей органики и различных выделений животных.
Таблица 1
” Трипсин
Клеточное дыхание. При этом виде дыхания выделенная энергия запасается организмом
в виде универсального энергетического носителя – АТФ (аденозинтрифосфата), а
частично рассеивается в виде тепла. Все остальные процессы организма получают
энергию от АТФ, который транспортируется в структуры клетки.
При разложении АТФ в клетке путем гидролиза выделяется энергия. АТФ состоит из
углеродной, азотной и трех фосфатных групп. При гидролизе этого соединения в клетке
происходит отщепление одной или двух фосфатных групп и образование АДФ –
аденозиндифосфата и АМФ – аденозинмонофосфата. При этом выделяется энергия для
жизнедеятельности клетки.
(5)
AH2 + B + F → A + BH2 + F+ ∆ G,
(6)
(7)
Fe 2+ + F → Fe 3++ F + e + ∆ G,
(8)
Аэробное дыхание. Это дыхание, для которого требуется кислород. Оно является
механизмом долговременного получения энергии для организма человека и высших форм
живого.
(9)
Белки используются для дыхания, когда исчерпаны все запасы углеводов и жиров.
Сначала белки гидролизируются до аминокислот, а затем от последних отщепляются
аминогруппы с выделением энергии. В зависимости от природы “углеродных скелетов”
аминокислот дальнейшее окисление происходит по схеме расщепления углеводов или
жирных кислот.
В БСС очень часто используют ферменты митохондрий. Эти органеллы длиной в единицы
мкм, а шириной в десятые доли мкм были обнаружены в клетках еще в конце XIX в., их
удалось выделить из клеток и обнаружить протекание в них окислительно-
восстановительных реакций. Внутри митохондрий под электронным микроскопом
обнаруживаются гребневидные складки, на которых размещены мультиферментные
системы цикла Кребса и железо- и медьсодержащие белковые соединения. Проницаемость
АДФ и АТФ через мембраны осуществляют ферменты транслоказы.
В БСС также используют организмы с аэробным дыханием, например бактерии E. coli (п.
2.2.7) или ферменты, катализирующие реакции аэробного дыхания, такие как фермент
глюкозооксидаза (пп. 2.5.1, 3.2.3).
Анаэробное дыхание. При этом типе дыхания процесс окисления идет в отсутствии
кислорода. Процесс включает гликолиз и спиртовое брожение:
(10)
или молочнокислое:
(11)
Все организмы делятся на два надцарства – прокариотов (не имеющих ядра), к которым
относятся бактерии и сине-зеленые водоросли, и эукариотов (имеющих ядро) – к ним
относятся все организмы, начиная с одноклеточных (например, водоросли, простейшие) и
кончая человеком.
Свойства ДНК и ее синтез. В 60-е гг. из клеток бактерий E.coli был выделен фермент
ДНК-полимераза, позволяющий размножать ДНК, в результате действия которого из
двойной спирали родительской ДНК можно получить пару идентичных спиралей ДНК
[11]. Однако эти цепи нельзя было использовать для синтеза белков, так как двойные
спирали не были связаны между собой. Такое связывание катализирует другой фермент
ДНК-лигаза, обеспечивающий биологическую активность ДНК и возможность синтеза
белков.
Для получения участков исходных цепей ДНК, выделенных из бактерий, применяют
фермент ДНК-рестриктазу (restrict – ограничение), который “узнает” участок ДНК и
катализирует расщепление последовательности нуклеотидов.
Этапы синтеза белка. Белки синтезируются под прямым контролем генетического кода.
Синтез белка происходит в цитоплазме, тогда как генетический носитель (ДНК)
находится в ядре клетки.
Значение ферментов состоит в том, что они образуют набор инструментов для получения
новых ДНК, так как появляются возможности разрезать цепи ДНК, включать новые
фрагменты, присоединять их и копировать.
Передача информации для синтеза естественного белка:
При митозе в результате деления ядра клетки образуются два дочерних ядра с набором
хромосом, идентичным родительским.
Потомство одной особи, полученное путем митоза, называется клоном. Организмы клона
могут иметь заметные генетические различия только в результате мутаций. Это явление
применяется для исследования мутагенности загрязнителей.
(12)
где N – разностная чувствительность; b – абсолютный порог чувствительности сенсора к
стимулу.
Это означает, что живое реагирует на стимул, если его значение превосходит пороговое.
