Transcripcin gentica

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Esquema del proceso de transcripcin de ADN. Se muestra la orientacin antiparalela de las cadenas de ADN y la produccin de ARN por accin de la enzima ARN polimerasa La transcripcin del ADN es el primer proceso de la expresin gnica, mediante el cual se transfiere la informacin contenida en la secuencia del ADN hacia la secuencia de protena utilizando diversos ARN como intermediarios. Durante la transcripcin gentica, las secuencias de ADN son copiadas a ARN mediante una enzima llamada ARN polimerasa que sintetiza un ARN mensajero que mantiene la informacin de la secuencia del ADN. De esta manera, la transcripcin del ADN tambin podra llamarse sntesis del ARN mensajero.

ndice

1 Transcripcin en eucariotas 2 Etapas de la transcripcin o 2.1 Preiniciacin o 2.2 Iniciacin o 2.3 Disgregacin del promotor o 2.4 Elongacin o 2.5 Terminacin 3 Vase tambin 4 Enlaces externos

Transcripcin en eucariotas
En el caso de las eucariotas, el proceso se realiza en el ncleo, y es similar al de las procariotas, pero de mayor complejidad. Diferentes ARNp transcriben distintos tipos de genes. La ARNpII transcribe los pre-ARNm, mientras que la ARNpI y ARNpIII transcriben los ARN-ribosomales y ARNt, respectivamente. Los ARNs transcritos son modificados posteriormente. El pre-ARNm,por ejemplo, sufre un proceso de maduracin que tras cortes y empalmes sucesivos elimina ciertos segmentos del ADN llamados los intrones para producir el ARNm final. Durante este proceso de maduracin se puede dar lugar a diferentes molculas de ARN, en funcin de diversos reguladores. As pues, un mismo gen o secuencia de ADN, puede dar lugar a diferentes molculas de

ARNm y por tanto, producir diferentes protenas. Otro factor de regulacin propio de las clulas eucariotas son los conocidos potenciadores (en ingls: "enhancers"), que incrementan mucho (100 veces) la actividad de transcripcin de un gen, y no depende de la ubicacin de stos en el gen, ni la direccin de la lectura.

Etapas de la transcripcin
Clsicamente se divide el proceso de la transcripcin en 3 etapas principales (iniciacin, elongacin y terminacin), pero realmente se pueden diferenciar 5 etapas :

Preiniciacin
Al contrario de la replicacin de ADN, durante el inicio de la transcripcin no se requiere la presencia de un cebador para sintetizar la nueva cadena, de ARN en este caso. Antes del inicio de la transcripcin se necesita toda una serie de factores de transcripcin que ejercen los factores de iniciacin. Estos se unen a secuencias especficas de ADN para reconocer el sitio donde la transcripcin ha de comenzar y se sintetice el ARN cebador. Esta secuencia de ADN en la que se ensamblan los complejos de transcripcin se llama promotor. Los promotores se localizan en los extremos 5'terminales de los genes, antes del comienzo del gen, y a ellos se unen los factores de transcripcin mediante fuerzas de Van der Waals y enlaces de hidrgeno. Los promotores tienen secuencias reguladoras definidas, muy conservadas en cada especie, donde las ms conocidas son la caja TATA (situada sobre la regin -10), con la secuencia consenso TATA(A/T)A(A/T); y la caja TTGACA (situada en el punto -35). La formacin del complejo de transcripcin se realiza sobre el promotor TATA, all se forma el ncleo del complejo de iniciacin. Sobre la caja TATA se fija una protena de unin (TBP) junto con el factor de transcripcin TFII D (TF proviene del ingls: transcription factor). Despus, a ellos se unen otros factores de transcripcin especficos: TFII B se une a TBP, TFII A (opcional), que estabiliza el complejo TFII BTBP; luego se une el complejo TFII F y ARN polimerasa, y al final TFII E y TFII H. Todo ello forma un complejo que se llama complejo de preiniciacin cerrado o PIC. Cuando la estructura se abre por mediacin del factor de transcripcin TFII H, da comienzo la iniciacin y al complejo abierto (por su accin helicasa dependiente de ATP).

Iniciacin
Primero, una Helicasa separa las hebras de ADN en estas denominadas cajas TATA, ya que entre adenina y timina se establecen dos enlaces de hidrgeno, mientras que entre citosina y guanina se forman tres. Posteriormente se unen los factores y las protenas de transcripcin (TBP, TF2D, TF2B) permitiendo, de esta manera, el acceso de la ARN polimerasa al molde de ADN de cadena simple, siendo esta la ltima en posicionarse. Aunque la bsqueda del promotor por la ARN polimerasa es muy rpida, la formacin de la burbuja de transcripcin o apertura del ADN y la sntesis del cebador es muy lenta. La burbuja de transcripcin es una apertura de ADN desnaturalizado de 18 pares de bases, donde empieza a sintetizarse el ARN cebador a partir del nucletido nmero 10 del ADN molde de la burbuja de transcripcin. La burbuja de transcripcin se llama complejo abierto. La ARN polimerasa es una enzima formada por 5 subunidades: 2 subunidades , 1 subunidad , 1 subunidad ' y 1 subunidad que tiene como funcin la unin de ribonucletidos trifosfato. Cuando se forma el complejo abierto, la ARN

polimerasa comienza a unir ribonucletidos mediante enlaces fosfodister, y una vez que se forma el primer enlace fosfodister, acaba la etapa de iniciacin y comienza as la siguiente etapa.

