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VISIN GENERAL

Regulacin de procesos celulares

Este captulo considera una variedad de mecanismos por los cuales se regula la expresin gnica. La discusin comienza dando los niveles de regulacin de la expresin gnica. La regulacin de la iniciacin de la transcripcin incluye la induccin y la represin con la lac, trp, y operones ara como ejemplos, e incluye dos componentes sistemas de regulacin.Reglamento en el nivel de transcripcin contina con la atenuacin y riboswitches. Regulacin de la traduccin y postraduccional se discuten. Los sistemas globales de regulacin incluyen discusiones de los factores sigma, la represin catablica, quimiotaxis, la deteccin de qurum, y la esporulacin. El captulo concluye con informacin sobre la regulacin de genes en eucariotas y arqueas.

OBJETIVOS DEL CAPITULO

Despus de leer este captulo, usted debera ser capaz de: analizar los niveles de regulacin de la expresin gnica describen la induccin y la represin con operones ejemplo discutir regulacin de la sntesis enzimtica por protenas reguladoras negativas y positivas describir sistemas de dos componentes normativos describir la atenuacin y riboswitches hablar sobre la regulacin de traduccin y postraduccional hablar sobre la regulacin global de la expresin gnica describe la deteccin de qurum y la represin catablica contrario la regulacin en eucariotas, bacterias y arqueas

DEL CAPTULO
I. Los niveles de Reglamento A. Regulacin de la expresin gnica (el control de la sntesis de la enzima) se produce a diferentes niveles, incluyendo el control de la transcripcin, traduccin y posttranslation B. Aunque hay similitudes en la regulacin de la expresin de genes en los organismos de diferentes mbitos, hay muchas diferencias en la organizacin de los cromosomas, las transcripciones de ARNm, sealizacin, y la estructura de la clula Regulacin de la iniciacin de la transcripcin A. La induccin y la represin de la sntesis de la enzima 1. 2. Las enzimas centrales a los procesos metablicos, habitualmente necesarios por las clulas, estn codificadas por genes de limpieza, que son genes constitutivos que estn continuamente expresadas Sntesis de enzimas implicadas en las vas catablicas son a menudo inducible y se expresa slo cuando sea necesario; el sustrato inicial de la va (o algn derivado del mismo) es generalmente el inductor; induccin aumenta la cantidad de ARNm que codifica las enzimas

II.

3.

B.

Sntesis de enzimas implicadas en las vas anablicas es a menudo reprimible y expresa cuando la biosntesis del producto final es necesario, el producto final de la va por lo general acta como un correpresor; represin disminuye la cantidad de ARNm que codifica las enzimas Control de la iniciacin de la transcripcin por protenas reguladoras

1.

C.

Las protenas reguladoras de las bacterias contienen reconocibles dominios de unin al ADN, tales como los dedos de zinc y dominios hlice-giro-hlice 2. Control transcripcional negativa ocurre cuando una protena represora inhibe la iniciacin de la transcripcin, el control transcripcional positiva se produce cuando la protena activadora promueve la iniciacin de la transcripcin 3. Incluso en operones, donde la expresin es reprimida, un bajo nivel basal de la transcripcin se produce, los genes se expresan nicamente cuando sea necesario (actualmente sustrato, producto ausente) 4. Protenas represoras obligar al operador, una regin de ADN se superponen o aguas abajo del promotor, y el bloque de la RNA polimerasa de unin; protenas activadoras se unen activador de sitios de unin, a menudo aguas arriba del promotor 5. En los sistemas inducibles, la protena represora se activa hasta que unido al inductor (unin de inductor inactiva el represor), mientras que en los sistemas de reprimibles, el represor es inactivo hasta que unido a la correpresor (unin de correpresor activa el represor) 6. En las bacterias, un conjunto de genes relacionados estructurales controlados por un solo operador y el promotor se denomina un opern Lactosa opern: control negativo de la transcripcin de genes inducibles 1. La lactosa (lac) opern, que codifica los genes del catabolismo de la lactosa, es un excelente ejemplo de la regulacin negativa de un gen inducible, la unin del represor lacde las curvas de lac operadores del ADN e inhibe la polimerasa de ARN vinculante o bloques del movimiento de ARN polimerasa El represor lac se inactiva mediante la unin del inductor, alolactosa, un derivado de la lactosa, la presencia de lactosa induce la expresin del opern lac por la unin del represor inhibir 3. El opern lac tambin est regulada por la protena activadora de catabolito (CAP), que forma parte de un sistema de regulacin mundial El triptfano opern: control negativo de la transcripcin de los genes reprimibles El triptfano (trp) opern, que codifica los genes para la sntesis de triptfano, es un ejemplo excelente de un opern reprimible; el opern trp se expresa a menos que el represor se une a su trp triptfano correpresor, el producto final de la va 2. El opern trp tambin se controla en el nivel de elongacin de la transcripcin a travs de la atenuacin Arabinosa opern: control de la transcripcin de una protena que acta tanto positiva como negativamente 1. La arabinosa (ara) opern codifica los genes del catabolismo de la arabinosa Cuando est ausente la arabinosa opern ara es reprimida por la interaccin de dos molculas de AraC a los operadores b. Cuando arabinosa est presente, esta interaccin se evita y las molculas de AraC estimular la expresin Sistemas de dos componentes y sistemas de regulacin phosphorelay 1. Los sistemas de transduccin de seales regular la expresin gnica en respuesta a las condiciones ambientales, en lugar de los niveles de metabolitos una.

