Академический Документы
Профессиональный Документы
Культура Документы
NDEKLER
NDEKLER ............................................................................................................................................................................ 1 ATP .......................................................................................................................................................................................... 2 OKSJENL SOLUNUM .............................................................................................................................................................. 3 GLKOLZ .................................................................................................................................................................... 3 KREBS DNGS ....................................................................................................................................................... 4 ELEKTRON TAIMA SSTEM (ETS) .............................................................................................................................. 5 BESNLERN SOLUNUMA KATILMALARI ..................................................................................................................... 7 MEKK SSTEMLER .................................................................................................................................................................. 9 1 - GLSEROL FOSFAT MEK ..................................................................................................................................... 9 2 MALAT ASPARTAT MEK ................................................................................................................................... 9 YALARIN OKSDASYONU ....................................................................................................................................................... 9 OKSJENSZ SOLUNUM .......................................................................................................................................................... 11 ETL ALKOL FERMANTASYONU ................................................................................................................................. 11 LAKTK AST FERMANTASYONU ............................................................................................................................... 11 FOTOSENTEZ : ENERJNN BALANMASI .............................................................................................................................. 14 IIK ENERJS VE KLOROFL ....................................................................................................................................... 14 KLOROFLN ETKNLETRLMES (FOTOSSTEMLER) ........................................................................................ 15 FOTOSENTEZ EVRELER ............................................................................................................................................ 16 1. IIK REAKSYONLARI ..................................................................................................................................... 16 DEVRSZ FOTOFOSFORLASYON : .......................................................................................................... 18 DEVRL FOTOFOSFORLASYON : ............................................................................................................ 18 2. KARANLIK EVRE (KARBON TUTMA) REAKSYONLARI (CALVIN DNGS).................................................. 19 ORGANK MOLEKL SENTEZ ................................................................................................................................... 20 BAKTERLERN FOTOSENTEZ ................................................................................................................................... 21 FOTOSENTEZ HIZINI ETKLEYEN FAKTRLER ............................................................................................................ 21 EVRESEL FAKTRLER ...................................................................................................................................... 21 GENETK (KALITSAL) FAKTRLER ...................................................................................................................... 22 FOTOSENTEZ LE SOLUNUM LKS ........................................................................................................................ 23 C3, C4 ve CAM BTKLER ........................................................................................................................................... 24 C3 ve C4 bitkilerinin farklar .................................................................................................................... 25 KEMOSENTEZ ........................................................................................................................................................................ 25 CANLILARDA ENERJ DNM ALIMA SORULARI........................................................................................................ 27 1
ATP
Tm canllarda enerjinin depoland molekldr. Molekl yaps byk olduundan hcreden hcreye geemez. Bunun iin her hcrede oksijenli ve oksijensiz solunumla hcrenin kullanabilecei ATPnin sentezlenmesi gerekir. ATP yksek enerjili fosfat balarna sahiptir. Yapsnda prin bazlardan Adenin, 5 karbonlu riboz eker ve fosfat grubundan oluur. Bu fosfat grubundan son ikisi yksek enerjili fosfat balarna sahiptir. Bu balarn her birinin hidrolizi (paralanmas) 7300 kalorilik enerji aa karr. Bu enerji hcre ii metabolizma faaliyetlerinde kullanlr.
Canllardaki enerjinin kayna gnetir. Gne enerjisi ototrof canllar tarafndan organik besinlerdeki kimyasal ba enerjisine dntrlr. Heterotrof canllarda ototrof canllar sayesinde bu enerjiden faydalanrlar. Heterotrof canllar aldklar besinleri oksijenli ve oksijensiz olarak ykarak kimyasal balar arasndaki enerji ile ATP sentezlerler. Buna Solunum ad verilir. C6H12O6 + 6O2 ----------> 6CO2 + 6 H2O + 38 ATP karyot hcrelerde solunum reaksiyonlar (ATP sentezi) sitoplazma ve mitokondrilerde gerekleir. Prokaryot hcrelerde mitokondri olmadndan yalnzca sitoplazmada gerekleir.
ATP den Pi kopartlarak aa kan enerjinin biyokimyasal reaksiyonlarda kullanlmasna da ATP tketilmesi denir. ADP moleklne enerji yardmyla Pi (inorganik fosfat) balanmasna fosforilasyon denir. ATP'nin sentezi endergonik (enerji alan); ykm (hidrolozi) ekzergonik (enerji veren) tepkimedir. ATP endergonik olaylarda harcanr. Difzyon, osmoz ve hidroliz olaylarnda enerji harcanmaz.
Yaamsal faaliyetler iin gerekli olan ATP sentezi Substrat dzeyinde fosforilasyon, Oksidatif fosforilasyon ve Fotofosforilasyon olmak zere canllarda 3 farkl ekilde gerekletirilir.
OKSJENL SOLUNUM
Organik besinlerin Oksijen kullanlarak yklmasyla ATP retimine Oksijenli Solunum (Aerobik Solunum) denir. karyot hcrelerde sitoplazma ve mitokondride, Prokaryotlarda ise hcre zarnn zel kvrml blgelerinde solunuma yardmc enzimler in kullanld tepkimler sonucu ATP retilir. Ototrof canllar fotosentez sonucu gne ndan aldklar enerjinin yaklak %40 n rettikleri besinlere kimyasal enerji olarak aktarrlar. Tketici canllar ise metabolizmalar sonucu besinleri monomerlerine paralarlar. Besin monomerleri sitoplazmada belli bir dzeye kadar paralanarak bir miktar ATP sentezlenir. Paralanma sonucu oluan kk molekller mitokondriye alnarak burada matriks ve kristadaki solunum enzimleri yardmyla ATP retimine devam edilir. Besinlerin paralanmas srasnda aa kan dk serbest enerji inorganik fosfatn (Pi )ADP ye balanmasnda kullanlr. Oksijenli solunum Glikoliz, Krebs Dngs (Sitrik Asit emberi=Tri Karboksilik Asit) ve ETS (Hidrojen yolu) evrelerinden oluur. Glikoliz oksijenli ve oksijensiz solunumda ortaktr.