Disgregacin del promotor

Una vez sintetizado el primer enlace fosfodister, se debe deshacer el complejo del promotor para que quede limpio para volver a funcionar de nuevo. Durante esta fase hay una tendencia a desprenderse el transcrito inicial de ARN y producir transcritos truncados, dando lugar a una iniciacin abortada, comn tanto en procariontes como eucariontes. Una vez que la cadena transcrita alcanza una longitud de unos 23 nucletidos, el complejo ya no se desliza y da lugar a la siguiente fase, la elongacin. La disgregacin del promotor coincide con una fosforilacin de la serina 5 del dominio carboxilo terminal de la ARN polimerasa, que es fosforilado por el TFII H (que es una protena quinasa dependiente de ATP)

Elongacin
La ARN polimerasa cataliza la elongacin de cadena del ARN. Una cadena de ARN se une por apareamiento de bases a la cadena de ADN, y para que se formen correctamente los enlaces de hidrgeno que determina el siguiente nucletido del molde de ADN, el centro activo de la ARN polimerasa reconoce a los ribonucletidos trifosfato entrantes. Cuando el nucletido entrante forma los enlaces de hidrgeno idneos, entonces la ARN polimerasa cataliza la formacin del enlace fosfodister que corresponde. A esto se le llama elongacin, la segunda etapa de la transcripcin del ARN.

Terminacin
Al finalizar la sntesis de ARNm, esta molcula ya se ha separado completamente del ADN (que recupera su forma original) y tambin de la ARN polimerasa, terminando la transcripcin. La terminacin es otra etapa distinta de la transcripcin, porque justo cuando el complejo de transcripcin se ha ensamblado activamente debe desensamblarse una vez que la elongacin se ha completado. La terminacin est sealizada por la informacin contenida en sitios de la secuencia del ADN que se est transcribiendo, por lo que la ARN polimerasa se detiene al transcribir algunas secuencias especiales del ADN. Estas secuencias son ricas en guanina y citosina, situadas en el extremo de los genes, seguidas de secuencias ricas en timina, formando secuencias palindrmicas, que cuando se transcriben el ARN recin sintetizado adopta una estructura en horquilla que desestabiliza el complejo ARN-ADN, obligando a separarse de la ARN polimerasa, renaturalizndose la burbuja de transcripcin. Algunas secuencias de ADN carecen de la secuencia de terminacin, sino que poseen otra secuencia a la que se unen una serie de protenas reguladoras especficas de la terminacin de la transcripcin como rho

Traduccin (gentica)
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La traduccin es el segundo proceso de la sntesis proteica (parte del proceso general de la expresin gnica). La traduccin ocurre tanto en el citoplasma, donde se encuentran los ribosomas, como tambin en el retculo endoplasmtico rugoso (RER). Los ribosomas estn formados por una subunidad pequea y una grande que rodean al ARNm. En la traduccin, el ARN mensajero se decodifica para producir un polipptido especfico de acuerdo con las reglas especificadas por el cdigo gentico. Es el proceso que convierte una secuencia de ARNm en una cadena de aminocidos para formar una protena. Es necesario que la traduccin venga precedida de un proceso de transcripcin. El proceso de traduccin tiene cuatro fases: activacin, iniciacin, elongacin y terminacin (entre todos describen el crecimiento de la cadena de aminocidos, o polipptido, que es el producto de la traduccin). En la activacin, el aminocido (AA) correcto se une al ARN de transferencia (ARNt) correcto. Aunque tcnicamente esto no es un paso de la traduccin, es necesario para que se produzca la traduccin. El AA se une por su grupo carboxilo con el OH 3' del ARNt mediante un enlace de tipo ster. Cuando el ARNt est enlazado con un aminocido, se dice que est "cargado". La iniciacin supone que la subunidad pequea del ribosoma se enlaza con el extremo 5' del ARNm con la ayuda de factores de iniciacin (FI), otras protenas que asisten el proceso. La elongacin ocurre cuando el siguiente aminoacil-ARNt (el ARNt cargado) de la secuencia se enlaza con el ribosoma adems de con un GTP y un factor de elongacin. La terminacin del polipptido sucede cuando la zona A del ribosoma se encuentra con un codn de parada (sin sentido), que son el UAA, UAG o UGA. Cuando esto sucede, ningn ARNt puede reconocerlo, pero el factor de liberacin puede reconocer los codones sin sentido y provoca la liberacin de la cadena polipeptdica. La capacidad de desactivar o inhibir la traduccin de la biosntesis de protenas se utiliza en antibiticos como la anisomicina, la cicloheximida, el cloranfenicol y la tetraciclina.

ndice

1 Mecanismos bsicos 2 Traduccin procaritica o 2.1 Iniciacin o 2.2 Elongacin o 2.3 Terminacin o 2.4 Reciclaje o 2.5 Polisomas o 2.6 Efecto de los antibiticos 3 Traduccin eucaritica o 3.1 Iniciacin 3.1.1 Iniciacin dependiente de caperuza 3.1.2 Iniciacin independiente de caperuza 4 Referencias 5 Vase tambin

Mecanismos bsicos

Esquema del mecanismo de traduccin.

