¿De dónde salen los 38 ATPs que derivan del metabolismo de una molécula de

glucosa? - Miguel Ferrá Rotger

Esta es una de las cuestiones que, tras un curso de introducción al metabolismo,

se nos plantea para explicar de forma simple y convincente.

La forma tradicional consiste en un recuento y enumeración de todas las fuentes

de ATP/GTP en la fosforilación a nivel de substrato (así como cuanto ATP deriva del
NADH+ y FADH+ en la fosforilación oxidativa).

NADH2 FADH2 ATP

Proceso / Unidades en Moles
(Por Glucosa) (Por Glucosa) (Por Glucosa)
Glucólisis 2 2
Descarboxilación oxidativa 2
Ciclo de Krebs 6 2 2
Fosforilación oxidativa -10 -2 30 + 4
Totales 38
Igualmente podríamos llevar el recuento de cuantos moles se crean (o se
destruyen) de los principales intermediarios en este complejo proceso (CO2, Acetil-CoA o
moléculas de agua, etc.). Por ejemplo resulta fácil poner en evidencia como a partir de
una Glucosa se liberarán 6 moléculas de dióxido de carbono…

Intentemos otra estrategia:

Vamos a considerar las concentraciones del conjunto de moléculas implicadas

como las coordenadas de un vector.

El espacio de fases (o espacio vectorial) en nuestro ejemplo poseerá 7 dimensiones

que corresponderán a las moléculas siguientes:

Glucosa (Glu)
Ácido Pirúvico (Pir)
Acetil Coenzima A (Aco)
Dióxido de Carbono (CO2)
Coenzima NAD Reducido (NAD)
Coenzima FAD Reducido (FAD)
Adenosín Trifosfato y Guanosin Trifosfato (ricos en energía) (ATP)

Recordemos que una matriz en un operador matemático capaz de “transformar”

un vector en otro, del mismo espacio, modificando sus coordenadas de acuerdo con un
patrón determinado.

Por ejemplo, en un espacio bidimensional, la matriz  cos a − sin a 

aplica una rotación de ángulo a al vector V; particularicemos  
ahora la matriz y el vector:  sin a cos a 
Sean a = 90º y V = (2,3)
 La trasformación del vector V en V’, tras realizar la rotación de 90º, se indica en
notación matricial como el producto:

 0 − 1  2   − 3
    =  
1 0   3  2 

3
Observemos que en la
2 ,5
matriz la disposición de filas y
2
columnas presenta una distribución
1,5 cuadrada e igual al número de
v
1 dimensiones a tratar, en cambio el
v' vector, en notación matricial, se
0 ,5
escribe como una matriz de una sola
0
-4 -3, -3 -2, -2 -1,5 -1 -0, 0 0,5 1 1,5 2 2,5 3 3,5 4
columna con tantas filas como
5 5 -50 ,5 dimensiones.
-1

- 1,5

-2

- 2 ,5
Intentando aplicar esta
-3 herramienta matemática a nuestro
propósito, diseñamos la matriz de
manera que lleve a cabo la transformación del vector concentraciones en la forma
adecuada al esquema bioquímico que deseamos modelizar.

Reactivos Iniciales (Columna) que

van a desaparecer y convertirse
en reactivos finales (Fila)
Glucosa ATP
Reactivos finales
que van a Glucosa 0 0
formarse a partir
de los reactivos
Iniciales.
ATP 38 1

En forma matricial y partiendo de un mol de Glucosa:

 0 0 1 0
    =  
 38 1   0  38 
Comprobamos el resultado previsto mediante el producto matricial (“Para este
viaje no hacían falta alforjas”), pero sobre todo evidenciamos que cada celda de la matriz
equivale a la cantidad de producto final (indicado por la fila a la que pertenece dicha
celda) que se formase a partir de una unidad de producto inicial (indicado por la columna a
la que pertenece la celda en tratamiento).

Vamos ahora a ensayar un diseño más complejo, en el que se recogen los

principales intermediarios y productos finales del metabolismo de los glúcidos.

Reactivos Iniciales (Columna) que van a desaparecer y

convertirse en reactivos finales (Fila)
GLU API ACA C02 NAD FAD ATP
GLU 0 0 0 0 0 0 0
Reactivos
finales
API 2 0 0 0 0 0 0
que van a ACA 0 1 0 0 0 0 0
formarse
a partir
C02 0 1 2 1 0 0 0
de los NAD 2 1 3 0 0 0 0
reactivos
Iniciales. FAD 0 0 1 0 0 0 0
ATP 2 0 1 0 2 2 1
El valor 1 de la Celda ATP/ATP o CO2/CO2 (situado en la diagonal principal)
permitirá el acarreo de los valores calculados en procesos anteriores.

