IMPORTANCIA Parentesco

Medida de fraccin compartida de genes

idea de que se puede usar informacin de parientes para predecir el VALOR GENTICO de un animal
MTODOS DE SELECCIN

idea de la variacin aditiva de la poblacin

HEREDABILIDAD

Consanguinidad disminucin de la productividad

DEPRESIN ENDOGMICA

depende de efectos no aditivos (se analizar ms adelante en al curso)

Una situacin muy sencilla

A B O C
antepasado comn de B y C

Si B y C reciben una copia del mismo gen genes IDNTICOS POR ASCENDENCIA (copias del mismo DNA)

CLASIFICACIN idnticos por ascendencia (I.P.A.) genes similares en estado (igual funcin, copias de distintos genes ancestrales) Ejemplo: poblacin base en equilibrio HW p2 2pq q2

homocigotas similares en estado CONSANGUINIDAD

COEFICIENTE DE CONSANGUINIDAD (Fx): probabilidad de que 2 genes presentes en un locus de un individuo sean idnticos por ascendencia.

Consanguinidad producto del cruzamiento de animales emparentados reflejo de la homocigosis pero medida en trminos relativos a una pobl. base PARENTESCO
PARENTESCO ADITIVO (axy): proporcin esperada de genes en comn idnticos por ascendencia entre 2 individuos

media de la covarianza entre valores de cra de parientes (rAA) muy usado en evaluacin gentica

slo aproximado cuando hay consanguinidad

COEFICIENTE DE PARENTESCO (RXY): correlacin entre VALORES DE CRA de X e Y (Wright, 1921)

valor entre 0 y 1 RXY =

Cov( X , Y )
2 2 X . Y

a XY a XY = a XX .aYY (1 + FX )(1 + FY )

si no hay consanguinidad en X e Y: aXY = RXY

PARENTESCO DE DOMINANCIA (dXY): probabilidad que los GENOTIPOS en una determinado locus sean idnticos por ascendencia

medida de covarianza entre desvos de DOMINANCIA dXY es 0 para la mayora de los parentescos (pero para HERMANOS ENTEROS: dXY 0)

Clculos de parentesco aditivo Recordemos:

Parentesco: % de genes en comn entre 2 individuos

Puede ser

Directo: el que existe entre un progenitor y sus descendientes (una rama) Colateral: genes en comn (IPA) pero provenientes por diferentes ramas

Parentesco directo Padre hijo P H H tiene una copia de uno de los genes de su padre (en todos los loci) Comparte EXACTAMENTE de los genes aPH =

Abuelo nieto A P H
aAH = x = como promedio Por qu? Vara entre o (el gameto heredado de P no es el proveniente de A) y ( el gameto heredado de P es el proveniente de A)

General:
El parentesco aditivo entre un individuo y un antepasado directo es ()n donde n es en nmero de generaciones hacia atrs

Conclusin:
A mayor distancia entre generaciones, menor probabilidad de heredar alguno de los genes de su antepasado, independientemente del mrito gentico de ste

Mensaje:
Es poco fructfero seleccionar un animal solamente porque tiene un antepasado muy famoso

Parentesco colateral A B D P Q C
Probabilidad de recibir un mismo gen de un antepasado comn?

P(B reciba una copia arbitraria de un gen de A) P(D reciba ese mismo gen de B) P(P reciba ese mismo gen de D) P(C reciba el mismo gen que B) P(Q reciba el mismo gen de C) n2 n1

aPQ = (1/2)n1 + n2 n1 = nmero de generaciones entre el primer pariente y el antepasado comn n2 = nmero de generaciones entre el segundo pariente y el antepasado comn

Qu sucede si es ms de un antepasado comn? A C B Hermanos enteros D

aCD = (1/2)1+1 + (1/2)1+1=1/4 + 1/4 = 1/2

aXY = (1/2)n1 +n2

Y si el ancestro es consanguneo? a mayor FA, mayor probabilidad de que 2 genes en un locus sean I.P.A. el parentesco aumenta un forma proporcional a FA
aXY = (1/2)n1 + n2 + FA(1/2)n1 + n2 = (1/2)n1 + n2 (1+FA)

Frmula General

a XY = (1/ 2) n1i + n2 i (1 + FAi )

i =1

Clculo de consanguinidad A Probabilidad de que X reciba 2 genes I.P.A.? B C

P(B reciba una copia arbitraria de un gen de A)

D P X

P(D reciba ese mismo gen de B) P(P reciba ese mismo gen de D)

n1

Q
P(C reciba el mismo gen que B) P(Q reciba el mismo gen que C) n2

P(X reciba de P un gen I.P.A. al que recibe de Q)

Fx = (1/2)n1 + n2 +1 Frmula General

FX = (1/ 2)n1i + n2 i +1 (1 + FAi )

ATENCIN

observar que

FX = (1/ 2) n1i + n2 i +1 (1 + FAi ) = 1/ 2aPQ

QU HACEMOS EN SITUACIONES REALES?

muchos animales parentescos complejos MTODO TABULAR PRINCIPIOS: 1. Si 2 animales son parientes, entonces uno o ambos padres de uno de ellos debern ser parientes del otro aCD = 1/2 (aAC + aBC) A D
aAC

B
aBC

aCD

2. aXY = 1 + Fx 3. El coeficiente de consanguinidad de un animal es 1/2 del parentesco de sus padres X Y FZ = 1/2 aXY Z

RESUMEN
mtodos de seleccin

parentesco uso en
estimacin VA

consanguinidad depresin endogmica parentesco aditivo

a XY

directo colateral = (1/ 2)n1 + nn 2 (1 + FA )

de dominancia
consanguinidad FX = (1/ 2)n1 + n2 +1 (1 + FA ) casos reales: MTODO TABULAR