GLKOLZ
Sitoplazmadaki glikoz moleklnn tepkimeye girebilmesi iin aktiflemesi gerekir. ATP moleklnden bir P ayrlarak glikoza balanr ve glikoz monofosfat oluur. ATP fosfat kaybederek enerji aa karr ve ADP ye dnr. Bu enerji tepkimenin balayabilmesi iin gerekli aktivasyon enerjisini salar. Glikoz monofosfat enzimler yardmyla kimyasal yaps deierek fruktoz monofosfata dnr. Fruktoz monofosfata ATP den bir P daha balanarak fruktoz difosfat oluturulur. Fruktoz difosfat yine enzim sayesinde (Aldolaz) 2 tane Fosfogliseraldehit (PGAL) moleklne paralanr. Bu oluan iki PGAL moleklnden ayrlan proton ve elektronlar NAD+ (Nikotinamit adenin dinkleotit 1) koenzimine aktarlr. Elektron tayc olarak grev yapan NAD+ proton ve 2 elektronu alarak 2NADH+H+ ya indirgenir. Heriki PGAL moleklne de ayrlan Hidrojenlerin yerine birer P daha balanr ve Difosfogliserik asit (DPGA) oluur. Bu fosfatlar sitoplazmadaki iyonik fosfatlardr. Her iki DPGAdaki ikier fosfat enzimler sayesinde ADP lere balanarak nce Fosfogliserik asit (PGA), sonra da Pirvat (Pirvik asit) oluur. Glikoliz substrat dzeyinde fosforilasyondur. Glikoliz sonucunda aktivasyon iin 2 ATP harcanr. Toplam 4 ATP sentezlenir. Kazan Net 2 ATP dir.
Glikozdaki enerjinin byk bir ksm pirvatta tutulur. Pirvattaki bu enerjiden daha sonraki tepkimelerle yeniden ATP sentezlenir.
KREBS DNGS
Sir Hans Adolf Krebs 1900 ylnda Almanyada dodu, 1981 ylnda ngilterede ld. Sheffield niversitesinde profesr olarak alrken re (1932) ve sitrik asit (1937) dnglerini tanmlad. 1954 te Oxford niversitesine profesr oldu. 1953 ylnda fizyoloji dalnda Nobel dl ald.
Ortamda O2 varlnda Glikoliz sonucu oluan 2 Pirvat ve 2NADH+H+ mitokondriye alnr. ndirgenmi NAD larn Mitokondri matriksine alnmas iki farkl mekik sistemi ile olur. Malat-Aspartat Mekii enerji aktarm yksek mekiktir ve bu sistemle Matrikse aktarlrsa 38 ATP (Kalp ve Karacier hcrelerinde), Gliserol Fosfat Mekii ile aktarlrsa net 36 ATP (kas ve sinir hcrelerinde) retilir. Konu sonunda aklanacak. Oksijensiz ortamda pirvat mitokondriye girmez ve etil alkol yada laktik asit femantasyonuna katlr. Pirvik asit mitokondri matriksinde nce Asetata (CO2 aa kar ), sonrada Asetil Co A ya indirgenir ( NAD dan NADH+H+ oluur ). Asetil Co-A Krebs dngsnde CO2 ve H2O ya kadar paralanr. 2 karbonlu Asetil Co-A, 4 karbonlu Okzaloasetikasit (okzaloasetat) la tepkimeye girerek 6 karbonlu Sitrik asiti meydana getirir. Sitrat nce ketoglutarata (NADH+H + ve CO2 oluur), sonra da Suksinil Co-A (NADH+H + ve CO2 oluur) ya dnr.
Suksinil Co-A suksinata dnrken GDP (Guanozin difosfat) fosfat alarak GTP ye dnr. Daha sonra bu Fosfat ADP ye vererek ATP sentezi gerekletirilir. (Substrat dzeyinde fosforilasyon) Suksinat Fumarata dnrken baka bir elektron taycs olan FAD (Flavin adenin dinkleotit 2 ) indirgenerek FADH2 oluturulur. Fumarat Malata sonrada Okzaloasetata dnr. Bu srada yine NAD+ indirgenerek NADH+H+ oluur.
SONU OLARAK : Glikoliz sonucu oluan 2 NADH+H+ ve Pirvattan Asetil Co-A oluurken oluan 2 NADH+H+ ve Krebs emberinde oluan 6 NADH+H+ ve 2 FADH2 molekl ETS ye iletilir. (Toplam 10 indirgenmi NAD ve 2 indirgenmi FAD) Pirvatlarn Asetil Co-Aya dnm srasnda aa kan 2CO2 ve Krebs evriminde aa kan 4 CO2 akcier solunumu yapan canllarda hcrelerden kana geer, oradan da akcierlere geerek soluk alp verme yoluyla dar atlr. Krebs evriminde 2 ATP sentezlenir.
Bylece iki zar aras matrikse gre daha yksek proton deriimine sahip olur. Ayn zamanda protonlarn tad elektrik yknden dolay i zarn iki yz arasnda elektriksel yk fark doar. Bu potansiyel enerji ATP sentaz yardmyla Oksidatif fosforilasyon iin kullanlr. Mitokondri i zar protonlara kar geirgen deildir. ATP sentaz enzimi bu protonlarn matrikse gemeleri iin bir yoldur. Proton ak ATP sentaz aktifletirir ve protonlar matrikse doru getike ADP ye bir P eklenerek ATP elde edilir. ETS sisteminde son elektron alc Oksijendir. Son aamada dk enerjili hale gelen elektronlar Oksijen ve Hidrojeni birletirerek suyu oluturur. Solunumda retilen enerjinin byk bir ksm ETS ile retilir. Bu protonlar ve elektronlar indirgenmi NAD tarafndan ETS ye iletilirse 3 ATP, indirgenmi FAD tarafndan ETSye iletilirse 2 ATP sentezlenir. SONU OLARAK;
ETS iin 10 indirgenmi NAD ve 2 indirgenmi FAD gelmiti. 10 *3 =30 ATP ; 2*2=4 ATP ; Toplam 34 ATP (ETS ile) Glikoliz ile 2 ATP ; Krebs evrimi ile 2 ATP ; Oksijenli solunumda Toplam 38 ATP retilir.
