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12-03-2011

1.Fundamentos moleculares de Bioqumica


AULA 2 BIOQUMICA SISTEMAS AQUOSOS A CLULA

1.Fundamentos moleculares de Bioqumica


S I S TE MAS AQ UO S O S E S UAS FUN E S BI O L G I C AS

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A gua o suporte fsico da vida


Principais componentes das biomolculas
Elemento O C H N P S Composio por peso (%) 65 18 10 3 1 0,25

Principal componente dos seres vivos ~70 % H2O As propriedades fisico-qumicas da gua condicionam a termodinmica dos processos biolgicos

Natureza dipolar da molcula de gua Os dois tomos de hidrognio possuem cargas positivas parciais e o tomo de oxignio possui carga negativa parcial

As molculas de gua podem formar ligaes por pontes de hidrognio entre si


Duas molculas de gua ligadas por uma ponte de hidrognio
(representada por 3 linhas azuis) entre o tomo de O da molcula de cima e o tomo de H da molcula de baixo

Estrutura do gelo

No estado lquido

Cada molcula faz 4 pontes de H

Cada molcula faz ~3,4 pontes de H

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Pontes de Hidrognio nos sistemas biolgicos


Ligaes ponte de hidrognio comuns nos sistemas biolgicos

As pontes de hidrognio so muito direccionadas e capazes de manter as duas molculas ligadas ao H numa orientao geomtrica especfica.

Pontes de Hidrognio nos sistemas biolgicos

Entre o grupo hidroxilo dum alcool e a gua

Entre o grupo carbonilo de uma cetona e a gua

Entre grupos dos aminocidos num polipeptido

Entre bases complementares no DNA

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A gua como solvente


A gua dissolve sais (NaCl) por hidratao dos ies (Na+ e Cl); as cargas inicas so parcialmente neutralizadas

Ateno orientao das molculas de gua

A gua um bom solvente para solutos polares quer por formar interaces electrostticas quer por formar pontes de H

Tipos de ligaes/interaces no-covalentes das biomolculas em sistemas aquosos

Ligaes ponte de hidrognio

Interaces electroestticas 4 20 Kj/mol

Interaces hidrofbicas

Interaces de van der Waals

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Exemplos de molculas polares, no polares e anfipticas (formas inicas a pH7)

Interaces hidrofbicas e o Efeito Hidrfobo


A gua no bom solvente de substncias apolares
As substncias apolares no formam nem pontes de H, nem possuem dipolos moleculares permanentes, no existindo vantagem entlpica na sua dissoluo em gua. Para alm disso, ocorre uma diminuio entrpica do solvente (gua), que vem da formao de um escudo altamente organizado de molculas de gua que vai encarcerar a(s) molcula(s) apolares, designado clatrato.

Exemplo de uma molcula anfiptica, um fosfolpido

Formao do Clatrato 4 molculas Camada ordenada 20 Kj/mol de de gua, forma um escudo volta da cadeia alquilo

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Interaces hidrofbicas e o Efeito Hidrfobo


A agregao de vrias molculas apolares vantagosa entrpicamente

Efeito Hidrfobo

Menos molculas de gua so foradas a ordenaremse, aumentando a entropia do sistema

Todos os grupos hidrofbicos esto protegidos da gua. O escudo de molculas de gua ordenadas minimizado e a entropia do sistema aumenta.

Formao de micelas

Interaces hidrofbicas e o Efeito Hidrfobo

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Interaces hidrofbicas e o Efeito Hidrfobo


O efeito hidrfobo importantssimo em sistemas biolgicos porque: a maioria das macromolculas so amfipticas (tm regies apolares) o factor mais determinante na definio da conformao das macromolculas biolgicas (protenas e cidos nucleicos e lpidos) O factor mais importante no folding/enrolamento das protenas a minimizao da exposio dos resduos hidrofbicos Membranas celular Dupla camada de fosfolpidos