FASE 1. Glucólisis: en este proceso la Glucosa es metabolizada en 2 moles de

ácido Pirúvico, produciéndose además dos
0 0 0 0 0 0 0   1   0   Glu moles de NADH+ y dos moles de ATP.
     
2 0 0 0 0 0 0   0   2   Api
0 1 0 0 0 0 0   0   0   Aca
      
0 1 2 1 0 0 0  *  0  =  0  →  CO 2
2 1 3 0 0 0 0   0   2   NAD
 
0 0 1 0 0 0 0   0   0   FAD
      
2 0 1 0 3 2 1   0   2   ATP

FASE 2. Descarboxilación oxidativa del piruvato: se producen 2 moles de

Acetil_CoA, dos moles de dióxido de carbono y
0 0 0 0 0 0 0   0   0   Glu 2 moles de NADH+.
     
2 0 0 0 0 0 0   2   0   Api
0 1 0 0 0 0 0   0   2   Aca Por su parte los dos moles de NADH+
       producidos en el proceso anterior son
0 1 2 1 0 0 0  *  0  =  2  →  CO 2 trasformados en el proceso de fosforilación
2
 1 3 0 0 0 0   2   2   NAD oxidativa de la cadena respiratoria en 6 moles

0 0 1 0 0 0 0   0   0   FAD de ATP que, junto con los dos moles que ya
       existían, se convierten en los 8 moles
2 0 1 0 3 2 1   2   8   ATP
resultantes.
 FASE 3. Ciclo de Krebs: Cada molécula de Acetil-CoA es totalmente oxidada a
dióxido de carbono (4 moles que junto con
0 0 0 0 0 0 0   0   0   Glu los 2 moles procedentes de la
       descarboxilación oxidativa del piruvato
2 0 0 0 0 0 0   0   0   Api
0 suman los 6 moles de dióxido de carbono
1 0 0 0 0 0   2   0   Aca finales)
       produciéndose de nuevo más
0 1 = →
2 1 0 0 0   2   6   CO 2 coenzimas redox NADH+ y FADH+.
*
2 1 3 0 0 0 0   2   6   NAD El ATP remanente de procesos
  anteriores se acumula al GTP (que hemos
0 0 1 0 0 0 0   0   2   FAD
       considerado equivalente a ATP) de este
2 0 1 0 3 2 1   8  16   ATP proceso.

FASE 4. Fosforilación oxidativa de los coenzimas redox resultantes de procesos

anteriores hasta su completa
 0 0 0 0 0 0 0   0   0   Glu transformación en ATP, en la cadena
      
 2 0 0 0 0 0 0   0   0   Api respiratoria.
 0 1 0 0 0 0 0   0   0   Aca
       Hemos considerado una tasa de
 0 1 2 1 0 0 0  *  6  =  6  →  CO 2 conversión de 3 ATP/NADH+ y de 2
 2 1 3 0 0 0 0   6   0   NAD
       ATP/FADH+ de acuerdo con los valores
 0 0 1 0 0 0 0   2   0   FAD generalmente aceptados, aun conociendo
       que dichas relaciones pueden fluctuar hacia
 2 0 1 0 3 2 1  16   38   ATP valores más bajos a consecuencia de que la
producción de ATP vía proceso ATP-Sintasa no sigue una estequiometría constante, a
diferencia del ATP generado por reacciones acoplada a nivel de substrato (glucólisis,
ciclo de Krebs)

Es fácil diseñar matrices de conversión

entre grupos más amplios de moléculas, en
las que se incluya el metabolismo de uno o
varios ácidos grasos.

Proponemos una matriz en las que

orlando los reactivos del ejemplo anterior
incluyamos

Tri-palmitato de Glicerina (TPG)

Tri-estearato de Glicerina (TEG)
Ácido Palmítico (APa)
Ácido Esteárico (AEs)
Glicerina (Gli), O2, etc..

Será interesante multiplicar dicha

matriz por un vector inicial V en el que se
combinen más de un substrato de partida,
por ejemplo una mezcla de azúcares y grasas,
más próxima a una dieta real.

La cuestión queda abierta ¿se anima? El sistema ATP-Sintasa mitocondrial