Aminocido

Estrutura geral de um Aminocido. Um aminocido uma molcula orgnica que contm um grupo amina e um grupo carboxila. Alguns aminocidos tambm podem conter enxofre. A forma mais importante dos aminocidos, os alfa-aminocidos, que formam as protenas, tem, geralmente, como estrutura um carbono central (carbono alfa, quase sempre quiral) ao qual se ligam quatro grupos: o grupo amina (NH2), grupo carboxlico (COOH), hidrognio e um substituinte caracterstico de cada aminocido. Os aminocidos se unem atravs de ligaes peptdicas, formando os peptdeos e as protenas. Para que as clulas possam produzir suas protenas, elas precisam de aminocidos, que podem ser obtidos a partir da alimentao ou serem fabricados pelo prprio organismo. Os aminocidos podem ser classificados nutricionalmente, quanto ao radical e quanto ao seu destino.

Classificao nutricional
Aminocidos no-essenciais
Aminocidos no-essenciais ou dispensveis so aqueles que o corpo humano pode sintetizar. So eles:alanina, asparagina, cido asprtico, cido glutmico, serina.

Aminocidos essenciais
Aminocido essencial Os aminocidos essenciais so aqueles que no podem ser produzidos pelo corpo humano. Dessa forma, so somente adquiridos pela ingesto de alimentos, vegetais ou animais. So eles: fenilalanina, isoleucina, leucina, lisina, metionina, treonina, triptofano, histidina e valina.

Aminocidos essenciais apenas em determinadas situaes fisiolgicas

Aminocidos condicionalmente essenciais so os aminocidos que devido a determinadas patologias, no podem ser sintetizados pelo corpo humano. Assim, necessrio obter estes aminocidos atravs da alimentao, de forma a satisfazer as necessidades metablicas do organismo. So eles: arginina, cistena, glicina, glutamina, prolina, tirosina.

Classificao quanto ao substituinte

A classificao quanto ao substituinte pode ser feita em: Aminocidos apolares: Apresentam como substituintes hidrocarbonetos apolares ou hidrocarbonetos modificados, exceto a glicina. So substituintes hidrofbicos. Alanina: CH3- CH (NH2) - COOH Leucina: CH3(CH2)3-CH2-CH (NH2)- COOH Valina: CH3CH(CH3)-CH (NH2)- COOH Isoleucina: CH3-CH2-CH (CH3)-CH (NH2)- COOH Prolina:-CH2-CH2-CH2- ligando o grupo amino ao carbono alfa Fenilalanina: C6H5CH2-CH (NH2)- COOH Triptofano: R aromtico- CH (NH2)- COOH Metionina: CH3S-CH2-CH2- CH (NH2)- COOH Aminocidos polares neutros: Apresentam substituintes que tendem a formar ligao de hidrognio. Glicina: H- CH (NH2) - COOH Serina: OH-CH2- CH (NH2)- COOH Treonina: OH-CH (CH3)- CH (NH2)- COOH Cisteina: SH-CH2- CH (NH2)- COOH Tirosina: OH-C6H4-CH2- CH (NH2)- COOH Asparagina: NH2-CO-CH2- CH (NH2)COOH Glutamina: NH2-CO-CH2-CH2- CH (NH2)- COOH Aminocidos cidos: Apresentam substituintes com grupo carboxlico.So hidrfilos. cido asprtico: HCOO-CH2- CH (NH2)- COOH cido glutmico: HCOO-CH2-CH2CH (NH2)- COOH Aminocidos bsicos: Apresentam substituintes com o grupo amino. So hidrfilos Arginina: {{{1}}}- CH (NH2)- COOH Lisina: NH3-CH2-CH2-CH2-CH2- CH (NH3)COOH Histidina: H-(C3H2N2)-CH2- CH (NH2)- COOH

Aminocidos alfa
Frmula geral
So aqueles que apresentam frmula geral: R - CH (NH2)- COOH na qual R uma cadeia orgnica. No aminocido glicina o substituinte o hidrognio, O carbono ligado ao substituinte R denominado carbono 2 ou alfa.

Simbologia e nomenclatura

Na nomenclatura dos aminocidos, a numerao dos carbonos da cadeia principal iniciada a partir do carbono da carboxila. Observao: A numerao dos carbonos da cadeia principal pode ser substituda por letras gregas a partir do carbono 2 () Exemplo: cido 2-amino-3-metil-pentanoico = cido -amino--metil-pentanico.

Estrutura

Alanina (Ala / A)

Arginina (Arg / R)

Asparagina (Asn / N)

cido asprtico (Asp / D)

Cisteina (Cys / C)

cido glutmico (Glu / E)

Glutamina (Gln / Q)

Glicina (Gly / G)

Histidina (His / H)

Isoleucina (Ile / I)

Leucina (Leu / L)

Lisina (Lys / K)

Metionina (Met / M)

Fenilalanina (Phe / F)

Prolina (Pro / P)

Serina (Ser / S)

Treonina (Thr / T)

Triptofano (Trp / W)

Tirosina (Tyr / Y)

Valina (Val / V)

Taurina

Estrutura tridimensional
Aminocidos apolares H um grupo de aminocidos com cadeia laterais apolares. Desse grupo fazem parte a alanina, a glicina, a valina, a leucina, a isoleucina, a prolina, a fenilalanina, o triptofano e a metionina. Em vrios elementos do grupo - isto , a alanina, a valina, a leucina, e a isoleucina - a cadeia lateral um grupo hidrocarboneto aliftico. A prolina tem uma estrutura cclica aliftica e o nitrognio est ligado a dois tomos de carbono. Na terminologia de qumica orgnica, o grupo amina da prolina uma amina secundria. Em contraste os grupos amina de todos os outros aminocidos so aminas primrias. Na fenilalanina, o grupo hidrocarboneto aromtico(contm um grupo cclico semelhante ao anel de benzeno) em vez de aliftico. No triptofano, a cadeia lateral contm um tomo de nitrognio adicionado ao grupo hidrocarboneto aliftico.