2.

D.

1.

E.

F.

III.

En sistemas de dos componentes reguladores, una protena quinasa sensor en los sentidos de plasma membrana cambios en el medio ambiente y puede fosforilar una protena de respuesta del regulador, una protena de unin al ADN que regula la expresin gnica 3. Sistemas Phosphorelay son ms largos que utilizan las vas de transferencia de grupos fosforilo para controlar la transcripcin de genes y actividad de la protena Regulacin de la elongacin de la transcripcin A. Atenuacin 1. Hay dos puntos de decisin para la regulacin de la transcripcin de las vas anablicas: iniciacin de la transcripcin y la continuacin de la transcripcin, la atenuacin regula la continuacin de la transcripcin 2. En sistemas en los que estn estrechamente transcripcin y traduccin acopladas, el comportamiento ribosoma en la regin lder del ARNm puede controlar continuacin de la transcripcin una. Si ribosomas activamente traducir la regin lder (atenuador), que contiene varios codones para el producto de aminocidos del opern, se forma un terminador de la transcripcin y la transcripcin no continuar b. Si puesto de ribosomas durante la traduccin de la regin debido a que el lder de carga apropiada aminoacil-tRNA est ausente, la terminacin no se forma y la transcripcin continuar Riboswitches 1.

2.

B.

IV.

Riboswitches (ARN sensoriales) son una forma de atenuacin que no implica que el ribosoma, la regulacin se basa en la diferencia de plegamiento de la secuencia lder de ARNm 2. Alternativa plegable, creando bucles antitermination y terminacin, es controlada por la unin de una molcula efectora Regulacin de la traduccin A. La regulacin de la traduccin por riboswitches es similar a la regulacin de la transcripcin por riboswitches, excepto aqu la unin de molculas efectoras cambia el plegado del ARNm de tal manera como para inhibir la unin al ribosoma y de iniciacin de la traduccin Reglamento de la traduccin por pequeas molculas de ARN 1.

B.

V.

Pequeos RNAs (sRNAs), tambin conocidos como ARN no codificante (ncRNAs), estn involucrados en la regulacin de procesos celulares directamente la vinculacin con los ARNm 2. Un tipo de sRNA es RNA antisentido, que es complementaria de la secuencia lder de una molcula de ARNm, y se une especficamente a ella, bloqueando as la traduccin Reglamento postraduccional A. La regulacin de las vas enzimticas a travs del control alostrico o modificacin covalente son las formas de regulacin postraduccional, modificacin covalente puede ser reversible (fosforilacin) o irreversible (protelisis) La quimiotaxis 1.

B.

VI.

Un sistema phosphorelay se utiliza para regular la respuesta quimiotctica de las bacterias y determinar el movimiento direccional de flagelo, el sistema incluye un sensor de quinasa y un regulador de respuesta 2. Atrayentes (o repelentes) son detectados por quimiorreceptores, que conduce a la transferencia de grupos fosforilo a las protenas quinasas por sensores que interactan con los reguladores que controlan la respuesta del motor flagelar Los sistemas mundiales de regulacin A. Informacin general

1.