Организмы различают один стимул от другого, если интенсивность одного изменяется не
меньше, чем на определенную долю по отношению к другому: dIi /Ii. В соответствии с
законом Вебера – Фехнера зависимости реакций организмов, как правило, отображаются
графиками с логарифмической шкалой величин стимулов.
Нелинейность восприятия стимула выражается в том, что для сенсорных систем при
увеличении интенсивности стимула снижается способность обнаружения изменений этой
интенсивности, что обусловливает невысокую точность определения стимулов. При
изменении чувствительности на величину dS погрешность определения интенсивности
стимула увеличивается как xdS , где x – основание логарифма. Биологический контроль
целесообразно применять там, где высокая чувствительность живого искупает меньшую
точность измерения стимулов.
В среде нет веществ, которые для организма могут считаться безусловно вредными или
полезными. Все зависит от их концентраций. В конце 90-х гг. XX в. были пересмотрены
взгляды на роль оксида азота (NO), прежде считавшегося только вредным загрязнителем.
Работы Р. Форчготта и соавторов показали, что NO играет важную роль в регуляции
сердечной деятельности и терапевтическое действие нитроглицерина обусловлено тем,
что это лекарство является генератором оксида азота. В организме NO вырабатывается с
помощью фермента NO-синтазы.
Советский физиолог П.К. Анохин, развивая теорию условных рефлексов И.П. Павлова,
установил в 60-е гг. XX в., что высокоорганизованное живое помимо стимульной
воспринимает как сигнальную, так и обстановочную информацию [4]. Выявлено, что
высокоразвитые формы живого реагируют на сложную целенаправленную
последовательность операций, так как их центральная нервная система включает особый
отдел, названный Анохиным “акцептором (собирателем) действий”.
1.4.1. Локомоции
Движение фибрилл происходит за счет энергии, выделяемой при гидролизе АТФ (1.2.2).
Не случайно жгутики сперматозоидов окружены большим числом митохондрий. Важную
роль в регуляции активности движения фибрилл играют мембранные процессы,
связанные с проницаемостью оболочек для ионов Na+, K+, Ca2+, Mg2+. Жгутики и реснички
также являются рецепторами, воспринимающими стимулы из внешней среды (п. 1.3.1). В
отличие от человека, у которого рецепторы находятся в слизистой оболочке, у инфузорий
ими покрыто все тело, что обусловливает высокую хемочувствительность. При
воздействии радиационного излучения на инфузорий они теряют подвижность в
результате выпадения ресничек (аналогично потере волосяного покрова человеком).
Ферментные процессы также оказывают воздействие на характер движения
микроорганизмов. Однако у бактерий и простейших не сформировалась нервная система,
поэтому они могут не реагировать на опасные нервные токсины.
Локомоции насекомых. Они включают два типа движений: ходьбу и полет. Движение
ног при ходьбе и крыльев при полете управляется нервными импульсами, что позволяет
обнаруживать по изменению полета различные наркотические вещества и нейротоксины
(п. 2.3.1).
Чем выше уровень развития организма, тем больше систем и органов оказывают влияние
на его поведенческие реакции, но тем хуже воспроизводимость реакций.
Гибель. Этот процесс может быть как естественным, так и вызванным высокими
концентрациями вредных веществ. Смерть, деградация или гибель включает многие
трудноуловимые этапы последовательной деструкции отдельных систем и структур и до
определенного момента имеет обратимый характер. При контроле смертности
организмов-сенсоров можно зафиксировать лишь наглядные симптомы предлетальных
состояний – обездвиживание организма, потерю важнейших функций.
К сложным принято относить системы с числом элементов более 1011. Структура самой
малой единицы жизни – макромолекулы уже соответствует критериям сложной системы.
Подобные системы проявляют новые свойства, не присущие простым (например
техническим), такие как уникальность, непредсказуемость, способность к
саморазвитию. Свойством уникальности сложной системы объясняется биологическая
изменчивость, характеризующая живое. Свойство непредсказуемости обусловливает
оценку биологических реакций как событий, т. е. явлений, которые могут происходить
или не происходить.
