Departamento de

Qumica de Biomacromolculas

Departamento de Qumica de Biomacromolculas Dr. Roberto A. Arreguin Espinosa de los Monteros Dr. Barbarn Arregun Lozano Dr. Hctor Barrios Lpez Dr. Jos Federico del Ro Portilla Dr. Enrique Garca Hernndez Dra. Alejandra Hernndez Santoyo Dr. Abel Moreno Crcamo Dra. Adela Rodrguez Romero Dra. Nuria Snchez Puig Dr. Manuel Soriano Garca Dra. Patricia Cano Snchez

Presentacin
i. Descripcin del Departamento. El Departamento de Qumica de Biomacromolculas (antes Departamento de Bioqumica) es uno de los lderes en el estudio de macromolculas biolgicas en el pas. Se distingue por haber sido pionero en Mxico en investigacin sobre Bioqumica vegetal y estructura de biomacromolculas. Est integrado por diez investigadores y un tcnico acadmico. ii. Objetivos. Desarrollar investigacin de alta calidad sobre las bases moleculares del funcionamiento de macromolculas, particularmente de protenas, y la aplicacin biotecnolgica y biomdica de las mismas. Una de las prioridades es formar alumnos que lleguen a ser profesionales altamente calificados tanto en el mbito cientfico, como en el social y el productivo. iii. Logros. En el Departamento fueron resueltas, por primera vez en Mxico, estructuras de protenas mediante difraccin de rayos X y resonancia magntica nuclear, y actualmente sigue conservando una posicin sobresaliente en la determinacin de estructura de protenas y de pptidos. La caracterizacin bioqumica de protenas de origen diverso ha sido parte sustancial de la investigacin. Ha sido pionero en el campo de la biomineralizacin y cristalognesis biolgica. Es uno de los principales centros de calorimetra de protenas en el pas, y en l se efectan proyectos de ingeniera de protenas y de frmacos. iv. Lneas de Investigacin. Se desarrollan diversos proyectos relacionados con: 1) bioestructura (bases estructurales de la alergenicidad, cristalognesis biolgica, biomineralizacin, oligomerizacin de protenas y amilodoignesis, estructura y actividad de pptidos antifngicos), 2) bioqumica de invertebrados marinos, 3) biotransformaciones en cultivos celulares vegetales, 4), fisicoqumica del plegamiento de protenas y del reconocimiento molecular, 5) ingeniera de protenas y diseo de frmacos para el tratamiento de artritis reumatoide, cncer de prstata y Alzheimer. v. Docencia y Formacin de Recursos Humanos. Los investigadores del Departamento ofrecen de manera continua diversos cursos a nivel posgrado y de licenciatura, entre los que se cuentan Los principios de la estructura, estabilidad y funcin de las protenas, Cristalografa de macromolculas biolgicas, Fundamentos e interpretacin de espectros de RMN, Plegamiento de protenas y reconocimiento molecular, Bioqumica, Purificacin y caracterizacin de protenas y Biofsica.

Dr. Roberto A. Arreguin Espinosa de los Monteros

Estructura y funcin de protenas de origen marino
Edificio B, Laboratorio QB4, tel. 5622-4468 arrespin@unam.mx

Estancia en la Universidad Johann Wolfgang Goethe en Frankfurt, Alemania, 1997. Estancia acadmica en Lousiana State University en E.U.A., 1992. Doctorado: Biologa, Universidad Nacional Autnoma de Mxico, 1991. Maestra: Biologa, Universidad Nacional Autnoma de Mxico, 1986. Licenciatura: Biologa, Universidad Nacional Autnoma de Mxico, 1983.

La investigacin que se realiza en el laboratorio de bioqumica est dirigido al entendimiento de la estructura y funcin de protenas. Dentro de este campo se estudia a los organismos marinos con el inters de encontrar sustancias bioactivas que se puedan utilizar como posibles frmacos en la Industria Farmacutica. Estudios de biomineralizacin en esponjas y estrellas de mar con la finalidad de entender las bases moleculares de este proceso. Dentro de la disciplina de la

Biologa Marina se estn realizando investigaciones de nuevas tcnicas bioqumicas de aislamiento, purificacin y caracterizacin de protenas y enzimas de organismos marinos. As como en la determinacin de estructura y cambios conformacionales de protenas en solucin utilizando tcnicas espectroscpicas como Dicrosmo Circular, Resonancia Magntica Nuclear, Espectroscopia Diferencial en el ultravioleta y Espectrometra de Masas de Alta Resolucin.

