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Aminocido
Un aminocido es una molcula orgnica con un grupo amino (-NH2) y un grupo carboxilo (-COOH). Los aminocidos ms frecuentes y de mayor inters son aquellos que forman parte de las protenas. Dos aminocidos se combinan en una reaccin de condensacin entre el grupo amino de uno y el carboxilo del otro, liberndose una molcula de agua y formando un enlace amida que se denomina enlace peptdico; estos dos "residuos" de aminocido forman un dipptido. Si se une un tercer aminocido se forma un tripptido y as, sucesivamente, hasta formar un polipptido. Esta reaccin tiene lugar de manera natural dentro de las clulas, en los ribosomas. Todos los aminocidos componentes de las protenas son L-alfa-aminocidos. Esto significa que el grupo amino est unido al carbono contiguo al grupo carboxilo (carbono alfa) o, dicho de otro modo, que tanto el carboxilo como el amino estn unidos al mismo carbono; adems, a este carbono alfa se unen un hidrgeno y una cadena (habitualmente denominada cadena lateral o radical R) de estructura variable, que determina la identidad y las propiedades de cada uno de los diferentes aminocidos. Existen cientos de radicales por lo que se conocen cientos de aminocidos diferentes, pero slo 20 (actualmente se consideran 22, los ltimos fueron descubiertos en el ao 2002) forman parte de las protenas y tienen codones especficos en el cdigo gentico. La unin de varios aminocidos da lugar a cadenas llamadas pptidos o polipptidos, que se denominan protenas cuando la cadena polipeptdica supera una cierta longitud (entre 50 y 100 residuos aminocidos, dependiendo de los autores) o la masa molecular total supera las 5000 uma y, especialmente, cuando tienen una estructura tridimensional estable definida.
"R" representa la cadena lateral, especfica para cada aminocido. Tanto el carboxilo como el amino son grupos funcionales susceptibles de ionizacin dependiendo de los cambios de pH, por eso ningn aminocido en disolucin se encuentra realmente en la forma representada en la figura, sino que se encuentra ionizado.
Aminocido
A pH bajo (cido), los aminocidos se encuentran mayoritariamente en su forma catinica (con carga positiva), mientras que a pH alto (bsico) se encuentran en su forma aninica (con carga negativa). Para valores de pH intermedios, como los propios de los medios biolgicos, los aminocidos se encuentran habitualmente en una forma de ion dipolar o zwitterin (con un grupo catinico y otro aninico).
Clasificacin
Existen muchas formas de clasificar los aminocidos; las dos que se presentan a continuacin son las ms comunes.
Con carga negativa o cidos: cido asprtico (Asp, D) y cido glutmico (Glu, E). Con carga positiva o bsicos: lisina (Lys, K), arginina (Arg, R) e histidina (His, H). Aromticos: fenilalanina (Phe, F), tirosina (Tyr, Y) y triptfano (Trp, W) (ya incluidos en los grupos neutros polares y neutros no polares).
Aminocido
Segn su obtencin
A los aminocidos que deben ser captados como parte de los alimentos se los llama esenciales; la carencia de estos aminocidos en la dieta limita el desarrollo del organismo, ya que no es posible reponer las clulas de los tejidos que mueren o crear tejidos nuevos, en el caso del crecimiento. Para el ser humano, los aminocidos esenciales son: Valina (Val, V) Leucina (Leu, L) Treonina (Thr, T) Lisina (Lys, K) Triptfano (Trp, W) Histidina (His, H) * Fenilalanina (Phe, F) Isoleucina (Ile, I) Arginina (Arg, R) * Metionina (Met, M)
A los aminocidos que pueden sintetizarse en el propio organismo se los conoce como no esenciales y son: Alanina (Ala, A) Prolina (Pro, P) Glicina (Gly, G) Serina (Ser, S) Cistena (Cys, C) ** Asparagina (Asn, N) Glutamina (Gln, Q) Tirosina (Tyr, Y) ** cido asprtico (Asp, D) cido glutmico (Glu, E)
Estas clasificaciones varan segn la especie e incluso, para algunos aminocidos, segn los autores. Se han aislado cepas de bacterias con requerimientos diferenciales de cada tipo de aminocido.
