RESUMEN 4.1.

ESTRUCTURA DE LOS ACIDOS NUCLEICOS

1.- Qu contiene gentico).

el

cido

desoxirribonucleico

(ADN)?

(Material

Contiene informacin para especificar las secuencias de aminonocidos de las protenas, la que se transcribe a varios tipos de cidos ribonucleicos (RNA), incluidos el RNA mensajero (mRNA), el RNA de trasferencia (tRNA) y el RNA ribosmico (rRNA), que intervienen en la sntesis de protenas. 2.- Qu son el DNA y el RNA? Son largos polmeros no ramificados de nucletidos, que constan de una pentosa fosforilada unida a una base orgnica, ya sea una purina o una pirimidina. 3.- Qu encontramos presente tanto en el DNA como en el RNA? Encontramos las purinas adenina (A) y guanina (G) y la pirimidina citosina (C). 4.- La pirimidina timina (T) que encontramos presente en el DNA, por quin es reemplazada en el RNA? La pirimidina timina (T) presente en el DNA es reemplazada por la pirimidina uracilo (U) en el RNA. 5.- Por qu enlaces se encuentran unidos los nucletidos adyacentes en un polinucletido? Estn unidos por enlaces fosfodister. 6.- Qu contiene el DNA natural (DNA B)? Contiene 2 hebras complementarias antiparalelas de polinucletidos enrolladas entre s para formar una doble hlice regular con giro hacia la derecha con las bases en la parte interior y los dos esqueletos azcarfosfato en la parte exterior. 7.- Qu hace que se estabilice la estructura nativa?

El apareamiento de bases entre las hebras y las interacciones hidrfobas entre bases adyacentes en la misma hebra, estabilizan la estructura nativa. 8.- A travs de qu pueden interactuar las bases en los cidos nucleicos? Pueden actuar a travs de los enlaces de hidrgeno. 9.- Cules son los pares de bases de Watson y Crick estndares en el DNA y RNA? Los pares de bases de Watson y Crick estndares son G.C, A.T en el DNA y A.U en el RNA. (ver pgina 108). 10.- Qu estructuras estabiliza en apareamiento de bases? Estabiliza las estructuras tridimensionales nativas de DNA y RNA. 11.- Qu puede deformar la unin de protenas al DNA? La unin de protenas al DNA puede deformar su estructura helicoidal, provocando la torsin o el desenrollamiento local de la molcula de DNA. 12.- Qu efectos causa el calor en las hebras de DNA? El calor hace que las hebras de DNA se separen o desnaturalicen. 13.- Con qu se incrementa la temperatura de fusin Tm del DNA? La temperatura de fusin Tm del DNA se incrementa con el porcentaje de pares de bases G.C. En condiciones apropiadas, las hebras separadas de cidos nucleicos complementarias se renaturalizan. 14.- Cmo pueden estar las molculas circulares de DNA? Pueden estar enrolladas sobre s mismas formando superenrollamientos. 15.- Qu funcin tienen las enzimas topoisomerasas I y II? Pueden aliviar la tensin torsional y eliminar los superenrollamientos de las molculas circulares de DNA. 16.- Qu son los RNA celulares? Son polinucletidos monocatenarios, algunos de los cuales forman estructuras secundarias y terciarias bien definidas.

17.- Qu poseen algunos RNA llamados ribozimas? Poseen actividad cataltica.

RESUMEN 4.2.

TRASCRIPCIN DE GENES CODIFICADORES DE PROTENAS Y FORMACION DE mRNA FUNCIONAL

1.- Por quin es llevada a cabo la transcripcin de DNA? Es llevada a cabo por la RNA polimerasa, que agrega un ribonucletido por vez al extremo 3 de la cadena de RNA en crecimiento. La secuencia de la hebra molde de DNA determina el orden en el cual los ribonucletidos se polimerizan para formar una cadena de RNA. 2.- Qu determina la secuencia de la hebra molde de DNA? Determina el orden en el cual los ribonucletidos se polimerizan para formar una cadena de RNA. 3.- Cul es la funcin de la RNA polimerasa durante la iniciacin de la transcripcin? Durante la iniciacin de la transcripcin, la RNA polimerasa se une a sitios especficos en el DNA (el promotor), disocia localmente el DNA de hebra doble para poner al descubierto la hebra molde desapareada y polimeriza los primeros dos nucletidos. 4.- Qu sucede con la RNA polimerasa durante la elongacin (estiramiento) de la hebra? Durante la elongacin de la hebra, la RNA polimerasa se desplaza a lo largo del DNA, disociando segmentos secuenciales del DNA y agregando nucletidos a la hebra de RNA creciente. 5.- Qu sucede cuando la RNA polimerasa llega a una secuencia de terminacin en el DNA?