Значение системных свойств. Именно эти свойства являются наиболее стабильными при
вариации биологических параметров элементов. Например, в организме поддерживается
гомеостаз – постоянство состава внутренней среды организма и устойчивость его
основных физиологических функций. Гомеостаз обусловлен сложными регуляторными
взаимодействиями элементов молекулярного, клеточного, органного и организменного
уровней. Таким образом возникает надежность обеспечения функций организма при
ненадежных (гибнущих и вновь размножающихся) элементах с параметрами,
нестабильными за счет биологической изменчивости.
“Живой датчик” меняет чувствительность при адаптации или сенсибилизации. При его
нагреве может денатурироваться клеточный белок или произойти переход к другому типу
размножения, при воздействии излучений может возникнуть мутация организма. Его
реакция зависит от взаимодействия целой группы факторов, отражая множество тонких и
важных изменений в окружающей среде или среде организма.
Например, если необходимо измерять токсичность ионов ртути для инфузорий в соленой
воде с содержанием ионов кальция, то требуется поставить следующие виды контролей:
К1 в соленой, К2 в кальцинированной, К3 в чистой воде.
Особенно важна организация подобных контролей, если на ферментативную реакцию
влияют несколько кофакторов и ингибиторов (пп. 1.1.3, 2.5.1) вместе или по отдельности.
Задача осложняется еще и тем, что многие вещества, запускающие ферментативную
реакцию или подавляющие ее, действуют в микроколичествах, в том числе попадая из
воздуха. Поэтому некоторые реакции, на которые оказывают действие кислород или азот,
проводят в среде инертных газов.
При этом в качестве корма следует использовать или органические вещества строго
определенного состава или организмы, выращенные по определенным методикам.
Таблица 2
Биологические Назначение
объекты
для БСС
Микроскопические Источники (in vivo, in vitro)
водоросли фотосинтезирующих пигментов,
ферментов, макромолекул, корм (in
vivo, in vitro), сенсоры токсичности
(in vivo)
Бактерии, Источники (in vivo, in vitro)
ферментов, пигментов, антибиотиков,
Микрокопические макромолекул, корм (in vivo, in vitro),
грибы сенсоры токсичности (in vivo)
Простейшие То же
(одноклеточные
животные)
Ткани То же
Клетки То же
Органеллы Источники (in vivo, vitro)
(митохондрии, ядра фотосинтезирующих пигментов,
клеток и др.) ферментов (п. 1.2.1)
Ферменты Детекторы (обнаружители) in vitro
макромолекул субстратов,
игибиторов, кофакторов (п. 1.1.3)
Субстраты- Детекторы ферментов (п. 1.1.3)
метаболиты
Цитохромы Биоэлектрические преобразователи
(биологические (in vitro) энергии (п. 1.2.1)
переносчики
электронов)
Фотопигменты Преобразователи воды (in vitro) путем
биофотолиза, биотопливные
элементы, оптические элементы
компьютерной памяти (п. 1.2.1)
G – белки (связанные Искусственные рецепторные
с рецепторами) структуры in vitro (п. 1.3.2)
Ионные каналы Биорегуляторы ионной проводимости
(белки, in vitro (п. 1.3.2)
регулирующие
проводимость)
Месседжеры Искусственные рецепторы и
(переносчики биорегуляторы ионной проводимости
информации в in vitro (п. 1.3.2)
клетку)
Нуклеиновые ДНК-зонды, ослабленные вирусы,
кислоты матрицы для синтеза белков in vitro
(п. 1.2.3)
Антитела Детекторы антигенов различной
природы in vitro, in vivo (1.2.4)
Антигены Детекторы антител различной
природы in vitro, in vivo (1.2.4)
Таблица 3
2.2.2. Культивирование
УФ-излучением обычно стерилизуют воздух помещения. При этом следует учесть, что
недостаточное по мощности излучение может не убивать микроорганизмы, а вызывать
мутации и способствовать размножению.
МПА создается путем добавки в МПБ желатинового вещества агар-агар. МПА удобен тем,
что он не проливается, его легко дозировать для посева.
б) Среды для простейших. Среды для инфузорий представляют собой различные виды
отваров трав (наиболее распространен сенной отвар) или слабоминерализованную воду.
Недаром “инфузории” с лат. означают “наливные”, т. е. появляющиеся в зацветающей
воде. Кормом для инфузорий могут быть бактерии, выращенные на пекарских дрожжах.
Некоторые из простейших (инфузория-туфелька) хорошо растут при комнатной
температуре (18...25 ° С). Поэтому получение таких инфузорий возможно в условиях
неспециализированных лабораторий без сложных аппаратов для стерилизации, что
облегчает разработку БСС с использованием инфузорий.
