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Ciclo de “Krebs”
Roma-2007
Bibliografía
Roma-2007
Glucólisis y CAC
Roma-2007
Ciclo de Krebs
Roma-2007
Ligas de interés
Roma-2007
¿Dónde
estamos en
las rutas?
Roma-2007
¿Dónde estamos en la célula?
En la matriz mitocondrial
http://porpax.bio.miami.edu/~cmallery/255/255atp/gk5x5.gif Roma-2007
Introducción
Combustibles metabólicos. Glucosa, pero no es
el único combustible
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Introducción
El procesamiento aeróbico
la oxidación completa hasta a CO2 y agua.
se genera la mayor cantidad de ATP.
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Destinos del piruvato
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Origen del acetil-CoA
De 3C a 2 C
http://www.citruscollege.edu/pic/46/c07_06.jpg
http://www.library.csi.cuny.edu/~davis/Biochem_3521/lect15/acetylCoAProd.GIF Roma-2007
Función del ciclo
•En CAC
electrones del •Cadena de transpsorte de e- Los •Los H+ retornan a la
acetyl CoA se e- fluyen dentro de complejos matriz, a través de la
transfieren y se enzimáticos de la mb interna, que ATP sintasa que genera
utilizan para
sintetizar NADH generan un gradiente de H+ entre ATP a partir de ADP y
y FADH2. la mb interna y la matriz Pi
mitocondrial
Fosforilación oxidativa
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Respiración celular
CAC
Cadena de
transporte de e-
Síntesis de ATP
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Oxígeno: aceptor final de electrones
El oxígeno es
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De glucólisis al ciclo del ácido cítrico
Matriz mitocondrial:
Piruvato → acetil-CoA por el
complejo multienzimático:
piruvato deshidrogenasa
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Eventos en la mitocondria
Estructura:
Mb externa, mb interna y matriz
mitocondrial
Lo que cambia
está en azul
Nombre de
la enzima
en amarillo
http://www.accessexcellence.org/RC/VL/GG/ecb/complete_citric_acid_cycle.html Roma-2007
Ciclo de Krebs
http://www.sp.uconn.edu/~terry/images/anim/ATPmito.html
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Pasos del ciclo a
continuación
Intermediario
Cis-aconitato
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Complejo
Piruvato deshidrogenasa (PDH)
Estructura multienzimática: Con tres actividades
enzimáticas: piruvato deshidrogenasa (E1), dihidrolipoil
transacetilasa (E2) y dihidrolipoil deshidrogenasa (E3).
http://sandwalk.blogspot.com/2007/08/theme-pyruvate-dehydrogenase.html
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Complejo PDH
E1 = Piruvato deshidrogenasa
E2 = Dihidrolipoil transacetilasa
E3 = Dihidrolipoil deshidrogenasa
E1-amarillo
E3-rojo
E2-verde
http://sandwalk.blogspot.com/2007/04/structure-of-pyruvate-dehydrogenase.html Roma-2007
Rxn’s de la Piruvato deshidrogenasa
Coenzima/enlace Funciones
Descarboxilación y
Tiamina pirofosfato (TPP)-unido
transferencia de grupos
a E1
aldehído
Acido lipoico-unido a Lys en E2 Transportador de grupos
(lipoamida) hidrógeno y acetilo
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Complejo piruvato deshidrogenasa de E.
coli
Actividad
Función Coenzimas
enzimática
Piruvato
Descarboxila al piruvato TPP
deshidrogenasa (E1)
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De piruvato en acetil CoA (PDH)
Descarboxilación del piruvato. Se forma un
nucleófilo. Un residuo básico de la enzima
extrae un protón del anillo de tiazol de la
tiamina-pirofosfato (TPP). Se forma el
intermediario, hidoxietil-TPP (HETPP), tras
el ataque del anillo nucleófilo de tiazol al
grupo carbonilo del piruvato con la pérdida
de CO2.
En los siguientes pasos, el grupo hidoxietilo del
HETPP se convierte en acetil-CoA por la
dihidrolipoil transacetilasa.
El ácido lipoico está unido a la enzima a través
de un enlace amida. Reacciona con el HETPP
para formar un ácido lipoico acetilado y TPP
libre.
El grupo acetilo se transfiere a continuación al
grupo sulfhidrilo de la coenzima A.
Posteriormente, el ácido lipoico reducido se
vuelve a oxidar por la dihidrolipoil
deshidrogenasa. El FADH2 se oxida por el
NAD+ y forma el FAD que se requiere para
la oxidación del siguiente residuo de ácido
lipoico reducido.
FIGURA 9-8 del McKee2
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De piruvato a acetil CoA (PDH)
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Regulación de PDH
CoA-SH y
AMP
Se inhibe por:
concentraciones elevadas de ATP
NADH
… ya dentro de la mitocondria…
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Revisar esta liga
http://www.wiley.com/legacy/college/boyer/0470003790/animatio
ns/tca/tca.htm
Let´s play…!!