El ARN(m) porta la informacin gentica codificada en forma de secuencia de ribonucletidos desde los cromosomas hasta los ribosomas. Los ribonucletidos son "ledos" por la maquinaria traductora en una secuencia de tripletes de nucletidos llamados codones. Cada uno de estos tripletes codifica un aminocido especfico. El ribosoma y las molculas de ARNt traducen este cdigo para producir protenas. El ribosoma es una estructura con varias subunidades que contiene ARNr y protenas. Es la "fbrica" en la que se montan los aminocidos para formar protenas. El ARNt son pequeas cadenas de ARN no codificador (de 74-93 nucletidos) que transportan aminocidos al ribosoma. Los ARNt tienen un lugar para anclarse al aminocido, y un lugar llamado anticodn. El anticodn es un triplete de ARN complementario al triplete de ARNm que codifica a su aminocido. La aminoacil-ARNt sintetasa (una enzima) cataliza el enlace entre los ARNt especficos y los aminocidos que concuerdan con sus anticodones. El producto de esta reaccin es una molcula de aminoacil-ARNt. Esta aminoacil-ARNt viaja al interior del ribosoma, donde los codones de ARNm se enfrentan con los anticodones especficos del ARNt mediante el emparejamiento de bases. Luego se utilizan los aminocidos que portan los ARNt para montar una protena. La energa requerida para traducir protenas es significativa. Para una protena que contenga n aminocidos, el nmero de enlaces fosfato de alta energa necesarios para traducirla es 4n-1. Es tambin el proceso mediante el que los ribosomas utilizan la secuencia de codones del ARNm para producir un polipptido con una secuencia particular de aminocidos.

Traduccin procaritica
Iniciacin

El proceso de iniciacin de la traduccin en las procariotas.

La iniciacin de la traduccin en las procariotas supone ensamblar los componentes del sistema de traduccin, que son: las dos subunidades ribosomales, el ARNm a traducir, el primer aminoacil-ARNt (el ARNt cargado con el primer aminocido), GTP (como fuente de energa) y factores de iniciacin que ayudan a ensamblar el sistema de iniciacin. La iniciacin procaritica es el resultado de la asociacin de las subunidades pequea y grande del ribosoma y el acoplamiento del primer aminoacil-ARNt (fmetARNt) con el codn de iniciacin mediante el emparejamiento de bases anticodncodn. El ribosoma consta de tres sitios: el sitio A, el sitio P y el sitio E. El sitio A es el punto de entrada para el aminoacil-ARNt (excepto para el primer aminoacil-ARNt, fmetARNt, que entra en el sitio P). El sitio P es donde se forma el peptidil-ARNt. Y el sitio E es el sitio de salida del ARNt una vez descargado tras ofrecer su aminocido a la cadena peptdica en crecimiento. La iniciacin de la traduccin en procariotas comienza con las subunidades 50s y 30s sin asociar. El IF-1 (factor de iniciacin 1) bloquea el sitio A para asegurar que el fMetARNt slo se puede acoplar al sitio P y que ningn otro aminoacil-ARNt puede acoplarse al sitio A durante la iniciacin, mientras que el IF-3 bloquea el sitio E y evita que las dos subunidades se asocien. El IF-2 es una GTPasa pequea que se asocia con el fmet-ARNt y le ayuda a acoplarse con la subunidad ribosmica pequea. El ARNr 16s de la subunidad ribosmica pequea 30S reconoce el sitio de acoplamiento ribosmico del ARNm (la secuencia Shine-Dalgarno, 5-10 pares de bases por delante del codn de iniciacin (AUG). La secuencia Shine-Dalgarno solo se encuentra en las procariotas). Esto ayuda a posicionar correctamente el ribosoma sobre el ARNm para que el sitio P est directamente sobre el codn de iniciacin AUG. El IF-3 ayuda a posicionar el fmetARNt en el sitio P, de manera que el fmet-ARNt interacta mediante el emparejamiento de bases con el codn de iniciacin del ARNm (AUG). La iniciacin termina cuando la subunidad ribosmica grande se une al sistema provocando el desacoplamiento de los factores de iniciacin. Hay que tener en cuenta que las procariotas pueden distinguir entre un codn normal AUG (que codifica la metionina) y un codn de iniciacin AUG

(que codifica la formilmetionina e indica el comienzo de un nuevo proceso de traduccin).