O2li solunumda ETS ye aktarlan indirgenmi NAD ve FAD larn tad 2 er Hidrojen atomu Oksijen ile birleerek toplamda 12 molekl H2O oluturur. Substrat dzeyinde fosforilasyonla mitokondri ierisinde Pirvattan Asetil CO-A oluurken 2 CO2; Krebs evriminde 4 CO2; toplamda 6 CO2 oluur. Bunlar kana karp akcierler ile dar atlr. O2li solunumda besinlerden elde edilen enerjinin bir ksm s enerjisine dnrken, bir ksm oluan bileiklerde kalr. Bu s enerjisi vcut scaklnn dzenlenmesinde kullanlr. Baka bir deyile O2li solunumda enerji verimi %40 tr. RNEK : 3 molekl glikoz tepkimeye girerse Krebs evriminde ka molekl ATP ve CO2 retilir ? 1 molekl glikozdan Krebs evrimi ile 2 ATP ve 4 CO2 retildiine gre; 3 molekl iin; 2 ATP *3 = 6 molekl ATP ve 4 CO2 *3= 12 molekl CO2 aa kar. RNEK: O2li solunum srasnda 6 molekl Asetil Co-A tepkimeye girdiinde oksidatif fosforilasyonla ka ATP retilir ? 2 molekl Asetil Co-A dan oksidatif fosforilasyonla 22 ATP sentezlenir. 6 Asetil Co-A ile 3*22 = 66 ATP sentezlenir.
Ya asidi ykm mitokondride ATP kullanlarak, molekln aktivasyonu ile balar. Ya asidi bu reaksiyonda koenzim Aya balanr. Her ya asidi iki karbonlu asetil Co-Aya paralanr. Bu asetil Co-A, sitrik asit evrimine girer ve enerji elde edilir. Lipidlerin yapsndaki H saysnn fazla oluu daha fazla ATP ve su aa karmalarna neden olur. rnein; 18 karbonlu ya asidi olan stearik asidi 9 asetil Co Aya ayrlr. Bunun iin ya asidi ykm evrimi 9 defa tekrarlanr. 9 mol asetil Co A, sitrik asit yklarak 9 mol ATP, 9 mol FADH2=(18 mol ATP), 27 mol NADH2=(81 mol ATP) elde edilir. Sonu olarak bir mol stearik asit ykm 108 mol ATP lik bir enerji kazanc salar.
Aminoasitler ise ierdikleri karbon saysna gre asetil CO-A dan, 3 karbonlu pirvattan yada Krebs dngsnden solunum tepkimelerine katlr. Aminoasitlerin amino gruplar molekl tepkimeye girmeden aminaz enzimi sayesinde ayrlr. Proteinler enerji kayna olarak kullanrsa son rn olarak CO2 ve H2O yannda NH3 da ortaya kar. Zehirli olan bu madde reye evrilerek dar atlr.
MEKK SSTEMLER
1 - GLSEROL FOSFAT MEK
Mitokondri zarndan indirgenmi NADlar zerindeki elektronlar Matrikste FADlar zerine aktarlrlar. Bu sistemde 3 mol ATP yerine 2 mol ATP sentezlenir. Belirli kas ve sinir hcrelerinde grlr.
YALARIN OKSDASYONU
Ya asidi molekl her oksidasyon sonucunda 2 karbon birimi ksalarak asetilCoAya indirgenmektedir. Her asetilCoAda krebs devrinde CO2 ve H2Oya paralanmaktadr. Bir oksidasyon srasnda 5 mol ATP, Krebs devrinde ise 12 mol ATP sentezlenmektedir. Buna gre stearik asidin (CH3(CH2)16COOH) oksidasyonu ile ka mol ATPnin sentezlendiini hesaplayalm.
8 tane oksidasyona urar. 9 tane asetilCoA oluur. oksidasyon 8x5=40 ATP AsetilCoA 12x9=108 ATP Toplam=148 ATP 1482=146 NET ATP
9
16 Clu Palmitik asit oksidasyon 7x5=35 mol ATP AsetilCoA 12x8=96 mol ATP Toplam 131 mol ATP2=129 mol NET ATP Enerji verimi 1 mol palmitik asit 2340 K.kal 1 mol ATP 7.3 K.kal 7.3x129=942 K.kal Palmitik asit oksidasyonu sonucu verim 942/2340x100=40
10
OKSJENSZ SOLUNUM
Organik besinlerin Oksijen kullanlmadan yklmasyla aa kan enerji ile ATP retimine Oksijensiz Solunum (Anerobik Solunum = Fermantasyon = Mayalanma) denir. Bakterilerin byk ounluunda, maya mantarlarnda, omurgal izgili kas hcrelerinde ve tohumda gerekleir. Louise Pasteur tarafndan 1857 de kefedilmitir. Fermantasyon glikoliz ile balar. Oluan 2 Pirvat oksijensiz ortamda kullanlan enzimlere gre Etil alkol veya Laktik aside kadar paralanr.
Pirvat NADH+H+ n hidrojenlerini alarak laktik asidi meydana getirir. NAD molekl yine ykseltgenir. Substrat dzeyinde fosforilasyondur. Youn kas faaliyetleri sonucunda oluan laktik asit hcrelerde birikir ve yorgunlua neden olur. Bu miktar artarsa laktik asit kan yoluyla beyindeki uyku merkezini uyarr. Dinlenme srasnda yeterli miktarda oksijen alnrsa laktik asit hidrojenlerini kaybederek ykseltgenir ve pirvat oluur. Pirvat oksijenli solunum tepkimelerine katlr. Laktik asit fermantasyonu sonucu 1 mol glikozdan 2 mol laktik asit, 4 ATP (net 2 ATP) ve bir miktar s oluur. CO2 olumaz. Yourt, yayk ayran, tuzsuz beyaz peynir ve turu retiminde laktik asit fermantasyonundan yararlanlr. Yourt bakterisi Lactobacillus vulgaris laktik asit fermantasyonu sonucu st yourta evirir. Stn iindeki bakterilerin fermantasyonu ile ortamn pH deieceinden stteki proteinler kelip stn kesilmesine sebep olur. rnek 1: Laktik asit fermantasyonu sonucu net 40 ATP retilmise tepkimeye giren glikoz miktar ve aktivasyon iin harcanan ATP miktar nedir?