Glicina (Gly / G)

Alanina (Ala / A)

Leucina (Leu / L)

Isoleucina (Ile / I)

Valina (Val / V)

Metionina (Met / M)

Prolina (Pro / P)

Fenilalanina (Phe/Fen/F)

Triptofano (Trp / Tri / W) Aminocidos polares neutros

Este grupo de aminocido tem cadeias laterais polares eletricamente neutras (sem cargas) em pH neutro. Este grupo inclui a serina, a treonina, a tirosina, a cistena, a glutamina, e a asparagina. Na serina, e na treonina, o grupo polar uma hidroxila (-OH) ligadas a grupos hidrocarboneto alifticos. O grupo hidroxila na tirosina ligado a um grupo hidrocarboneto aromtico, o qual eventualmente perde um prton em pHs mais altos.

Asparagina (Asn / N)

Cisteina (Cys / Cis / C)

Glutamina (Gln / Q)

Serina (Ser / S)

Treonina (Thr / The / T)

Tirosina (Tyr / Tir / y) Aminocidos polares cidos Dois aminocidos, o cido glutmico e o cido asprtico, possuem grupos carboxila em suas cadeias laterais, alm daquele presente em todos os aminocidos.

cido asprtico (Asp / D)

cido glutmico (Glu / E) Aminocidos polares bsicos H trs aminocidos (a histidina, a Lisina e a Arginina) que possuem cadeias laterais bsicas, e em todos e eles cadeia lateral carregada positivamente em pH neutro ou perto dele.

Arginina (Arg / R)

Histidina (His / H)

Lisina (Lys / Lis / K)

Classificao quanto ao destino

Essa classificao dada em relao ao destino tomado pelo aminocido quando o grupo amina excretado do corpo na forma de uria(mamferos), amnia(peixes) e cido rico(Aves e rpteis).

Destino cetognico
Quando o lcool restante da quebra dos aminocidos vai para qualquer fase do Ciclo de Krebs na forma de Acetil coenzima A ou outra substncia. Os aminocidos que so degradados a acetil-coa ou acetoacetil-coa so chamados de cetognicos porque do origem a corpos cetnicos. A sua capacidade de formao de corpos cetnicos fica mais evidente quando o paciente tem a diabetes melitus, o que vai fazer com que o fgado produza grande quantidade dos mesmos.

Destino glicognico
Quando o lcool restante da quebra dos aminocidos vai para a via glicoltica. Os aminocidos que so degradados a piruvato, a-cetoglutarato, succinil-coa, fumarato ou oxaloacetato so denominados glicognicos. A partir desses aminocidos possvel fazer a sntese de glicose, porque esses intermedirios e o piruvato podem ser convertidos em fosfoenolpiruvato e depois em glicose ou glicognio. Do conjunto bsico dos 20 aminocidos, os nicos que so exclusivamente cetognicos so a leucina e a lisina. A fenilalanina, triptofano, isoleucina e tirosina so tanto cetognicos quanto glicognicos. E os aminocidos restantes (14) so estritamente glicognicos (lembrando que o corpo pode gerar Acetil-Coa a partir da glicose)..

Ocorrncia
Os aminocidos alfa ( cerca de vinte ) so constituintes de todas as protenas e peptdeos, portanto, de toda a matria viva. Todos os aminocidos constituintes das protenas so alfa aminocidos. As protenas so alfa-polmeros formados por alfa-aminocidos. Alguns autores relatam que para formar uma protena necessrio uma cadeia com mais de 50 aminocidos. Uma cadeia formada por dois alfa aminocidos um dipeptdeo, at 50 alfa-aminocido um polipeptdeo. Fixao de nitrognio A fonte primria de nitrognio para os seres vivos o nitrognio atmosfrico, que tem que ser convertido a uma forma metabolizvel como a amnia. Mas s algumas bactrias conseguem converter nitrognio em amnia. A converso de nitrognio a amnia, chamada de fixao de nitrognio, feita por um sistema enzimatico complexo, denominado nitrogenase, que utiliza NADPH como doador de eltrons e s processado com um consumo muito grande de ATP.

Isomeria
Os dois enantimeros da Alanina, D-Alanina e L-Alanina. Com exceo nica da glicina, todos os aminocidos obtidos pela hidrlise de protenas em condies suficientemente suaves apresentam atividade ptica. Esses aminocidos apresentam 4 grupos diferentes ligados ao carbono central, ou seja, esse carbono assimtrico, assim esse carbono chamado centro quiral. A existncia de um centro quiral permite que esses aminocidos formem esteroismeros devido aos diferentes arranjos espaciais pticamente ativos. Dentre os esteroismeros existem aqueles que se apresentam como imagens especulares um do outro sem sobreposio, a estes chamamos enantimeros. Os enantimeros podem ser D ou L, sendo essa classificao referente semelhana com a estrutura do aminocido D-gliceraldedo e do L-gliceraldedo, respectivamente. Somente os L-aminocidos so constituintes das protenas.

Sntese
Todos os aminocidos so derivados de intermedirios da gliclise, do ciclo do cido ctrico ou das via das pentoses-fosfato. O nitrognio entra nessas vias atravs do glutamato. H uma grande variao no nvel de complexidade das vias, sendo que alguns aminocidos esto a apenas alguns passos enzimticos dos seus precursores e em outros as vias so complexas, como no caso dos aminocidos aromticos. Os aminocidos podem ser essenciais ou no-essenciais.

Os aminocidos no-essenciais so mais simples de serem sintetizados e o so produzidos pelos prprios mamferos. Por isso eles no necessariamente precisam estar na alimentao. J os aminocidos essenciais precisam estar presentes na dieta, j que no so sintetizados pelos mamferos.

As biossintticas de aminocidos so agrupadas de acordo com a famlia dos precursores de um deles. Existe a adio a esses precursores do PRPP (fosforribosil pirofosfato). As principais famlias so: 1. A do alfa-cetoglutarato que origina o glutamato, a glutamina, a prolina e a arginina. 2. A do 3-fosfoglicerato de onde so derivados a serina, a glicina e a cistena. 3. O oxaloacetato d origem ao aspartato, que vai originar a asparagina, a metionina, a treonina e a lisina. 4. O piruvato dar origem a alanina, a valina, a leucina e a isoleucina.

