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Fac.

Veterinaria

PUBMED
Es una de las bases de datos bibliogrficas ms completas en el rea biomdica. Cubre las reas de medicina, oncologa, enfermera, odontologa, veterinaria, salud pblica y ciencias preclnicas. Permite el acceso a la base de datos Medline, compilada por la NLM (Nacional Library of Medicine), complementada con otras bases de datos como preMedline (citas enviadas por los editores), Genbak y Complete Genoma. Contiene ms de 15 millones de referencias bibliogrficas de artculos de revista, con una cobertura temporal desde 1950 y se actualiza diariamente. Medline contiene subbases: AIDS, Bioethics, Cancer, Complementary Medicine, Core Clinical Journals, Dental Journals, Dental Journals, Nursing Journals, PubMed Central que pueden consultarse individualmente pulsando la opcin Limits y seleccionando Subsets. BUSQUEDA EN PUBMED Esta base de datos nos da la opcin de buscar desde la pantalla principal en una sola ventana de bsqueda o acceder a la Bsqueda avanzada.

Ventana para introducir bsqueda

Bsqueda avanzada

Para cualquier bsqueda necesitaremos conocer los operadores booleanos y el truncamiento Cmo utilizar los operadores booleanos? Los operadores booleanos establecen las relaciones entre los trminos cuando elaboramos una estrategia de bsqueda. Distinguimos tres operadores bsicos. AND El sistema recupera los artculos en los que aparecen todos los trminos que hemos escrito unidos por el operador AND. P.Ej. Obesity and Diabetes recuperar los artculos cuyo registro contenga los dos trminos

OR El sistema recupera los trminos unidos por OR tanto si estn los dos juntos como si estn separados. P.Ej. Obesity OR Diabetes recuperar los artculos que traten de obesidad, de diabetes y de obesidad relacionada con la diabetes. Lgicamente, el nmero de artculos recuperados es mucho mayor. NOT Este operador elimina el segundo trmino de la bsqueda. P.Ej. Obesity NOT Diabetes recuperar los artculos que traten de la obesidad pero no relacionada con la diabetes. Uso del parntesis PubMed entiende los operadores booleanos en la ecuacin de bsqueda de izquierda a derecha. El uso del parntesis nos permite relacionar un trmino con cualquiera de los que estn incluidos en el parntesis. Por ejemplo

En este caso encontraremos los artculos que contengan el trmino caballo y el trmino anemia en cualquiera de sus dos variantes ortogrficas. Si no se hubiese utilizado el parntesis el sistema habra unido los trminos horse y anemia y en segundo lugar habra buscado todos los registros que contuviesen el trmino anaemia Otra forma de bsqueda es mediante truncamiento Para bsquedas ms amplias. Se aade a la raiz de la palabra que buscamos un asterisco * . De esta forma el sistema buscar las palabras que tengan esa raiz. P. Ej. Cardio* encontrar las palabras que comiencen por Cardio- (cardiology, cardiovascular, cardiopathology...)

Ventana de bsqueda en la pgina principal Para iniciar la bsqueda en PubMed introducimos el/los trmino/s o frase buscada en el formulario de bsqueda y pulsamos Go. Si introducimos varios trminos o un concepto compuesto por ms de una palabra, PubMed combina automticamente los trminos con AND. Si queremos buscar una frase exacta, la escribiremos entre comillas.

Buscar por un campo concreto Cada campo de un registro bibliogrfico se identifica con una etiqueta de dos o ms letras (identificadores de campo). Si queremos buscar en un campo concreto desde la pgina principal, debemos aadir a continuacin del trmino el identificador de campo entre corchetes [ ] En este tipo de bsqueda el identificador de campo se puede escribir indistintamente en maysculas o minsculas y tampoco importa si hay espacio o no entre el trmino y los corchetes. P.Ej. Tuberculosis [TI] AND nunn [AU] Los identificadores de campo ms frecuentes son: [ALL] Todos los campos [AU, AUTH] Autor [TI, TITL] Palabras del ttulo [TA, JOUR] Nombre de la publicacin (revista) [MH, MESH] Trmino Mesh. Los trminos Mesh es vocabulario controlado (Tesauro) de trminos biomdicos que se usan como descriptores de cada artculo. [PS] Nombre personal Busca artculos sobre un individuo como tema [TW,WORD] Palabras del texto Recupera artculos en los que el trmino elegido aparece en titulo, resumen, trminos Mesh, subencabezamientos, nombres de substancias qumicas, nombre de persona como tema y campos de identificacin secundaria. [LA, LANG] Idioma. Idioma en el que se public el artculo

Bsqueda avanzada La finalidad principal de esta bsqueda es combinar varios campos a la vez pero ofrece todas las posibilidades de las pestaas que encontramos en la pantalla principal, excepto Clipboard (Lmites, ndice, historial y detalles)

En la pantalla de bsqueda avanzada, encontramos: 1. Uso de Details

La opcin Details, presente en la visualizacin de resultados, permite ver la estrategia de bsqueda en la forma en que fue traducida por el mapeo automtico de trminos. Puede guardar o editar la estrategia.