1 mol glikozdan net 2 ATP kazanldna gre; Net 40 ATP iin 40/2 = 20 mol glikoz tepkimeye girmitir. 1 mol glikozun aktivasyonu iin 2 ATP gerektiine gre; 20 mol glikoz iin; 20*2=40 ATP aktivasyon iin harcanr. rnek 2: Aralarnda 102 glikozit ba bulunan bir polimerin etil alkol femantasyonu sonucu ka mol CO2 aa kar?
Aralarnda 102 ba bulunduuna gre 103 mol glikoz tepkimeye girmitir. 1 mol glikoz tepkimeye girdiinde 2 CO2 aa ktna gre; 103 mol glikoz iin; 103*2=206 CO2 oluur.
12
13
Baz alglerde klorofilin yan sra krmz rengi veren fikoeritrin ve mavi rengi veren fikosiyanin gibi pigmentler de bulunabilir. Baz bitkilerde ise turuncu rengi veren karoten ve sar rengi veren ksantofil renk pigmentleri de vardr. Bu pigmentler klorofilin yakalayabildiinden daha farkl dalga boyuna sahip nlarn sourularak klorofile aktarmasn salarlar. Klorofildeki porfirin halkas yap bakmndan hayvanlardaki hemoglobine benzer. Hemoglobinde farkl olarak merkezde Fe atomu bulunur.
3 4
1 nm = mm nin milyonda biri = 10 mm = 10 m = 10 Angstrom () Foton = In yapsnda yksek hzda hareket eden, enerji ykl tanecik
-6
-9
15
FOTOSENTEZ EVRELER
Fotosentez a baml k reaksiyonlar ve ktan bamsz gerekleen karbon tutma reaksiyonlar olmak zere iki ekilde gerekleir.
Fotosentezin k reaksiyonlar evresinde n suyu paralamas (fotoliz) sonucu oluan oksijen serbest halde aa kar. Suyun Hidrojenleri NADP+ koenzimi ile birleerek NADPH+H+ molekln oluturur. (indirgenme (5)) Bu evrede k enerjisi yardmyla ATP sentezlenir. NADP +(Nikotinamid Adenin Dinkleotid Fosfat) fotosentez reaksiyonlarnda grev alan nemli bir koenzimdir. O2li solunumdaki NAD +gibi bir ift H+ atomu aktarldnda 2 elektronla bir proton tutarak indirgenir, bir proton serbest hale geerek NADPH+H+ oluur. Fotosentezin karbon tutma reaksiyonlarnda ise CO2, suyun H+ leri ile birleerek glikoza dntrlr. Dnm iin gerekli enerji ATP den salanr.
1. IIK REAKSYONLARI
Bu evrede karbon tutma reaksiyonlar iin gereken ATP ve NADPH2 oluur. Ayrca O2 aa kar ve atmosfere verilir. Bir klorofil molekl k enerjisini sourduu zaman, bu enerji klorofilin bir elektronuna geirilir. Enerji dzeyi artan e- bir st yrngeye geer ve eer e- yeterince enerji yklenirse d yrngeye gemekle kalmaz, atom ya da moleklden tamamen ayrlabilir. Bu durumda e- kaybetmeden atom / molekl pozitif iyon haline gelir. Klorofilden ayrlan yksek enerjili e-, kloroplastalarn granalarnda tilakoit zar zerinde bulunan ETSye geer. ETS elelmanlar ferrodoksin (Fd), plastokinon (Pq) (flavoprotein), sitokrom kompleksi (Stk) (sitokrom b ve c) ve plastosiyanindir (Pc). Elektron ETS deki tayc molekllerden her defasnda getike fazladan kazanlm enerjinin bir ksmn serbest brakr. Bu enerjinin bir blm ATP sentezinde kullanlr. ETS kullanlarak k enerjisi yardmyla ATP sentezine fotofosforilasyon denir. Oksijenli solunumun son basamanda ETS ile ATP sentezini Kemiozmotik Hipotez ile aklamtk. Ia baml tepkimelerde Fotofosforilasyonla ATP sentezini de bu hipotezle aklamak mmkndr. Tek fark hcresel solunumda ETS elemanlar krista zerinde yer alyordu ve d zar ile i zar arasndaki zarlar aras bolukta H+ iyonlar younluk fark gerekleiyordu.
16
Fotosentezde ise bu olay tilakoit zarlarn arasnda yer alan tilakoit bolukta gerekleiyor. Fotosistemler ve bunlarn arasndaki ETS elemanlar elektronlar tarken, stromadan tilakoit bolua doru H+ geii gerekleir. Tilakoit boluktaki H+ younluunun artmas ile elektriksel yk fark oluur ve protonlarn ATP sentaz dan stromaya geii ile aktifleme sonucu ATP retimi gerekleir. Bu srada elektron enerji ykn azaltarak enzim sayesinde NADP+ ya aktarlr. Bunun sonucunda Karanlk evre reaksiyonlar iin gerekli olan ATP ve NADPH oluturulmu olur.
Klorofilden ayrlan yksek enerjili e- ayrld klorofile geri dnerse Devirli Fotofosforilasyon, dnmezse Devirsiz Fotofosfosilasyon gerekleir. 17
DEVRSZ FOTOFOSFORLASYON : FS I uygun dalga boyundaki sourduu zaman klorofil e- kaybeder ve bu yksek enerjili e- ilk elektron alc tarafndan tutulur. Daha sonra ferrodoksin (Fd)e aktarlr. ndirgenen Fd, elektronunu NADP Redktaz enzimi sayesinde NADP+ ye vererek ykseltgenir. NADP+ suyun fotolizi sonucu oluan Hidrojen protonlarn alarak NADPH+H+ ye dnr. FS II uygun dalga boyundaki sourmasyla klorofilden kopan yksek enerjili e- nce ilk elektron alcya, sonra Plastokinona (Pq), daha sonrada Sitokromlara (Stk) ve Pilastosiyanine, en son FS Ie aktarlr. Elektronun bu tanm srasnda serbest kalan enerji ile ATP sentezlenir. (Chemiosmotic Hypothesis) FS Ie elektron vererek ykseltgenen FS II, elektron an fotoliz sonucunda aa kan elektronlardan karlar. FS II sudan e- alrken yan rn olarak aa kan O2 atmosfere verilir. Atmosfere verilen O2 nin kayna sudur. SU; NADP+ iin H+, atmosfer iin O2, FS II iin e- kaynadr. Devirsiz fotofosforilasyonda su harcanarak ATP ve 2 NADPH2 retilir ve atmosfere oksijen verilir.
