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Rabat
Cours de
Microbiologie Générale
(1ère partie)
Préparé par
Pr El Bekkay BERRAHO
levures
1860: f. alcoolique: sucre Ethanol, glycérol
+ CO2
1861: f. butyrique: sucre Vibrions Acide butirique
(-O2 )
anaérobiose
La bactériologie médicale
2. L’époque actuelle
Il y a longtemps: microbiologie = étude des microbes
les végétaux
- les algues,
- les protozoaires,
les protistes: englobent tous les µ-organismes
- les champignons,
- les bactéries
Selon l'organisation cellulaire, les protistes se subdivisent en:
Archébactéries Archéobactéries
chromatophores ou chlorosomes
Photosynthèse: chloroplastes
(système membranaire interne)
- pas de mouvement amiboïde - Mouvement amiboïde
Mobilité (paroi rigide). (eucaryotes sans paroi).
- mouvement flagellaire - Mouvement flagellaire.
La cellule bactérienne
I. Morphologie bactérienne
1. Les coques (Cocci):
diplocoques
1
Streptocoques
Streptococcus
1 Tetrades
2
Sarcina sp
1 3 Grappes
de
2 raisin
Staphylococcus aureus
Staphylococcus
2. Les bâtonnets:
- Bâtonnets droits =
Bacilles
Rhodospirillum sodomense
Regroupements:
Bacilles isolés
Diplobacilles
Bacillus subtilis
Streptobacilles
Lactobacillus delbrueckii
- Bacilles incurvés:
Treponema pallidum
Spirochaeta zuelzerae
II. Paroi bactérienne
Rigide "exosquelette"
CH 2 OH CH 2 OH
O OH H O OH
H
OH O
HO H HO H
H
H NH C CH 3 NH C CH 3
H 3C CH COOH
O O
La galactosamine:
Existe chez certaines espèces seulement et en faible quantité
b- Les acides aminés
COOH
H C NH 2
COOH COOH CH 2
NH 2 C H H C NH 2 CH2
CH 3 CH 3 COOH
NH 2 C H NH 2 C H H C NH 2
CH 2 CH2 CH 2
CH2 CH 2
ou
CH 2
CH 2 CH2 CH 2
CH 2 NH 2 CH NH 2 CH
NH 2 COOH COOH
( Meso) (L)
N-Acétylglucosamine
(liaison au peptidoglycane)
b- Polyglycérol-phosphate
(Bacillus subtilis)
O
CH 2 OH
CH 2
H O O CH Glycérol
OH CH 2
HO H
O
H OH O P OH
Glucose O 2 HN
CH 2 CH CH 3
Glycérol HC O CO
CH 2
D-Alanine
O
O P OH
O
CH 2
H O
O O
OH
H
H NH CO CH 3
N-Acétylglucosamine
(liaison au peptidoglycane)
d- Les oses simples
e- Les lipides
faibles quantité chez les Gram- (10 à 22%)
presque absents chez les Gram+ (1 à 2,5%).
Gram + Gram -
1. Osamines Abondants Peu
Nombre 4 à 10 16 à 17
Oses 20 à 60 % 20 à 60 %
Lipides 1 à 2,5 % 10 à 22 %
2. Structure moléculaire
- Muréine
Le peptidoglycane - Mucocomplexe
- mucopeptide
H O OH
H O
O O
OH H
HO H (1-4)
H
H NH C CH3 NH C CH 3
CH CH 3
O O
C=O
L-Alanine
Acide D-Glutamique
Chaînon peptidique
Lysine ou DAP
D-Alanine
L'acide N-acétylmuramique joue un rôle central dans la polymérisation
des unités glycanes
M M
M
G G
G
M
M M
M
G
G G
G M M
M M
M G
G G
G G
M M
M M
M G
G G
G G M
M M
M M
G G
G G
G M
M M G La N-acétylglucosamine
M
G G
G G M L'acide N-acétylmuramique
M M
M Chaînon peptidique
G G
G
Liaison interpeptidique
Structure en réseau du peptidoglycane
Cette structure de polymère en réseau, qui donne à la cellule sa
rigidité, est caractérisée par:
G Pont
M
G
L-ala
D-glu
T DAP
D-ala
D-ala DAP Escherichia . Coli
D-glu
L-ala
G
M
G
Lâche pour les formes sphériques (liaisons interpeptidiques longues),
Pont
G G
M M
G L-ala G
L-ala
D-glu L-lys-D-glu
L-lys (Gly) D-ala L-lys D-ala – L-lys – D-glu – L-ala D-ala
D-ala 5 D-ala
L-lys L-lys L-lys
D-glu L-lys-D-glu
L-ala L-ala
G G
M M
G G
Acides téchoïques
Paroi
Acides lipotéchoïques
Mem; cyt
Représentation des acides téchoïques
Chez les Gram+ selon le modèle de
Van Driel et al. (1971)
b. Chez les bactéries Gram -
Chez E. coli 7.5 105 lipoprotéines/cellule dont les 2/3 sont à l'état
libre et le 1/3 sont liées au peptidoglycane.
Endotoxines
. lipide A:
considéré comme le support de la toxicité,
Heptose
Antigène O
Cétodesoxy
Prot. Majeures Octanate (KDO)
Peptidoglycane (Porines) LPS
• Phosphate
Lipoprotéine de
Braun N-Acétyl
Core Glucosamine
• • Acides gras
Lipide A
externe
Memb.