Elongacin
La elongacin de la cadena polipeptdica consiste en la adicin de aminocidos al extremo carboxilo de la cadena. La elongacin comienza cuando el fmet-ARNt entra en el sitio P, causando un cambio de conformacin que abre el sitio A para que el nuevo aminoacil-ARNt se acople. El factor de elongacin Tu (EF-Tu), una pequea GTPasa, facilita este acoplamiento. Ahora el sitio P contiene el comienzo de la cadena peptdica de la protena a codificar y el sitio A tiene el siguiente aminocido que debe aadirse a la cadena peptdica. El polipptido creciente que est conectado al ARNt en el sitio P se desacopla del ARNt y se forma un enlace peptdico entre el ltimo de los aminocidos del polipptido y el aminocido que est acoplado al ARNt en el sitio A. Este proceso, conocido como formacin del enlace peptdico, est catalizado por una ribozima, la peptidil-transferasa, una actividad intrnseca al ARNr 23s de la unidad ribosmica 50s. En este punto, el sitio A ha formado un nuevo pptido, mientras que el sitio P tiene un ARNt descargado (ARNt sin aminocido). En la fase final de la elongacin, la traslacin, el ribosoma se mueve 3 nucletidos hacia el extremo 3' del ARNm. Como los ARNt estn enlazados al ARNm mediante el emparejamiento de bases codn-anticodn, los ARNt se mueven respecto al ribosoma recibiendo el polipptido naciente del sitio A al sitio P y moviendo el ARNt descargado al sitio E de salida. Este proceso est catalizado por el factor de elongacin G (EF-G) gastando un GTP. El ribosoma contina trasladando los codones restantes del ARNm mientras siguen acoplndose ms aminoacil-ARNt al sitio A, hasta que el ribosoma alcanza un codn de parada (codn de trmino) en el ARNm (UAA, UGA o UAG).

Terminacin
La terminacin ocurre cuando uno de los tres codones de terminacin entra en el sitio A. Estos codones no son reconocidos por ningn ARNt. En cambio, son reconocidos por unas protenas llamadas factores de liberacin, concretamente la RF-1 (que reconoce los codones de parada UAA y UAG) o la RF-2 (que reconoce al UAA y al UGA). Un tercer factor de liberacin, el RF3, cataliza la liberacin producida por el RF-1 y el RF-2 al final del proceso de terminacin. Estos factores disparan la hidrlisis del enlace ster de la peptidil-ARNt y la liberacin del ribosoma de la protena recin sintetizada. O fin de la fase.

Reciclaje
El sistema de post-terminacin formado al final de la terminacin consiste en el ARNm con el codn de terminacin en el sitio A, los ARNt y el ribosoma. La fase de reciclaje del ribosoma es responsable del desmantelamiento del sistema ribosmico posterior a la terminacin. Una vez que la protena nueva es liberada durante la terminacin, el factor de reciclaje del ribosoma y el factor de elongacin G (EF-G) se ponen en funcionamiento para liberar el ARNm y los ARNt de los ribosomas y desligar los ribosomas 70s en las subunidades 30s y 50s. El IF-3 tambin ayuda al proceso de reciclaje del ribosoma convirtiendo a las subunidades transitorias desacopladas en

subinidades estables, enlazndose con las subunidades 30s. Esto "recicla" los ribosomas para posteriores rondas de traduccin.

Polisomas
La traduccin es ejecutada por varios ribosomas al mismo tiempo. Debido al gran tamao de los ribosomas, solo se pueden acoplar al ARNm a una distancia de 35 nucletidos unos de otros. El sistema consistente en un ARNm y un cierto nmero de ribosomas se llama polisoma o poliribosomas.

Efecto de los antibiticos

Hay varios antibiticos que actan interfiriendo en el proceso de traduccin de las bacterias. Explotan las diferencias entre los mecanismos de traduccin procaritica y eucaritica para inhibir selectivamente la sntesis de protenas en las bacterias sin afectar al husped. Algunos ejemplos incluyen:

La puromicina tiene una estructura similar al aminoacil-ARNt de la tirosina. Por tanto, se enlaza al sitio A del ribosoma y participa en la formacin de enlaces peptdicos, produciendo peptidil-puromicina. Sin embargo, no toma parte en la traslacin y se desacopla rpidamente del ribosoma, causando una terminacin prematura de la sntesis del polipptido. La streptomicina provoca una mala lectura del cdigo gentico en las bacterias a concentraciones relativamente bajas e inhibe la iniciacin a concentraciones mayores, enlazndose a la subunidad ribosmica 30s. Otros aminoglucsidos como la tobramicina y la kanamicina evitan la asociacin ribosmica al final de la fase de iniciacin y provocan una mala lectura del cdigo gentico. Las tetraciclinas bloquean el sitio A del ribosoma, evitando el acoplamiento de los aminoacil-ARNt. El cloranfenicol bloquea la fase de la transferencia peptdica de la elongacin en la subunidad ribosmica 50s, tanto en las bacterias como en las mitocondrias. Los macrlidos y las lincosamidas se enlazan a las subunidades ribosmicas 50s, inhibiendo la reaccin de la peptidiltransferasa o la traslacin, o ambas cosas.