1. Vanessa Cabra, Roberto Arreguin, Rafael VazquezDuhalt & Amelia Farres. Effect of alkaline deamidation on the structure, surface hydrophobicity and emulsifying properties of 19 KDa alpha zein. J. Agricul. Food Chem. 55 (2): 439-445, 2007. 2. Martiniano Bello, Gerardo Prez-Hernndez, Alejandro Fernndez-Velasco, Roberto Arreguin-Espinosa and Enrique Garca-Hernndez. Energetics of Protein Homodimerization: effects of water sequestering on the formation of -lactoglobulin dimer. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. 70 (4): 1475-1487, 2008. 3. Vanessa Cabra, Edgar Vazquez Contreras, Abel Moreno and Roberto Arreguin. The effect of sulfhydryl groups and disulphide linkage in the thermal aggregation of Z19 alpha zein. BBA. Proteins and Proteomics. 1784: 1028-1036, 2008.

4. Norma Silvia Snchez, Roberto Arreguin, Martha Calahorra and Antonio Pea. Effects of salts on aerobic metabolism of Debaryomyces hansenii. FEMS Yeast Res. 8: 1303-1312, 2008. 5. Castan-Olivares LR, Martnez Martnez K, Bermdez Cruz RM, Meyer W, Arregun-Espinosa R, Lpez Martnez R and Ruz Palacios y Santos GM. Genotyping of Mexican Cryptoccocus neoformans and C. gattii isolates by PCR fingerprinting. Journal of Medical Mycology. 48: 1-9, 2009. 6. E. Rodrguez-Bustamante, G. Maldonado-Robledo, R. Arregun-Espinosa and Sergio Snchez Esquivel. A possible peroxidase from T. asahii, with carotenoid clearing activity, seems to be the target of glucosa regulation in the bioconversion of lutein. Applied Microbiology and Biotechnology. 84: 499510, 2009.

Dr. Barbarn Arregun Lozano

Bioqumica vegetal y de organismos marinos
Edificio B, Laboratorio QB2, tel. 5622-4569 barbarin@servidor.unam.mx

Su educacin escolar la inici en los aos veinte del siglo pasado, durante el Mxico posrevolucionario y de la rebelin cristera; continu con los estudios preparatorianos y profesionales en la UNAM durante los treinta, y realiz los estudios doctorales en el Instituto Tecnolgico de California (Caltech, Pasadena), durante la segunda guerra mundial, los cuales concluy en 1946. Trabaj como investigador en esa misma institucin por algunos aos, y despus de incidir laboralmente en la industria en nuestro pas, ingres al Instituto de Qumica de la UNAM en 1954. Reconocido como uno de los investigadores pioneros en el rea de la bioqumica vegetal en Mxico, y miembro fundador de la Sociedad Mexicana de Bioqumica y de la Academia de la Investigacin Cientfica (ahora Academia Mexicana de Ciencias), el Dr. Arregun ha recibido numerosos reconocimientos por su labor docente y de investigacin, incluyendo el de Investigador Emrito de la UNAM.

Los estudios bioqumicos comenzaron en el Instituto de Qumica, hace ms de 40 aos, cuando fue inaugurado el laboratorio de Bioqumica. Desde entonces, sus esfuerzos de investigacin han estado centrados en entender las rutas metablicas y la biosntesis. Algunas de las reas de investigacin en las cuales se ha involucrado son estudios de la glicsisis, el ciclo de la pentosa fostato, biosntesis de poliisoprenoides en plantas del hule, as como in-

vestigacin sobre proteasas de varias fuentes, tales como plantas y animales marinos. El ltex de Hevea ha sido uno de los materiales preferidos, realizando estudios sobre las enzimas presentes en l, las rutas metablicas y sus interconexiones. La investigacin actual hace nfasis en el aislamiento y caracterizacin de protenas y enzimas y sus estudios estructurales mediante dicrosmo circular, NMR y difraccin de rayos X.

1. Roberto Arregun-Espinosa, Barbarn Arregun and Carolina Gonzlez. (2000) Purification and properties of a lipase from Cephaloleia presignis (Coleoptera: crysomelidae) Biotechnol. Appl. Biochem. 31: 237-244.

2. BarbarnArregun and Roberto Arregun Espinosa (2000) Oxidative reactions of the pentose phosphate pathway and the origin of reducing equivalents for the biosynthesis of rubber in Hevea brasiliensis J. Chem. Technol. Biotechnol. 75: 294-298.