Capacidade de isolar a clula do meio exterior

A solvatao por molculas de gua ajuda na catlise enzimtica


A remoo da camada ordenada de molculas de gua favorece a formao do complexo enzima-substrato.
Camada de molculas de gua ordenadas

molculas de gua desordenadas, libertadas pela interaco do enzima com o substrato

S aumenta

Interaco enzimasubstrato estabilizada por pontes de hidrognio, interaces inicas ou hidrofbicas

Separados, o enzima e o substrato foram as molculas de gua vizinhas a formarem uma camada ordenada. A ligao do substrato enzima liberta algumas molculas de gua, aumentando a entropia do sistema (S) e portanto favorecendo energeticamente a reaco.

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A gua como reagente


Dissociao da gua Valores de pH de algumas solues aquosas
NaOH 1M Lixvia Amnia

Escala de pH

Bicarbonato de sdio (NaHCO3) gua do mar Sangue, lgrimas Leite, saliva Caf Cerveja Vinho tinto Coca-cola, vinagre Sumo de limo Suco gstrico HCl 1M

De acordo com o seu pKa, as molculas biolgicas que contenham grupos cido ou base podem ter carga elctrica ao pH fisiolgico

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A gua como reagente


A gua participa em diversas reaces biolgicas Reaces de hidrlise

Reaces de oxidao-reduo

+ H2O

+ 2H+ + 2e-

Oxidao de aldedo a cido carboxlico

1.Fundamentos moleculares de Bioqumica


OS DIFERENTES TIPOS DE CLULAS E AS S U A S C AR A C T E R S T I C A S

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Biodiversidade dos organismos vivos, uniformidade bioqumica


Relao filogentica entre as espcies de seres vivos conhecidas que se dividem em 3 reinos

Eucariotas

A clula a UNIDADE FUNCIONAL de todos os seres vivos Procariotas

A clula procaritica, verso mais simples da vida


Os procariontes dividem-se em Bactria e Archaea So os seres vivos mais numerosos do planeta Um ser humano tem mais clulas procariticas do que das suas prprias So unicelulares, existindo casos especficos de agregados de vrias clulas, mas iguais As archaea vivem em habitats estranhos de alta salinidade, pH muito cido, temperaturas muito elevadas, ou muito alta presso. Diferenciam-se das bactrias pela natureza dos seus lpidos membranares. As bactrias so encontradas no solo, na gua, ou dentro de organismos superiores. Incluem as bactrias Gram-positivas, Gram-negativas e as cianobactrias, etc.

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Clula Procaritica
Confere forma e proteco osmtica 1 cromossoma circular svezes h plasmdeos Complexos moleculares para a transcrio gnica Onde ocorre quase todo o metabolismo locomoo

Duas membranas de fosfolpidos. Periplasma o espao entre membranas. importante para a cadeia respiratria

Mesossoma Estrutura de invaginaes membranares , onde ocorrem reaces enzimticas especiais

A parede celular procaritica


Confere a forma s bactrias composta pelo peptidoglicano, uma estrutura de peptidos e oligossacridos

Malha de peptidoglicano A penicilina e antibiticos anlogos inibem a sntese do peptidoglicano

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A parede celular procaritica


Gram positiva Gram negativa

25 nm

3 nm

A clula procaritica muito verstil


Caractersticas das bactrias
Conseguem sintetizar as biomolculas a partir de sais simples Multiplicam-se muito rapidamente (p.e., S. aureus duplica a cada 20 min) Possuem material gentico de fcil manipulao e reinsero, plasmdeos. Apresentam grande adaptabilidade e versatilidade metablica. Tm cadeias respiratrias que no usam oxignio. Baseiam-se fortemente na regulao da expresso gnica para se adaptarem metabolicamente ao meio em que se encontram

Potencialidade biotecnolgica
Os meios de crescimento so de baixo custo Uma produo em larga escala no demorada. Clonagem de genes para expresso de protenas ou pptidos recombinantes. Podem ser usados na remoo de produtos txicos (p.e., metais pesados) ou no tratamento de lixo

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Diferenas entre clula eucaritica e procaritica

Comparao entre clula procaritica e eucaritica


CARACTERSTICAS CLULA PROCARTICA CLULA EUCARITICA Cerca de 40 m de dimetro e em mdia 1000 a 10000 vezes o volume da clula Procaritica. Apenas nas plantas e fungos, constituda por celulose e quitina respectivamente. Rgida.

