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EN LA ACTUALIDAD COMO FUNCIONAN LAS MACROMOLECULAS.

El LANEM es un laboratorio especializado, nico en su tipo en nuestro pas, para llevar a cabo estudios estructurales y funcionales de diversas macromolculas. El laboratorio utiliza tcnicas modernas de resonancia magntica nuclear y difraccin de rayos X para conocer la estructura tridimensional de macromolculas biolgicas, as como de complejos protena-protena y protena ligando. El LANEM cuenta con dos unidades, una de cristalografa de macromolculas ubicado en el Instituto de Qumica de la Universidad Nacional Autnoma de Mxico y uno de resonancia magntica nuclear, que se ubica en el Centro de Investigaciones Qumicas de la Universidad Autnoma del Estado de Morelos. Ambas tcnicas son complementarias y permiten determinar la estructura tridimensional de protenas, que es til en el diseo de medicamentos, en la ingeniera de protenas, en estudios sobre oligomerizacin, entre otros. Tambin permiten realizar estudios de interaccin y dinmica de protenas de inters farmacolgico, biomdico y biotecnolgico.

Cristalografa de protenas

La cristalografa de protenas es en la actualidad la tcnica ms desarrollada y poderosa para determinar la estructura de macromolculas a nivel atmico. El impacto que ha tenido el conocimiento detallado de las estructuras de protenas y cidos nucleicos en diversas disciplinas ha sido muy significativo en las ltimas dcadas y promete ser de gran relevancia en las que estn por venir. El contar con diversas estructuras de una macromolcula, ya sea en forma individual o en complejo con otras macromolculas o con ligandos especficos, es de gran importancia, tanto en el diseo como en el desarrollo de compuestos con valor farmacolgico. El Laboratorio de Estructura de Protenas, que forma parte del LANEM, cuenta con una importante tradicin en este campo.

Algunas macromolculas se forman naturalmente y adems son, literalmente, vitales como polisacridos almidn y celulosa, que proporcionan alimento vestuario y techo; las protenas que forman parte importante del cuerpo animal, lo mantiene armado y lo hace funcionar, y los cidos nuclicos, que controlan la herencia a nivel molecular. En la actualidad es fundamental el estudio de las sustancias llamadas las macromolculas son molculas que tienen una masa molecular elevada, formadas por un gran nmero de tomos. Generalmente se pueden describir como la repeticin de una o unas pocas unidades mnimas o monmeros, formando los polmeros. Pueden ser lineales o ramificadas.

A menudo el trmino macromolcula se refiere a las molculas que pesan ms de 10.000 dalton de masa atmica. Pueden ser tanto naturales como sintticas, y algunas de gran relevancia se encuentran en el campo de la qumica.

La estructura primaria: es la secuencia de subunidades ( monmeros ) que la forman. La estructura secundaria: hace referencia a la configuracin que adquiere la cadena principal de la macromolcula. La estructura terciaria es el plegamiento general que adquiere la macromolcula en el espacio. La estructura cuaternaria hace referencia a la posible asociacin de ms de una molcula del polmero para formar agregados oligomricos (dmeros, octmeros, etc.). Las macromolculas naturales En la actualidad es fundamental el estudio de las sustancias qumicas ll amadas macromolculas por su gran tamao y peso. Se conocen 2 tipos las naturales y las sintticas y las naturales. Dentro de las naturales se encuentran los carbohidratos, lpidos y las protenas I. Carbohidratos (glucidos)

