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Ncleo RE rugoso
Sntesis Protenas Vescula de transporte Lisosoma RE liso Lado CIS Complejo de Golgi Lado TRANS Endosoma Vescula secrecin
Endocitosis
Compartimentacin celular Mantenimiento composicin especfica Flujo energtico celular Reconocimiento celular Transduccin de seales Movilidad celular
La correcta funcionalidad de las mbs depende de la funcin coordinada del componente lipdico y proteco
Introduccin terica
Espacio intermb
NAD+ NADH + H+
fumarato succinato
H2O O2 + 2 H+
Modelos de membrana
Mdelo de mosaico fluido, (Singer & Nicholson, 1972)
Oligosacrido de glicoprot Glicolpido
Zona hidrofbica Cabezas polares de PLs Prot perifrica Ch Prot integral (1TM) Prot perifrica unin covalentemente
Ch
PLs
SFLs
Asimetra de membrana
Composicin % total en mb
% de distribucin en mb plasmtica
Monocapa interna Monocapa externa
PE PC SM PS PI PI 4-P PI 4,5-bP PA
100
100
Mb plasmtica
Existe adems distribucin asimtrica composicin lipdica en mbs celulares Ch, % en mbs orgnulos CL, en mb mitoc int PIs, imp en funcin pero minoritarios
Mb Mitocondrial interna Mb Mitocondrial externa Mb lisosomal Mb nuclear Mb RE rugoso Mb RE liso Mb Golgi 0 100
PS, PE
Aminofosfolpido tranlocasa
Flipasa
Scramblasa
Ca2+
Debido a que es energeticamente desfavorable que se expongan dominios hidrofbicos de las protenas a un entorno polar, los lpidos de membrana se adaptan localmente al espesor de estas zonas de interaccin Lipido-Protena
Existen dominios de membrana. Esta segregacin puede venir condicionada por la composicin lipdica y tambin por protenas de mb. Ej. Muestra los dominios en mb modelo formada por dilaurilPC (estado fluido, desordenado; en verde) y dipalmitoil PC (estado gel ordenado; en rojo)
Rafts y Caveolas
Raft, dominio lipdico de mb rico en SM/Ch monocapa externa y Ch en monocapa interna Concentran protenas ancladas va GPI y protenas de sealizacin (GTPasas, PKs aciladas). La existencia de caveolina-1 define las caveolas
raft raft
caveola caveola
La monocapa externa de mb rica en SM y Ch, crea una barrera de permeabilidad pero permite difusin lateral
Esfingomielina
Go < 0
PL, forma geomtrica cilindrica
Monocapa LisoPL
Bicapa
Micela Vescula lipdica (Liposoma)
Interior acuoso
PL
Lamelaridad:
Tamao:
25 nm
2,5 m
pequeas (SUV) (dimetro <100 nm) grandes (LUV) (dimetro > 100 nm)
Estructura de Lpidos
GliceroPL:
Cabeza polar
Grupo polar (X) puede ser: Colina PC Etanolamina PE Serina PS -O-CH2-CH2-N+(CH3)3 -O-CH2-CH2-NH3+ -O-CH2-CH-NH3+ C00Fosfatidil-DAG CL Inositol-4,5-bisP PI
# Como veremos durante la parte prctica de la asignatura esta estructura confiere a cada PL carga neta especfica a pH fisiolgico que influyen en su comportamiento.
Nomenclatura
LisoPL PL nombre genrico; especificar AG posicin 1 y 2 AG 18:n (nmero de atomos de C: nmero de insaturaciones) si existen varias estas ocurren normalmente cada 3C debido al mecanismo biosinttico
Estructura de los AG
Grupo carboxilo (polar)
Por el tipo de ruta biosinttica los AGs en general estn formados por nmero par de atomos de C. Estas insaturaciones pueden tener conformacin cis o trans
Mayor grado de insaturacin menor punto de fusin Mayor longitud mayor punto de fusin (Aceites vs grasas)
AG saturados
# Prediccin estructural de una bicapa di(C18:1)PC. Se indica la probabilidad de encontrar los distintos elementos estructurales en la zona hidrofbica y acuosa.