DEVRL FOTOFOSFORLASYON : FS I de Klorofil moleklnn (P700) emmesiyle serbest kalan yksek enerjili e-, nce ilk elektron alcya sonra da ETS nin ilk e- alcs olan Ferrodoksine geer. Bylece e- veren klorofil ykseltgenmi olur. (Klorofil+) Ferrodoksinden plastokinona ve oradanda sitokroma geen e-, tad enerjiyi ortama brakr ve bu srada ATP sentezlenir. Pq dan sonra semiqinonlar devreye girer. Semiqinon 1 eaktarabilir. Campbell Biyoloji ve Taiz Bitki Fizyolojisinde aklamalar var. Sonuta e- ayrld klorofile geri dner ve bylece klorofil kaybetmi olduu elektronu yeniden kazanarak indirgenir, ntr hale geer. Herhangi bir bileiin tketimi gereklemez. Dngsel elektron ak dngsel olmayan elekton aknn bir paras olarak i grr. Fazla miktarda ATP gerekliyse dngsel elektron ak gerekleir. Kemiozmotik hipoteze gre a baml reaksiyonlar sonucunda oluan ATP says kesin olarak bilinememekle birlikte 1 molekl CO2nin eker ierisinde fiske edilebilmesi iin 2 mol NADPH ve 3 mol ATP ye ihtiya vardr. SONU : Ik reaksiyonlarnda 3 ATP, 2 NADPH2 retilir ve Oksijen yan rn olarak aa kar. Ik enerjisi 2 H2O + 3 ADP + 3 Pi + 2 NADP
+
Melvin Calvin ve arkadalar 1950li yllarda gerekletirdikleri bir dizi deney sonucunda fotosentezin ktan bamsz evrelerini aklamlardr. Melvin Calvin bu almalarndan tr 1961 de Nobel dl almtr.
19
Fotosentezin karbon tutma reaksiyonlarnda 1 CO2 iin 3 ATP ve 2 NADPH2 kullanlr. Fotosentezin genel denklemine gre 6 molekl CO2 tepkimeye girerse toplam 18 ATP ve 12 NADPH2 a ihtiya duyulur. Yani 1 mol glikoz iin karbon tutma reaksiyonlar 6 kez tekrarlanmas gerekir. 6 mol RuDP, 6 mol CO2 tutar ve 12 mol PGAL oluur. 12 PGALin yapsnda 36 C atomu vardr. 12 PGALin 2 mol (6 karbonu) eker yapmnda kullanlr. Geri kalan 10 PGAL (30 karbon) nce 6 mol RuMPa sonra balangtaki 6 mol RuDPa dntrlr. Bylece organik madde retimi sreklilik kazanr.
RNEK 1 : Bitkide fotosentez srasnda 3 mol glikoz olutuuna gre a baml tepkimelerde ka molekl ATP ve NADPH2 sentezlenmesi gerekir ? 1 molekl C6H12O6 iin 18 molekl ATP ve 12 molekl NADPH2 kullanldna gre ; 3 mlekl iin 3*18 = 54 mol ATP ve 3*12 = 36 mol NADPH2 kullanlr. RNEK 2 : Fotosentezin ktan bamsz tepkimelerinde 24 mol CO2 kullanlrsa fotosentezin k tepkimelerinde ATP ve NADPH2 ye ihtiya vardr ? 6 mol CO2 iin 18 mol ATP kullanldna gre 24 mol CO2 iin 4*18=72 mol ATP gerekir. 6 mol CO2 iin 12 mol NADPH2 kullanldna gre 4*12=48 mol NADPH2 gerekir. RNEK 3 : Bir bitkinin kk hcresinde depo edilmi olan niasta molekln monomerlerine paralamak iin 195 molekl suya ihtiya duyulduuna gre, bu niastann yapsndaki monomerleri oluturmak iin bitki ka molekl CO2 kullanmtr ? Niastay hidroliz iin 195 molekl su gerektiine gre, hidroliz sonucu 195+1 = 196 molekl glikoz oluur. 1 molekl glikoz iin 6 CO2 kullanldna gre, 196 molekl glikoz iin 196*6=1176 molekl CO2 kullanlmtr. 20
BAKTERLERN FOTOSENTEZ
Kloroplastlar bulunmadndan yeil bitkilerden farkl olarak klorofilleri sitoplazmada, ETS enzimleri ise hcre zarnda yer alr. Fotosentez yapan bakteriler siyanobakteriler (mavi-yeil algler), mor slfr bakterileri ve hidrojen bakterileri rnek verilebilir. Siyanobakteriler fotosentez srasnda bitkiler gibi CO2 ile birlikte su kullanrlar ve oksijen aa karrlar. Mor kkrt bakterileri ise hidrojen ve elektron kayna olarak su yerine H2S (hidrojen slfr) gaz kullanrlar ve yan rn olarak oksijen yerine kkrt aa karrlar. Ik CO + 2 H S Besin + 2 S + H O
2 2 2
Hidrojen bakterileri ise hidrojen ve elektron kayna olarak H2 gazn kullanrlar. Ik CO + 2 H Besin
2 2
evresel Faktrler: CO2 miktar, Ik iddeti, In dalga boyu, Scaklk, Su miktar, Mineral tuzlar ve Ortamn pH. Genetik (Kaltsal) Faktrler: Kloroplast says, Yaprak yaps, Stomalarn yaps ve says, Kloroplastlarn ierdii su miktar, Enzim miktar ve Ktikula kalnl.