Обычно из них берут и хорошо изученные организмы в целях разработки БСС. При
описании экспериментов с БСС всегда должен быть указан источник, откуда взяты
организмы.
Синтез белка используют для получения нужных ферментов или для передачи клеткам
бактерии гена выработки этих ферментов.
Недостатком данного типа БХП является трудность оценки влияния на них отдельных
веществ в биологических или природных средах.
БХП этого типа используют для выявления вредных веществ. По различию характеристик
прироста в опыте и контроле (п. 2.1) определяют предельную концентрацию вещества,
обнаруживаемую организмами ( рис. 2.). Для оценки токсичности в питательные среды с
микроорганизмами вводят не только растворы исследуемых химических веществ, но и
экстракты, извлекаемые с помощью растворителей из тканей, почв и т.п.
Рис. 2. Характеристики БХП с микроорганизмами [53]
Это свойство БХП используется в БСС для оценки токсичности воды и почвы. После
помещения сухих дрожжей (Sacharomyces cerevisae) в пробу воды защелачивание пробы
указывает на отсутствие в ней токсикантов [39]. При взаимодействии питательной среды с
токсикантом возникает ее закисление, что выявляется в результате измерения рН
(п. 3.2.4).
Таблица 4
Этологические реакции организмов как БХП (п. 1.4). Можно выделить БХП данного
типа с несколькими тест-реакциями.
Среди перспективных организмов для БХП на основе таксисов можно назвать водоросль –
ряску. Она реагирует на химические вещества сразу за счет нескольких биологических
механизмов: как изменения цвета фотосинтетических пигментов (пп. 1.2.1, 2.5.4), так и
фототаксиса листьецов (маленьких листочков) – их схождения или расхождения на
поверхности воды. Это позволяет не только обнаруживать вредные вещества, но и
дифференцировать их по механизмам воздействия на живое.
Особенность БХП на основе иммобилизованных организмов (п. 2.2.6) состоит в том, что
они, помещенные в гель или в пористый материал, часто находятся в состоянии
субстратного голода.
В этом случае для уменьшения потребления энергии в клетках снижается уровень обмена
веществ, а основным путем воздействия стимула является его диффузия из внешней среды
через стенки клеток и их последующее ферментное преобразование. Поэтому реакция
БХП на основе иммобилизованных организмов более медленная, чем у подвижных клеток
в питательной среде [22].
Цисты используют в БСС для оценки качества кормового белка (п. 2.3.1). Важным
преимуществом инцистирования инфузорий является то, что они покидают свои цисты на
одной и той же стадии развития, что улучшает воспроизводимость результатов
эксперимента [8].
2.4. Методы подготовки структур организмов
РВ по заряду. Белки обладают зарядом (п. 1.1.2), величина и знак которого меняются в
зависимости от кислотности среды. Этот эффект лежит в основе электрофореза –
разделения белков по знаку заряда при приложении высокого постоянного напряжения к
среде с известным рН, содержащей белки. В этом случае разноименно заряженные белки
движутся к разным электрическим полюсам.
Принцип аффинной хроматографии состоит в том, что смесь белков, например, капля
крови иммунизированного животного, в которой находятся белки-иммуноглобулины
(антитела) пропускается через колонку с полисахаридными шариками, к которым
прикреплены определенные антигены (п. 1.2.4). Они связывают из всех белков только
специфические антитела, т. е. иммуноглобулины, которые имеют наибольшее сродство к
данным антигенам. Связанные антитела затем вымывают из колонки кислым или
щелочным раствором. Один цикл аффинной хроматографии позволяет очистить белки в
1000 раз и более (выделить 1 вид белка из 1000).
Для расширения круга объектов аффинной хроматографии было изучено, какие объекты
могут являться антигенами. Оказалось, что антигенами могут быть клетки
микроорганизмов, вирусы, белки, полисахариды. Они называются полноценными, так как
вызывают выработку антител сами по себе. Были открыты неполноценные антигены
(гаптены), которые сами не вызывают появления антител, но если их осадить на белок
или биополимеры, то они становятся иммуногенными. Таким способом получают
антитела к антибиотикам, витаминам, гормонам, лекарственным препаратам. Для
выделения подобных антител их пропускают через колонку с гаптенами, осажденными на
гормонах и других веществах, превращенных в антигены.