Se puede guardar desde el botn URL que nos muestra la direccin de Internet que contiene la estrategia de bsqueda y luego guardarla como favorito o bookmark

2. Historial de bsqueda Vemos todas las bsquedas que ya hemos realizado con acceso a los resultados

3. Formulario de bsqueda Posibilidad de buscar por campos y combinarlos. Si est marcado All of these combinar los trminos con AND Si est marcado Any of these combinar los trminos con OR Add more citation Search fields nos permite aadir nuevos campos a la bsqueda. Por defecto nos aadir los campos de ttulo, volumen, nmero y pginas de la publicacin

Posibilidad de aadir nuevos campos

Los campos que pueden tener ndice (autor, ttulo de publicacin, idioma, autor corporativo ), lo encontramos en el propio campo de bsqueda pulsando en Index En el caso concreto de autores si buscamos un autor concreto debemos escribirlo entre comillas Smith AT. De otro modo si elegimos el trmino Smith A. para nuestra bsqueda encontrar todos los autores que que tengan una A en sus iniciales.

En el caso de los ttulos de revista, la introduccin de un trmino del ttulo de la publicacin har que la base de datos nos d informacin sobre las revistas que tienen ese trmino en su ttulo

4. Establecer LIMITES Los lmites de autores, publicacin o fecha los establecemos en la bsqueda por campos. En el caso de la fecha de publicacin la pestaa de la pgina principal nos permite otras opciones que la bsqueda avanzada

Limitar la fecha de publicacin del artculo Limitar la fecha en que el artculo se aadi a PubMed

En ambos casos un men desplegable nos permite elegir periodo de tiempo entre los ltimos 30 das y los ltimos 10 aos, o bien elegir una fecha concreta en Specify date range.

Esta opcin nos permite limitar la fecha a dos aos, o dos fechas, concretas

Los lmites de la bsqueda avanzada, nos permiten limitar los siguientes conceptos

Full text, Free full text and Abstract Permite acotar la bsqueda a los artculos que estn a texto completo, a texto completo gratuito o que proporcionen resumen. En el primer caso lo ms habitual es que el enlace a texto completo nos de informacin de dnde adquirir el artculo. Human or Animal (Humanos o Animales). Permite la seleccin del grupo en estudio Gender (Gnero). Puede limitar los estudios humanos por gnero (maculino o femenino) Language (Idioma). Nos permite elegir el idioma original del artculo. Subsets (Subtemas). El men desplegable de Subsets permite limitar la bsqueda a diversos temas concretos contenidos en PubMed. Las opciones son: Core clinical Journals: Seleccin de articulos aparecidos en revistas relevantes para la prctica mdica Dental Journals: Limitar la bsqueda a revistas incluidas en el Index to Dental Literatura

Nursing Journals: Limitar la bsqueda a revistas de enfermera incluidas en el Internacional Nursing Index. AIDS: Localiza referencias sobre el SIDA Bioethics: Limita la bsqueda a la tica, cuidado de salud e investigacin biomdica. Cancer: Limita la bsqueda al campo de la oncologa. Incluye las referencias de la desaparecida base de datos CancerLit del National Cancer Institute. Commplementary medicine. Lmita la bsqueda al campo de la medicina complementaria History of medicine. Restringido a la Historia de la medicina. Space Life Sciences: Lmita a las Ciencias del Espacio. Elaborado por la NASA. Systematic reviews: Limita a artculos de revisin Toxicology: Limita la bsqueda a artculos sobre toxicologa, efectos farmacolgicos, bioqumicos y fisiolgicos de medicamentos y otras sustancias qumicas. OldMedline: recupera referencias bibliogrficas desde 1959 hasta 1965 PubMed Central: Coleccin digital de artculos gratuitos a texto completo suministrado por las editoriales

Type of article (Tipo de artculo). Permite limitar la bsqueda segn el tipo de estudio publicado

Ages (Edades). Permite seleccionar un grupo de edad especfico en los estudios humanos

5. Indice por campos

Es otra forma de acceso a los ndices igual a la pestaa Indice/preview de la pgina principal

Elegimos el campo y en la ventana de bsqueda escribimos el trmino que queremos buscar y al pulsar Index nos mostrar el trmino tecleado y los que le siguen en la lista. Podemos elegir el trmino que deseemos y pulsando Preview o AND lo aade a la estrategia de bsqueda. Se pueden aadir diversos trminos con el operador booleano que elijamos. Si se quieren seleccionar varios trminos lo haremos mediante la tecla control.