Dr. Hctor Barrios Lpez

Biotransformaciones con cultivos celulares vegetales
Edificio B, Laboratorio QB1, tel. 5622-4612 barrios@servidor.unam.mx

Veracruz, Ver., Mxico, 1944. Licenciatura Universidad Autnoma de Puebla. Grados: Maestro en Ciencias Qumicas y Doctor en Qumica Orgnica por la Universidad Nacional Autnoma de Mxico. Investigador Titular Instituto de Qumica UNAM, Mxico. Sntesis Orgnica Sabticos y permisos: Sabtico y comisin de tres meses. Departamento de Botnica de la Universidad de British Columbia, Vancouver, Canad. 1986. Productos Naturales. Comisin por un ao y semestre sabtico, Departamento de Botnica. Universidad de British Columbia, Vancouver Canad. 1990. Cultivo de Clulas vegetales. Comisin por un ao. Departamento de Qumica. Universidad de British Columbia, Vancouver Canad. 1992. Reacciones orgnicas mediante cultivos de clulas vegetales.

Nuestra investigacin consiste en el cultivo in vitro de clulas vegetales y su utilizacin en reacciones de sntesis orgnica como reducciones, ciclizaciones, desracemizaciones, entre otras.

El estudio se basa fundamentalmente en la estereoselectividad que ofrecen las reacciones enzimticas.

1. Diaz. E., Jankowski, C.K., Hocquelet, C., del Rio, F., Barrios, H. (2008) The unambiguous assignment of NMR spectra of per-O-methylated 6-mono and 6,6-diamino-beta-cyclodextrins. Can. J. Chem. Revue Canadienne de Chimie 86: 726-736. 2. Sandoval, C., Mendez, J.M., Sanchez-Obregon, R., Alpizar, C.B., Barrios, H. (2009) Reduction and cyclization in biotransformation of carbonyl compounds by cultured cells of Taxus species. Biocatalysis Biotransformation 27: 36-44.

3. Corona, D., Diaz, E., Barrios, H., Sanchez, E., Alvarado, C., Jankowski, C.K., Guzman. A. (2009) 2D H-1 and C-13 NMR conformational studies of thienopyridines and carboline biarylic compounds. Spectrochimica Acta Part A Molec. Biomolec. Spectroscopy 74: 515-525.

Dr. Jos Federico del Ro Portilla

Estudio de protenas por resonancia magntica nuclear
Edificio B, Laboratorio QB1, tel. 5622-4613 jfrp@ unam.mx

Realiz sus estudios de licenciatura en Qumica en la facultad de Qumica de la UNAM; maestra en Ciencias Qumicas en la misma universidad; y sus estudios de doctorado en Qumica (Fisicoqumica) en la UNAM con una estancia de dos aos en la Universidad de Cambridge en Inglaterra, al trmino de los cuales recibi la medalla Gabino Barreda. Realiz dos aos de postdoctorado en la Harvard Medical School en el rea de estructura de protenas por RMN. Ha realizado dos aos sabticos, uno en la misma Universidad de Harvard y un segundo en la Universidad de California en Irvine.

El grupo del Dr. Federico del Ro Portilla trabaja con protenas para determinar sitios de interaccin, dinmica y estructuras por resonancia magntica nuclear (RMN). Al mismo tiempo tiene gran inters en el desarrollo de nuevas tcnicas en RMN y en la medicin de constantes de acoplamiento espn-espn. Actualmente cuenta con siete estructuras depositadas en el Protein Data Bank y con publicaciones en el rea de la RMN. Su actual inters se basa en la determinacin de estructuras de protenas pequeas como toxinas de alacrn, as como el conocer la interaccin de ellas con el canal al cual inhiben o bloquean.

Cuenta actualmente con 40 publicaciones en revistas internacionales con arbitraje estricto, as como con ms de 400 citas a sus trabajos publicados.

Estructura de la TtTx1. Estructura determinada en el Instituto de Qumica.

1. F. del Ro Portilla, A. Gaskell, D. Gilbert, J. Ladias and G. Wagner Solution Structure Determination of h-RPABC14.4 by NMR Nature Structural Biology, 6 (1999) 1039-1042. 2. Ernesto Snchez Mendoza, Jess Hernndez Trujillo y Federico del Ro Portilla Experimental and Theoretical Analysis of Vicinal and Long-Range Proton-Proton Coupling Constants for Anthracene Derivatives. The Journal of Physical Chemistry A, 111, (2007) 264-8270. 3. Federico del Ro Portilla, Ernesto Snchez Mendoza, Vctor U. Constantino-Castillo y J. Antonio del Ro, New guide for first order multiplet analysis by modified J doubling in the frequency domain Arkivoc Regional Issue Organic Chemistry in Mexico, xi, (2003) 213-226.