B.

Los sistemas globales de regulacin afectan a muchos genes y las vas de forma simultnea, lo que permite tanto la regulacin independiente de operones as como la cooperacin de los operones 2. Un reguln es un grupo de genes o operones controlados por una protena reguladora comn; un modulon es ms complejo y tiene una protena comn regulador que controla una red opern, pero operones individuales se controlan por separado, as, un estimuln es un sistema regulador en el que todos los operones responder juntos a un estmulo ambiental Los mecanismos utilizados para la regulacin mundial 1. 2. Las bacterias producen una serie de diferentes factores sigma; cada permite la ARN polimerasa para reconocer y unirse a los promotores especficos Alternos factores sigma disponibles a ARN polimerasa cambio la expresin gnica Represin catablica 1. Diuxico crecimiento, un patrn de crecimiento bifsico observado cuando una bacteria se cultiva en dos diferentes azcares (por ejemplo, la glucosa y la lactosa) 2. Para E. E., la disponibilidad de la glucosa (el carbono y fuente de energa preferida) provoca una cada en los niveles de AMPc, resultando en la desactivacin de la NAC (un regulador positivo de varias vas catablicas, incluyendo el opern lac); desactivacin de CAP permite que la bacteria para utilizar la glucosa preferentemente sobre otro azcar cuando ambos estn presentes en el medio ambiente Reglamento por parte de otros nucletidos 1. 2. Adems de AMPc, tetrafosfato guanosina (ppGpp) y cclico dimrico BPF (c-di-GMP) regular la expresin gnica La respuesta rigurosa que implica ppGpp ocurre en las clulas hambrientas de los aminocidos Cuando la sntesis de protenas se detiene debido a una falta de ARNt cargados, ppGpp se produce b. ppGpp regula a la baja tRNA y la sntesis de rRNA, mientras regulacin al alza de la biosntesis de aminocidos La deteccin de qurum 1. La comunicacin intercelular (quorum sensing) en procariotas es importante en la regulacin gnica, e incluso los microbios de diferentes especies puede afectar uno al otro de la expresin gnica 2. La deteccin de qurum se suele mediada por la liberacin de lactonas homoserina como autoinductores, en algunos casos un sistema regulatorio de dos componentes, se trata de La esporulacin en Bacillus subtilis 1. una.

C.

D.

E.

F.

VII.

La esporulacin es un proceso complejo que est controlada en varios niveles a travs de phosphorelay, factores de transcripcin, modificaciones postraduccionales, y factores sigma alternativos 2. Bajo ciertos estmulos ambientales, una protena de respuesta del regulador, spo0A, altera la expresin de ms de 500 genes, incluidos los factores sigma alternativos que controlan la expresin diferencial de genes en la clula y la madre preespora Regulacin de la expresin gnica en eucariotas y arqueas A. En los eucariotas, numerosos factores de transcripcin generales se requieren, hay factores reguladores de la transcripcin que son especficos de uno o ms genes y alterar la tasa de transcripcin, sitios de activadores se unen reguladores llamados potenciadores, mientras que los sitios represores se unen llamados silenciadores sRNAs acto en eucariotas como ARN antisentido y la funcin en el mbito de la traduccin, los ms pequeos tipos son llamados microARN (miRNA), un trabajo con la sRNAs spliceosome

B.

C.

La regulacin de genes en arqueas no se entiende, en la mayora de los casos archaeal protenas reguladoras funcionan como activadores bacterianos y represores, mientras que en otros funcionan como factores de transcripcin eucariotas reguladoras

TRMINOS Y DEFINICIONES
Coloque la letra de cada trmino en el espacio junto a la definicin o descripcin que mejor le corresponda. 140 1. f, 2. d, 3. I, 4. j, 5. c, 6. b, 7. q, 8. O, 9. m, 10. E, 11. h, 12. r, 13. p, 14. k, 15. a, 16. g, 17. n, 18. l

