4/11/2012

Protenas

Prof.: Matheus de Souza Gomes Disciplina: Bioqumica I

Patos de Minas 2012

Protenas

Contedo
Estrutura Tridimensional de protena
Conformao

Estabilidade de protenas Ligao peptdica Estrutura Secundria de protenas

-hlices Conformao

ngulos de Ligao Estruturas Tercirias

Fibrosas Globulares

Estruturas Quaternrias Desnaturao e enovelamento

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Protenas

Protenas
Nveis

Protenas

Estruturas tridimensionais
Inmeras conformaes possveis Estruturas tridimensionais mais estveis

Conformao
Arranjo espacial dos tomos Conformaes possveis = dinmica mais estveis - dependendo das condies Conformaes funcionais (mais estveis) = protena nativa Estabilidade
Manter na forma nativa Dependente de lig. fracas

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Protenas

Desenovelada X Enovelada
O que faz uma protena permanecer no estado enovelado???
Lig. Fracas intramoleculares principal Resduos hidrofbicos ficam enterrados na molcula Lig de H intramolecular tende a ser maximizado Aumentando a entropia Pontes de sulfeto (quando existentes) Camada de solvatao (arranjo timo das molculas de gua no exterior da molcula) Ligaes de H com gua

Protenas

Ligaes peptdicas
Planar Carter de ligao dupla ngulos (N-C ) e (C -C) podem girar Valores permitidos ngulos impossveis
0 graus e

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Protenas

Valores permitidos
Diagrama de Ramachandran

Protenas

Estrutura secundria
Conformaes locais Tipos:
-hlices Conformao-

-hlices
Arranjo secundrio mais simples Sentido da mo direita 3,6 resduos por volta Lig de H maximizada na estrutura

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Protenas

-hlices
Estabilidade
Bloco de resduos carregados Ex: glutamato Forma e volume de certos resduos Ex: Asn, Thr e Ser aa carregado neg no amino terminal (estabiliza) aa carregado pos no carboxi terminal (estabiliza)

Protenas

Conformao
Conformao estendida da cadeia Ziguezague 2 sentidos Lig de H. Tendncia aa pequenos Ex: alanina e glicina

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Protenas

Estrutura terciria
Arranjo tridimensional Interao entre resduos distantes na estrutura Dois grupos
Fibrosas Globulares

Protenas

Fibrosas
Funes Solubilidade Exemplos -queratinas e colgeno -queratinas
L, chifre, unhas, cabelos, etc Resistncia e proteo Composio: espiral supertorcida mo esquerda

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Colgeno
Colgeno
Tecido conjuntivo e cartilagens Proteo, resistncia e preenchimento

Unidades do colgeno Gly-X-Y

X=Pro e Y=4-Hyp

Mutaes cido ascrbico

Vitamina C Deficincia escorbuto Hidroxilao da prolina Sintomas Tratamento

Protenas

Globulares
Composio compacta Exemplos Mioglobina

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Protenas

Outras globulares

Porcentagens de estruturas secundrias em algumas protenas

Protenas

Combinaes de estruturas secundrias em protenas globulares

Estveis motivos ou supersecundrias

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Protenas

Domnios
Unidade globular estvel
Protena Argonauta

Protenas

Organizao baseada em motivos e domnos SCOP (Classificao Estrutural de protenas)

Toda Toda / +

PFAM
Banco de dados de Famlia de protena Consevao de domnios Alinhamento mltiplo e HMM

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Protenas

Toda
PDB 1AO6 Soro albumina humana

Protenas

Domnio - SCOP Secundaria - DSSP Primria - PDB

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Protenas

Toda PDB 1LXA

UDP N-ACETYLGLUCOSAMINE ACYLTRANSFERASE

PDB 1PEX COLLAGENASE-3

Protenas
Toda PDB 1LXA
UDP N-ACETYLGLUCOSAMINE ACYLTRANSFERASE

Domain Assignment:SCOP d1lxaa_ UDP N-acetylglucosamine acyltransferase: 262 residues Secondary Structure:DSSP 16% helical (5 helices; 43 residues) 28% beta sheet (32 strands; 75 residues)

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Protenas

/ PDB - 1DEH
ALCOHOL DEHYDROGENASE

Protenas

+ PDB - 1EMA
GREEN FLUORESCENT PROTEIN

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Protenas

Estrutura quaternria
Mltiplas subunidades Diviso Exemplos Arranjo estrutural
Simetria rotacional ou helicoidal Rotacional

Protenas

Desnaturao e enovelamento
Dogma Conceito perda da conformao nativa Desnaturao X Estado desenovelado Elementos que causam desnaturao Renaturao

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Protenas

Enovelamento
Chance de enovelamento
Protena contendo 100 aa = 1077 anos

Vias de enovelamento
Hierrquico ou colapso hidrofbico

Protenas

Enovelamento assistido
Chaperonas moleculares Tipos
Hsp70 e Chaperoninas

Hsp70

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Protenas

Chaperoninas

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