Obteno
Hidrlise de protenas As protenas so molculas formadas por at milhares de aminocidos unidos por ligaes peptdicas (que ocorre entre a carboxila de um aminocido e o grupo amino de outro). Essas ligaes podem ser quebradas por hidrlise produzindo uma mistura complexa de aminocidos. Sntese Sntese de Hoffmann, sntese de Strecker e sntese de Gabriel so mtodos sintticos para a obteno de alfa-aminocidos.

A condensao de dois aminocidos para formar uma ligao peptdica

Ionizao
Os aminocidos so substncias anfteras, ou seja, pode atuar como cidos ou como bases. Existem 2 grupos cidos fortes ionizados, um COOH e um NH3+ . Em soluo essas duas formas esto em equilbrio protnico. R-COOH e R-NH3+, representam a forma

protonada ou cida, parceiras nesse equilbrio. E as formas R-COO- e R-NH2 so as bases conjugadas. Assim, dependendo do meio, os aminocidos podem atuar como cidos (protonado, podendo doar prtons), neutros (a forma protonada e a forma receptora de prtons em equilbrio) e base (base conjugada do cido correspondente, ou seja, perdeu prtons, e agora receptora deles). Os aminocidos reagem com o cido nitroso produzindo nitrognio e um hidroxi-acido. A aplicao desta reao a determinao da dosagem de aminocidos,no sangue, medindo-se o volume de nitrognio produzido (mtodo de Slyke). Na putrefao dos organismos, certas enzimas reduzem os aminocidos em aminas como a putrescina e a cadaverina.

Propriedades
Organolpticas: Incolores. A maioria de sabor adocicado. Fsicas: Slidos com solubilidade varivel em gua. Apresentam atividade ptica por apresentarem carbono assimtrico, em geral,na forma levgira. A glicina solvel em gua e no apresenta atividade ptica Qumicas: O grupo carboxlico (-COOH) na molcula confere ao aminocido uma caracterstica cida e o grupo amino (-NH2) uma caracterstica bsica. Por isso, os aminocidos apresentam um carter anftero, ou seja, reagem tanto com cidos como com bases formando sais orgnicos.

Protena
Estrutura 3D da mioglobina, protena globular de 153 aminocidos, que contm um grupo prosttico heme no centro.

Parte de uma cadeia proteica mostrando as ligaes peptdicas.

Estrutura geral de um aminocido. As Protenas so compostos de alto peso molecular, compostos orgnicos de estrutura complementa e massa molecular elevada (de 100.000 a 100.000.000.000 ou mais unidades de massa atmica), sintetizadas pelos organismos vivos atravs da condensao de um grande nmero de molculas de alfa-aminocidos, atravs de ligaes denominadas ligaes peptdicas. Uma protena um conjunto de no minimo 20 aminocidos, mas sabemos que uma protena possui muito mais que essa quantidade, sendo os conjuntos menores denominados Polipeptdeos. Em comparao, designa-se Prtido qualquer composto nitrogenado que contm aminocidos, peptdios e protenas (pode conter outros componentes). Uma grande parte das protenas so completamente sintetizadas no citosol das clulas pela traduo do RNA enquanto as protenas destinadas membrana citoplasmtica, lisossomas e as protenas de secreo possuem um sinal que reconhecido pela membrana do retculo endoplasmtico onde terminam sua sntese. As protenas so os componentes qumicos mais importantes do ponto de vista estrutural.

Aminocidos
So compostos quaternrios de carbono (C), hidrognio (H), oxignio (O) e nitrognio (N) - tambm chamado de azoto em Portugal, s vezes contm enxofre (S), como a cistina. A estrutura geral dos aminocidos envolve um grupo amina e um grupo carboxila, ambos ligados ao carbono (o primeiro depois do grupo carboxila). O carbono tambm ligado a um hidrognio e a uma cadeia lateral, que representada pela letra R. O grupo R determina a identidade de um aminocido especfico. A frmula bidimensional mostrada aqui pode transmitir somente parte da estrutura comum dos aminocidos, porque uma das propriedades mais importantes de tais compostos a forma tridimensional, ou estereoqumica. Existem 300 tipos de aminocidos, porm somente 20 so utilizados no organismo humano, sendo denominados aminocidos primrios ou padro; apenas esses podem ser sintetizados pelo DNA humano. Desses 20, nove so ditos essenciais: isoleucina, leucina, lisina, metionina, fenilanina, treonina triptofano, valina, histidina e arginina. O organismo humano no capaz de produzi-los, e por isso necessria a sua ingesto atravs dos alimentos para evitar sua deficincia no organismo. Uma cadeia de

aminocidos denomina-se de "peptdeo", estas podem possuir dois aminocidos (dipeptdeos), trs aminocidos (tripeptdeos), quatro aminocidos (tetrapeptdeos), ou muitos aminocidos (polipeptdeos). O termo protena dado quando na composio do polipeptdeo entram centenas ou milhares de aminocidos. As ligaes entre aminocidos denominam-se ligaes peptdicas e estabelecem-se entre o grupo amina de um aminocido e o grupo carboxilo de outro aminocido, com a perda de uma molcula de gua.

Estrutura tridimensional
Estruturas tridimensionais das protenas. As protenas podem ter 4 tipos de estrutura dependendo do tipo de aminocidos que possui, do tamanho da cadeia e da configurao espacial da cadeia polipeptdica. As estruturas so:

Estrutura primria
dada pela seqncia de aminocidos ao longo da cadeia polipeptdica. o nvel estrutural mais simples e mais importante, pois dele deriva todo o arranjo espacial da molcula. So especficas para cada protena, sendo, geralmente, determinadas geneticamente. A estrutura primria da protena resulta em uma longa cadeia de aminocidos, com uma extremidade "amino terminal" e uma extremidade "carboxi terminal". Sua estrutura somente a seqncia dos aminocidos, sem se preocupar com a orientao espacial da molcula. Suas ligaes so ligaes peptdicas e pontes dissulfeto. Representada pela sequncia de aminocidos unidos por meio das ligaes peptdicas. ligada a carboidratos assim como outros.