4. Acely Garza-Garca, Gioconda Ponzanelli-Velzquez y Federico del Ro Portilla Deconvolution and Measurement of Spin-Spin Splittings by Modified J Doubling in the Frequency Domain Journal of Magnetic Resonance, 148, (2001) 214-219. 5. Federico del Ro-Portilla, Elizabeth HernndezMarn, Genaro Pimienta, Fredy V. Coronas, Fernando Z. Zamudio, Ricardo C. Rodrguez de la Vega, Enzo Wanke, Lourival D. Possani, NMR solution structure of Cn12, a novel peptide from the Mexican scorpion Centruroides noxius with a typical -toxin sequence but with -like physiological activity Eur. J. Biochem. 271, (2004) 25042516.

Dr. Enrique Garca Hernndez

Plegamiento de protenas y reconocimiento molecular: estabilidad, estructura y diseo
Edificio B, Laboratorio QB4, tel. 5622-4424 egarciah@unam.mx

El Dr. Garca curs la carrera de Biologa en la UNAM (1990), y obtuvo el grado de Doctor en Ciencias Qumicas en la Universidad Autnoma Metropolitana (1997). Es Investigador de tiempo completo en el Instituto de Qumica desde 1998. Actualmente es Investigador Titular A y nivel 1 del Sistema Nacional de Investigadores. Co-fundador de la Rama de Protenas de la Sociedad Mexicana de Bioqumica.

En mi grupo estudiamos las bases moleculares del funcionamiento de protenas. El plegamiento de protenas y la interaccin de stas con otras biomolculas (lpido, carbohidrato, nucletido, protena) son caracterizados mediante tcnicas calorimtricas de alta precisin (DSC, ITC), espectroscpicas (DC, fluorescencia, DLS) y computacionales (modelado y dinmica molecular). Estos estudios permiten determinar el mecanismo de interaccin de receptores biolgicos con sus ligandos/sustratos naturales y con molculas exgenas. Adems, sirven de gua

para modificar la especificidad de protenas de inters biomdico y biotecnolgico, y para el descubrimiento y optimizacin de nuevos frmacos.

1. Chavelas, E. A., Zubillaga, R. A., Pulido, N. O., Garca-Hernndez, E. (2006) Multithermal titration calorimetry: A rapid method to determine binding heat capacities. Biophys. Chem. 120: 10-14. 2. Bello, M., Prez-Hernndez, G., Fernndez-Velasco, D. A., Arregun-Espinosa, R., Garca-Hernndez, E. (2008) Energetics of protein homodimerization: effects of water sequestering on the formation of -lactoglobulin dimer. Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 70: 1475-1487. 3. Garca-Hernndez, E., Fernndez-Velasco, D. (2008) Advances in Protein Physical Chemistry. Transworld Research Network. 501 pp.

4. Chavelas, E. A., Garca-Hernndez, E. (2009) Heat capacity changes in carbohydrates and proteincarbohydrate complexes. Biochem. J. 420: 239-247. 5. Pulido, N.O., Salcedo, G., Prez-Hernndez, G., Jos-Nez, C., Velzquez-Campoy, A., GarcaHernndez, E. (2010) Energetic effects of magnesium in the recognition of adenosine nucleotides by the F1-ATPase subunit. Biochemistry 49: 52585268.

Dra. Alejandra Hernndez Santoyo

Mecanismos moleculares de la oligomerizacin en protenas. Estudios fisicoqumicos y estructurales de protenas amiloidognicas. Estabilidad de protenas. Cristalografa de protenas
Edificio B, Laboratorio QB3, tel. 5622-4568 hersan@servidor.unam.mx

La Dra. Hernndez obtuvo el ttulo de Oceanloga Qumica y la maestra en Oceanografa costera en el rea de Bioqumica Marina por la Universidad Autnoma de Baja California. En 2001 obtuvo el grado de doctora en Ciencias Biomdicas por la Universidad Nacional Autnoma de Mxico incorporndose como investigadora en el Instituto de Qumica de la UNAM, en el departamento de Bioqumica. Realiz estancias de investigacin en el Centro de investigacin Biocristalogrfica y Universidad Mickiewicz en Poznan, Polonia.