__f__ 1.

Las pequeas molculas que inactivan las protenas represoras y con ello aumentar la sntesis de ciertas enzimas __d__ 2. Las pequeas molculas que activan las protenas represoras y de ese modo disminuir la sntesis de ciertas enzimas __i__ 3. El sitio en el ADN a la que un represor se une __j__ 4. __c__ 5. Un promotor, un operador, y los genes estructurales que controlan Un sitio de terminacin de la transcripcin se encuentra en la regin lder de operones ciertos que controla la continuacin de la transcripcin de ese opern __b__ 6. Una molcula de ARN que se une especficamente a un ARN diana, impidiendo as la utilizacin de que el ARN diana __q__ 7. Regular la expresin gnica en respuesta a las condiciones ambientales __o__ 8. __m__ 9. Plasma protena de membrana que detecta los cambios en el medio ambiente. ADN-protena de unin que regula la expresin de genes despus de la fosforilacin por una quinasa sensor __e__ 10. Afecta muchos genes y las vas de forma simultnea __h__ 11. Protena reguladora Comn controla la red de opern, pero operones individuales tambin controlan por separado __r__ 12. Sistema de regulacin en operones responder juntos a los estmulos del medio ambiente __p__ 13. Las protenas que permiten a la ARN polimerasa para reconocer y unirse a los promotores especficos __k__ 14. La comunicacin intercelular importante en la regulacin de los genes __a__ 15. __g__ 16. __n__ 17. __l__ 18. a. b. c. d. e. f. g. En eucariotas, estos sitios se unen regulatorios llamados potenciadores Los ms pequeos sRNAs en eucariotas que actan a nivel de traduccin ARN sensoriales que participan en una forma de atenuacin que no implique el ribosoma. Una coleccin de genes o operones que es controlado por una protena reguladora comn activadores ARN antisentido atenuador corepressors los sistemas mundiales de regulacin inductores microARN (miRNA)

h. i. j. k. l. m. n. O. p. q. r.

modulon operador opern la deteccin de qurum reguln la respuesta-la regulacin de protenas riboswitches sensor de quinasa sigma factores los sistemas de transduccin de seales estimuln

140

COMPLETA EL ESPACIO VACIO

1. Si E. coli se cultivan en un medio que contiene glucosa y la lactosa, se utiliza preferentemente ____________ hasta este azcar se ha agotado. Luego, despus de un retardo corto, el crecimiento se reanuda usando ____________ como una fuente de carbono. Este patrn de crecimiento bifsico se llama crecimiento ____________. Para operones negativamente regulados que contienen genes para una va catablica, los sustratos iniciales de las vas a menudo actan como ____________, mientras que para operones negativamente regulados que contienen genes para las vas anablicas, los productos finales de las vas generalmente actan como ____________. El mecanismo de regulacin, , Se observa para numerosas vas biosintticas de aminocidos. En este mecanismo, el comportamiento de los ribosomas impacta la continuacin de la transcripcin. Entre el operador y los genes estructurales del opern es el regin. Esta regin codifica un pptido lder que tiene dos o ms codones para el , producto cido extremo amino de la va, y tiene una

2.

3.

un sitio de transcripcin rho-independiente de terminacin que pueden formar una horquilla terminador. Si el ribosoma traduce con xito la secuencia del pptido lder del ARNm, entonces la horquilla terminador se forma y se detiene la continuacin de la transcripcin del opern. Esto slo puede ocurrir si el aminocido es fcilmente disponible y activado por el apropiado . Si el aminocido no est fcilmente disponible, el ribosoma brevemente, se parar durante la traduccin de la secuencia del pptido lder. Si esto ocurre mientras que la regin lder todava est siendo transcrito, se evita la formacin de la horquilla terminador. Por lo tanto, la transcripcin contina, el ARNm se traduce, las enzimas de la va se sintetizan, y el cido amino sintetizado se necesita. Tal proceso de regulacin slo es posible cuando los procesos de transcripcin y la traduccin son . Por lo tanto, slo se ve en los organismos ____________ y no en ____________ organismos. Algunos operones estn regulados por protenas, que se unen al operador y evitar la transcripcin. Este tipo de regulacin de la expresin gnica se

4.

llama ejemplo,

controlar. Otros operones estn regulados por las protenas activador (por activador de la protena, que regula el opern lactosa y otros operones

5.

en E. coli), que promueven la transcripcin. Este tipo de regulacin se llama opern de control. Muchas enzimas biosintticas son enzimas cuyos niveles se reducen en presencia de los productos finales llama protena recin sintetizada represor es inactivo y se refiere como el el . . En este tipo de sistema de regulacin, la . Es activada por

6. 7.