Estrutura secundria
dada pelo arranjo espacial de aminocidos prximos entre si na sequncia primria da protena. o ltimo nvel de organizao das protenas fibrosas, mais simples estruturalmente. Ocorre graas possibilidade de rotao das ligaes entre os carbonos alfa dos aminocidos e os seus grupos amina e carboxilo. O arranjo secundrio de uma cadeia polipeptdica pode ocorrer de forma regular; isso acontece quando os ngulos das ligaes entre carbonos alfa e seus ligantes so iguais e se repetem ao longo de um segmento da molcula. So dois os tipos principais de proteicas

alfa-hlice: presente na estrutura secundria dos nveis de organizao das protenas. So estruturas cilindricas estabilizadas por pontes de hidrognio entre aminocidos. As cadeias laterais dos aminocidos encontram-se viradas para fora. Existem vrias formas de como as hlice alfa podem organizar-se.

folha-beta: padro estrutural encontrado em vrias protenas, nas quais regies vizinhas da cadeia polipeptdica associam-se por meio de ligaes de hidrognio, resultando em uma estrutura achatada e rgida.

Estrutura terciria
Resulta do enrolamento da hlice ou da folha pregueada, sendo estabilizada por pontes de hidrognio e pontes dissulfeto. Esta estrutura confere a atividade biolgica s proteicas. A estrutura terciria descreve o dobramento final de uma cadeia, por interaes de regies com estrutura regular ou de regies sem estrutura definida, podendo haver interaes de segmentos distantes de estrutura primata, por ligaes no covalentes. Enquanto a estrutura secundria determinada pelo relacionamento estrutural de curta distncia, a terciria caracterizada pelas interaes de longa distncia entre aminocidos, denominadas interaes hidrofbicas, pelas interaes eletrostticas, pontes de hidrogenio e de sulfeto. Todas tm seqncias de aminocidos diferentes, refletindo estruturas e funes diferentes. Efetua interaes locais entre os aminocidos que ficam prximos uns dos outros.

Estrutura quaternria
Algumas protenas podem ter duas ou mais cadeias polipeptdicas. Essa transformao das protenas em estruturas tridimensionais a estrutura quaternria, que so guiadas e estabilizadas pelas mesmas interaes da terciria.A juno de cadeias polipeptdicas pode produzir diferentes funes para os compostos. Um dos principais exemplos de estrutura quaternria a hemoglobina. Sua estrutura formada por quatro cadeias polipeptdicas.

Funes
As protenas podem exercer funes importantes no organismo de todos os organismos vivos, das quais se destacam as seguintes.

Hormonal
Exercem alguma funo especfica sobre algum rgo ou estrutura de um organismo como, por exemplo, a insulina que retira a glicose em excesso do sangue(embora tecnicamente a insulina seja considerada apenas um polipeptdeo, devido a seu pequeno tamanho).

Defesa
Os anticorpos so protenas que realizam a defesa do organismo, especializados no reconhecimento e neutralizao de vrus, bactrias e outras substncias estranhas.

O fibrinognio e a trombina so outras protenas de defesa, responsveis pela coagulao do sangue e preveno de perda sangunea em casos de cortes e ferimentos.

Energtica
No Brasil uma das principais fontes de protenas feijo. 100g de feijo possuem 21g de protena Obteno de energia a partir dos canais que compem as protenas. Durante a fase de crescimento as crianas so especialmente sensveis s deficincias de nutrientes, sobretudo protenas. Deficincia de calorias ou protenas na dieta desvia as protenas para a funo energtica, levando deficincia de crescimento. A necessidade diria de protenas de cerca de 1g/kg durante essa fase e 0,8-0,9g/kg na fase adulta.

Enzimtica
Enzimas so protenas capazes de catalisar reaes bioqumicas como, por exemplo, as lipases. As enzimas no reagem, so reutilizadas (sempre respeitando o stio ativo) e so especficas. As enzimas reduzem a energia de ativao das reaes qumicas. A funo da enzima depende diretamente de sua estrutura. Protenas altamente especializadas e com atividade cataltica. Mais de 2000 enzimas so conhecidas, acreditava-se que cada uma era capaz de catalisar apenas um tipo diferente de reao qumica, porm novas pesquisas provaram que algumas enzimas podem catalisar diferentes reaes qumicas.

Condutoras de gases
O transporte de gases (principalmente do oxignio e um pouco do gs carbnico) realizado por protenas como a hemoglobina e hemocianina presentes nos glbulos vermelhos ou hemcias .

Desnaturao
A desnaturao ocorre quando a protena perde sua estrutura secundria e/ou terciria, ou seja, o arranjo tridimensional da cadeia polipeptdica rompido, fazendo com que, quase sempre, perca sua atividade biolgica caracterstica. Quando as protenas sofrem desnaturao no ocorre rompimento de ligaes covalentes do esqueleto da cadeia polipeptdica, preservando a seqncia de aminocidos caractersticas da protena. Os fatores que causam a desnaturao, so:

Aumento de temperatura (cada protena suporta certa temperatura mxima, se esse limite ultrapassado ela desnatura); Extremos de pH; Solventes orgnicos miscveis com a gua (etanol e acetona); Solutos (ureia);

Exposio da protena a detergentes; Agitao vigorosa da soluo proteica at formao abundante de espuma.

Renaturao
Experimentos que demonstram a reversibilidade da desnaturao, ajudam a provar que a estrutura terciria de uma protena globular determinada pela sua sequncia de aminocidos. As protenas desnaturadas retomam sua estrutura nativa e sua atividade biolgica assim que sua conformao natural de estabilidade atingida novamente. Renaturao o nome que se d a esse processo. Por exemplo, uma ribonuclease purificada pode ser desnaturada pela presena de um agente redutor em soluo concentrada de ureia, atravs da clivagem de quatro de suas oito ligaes dissulfido a resduos de cistena e pela desestabilizao das interaes hidrofbicas causada pela ureia. A desnaturao da ribonuclease acompanhada por uma completa perda de sua atividade cataltica. Removidos o agente redutor e a ureia, a ribonuclease desnaturada retoma sua estrutura terciria correta, dobrando-se espontaneamente, com restaurao completa de sua atividade cataltica. As ligaes dissulfido so refeitas nas mesmas posies anteriores.

