Aula 6 03/10/12 Sumrio

Protenas Protenas fibrosas/Protenas globulares/Protenas de membrana Modificaes Ps-traduo Modificaes de aminocidos Adio de grupos funcionais Protelise Funo Proteica Ligando (Ka e Kd) Induced Fit

Bioqumica I (MICF; 12/13)

Protenas Classificao Estrutural

Protenas Globulares Arranjo estrutural numa forma esfrica ou globular (Maioria das protenas) Protenas Fibrosas Arranjo estrutural da cadeia polipeptdica em fibra - queratina (cabelo, unhas, l, chifres, etc) Fibrona Colagnio Protenas de Membrana
* Caso especial
Bioqumica I (MICF; 12/13)

Protenas Protenas Globulares

Constitudas por diferentes domnios Folhas e Hlices- adquirem uma posio espacial e so ligadas entre si atravs das voltas ou loops Exterior hidrfilo; interior hidrfobo (*excepes).
Exterior Interior

Quimotripsina

Aahidrfilos

Aahidrfobos

Bioqumica I (MICF; 12/13)

Protenas

*excepo
Bioqumica I (MICF; 12/13)

Protenas Protenas Fibrosas

No apresentam diferentes domnios Estruturas repetidas da mesma estrutura secundria Geralmente insolveis (formao de agregados)

Colagnio

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Protenas

Hlice (enrolamento para a direita), rica em aa hidrfobos (Ala, Val, Leu, Ile, Met, Phe) e Cys 2 Hlices (paralelas entre si e com enrolamento para a esquerda) 2x duas cadeias

4x duas cadeias

(cabelo, unhas, camada externa da pele, chifres .)

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Protenas

Estrutura estabilizada por ligaes covalentes (ligaes dissulfureto; Cys-Cys)

Bioqumica I (MICF; 12/13)

Protenas

No Hlice Seq Gly-X-Y (X: Pro; Y: OHPro) enrolamento para a esquerda 3 resduos por volta 35% Gly, 11% Ala, 21% Pro e OH-Pro

(tendes, cartilagem .)

3 hlices com enrolamento para a direita

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Protenas

Nasextremidadesasfibrilhasde colagneoestabilizadaspor ligaescovalentesentreLyseOH Lys

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Protenas

(seda, fio de aranhas )

Folha Cadeia polip. rica em Ala e Gly Repeties de: Gly-X-Gly-X (X pode ser Ala ou Ser) Estabilizada por ligaes de H e interaces de Van der Waals Empacotamento das folhas formando camadas.
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Protenas

Bioqumica I (MICF; 12/13)

Protenas

Hidroxilao

OH

Lys/Pro

Protenasestruturais (Colagnio,elastina) Reg.Actv Enzimtica

Fosforilao (>30%) Metilao Acetilao SNitrosilao Carboxilao

HPO3 CH3 CH3CO NO

Ser/Tyr/Thr Arg/Lys Aa Nterminal/Lys Cys Glu

Ex:Histonas

Protrombina (Carboxi Glu) responsvelpelaligaoao Ca2+ Fibrinognio eprotenasde secreo

Sulfatao

Tyr

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Protenas

Aucares (Glicosilao)

Nacetilglucosamina (GlcNAc) Manose (Man) Galactose (Gal) cido silico (Neu5Ac) Fucose (Fuc) Nacetilgalactoseamina (GalNAc)

Bioqumica I (MICF; 12/13)

Protenas

Aucares (Glicosilao)

Nacetilglucosamina (GlcNAc) Manose (Man) Galactose (Gal) cido silico (Neu5Ac) Fucose (Fuc) Nacetilgalactoseamina (GalNAc)

Asn (Nlinked) Ser(Olinked) Thr (Olinked)

Bioqumica I (MICF; 12/13)

Protenas

Aucares (Glicosilao)

Nacetilglucosamina (GlcNAc) Manose (Man) Galactose (Gal) cido silico (Neu5Ac) Fucose (Fuc) Nacetilgalactoseamina (GalNAc)

Asn (Nlinked) Ser(Olinked) Thr (Olinked)

Estabilizao/Solubilidade/ Loc.Extracelular/ Interacesextracelulares

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Protenas

Lpidos

c.Palmtico c.Mirstico Glicofosfatidilinositol (GPI) GruposPrenil (farnesil;geranil) Colesterol

Cys (Ser) Gly (reg.Nterminal) Cterminal Cys (reg.Cterminal) Gly (reg.Cterminal)

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Protenas

Lpidos

c.Palmtico c.Mirstico Glicofosfatidilinositol (GPI) GruposPrenil (farnesil;geranil) Colesterol

Cys (Ser) Gly (reg.Nterminal) Cterminal Cys (reg.Cterminal) Gly (reg.Cterminal)

Ancoragem de protenas globulares a membranas

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Protenas

AdiodeGrupos prostticos Protelise daseq sinal Protelise

Heme Biotina Etc

Hemoglobina

Ex:Protenas mitocondriais Ex: Insulina protenaspercursoras inactivas:proprotenas; enzimaspercursoras inactivas:zimognio

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Protenas Funo Proteica

Interaco especfica com outras molculas

Outras protenas (grandes complexos) cidos nucleicos (controlo da replicao e expresso) Polissacridos (superfcie da membrana celular) Lpidos (incorporados nas membranas) Pequenas molculas, como ies, Ox, electres