Mi investigacin se centra en el estudio de los mecanismos moleculares que dan lugar a la oligomerizacin de las protenas, esto mediante el uso de tcnicas bioqumicas, espectroscpicas, calorimtricas y de difraccin de rayos X. Una gran cantidad de las protenas presentes en la naturaleza se encuentran en forma oligomrica o requieren cambiar su estado de oligomerizacin para cumplir con una funcin dada. Dicha oligomerizacin puede provocar un efecto positivo o negativo en las propiedades de las mismas Por un lado puede regular la funcin de las protenas, favorecer la estabilidad y actividad de las mismas, convertirlas en multifuncionales o multiespecficas; y por el otro puede generar protenas no funcionales y formacin de depsitos en fibras, dando lugar a un gran nmero de enfermedades. Por lo anterior es importante enfocar nuestra atencin en los mecanismos moleculares que dan lugar a este fenmeno. Esto con el fin de conocer

el tipo de interaccin protena-protena que se establece y para intentar encontrar procedimientos que permitan inhibir dicha ologomerizacin, ya sea mediante modificaciones qumicas, mutaciones o mediante la bsqueda de frmacos o anticuerpos monoclonales especficos que inhiban dicho efecto. Adems, entender como un proceso de oligomerizacin, puede cambiar la especificidad o incrementar la actividad de una protena nos abre una perspectiva nueva para entender a nivel molecular como ocurren este tipo de fenmenos y la forma de poder controlarlos, aplicando este conocimiento ya sea en Biotecnologa, ingeniera de protenas o medicina.

1. Kolodziejczyk, R., Michalska, K. Hernandez-Santoyo, A. Wahlbom., Grubb, A. and Jaskolski, M. (2010) Crystal structure of human cystatin C stabilized against amyloid formation. FEBS J. 277, 1726-1737. 2. Hernndez-Santoyo, A., del Pozo Yauner, L., FuentesSilva1, D., Ortiz, E., Rudio-Piera, E., Snchez-Lpez, R., Horjales, E., Becerril, B., and Rodrguez-Romero, A. (2010) A single mutation at the sheet switch region results in conformational changes favoring 6-lightchain fibrillogenesis. J. Mol. Biol. 396, 280-292.

3. Michalska, K., Hernandez-Santoyo, A. and Jaskolski, M. (2008) The Mechanism of Autocatalytic Activation of Plant-type L-Asparaginases. J Biol Chem. 283,13388-97. 4. Michalska, K., Borek, D., Hernndez-Santoyo, A. and Jaskolski M. (2008) Crystal packing of planttype L-asparaginase from Escherichia coli. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 64, 309-20.

Dr. Abel Moreno Crcamo

Cristalognesis biolgica y procesos de biomineralizacin en seres vivos
Edificio B, Laboratorio QB6, tel. 5622-4467 carcamo@unam.mx

Naci en la Ciudad de Puebla, curs la carrera de Qumica en la Universidad Autnoma de Puebla, se gradu como Doctor en Ciencias Qumicas con categora Cum Laude en la Universidad de Granada, Espaa. Ha sido profesor visitante de varias universidades extranjeras, en las que ha participado en investigaciones conjuntas relacionadas con el tema de su especialidad, dentro de ellas estn la Universidad de California Riverside (EUA), El Colegio Imperial de Londres (Inglaterra), la Universidad de Tohoku en Sendai (Japn), el Instituto de Crecimiento Cristalino de Berln y la Universidad de Luebeck (ambos en Alemania). El doctor Moreno Crcamo, ha realizado dos estancias de ao sabtico, una en el Instituto de Biologa Molecular y Celular del CNRS, ubicado en la Universidad Louis Pasteur de Estrasburgo (Francia) y recientemente otro ao sabtico en el departamento de Bioqumica de la Universidad de Cambridge en Inglaterra. Actualmente, es Investigador Titular C de tiempo completo, PRIDE D en la categora de estmulos, Investigador Nacional Nivel 3 y Miembro de la Academia Mexicana de Ciencias y de la Academia de Ciencias de New York (EUA).

1. Cristalognesis Biolgica. 2. Procesos de Biomineralizacin en seres vivos.

3. Tcnicas Biofsicas y Bioqumicas para la caracterizacin de Biomolculas

1. Bernard Lorber, Claude Sauter, Anne Thobald-Dietrich, Abel Moreno, Pascale Schellenberger, MarieClaire Robert, Bernard Capelle, Sarah Sanglier, Nelle Potier, and Richard Gieg Crystal Growth of Proteins, Nucleic Acids, and Viruses in Gels. Progress in Biophysics and Molecular Biology 101 (2009) 13-25. 2. Takashi Ochi, Victor M. Bolanos-Garcia, Vivian Stojanoff, Abel Moreno Perspectives on Protein Crystallisation. Progress in Biophysics and Molecular Biology 101 (2009) 56-63. 3. Takashi Ochi, Sachin Surade, Daniel Nietlispach, Dima Chirgadze and Abel Moreno. Investigations into Protein Crystallisation in the Presence of a Strong Magnetic Field. Crystal Growth and Design 10 (2010) 691-699.