Enzima
Enzimas so um grupo de substncias orgnicas de natureza normalmente protica (existem tambm enzimas constitudas de RNA, as ribozimas), com atividade intra ou extracelular que tm funes catalisadoras, catalisando reaes qumicas que, sem a sua presena, dificilmente aconteceriam. Isso conseguido atravs do abaixamento da energia de ativao necessria para que se d uma reao qumica, resultando no aumento da velocidade da reao e possibilitando o metabolismo dos seres vivos. A capacidade cataltica das enzimas torna-as adequadas para aplicaes industriais, como na indstria farmacutica ou na alimentar. Em sistemas vivos, a maioria das reaes bioqumicas d-se em vias metablicas, que so sequncias de reaes em que o produto de uma reao utilizado como reagente na reao seguinte. Diferentes enzimas catalisam diferentes passos de vias metablicas, agindo de forma concertada de modo a no interromper o fluxo nessas vias. Cada enzima pode sofrer regulao da sua atividade, aumentando-a, diminuindo-a ou mesmo interrompendo-a, de modo a modular o fluxo da via metablica em que se insere. O ramo da Bioqumica que trata do estudo das reaces enzimticas a enzimologia.

Atividade enzimtica
As enzimas convertem uma substncia, chamada de substrato, noutra denominada produto, e so extremamente especficas para a reao que catalisam. Isso significa que, em geral, uma enzima catalisa um e s um tipo de reao qumica. Consequentemente, o tipo de enzimas encontradas numa clula determina o tipo de metabolismo que a clula efetua. A velocidade da reao catalisada por uma enzima aumentada devido ao abaixamento da energia de ativao necessria para converter o substrato no produto. O aceleramento da reao pode ser da ordem dos milhes de vezes: por exemplo, a enzima orotidina-5'fosfato descarboxilase diminui o tempo da reao por ela catalisada de 78 milhes de anos para 25 milissegundos. Como so catalisadores, as enzimas no so consumidas na reaco e no alteram o equilbrio qumico dela. A atividade enzimtica pode depender da presena de determinadas molculas, genericamente chamadas cofatores. A natureza qumica dos cofatores muito varivel, podendo ser, por exemplo, um ou mais ions metlicos (como o ferro), ou uma molcula orgnica (como a vitamina B12). Estes cofatores podem participar ou no diretamente na reao enzimtica. Determinadas substncias, podem inibir a atividade de algumas enzimas, diminuindo-a ou eliminando-a totalmente; so os chamados inibidores enzimticos. Pelo fato de serem protenas com estrutura terciria ou quaternria, as enzimas so dotadas de dobramentos tridimensionais em suas cadeias polipeptdicas, o que lhes confere uma forma caracterstica e exclusiva. Assim, diferentes enzimas tm diferentes

formas e, portanto, diferentes papis biolgicos. Para que um enzima atue, necessrio que os substratos "se encaixem" na enzima. Esse "encaixe", porm, depende da forma, isto , do "contorno" da enzima. Por isso, substratos que se "encaixam" em uma determinada enzima no se "encaixam" em outras diferentes, e a reao no ocorre; da a especificidade das enzimas quanto aos substratos em que atuam. Uma vez ocorrido o "encaixe", forma-se o complexo enzima-substrato, que se assemelha ao sistema "chavefechadura". O local da enzima onde o substrato se "encaixa" denominado stio ativo (ou centro ativo). No caso de substncias que reagem entre si, sob a ao catalisadora das enzimas, a reao facilitada, tornando-se mais rpida, pois a proximidade entre as molculas "encaixadas" acelera o processo reativo; aps a reao, a enzima desliga-se do substrato e permanece intacta.

Localizao
Podemos encontrar enzimas em quase todas as estruturas celulares e fluidos corporais. Algumas tm uma localizao especfica, de tal modo que podem servir para indicar que estamos em presena de um tal tecido, secreo ou fragmento celular se verificar a actividade de uma dada enzima.

Estruturas e mecanismos
As enzimas so protenas, e podem ter um tamanho desde 62 resduos de aminocidos, como o caso do monomero da enzima 4-oxalocrotonato tautomerase, at um tamanho de 2.500 resduos, como o caso da sintase de cidos graxos. A atividade das enzimas so determinadas pela sua estrutura quaternria. A maioria das enzimas so maiores do que o substrato sobre o qual atuam, e s uma pequena poro da enzima (cerca de 3-4 aminocidos) est envolvida na catlise. A regio que contm estes resduos catalticos, que se liga-se ao substrato e que desempenha a reao, denominada de stio ativo. As enzimas tambm podem ter stios onde se ligam cofatores, que so necessrios s reaes catalticas. Algumas enzimas tambm podem ter stios de ligaes para pequenas molculas, que so produtos ou substratos, diretos ou indiretos, da reao catalisada. Estas ligaes servem para aumentar ou diminuir a atividade da enzima, providenciando um meio de regulao por feedback. Tal como todas as protenas, as enzimas so formadas por longas cadeias lineares de aminocidos que sofrem um enovelamento que tem como resultado um produto com estrutura tridimensional. Cada sequncia nica de aminocidos produz tambm uma estrutura tridimensional nica que tem propriedade especficas. Cadeias individuais de protenas podem por vezes agrupar-se para formar um complexo proteico. A maioria das enzimas pode sofrer desnaturao, isto , a sua estrutura pode sofrer desagregao e inativao pelo aumento de temperatura, o que provoca alteraes na conformao tridimensional da protena. Dependendo da enzima, a desnaturao pode ter efeitos reversveis ou irreversveis.

Especificidade

As enzimas possuem normalmente uma alta especificidade em relao s reaes que catalizam e aos substratos que esto envolvidos nessas reaes. A forma complementar, carga e caractersticas hidroflicas/hidrofbicas, so responsveis por esta especificidade. As enzimas exibem tambm elevados nveis de estereoespecificidade, regioselectividade e quimioselectividade. Algumas das enzimas que apresentam maior especificidade e preciso, esto envolvidas na cpia e expresso do genoma. Estas enzimas possuem mecanismos de proof-reading (reviso). Um destes casos a DNA polimerase, que cataliza uma reao num primeiro passo, para de seguida confirmar, num segundo passo, se o produto o correto. Este processo em duas etapas resulta em mdias de taxa de erro muito diminutas, na ordem de uma para cem milhes de reaes, no caso de polimerases de mamferos. Mecanismos de reviso similares tambm podem ser encontrados na RNA polimerase, na aminoacil-tRNA sintetases e em ribossomas. Algumas enzimas que produzem metabolitos secundrios so descritos como promscuos, visto que podem atuar num largo espectro de diferentes substratos. Tem sido sugerido que este tipo de especificidade alargada importante nos processos de evoluo de novas vias de biossntese.[ Modelo chave-fechadura As enzimas exibem uma elevada especificidade, e foi sugerido por Emil Fischer, em 1894, que esse fato era devido a que tanto as enzimas como os substratos apresentam formas geomtricas complementares, fazendo com que encaixem de maneira precisa umas nos outros. Este processo muitas vezes referido como modelo chave-fechadura. No entanto, apesar de estes modelo explicar a especificidade das enzimas, falha em explicar a estabilizao dos estados de transio que as enzimas exibem. Modelo do encaixe induzido