Paroi
Membrane
Espace
périplasmiq
Phospholipides
Protéine Protéine
intégrale périphériques
Gram + Gram -
c. Autre types de paroi
Gonflement et éclatement
de la cellule
+
Lyzosyme
( détruit les (1-4))
Milieu Milieu isotonique
hypotonique (1 ‰ de daccharose)
Gonflement et éclatement
de la cellule
b. Propriétés antigéniques
Exemples:
le groupe sérologique G
Le rhamnose
antigène C
La N-acétyl galactosamine
Des antigènes de nature protéiques: appelés antigènes M, T, R
Donc
un antigène somatique O
Deux principaux antigènes:
un antigène flagellaire H
d. Coloration de Gram
Gram, médecin danois (1884) une coloration différentielle
Frottis
A B
Gram + Gram -
III. Membrane cytoplasmique
1. Composition chimique et structure moléculaire
30 à 40 % du PS Protéines: 60 à 70 % du PS
a. Les phospholipides:
- Brucella
rareté des phosphatidyl-cholines
- Agrobactérium tumefaciens
phosphatidyl-éthanolamine (PE) G-
phosphatidyl-glycérol (PG) G+
b. Les protéines:
Protéines extrinsèques, appelées encore protéines périphériques
Protéines intrinsèques ou intégrales
c. Les glucides:
faiblement représentés (2 à 12%),
on trouve particulièrement le glucose et la glucosamine.
c. Les enzymes:
- Enzymes de la chaîne respiratoire c-à-d les déshydrogénases
- Coenzymes: cytochromes, les cytochromes oxydases ect…
2. Fonctions de la membrane
- Membrane cytoplasmique = support des enzymes de la respiratoire
++++++++++
------------- Respiration
Na+ 2e-
NADH
Substrat 2e- H+
2H+
Cytoplasme 2e-
3H 2O 3OH- H+
H+ H+ 2e-
ATP
ADP + Pi [H +int] [H+ext]
2e- H+
H 2O 2H + + 1/2 O2
F1
Membrane F0
ATP-synthétase H+ Phosphorylation
2.1. Respiration
circulation d'électrons le long d'une chaîne de transporteurs
source d'électrons: substance organique ou inorganique
récepteur terminal:
O2 aérobiose
corps organique (fumarate)
anaérobiose
Corps inorganique (nitrate)
Chez E. coli :
2. 2. Phosphorylation oxydative
Au niveau de la membrane, l'ATP est synthétisée par une H+-ATPase (ou
ATP-synthétase) utilisant la force protomotrice crée par la chaîne
respiratoire.
2. 3. Transport
Maltose
Substances Mélibiose Proline
Glycérol Glutamine Glucose Na+ H+
liposolubles B.P Lactose
II
Transport facilité:
b. Transport actif
Se fait contre le gradient de concentration c-à-d du moins concentré
vers le plus concentré.
membrane
externe
Binding protein
protéines
F&G éspace
périplasmique
Protéine Tar
membrane
cytoplasqmique
P Mannitol-1- phosphate
(m rot . Métabolisme
ann II
i to
l)
Prot.III-P hpr Prot.I-P
Pyruvate
Prot.II Prot.III Prot.I PEP
(glucose) Hpr -P
Glucose–6-phosphate Glycolyse
Métabolisme
Transport actif secondaire ou osmo osmotique
extérieur
Ex. Chez E. coli
intérieur
H+ Lactose
les deux éléments sont véhiculés par une protéine intrinsèque (perméase lac y),
Quantité de la radioactivité
Bactérie
+ t0 Filtration dans la bactérie
14
Substance X C Q0
[C1]
t1 Filtration Q1
t2 Filtration Q2
. . .
. . .
. . .
. . .
tx Filtration Qx
Quantité de la radioactivité
dans la bactérie
Temps
Temps
Q max 4 [C4]
Q max 3 [C3]
Transport actif
[S] intracellulaire
Qx
.
.
Transport passif
. OU
.
Q2
Q1
Q0
Co C1 C2 . . . . Cx
[S] extracellulaire
Comment distinguer entre les différents types de transport actif ?
Les deux sous unités sont reliées entre elles par l'intermédiaire
de liaisons ARN - protéine et protéine - protéine.
Amidon et glycogène
Acide poly ß-hydroxybutirique
Granulations métachromatiques Corynebacterium diphterieae
- soufre chez les thiobactéries
inclusions de - fer chez les sidérobactéries
- oxyde de fer (Fe3O4): bactéries << magnétiques >>.
magnétosomes
3. Chromatophores et pigments
1. Chromosome bactérien
filament unique, continu et circulaire, formé d'une double chaîne d'ADN
2. Plasmides
a. Composition chimique
H O OH
HO O
O O
OH H
H H (1-4)
H
H OH OH
Acide aldobionique
- acide galacturonique
des acides uroniques: - acide glucuronique
-acide cellobiuronique, …
- glucose
des oses: - galactose
-rhamnose, …
La capsule est également de nature polyholosidique chez de
nombreuses bactéries Gram- :
b. fonctions
dans environnement
la dessiccation.
2. Flagelles ou cils
2 types de mouvement:
Chez les myxobactéries: déplacement par glissement,
Spirochaeta zuelzerae
Chez les eubactéries, la mobilité est assurée par des flagelles.
Proteus mirabilis
En microscopie électronique, ils apparaissent sous forme d'organites
simples, filamenteux, sinueux, généralement plus long que la bactérie
elle même, de l'ordre de 6 à 20 µm.
Insertion polaire:
Monotriche
Amphitriche
Lophotriche
Insertion péritriche :
Flagelle constitué d’une protéine, de PM de 30 à 40 Kda, la
flagelline qui fait partie de la famille des Kératomyosines.
Chimiotactisme
sucres et acides aminés les attirent chimiotaxie positive
phénols, acides et bases les repoussent chimiotaxie négative
3. Pili et fimbriae
appendices filiformes différentes des flagelles,