4. Victoria M. Virador, Juan P. Reyes-Grajeda, Alejandro Blanco-Labra, Elisabeth Mendiola-Olaya, Gary M. Smith, Abel Moreno, and John R. Whitaker Cloning, Sequencing, Purification, and Crystal Structure of Grenache (Vitis vinifera) Polyphenol Oxidase. Journal of Agricultural and Food Chemistry 58 (2010) 1189-1201. 5. Zbigniew Pietras, Hong-Ting Lin, Sachin Surade, Ben Luisi, Orla Slattery, Klass M. Pos, Abel Moreno The use of novel organic gels and hydrogels in protein crystallization. Journal of Applied Crystallography 43 (2010) 58-63.

Dra. Adela Rodrguez Romero

Estudios bioqumicos, fisicoqumicos y cristalogrficos de diversas protenas y complejos de inters biomdico
Edificio B, Laboratorio QB3, tel. 5622-4568 adela@unam.mx

La Dra. Adela Rodrguez-Romero recibi el grado de Doctor en Ciencias de la UAM-I en 1991, especializndose en cristalografa de protenas. Realiz una estancia de un ao (1995-1996) en el Center for Advanced Research in Biotechnology, NIST, Maryland, USA como Guest Researcher. Ella se incorpor al Instituto de Qumica de la UNAM en 1986, actualmente es Investigadora Titular C de tiempo completo y es miembro del Sistema Nacional de Investigadores.

Las lneas de investigacin de nuestro grupo de trabajo se enfocan principalmente en estudios cristalogrficos y funcionales de alrgenos y sus receptores con el fin comprender los mecanismos moleculares de las enfermedades alrgicas, as como para desarrollar herramientas de diagnstico. Una de las aportaciones ms importante del grupo ha sido la determinacin de la estructura tridimensional de varias protenas alergnicas del hule natural utilizando tcnicas de difraccin de rayos X. Describimos por primera vez en nuestro pas la estructura cristalogrfica de una protena, la hevena y de una isoforma, que son alrgenos relevantes. Recientemente determinamos la primera estructura de un alrgeno natural glicosilado, la glucanasa, cuyo sitio de glicosilacin es el principal determinante antignico.

Otras lneas de investigacin comprenden estudios bioqumicos, fisicoqumicos y estructurales de enzimas de plantas y parsitos, as como de protenas que sufren procesos de oligomerizacin, como blancos para el diseo de medicamentos.

Hevena (PDB 1Q9B)

Glucanasa (PDB 3F55 y 3EM5)

1. Olivares-Illana V, Rodrguez-Romero A., Becker I, Berzunza M., Garca J., Prez-Montfort R., Cabrera N., Lpez-Calahorra F., de Gmez-Puyou MT, Gmez-Puyou A. Perturbation of the dimer interface of triosephosphate isomerase and its effect on Trypanosoma cruzi. PLoS Negl Trop Dis.;1(1), 1-8, 2007 2. Hernndez-Alcantara G, Rodrguez-Romero A, ReyesVivas H, Pen J. Cabrera N, Ortiz C, Enriquez-Flores S, De la Mora-De la Mora I, Lpez-Velzquez G. Unraveling the machanisms of tryptophan fluorescence quenching in the triosephosphate isomerase from Giardia lamblia. Biochem. Biophys. Acta 1784, 1493-1500, 2008.

3. Pedraza-Escalona M, Becerril-Lujn, B., Agundis, C., Domnguez-Ramrez L., Pereyra A, Riao-Umbarilla L, Rodrguez-Romero A. Anlisis of B-cell epitopes from the allergen Hev b 6.02 revealed by using blocking antibodies. Mol. Immunol. 46, 668-76, 2009. 4. Hernndez-Santoyo, A., del Pozo Yauner, L., FuentesSilva, D., Ortiz, E., Rudio-Piera, E., Snchez-Lpez, R., Horjales, E., Becerril, B. and Rodrguez-Romero A. A single mutation at the sheet switch region results in conformational changes favoring 6-light-chain fibrillogenesis. J. Mol. Biol, 396, 280-292, 2010.

Dra. Nuria Snchez Puig

Propiedades bioqumicas y moleculares de protenas involucradas en el desarrollo de enfermedades
Edificio B, Laboratorio QB5, tel. 5622-4468 nuriasp@servidor.unam.mx

Realic mis estudios de licenciatura en Qumica de Alimentos y la Maestra en Ciencias Bioqumicas en la Facultad de Qumica de la UNAM. Posteriormente obtuve el doctorado en Biofsica de protenas en el Centro de Ingeniera de Protenas y la Universidad de Cambridge en Inglaterra bajo la supervisin de Sir Alan R. Fersht. Realic una estancia postdoctoral en el Laboratory of Molecular Biology, MRC en Inglaterra, y posteriormente me incorpor al Instituto de Qumica en el ao 2009.