Diagramas que mostram a atividade enzimtica atravs do modelo do encaixe induzido. Em 1958, Daniel Koshland sugeriu uma modificao ao modelo de chave-fechadura: uma vez que as enzimas exibem estruturas flexveis, o stio ativo altera a sua forma de maneira continuada atravs de interaes com o substrato, enquanto esse mesmo substrato vai interagindo com a enzima. Como resultado, o substrato no se liga simplesmente a um stio ativo que rgido. As cadeias laterais dos aminocidos que formam o stio ativo sofrem uma reorientao de maneira a que as suas posies potenciem a ao cataltica da enzima. Em alguns casos, como nas glicosidases, a molcula de substrato tambm sofre alteraes de conformao medida que vai se aproximando do stio ativo. O stio ativo continua a sofrer modificaes at que o substrato esteja completamente ligado e neste momento em que a conformao final e a carga so determinadas.

Mecanismos
As enzimas atuam de diversas formas, todas elas baixando o valor de G: Baixando a energia de ativao, atravs da criao de um ambiente no qual o estado de transio estabilizado. Providenciando uma via alternativa. Reduzindo a variao da entropia da reao ao orientar os substratos de forma correta para facilitar a reao. Na ausncia de enzima, as molculas colidem em todas as direes possveis de forma aleatria, um processo menos eficiente que na presena da enzima. Ao considerar-se H isoladamente, este aspecto negligenciado. Dinmica e funes Investigaes recentes providenciaram novos conhecimentos sobre a ligao entre a dinmica interna de uma enzima e o seu mecanismo de catlise. A dinmica interna de uma enzima descrita como o movimento de partes internas (como aminocidos individuais, grupos de aminocidos, um lao da cadeia, uma hlice alfa, folhas beta vizinhas ou at domnios proteicos inteiros) destas biomolculas, que podem ocorrer a diversas escalas de tempo, desde femtossegundos a segundos. Redes de resduos de aminocidos de uma estrutura podem contribuir para a catlise atravs de movimentos dinmicos. Os movimentos em protenas so importantes para diversas enzimas mas o tipo de reao que elas catalisam determina que tipos de movimento so mais importantes: pequenas e rpidas vibraes ou lentas e significativas alteraes conformacionais. Estes estudos tm consequncias na compreenso dos efeitos alostricos, na produo industrial de enzimas e no desenvolvimento de novos frmacos.

Regulao alostrica
As enzimas alostricas mudam a sua estrutura aquando da ligao de determinadas molculas. A modulao da atividade da enzima pode ser direta, quando a molcula se liga diretamente a um local de ligao na enzima, ou indireta, quando a molcula se liga a outras protenas ou subunidades que interagem com a enzima alostrica, influenciando ento a sua atividade.

Cofatores e coenzimas
Cofactores
Algumas enzimas no necessitam de componentes adicionais para mostrarem uma atividade completa. No entanto, outras requerem ligao a molculas no protecas para que possam exercer a sua atividade. Os cofatores podem ser inorgnicos (ions metlicos e complexos ferro-enxofre) ou compostos orgnicos (flavina ou heme). Os cofatores orgnicos (coenzimas) so normalmente grupos prostticos, que esto intimamente ligados s enzimas a que eles prestam assistncia. Os cofatores que possuem ligao

forte s enzimas so distintos de outras coenzimas, tal como a NADH, visto que no so libertados do stio ativo durante a reao catalisada. Um exemplo de uma enzima que contm um cofactor a anidrase carbnica, que mostrada em figura acima com um ion de zinco como cofator. Estas molculas que possuem uma ligao estreita com as enzimas so normalmente encontradas no stio ativo e esto envolvidas na reao cataltica. Por exemplo, a flavina e grupos heme esto muitas vezes envolvidos em reaes de oxidao-reduo. Enzimas que requerem um cofator mas que no se ligam a estes, so denominadas apoenzimas. Uma apoenzima juntamente com o(s) seu(s) cofator(es) so denominadas holoenzimas. A maioria dos cofatores no se ligam por covalncia a uma enzima, mas estabelecem ligaes fortes. No entanto, os grupos prostticos orgnicos podem ligar-se de maneira covalente. Um exemplo disso a ligao da tiamina pirofosfato enzima piruvato desidrogenase.

Coenzimas
Modelo tridimensional da coenzima NADH. As coenzimas so pequenas molculas que transportam grupos qumicos de uma enzima para outra. Alguns destes compostos qumicos, como a riboflavina, a tiamina e o cido flico, so vitaminas, compostos que no so sintetizados no organismo e que tm de ser assimilados atravs da dieta. Os grupos qumicos transportados incluem o ion hidreto (H-) transportado pelo NAD ou NADP+, o grupo acetil transportado pela coenzima A, os grupos formilo, metenilo e metilo transportados pelo cido flico e o grupo metilo transportado pela S-adenosilmetionina. Dado que as coenzimas so modificadas quimicamente como consequncia da ao enzimtica, til consider-las como sendo uma classe especial de substratos, ou substratos secundrios, que so comuns em muitos tipos de enzimas diferentes. Por exemplo, sabe-se que existem cerca de 700 enzimas que utilizam a coenzima NADH. As coenzimas sofrem regenerao e as suas concetraes so mantidas a um nvel estvel dentro da clula. Por exemplo, o NADPH regenerado atravs da via das pentoses-fosfato e a S-adenosilmetionina regenerada pela metionina adenosiltransferase.