EVRESEL FAKTRLER
1. KARBONDOKST MKTARI Fotosentezin ktan bamsz tepkimeleri iin gerekli olan CO2 miktar arttnda fotosentezin hz belirli bir deere kadar artar, sonra sabit kalr. CO2 miktar gerektiinden az ise dier maddeler uygun deerde olsa da fotosentez yavalar. (Minimum Kural) Eer fotosentez ortamnda KOH (potasyum hidroksit) ve NaOH (sodyum hidroksit) gibi karbondioksiti tutan bileikler bulunuyorsa fotosentez hz der. CO2 ile k bir arada dnlrse CO2 miktar arttka n iddetine bal olarak fotosentez hz deiir. Ik iddeti arttka fotosentez hz artar. CO2 miktarnn artt durumlarda n iddeti dkse fotosentez hz k iddetine bal kalr. (Minimum Kural) 2. IIK DDET Fotosentez iin k, a baml tepkimelerde ATP ve NADPH sentezlenmesi iin gereklidir.Ik iddetindeki art fotosentez hzn da belirli bir seviyeye kadar artrr, daha sonra fotosentez hz sabit kalr.
21
3. IIIN DALGA BOYU Fotosentez mor, mavi, yeil, sar, turuncu ve krmz renklerdeki kta gerekleir. Fotosentez hz mor ve krmz renkte yksek, yeil kta en dktr. Fotosentez hzn belirleyen etken n dalga boyu ya da enerjisinin azalp artmas deil klorofil molekl tarafndan n sourulmasdr. Klorofil pigmenti en fazla mor ve krmz dalga boyundaki nlar en az ise yeil dalga boyundaki nlar sourur. Dolaysyla fotosentez hz en yksek mor ve krmz kta, en dk ise yeil renkte olur. 4. SICAKLIK Scaklk enzimlerin almasn etkileyen faktrlerden biridir. Uygun scakln olduu ortamlarda fotosentezin ktan bamsz tepkimelerinde kullanlan enzimlerin verimlilii de artar. Scakln 40 C nin zerine kmas enzimlerin yapsn bozacandan tepkime hz da yavalar. Ik iddeti dk olduunda scaklk yksek olsa bile fotosentez hznda belli bir deime olmaz. 5. SU MKTARI Fotosentezin gerekleebilmesi iin su gereklidir. Su a baml tepkimelerde fotolize urayarak FS II iin elektron kayna, NADP+ iin hidrojen kayna ve atmosfer iin oksijen kayna olur. Ortamdaki suyun art fotosentez hzn da artrr. Belli bir deerin zerine kan su miktar fotosentez hzn deitirmez, sabit kalr. Enzimlerin alabilmesi iin ortamdaki su miktarnn % 15 in zerinde olmas gerekir. Bu deerin altndaki miktarlarda fotosentez durur. 6. MNERALLER Fotosentezde etkili olan mineraller Fe, Mg, Ca, K, N, P, S gibi minerallerdir. Fe ferrodoksinin, Mg klorofilin, P ATP nin, nkleik asitlerin, N aminoasit, nkleik asit ve vitaminlerin yapsna katlr. Baz mineraller ise enzimlerin yapsna kofaktr olarak katlr. Bitkilerdeki fotosentez hz dolaysyla bymenin hz, bulunduu ortamdaki minerallerden en az olanna gre belirlenir. 7. ORTAMIN pH DEER Fotosentezin gerekleebilmesi iin ortam pH deerinin belirli bir seviyede tutulmas gerekir. Iktan bamsz tepkimelerde enzimler grev aldndan dolay pH fotosentez hzn etkiler. nk ortam pH enzimlerin almas zerine olumlu yada olumsuz etki eder. Farkl enzimler farkl ortam pHlarnda etkin alrlar.
22
2. STOMALARIN SAYISI ve YAPISI Yapraktaki stoma (gzenek) ad verilen aklklar bitkinin gaz al veriini salar. Turgor basnc ile alp kapanabilirler. Stoma says ne kadar fazla ise bitki karbondioksitten daha ok faydalanr ve fotosentez hz artar. Stomalarn yaps, bykl ve dal da fotosentez hz zerine etkilidir. 3. YAPRAKLARIN YAPISI ve SAYISI Geni yaprakl bitkiler gne ndan daha ok yararlanacandan ve yaprakta bulunan kloroplast says artacandan fotosentez hz artar. Bitkilerde yaprak says ne kadar fazla ise fotosentez hz o kadar artar. Ayn bitkinin dorudan k gren yapraklar ile alt ksmda yer alan, tam alamayan yapraklar farkl hzda fotosentez yaparlar. Yani yapraklarn konumu da fotosentez hzna etki eder. 4. ENZM MKTARI Geni Fotosentez de biyokimyasal reaksiyonlar enzimlerin denetiminde gerekletiinden fotosentezde grev yapan enzimlerin miktar fotosentez hzn artrr. 5. KTKULANIN KALINLII Yapraklarn yzeyini rten ve bitkinin su kaybn nleyen mumsu tabakaya Ktikula denir. Bu tabaka kurak ortam bitkilerinde kaln, sulak ortam bitkilerinde incedir. Ktikulann kalnl bitkinin su kaybna bal olarak fotosentezi etkiler.
23
OKSJENL SOLUNUM
Basit yapl canllar hari tm canllarda grlr. karyot canllarn mitokondrilerinde gerekleir. Ik ve karanlkta kesintisiz gerekleir. Karbondioksit ve su aa kar. Besin ve oksijen tketilir. Besinlerdeki kimyasal ba enerjisi ATP nin fosfat balar arasndaki kimyasal ba enerjisine dntrlr. Ekzergonik (enerji veren) tepkimedir. Arlk azalmasna neden olur.