2.4.3. Модификация
2.5.1. Ферменты
Ферменты можно наносить в виде простейшего БХП на бумагу, вносить в состав мембран
на гелевой или иной основе или применять в виде экстрактов [22, 46].
(14)
(15)
(16)
(17)
люциферин+ АТФ +F →
(18)
(19)
(20)
Таблица 5
Состав и свойства светящихся смесей некоторых организмов [16]
Положение
максимума
Груп Организм Реагирующие интенсивно
па соединители сти
излучения
(область)
I Медуза белок + Са++ синяя
(Aeguorera)
II Усоногие H2O2 + LH2 + E голубая
рачки
(Balanoglossus
biminiensis)
III Рыба O2 + LH2 + E 460
(Apagon)
O2 + LH2 + E синяя
Простейшие
(Gonyaulax)
Ракообразные
(Cypridina) O2 + LH2 + E 460
IV Грибы O2 + LH2 + E+ДПН –
(Collibia и Н
Armillaria)
или
ТПН – Н
Светящиеся
насекомые O2 + LH2 + E + АТФ 562
VI Бактерии O2 +LH2+E+ФМН– 405
(Ahromobacter
и другие)
то же + лецитин
то же +
аминокислоты
S + F1 + K + I = P1 + F1 = P2 + F1 +F2,
(21)
• выявлять субстрат-метаболит S;
• измерять активность ферментов по поглощению S или образованию P1 и P2;
• выявлять кофакторы K, запускающие работу фермента;
• выявлять ингибиторы I, подавляющие активность ферментов;
• выявлять цепочки взаимодействия ферментов.
В качестве примера можно привести другой БХП [7] на основе ацетилхолинэстеразы (F1)
Для оценки активности этого важного фермента используется цепь реакций, приводящая к
образованию пероксида водорода:
(22)
(23)
Для БХП используют гомогенаты (измельченные ткани, п. 2.4.2) или срезы тканей в
питательной среде, фиксируя их в полупроницаемой пленке (например нейлоновой) на
поверхности измерительного преобразователя – ИП (разд. 3). Иногда измельченные
частицы включают в порошки, пасты, гели. В результате ферментативной реакции,
протекающей в ткани, выделяются вещества, концентрация которых определяет величину
выходного сигнала ИП, в качестве которого чаще всего используется газочувствительный
датчик (п. 3.2.4, 3.2.5). В гибридных БХП, кроме ткани, иммобилизованы еще и ферменты.
Тканевые БХП для отдельных веществ. В табл. 6 приведены примеры подобных БХП
для определения различных веществ.
Зависимость скорости образования продукта от концентрации субстрата нелинейна, если
количество фермента постоянно (п. 1.1.3). В табл. 6 приведен диапазон концентраций, при
котором сохраняется линейная зависимость между концентрацией измеряемого и
количеством выделяемого или потребляемого вещества в процессе ферментативной
реакции. Время работы БХП – это время сохранения им линейного отклика на
анализируемое вещество.
Таблица 6
моноаминоксидаза
Аскорбино Сок огурца / О2 , П, вода 2,5× 10–4... 3 ... 6 мин / Витамин
вая кислота В –
аскорбатоксидаза 1,6× 10–3
Дофамин Мякоть банана / О2, П 1,3× 10–6... 12 с /10 дн Вещество,
дейсвующее на
полифенолоксидаза нервную
9× 10–5 систему
Тирозин Срез сахарной О2, В – /8 дн Аминокислота
гормонов
свеклы / (инсулина и
др.)
тирозиназа
БХП для выделения веществ из смесей. Существенно, что с помощью тканевых БХП
возможно выделять вещество из смесей. БХП на основе тканей корней хрена позволяет по
разложению H2O2 определять концентрацию перекисей не только в водных растворах, но
и в органических растворителях. Аскорбиновую кислоту с помощью тканей растений
можно определять в смесях органических кислот, фенолов, аминокислот и глюкозы.
Клетки лейкоцитов возможно получать лабораторным методом (п. 2.4.1), поэтому в 1971
г. Международная организация здравоохранения при ЮНЕСКО рекомендовала для
анализа мутагенных эффектов загрязнителей (в том числе сельскохозяйственных ядов)
метод изучения структурных мутаций хромосом с помощью клонов лейкоцитов.