El programa de investigacin desarrollado en mi laboratorio involucra un enfoque multidisciplinario en el que se combinan tcnicas de ADN recombinante, la expresin de protenas recombinantes en sistemas heterlogos, con tcnicas bioqumicas y espectroscpicas. Los temas que se abordan son: a) Entender las bases estructurales que rigen las interacciones protena-protena utilizando como modelo protenas involucradas en enfermedades con predisposicin a desarrollar cncer. b) Entender las bases moleculares que le permiten a las protenas

intrnsecamente desordenadas interaccionar con diferentes ligandos de manera especfica pese a la falta de estructura terciaria, as como su habilidad para adquirir diferentes conformaciones dependiendo del ligando con quien interaccionen. c) Caracterizacin de las enzimas denominadas silicatenas involucradas en la polimerizacin de silicio y otros compuestos como xidos de titanio y galio, y su utilizacin en la produccin de nanopartculas que puedan usarse como vehculos para el suministro de frmacos, entre otras aplicaciones.

1. Tobias F. Menne, Beatriz Goyenechea, Nuria Snchez-Puig, Chi C. Wong, Louise M. Tonkin, Philip J. Ancliffe, Rene L. Brost, Michael Costanzo, Charles Boone and Alan J. Warren. (2007) The Shwachman-Bodian-Diamond syndrome protein mediates translational activation of ribosomes in yeast. Nature Genetics 39, 486-495.

2. Nuria Snchez-Puig, Dmitry B. Veprintsev and Alan R Fersht. (2005) Human full-length Securin is a natively unfolded protein. Protein Science 14, 1410-18. 3. Nuria Snchez-Puig, Dmitry B. Veprintsev and Alan R Fersht. (2005). Binding of natively unfolded HIF1 ODD domain to p53. Molecular Cell, 17, 11-21.

Dr. Manuel Soriano Garca

Estructura, dinmica y funcin de molculas pequeas y protenas, y Cristalografa de rayos X
Edificio B, Laboratorio QB2, tel. 5622-4569 soriano@servidor.unam.mx

Ingeniero Bioqumico (1971) Escuela Nacional de Ciencias Biolgicas del IPN (Dra. Luz Mara del Castillo), Doctor en Biofsica (1975), Department of Biophysical Sciences, State University of New York at Buffalo, USA (Prof. Herbert Hauptman, Premio Nobel de Quimica 1986 y Prof. Rangachary Parthasarathy). Profesor Adjunto en el Department of Chemistry, Michigan State University (1988-1991), Investigador Titular C del Instituto de Qumica e Investigador Nacional Nivel 3 desde 1990. Premio Nacional de Qumica Andrs Manuel del Ro en el rea de investigacin, 1989; Presea Lzaro Crdenas: Egresado Distinguido, otorgada por el IPN en 1992; Premio Nacional de Ciencias de Cuba en ocasin del Da de la Ciencia Cubana otorgado por la Academia de Ciencias de Cuba, en 1994; Premio Nacional de Ciencia y Tecnologa de Alimentos, 1999. Ha publicado 260 artculos de investigacin y dirigido 12 tesis de maestra en ciencias y 11 de doctor en ciencias. Es el iniciador de la cristalografa de rayos en el pas desde 1976.

1) Estructura, dinmica y actividad biolgica de protenas y enzimas con inters en las industrias de los alimentos y farmacutica. 2) Estructura, dinmica y actividad biolgica de pptidos antimicrobianos y antifngicos aislados de plantas. 3) Diseo racional de frmacos: organoselenidos como agentes tera-

puticos y quimopreventivos en artritis reumatoide, cncer y diabetes. 4) Diseo racional de frmacos para el tratamiento de enfermedades del sistema nervioso: enfermedad de Alzheimer. 5) Estructurafuncin de canales de inicos que participan en al generacin de dolor, inflamacin, calor y picor.

1. M. Soriano-Garca. Organoselenium Compounds as Potential Therapeutic and Chemopreventive Agents: A Review. Current Medicinal Chemistry, 11, 1657-1669 (2004). 2. J. A. Gavira, L.A. Gonzlez-Ramrez, M.C. OliverSalvador, M. Soriano-Garca and J.M. Garca-Ruiz. Structure of the Mexicain-E64 complex and comparison with others cysteine proteases of the papain family. Acta Crystallographica. D63, 555-563 (2007). 3. L. A. Rivillas-Acevedo and M. Soriano-Garca. Isolation and Biochemical Characterization of an Antifungal Peptide from Amaranthus hypochondriacus Seeds. Journal of Agricultural Food Chemistry, 55, 10156-10161 (2007).