Traduccin eucaritica
Iniciacin

El proceso de la iniciacin de la traduccin en las eucariotas. Iniciacin dependiente de caperuza

La iniciacin de la traduccin supone la interaccin de varias protenas con una marca especial ligada al extremo 5' de las molculas de ARNm. Los factores protenicos se asocian a la subunidad ribosmica pequea. La subunidad, acompaada de algunos de esos factores protenicos, se mueve a lo largo de la cadena de ARNm hacia su extremo 3' buscando el codn de 'comienzo' (normalmente el AUG), que indica en qu punto se empieza a codificar la protena. Luego el ribosoma traduce la secuencia que hay entre los codones de 'comienzo' y 'parada' en una secuencia de aminocidos, sintetizndose una protena. En los eucariontes y las archaea, el aminocido codificado por el codn de inicio es la metionina. El ARNt iniciador cargado con metionina forma parte del sistema ribosmico, y por tanto todas las protenas empiezan por este aminocido (a menos que lo extirpe una proteasa en algn paso posterior).
Iniciacin independiente de caperuza

El ejemplo mejor estudiado de traduccin independiente de caperuza en las eucariotas es el IRES, el Sitio Interno de Entrada al Ribosoma. Lo que distingue a la traduccin independiente de caperuza de la dependiente de caperuza es que la primera no necesita que el ribosoma empiece a recorrer el ARNm desde el extremo 5' hasta el codn de comienzo. Los ITAF (IRES trans-acting factor) pueden colocar al ribosoma en el sitio de inicio, evitando la necesidad de recorrer el ARNm desde el extremo 5' de la regin sin traducir del ARNm. Este mtodo de traduccin ha sido descubierto recientemente, junto con su importancia en condiciones que requieren la traduccin de ARNm especficos a pesar del estrs celular o la incapacidad de traducir la mayora de los ARNm. Ejemplos incluyen a los factores que responden a la apoptosis

Biosntesis proteica
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La biosntesis de protenas es el proceso anablico mediante el cual se forman las protenas. El proceso consta de dos etapas, la traduccin del ARN mensajero, mediante el cual los aminocidos del polipptido son ordenados de manera precisa a partir de la informacin contenida en la secuencia de nucletidos del ADN, y las modificaciones postraduccin que sufren los polipptidos as formados hasta alcanzar su estado funcional. Dado que la traduccin es la fase ms importante la biosntesis de protenas a menudo se considera sinnimo de traduccin.1

ndice

1 Traduccin o 1.1 Componentes del equipo de traduccin o 1.2 Iniciacin de la traduccin o 1.3 Elongacin de la cadena polipeptdica o 1.4 Terminacin de la sntesis de la cadena polipeptdica 2 Modificaciones postraduccin o 2.1 Plegamiento o 2.2 Glucosilacin o 2.3 Protelisis parcial o 2.4 Modificacin de aminocidos 3 Vase tambin 4 Referencias 5 Enlaces externos

Traduccin

Elongacin del polipptido. El ribosoma es verde y amarillo, los ARNt son azul oscuro y las dems protenas implicadas son azul claro. Artculo principal: Traduccin (gentica).

Componentes del equipo de traduccin

ARN mensajero. El ARN mensajero (ARNm) transmite la informacin gentica almacenada en el ADN. Mediante el proceso conocido como transcripcin, secuencias especficas de ADN son copiadas en forma de ARNm que transporta el mensaje contenido en el ADN a los sitios de sntesis proteica (los ribosomas). ARN de tranferencia y aminocidos. Los aminocidos (componentes de las protenas) son unidos a los ARN de transferencia (ARNt) que los llevarn hasta el lugar de sntesis proteica, donde sern encadenados uno tras otro. La enzima aminoacil-ARNt-sintetasa se encarga de dicha unin, en un proceso que consume ATP. Ribosomas. Los ribosomas son los orgnulos citoplasmticos encargados de la biosntesis proteica; ellos son los encargados de la unin de los aminocidos que transportan los ARNt siguiendo la secuencia de codones del ARNm segn las equivalencias del cdigo gentico.

Iniciacin de la traduccin
Es la primera etapa de la biosntesis de protenas. El ARNm se une a la subunidad menor de los ribosomas. A stos se asocia el aminoacil-ARNt, gracias a que el ARNt tiene en una de sus asas un triplete de nucletidos denominado anticodn, que se asocia al primer codn del ARNm segn la complementariedad de las bases. A este grupo de molculas se une la subunidad ribosmica mayor, formndose el complejo ribosomal o complejo activo. Todos estos procesos estn catalizados por los llamados factores de iniciacin (FI). El primer codn que se traduce es generalmente el AUG, que corresponde con el aminocido metionina en eucariotas. En procariotas es la formilmetionina.

Elongacin de la cadena polipeptdica

El complejo ribosomal posee dos sitios de unin o centros. El centro peptidil o centro P, donde se sita el primer aminoacil-ARNt y el centro aceptor de nuevos aminoacilARNt o centro A. El carboxilo terminal (-COOH) del aminocido iniciado se une con el amino terminal (-NH2) del aminocido siguiente mediante enlace peptdico. Esta unin es catalizada por la enzima peptidil transferasa. El centro P queda pues ocupado por un ARNt sin aminocido. El ARNt sin aminocido sale del ribosoma. Se produce la translocacin ribosomal. El dipeptil-ARNt queda ahora en el centro P. Todo ello es catalizado por los factores de elongacin (FE) y precisa GTP. Segn la terminacin del tercer codn, aparece el tercer aminoacil-ARNt y ocupa el centro A. Luego se forma el tripptido en A y posteriormente el ribosoma realiza su segunda translocacin. Estos pasos se pueden repetir mltiples veces, hasta cientos de veces, segn el nmero de aminocidos que contenga el polipptido. La traslocacin del ribosoma implica el desplazamiento del ribosoma a lo largo de ARNm en sentido 5'-> 3'.