Свойства ДНК, применяемые в БХП [3, 13]. Двойная цепь нуклеотидов, не свернутая в
трехмерную структуру, позволяет наблюдать и контролировать следующие тест-реакции:
При формировании БХП можно использовать следующие тест-реакции [32, 33] комплекса
антиген-антитело:
1) культивирование, очистка (п. 2.4.2) антигена Aг, например вирусного белка, который
должен иметь сродство не менее чем к двум классам антител;
(24)
(АтП);
(Аг +Ат+ Е)
(Аг+ АтП);
*(Аг + Ат + Е)
°(Аг+ АтП)
*(Аг + Ат + Е) + S = *(Аг + Ат + P) + E,
(25)
°(Аг+ АтП) + S;
PP P P P P P;
Реагенты для проведения ИФА сегодня стали коммерческими продуктами и могут быть
приобретены по каталогам известных фирм.
3.1. Оптические
3.1.1. Денситометрические
D = –lg(Фпр/Ф0),
(26)
3.1.2. Колориметрические
D = C ε b,
(27)
ИП этого типа применяют в БСС для оценки переработки углерода, в котором в качестве
БХП используются ферменты аэробных бактерий (п. 1.2.2), перерабатывающие
соединения углерода с выделением продукта СО2. Индикатор на основе раствора Ba(OH)2
образует с продуктом БХП цветной раствор соли.
3.1.3. Спектрофотометрические
Эти ИП применяют в БСС для оценки воздействия загрязнений воды на фотосинтез (п.
1.2.1). В этом случае используется БХП на основе фотосинтезирующего пигмента
(хлорофилла-а), выделенного из тканей растений (п. 2.5.3). С помощью ИП измеряют
спектр поглощения пигментом видимого света [43].
ИП могут также применяться в БСС для оценки метаболизма (п. 1.1.3) с БХП на основе
ферментов (п. 2.5.1), когда различны спектры поглощения субстрата и продукта
ферментативной реакции.
БО в питательной среде при падении на них светового потока создают эффект рассеяния.
При прохождении через мутную среду с большой концентрацией БО световой поток
ослабляется. Чем более мутная среда (т. е. чем больше концентрация в ней БО), тем
меньше проходящий через нее поток излучения.
3.1.5. Рефлектометрические
(28)
(1 – ρ БО )2/ 2ρ БО = χ /σ ,
(29)
3.1.6. Рефрактометрические
∆ Ф= k (nс – nв),
(30)
D = α вL + f (α ИК с),
(31)
Поверхностный плазмонный резонанс [3, 25, 56, 59, 60]. Эффект НПВО в треугольной
призме при падении инфракрасного излучения на ее основание проявляется, если оно
покрыто тонкой пленкой металла или полупроводника, на которой возникают плазмоны –
квантовые колебания поверхностных зарядов.
3.1.7. Флуктуационные
mT =Λ T = kC,
(32)
(33)
где коэффициент К зависит от параметров ИП и времени усреднения T, а α =SБО b,
поскольку характер экспоненциальной зависимости такой же, как и при измерении
полезного сигнала турбидиметра (п. 3.1.4).
Данный метод применен [17] в БСС типа «БИОТЕСТЕР» для оценки токсичности водных
сред с БХП на основе хемотаксиса инфузорий P.caudatum (п. 2.3.1).
3.1.8. Флуктуационно-корреляционные
S (ω ) = S1 (ω ) + S2 (ω ).
(34)
S1 (ω )= f (ω , v1, ∆ N ),
(35)
S2 (ω ) = f (ω , v2, Q),
(36)
Мп = ACv1,
(37)
3.1.9. Биолюминометрические
QM – QN = hc/λ MN ,
(38)
энергетическим выходом:
η эн = Фл/Фв,
(39)
η кв = Nл /Nв,
(40)
Iхл = vхл× η ×η
мв кв л ,
(41)
(42)
б) Приборы для оценки токсичности воды и почвы. Фирмами Beckman и Microbics на базе
люминесцентного ИП спроектирована БСС «Microtox», в которой для оценки загрязнения
воды применен БХП со светящимися морскими бактериями. Их люминесценция
подавляется токсичными веществами.