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Visualizacin de los documentos encontrados Una vez realizada una bsqueda el sistema nos permite visualizar los documentos encontrados con diferentes presentaciones. Por defecto presenta los datos con la presentacin de Summary. Los resultados aparecen de esta forma
Pestaa de acceso a Limites Ultimas bsquedas realizadas

Artculos relacionados

En la parte inferior del registro aparecen dos enlaces de inters. Free article in PMC Si el artculo tiene acceso al texto completo Related records. Registros relacionados

De los formatos restantes los ms habituales son los siguientes: Brief. Autor y 30 primeros caracteres del ttulo con el PMDI (N de identificacin en PubMed) Abstract. Referencia bibliogrfica, enlace con la sede del editor (si est disponible), status de la cita, ttulo, indicacin de si el artculo est en un idioma que no sea ingls, autores, direccin postal del autor, resumen (si

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est disponible), tipo de publicacin (excepto si son artculo de revista), PMDI Abstract plus. Ofrece, adems, enlaces relacionados directamente en la pantalla. Citation. Referencia bibliogrfica, status de la cita, ttulo, indicacin de si el artculo est en un idioma que no sea ingls, autores, direccin postal del autor, resumen (si est disponible), tipo de publicacin (excepto si son artculo de revista), PubMed y MEDLINE Unique Identifiers, y trminos MESH. MEDLINE Cita completa con etiquetas de 2 letras que identifican cada campo. Hay que tener en cuenta este tipo de visualizacin porque ser necesario utilizarla en caso de que queramos gestionar y controlar las referencias buscadas mediante un programa de gestin de citas. Uso de los resultados de una bsqueda Salvar resultados de una bsqueda Una vez realizada una bsqueda podemos querer guardar el resultado de sta. Elegimos los artculos que son de inters y los marcaremos en la casilla destinada a ello en el margen izquierdo del artculo.
Marco los registros que me interesan

Tenemos las siguientes opciones: Imprimir los resultados desde la opcin Imprimir desde el navegador. En ese caso mejor que estn en formato texto.

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Enviar por e-mail. Elegimos la opcin e-mail en Send to y pulsamos este botn. Elegimos las opciones (formato texto o html) y direccin de correo a la que los remitimos.

Guardar en un archivo. Para ello seleccionamos File en Send to desde el men del navegador Archivo-Guardar

Guardarlos en Clipboard Si se desean guardar resultados de distintas bsquedas se pueden ir aadiendo a Clipboard desde Send to, hasta un mximo de 500 referencias y, despus, trabajar con ellos

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La finalidad es imprimirlas o enviarlas al final. Se podrn consultar desde Clipboard en el men bajo la ventana de bsqueda. Para borrar referencias se seleccionan en Clipboard y se pulsa Clip remove desde Send to.

El Clipboard se pierde despus de 8 horas de inactividad. Las citas en Clipboard se pueden guardar e imprimir de la misma manera que las opciones de bsqueda Si lo que queremos es guardar y gestionar los resultados de sta y otras bsquedas deberemos contar con un programa gestor de citas bibliogrficas. Si es as marcaremos lo registros a exportar en un formato MEDLINE ya que este podr ser entendido por el programa. Guardamos los resultados en el Escritorio o en un archivo y despus desde el programa Endnote, Procite... lo importamos para manejarlo y gestionarlo.

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OTRAS OPCIONES DE INTERS EN PUBMED Otras Bases de Datos

El acceso a las siguientes bases de datos est disponible encima del formulario de bsqueda. Nucleotide: Secuencias de ADN del GenBank Protein: Secuencias de aminocidos (protenas) Genome: Acceso a citas y grficos del genoma completo y cromosomas. Structure: Estructuras moleculares en 3-D de la Molecular Modeling Database (MMDB) PM PubMed Central: Archivo digital gratuito de artculos de revista a texto completo. Taxonomy: Bae de datos que contiene los nombres de todos los organismos que se encuentran representados en todas las bases de datos genticas. OMIM Online Mendelian Inheritance in Man: Base de datos de genes humanos y alteraciones genticas. En el men de la izquierda nos da acceso a otras opciones de inters. De la parte que se refiere a Recursos relacionados (Related Resources) destacaremos Artculos a texto completo

Podemos hacer una bsqueda slo en artculos que estn a texto completo con acceso gratuto haciendo la consulta en PubMed Central Podemos elegir esta opcin en los Lmites a travs de Subsets o bien en el men lateral de la parte izquierda.

Servicios de Pubmed

De la parte que se refiere a Servicios de PubMed (PubMed Services) destacaremos Mesh Database, Journals Database, Single Citation, Clinical Queries y My NCBI

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Mesh Database El Medical Subject Headings (Descriptores de Ciencias de la Salud) es un vocabulario controlado de trminos biomdicos que identifican el contenido de cada artculo en la base de datos Medline. Recoge ms de 33.000 trminos en una estructura jerrquica a partir de 15 grandes categoras. Estos trminos pueden restringirse con subencabezamientos. Es til para saber los trminos que utiliza la base de datos. Nos orientar igualmente sobre trminos relacionados con el de nuestra bsqueda.