Tamanho

0,5 a 5 m de dimetro Rgida, constituda por peptidoglicano

Parede celular Material gentico Organelos Estruturas respiratrias Fotossnteses Flagelos

Em contacto com o citoplasma e sem Possui ncleo e um ou mais nuclolos. qualquer invlucro nuclear Sem organelos membranares, com muitos ribossomas Vrios tipos de organelos membranares (mitocndrias, retculo, complexo de Golgi).

Hialoplasma e membrana plasmtica Hialoplasma e mitocndrias Sem cloroplastos mas ocorre por vezes D-se nos cloroplastos (apenas nas clulas em lamelas fotossintticas. vegetais). Organelos locomotores simples apenas ligados superfcie da clula. Organelos locomotores complexos envoltos na membrana plasmtica

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A organizao da clula animal


Sistemas de vesculas membranares Rugoso, (com ribossomas) Sntese e enrolamento das protenas membranares ou para secreo. Liso, sntese de fosfolpidos - Armazenamento da informao gentica - Sntese de ribossomas

Poros nucleares Controlo de entrada e sada de RNA e factores de transcrio Ribossomas Traduo do RNA . Sntese de protenas Complexo de Golgi Sculos vesiculares, glicosilao das protenas , direccionamento das protenas para a membrana, ou organelos, p.e. lisossoma

Organelo com lumencido, que contm enzimas que degradam cidos gordos, com libertao de H2O2

Vescula com interior cido, com hidrolases (proteases, lipases nucleases, etc) que degradam biomolculas

Organelo com dupla membrana, e prprio DNA. Funo energtica produo de ATP

Ncleo

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Sistema endomembranar

Citosqueleto microtubulos, filamentos intermedirios e actina

As trs fibras do citoesqueletomicrotubulos a azul, filamentos intermedirios a vermelho, e actina a verde

Nestas clulas, os filamentos de actina aparecem roxo claro, os microtubulos a amarelo e o ncleo a verde.

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Mitocondrias onde ocorre a respirao celular

DNA mitocondrial

ribossomas

Cclo dos cidos tricarboxlicos - TCA Oxidao Beta (c gordos) Cadeia respiratria, fosforilao oxidativa

Clula animal e vegetal


Organelos especficos das plantas Vaclos maiores Cloroplastos Parede Celulas
Membrana plasmtica Compl. Golgi mitocondria nuclolo ncleo RE

ribossomas

mitocondria

Vacolo Armazenamento de nutrientes. Presso hidrstatica

Parede celular (feita de celulose)

cloroplastos fotossntese sntese de ATP a partir da energia solar Converso de CO2 em compostos orgnicos

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Diferentes tipos de clulas


Adipcitos neurnios

Clula epitelial

Comparao entre clula animal e vegetal

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Permeabilidade selectiva das membranas

Os cloroplastos - fotossntese

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Teoria endossimbitica Aquisio de cloroplastos e mitocndrias

Relembrar conceitos:
A gua polar ou apolar? Como se comportam substncias polares e apolares neste solvente? Considere uma macromolcula polimrica linear, com bastante liberdade conformacional. Discuta as consequncias para a conformao da macromolcula, quando dissolvida em gua, da distribuio de monmeros hidroflicos e hidrofbicos ao longo da cadeia. Justifique porque, para se explicar a insolubilidade de molculas apolares em gua, correcto invocar o efeito hidrofbico e no as interaces hidrofbicas. Que tipo de interaces so possves de ocorrer em meio aquoso entre o solvente e/ou grupos polares das biomolculas?

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Que tipo de clula esta? Escrever a legenda.


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