A adoo da bacia hidrogrfica como unidade fundamental para o gerenciamento dos recursos hdricos, a partir da lei 9433 de 1997,

proporciona uma abordagem descentralizada, permitindo a participao dos atores locais no gerenciamento deste recurso. Entretanto suscita alguns problemas tanto de ordem ambiental quanto poltico administrativa. As guas subterrneas, responsveis atualmente pelo abastecimento de vrias reas urbanas dos municpios do Estado de So Paulo, desempenham a importante funo de descarga em cursos de gua superficial (fluxo de base) alimentando rios e lagos, alm de promover manuteno destes durante os perodos de estiagens. Em muitos casos o fluxo de base pode corresponder a totalidade da vazo de um rio durante certos meses do ano. A explorao irracional das guas subterrneas pode, entre outros problemas, provocar a drenagem dos rios em funo do rebaixamento do nvel hidrulico do aqfero. Diante disto surge a questo: como proceder o gerenciamento quando as guas dos rios de uma bacia hidrogrfica apresentam significativa reduo devido explorao dos aqferos exteriores a esta bacia, j que os limites dos aqferos no coincidem necessariamente com os das bacias hidrogrficas? O mesmo questionamento pode ser levantado quando h contaminao do aqfero, o que pode afetar vrias bacias. Outra questo a ser considerada so os conflitos bacia x municpio e municpio x municpio. Como esclarece CHRISTOFIDIS:
A dificuldade que se apresenta a de compatibilizar a sua administrao, uma vez que as bacias hidrogrficas no se constituem em unidades polticoadministrativas, mas sim em reas de superposio de jurisdio em diferentes nveis, possibilitando o surgimento de conflitos. (CHRISTOFIDIS, ano, pg. 21).

Em relao aos rios estaduais (que possuem todo seu curso inserido em um nico estado) no caso em que mais de um municpio divida as reas de sua bacia, teme-se que a algum perca sua soberania frente ao comit ou a outros municpios econmico e politicamente mais expressivo. Tal perda de soberania tambm temida nos casos em que os territrios de um municpio pertenam a mais de uma bacia. No que se refere aos rios federais (que cortam mais de um estado) o temor por parte dos rgos estaduais o mesmo. A legislao destes estados muitas vezes diferente apesar de terem que seguir uma mesma diretriz do governo federal. A proposta para sanar este tipo de situao, feita por LEAL e ROVERE e citada por LUCHINI, SOUZA E PINTO, seria:

Admitir a autonomia dos Estados, ou seja, as iniciativas dentro de cada Estado que no afetem os demais devem ser de responsabilidade dos prprios Estados. Os comits e agncias federais representariam, nesse caso, entidades de compatibilizao entre os Estados e um apoio s suas iniciativas (LEAL E ROVERE citado por LUCHINI, SOUZA e PINTO, ano, pg. 91).

Esta proposio, entretanto esbarraria na definio da bacia hidrogrfica como unidade de gesto prevista na lei 9433/97. Nas reas urbanas, em especial as conurbadas, a adoo da bacia hidrogrfica torna-se mais problemtica devido dificuldade se precisar os limites municipais. Nestas reas torna-se praticamente invivel esta adoo pois os servios de gua e esgoto, demandados por reas vizinhas, podem transcender os limites da bacia. Outra situao problemtica so as dos rios que fazem fronteiras entre o Brasil e outros pases ou que possuem parte da sua drenagem em pases vizinhos, caso da bacia Amaznica. Nesta situao haveria a necessidade de tentar compatibilizar as legislaes para que possa adotar a bacia hidrogrfica como unidade fundamental. Nos casos onde tal compatibilizao seja invivel ser necessrio abordar o gerenciamento dos recursos hdricos de outra maneira. No pretendemos com o exposto acima desconsiderar a importncia e a aplicabilidade do conceito de bacia hidrogrfica. Acreditamos que este seja importante e, em casos onde exista uma unidade econmica e social (entre outros fatores), possvel de ser utilizado como unidade para a gesto dos recursos hdricos. Entretanto, nossa crtica reside na utilizao generalizada do termo, enquanto forma de regionalizao, em um pas com extensa rede hidrogrfica que apresenta configuraes peculiares como o caso do Brasil. Acreditamos que seja importante rever a adoo da bacia hidrogrfica enquanto unidade fundamental para o gerenciamento dos recursos hdricos buscando, quando for necessrio, priorizar as relaes scio-econmicas da rea em questo para se definir uma unidade de gesto mais apropriada. Como exemplo desta forma de abordagem citamos o caso da Finlndia onde foram definidas 19 regies para a gesto deste recurso, sendo algumas bacias hidrogrficas e outras, reas econmicas importantes para aquele pas. Outro pas o qual a legislao hdrica seria importante de ser analisada so os Estados Unidos onde a bacia hidrogrfica no necessariamente a unidade fundamental de gesto, como esclarece BORSOI e TORRES:
Em 1965, foi publicada lei federal voltada para o planejamento dos recursos hdricos e, em acordo com seus dispositivos, todos os estados publicaram normas para o controle de poluio das guas em seus territrios. Segundo essa lei, ao ser definido uma unidade de gesto seja uma regio, uma bacia hidrogrfica ou um grupo de bacias -, pode ser criada uma comisso de bacia,

por proposio do Conselho dos Recursos Hdricos ou dos estados interessados. (BORSOI e TORRES, ano, pg. 8).