Cuando arabinosa est ausente del opern ara es ___________ por AraC, sin embargo, cuando _________ est presente, esta interaccin se evita y la expresin AraC _________. En respuesta a las condiciones ambientales, unido a la membrana protena acta sobre una protena ______________ por fosforilacin de ella.Este sistema puede regular la expresin gnica. Ya las vas que utilizan transferencia de grupos fosforilo para controlar la expresin de genes se llaman sistemas de _________. La comunicacin intercelular importante en la expresin de genes, conocido como , Est mediada en procariotas por la liberacin de que actan como ___________, en algunos casos a travs de sistemas de dos componentes de regulacin. En los eucariotas, muchos factores de transcripcin ___________ se requiere, que incluye la estimulacin de __________ que se unen _________ y __________ represores que se unen. Durante la hambruna de aminocidos, las clulas presentan el ________________________, cuando se

8.

9. 10.

detiene la sntesis de protenas, generando el _______ reguladora de nucletidos. Los genes de __________ y _________ son regulados a la baja, mientras que los de _______________________________ son upregulated. 11. La esporulacin y la quimiotaxis de los sistemas de regulacin de las bacterias son ejemplos de quimiotaxis, rotacin flagelar. sistemas, que tienen dos componentes principales: un sensor de quinasa protenas (MCP) contribuyen a la regulacin de la y un regulador de la respuesta. En el sistema de regulacin de

ELECCIN MLTIPLE
1. c, 2. b, 3. c, 4. c, 5. c, 6. d, 7. c, 8. c, 9. a, 10. d, 11. c Para cada una de las preguntas a continuacin seleccione la mejor respuesta. 1. a. b. c. d. 2. a. b. c. Cul de los siguientes NO es un mecanismo de regulacin para controlar el opern lactosa en E. E.? induccin represin catablica atenuacin Todo lo anterior se utilizan para regular el opern lactosa. Cul de los siguientes NO es un mecanismo de regulacin para controlar el opern triptfano en E. E.? represin represin catablica atenuacin

d. 3.

Todo lo anterior se utilizan para regular el opern triptfano de E. coli.

Cul de los siguientes es menos probable que median respuestas rpidas a los cambios en las condiciones ambientales? a. canalizacin metablica b. c. d. ajuste de la actividad enzimtica regulacin de la expresin gnica Todo lo anterior son igualmente propensos a responder a los rpidos cambios del medio ambiente. Cul de las siguientes lo ms probable es conservar la mayor cantidad de energa para la clula? a. b. c. d. canalizacin metablica ajuste de la actividad enzimtica regulacin de la expresin gnica Todo lo anterior conservar cantidades casi iguales de energa. Cul de los siguientes es el inductor del opern lactosa de E. E.? a. b. c. d. protena activadora de catabolito (CAP) 3 ', 5' monofosfato cclico de adenosina (AMPc) lactosa (alolactosa) AMP cclico receptor de la protena (CRP) Cul de los siguientes NO es un nivel en el que se puede controlar la expresin gnica? a. b. c. d. transcripcin traduccin posttranslation Todos pueden ser enteros po de control. Cul de los siguientes es un papel para riboswitches? a. b. c. d. ribosomas estancamiento durante la traduccin inducir la expresin de protenas ribosmicas diferencial de plegado de secuencias lder de mRNA transmitir seales a partir de protenas de sensores ambientales

4.

5.

6.

7.

8.

Riboswitches conducir a plegable alternativa de mRNAs durante la transcripcin y conducir a la formacin de: a. bucles de terminacin b. c. d. bucles antitermination tanto (a) y (b) ni (a), ni (b) Cuando los factores sigma alternativos estn disponibles a la RNA polimerasa? a. b. c. d. cambios de expresin gnica potenciadores de la unin a est bloqueado secuencias operadoras no se utilizan factores rho son necesarios para la expresin Cul de los siguientes NO es un ejemplo de un sistema regulatorio mundial? a. b. c. estimuln reguln modulon

9.

10.

d.