4. I I. Arias-Olgun, I Vitko, M. Fortuna, J. P. Baumgart, S. Sokolova, I. A. S., Amy Van Deusen, M. Soriano-Garca, J. C. Gomora and E. Perez-Reyes. Characterization of the Gating Brake in the I-II loop of cav3.2 t-type Ca2+ Channels. Journal of Biological Chemistry, 283, 8136-8144 (2008). 5. M. E. Campos-Aldrete, H. Salgado Zamora, M. E. Melndez-Camargo, Y. Karina Marquez-Flores and M. Soriano-Garca. Synthesis and Anti-immflamatory Activity Evaluation of Unsymmetrical Selenides. F. Marinez-Ramos, European Journal of Medicinal Chemistry. 43(7) 1432-1437 (2009). 6. H. Salazar, A. Jara-Oseguera, E. Hernndez, I. Llorente, I I. Arias-Olgun, M. Soriano-Garca, L.D. Islas and T. Rosenbaum. Structural Determinants of Gating in the TRPV1 Channel. Nature: Structural and Molecular Biology. 16 (7) 704-710 (2009).

Unidad de Biologa Molecular Dra. Patricia Cano Snchez

Clonacin y expresin de protenas recombinantes
Edificio C, Laboratorio de Biologa Molecular, tel. 5622-8222 ext. 45661 patcansan@yahoo.com Encargada:

Licenciatura en QFB, BUAP (1996), Maestra en Bioqumica, ENCB del IPN (1999), Doctorado en Ciencias Qumico-Biolgicas, ENCB del IPN (2008). Estancia Doctoral en la Universidad de Pittsburgh, PA. (2000-2003). De 2004 a 2006 Research assistant en el Institute of Macromolecular Assemblies en el College of Staten Island, NY. Tcnico Acadmico Titular A tiempo completo en el Instituto de Qumica desde 2007. Nivel I en el Sistema Nacional de Investigadores.

La Unidad de Biologa Molecular es un laboratorio del Departamento de Qumica de Biomacromolculas, que cuenta con la infraestructura necesaria para la clonacin y expresin de protenas recombinantes en E. coli. Tiene como principal objetivo apoyar a los investigadores del departamento con la produccin de protenas recombinantes para sus estudios posteriores.

La unidad asesora en el diseo de oligonucletidos, clonacin de los genes de inters a partir de sus fuentes naturales (DNA o RNA), subclonacin de stos en vectores de expresin as como en la optimizacin de la expresin de la protena para obtenerla plegada y funcional. Tambin se da asesora para la generacin de mutantes de protenas por mutagnesis dirigida.

1. Mehta M, Ahmed Z, Fernando SS, Cano-Sanchez P, Adayev T, Ziemnicka D, Wieraszko A, Banerjee P. Plasticity of 5-HT1A receptor-mediated signaling during early postnatal brain development. Journal of Neurochemistry. 2007. 101: 918-928. 2. Patricia Cano, Alejandro Godoy, Rosalba Escamilla, Rajiv Dhir y Sergio A. Oate. Stromal-epithelial cell interactions and AR-coregulator recruitment is altered in the tissue microenvironment of prostate cancer. Cancer Research. 2007. 67(2):511-9.

3. Patricia Cano-Sanchez, Beatrice Severino, V.V. Sureshbabu, Joe Russo, Tatsuya Inui, Fa-Xiang Ding, Boris Arshava, Jeff Becker y Fred Naider. Effects of N- and C- terminal addition of oligolysines or native loop residues on the biophysical properties of transmembrane domain peptides from a G-proteincoupled receptor. J. Pept. Sci. 2006. 12:808-822. 4. Fix C, Jordan C, Cano P, Walker WH. Testosterone activates mitogen-activated protein kinase and the cAMP response element binding protein transcription factor in Sertoli cells. Proc Natl Acad Sci USA. 2004. 101(30):10919-24.

Instituto de qumica

Organizacin Dr. Gabriel Eduardo Cuevas Gonzlez Bravo Director Dr. Roberto Martnez Secretario Acadmico Dr. Jorge Pen Peralta Secretario Tcnico Dr. Jess Valds Martinez Secretario de Vinculacin C.P. Mara Guadalupe Morales Ramrez Secretaria Administrativa

Departamentos Acadmicos Dr. Enrique Garca Hernndez Qumica de Biomacromolculas Dra. Jacqueline Quintana Hinojosa Fisicoqumica M. en C. Baldomero Esquivel Rodrguez Productos Naturales Dr. Cecilio lvarez Toledano Qumica Inorgnica Dr. Luis Demetrio Miranda Gutirrez Qumica Orgnica