Ejemplo
Organizacin
Cono invertido
Cilindro
PLs (sin gran repulsin grupos polares) PC, SM, PS, PI, PG, PA Bicapa
Cono
Distintos tipos de estructuras anisotrpicas: A) fase hexagonal normal HI, fase lamelar L, fase hexagonal reversa HII Estas propiedades son claves en funcionamiento de mbs. La tendencia a formar un tipo de estructuras u otras ser esencial en procesos de fusin de mbs, transporte vesicular, endo- y exocitosis etc
Por ejemplo:
La transformacin de PA (forma ~ cono) en LPA (forma ~ cono invertido) por transferencia de AA (C20:4) catalizada por endofilina I (LPA aciltransferasa) PLA2 favorece la curvatura de membrana y el proceso de endocitosis en vesiculas revestidas de clatrina.
LPA
AA-CoA
PA
cono invertido
cono
Interviene de forma activa tambin el PtdIns (4,5) P2 que atrae las protena necesarias para el proceso y posteriormente es desfosforilado a PtdIns-4P
Factor desencadenante
Agregacin
Semifusin
Fusin
Esfingosina
AG
Enlace amida
Glucosilcerebrosido
Glucosa
Lactosilceramida
Gangliosido
Oligosacrido complejo
No se emplean disolventes orgnicos Se obtiene una poblacin homognea de vesculas Tamao controlado Aplicable a una gran variedad de sistemas lipdicos Temperatura controlada Altas eficacias de encapsulacin
extruder
La composicin lipdica afecta a las propiedades fsicas de las mb: Longitud y grado de insaturacin de AG Caractersticas cabezas polares: impedimentos estricos, carga Composicin en Ch Composicin en SFL
Gel
Fase Gel Altamente ordenada, compacta
Cristal Lquido
Fase Cristal-Lquido Fase menor grado de orden, ms fluida, movimientos moleculares, ms desordenado
Estudios de calorimetra
# Efecto de la longitud de los grupos acilo: L, lauril;M, miristoil; P, palmitoil; S, estearoil; A, araquidonoil
Experimento tipo
IF
0.8
NBD-PE
NBD/Rh
0.4
0.0 480
520
560
600
640
nm
ANTS (fluorescente)
Fusin
Apagamiento Colisional
DPX (apagador)
Sondas hidrosolubles
# Existen otros sistemas en los que se emplea una sonda dbilmente fluorescente (ej. Tb3+ ) que al encontrarse como consecuencia del proceso de fusin con otro agente (ej. DPA) se produce un aumento de la emisin de fluorescencia
2-Micelas y detergentes
Micela
[monmero]
cmc
[micelas]
[Detergente]
Detergentes no inicos
- Serie Triton-X - Serie Lubrol
- Serie Brij
Brij 35
Complejo protena:detergente
# La solubilidad del complejo depender del tipo de detergente y la relacin [protena]/[detergente] Criterios para la eleccin de detergentes: Efecto en la actividad/estructura de protena Capacidad de solubilizacin de protena CMC
Dependiendo del tipo de interaccin entre prots y mb se pueden separar de modo: Prots perifricas pH, fuerza inica, agentes quelantes o desnaturalizantes PLC (prots unidas covalentemente a GPI), esterasas (prots aciladas) Prots integrales utilizacin de detergentes
Los lpidos y la estructura de las protenas de mb # Mayor grado de conocimiento de la estructura de protena de mb si se consigue hacerlo en presencia de los lpidos con los que interaccionan # Dificultades metodolgicas en la purificacin de protenas de mb y en la resolucin estructural
Protenas integrales de mb
- Hlices hidrofbicas
Nt
zona hidrofbica
residuos bsicos
Ct
Ej. Bacteriorrodopsina: 248 aa/monmero 7 hlices transmembrana oligomeriza formando trmeros
- Barril
Formado por 20 segmentos TMB entorno a un cilindro Estabilizado por fuerzas semejantes a hlice hidrofbica
Ca
Cabeza polar Pls Grupos fosfato
2+
Perfiles de hidropata
Glicoforina
- Permite predecir estructura de prots de mb Basados en algoritmos que atribuyen a cada aa en funcin de su naturaleza un valor indicativo de su probabilidad de estar en entorno hidrofbico de Mb o en entorno polar - Importante valor parmetro calculado para aa adyacentes - Son necesarios ~7-20 aa para atravesar bicapa (ventana) Indice de hidropata
Hidrofbico
Hidroflico
N aa
Bacteriorrodopsina
Indice de hidropata
Hidrofbico
Hidroflico
N aa
3-
Modelos
Experimentales
de
Membrana
4-
Agregacin
fusin
de
vesculas
2- Translocacin a dominios preferentes, influencia covalente de y procesos de modificacin por seales regulacin
extracelulares
3-
Prediccin de
anlisis
de
la de
protenas