Son moleculas organicas compuestas por carbono, hidrogeno y oxigeno. Son solubles en agua y se clasifican de acuerdo a la cantidad de carbonos o por el grupo funcional aldehdo El trmino "hidrato de carbono" o "carbohidrato" es poco apropiado, ya que estas molculas no son tomos de carbono hidratados, es decir, enlazados a molculas de agua, sino que constan de tomos de carbono unidos a otrosgrupos funcionales Los glcidos son compuestos formados en su mayor parte por tomos de carbono e hidrgeno y en una menor cantidad de oxgeno. Los glcidos tienen enlaces qumicos difciles de romper llamados covalentes, mismos que poseen gran cantidad de energa, que es liberada al romperse estos enlaces. Una parte de esta energa es aprovechada por el organismo consumidor, y otra parte es almacenada en el organismo. Actualmente son derivados de polihidroxialdehido. Un azcar que contiene un grupo aldehidico se llama aldosa y uno que contiene un grupo cetnico se llama cetosa En la naturaleza se encuentran en los seres vivos, formando parte de biomolculas aisladas o asociadas a otras como las protenas y los lpidos. Tipos de carbohidratos 1. Monosacridos: los glcidos ms simples, los monosacridos, estn formados por una sola molcula; no pueden ser hidrolizados a glcidos ms pequeos. La frmula qumica general de un monosacridos no modificado es (ch2o)n, donde n es cualquier nmero igual o mayor a tres, su lmite es de 7 carbonos. EJEMPLOS: ALDOSAS:GLICERALDEHIDO CETOSAS:DIHIDROXIETANO ALDOSAS: ARABINOSA XILOSA RIBOSA CETOSAS:FRUCTOSAS

Se clacifican en : Triosas: las triosas son monosacridos formados por una cadena de tres tomos de carbono. Su frmula emprica es c3h6o3. Como en los dems monosacridos, en las triosas aparecen los grupos cetona y aldehdo, tambin llamados genricamente grupos funcionales carbonilolas triosas tienen gran importancia en el metabolismo de los hidratos de carbono y de la respiracin.

Las pentosas son monosacridos(glcidos simples) formados por una cadena de cinco tomos de carbono. Como en los dems monosacridos aparecen en su estructura grupos hidroxilo (oh). Adems, tambin pueden llevar grupos cetnicos oaldehdicos. La frmula general de las pentosas es c5h1005.

2. Disacarido: los disacridos son un tipo dehidratos de carbono, (tambien llamados como glcidos o carbohidratos) , formados por la condensacin (unin) de dos azucaresmonosacridos iguales o distintos mediante enlace o-glucosdico (con prdida de una molcula de agua), mono o dicarbonlico EJEMPLOS: GLUCOSA+FRUCTOSA GLUCOSA+GLUCOSA GLUCOSA+GALACTOSA Se clacifican en Sacarosa: la sacarosa o azcar comn es un disacrido formado por alfa-glucopiranosa y betafructofuranosa.la sacarosa se usa en los alimentos por su poder endulzante. Al llegar al estmago sufre una hidrlisis cida y una parte se desdobla en sus componentes glucosa y fructosa.

MALTOSA: es un disacrido formado por dos glucosas unidas por un enlace glucosdico producido entre el oxigeno del primer carbono anomrico (proveniente de -OH) de una glucosa y el oxgeno perteneciente al cuarto carbono de la otra so formula es C12H22O11 LACTOSA: es un disacrido formado por la unin de una molcula de glucosa y otra degalactosa. Concretamente intervienen una -galactopiranosa y una -glucopiranosa unidas por los carbonos 1 y 4 respectivamente

3. Polisacridos: Los polisacridos sonbiomolculas formadas por la unin de una gran cantidad de monosacridos.Se encuadran entre los glcidos, y cumplen funciones diversas, sobre todo de reservas energticas y estructurales. Los polisacridos son polmeros, cuyosmonmeros constituyentes sonmonosacridos, los cuales se unen repetitivamente mediante enlaces glucosdicos. Estos compuestos llegan a tener un peso molecular muy elevado,

que depende del nmero de residuos o unidades de monosacridos que participen en su estructura Principales polisacridos: Almidn Glucgeno Celulosa Quitina Tipos de polisacridos: Hexosanos: Las hexosas sonmonosacridos (glcidos simples) formados por una cadena de seis tomos de carbono. Su frmula general es C6H12O6. Su principal funcin es producir energa. Un gramo de cualquier hexosa produce unas 4 kilocaloras de energa.