Termodinmica
Diagrama de uma reaco cataltica, mostrando o nvel de energia em cada etapa da reaco. Normalmente, o substrato necessita de uma quantidade elevada de energia para conseguir chegar ao estado de transio, decaindo depois at a um produto final. A enzima estabiliza o estado de transio, reduzindo o valor de energia necessrio para que se formem os produtos. Tal com acontece com todos os compostos catalisadores, as enzimas no alteram a posio do equilbrio qumico da reao. Normalmente, na presena de uma enzima, a

reao desenvolve-se na mesma direo que se seria tomada se ela no estivesse presente, mas de maneira mais rpida; no entanto, na ausncia da enzima, as reaes podero dar origem a diferentes produtos, porque nessas condies esses produtos so formados de maneira mais rpida. Alm disso, as enzimas podem executar duas ou mais reaes, de tal maneira que a atuao numa reao termodinamicamente favorvel possa facilitar a atuao numa reao menos favorvel. Por exemplo, a energia disponibilizada pela hidrlise do ATP normalmente utilizada para executar outras reaes. As enzimas catalisam as reaes em ambos os sentidos. Elas no alteram o equilbrio em si, mas a velocidade em que este alcanado. Por exemplo, a anidrase carbnica catalisa a sua reao nas duas direes, dependendo da concentrao dos seus reagentes. (em tecidos; alta concentrao de CO2) (nos concentrao de CO2) Se o equilbrio estiver substancialmente deslocado para uma das direes, isto , se for uma reao muito exergnica, a reao efetivamente irreversvel. Nestas condies, a enzima s catalizar a reao na direo termodinamicamente permitida. pulmes; baixa

Cintica

Mecanismo de reao de uma enzima com substrato nico. A enzima (E) liga o substrato (S) e liberta o produto (P). A cintica enzimtica o estudo do mecanismo pelo qual as enzimas ligam substratos e os transformam em produtos. So utilizados dados sobre a velocidade de reao de enzimas atravs de ensaios enzimticos. Henri contribuiu significativamente para este campo ao teorizar as reaes enzimticas ocorrendo em dois passos. No primeiro, o substrato liga-se de forma reversvel enzima, formando o complexo enzima-substrato. A enzima catalisa ento o passo qumico da reao e liberta o produto.

As enzimas podem catalisar at vrios milhes de reaes por segundo. Por exemplo, a reao catalisada pela orotidina 5'-fosfato descarboxilase tem uma semivida de 78 milhes de anos na ausncia de enzima, diminuindo para apenas 25 milissegundos na presena desta. As velocidades de reao dependem das condies em que as enzimas se encontram e da concentrao de substrato. Condies de alta temperatura, pH extremos ou altas concentraes salinas desestabilizam a estrutura da protena, desnaturando-a. Por outro lado, em geral, um aumento na concentrao de substrato tende a aumentar a atividade enzimtica.

Inibio

Os inibidores competitivos ligam-se de maneira reversvel enzima, prevenindo a ligao do substrato. Por outro lado, a ligao do substrato previne a ligao do inibidor. O substrato e o inibidor competem pela enzima. a) Reao normal, (b) Inibio. S: substrato; E: enzima; I: inibidor; A: centro activo. (1) O substrato liga-se enzima; (2) A enzima liberta produtos; (3) O inibidor liga-se enzima; (4) O inibidor compete com o substrato. As taxas de reaco enzimticas podem ser diminudas por ao de vrios tipos de inibidores enzimticos. Inibio competitiva Na inibio competitiva, o inibidor e o substrato competem pela enzima, isto , no se podem ligar ao mesmo tempo enzima. Os inibidores so muitas vezes semelhantes ao substrato da enzima. Por exemplo, o metotrexato um inibidor competitivo da enzima dihidrofolato redutase, que cataliza a reduo do dihidrofolato em tetrahidrofolato. A similitude entre as estruturas do cido flico e desta droga so mostradas na figura adjacente. Notar que o local de ligao do inibidor no necessariamente o mesmo que o local de ligao do inibidor, se a ligao de este ltimo mudar a conformao da enzima com vista a impedir a ligao do substrato, e vice versa. Na inibio competitiva, a velocidade mxima da reao no alterada, mas nveis mais altos de

concentrao do substrato so requeridos para que se atinja uma determinada velocidade, aumentando o KM aparente. Inibio no-competitiva Os inibidores no-competitivos podem ligar-se enzima e ao substrato ao mesmo tempo, ou seja, nunca se ligam ao stio ativo. Quer o complexo E-I, quer o complexo EI-S, so enzimaticamente inativos. Tanto o KM aparente como o Vmax mudam neste caso, pois o inibidor no pode ser desligado da enzima por aumento da concentrao de substrato (em contraste com o que acontece na inibio competitiva). Em muitos organismos, os inibidores podem agir como parte do mecanismo de retroalimentao. Se uma enzima produz um determinada substncia em demasia, essa substncia poder agir como inibidor da enzima, no incio da via que a produz, causando a reduo ou paragem da produo da substncia quando esta se acumula. Esta um forma de retroalimentao negativa. Enzimas que esto sujeitas a esta forma de regulao so muitas vezes multimricas e possuem stios de ligao alostricos para substncias reguladoras. Os seus grficos substrato/velocidade no tm a forma hiperblica mas sim forma sigmide (curva em forma de S) O cido flico e a droga anticancergena metotrexato so semelhantes na sua estrutura. Como resultado, o metotrexato um inibidor competitivo de muitas das enzimas que utilizam os folatos. Os inibidores irreversveis reagem com a enzima e formam ligaes covalentes com a cadeia polipeptdica. Este tipo de inativao irreversvel. Um exemplo de inibidor irreversvel a eflornitina, uma substncia utilizada no tratamento da doena do sono. A penicilina e a aspirina tambm atuam deste modo. Nestes casos, o composto liga-se ao centro ativo e a enzima converte-o a uma forma ativada que reage irreversivelmente com um ou mais resduos de aminocidos.