Cuando introducimos un trmino que no es MESH, el sistema nos mostrar el trmino aceptado. P. Ej. Si buscamos Mongolism, el trmino que nos mostrar como aceptado ser Down syndrome.

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Si pinchamos en el trmino ofrece una descripcin de ste, seguido de los Subheadings (Subencabezamientos que pueden acompaarle), la posiblidad de limitarlo al Major Topic (tema principal en el artculo) o bien Do not explode this term (no dividir este termino en otros ms especficos)

Desde Links aadir el trmino elegido a la ventana de bsqueda de Pubmed si as lo sealamos.

Tambin podemos seleccionar el trmino en la casilla de la izquierda y pulsar Send to Search box with AND, OR o NOT

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Para comenzar la bsqueda hay que pulsar Search PubMed

Single Citation Matcher Es de utilidad para la bsqueda de referencias concretas. Nos permite buscar en una publicacin por su ttulo, ao de publicacin, volumen... y tambin por autor y ttulo del artculo.

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Clinical Queries Es un buscador especializado que tiene incorporados filtros para diversas bsquedas especializadas: - Search by Clinical Study Category - Find Systematic Reviews - Medical Genetics Searches

Clinical Study Category Propone 5 categoras: Therapy (teraputica), diagnosis (diagnstico), etiology (etiologa), prognosis (pronstico) y Clinical prediction guides Systematic reviews Localiza los artculos de revisiones sistemticas y meta-anlisis, revisiones de ensayos clnicos, conferencias de consenso, guas de prctica clnica Medical Genetics Recupera registros relacionados con la gentica mdica. Se pueden aplicar diferentes criterios de bsqueda: diagnosis, diagnosis diferencial, pruebas genticas Journal Database Esta opcin permite buscar las revistas indizadas en PubMed por diversos criterios: ttulo, abreviatura del ttulo o ISSN (Internacional Standard Serial Number) correspondiente. Tambin podemos consultarlas por especialidades, o bien aquellas que permiten acceder al texto completo desde PubMed.

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Por ejemplo la revista Advances in Cancer Research podr localizarse por su ttulo completo, por el ttulo abreviado (Adv. Cancer res.) o por su ISSN 0065-230X Una vez recuperada una revista podemos recuperar todas las referencias que haya en ella pulsando Links y seleccionando PubMed

My NCBI
Para activar la opcin My NCBI es necesario registrarse previamente. Para ello pulsaremos Register en el recuadro de la parte superior derecha de la pgina Si ya somos usuarios registrados, para activar la opcin de My NCBI, debemos introducir nuestras claves en Sing in

Mi perfil en PubMed me permite, adems de crear las alertas de bsqueda, establecer una personalizacin

Mis bsquedas, colecciones y bibliogrfias guardadas

Mis filtros establecidos

Mis preferencias: formato del registro, marcar trminos de bsqueda

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Destacamos: 1. Guardar la bsqueda y recibir alertas

Salvar bsquedas

Una vez salvada la bsqueda, me da la opcin de crear alerta sobre la bsqueda para recibirla en el correo

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2. Establecer hasta 5 filtros personalizados Para visualizar los filtros que PubMed permite aplicar tus bsquedas . Como filtros ms utilizados aparecen: personalizadas pulsamos el icono Articles that review the literature on a subject (Artculos de revisin) Clinical trial (Ensayos clnicos) English (En lengua inglesa) English and Human (En lengua inglesa y limitado a humanos) Free full text (Texto completo gratis) Full text (Acceso web a texto completo pero puede exigir suscripcin) Humans (Limitado a humanos) Items with abstract (Artculos con resumen) Published in the last 5 years (Artculos publicados en los ltimos 5 aos)

La pestaa Browse nos permite modificar las opciones de este filtro y establecer filtros personalizados: Linkout: permite accedeer a filtros externos incluido la coleccin de revistas de una biblioteca. Para ver la relacin de Centros que han activado esta opcin, pulsar Libraries. Las opciones de acceso a los textos completos esta disponible en Miscellaneous Links: vnculos a otras bases de datos Properties: filtro por reas de inters: edades, gnero, idioma, tipos de estudio, fecha de publicacin, reas de inters (enfermera, odontologa )

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El establecer unos lmites en mi perfil permite ver en la pgina de bsqueda pestaas que nos llevan a un n distinto de resultados segn el lmite establecido. En este caso se han establecido 3 posibles lmites (para artculos a texto completo, publicados en los ltimos 5 aos y que estn en espaol.)

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