GLUCOSAS: La glucosa es unmonosacridos con frmula molecularc6h12o6, la misma que la fructosa pero con diferente posicin relativa de los grupos -OH y O=. Es una hexosa, es decir, que contiene 6 tomos de carbono, y es una aldosa, esto es, el grupo carbonilo est en el extremo de la molcula. Es una forma de azcar que se encuentra libre en las frutas y en lamiel.

4. MUCOPOLISACARIDOS: son cadenas largas y no ramificadas de heteropolisacridos, compuestas generalmente por una unidad repetitiva de disacrido con la frmula general (azcar cido amino azcar)n. EJEM: ACIDO HIALURONICO CONDROITINSULFATO HEPARINA

SE CLACIFICA EN: PENTOSA: son monosacridos (glcidos simples) formados por una cadena de cinco tomos decarbono. Como en los dems monosacridos aparecen en su estructura grupos hidroxilo (OH)

LIPIDOS: EL TERMINO LPIDO LO PROPUSO EL BIOQUMICA BLOOR, SON UN CONJUNTO DE MOLCULAS ORGNICAS, LA MAYORA BIOMOLCULAS, COMPUESTAS PRINCIPALMENTE POR CARBONO EHIDRGENO Y EN MENOR MEDIDAOXGENO, AUNQUE TAMBIN PUEDEN CONTENER FSFORO, AZUFRE Y NITROGENO. EN EL USO COLOQUIAL, A LOS LPIDOS SE LES LLAMA GRASAS, YA QUE LAS GRASAS SON SLO UN TIPO DE LPIDOS PROCEDENTES DE ANIMALES. LOS LPIDOS CUMPLEN FUNCIONES DIVERSAS EN LOS ORGANISMOS VIVIENTES, ENTRE

ELLAS LA DE RESERVA ENERGTICA (TRIGLICRIDOS), LA ESTRUCTURAL (FOSFOLPIDOS DE LAS BICAPAS) Y LA REGULADORA (ESTEROIDES). Y SE DIVIDEN EN: LPIDOS SIMPLES: LPIDOS QUE SLO CONTIENEN CARBONO, HIDRGENO Y OXGENO. ESTAS REACCIONES PRESENTAN UN MAYOR GRADO DE COMPLEJIDAD, DEBIDO A QUE LOS LPIDOS SIMPLES SON COMPUESTOS QUE PRESENTAN VARIOSGRUPOS FUNCIONALES, LOS LPIDOS SIMPLES SON ABUNDANTES EN LAS PLANTAS Y ANIMALES LPIDOS CONMPUESTOS: LOS FOSFOLPIDOSSON UN TIPO DE LPIDOS COMPUESTOS COMPUESTOS POR UNA MOLCULA DEGLICEROL, A LA QUE SE UNEN DOS CIDOS GRASOS Y UN GRUPO FOSFATO. EL FOSFATO SE UNE MEDIANTE UN ENLACE FOSFODISTER A OTRO GRUPO DE TOMOS, QUE FRECUENTEMENTE CONTIENENNITRGENO, COMO COLINA, SERINA OETANOLAMINA LIPIDOS DERVADIOS: LOS ESFINGOLPIDOS O ESFINGOFOSFOLPIDOS SON LPIDOSCOMPLEJOS QUE DERIVAN DEL ALCOHOLINSATURADO DE 18 CARBONOSESFINGOSINA; LA ESFINGOSINA SE HALLA UNIDA A UN CIDO GRASO DE CADENA LARGA MEDIANTE UN ENLACE AMIDA FORMANDO LACERAMIDA. SON UNA CLASE IMPORTANTE DE LPIDOS DE LAS MEMBRANAS CELULARES DEANIMALES Y VEGETALES Y SON LOS MS ABUNDANTES EN LOS TEJIDOS DE LOS ORGANISMOS MS COMPLEJOS