Usos de inativadores
Os inativadores so muitas vezes usados como medicamentos, mas tambm podero atuar como venenos. No entanto, a diferena entre um medicamento e um veneno normalmente uma questo de dosagem, visto que a maior parte dos medicamentos e drogas so txicas a partir de certo nvel. Como Paracelso disse: "Todas as coisas so um veneno e nada existe sem veneno, apenas a dosagem razo para que uma coisa no seja um veneno"[49] Igualmente, os antibiticos e outras drogas anti-infecciosas so apenas venenos que matam o agente patognicos e no o hospedeiro deste. Um exemplo de um inativador que usado como medicamento a aspirina, que inibe a ciclooxigenase 1 e a ciclooxigenase 2, que so enzimas que produzem um mensageiro que age em casos de inflamao, neste caso uma prostaglandina, suprimindo assim a dor e a inflamao. O cianureto um inactivador enzimtico irreversvel, que se combina com cobre e zinco no stio activo da anzima citocromo c oxidase, bloqueando a respirao celular.[50]

Funes biolgicas
A ao da luciferase induz bioluminiscncia nos pirilampos. As enzimas exercem uma grande variedade de funes nos organismos vivos. So indispensveis para a transduo de sinais, na regulao celular, muitas vezes por ao de cinases e fosfatases. Atravs da sua ao podem gerar movimento, como no caso da miosina que hidroliza ATP, gerando contraes musculares. Tambm movimentam carga atravs da clula, atravs da ao do citoesqueleto. Algumas enzimas so ATPases (funcionam como bombas ionicas), que se localizam na membrana celular, estando envolvidas do processo de transporte ativo. Algumas funes mais exticas so operadas por enzimas, como o caso da luciferase que gera luz nos pirilampos. Os vrus podem conter enzimas que auxiliam na infeco de clulas (HIV-integrase e transcriptase reversa) ou na libertao celular de vrus (neuraminidase no vrus influenza). Uma importante funo das enzimas tem lugar no sistema digestivo dos animais. Enzimas como as amilases e proteases, quebram grandes molculas como o amido e protenas, respetivamente, em molculas de menores dimenses, de maneira a que estas possam ser absorvidas no intestino. O amido no absorvvel no intestino, mas as enzimas hidrolizam as cadeias de amido em molculas menores tais como a maltose e a glucose, podendo desta maneira ser absorvidas. Diferentes enzimas atuam sobre diferentes tipos de alimento. Nos ruminantes, que possuem uma dieta herbvora, bactrias no sistema digestivo produzem uma enzima denominada celulase que quebra as paredes celulares das clulas vegetais. As enzimas podem trabalhar em conjunto, seguindo uma ordem de atuao especfica. Desta maneira podem formar vias metablicas. Nestas vias, uma enzima processa o produto da ao de outra enzima como o seu substrato. Aps a reao cataltica, o produto depois entregue a outra enzima. Por vezes, mais do que uma enzima pode catalisar a mesma reao, em paralelo. Isto permite uma regulao mais complexa: As enzimas determinam que passos que ocorrem nessa vias metablicas. Sem a presena de enzimas, o metabolismo no progride atravs dos mesmo passos, nem suficientemente rpido para que sirva as necessidades da clula. De fato, uma via metablica to importante como a gliclise no poderia existir sem a presena de enzimas. A glucose, por exemplo, pode reagir diretamente com o ATP para dar origem a um produto fosforilado em um ou mais carbonos. Na ausncia de enzimas, este processo to lento que se torna insignificante. No entanto, se a enzima hexocinase for adicionada, estas reaco lentas continuam a ser efectuadas, mas a fosforilao do carbono nmero 6 ocorre de maneira to rpida que, se a mistura for testada pouco tempo depois, a glicose-6-fosfato o nico produto significativo. Consequentemente, pode-se dizer que a rede de vias metablicas existentes dentro de cada clula depende do conjunto de enzimas funcionais que esto presentes.

Controle da atividade
A atividade enzimtica na clula controlada de cinco principais modos:

1. A produo da enzima (transcrio e traduo dos genes que codificam a enzima) pode ser aumentada ou diminuda pela clula em resposta a mudanas no ambiente celular. Esta forma de regulao gentica designada como induo ou inibio da expresso enzimtica. 2. As enzimas podem encontrar-se compartimentadas, com difentes vias metablicas (ou partes de vias metablicas) ocorrendo em diferentes compartimentos celulares. Por exemplo, os cidos graxos so sintetizados por um conjunto de enzimas no citoplasma, no retculo endoplasmtico e no complexo de Golgi e usados por um conjunto diferente de enzimas como fonte de energia na mitocndria, atravs da -oxidao. 3. As enzimas podem ser reguladas por inibidores e ativadores. Por exemplo, os produtos finais de uma dada via metablica so frequentemente inibidores das enzimas que catalisam os primeiros passos da via (normalmente o primeiro passo factualmente irreversvel), regulando assim a quantidade de produto final produzido pela via. Este tipo de regulao denominado mecanismo de feedback (ou autoalimentao) negativo porque a quantidade de produto final regulada pela sua prpria concentrao. Na prtica, o feedback negativo ajusta a velocidade de sntese de metabolitos intermedirios da via de acordo com a necessidade da clula. Este mecanismo ajuda na distribuio econmica e eficiente de compostos, evitando a produo excessiva de produtos finais. Tal como outros mecanismos homeostticos, o controlo da actividade enzimtica ajuda na manuteno de um ambiente interno estvel em organismos vivos. 4. As enzimas podem ser reguladas atravs da sua modificao ps-traducional. Este tipo de modificao inclui a fosforilao, a miristoilao e a glicosilao. Por exemplo, a fosforilao de diversas enzimas, como a glicognio sintase, em resposta a um sinal da insulina, ajuda no controlo da sntese ou degradao do glicognio e permite a resposta celular a variaes da glicemia[55]. Outro exemplo a quebra da cadeia polipeptdica da quimotripsina, uma protease digestiva que produzida numa forma inactiva (quimotripsinognio) no pncreas e transportada ento para o estmago, onde activada. Este mecanismo evita a digesto de tecidos pancreticos (ou outros) pela quimotripsina antes de entrar no tracto digestivo. Este tipo de precursor inactivo de uma enzima denominado zimgeno. 5. Algumas enzimas tornam-se ativas quando so colocadas num ambiente diferente (por exemplo, de um ambiente citoplasmtico redutor para um ambiente periplasmtico oxidativo). Um exemplo encontra-se na hemaglutinina dos vrus Influenza (vrus da gripe), que sofre uma mudana conformacional quando encontra o ambiente acdico de vesculas da clula hospedeira, provocando a sua activao[56].