3.1.10. Жидкокристаллические
3.2. Электрохимические
Э ЭД Э Э
л ли лл
еес ее
к кс кк
тто тт
р рц рр
о ои оо
нли лн
н ир ин
ыт у т ы
й ю й
Вщ D
п е п
р е р
о в о
в е в
о щ о
д е д
н с н
и т и
к в к
о
А E
C
3.2.1. Кондуктометрические
Сопротивление ячейки измеряется путем уравновешивания плеч моста Вина, когда ток в
диагонали моста равен нулю.
G = f (∑z i С i µ i ),
(43)
GВ = f (CБО,γ БОi /γ с, µ ),
БО
(44)
(45)
3.2.2. Потенциометрические
E = E0 – (RT/zF) lnQ,
(46)
Наиболее распространен рН– электрод, селективный к ионам водорода (pH = –lg[H+], где
[H+] – активность ионов водорода). Если определяется только один вид иона и существует
электрохимическое равновесие между электродом и раствором, то при стандартных
условиях потенциал электрода (46)
E = E0 + 0,05915 lg[H+]
(47)
(48)
(49)
На границе затвора образуется слой ионов водорода, которые приводят к изменению тока
стока транзистора. В присутствии кислорода атомы водорода вступают в реакцию, что
уменьшает толщину их слоя, поэтому с помощью транзистора можно измерять
концентрацию как водорода, так и кислорода.
Электрод погружают в аналит (п. 3.2) и через 30–60 мин фиксируют изменение pH. С
помощью таких электродов можно оценивать активность соответствующих ферментов и
воздействие на нее загрязнений среды. Недостатком их является малый срок службы –
около 100 ч.
Таблица 7
3.2.3. Амперометрические
Толщина слоя L считается постоянной. Для выделения одного вида иона применяют ион-
селективные мембраны.
i Д = zF Aэ DC /L,
(50)
За счет одного процесса диффузии ток нарастает крайне медленно. Чтобы увеличить
скорость электрохимической реакции, перемешивают аналит или вращают электроды, в
результате чего уменьшается толщина диффузионного слоя L. Это особенно важно в
случае использования веществ с малыми скоростями диффузии. Диффузионный ток iд для
вязких органических соединений:
iд = k ν –5/6
,
(51)
ИП для этой цели (электрод Кларка, рис. 11, [6]) состоит из из следующих элементов:
I = κ C,
(52)
Таблица 8
Глюкозоанализаторы [3]
Фи Д О Ч ПС
рм и б а от
а, а ъс -а
пр п е т гб
иб а м о ри
ор з т е л
о п а шь
н р нн
о и оо
к б з сс
о ым т т
н , е ьь
ц р,
е ме
н кн%
ли
т й
р ,
а п
ц р
и о
й б
, /
ч
м
м
о
л
ь
/
л
Неавтоматиз
ированные
анализаторы
«Э 0 5 6 5
кса , 0 0
н 5
Г» .
Рос .
сия .
3
0
Yel 0 2 4 2 3
low , 5 0 0
Spr 5 0
ing .
s . и
Inst . з
ru 5 м
me 0 е
nts р
(С е
Ш н
А), и
й
мо
дел
ь
23
А
Ser 1 26 5
es . 00 0
(Ф . 0 0
ран .
ци 2 и
я), 2 з
м
En е
zy р
mat е
н
и
й
Sol 0 21
ea- , 0
Tac 0 0
uss 0 0
el 0
(Ф 1 и
ран . з
ци . м
я), . е
1 р
гл , е
юк 0 н
озн и
ый й
эле
ктр
од
Ho 2 1 t 1 8
ffm , 0 и ,
an . 0 з 5 н
la 5 м е
Ro . д
she . 6 .
(Ш . 0
вей 2
цар 7 с
ия) ,
5
Гл
юк
озо
ана
лиз
ато
р
541
0*
Fuj 0 2 2 35
i . 00 0
Ele . 0
ctri .
c 2 и
(Я 7 з
по м
ни е
я), р
е
Glu н
co и
20 й
A
An 0 2 1 2
alyt . 0 2 ,
ical . . 0 0
inst . . .
ru 5 . .
me 5 4 .
nts , 0 1
(Я 5 5
по 0
ни
я)
Glu
cor
der
-E
Автоматичес
кие
проточные
анализаторы
Dai 1 1 1
ichi . 0 .
(Я . 0 0
по . .
ни 4 .
я), 0 .