Cuando la RNA polimerasa llega a una secuencia de terminacin en el DNA, la enzima detiene la transcripcin lo que da como resultado la liberacin del RNA terminado y la disociacin de la enzima del DNA molde. 6.- Para qu se agrupan los genes codificadores de protenas en el DNA procarionte? En el DNA procarionte, varios genes codificadores de protenas suelen agruparse para formar una regin funcional, un opern que se transcribe a partir de un nico promotor para formar mRNA, que codifica mltiples protenas con funciones relacionadas. 7.- Cundo puede comenzar la traduccin del mRNA bacteriano? Puede comenzar antes de que la sntesis del mRNA haya sido completada. 8.- Cul es la funcin de cada gen codificador de protenas en el DNA eucarionte? En el DNA eucarionte cada gen codificador de protenas se transcribe desde su propio promotor. El transcripto primario inicial muy a menudo contiene regiones no codificantes (intrones) diseminadas entre las regiones codificantes (exones). 9.- Qu significa intrones? Intrones significa que no se expresa. 10.- Qu significa exones? Exones significa que se expresa. 11.- Qu atraviesan los transcriptos primarios de eucarionte? Deben atravesar el procesamiento de RNA para producir RNA funcionales. Durante el procesamiento, los extremos de casi todos los transcriptos primarios de los genes codificadores de protenas se modifican mediante la adicin de un casquete 5 y una cola poli(A) 3. Los transcriptos de los genes que contienen intrones sufren la escisin (ruptura) y eliminacin de intrones y la unin de exones. 12.- Por quines son codificados los dominios individuales de las protenas multidominio presentes en los eucariontes superiores?

A menudo son codificados por exones individuales o por un pequeo nmero de exones. Las distintas isoformas de tales protenas suelen expresarse en tipos celulares especficos como resultado del corte y empalme alternativo de exones.

RESUMEN 4.3. CONTROL DE LA EXPRESIN GNICA EN LOS PROCARIONTES.

1.- Por quin es regulada la expresin gnica tanto en los procariontes como en los eucariontes? Es regulada principalmente por mecanismos que controlan la iniciacin de la transcripcin. 2.- Cul es el primer paso en la iniciacin de la transcripcin en E. coli. El primer paso es la unin de la subunidad en una RNA polimerasa a una regin promotora. 3.- Qu determina la secuencia de nucletidos de un promotor? La secuencia de nucletidos de un promotor determina su fuerza, es decir, cun frecuentemente distintas molculas de RNA polimerasa se pueden unir e iniciar la transcripcin por minuto. 4.- Qu son los represores? Son protenas que se unen a secuencias operadas, que superponen o se ubican adyacentes a los promotores. 5.- Qu inhibe la unin de un represor a un operador? Inhibe la iniciacin de la transcripcin. 6.- Por quin es modulada la actividad de unin al DNA de la mayora de los represores bacterianos? La actividad de unin al DNA de la mayora de los represores bacterianos es modulada por pequeas molculas efectoras (inductoras). Esto le

