Universidad Nacional Autnoma de Mxico Facultad de Estudios Superiores Cuautitln Qumica Orgnica IV Len Len Donaldo Gamaliel Unidad 4:

Fundamentos de Aminocidos
. Los aminocidos, como su nombre lo indica, son bifuncionales. Contienen un grupo amino bsico y un grupo carboxlico cido.

Como los aminocidos contienen un grupo cido y un grupo bsico, experimentan una reaccin cido-base intramolecular y se encuentran principalmente en la forma de un in dipolar, o Zwitterion.

Los aminocidos son Anfteros: pueden reaccionar como cidos o como bases, dependiendo de las circunstancias.

Los aminocidos proteicos se dividen en dos grupos: a) Los aminocidos codificables o universales, que permanecen como tal en las protenas. b) Los aminocidos modificados o particulares, que son el resultado de diversas modificaciones qumicas posteriores a la sntesis de protenas. Los aminocidos proteicos codificables son 20 y adems de su nombre comn, se pueden describir mediante un cdigo de tres letras o mediante un cdigo de una letra. Todos son -aminocidos.

De estos 20 aminocidos, la mitad pueden ser sintetizados por el hombre, pero hay otra mitad que no, y por lo tanto deben ser suministrados en la dieta, se conocen como aminocidos esenciales. Los aminocidos esenciales son: Val, Leu, Ile, Phe, Trp, Thr, Met y Lys. Los aminocidos His y Arg tambin son esenciales, pero nicamente durante la etapa de crecimiento. Los aminocidos no proteicos se pueden dividir en dos grupos: a) -aminocidos no proteicos: La L-ornitina y la L-citrulina son importantes intermediarios en el metabolismo de la eliminacin del nitrgeno y la creatina juega un papel importante como reserva de energa metablica. Tambin pertenecen a este grupo la homoserina y la homocistena. b) -aminocidos. En estos aminocidos, el grupo amino sustituye al ltimo carbono. La -Alanina forma parte de algunas coenzimas, y el cido aminobutrico es un importante neurotransmisor

Punto isoelctrico

El punto isoelctrico (PI) de un aminocido depende de su estructura; y es el promedio de las dos constantes de disociacin cida que incluyen el zwitterion neutro. En cuanto a los aminocidos con una cadena lateral que sea un cido fuerte o un cido dbil, el PI es el promedio de los dos valores de pKa ms bajos. En el caso de los aminocidos con una cadena lateral bsica, el PI es el promedio de los dos valores de pKa ms altos.

Sntesis de aminocidos
Uno de los mtodos ms antiguos comienza con la -bromacin de un cido carboxlico por tratamiento con Br2 y PBr3 (La reaccin de Hell-Volhard-Zelinsky). La sustitucin del -bromo cido con amoniaco produce un -aminocido.

En la sntesis de Strecker, un aldehdo se convierte a una -aminocido con un tomo de carbono ms, mediante un procedimiento en el que un -aminonitrilo es un intermediario. El -aminonitrilo se obtiene por la reaccin del aldehdo con amoniaco o con una sal de amonio y una fuente de iones cianuro. Para formar una funcin cido carboxlico, la hidrlisis del grupo nitrilo completa la sntesis.

Sntesis de Gabriel
El reactivo clave es la sal de potasio de la ftalamida, esta sal tiene un tomo de nitrgeno con carga negativa, que se comporta como nuclefilo hacia los halogenuros de alquilo primarios, en un proceso de sustitucin nucleoflica bimolecular (SN2). El producto de esta reaccin es una imida, un diacil derivado de una amina. Para hidrolizar sus dos enlaces de amida y liberar la amina primaria deseada, se puede usar ya sea cido o una base acuosos.

Glicina

Fenilalanina

Reacciones de los aminocidos

Un enlace amida entre la funcin de un cido carboxlico de un aminocido y el nitrgeno del amino de otro se llama enlace peptdico.

El grupo amino N-terminal est libre, y puede actuar como nuclefilo. Los grupos amino de todos los dems aminocidos son parte de enlaces amida, no estn libres, y son mucho menos nucleoflicos. El mtodo de Sanger para analizar los residuos N-

terminales implica tratar un pptido con 1-fluoro-2,4-dinitrobenceno, muy reactivo hacia la sustitucin nucleoflica aromtica. El grupo amino del aminocido N-terminal desplaza al fluoruro del 1-fluoro-2,4dinitrobenceno, y forma un pptido en el que el nitrgeno N-terminal est marcado con un grupo 2,4-dinitrofenilo (DNP).

Degradacin de Edman
Un pptido reacciona con isotiocianato de fenilo, para forma un derivado de feniltiocarbamolo (PTC). Este derivado de PTC se trata entonces con un cido en un medio anhidro para romper el enlace de amida entre el aminocido N-terminal y el resto del pptido. Cuando el derivado PTC se trata con cido en medio anhidro, el tomo de azufre de la unidad C=S reacciona como nuclefilo interno, y el nico enlace amida que se rompe bajo estas condiciones es el del aminocido N-terminal. El producto de esta ruptura, llamado tiozalona, es inestable bajo las condiciones de su formacin, y se isomeriza para formar un derivado de feniltiohidantona (PTH), que se asla y se identifica comparndola con muestras patrn de PTH derivadas de aminocidos conocidos. Esto se hace normalmente con mtodos cromatogrficos. Solo se rompe el enlace amida del N-terminal en la degradacin de Edman; el resto de la cadena de pptidos permanece intacta.

PTH

Bibliografa Carey, Francis A. Qumica Orgnica. 6ta. Edicin. Mc Graw Hill. Mxico. 2006 http://depa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/Unidad_2_Aminoacidos,_peptidos_y_pr oteinas_1887.pdf http://www.ehu.es/biomoleculas/1b/pdf/8_aminoacidos.pdf