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Ciclo del ácido cítrico
*
*
Reacciones individuales
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Paso 1: Acetil CoA a Citrato
http://www.accessexcellence.org/RC/VL/GG/ecb/complete_citric_acid_cycle.html Roma-2007
Citrato: acetil CoA a + oxalacetato
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Paso 2: Citrato a Isocitrato
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Isocitrato por isomerización
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Paso 3: Isocitrato a α-cetoglutarato
http://www.accessexcellence.org/RC/VL/GG/ecb/complete_citric_acid_cycle_part2.html Roma-2007
α-cetoglutarato: de isocitrato (se oxida y
se descarboxila)
La tasa de formación del α-cetoglutarato define la tasa del ciclo del ácido
cítrico
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Succinil-CoA: a partir de α-cetoglutarato (se oxida y se
descarboxila)
Productos (ambas) moléculas de tioéster con energía abundante, esto es, acetil-CoA
y succinil-CoA
Requieren los mismos cofactores (TPP, CoASH, ácido lipoico, NAD+ y FAD)
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Paso 5: Succinil CoA a Succinato
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Succinato: a partir de succinil-CoA (acoplada a una
fosforilación a nivel de sustrato)
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Paso 6: Succinato a Fumarato
http://www.accessexcellence.org/RC/VL/GG/ecb/complete_citric_acid_cycle_part2.html Roma-2007
Paso 7: Fumarato a Malato
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Síntesis de ATP
Nucleósido Difosfato cinasa
GTP + ADP GDP + ATP
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Paso 8: Malato a Oxaloacetato
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Oxalacetato: regeneración
Enzimas:
Succinato deshidrogenasa: oxidación del succinato Æ
fumarato. Utiliza FAD
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Resumen
El α-cetoglutarato se descarboxila
oxidativamente: forma succinato (4C)
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Resumen
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Control del ciclo del ácido
cítrico
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Control
La disponibilidad de sustratos
La demanda de ATP
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Piruvato dehidrogenasa: regulada alostéricamente y
fosforilación reversible
PASO IRREVERSIBLE:
En animales, la formación de acetil CoA a
partir de piruvato
Síntesis de lípidos
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Pir-deshidrogenasa: punto de control
Cuando ↑ los niveles de acetil CoA,
NADH y ATP, se promueve la
fosforilación y por tanto se inhibe
la actividad de la enzima
(la actividad de piruvato
dehidrogenasa se inhibe cuando la
carga de energía es alta y los
intermediarios biosintéticos son
abundantes)
Incremento en vasopresina
Se activa la fosfatasa
(se inhibe la fosforilación de la enzima)
Incremento en insulina
Se incrementa la conversión de
piruvato a acetil CoA
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Control: reacciones irreversibles
ENZIMA CLASIFICACION ES IREVERSIBLE?
Aconitasa Hidatasa NO
Isocitrato Ox-reductasa SI
deshidrogenasa
Complejo α- Ox-reductasa SI
Cetoglutarato
deshidrogenasa
Succinil CoA sintasa Ligasa NO
Succinato Ox-reductasa NO
deshidrogenasa
Fumarasa Hidratasa NO
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Regulación del ciclo
Puntos de inhibición ¤
Intermediarios inhibidores
Activadores_ ADP y Ca2+
1. Piruvato deshidrogenasa:
NADH y Ac-CoA
2. Citrato sintasa:
NADH , citrato y succinil-Co-A
3. Isocitrato deshidrogensa:
NADH y ATP
4. α-cetoglutarato deshidrogenasa:
NADH y succinil-Co-A
Roma-2007
El ciclo del ácido cítrico se controla en
diferentes puntos
necesidad de intermediarios y
α-cetoglutarato deshidrogenasa
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Isocitrato deshidrogenasa
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α-cetoglutarato deshidrogenasa
y ATP.
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El ciclo del ácido cítrico como
fuente de precursores
biosínteticos
http://www.bmb.leeds.ac.uk/teaching/icu3/lecture/14/index.htm Roma-2007
Fuente de precursores biosintéticos
Roma-2007
El ciclo debe de mantenerse
Roma-2007
Cómo es re-incorporado el oxalacetato?
Roma-2007
Destinos del oxalacetato en base a requerimientos
energéticos de la célula
Clase: porqué..??
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Ubicación donde se requiere…
http://classes.midlandstech.edu/carterp/Courses/bio225/chap05/lecture4.htm
Roma-2007
Producción de energía
Oxidación de azúcares y grasas
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Animaciones:
MUY DIDACTICO…!!!!!!!!
http://www.johnkyrk.com/krebs.html
Roma-2007
Para recordar…