permite a las clulas bacterianas regulas la transcripcin de genes especficos en respuesta a cambios en la concentracin de diversos nutrientes en el medio. 7.- Por quin estn regulados el opern lac y algunos otros genes bacterianos? Estn regulados por protenas activadoras que se unen a los promotores contiguos e incrementan la frecuencia de iniciacin de la transcripcin por la RNA polimerasa. 8.- Cul es el principal factor sigma en E. coli? Es el (ver pg. 118), pero tambin se encuentran varios otros factores sigma menos abundantes, cada uno de los cuales reconocen diferentes secuencias promotoras consenso 9.- Por quin son reguladas la iniciacin de la transcripcin por todas las RNA polimerasas de E. coli? La iniciacin de la transcripcin por todas las RNA polimerasas de E coli, a excepcin de las que contienen (ver pg.118), pueden ser regulada por represores y activadores que se unen cerca del sitio de inicio de la transcripcin. 10.- Por quin son regulados los genes transcriptos por RNA polimerasas con (ver pg. 119)? Son regulados por activadores que se unen a los amplificadores ubicados a = 100 pares de base corriente arriba desde el sitio de inicio. Cuando el activador y la RNA polimerasa (ver pg.119) interactan, el DNA entre sus sitios de unin forma un bucle (rizo). 11.- Qu acta en los sistemas reguladores de dos componentes? En los sistemas reguladores de dos componentes, una protena acta como un sensor, motorizando el nivel de nutrientes u otros componentes en el ambiente. En condiciones apropiadas, el fosfato (ver pg. 119) de un ATP es transferido primero a una histidina en la protena sensora y luego a un cido asprtico en la segunda protena, el regulador de respuesta. 12.- A qu se une el regulador de respuesta fosforilado?

Se une luego a las secuencias reguladoras del DNA, estimulando o reprimiendo de este modo la transcripcin de genes especficos.

RESUMEN 4.4.

LAS TRES FUNCIONES DEL RNA EN LA TRADUCCIN

1.- Bajo qu forma la informacin gentica es transcripta del DNA al mRNA? Bajo la forma de un cdigo de tripletes degenerados, superpuesto y sin comas. 2.- Por qu est codificado cada aminocido en el mRNA? Cada aminocido est codificado trinucletido (codones) en el mRNA. 3.- Qu especifica cada codn? Cada codn especifica un aminocido, pero la mayora de los aminocidos estn codificados por mltiples codones. 4.- Cul es el codn de inicio ms comn y qu especifica? El codn AUG para la metionina es el codn de inicio ms comn y especifica el aminocido del extremo NH2-terminal de una cadena de protena. 5.- Cules son terminacin? los codones que funcionan como codones de por una o ms secuencias de

Tres codones (UAA,UAG,UGA) funcionan como codones de terminacin y no especifican ningn aminocido. 6.- (Leer punto 4 pg.125) 7.- De qu depende la decodificacin de la secuencia de nucletidos en el mRNA en una secuencia de aminocidos de una protena?

La decodificacin de la secuencia de nucletidos en el mRNA en una secuencia de aminocidos de una protena depende de los tRNA y de las aminoacil-tRNA sintetasas. 8.- Cmo es la estructura de todos los tRNA? Todos los tRNA tienen una estructura tridimensional similar, que incluye un brazo aceptor para la fijacin de un aminocido especfico y un tallo con bucle con una secuencia anticodn de tres bases en el extremo. El anticodn puede aparearse con su correspondiente codn del mRNA. 9.- Con quin puede aparearse un tRNA? Debido a las interacciones no estndares, un tRNA puede aparearse con ms de un codn del mRNA; a la inversa, un codn particular puede tener un apareamiento de bases con mltilples tRNA. Sin embargo, en cada caso, slo el aminocido adecuado es insertado en una cadena polipeptdica creciente. 10.- Qu reconoce cada una de las 20 aminoacil-tRNA sintetasas? Cada una de las 20 aminoacil-tRNA sintetasas reconoce un nico aminocidos y lo une, mediante enlaces covalentes, a un tRNA anlogo, para formar un aminoacil-tRNA. Esta reaccin activa el aminocido para que pueda participar en la formacin de un enlace peptdico. 11.- De cuntas subunidades constan tanto los ribosomas de los procariontes como los de los eucariontes? Constan de una subunidad mayor y una menor. Cada subunidad contiene numerosas protenas diferentes y una molcula principal de rRNA (grande o pequea). La subunidad grande tambin contiene un rRNA 5S accesorio en los procariontes y dos rRNA accesorios en los eucariontes (5S y5,8S en los vertebrados). 12.- Para qu se pliegan los rRNA anlogos de muchas especies diferentes? Se pliegan para formar estructuras tridimensionales que contienen numerosos tallos con bucles y sitios de unin para protenas, mRNA y tRNA. 13.- Con qu se asocian muchas protenas ribosmicas pequeas?

Se asocian con la periferia de los rRNA.