Вы находитесь на странице: 1из 7

Что такое молекулярные машины ?

I would propose the denition that molecular


machine is a naturally occurring molecular device (macromolecular
complex) that involves the transformation of chemical or electrochemical
energy into directional molecular motion (Spirin A.S (2002) Ribosome as
a molecular machine FEBS letters 514 2-10 )
3. DNA and RNA polymerases
4. Ribosomes
5. Intracellular transport systems of microtubules
6. Myofibrils
7. Flagella and cilia
Функционирование рибосомы, как молекулярной
машины обеспечивается структурой рибосомной РНК

Экспериментально показано, что РНК в


растворе формирует компактные глобулы за
счет ближних и дальних взаимодействий

Схема конформационных переходов


молекулы высокополимерной РНК в
растворе, как функция ионной силы
РН раствора
Именно третичный фолд узнаётся
соответствующими лигандами.

Фолдинг меняется даже при


незначительных изменениях
внешних условий.

Самые сильные перестройки


наблюдаются в местах
контактов рибосомных
субъединиц.

При связывании лиганда происходит


стабилизация определённой
конформации (фиттинг).

Как химические, так и физические


изменения могут релаксировать
стабилизированную
конформацию.
Гипотеза locked-unlocked состояний рибосомы.

Открытое состояние: акцептирование лиганда,


внутрисубъединичные перемещения
субстратов и выход продуктов.

Закрытое состояние: фиксация и


иммобилизация лиганда для точного
узнавания, ориентации и последующей
химической реакции.

Транслокация рибосомы делает её


менее компактной.
What is a Maxwellian Demon?

In 1871, James Clerk Maxwell


(Scottish physicist, biography
at St Andrews) proposed a
thought experiment. A wall
separates two compartments
filled with gas. A little "demon"
sits by a tiny trapdoor in the
wall. It looks at oncoming gas
molecules, and depending on
their speeds it opens or
closes the trapdoor. The
object of the game is to
eventually collect all the
molecules faster than average
on one side, and the slower
ones on the other side.