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Protenas

FUNO
Catalizadores biolgicos Armazenamento Transporte

EXEMPLOS
Enzimas (componentes mecanismo celular) centrais do

Ferritina (armaz. Fe no fgado) Mioglobina (armaz. Ox no msculo) Transferrina (trans. Fe) Hemoglobina (trans. Ox) Poros das membranas celulares Algumas hormonas Anticorpos Colagnio (suporte mecnico)

Mensageiros Imunolgica Estrutural

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Protenas Funo Proteica

1. Estabelecimento de ligaes reversveis a outras molculas (ligandos) 2. Existncia de um stio de ligao, complementar ao ligando (carga, tamanho, caractersticas hidrfobas e/ou hidrfilas) 3. Possibilidade de ocorrncia de alteraes conformacionais (induced fit) que permitem a ligao da protena ao ligando

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Protenas
Ligandos: P+L PL

Ka =

[PL] [P ][L]

Ka Constante de afinidade

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Protenas
Ligandos:
Fraco dos Stios de Ligao totais ocupados pelo Ligando

P+L

PL
Curva hiperblica

[L]
Como: Ento:

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Protenas
Ligandos: Se = 0,5; L=1/Ka P+L Concentrao molar de L para a qual metade dos stios de ligao da protena se encontram ocupados PL

[L]

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Protenas
Ligandos: P+L PL

Menor Kd (maior Ka) (necessrio menor [L] para ocupar metade dos stios de ligao)

Kd

[L]

Quanto mais fortemente um ligando se ligar protena menor a quantidade de ligando necessria para que metade dos stios de ligao se encontrem ocupados
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Protenas
Hemoglobina/Mioglobina -protenas de ligao ao OxignioMioglobina (Mb):
Monmero Mr 16.700 (153 aa) Grupo prosttico Heme

Hemoglobina (Hb):
Heterotetrmero Mr 64.500 2 unidades (141 aa) 2 unidades (146 aa) G. Prosttico - Heme
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Protenas
Mioglobina Hemoglobina

1,0

Saturao

0,5

10

20

30

40

50

Presso parcial de O2 (mm Hg)

Ka e Kd Hemoglobina Ka e Kd Mioglobina Hb Mb Kd , Ka Kd , Ka
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Protenas

Bioqumica I (MICF; 12/13)

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Protenas
Estados conformacionais:

Estado T (tense; desoxi-hemoglobina) maior nmero de ligaes par-inica nas interfaces 12 estabilizada pela ausncia de Ox Estado R (relaxed; oxi-hemoglobina) maior afinidade para o Ox (forma estabilizada pela ligao ao Ox)
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Protenas
Estados conformacionais:

Ligao do Ox Hb no estado T promove uma alterao estrutural evoluindo para a forma R; As sub-unidades ficam mais perto uma da outra, as posies dos aa volta do Heme ficam alteradas, facilitando a ligao do Ox
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Protenas
Imunoglobina G -AnticorposForma Y 2 cadeias leves (L) e 2 cadeias pesadas (H) ligadas entre si por pontes de S e ligaes no-covalentes Stios de ligao ao Ag Domnios constantes (C) entre as diferentes IgG (estrutura caracterstica) e domnios variveis (V)

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Protenas
Imunoglobina G -Anticorpos-

Ligao especfica Ac-Ag determinada pelos resduos de aa do domnio varivel das cadeias H e L complementaridade Ac-Ag dependente da forma, localizao das cargas, hidrofobicidade e formao de ligaes de H Estruturas do Ag interage com o Ac alterando-se conformacionalmente (induced fit) Interaco Ag-Ac muito forte (ka , kd )
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Protenas
No contexto da estrutura proteica h que ter em conta algumas das propriedades dos aminocidos:

Tamanho Carga Polaridade Hidrofobicidade Aromaticidade

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Protenas
Classificao Hidrfobos alifticos Aa Ala Caractersticas Menos hidrfobo desta classe. Situa-se fora e dentro das protenas Frequentes em protenas que no requerem o folding compacto (grupo R pequeno) Favorecem o folding hidrfobo Geralmente fazem parte dos stios de ligao de enzimas excepo da Leu, quebram a hlice Formao da hlice Localizados no interior hidrfobo da protena

Val Leu Ile Met Hidrfobos aromticos Polares com cadeias no carregadas Phe Tyr Trp Ser Thr

Formao de steres com fosfatos ou cidos orgnicos Ligao ao anel aromtico dos aucares Grupos OH perto da cadeia principal podendo formar com ela ligaes de H (influenciando a conformao)

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Protenas
Classificao Polares com cadeias no carregadas Aa Cys Caractersticas Mais polar Grupo tilico facilmente oxidado (aa mais reactivo) Formao de ligaes dissulfito Grupos amida que formam ligaes de H sempre que ocorrem no interior da protena Participa nos stios activos das enzimas Grupo R flexvel Importante nas reaces enzimticas Ligao a grupos fosfato Localizam-se na superfcie das protenas onde interagem com as molculas de solvente Fazem parte das interaces electrestticas com grupos carregados positivamente Capacidade de ligaes a metais

Asn Gln Grupos carregados positivamente His Lys Arg Grupos carregados negativamente Asp Glu

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Protenas
Classificao Aa Gly Caractersticas No tem cadeia lateral podendo adoptar conformaes estricas impossveis para outros aminocidos Confere um elevado grau de flexibilidade local Aminocido muito rigdo (cadeia lateral ligada ao N da cadeia principal)

Pro

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