Aminocido
Aminocidos modificados
Las modificaciones postraduccionales de los 20 aminocidos codificados genticamente conducen a la formacin de 100 o ms derivados de los aminocidos. Las modificaciones de los aminocidos juegan con frecuencia un papel de gran importancia en la correcta funcionalidad de una protena. Son numerosos los ejemplos de modificacin postraduccional de aminocidos. La formacin de puentes disulfuro, claves en la estabilizacin de la estructura terciaria de las protenas, est catalizada por una disulfuro isomerasa. En las histonas tiene lugar la metilacin de las lisinas. En el colgeno abunda el aminocido 4-hidroxiprolina, que es el resultado de la hidroxilacin de la prolina. La metionina inicial de todos los polipptidos (codificada por el codn de inicio AUG) casi siempre se elimina por protelisis.[4] Algunos aminocidos no proteicos tienen funcin propia, por ejemplo como neurotransmisores o vitaminas. Por ejemplo, la beta-alanina o el cido gamma-aminobutrico (GABA). Existen muchos aminocidos no proteicos que juegan papeles distintos en la naturaleza y pueden o no provenir de aminocidos. Ejemplos de estos aminocidos no protenicos son: Sarcosina Etilglicina o cido -aminobutrico (AABA) cido djenclico Hipoglicinas A y B Mimosina Aliina Canalina Canavalina Ornitina Homometionina Homoserina Homoarginina Homofenilalanina Homocistena Homoleucina Cistationina Norvalina Norleucina Ciclopentenilglicina -Alanina cido gamma-aminobutrico cido ibotnico
Aminocido Taurina cido trans-2-amino-5-cloro-4-hexenoico cido trans-2-amino-5-cloro-6-hidroxi-4-hexenoico cido 2-amino-4-cloro-4-pentenoico cido diaminopimlico Semialdehdo asprtico Semialdehdo glutmico Citrulina DOPA Quinurenina Nicotianina cido 2-azetidincarboxlico -(4-hidroxibenzotiazol-6-il)alanina -(2-metil-4-hidroxibenzotiazol-6-il)-alanina Indospicina N-(indol-3-acetil)lisina (p-hidroximetil)fenilalanina 0-etil-L-homoserina, aislada de Corynebacterium ethanolaminophilum 5-Hidroxitriptfano cido licoprdico, aislado de Lycoperdon perlatum cido lentnico cido estizolobnico cido estizolbico Tiroxina Azoxibacilina
Propiedades
cido-bsicas. Se refiere al comportamiento de cualquier aminocido cuando se ioniza. Cualquier aminocido puede comportarse como cido y como base, por lo que se denominan sustancias anfteras. Cuando una molcula presenta carga neta cero est en su punto isoelctrico. Si un aminocido tiene un punto isoelctrico de 6,1 su carga neta ser cero cuando el pH sea 6,1. Los aminocidos y las protenas se comportan como sustancias tampn. pticas. Todos los aminocidos excepto la glicina tienen 4 sustityentes distintos sobre su carbono alfa (carbono asimtrico o quiral), lo que les confiere actividad ptica; esto es, sus disoluciones desvan el plano de polarizacin cuando un rayo de luz polarizada las atraviesa. Si el desvo del plano de polarizacin es hacia la derecha (en sentido horario), el compuesto se denomina dextrgiro, mientras que si se desva a la izquierda (sentido antihorario) se denomina levgiro. Un aminocido puede en principio existir en sus dos formas enantiomricas (una dextrgira y otra levgira), pero en la naturaleza lo habitual es encontrar slo una de ellas. Estructuralmente, las dos posibles formas enantiomricas de cada aminocido se denominan configuracin D o L dependiendo de la orientacin relativa en el espacio de los 4 grupos distintos unidos al carbono alfa. Todos los aminoacidos proteicos son L-aminocidos, pero ello no significa que sean levgiros. Se consideran L-aminocidos los que estructuralmente derivan de L-gliceraldehdo y D-aminocidos los derivados del D-gliceraldehdo.
Aminocido Qumicas. Las que afectan al grupo carboxilo, como la descarboxilacin. Las que afectan al grupo amino, como la desaminacin. Las que afectan al grupo R o cadena lateral. Solubilidad. No todos los aminocidos son solubles en agua debido a la diferente naturaleza de su cadena lateral, por ejemplo si sta es ionizable el aminocido ser ms soluble.
Referencias
[1] 22nd amino acid reflects genetic versatility. University of Utah geneticists write Science commentary on discovery (http:/ / www. unews. utah. edu/ releases/ 02/ may/ amino. html), Universidad de Utah (en ingls) [2] Un nuevo aminocido natural llamado pirrolisina (http:/ / ciencia15. blogalia. com/ historias/ 1245), Ciencia15 [3] Sntesis proteica (http:/ / web. archive. org/ web/ http:/ / fai. unne. edu. ar/ biologia/ adn/ adntema2. htm), Facultad de Agroindustrias de la Universidad Nacional del Nordeste. [4] Devlin, T. M. 2004. Bioqumica, 4 edicin. Revert, Barcelona. ISBN 84-291-7208-4
Bibliografa
Rodrguez-Sotres, Rogelio. La estructura de las protenas Lehninger, 2000. Principios de bioqumica, Omega, Barcelona Pato Pino, 2008. Bioqumica II, Alfa, Buenos Aires Raymond Chang, 2007. Qumica
Enlaces externos
Wikcionario tiene definiciones para aminocido.Wikcionario Wikimedia Commons alberga contenido multimedia sobre AminocidoCommons. Estructura de las protenas (http://web.archive.org/web/http://depa.pquim.unam.mx/proteinas/estructura/ index.html)
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