Terminacin de la sntesis de la cadena polipeptdica

Los codones UAA, UAG y UGA son seales de paro que no especifican ningn aminocido y se conocen como codones de terminacin; determinan el final de la sntesis proteica. No existe ningn ARNt cuyo anticodn sea complementario de dichos codones y, por lo tanto, la biosntesis del polipptido se interrumpe. Indican que la cadena polipeptdica ya ha terminado. Este proceso viene regulado por los factores de

liberacin, de naturaleza proteica, que se sitan en el sitio A y hacen que la peptidil transferasa separe, por hidrlisis, la cadena polipeptdica del ARNt. Un ARNm, si es lo suficientemente largo, puede ser ledo o traducido, por varios ribosomas a la vez, uno detrs de otro. Al microscopio electrnico, se observa como un rosario de ribosomas, que se denomina polirribosoma o polisoma. Una vez finalizada la sntesis de una protena, el ARN mensajero queda libre y puede ser ledo de nuevo. De hecho, es muy frecuente que antes de que finalice una protena ya est comenzando otra, con lo cual, una misma molcula de ARN mensajero, est siendo utilizada por varios ribosomas simultneamente.

Modificaciones postraduccin
Artculo principal: Modificacin postraduccional.

Algunas protenas emergen del ribosoma preparadas para ejercer su funcin de inmediato, mientras que otras experimentan diversas modificaciones postraduccin, que pueden conducir a la protena a la adquisicin de su forma funcional, a su traslado a un compartimento subcelular determinado, a su secrecin al exterior de la clula, etc.

Plegamiento
Muchas protenas adquieren espontneamente la correcta conformacin tridimensional, pero otras muchas solo adquieren la conformacin correcta con la ayuda de una o ms protenas chaperonas. Las chaperonas se unen reversiblemente a regiones hidrofbicas de las protenas desplegadas y a los intemediarios de plegamiento; pueden estabilizar intermediarios, mantener protenas desplegadas para que pasen con facilidad a travs de membranas, ayudar a desplegar segmentos plegados incorrectamente, impedir la formacin de intermediarios incorrectos o impedir interacciones inadecuadas con otras protenas.1

Glucosilacin
Artculo principal: Glucosilacin.

La glucosilacin es la adicin de uno o ms glcidos a una protena lo que da lugar a las glucoprotenas, que son esenciales en los mecanismos de reconocimiento celular. La glucosilacin puede implicar la adicin de unas pocas molculas glucdicas o de grandes cadenas ramificadas de oligosacridos. Existe un centenar de glucosiltransferasas distintas, las enzimas encargadas de realizar este proceso. El mecanismo es bsicamente el mismo en todos los casos; un azcar es transferido desde un sustrato dador activado hasta un aceptor apropiado.1

Protelisis parcial
La protelisis parcial es una etapa frecuente en los procesos de maduracin de las protenas. Pueden eliminarse secuencias de aminocidos en ambos extremos o en el interior de la protena. La protelisis en el retculo endoplasmtico y en el aparato de Golgi son, por ejemplo, esenciales en la maduracin de la insulina; la preproinsulina

codificada por el ARNm es introducida en el retculo endoplasmtico; una peptidasa la corta y origina la proinsulina que se pliega para formar los puentes disulfuro correctamente; la proinsulina es transportada al aparato de Golgi, donde es empaquetada en grnulos de secrecin; entonces se elimina un fragmento (pptido C) por protelisis originando la insulina funcional, que es secretada. La hiperproinsulinemia familiar es una enfermedad gentica autosmica dominante causad por en defecto en el proceso de maduracin de la proinsulina, que da lugar a la presencia en el torrente circulatorio de insulina y de proinsulina en cantidades similares.1

Modificacin de aminocidos
Slo 20 aminocidos estn codificados genticamente y son incorporados durante la traduccin. Sin embargo, las modificaciones postraduccin conducen a la formacin de 100 o ms derivados de los aminocidos. Las modificaciones de los aminocidos juegan con frecuencia un papel de gran importancia en la correcta funcionalidad de la protena. Son numerosos los ejemplo de modificacin postraduccin de aminocidos. La formacin postraduccin de puentes disulfuro, bsicos en la estabilizacin de la estructura terciaria de las protenas est catalizada por una disulfuro isomerasa. En las histonas tiene lugar la metilacin de las lisinas. En el colgeno abunda el aminocido 4hidroxiprolina, que es el resultado de la hidroxilacin de la prolina. La traduccin comienza con el codn "AUG" que es adems de seal de inicio significa el aminocido metionina, que casi siempre es eliminada por protelisis.1
Regulacin jurdica de las biotecnologas
Profesora: Dra. Teodora Zamudio ~ Equipo de docencia e investigacin
Editado para l@s alumn@s de la U.B.A.-Derecho
Ediciones Digitales 2005 Material fuera de comercio
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- 2. La transcripcin y la traduccin

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Cronograma celular
Todas las actividades bioqumicas de la clula viva, incluyendo la multitud de reacciones sintticas que producen sus molculas constituyentes (carbohidratos, lpidos y protenas) dependen de diferentes enzimas especficas; an la sntesis de enzimas depende de enzimas[1], cuya especificidad es el resultado de su estructura primaria: la secuencia lneal de aminocidos en la molcula. El cmo y cundo se construye esa estructura es responsabilidad del ADN[2].