24
C3 ve C4 bitkilerinin farklar
C3 bitkilerinde tek fotosentez yolu bulunurken, C4 bitkilerinde 2 fotosentez yolu bulunur. C3 bitkilerinde CO2'i ilk yakalayan ribuloz1,5difosfat, C4 bitkilerinde fosfoenol pirvik asittir. C3 bitkilerinin tm k solunumu yaparken, C4 bitkileri ok az k solunumu yaparlar. C3 bitkilerinde oluan ilk rn 3-fosfogliserikasit, C4 bitkilerinde ise oksaloasetik asittir. C3 de karbonhidrat, C4'de organik asit sentezlenir. C4'de glikolat oksidaz enzimi ya yok ya da ok azdr. Bu verimi ykseltir. C3 bitkileri tm angiospermler (kapal tohumlular), gymnospermler (ak tohumlular) ve dikotiledonlarn (ift enekliler) oudur; C4 bitkileri eker pancar gibi baz dikotiller ve Graminae (Budaygiller) familyas yeleri ve ou monokotil bitkileridir. CAM (Crassulaceae 7 Asit Metabolizmas) bitkileri denilen ananas ve kakts gibi bitkiler ise yksek scaklk ve uzun sreli susuzlua dayankl bitkilerdir. Bu bitkiler stomalarn gndz kapatarak su kaybn en dk seviyede tutarlar. Gece ise stomalarn aarak bir sonraki gn kullanacaklar CO2 yi C4 bitkilerinde olduu gibi mezofil hcrelerinde malat oluturarak depolarlar ve gnn ilk klaryla birlikte fotosentez yapmaya baladklarnda stomalarn yeniden kapatrlar. Malat, malik aside dnerek kofullarda depolanr. Fotosentez esnasnda malik asit sitoplazmaya geerek CO2 ve pirvata paralanr. Aa kan CO2 kloroplasta tanarak Calvin dngsne katlr. Palizat parankimas hcreleri iyi gelimediinden snger parankimasyla fotosentez yaparlar. Hcreleri az sitoplazmal ve byk kofulludur. letim demetleri etrafndaki demet kn hcreleri iyi gelimemitir. Fotosentez Hz; C4 > C3 > CAM
KEMOSENTEZ
Klorofile sahip olmayan baz ototrof canllar, k enerjisini kullanamadklarndan kimyasal maddelerin oksidasyonu sonucu rettikleri enerjiyi organik madde sentezlemek iin kullanrlar. Madde dngsnn de devamnn saland bu olaya kemosentez denir. Kemosentez yapan canllara kemoototrof canllar denir. Kemosentezde gerekli enerji demir (Fe+2), amonyak (NH3), nitrit NO2-), nitrat (NO3-), hidrojen gaz (H2), hidrojen slfr (H2S) ve kkrt (S) gibi inorganik bileiklerin oksitlenmesiyle elde edilir. Baz bakteriler klorofile sahip olmadklar halde kendi besinlerini kemosentez yoluyla retebilirler. (Kemosentetik bakteriler) Hidrojen slfr gaznn fotosentetik bakteriler tarafndan da kullanldn renmitik. H2S gaz fotosentetik bakteriler iin H+ kayna, kemosentetik bakteriler iin enerji kayna olarak kullanlr. Azot canllardaki nkleik asitler ve proteinlerin yapsna katldndan nemli bir inorganik maddedir. len canllarn yapsndaki azot saprofitler tarafndan nce amonyaa dntrlr. Ancak amonyak bitkiler ve dier canllar iin emilime ve kullanma uygun olmadndan Nitrosomonas bakterileri tarafndan suda znebilir nitrit ve nitrat tuzlar ekline dntrlmesi gerekir. Nitrosomonas bakterileri (Nitrit bakterileri); 2NH3 + 3O2 -- 2HNO2 (Nitrz asit) + 2H2O + Kimyasal Enerji Tepkimesiyle Nitrz asit ve kimyasal enerji aa karrlar. Nitrobacter bakterisi (Nitrat bakterileri) ise; 2HNO2 + O2 -- 2HNO3 (Nitrik asit) + Kimyasal Enerji
Crassulaceae Kapal tohumlular blmnde ift enekli snfna ait bir bitki.
25
Tepkimesi ile Nitrz asidi Nitrik asite 8 evirirler ve Kimyasal Enerji aa kartrlar. Nitrit ve Nitrat bakterilerinin birlikte altklar bu evrime Nitrifikasyon (Azot tuzlarnn oluumu) denir. Amonyan nitrata kadar olan bu ykseltgenmelerde her basamakta aa kan elektronlar bakteri tarafndan bir ETS den geirilerek ATP sentezlenir. Bu ATP nin bir ksm kullanlarak NADH oluturulur. ATP ve NADH ile CO2 ve H2O kullanlarak glikoz sentezlenir. Nitrobacterin 6 molekl CO2 yi kullanarak 1 molekl glikoz sentezleyebilmesi iin 78 nitrit iyonunu (NO2-) ykseltgemesi gerekir. Kemosentez yolu ile bakteriler kendi besinlerini sentezlerken ayn zamanda azotlu bileiklerin toprakta tutulmasn ve bitkiler tarafndan kullanlmasn salarlar. Bundan dolay kemosentezin biyolojik dengenin korunmasnda rol oynadn syleyebiliriz. Demir bakterileri Fe+2 yi ykseltgeyerek aa kan enerjiyi organik madde sentezi iin kullanrlar. FeCO3 (Siderit) + O2 -- Fe(OH)3 (Demir Hidroksit)+ CO2 + Enerji Kkrte zengin ortamlarda yaayan kkrt bakterileri (Beggiatoa ve Thiospirillum) Hidrojen slfr gazn kullanarak Kkrt, Su ve enerji retirler. H2S + O2 -- H2O + S + Enerji Hidrojen bakterileri ise H2 gazn oksitleyerek enerji retirler. Azot bakterileri (Rhizobium 9 ) atmosferdeki serbest azotu balayarak baklagillere nitrit temin eder ve enerji aa kar. Madde dngsnde nemli rol oynar. Elektron vericisi Ykseltgenme rn N2 + O2 -- NO2 + Enerji
Kemosentez sonucu:
1. 2. 3. 4. Baz zararl maddeler ortadan kaldrlr. Bitkilerin alabilecei tuzlar oluturulur. Kimyasal enerji kazanlr. Organik besin sentezlenir.
