Génie biologique EVALUATION DE FIN DE MODULE ECOLOGIE MICROBIENNE Calculatrice non autorisée Document annexe p2 : la cellule de Mallassez Une étude de la diversité des microorganismes au niveau de la rhizosphere de la plante Miscanthus est réalisée. On préléve la terre autours des racines de maniére stérile et on stocke 'échantillon & basse température, Les techniques utilisées pour cette étude sont ARDRA et la TGGE. 1) Expliquer & V’aide d'un schéma annoté le principe de la technique de 'ARDRA (depuis léchantillon de base). Le schéma sera réalisé sur une page ENTIERE. 2) Expliquer a aide d’un schéma annoté le principe de la technique de la TGGE. Le schéma sera réalisé sur une page ENTIERE. 3) Réaliser un tableau de deux colonnes. Dans la premiere colonne, donner le nom de toutes les techniques d’analyse moléculaire de la diversité microbienne. Dans la deuxieme colonne, indiquer quel est le principe de séparation des molécules sur le gel (conformation ~ séquence ~ taille... Parallélement, on réalise un dénombrement selon la technique de 'ensemencement en masse. Un échantillon de terre de 1g est remis en suspension dans de Yeau stérile (9 mL) puis vortexé pour détacher les bactéries. On considére que 1g de terre équivaut 4 1 mL. On réalise & partir de ce tube (appelé 10°) des dilutions en cascade au 1/10 jusqu’a 10°. On réalise un comptage en Cellule de mallassez de la dilution au 10° de maniére a choisir les dilutions ensemencer. roint le résultat du comptage : = nombre de périmétre de comptage = 10 * nombre de bactérie dénombrées = 200 4) Calculer la concentration en bactérie/mL. dans le tube 10°. Donner la formule littérale vous permettant de faire ce calcul ainsi qu'un lexique. 5) Calculer la concentration théorique en bactérie/g dans le sol. Donner la formule littérale vous permettant de faire ce calcul ainsi qu'un lexique. 6) Déterminer quelles sont les 3 dilutions successives & ensemencer de maniére & obtenir pour la dilution centrale entre 30 et 300 colonies (par ensemencement en masse). 7), Réaliser un schéma type « protocole de TP » permettant de résumer cette analyse microbiologique Lors de l'analyse, on constate la présence de nodule sur les racines de la plante. Aprés examens microscopiques, on en déduit qu’une bactérie du genre rhizobium est présente a Vintérieur des nodules. 8) Donner les principales caractéristiques du genre rhizobium 9) Expliquer de quelle maniére cette bactérie participe au cycle de azote 10) Sur un schéma annoté, expliquer quelles sont les réactions métaboliques impliquées dans ce processus. Indiquer avec une couleur les réactions ou molécules provenant de fa plante et avec une autre couleur les réactions réalisées par la bactérie 11) Quel type d'interaction (se référer au chapitre III) se met en place entre la plante et rhizoblum 2 12) Citer une autre association entre un microorganisme et un végétal 1 Schneider M.