Transcripcin del ADN

Cuando una parte de la informacin contenida en la molcula de ADN debe ser utilizada en el citoplasma de la clula para la construccin de las protenas, ella es transcrita bajo la forma de una pequea cadena de cido ribonuclico: el ARN mensajero (ARNm) utilizando las mismas correspondencias de base que el ADN visto anteriormente, pero con la diferencia ya sealada de que la timina es reemplazada por el uracilo. Uno a uno se van aadiendo los ribonucletidos trifosfato en la direccin 5a 3, usando de molde slo una de las ramas de la cadena de ADN y a la ARN polimerasa como catalizador. La operacin de trascripcin no puede tener lugar salvo que dos secuencias particulares estn presentes en el ADN: la promotora al comienzo de la secuencia, que es distinta en las eucariotas y en los procariotas, y la de corte propiamente dicha -conocida como cola de poli A (compuesto de hasta 200 nucletidos de adenina)-, que en las procariotas slo existe al final de la secuencia. Las eucariotes presentan en esta regin una seal que induce la cpula de un precursor ms grande. Grfico 1 Asociacin asimtrica de nucletidos.
Puesto que los pares de bases se asocian asimtricamente (tomando como referencia el esqueleto de fosfato-azcar), un surco entre los hilos es ms ancho que el otro. stos se llaman: el surco principal y el de menor importancia. Ambos proporcionan oportunidades para las interacciones de las base-especficas, pero el surco principal satisface mejor esa tarea y se observa ms a menudo como el sitio obligatorio y primario para comenzar las transcripciones.

Traduccin del ARN

La informacin gentica llevada por el ARNm deber ser traducida en el citoplasma por una fbrica de protenas: el ribosoma (ste est compuesto por varios tipos de protenas ms una forma de ARN, denominado ARN ribosmico). En el ribosoma no se podr comenzar la lectura de un mensajero mas que por una secuencia particular, distinta en las eucariotes y en las procariotas. Asido el ARNm en el ribosoma, el tercer tipo de ARN -ARN de transferencia (ARNt)- entra en accin. Existen muchos tipos de ARNt y Grfico 2 Engrosamiento o "splicing" del ARNm cada uno es capaz de reconocer determinados grupos de tres bases (codones) del ARNm. A cada triplete de nucletidos, los ARN de transferencia hacen corresponder uno de los veinte aminocidos[3] que constituyen las mayores cadenas Procesamiento de un Splicing alternativo Procesamiento de una polipptidas, las protenas. La preARNt en eucariontes molcula de ARNm en eucariontes informacin es inscripta de un trazo en el ADN bacteriano[4], pero en los organismos superiores se ha descubierto hace una decena de aos que la informacin

gentica constituye un mosaico en los que la informacin til es interrumpida por secuencias no codificantes, aparentemente intiles, llamadas intrones (las secuencias codificantes son llamadas exones).En la clula eucariote, en principio, el ARNm transcribe todo, intrones includos. Las secuencias supernumerarias formarn los lazos que sern cortados al mismo tiempo que los pedazos tiles del ARN sern recolectados. Este proceso es llamado engrosado (el cual puede dar origen a ms de una forma diferente de empalme o empalmes alternativos de los que puede resultar la formacin de ms de un polipptido funcional, a partir de una trascripcin inicialmente idntica[5]); recin entonces, la molcula engrosada de ARN mensajero maduro atraviesa la membrana nuclear por los poros nucleares, ayudada por protenas particulares de ribo-ncleo-protenas (RNPs m). En resumen, hasta aqu ... Grfico 3. Trascripcin y traduccin del ADN en la clula eucariota

CLULA EUCARIOTA

detalle

TRANSCRIPCIN

TRADUCCIN

Expresin del ADN mitocondrial

El genoma mitocondrial contiene un total de 37 genes de los cuales

13 genes que
codifican para ARNs mensajeros, y por lo tanto para 13 protenas.

22 genes que
codifican para 22 tARNs (ARNs de transferencial) y 2 genes que codifican para dos rRNAs mitocondriales (RNAs ribosmicos). Adems de las protenas que la mitocondria puede sintetizar por si misma, necesita importar algunas otras sintetizadas en el ncleo. De igual forma, los lpidos que forman las membranas externa e interna de la mitocondria son importadas. [ver prxima clase ADN mitocondrial]

El producto: las protenas.

El cdigo gentico consiste en 64 combinaciones de triples (codones) y sus aminocidos correspondientes. A continuacin se detallan los codones que apareceran en una molcula de ARN mensajero: 61 codifican para aminocidos y 3 son seales de detencin. Como los aminocidos son slo veinte, existen tripletes sinnimos [ver Cuadro 1] Asimismo, a este fennemo llamado degeneracin del cdigo (expresin para describir los estados mltiples de los tripletes) que, de hecho, puede producir cierta ambigedad en la lectura de los codones, debe agregarse la existencia de las secuencias no codificantes, y, en las eucariotes, las secuencias repetidas, las interacciones y las recombinaciones espontneas entre los genes. Luego de la iniciacin, la traduccin -que siempre se llevar a cabo por la lectura de un triplete o codn (tres bases) por vez- no trae problemas de especie, el cdigo gentico es universal y determina la relacin que existe en el mbito de la traduccin entre series de nucletidos o codones y los aminocidos (vale siempre para el ADN citoplsmico). El flujo de informacin va del ADN al ARN mensajero y de all, finalmente, a formar la protena, con la importante diferencia ya apuntada- entre las procariotas y las eucariotes.