LIPIDOS LIPIDOS SIMPLES

FOSFOLIPIDOS

ESFINGOLIPIDOS

FUENTES ACEITES VEGETALES ESTERES DE ACIDOS GRASOS DE GLICEROL CERAS DE FRUTAS ESTEROIDES LECITINAS CEFALINAS FOSFATIDILSERINAS LOCALIZADOS EN EL TEJIDO CEREBRAL ESFINGOMIENALINAS

LAS GRASAS PROPORCIANAN ENERGIA , SON FUNDAMENTALES PARA LA FORMACION DE ALGUNAS HORMONAS Y MANTIENEN LA ACTIVIDAD DEL SISTEMA NERVIOSO.LOS LIPIDOS SON GRASAS QUE SE PRESENTAN 2 PROCESOS QUIMICOS : LA HIDRLISIS Y LA SAPONIFICACION LA SAPONIFICACION: ES UNA REACCIN QUMICA ENTRE UN CIDO GRASO (O UNLPIDO SAPONIFICABLE, PORTADOR DE RESIDUOS DE CIDOS GRASOS) Y UNA BASE O ALCALINO,. SE USA PARA HACER JABONES LA HIDRLISIS: UNA REACCIN CIDO-BASEENTRE UNA SUSTANCIA, TPICAMENTE UNASAL, Y EL AGUA.[1] ESTA REACCIN ES IMPORTANTE POR EL GRAN NMERO DE CONTEXTOS EN LOS QUE EL AGUA ACTA COMO DISOLVENTE. TAMBIN SE APLICA A ALGUNAS REACCIONES CIDO-BASE EN LAS QUE PARTICIPA EL AGUA Y SE ROMPE UNENLACE COVALENTE, COMO SE ILUSTRA EN LA FIGURA.

Protena
Estructura tridimensional de la hemoglobina. La animacin corresponde a la transicin conformacional entre las formas oxigenada y desoxigenada. Las protenas son biomolculas formadas por cadenas lineales de aminocidos. El nombre protena proviene de la palabra griega ("proteios"), que significa "primario" o del diosproteo, por la cantidad de formas que pueden tomar. Las protenas desempean un papel fundamental para la vida y son las biomolculas ms verstiles y ms diversas. Son imprescindibles para el crecimiento del organismo. Realizan una enorme cantidad de funciones diferentes, entre las que destacan:

Estructural. sta es la funcin ms importante de una protena Inmunolgica (anticuerpos), Enzimtica (sacarosa y pepsina), Contrctil (actina y miosina). Homeosttica: colaboran en el mantenimiento del ph, Transduccin de seales (rodesiana) Protectora o defensiva (trombina yfibringeno)

Las protenas estn formadas por aminocidos. Las protenas de todos los seres vivos estn determinadas mayoritariamente por su gentica(con excepcin de algunos pptidos antimicrobianos de sntesis no ribosoma), es decir, la informacin gentica determina en gran medida qu protenas tiene una clula, un tejidoy un organismo. Las protenas se sintetizan dependiendo de cmo se encuentren regulados los genes que las codifican. Por lo tanto, son susceptibles a seales o factores externos. El conjunto de las protenas expresadas en una circunstancia determinada es denominado proteasa.. Caractersticas Los prtidos o protenas son biopolmeros, es decir, estn formadas por gran nmero de unidades estructurales simples repetitivas (monmeros). Debido a su gran tamao, cuando estas molculas se dispersan en un disolventeadecuado, forman siempre dispersiones coloidales, con caractersticas que las diferencian de las disoluciones de molculas ms pequeas. Por hidrlisis, las molculas de protena se dividen en numerosos compuestos relativamente simples, de masa molecular pequea, que son las unidades fundamentales constituyentes de lamacromolcula. Estas unidades son losaminocidos, de los cuales existen veinteespecies diferentes y que se unen entre s mediante enlaces peptdicos. Cientos y miles de estos aminocidos pueden participar en la formacin de la gran molcula polimrica de una protena. Todas las protenas tienen carbono, hidrgeno,oxgeno y nitrgeno, y casi todas poseen tambin azufre. Si bien hay ligeras variaciones en diferentes protenas, el contenido de nitrgenorepresenta, por trmino medio, 16% de la masa total de la molcula; es decir, cada 6,25 g de protena contienen 1 g de N. El factor 6,25 se utiliza para estimar la cantidad de protena

