Propriedades ácido-base dos aminoácidos e péptidos

1.

Entre que grupos químicos dos aminoácidos se estabelece a ligação peptídica na formação de um

péptido?

2.

O aminoácido histidina apresenta três grupos ionizáveis com os seguintes valores de pK:

pk a1 =1.8 ( -carboxilo)

pk a2 =9.2 ( -amino)

pk a3 =6.0 (imidazol)

a.

Esquematize uma curva de titulação (pH vs equivalentes de base adicionada) indicando as espécies

presentes.

b.

Indique na curva onde se situa o ponto isoeléctrico.

14

12

10

8

H

p

6

4

2

0

0

1

2

3

4

NaOH equivalents

3.

Responda às seguintes questões com “verdadeiro” ou “falso”. Se “falso” explique porquê:

a.

Só a pH muito ácido ou muito básico é que a forma não ionizada de um dado aminoácido predomina.

b.

A um valor de pH superior ao valor de pK a de um grupo ionizável, mais de metade desses grupos estão

ionizados.

c.

O ponto isoeléctrico do tripétideo Lis-Lis-Lis é maior do que qualquer dos valores de pKa dos resíduos

individuais (lisina).

1

4.	O grupo γ-carboxilo do ácido glutamico tem um pKa = 4.3.
a.	Que fracção destes grupos estão desprotonados (i.e. na forma -COO - ) em solução diluída de ácido glutâmico a pH = 5.0.
b.	E a pH = 3.8.
c.	Calcule as cargas formais do glutamato para os valores de pH das alíneas anteriores.
5.	Porque é que os aminoácidos cujas cadeias laterais não são ionizáveis têm propriedades anfotéricas para valores de pH próximos dos fisiológicos?
6.	Quais as propriedades dos aminoácidos que são relevantes para a formação da estrutura tridimensional das proteínas?
7.	Considere as seguintes misturas de aminoácidos:
a.	Uma mistura de aminoácidos, Ala, Ser, Fen, Arg, Asp e His é sujeita a electroforese em papel a pH = 3.9. Indique a direcção de migração de cada aminoácido.
b.	Suponha que tem uma mistura de Ala, Val, Glu e Lis a pH = 6. Calcule a carga formal de cada aminoácido. Desenhe a forma da tira de papel após ter realizado a electroforese. Indique o ânodo (+) e o cátodo (-) e a origem e a posição final de cada um dos aminoácidos.

2

8. Usando os valores de pka indicados na tabela em anexo identifique os aminoácidos correspondentes as seguintes curvas de titulação:

9. Considere o seguinte peptídeo:

Glu-Leu-Arg-Met-Glu-Trp-Arg-Ala-Trp-Glu

a. Representando o peptídeo na forma Ln ^- , indique todos os equilírios desde a forma totalmente desprotonada até à forma totalmente protonada referindo quais os grupos envolvidos em cada passo e os respectivos valores de pK _a .

b. Desenhe a curva de titulação.

c. Calcule o pH do ponto isoeléctrico.

3

4

Anexo I Estruturas dos aminoácidos

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Anexo II pKa e pI dos aminoácidos

Amino Acid	pKaC	pKaN	pKaR	pI
Glycine	2.4	9.8		6.10
Alanine	2.4	9.9		6.15
Valine	2.3	9.7		6.00
Leucine	2.3	9.7		6.00
Isoleucine	2.3	9.8		6.05
Proline	2.0	10.6		6.30
Serine	2.2	9.2		5.70
Threonine	2.1	9.1		5.60
Cysteine	1.9	10.7	8.4	5.15
Methionine	2.1	9.3		5.70
Asparagine	2.1	8.7		5.40
Glutamine	2.2	9.1		5.65
Phenylalanine	2.2	9.3		5.75
Tyrosine	2.2	9.2	10.5	5.70
Tryptophan	2.5	9.4		5.95
Lysine	2.2	9.1	10.5	9.80
Arginine	1.8	9.0	12.5	10.75
Histidine	1.8	9.3	6.0	7.65
Aspartate	2.0	9.9	3.9	2.95
Glutamate	2.1	9.5	4.1	3.10

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