ALTERON

11. Cul de los siguientes es el control de las rutas metablicas por la modulacin de la actividad de ciertas enzimas reguladoras? a. regulacin transcripcional b. c. d. regulacin de la traduccin regulacin postranscripcional regulacin global

TRUE / FALSE
____ 1. ____ 2. Si una fuente de energa particular no est disponible, las enzimas requeridas para su utilizacin son necesarios y la energa se gasta para producirlos. En presencia de glucosa y la lactosa, el represor lactosa no est vinculada al operador, sin embargo, los genes del opern lactosa todava no se expres: represin catablica afecta a la unin de la RNA polimerasa al promotor, pero no implica el operador . Aunque la replicacin del ADN y la divisin celular son procesos separados, estn estrechamente coordinada. Por lo tanto, si un frmaco o una mutacin del gen inhibe la sntesis de ADN, la divisin celular tambin se bloquea. Incluso a altas tasas de divisin celular (tiempo de duplicacin de menos de 60 minutos), la replicacin del ADN para la duplicacin siguiente no se inicia hasta que el anterior ciclo de divisin celular se ha completado. -galactosidasa es una enzima reprimible. Un ejemplo de la regulacin de la expresin gnica por pequeas molculas de ARN (sRNAs) es la unin de molculas de ARN nuclear heterogneo (hnRNAs) al ARNm diana, bloqueando as su traduccin. Boswitches Ri actuar tanto a nivel de transcripcin y traduccin. El correpresor para el opern trp es triptfano. En la mayora de los casos, archaeal protenas reguladoras funcionan como los de los eucariotas. Una clula procariota no puede afectar a la expresin del gen de otra clula. La esporulacin en Bacillus subtilis se controla en parte por un sistema phosphorelay. El opern arabinosa se tanto positiva como negativamente controla en el nivel de la transcripcin. Quinasas del sensor son importantes las protenas intracelulares que se encuentran en la regin

____ 3.

____ 4.

____ 5. ____ 6.

____ 7. ____ 8. ____ 9. ____ 10. ____ 11. ____ 12. ____ 13. nucleoide.

PENSAMIENTO CRTICO
1. Mira las siguientes dos diagramas. Comparar y contrastar los mecanismos de regulacin que aparecen en (A) con los de (B). Lo que es ms probable que regulan las enzimas de una va catablica y que es ms probable para regular una va anablica? Explique.

2. Despus de inocular un matraz de caldo mnimo que contena glucosa y la lactosa con E. coli y despus de la cintica de crecimiento, se obtiene la curva de crecimiento siguiente:

IV III II Yo

una.

Describe cada etapa de la curva de crecimiento (I - V) en trminos de las tasas de crecimiento, sustratos de crecimiento, y la actividad metablica general.

b.

Diagrama del opern lactosa. Qu diferencias hay en el estado de la opern durante la fase I, fase II, fase III y fase IV de la curva de crecimiento dado? Asegrese de hablar sobre las regiones

promotoras y el operador, as como las funciones del represor lac y de la PAC en cada una de las primeras cuatro fases. 140

CLAVE DE RESPUESTAS
Trminos y definiciones 1. f, 2. d, 3. I, 4. j, 5. c, 6. b, 7. q, 8. O, 9. m, 10. E, 11. h, 12. r, 13. p, 14. k, 15. a, 16. g, 17. n, 18. l Llene los espacios en blanco 1. glucosa; lactosa; diuxico 2. inductores; corepressors 3. la atenuacin; lder; atenuador; aminoacil-tRNA sintetasas, estrechamente unida; procariota, eucariota 4. represor; negativo; catabolito; positiva 5. reprimible; corepressors; aporrepresor; corepressor 6. reprimido, arabinosa, estimula 7. quinasa sensor, regulador de la respuesta-, la transduccin de seales; phosophorelay 8. la deteccin de qurum; homoserina lactonas; autoinductores 9. generales, activadores, potenciadores, silenciadores 10. respuesta estrictas; ppGpp; tRNAs, rRNA, la biosntesis de aminocidos 11. dos componentes phosphorelay; aceptando metil-quimiotaxis Opcin mltiple 1. c, 2. b, 3. c, 4. c, 5. c, 6. d, 7. c, 8. c, 9. a, 10. d, 11. c Verdadero / Falso 1. F, 2. T, 3. T, 4. F, 5. H, 6. H, 7. T, 8. T, 9. M, 10. M, 11. T, 12. T, 13. F 140