Hidrojen slfr (H2S) Kkrt (S) Amonyak (NH3) Nitrit (NO2-) ki deerlikli demir (Fe2+)
Kkrt (S) Slfat (SO42-) Nitrit (NO2-) Nitrat (NO3-) deerlikli demir (Fe3+)
Baklagillerle ortak yaam srerek azot biriktirmeye yarayan bakteri kategorisi. Havann azotunu alr, albminoite dntrr; bitki bunu sourur, karlnda bakterinin glsit ihtiyacn giderir.
26
4-
I.
Gliserol, zel bir enzim yardmyla ATP harcanarak gliserol fosfata dntrlerek glikoliz tepkimelerine katlr.
II.
Amino asitlerden amino grubunun ayrlmasndan sonra, geriye kalan madde karbon saylarna gre; asetil koenzim A, pirvat veya krebs dngsnden solunuma katlr.
I.
II.
III. "c" reaksiyonu hcrenin O2 alamadn gsterir. IV. "d" reaksiyonu srasnda CO2 aa kar. V.
"e" reaksiyonu tm canllarda gerekleir.
Buna gre, aada verilenlerden hangisinin gereklemesi, maya hcrelerinin oksijensiz solunum yaptn kesin olarak ispatlar?
A) zeltideki karbon dioksit miktarnn artmas B) Besleyici zeltinin scaklnn artmas C) zelti iindeki etil alkol miktarnn artmas D) Maya hcrelerinin saysnn artmas E) zelti iindeki glikoz miktarnn azalmas
A) Kreps devri reaksiyonlar sonucu elde edilen enerjidir. B) Elektronlarn, elektron tutuculara aktarlmas ile ortaya
kan enerjidir ve son elektron alcs oksijendir.
D) Elektron tutucular ETS'de elektron severlilikle- rine gre E) Oksidatif fosforilasyon srasnda ilk elektron tutucu NAD,
son elektron tutucu O2 dir.
27
10 -
II.
I. II.
CO2 miktar fotosentez hzn snrlandryordur. Bir sre fotosentezi k iddeti snrlandrmtr.
I.
II.
12 zde yap ve bykle sahip olan; X, Y ve Z bitkilerine verilen k iddetleri arasnda, grafikte gsterilen iliki bulunuyor.
I.
II.
Gn ierisinde Z bitkisi, X ve Y bitkisinin toplamndan daha ok karbon dioksit tketir. Yukardaki grafik bir hcrenin zamanla tkettii oksijen miktarn gstermektedir. Grafikteki bilgilere gre hcrenin oksijenli solunum ile rettii ATP miktarnn ilk azalmaya balad zaman dilimi hangisidir? A) I B) II C) III D) IV E) V
28
13 I. II. III. IV. V. Yaprak says fazla Kutikula tabas kaln Stomalar kutikula zerinde Yapraklar byk ve geni Kkler derinlerde
16 -
Yukarda baz bitkilere verilen zelliklerden hangileri kurak blge, hangileri nemli blge bitkilerinin adaptasyonlarndandr ?
Yukardaki grafikte yksek k iddetinde (500 mum/metre) ve dk k iddetindeki (100 mum/metre) fotosentez hz verilmitir. Buna gre, ayn bitki trnden ayr bitki, aadaki ortamlara braklmtr. I. Ortam : 100 mum/metre k iddeti (A1 bitkisi) 10C derecelik scaklk II. Ortam : 350 mum/metre k iddeti (A2 bitkisi) 30C derecelik scaklk III. Ortam : 350 mum/metre k iddeti
(A3 bitkisi) 10C derecelik scaklk Yukarda verilen ortamlara gre fotosentez hz yksek olan bitkiden dk olan bitkiye doru nasl bir sralama olmaldr ? (Bitkilerin byklkleri ayndr.) A) A2 > A3 = A1 B) A3 > A2 > A1 C) A2 > A3 > A1 D) A2 = A3 > A1 E) A3 > A1 > A2
A) Suyun iyonlarna ayrtrlmas B) ATP enerjisi retilmesi C) eitli enzimlerin grev yapmas D) ETS de elektron tanmas E) O2 ve CO2 alveriinin yaplmas
17 -
Yukardaki emada fotosentez reaksiyonlar zetlenmitir. Bu madde deiimleriyle ilgili olarak, aada verilenlerden hangisi doru olur? Buna gre;
I.
A) I yerine; oksijen B) II yerine; karbon dioksit C) III yerine; su D) IV yerine; ATP enerjisi E) I yerine; glikoz
Ikl evre reaksiyonlarnda retilen enerji hem karanlk evrede hem de hcresel solunumda kullanlr.
II.
Fotosentez sonucu retilen besinin yapsndaki "C" (karbon) atomlar karanlk evrede reaksiyona katlr.
29
18 -
22-
Canllarda gerekleen solunum olaylarnda organik monomerin yapsndaki kimyasal ba enerjisi ATP'ye aktarlmaktadr.bu dnm oksijenli solunum ve oksijensiz solunum olmak zere 2 eittir. Buna gre; I. Piruvat olumas II. ATP sentezlenmesi
Yukarda verilen O 2 li solunuma ait reaksiyon basamaklarndan hangilerinde CO 2 k grlr ? A) Yalnz II D) III ve IV C) I ve III E) I, III ve IV C) II ve III
III. Asetil CoA oluumu IV. Elektron aktarm Olaylarndan hangileri bir hcrenin solunum reaksiyonlarndaoksijen kullanp kullanmamasna bal olmakszn gerekleir? A) Yalnz I B) I ve II C) III ve IV D) I - II ve IV E) II - III ve IV
19 I. Hidrojen tutucu koenzimlerin grev almas II. E.T.S. grev almas III. Fosforilasyon sonucu ATP sentezi IV. CO2 zmlenmesi Yukarda verilen olaylardan hangileri hem O 2 li solunum hem de fotosentez reaksiyonunda ortak olarak gerekleir? A) Yalnz II D) I, II ve III B) I ve III E) I, II, III ve IV C) II ve IV
verilen olaylarn oluum sras aadakilerden hangisinde verilmitir? A) III I II - IV B) III IV II - I C) I II III - IV D) II III I - IV E) II III IV - I
D) CO2 kullanma
30