Las protenas estn configuradas por cadenas polipptidas, esto es aminocidos asociados qumicamente y plegados de manera especfica. [ver Cuadro 2] Cuadro 1 Combinaciones de triples y sus correlativos aminocidos. Cuadro 2 Caractersticas de los aminocidos.

En el cuadro a la derecha, la frmula qumica de los aminocidos (en color negro la parte comn, mientras que en color azul puede verse la parte variable, que da a los aminocidos distinto comportamiento: naranja = aminocidos hidrfobos; verde = aminocidos polares; magenta = aminocidos cidos; ciano = aminocidos bsicos

Las protenas han tenido una significativa importancia, como gua del diseo gentico, en el momento del cartografiado del genoma de los organismos.
El primer genoma cuya secuencia completa de nucletidos fue conocida, fue la del ADN del bacterifago X174, descubierto por Frederick Sanger, lo que le vali su segundo premio Nbel, en 1980. Cuando comenz, los enunciados bsicos eran:

a cada triplete corresponde un

aminocido de la cadena correspondiente a cada protena;

Grfico 4 Cdigo gentico de bacteriofago X174

se saba que el ADN del X174

contena 5.375 nucletidos;

se saba que este ADN codificaba

para nueve protenas, y tambin

se conoca el nmero de
aminocidos de cada una de ellas. Segn el cdigo de tripletes, la cantidad de ADN era insuficiente para codificar todas sus protenas; las leyes bsicas de la biologa molecular parecan ser refutadas.

Un segmento de ADN de un X174, mostrando una porcin de los genes para las protenas D y E. El gen completo para E est dentro del gen de D, que no tiene ninguna relacin con la anterior

Sin embargo la teora qued confirmada por el hecho, desconocido hasta entonces, de la superposicin de genes, en otras palabras las mismas regiones del ADN codifican para distintas protenas pero usando diferentes pautas de lecturas. [Ver Grfico 4].

NOTAS:

[1] La enzima es una protena globular -tal como se explic en la nota 12- que acelera las reacciones qumicas, cada enzima lo hace sobre una sustancia en particular: es un catalizador que opera disminuyendo la energa de activacin del modo necesario para una reaccin al formar una asociacin pasajera con las molculas con las que reacciona -llamadas sustrato-, tambin puede debilitar los enlaces qumicos existentes, facilitando la formacin de nuevos; como resultado, la reaccin ocurre ms rpidamente. El nombre de cada tipo de enzima est dado por el sustrato sobre el que acta + el sufijo -asa (v.gr., la sacarasa es la enzima que actuando sobre la sacarosa, cataliza para glucosa y fructuosa) [2] En 1941, el equipo formado por los cientficos Edward Tatum y George Beadle, a la sazn en el laboratorio establecido en 1909 por Thomas Morgan en la Universidad de Columbia, cuna de la gentica norteamericana, pudo establecer, sobre la evidencia de los experimentos realizados en un moho rojo del pan -la Neurospora crassa-, que las mutaciones genticas daban como resultado la prdida de la capacidad para sintetizar diferentes aminocidos. Estos experimentos, sumados a la evidencia circunstancial dada por la abundancia de ARN en el citoplasma -lugar donde se lleva a cabo la mayor parte de los procesos de sntesis de protenas-, llevaron a Francis Crick a establecer el llamado dogma central de la gentica molecular: la informacin gentica contenida en el ADN fluye hacia el ARN, el que a su vez especfica protenas , un camino de una sola va que permite afirmar la influencia del genotipo ( ADN) sobre el fenotipo, al dictar la secuencia de las protenas; sin embargo, stas no alteran el genotipo, es decir, las protenas no envan instrucciones al genotipo. La excepcin al dogma central es un proceso conocido como trascripcin inversa, en la cual la informacin codificada por ciertos virus de ARN se transcribe a ADN. [3] Los aminocidos son cidos en los cuales uno o ms tomos de carbono tienen un grupo amino (derivado del amonaco en el que uno o ms tomos de hidrgeno se han sustitudo por radicales hidrocarbonados), de los 70 conocidos, slo 20 se encuentran en las protenas y ellos son:
no polares polares de carga + de carga alanina valina isoleucina leucina metionina fenilalania prolina triptofano asparagina cistena glutamina glicina serina treonina triosina arginina lisina histidina ac. asprtico ac.glutmico [Ver Cuadro2 -en el texto- para sus frmulas qumicas]

[4] Un conjunto de tripletes dispuestos linealmente a lo largo del ADN y transcriptos secuencialmente en una sola operacin constituye una unidad de trascripcin u

opern. [5] Por ejemplo, el mismo ARNm nuclear es procesado en las clulas de la glndula tiroides de modo tal que traduce a la hormona peptdica calcitonina, y en las de la glndula pituitaria, el engrosado, que elimina cinco intrones -incluyendo uno que en la tiroides se retena como exn-, traduce a una hormona diferente: la CGRP