existente en una muestra a partir de la medicin de N de la misma. La sntesis proteica es un proceso complejo cumplido por las clulas segn las directrices de la informacin suministrada por los genes. Las protenas son largas cadenas de aminocidos unidas por enlaces peptdicos entre el grupo carboxilo (-COOH) y el grupo amino (-NH2) de residuos de aminocido adyacentes. La secuencia de aminocidos en una protena est codificada en su gen (una porcin de ADN) mediante el cdigo gentico. Aunque este cdigo gentico especifica los 20 aminocidos "estndar" ms la selenocistena y en ciertosarchaea la pirrolisina, los residuos en una protena sufren a veces modificaciones qumicas en la modificacin postraduccional: antes de que la protena sea funcional en la clula, o como parte de mecanismos de control. Las protenas tambin pueden trabajar juntas para cumplir una funcin particular, a menudo asocindose para formar complejos proteicos estables. Funciones Las protenas ocupan un lugar de mxima importancia entre las molculas constituyentes de los seres vivos (biomolculas). Prcticamente todos los procesos biolgicos dependen de la presencia o la actividad de este tipo de molculas. Bastan algunos ejemplos para dar idea de la variedad y trascendencia de las funciones que desempean. Son protenas:

Casi todas las enzimas, catalizadores de reacciones qumicas en organismos vivientes; Muchas hormonas, reguladores de actividades celulares; La hemoglobina y otras molculas con funciones de transporte en la sangre;

Los anticuerpos, encargados de acciones de defensa natural contra infecciones o agentes patgenos; Los receptores de las clulas, a los cuales se fijan molculas capaces de desencadenar una respuesta determinada; La actina y la misiona, responsables finales del acortamiento del msculodurante la contraccin; El colgeno, integrante de fibras altamente resistentes en tejidos de sostn.

Estructura Artculo principal: Estructura de las protenas Es la manera como se organiza una protena para adquirir cierta forma. Presentan una disposicin caracterstica en condiciones fisiolgicas, pero si se cambian estas condiciones como temperatura, ph, etc. Pierde la conformacin y su funcin, proceso denominado desnaturalizacin. La funcin depende de la conformacin y sta viene determinada por la secuencia de aminocidos. Para el estudio de la estructura es frecuente considerar una divisin en cuatro niveles de organizacin, aunque el cuarto no siempre est presente. Conformaciones o niveles estructurales de la disposicin tridimensional:

Estructura primaria.

Estructura secundaria. Nivel de dominio. Estructura terciaria. Estructura cuaternaria.

A partir del nivel de dominio slo las hay globulares. Propiedades de las protenas Solubilidad: Se mantiene siempre y cuando los enlaces fuertes y dbiles estn presentes. Si se aumenta la temperatura y el ph, se pierde la solubilidad.

Capacidad electroltica: Se determina a travs de la electroforesis, tcnica analtica en la cual si las protenas se trasladan al polo positivo es porque su molcula tiene carga negativa y viceversa.

Especificidad: Cada protena tiene una funcin especfica que est determinada por su estructura primaria. Amortiguador de ph (conocido comoefecto tampn): Actan como amortiguadores de ph debido a su carcter anftero, es decir, pueden comportarse como cidos (donando electrones) o como bases (aceptando electrones).

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