2
Aut 5
o& 0
Sta
t
GA
111
0
Ка 0 6 3 3
рло . 0, 0
в 0 5
ун 0 д
иве 6 н
рси . .
тет .
(Че .
хия 5
) ,
0
Приборы
непрерывног
о действия
Lif д 2 5 5
e о 0
Sci м
enc 2 и ч
e 7 н
Inst ,
r, 5
Div
.
Mil
es
(С
Ш
А,
Би
ост
ато
р
GC
IIS
Ун 2 3
иве ,
рси 8 д
тет 5 н
г. . .
Ос .
ака .
, 2
ме 2
ди ,
ци 0
нск
ий
фа
кул
ьте
т
3.3. Гравиметрические
(53)
Чаще всего для измерения частоты используют подсчет периода колебаний с помощью
сверхбыстрых счетчиков. Информативным параметром является отличие распределения
частоты от нормального распределения.
3.4. Калориметрические
При некоторых ферментативных реакциях [3] выделяется 25...100 кДж/моль тепла (п.
2.5.1) Обычно это величина зависит от типа реакции и достаточно стабильна. Выделенное
тепло расходуется на нагрев поверхности, на которой иммобилизован фермент, или на
нагрев среды, контактирующей с продуктами реакции.
(54)
Таблица 9
каталаза
Мочевина Уреаза 0,01...500 ммоль/л
Мочевая кислота Уриказа 0,05...4 ммоль/л
Определение растворимых ферментов
Мочевина Уреаза (растворимая) 0,1...100 ед/мл
H2O2 Каталаза (растворимая) 0,1...100 ед/мл
Иммунологический анализ
Инсулин (антиген) Иммобилизованные тела, 0,1...50 мкг/л
меченные ферментом
Альбумин (антиген) То же 10–10 моль/л
Контроль ферментативных процессов
Лактоза Лактаза+глюкозоксидаза + 0,05...10
каталаза
Пенициллин Пенициллиназа 0,05...500
Этанол Алкогольоксидаза 0,01...1
3.5. Радиоактивные
3.6. Микроаналитические
К ним относятся, например, БСС для анализа белкового состава веществ, включающие
устройства для микроэлектрофореза (п 2 4.2) и флуоресцентного анализа (пп. 2.5.1, 2.5.2,
3.1.9), выполненные на одном кристалле [64]
3.7. Микромеханические
4. Особенности конструирования и
эксплуатации биосенсорных систем
4.1. Обобщенная структура биосенсорной системы
Пробы для экологических анализов отбирают из воды, донных осадков или воздуха
специализированными пробоотборниками и обычно хранят в емкостях из пластика или в
стеклянных сосудах. Следует учитывать, что не пищевой полиэтилен и пробки из
вулканизированной резины (с содержанием серы) выделяют вещества, токсичные для
организмов.
Линия подготовки биообъекта (БО) может существенно влиять на результаты БСС, если
не соблюдены правила культивации клеток или выделения и модификации клеточных
структур (пп. 2.2.2, 2.4).
Блок ПИП может негативно воздействовать на БХП за счет вредного влияния как
основных конструкционных материалов ПИП – меди, латуни, бронзы, свинца, железа и
т. п., так и вспомогательны – клеев, лаков, красок, растворителей, гальванических
покрытий. Изменение реакции живого может возникнуть даже при кратковременном
контакте некоторой части БО с этими материалами. Излучения ПИП могут изменять
поведение или ухудшать жизнеспособность биообъектов (п. 1.4, 1.5).
БВИП позволяет выделять сигнал БХП на фоне помех. Полезный сигнал ИП обычно
представляет собой сверхмалые величины (разд. 3). Это требует применения современных
схем усилителей, детекторов, фильтров и др. Их качество существенно влияет на
результат измерения реакций живого.
Для обработки данных БСС как сложных систем (п. 1.6) используется математический
аппарат теории вероятностей: случайных событий, случайных величин, случайных
процессов. Для описания изменения случайных величин неслучайными функциями
применяются регрессионные модели, а выявление взаимосвязей между случайными
величинами оценивается с помощью коэффициентов корреляции.
БСПС требуется для работы БСС тогда, когда скорость роста организма, возникновение
реакции биообъекта или ее измерение зависят от различных внешних условий.
Линия подготовки пробы (обычно крови пациента) включает блоки для взятия пробы
крови, заполнения и маркировки проб, что исключает опасность перепутать ячейки
планшета.