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Impreso por Javier Granda Revilla. Prohibida su reproduccin.

10 DEL 15 AL 21

DE ABRIL DE 2013

TECNOLOGAS DIAGNSTICAS

ESPECIAL

LABORATORIO

HERRAMIENTAS PARA DISEAR LABORATORIOS QUE CABEN EN UN CHIP


Los profesionales deben ser capaces de interpretar y manejar toda la informacin que aportan los 'microarrays'
JAVIER GRANDA REVILLA dmredaccion@diariomedico.com

El gran auge de los sistemas de secuenciacin de ADN, que ha permitido disminuir drsticamente los costes de secuenciacin, ha incentivado el desarrollo de sistemas para la deteccin de otros biomarcadores. Para ello, se utilizan chips o biosensores integrados de lpidos, muerte sbita cardiaca, oncochips y tambin otros basados en mARN y en nanodiagnstico y que constituyen un verdadero laboratorio en un chip. La necesidad de formar profesionales capaces de interpretar la informacin que proporcionan estas herramientas es un aspecto en el que coinciden los expertos en este campo. Como ha recordado Josep Samitier, director asociado del Instituto de Bioingeniera de Catalua, el nanodiagnstico posibilita la identificacin de enfermedades o de la predisposicin a ellas a nivel celular o molecular mediante la utilizacin de nanodispositivos. "El fin ltimo consiste en identificar la patologa en el estado ms inicial posible. Para alcanzar este objetivo, se requiere un gran desarrollo de la investigacin en nanotecnologa para mejorar la eficiencia de los sistemas de diagnstico in vitro e in vivo. Es necesario mejorar la sensibilidad y la especificidad y disminuir los falsos positivos", ha explicado.
ONCOLOGA

valiosa e importante una vez localizado el nicho en que llenan huecos y resuelven problemas", ha especificado. En este mbito, los microarrays se usan tanto en investigacin como en clnica: en investigacin permiten examinar los efectos de un tratamiento, observando cmo se modifica la expresin gnica, o bien examinar los cambios asociados con metstasis o con el desarrollo tumoral, tanto en la expresin gnica como en la acumulacin de aberraciones cromosmicas.

de amplio espectro, las que pueden emplearse una vez caracterizadas en chips ms pequeos en los que nicamente se examinen los genes marcadores, especficos para subclasificar los pacientes de la patologa correspondiente".
MAMMAPRINT

JSE LUIS PINDADO

Orlando Domnguez, jefe de la Unidad de Genmica del Centro Nacional de Investigaciones Oncolgicas.

Signature OncoChip ejemplifica la variedad de los dispositivos que detectan anomalas cromosmicas, en este caso dirigido a cnceres hematolgicos Los expertos en gentica cuestionan la validez de ciertos test disponibles, especialmente los de las compaas que hacen diagnsticos por internet
En diagnstico se emplean en la estratificacin de pacientes y en el pronstico, proporcionando informacin difcil o imposible de obtener por medios alternativos. El oncochip diseado en 2001 en el CNIO -que ya no se usa- sirvi en la caracterizacin tumoral e incluso permiti identificar una firma molecular de 39 genes que predecan o acompaaban la resistencia a interfern alfa de un tipo de linfoma cutneo de clula T. Como ha precisado Domnguez, "son las firmas moleculares obtenidas de esta forma, analizando series de pacientes en microarrays

En el campo especfico del cncer, Orlando Domnguez, jefe de la Unidad de Genmica del Centro Nacional de Investigaciones Oncolgicas (CNIO), considera que los oncochips "son una herramienta valiosa. Quiz no tanto como prometan en sus comienzos, tal y como suele suceder con la mayora de las innovaciones, pero

De esta forma ha surgido MammaPrint, que analiza la actividad de 70 genes para predecir el riesgo de recurrencia en cncer de mama. "Sus resultados ayudan a decidir si conviene emplear quimioterapia para evitar la recurrencia o si es innecesaria. Este chip ha sido recientemente autorizado por la FDA", ha recordado el investigador. Existe otro microarray denominado Signature OncoChip que representa la variedad de los dispositivos dirigidos a detectar anomalas cromosmicas, en este caso para casos de cnceres hematolgicos. En su opinin, el microarray cromosmico ofrece una resolucin ms fina que la del FISH de la citogentica ms tradicional, con sensibilidad a aberraciones de menor tamao y a deteccin de roturas que pasaran desapercibidas en FISH. "Cada tipo de ensayo tiene sus limitaciones. El microarray cromosmico, por ejemplo, tiene problemas para detectar anomalas equilibradas, en las que un segmento perdido en su posicin habitual se ha insertado en algn locus diferente. Esto ilustra el hecho de que las tecnologas de microarrays no resuelven un diagnstico por s solas, sino que complementan y enriquecen la batera de tcnicas disponibles habitualmente", ha subrayado. Feliciano Ramos, presidente Sociedad Espaola de Gentica Humana, ha coincidido en sealar que los test que ms se utilizan en

JAUME COSIALLS

Manel Martnez, consejero delegado de la compaa dedicada al diagnstico gentico Gendiag.

la actualidad "tienen ciertos aos de recorrido". No obstante, ha puntualizado que "la validez de algunos de ellos est en cuestin, especialmente los de las compaas que realizan diagnsticos por internet". Como ha recordado, "la mayora de estudios genticos utilizan tcnicas validadas. Los microarrays nos estn dando respuesta en un 20 por ciento de pacientes; es un barrido del genoma a una escala no muy fina y que tambin tiene sus indicaciones, con resultados bastante satisfactorios. Tambin se est incorporando la secuenciacin masiva del genoma y del exoma, con dificultades de interpretacin por la cantidad de datos que proporciona. Pero, en diagnstico gentico, debe recalcarse que es imprescindible siempre un asesoramiento gentico antes y despus del estudio y que debe realizarlo un profesional preparado".

Empresas de vanguardia
Gendiag, Sistemas Genmicos y Roche Diagnostics son algunas de las empresas punteras en este campo. La primera ha desarrollado y est comercializando, a travs de Ferrer inCode, diversos diagnsticos, como Cardio inCode -que puede ayudar a disminuir infartos de miocardio en la poblacin con riesgo intermedio- o SudD in Code -que ayuda al diagnstico de la muerte sbita cardiaca-. Segn Manel Martnez, consejero delegado de Gendiag, "la calidad se debe obtener durante el desarrollo, llevando a cabo las necesarias validaciones analticas y clnicas. En cuanto al manejo de la informacin, necesitamos la intervencin de bioinformticos que la hagan asequible al clnico mediante programas y algoritmos", ha subrayado. Sistemas Genmicos centra sus esfuerzos en diferentes campos, como el diagnstico de enfermedades cardiovasculares con CardioGeneprofile, un modelo de anlisis altamente innovador basado en resecuenciacin masiva dirigida. Roche Diagnostics es experta en PCR en tiempo real, que permite detectar diferentes alelos y mutaciones. Sus sistemas estn enfocados a la medicina personalizada y se usan en la prctica clnica diaria desde hace bastantes aos.

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