4.

Sistemas Biolgicos
Los sistemas biolgicos proporcionan un campo muy amplio de aplicacin de la
fsica, y en particular, de la fsica estadstica. Aqu voy a mencionar unos pocos
Ejemplos
1
(pero la fsica estadstica es mucho ms amplia: redes genmicas,
metablicas, neuronales, uso mittico,)
1
Para una introduccin sencilla, Mecnica estadstica i biologia molecular, de David Jou,
edicions UAB).
Macromolculas
Elasticidad entrpica
Desnaturalizacin de protenas y del ADN
Adsorcin de molculas sobre macromolculas, membranas,
Mquinas moleculares,
Membranas biolgicas
Potencial de membrana. Frmula de Nernst
Permeabilidad de la membrana segn el potencial
Fluctuaciones en el potencial de membrana
4.1 Desnaturalizacin del ADN
4.2 Membranas biolgicas
4.3 Curva de saturacin de la mioglobina. Isoterma de Langmuir
http://www.youtube.com/watch?v=4PKjF7OumYo&feature=related
4.1 Desnaturalizacin del ADN
4. Sistemas Biolgicos
Contiene la informacin para fabricar protenas
Doble hlice (el ARN tiene una hlice simple)
Cuatro letras: A, T, C, G
Puentes de hidrgeno unen las dos cadenas y
emparejan AT y CG
Esta especificidad permite la duplicacin
El esqueleto es una cadena de azcar-fosfato
Molcula de ADN
Propiedades trmicas del ADN
A cierta temperatura (o pH), los
pares de bases se desconectan
(se abren los puentes de
hidrgeno): desnaturalizacin
(AT: 67C, GC:107 C)
La fraccin abierta en funcin de
la temperatura queda reflejada en
experiencias de absorcin ptica,
Dinmica de desnaturalizacin y
renaturalizacin
Las zonas abiertas se pueden
transmitir a lo largo de la
molcula como excitaciones
solitnicas
4. Sistemas Biolgicos
Helix-coil transition
4. Sistemas Biolgicos
Helix to coil transition (melting)
N
ubctos
N
N=16 N=20
Objetivo: Modelizar 0 =
N
cbicrtcs
N
, i. e. hallar la Temperatura de transicin, T
f
, y T
H 510 Kcal/mol
S 20 25 cal/kmol
Valores experimentales para los enlaces AT, CG:
T
f
?
4. Sistemas Biolgicos
(a) Modelo ideal
Hiptesis:
+ enlaces idnticos (AT o CG) homopolinucletidos
+ no hay interacciones entre enlaces sistema ideal
+ cada enlace puede estar en dos configuraciones: abierto o cerrado
4. Sistemas Biolgicos
(b) The zipper model
Consideremos el ADN como una cremallera con N links, donde cada link slo
Puede estar en dos niveles: cerrado (con energa 0) y abierto (con energa , y
g configuraciones). Un link slo puede estar abierto si lo est el de su izquierda.
abiertos cerrados
(a) Hallar la funcin de particin del sistema
(b) Hallar el nmero medio de links abiertos
N=50
N=500
4. Sistemas Biolgicos
4.2 Membranas biolgicas
Modelo muy simplificado:
Desde el punto de vista elctrico, la membrana
celular se comporta como:
- un condensador de capacidad C (los lpidos)
- unos canales conductores R (las protenas)
- unos generadores (bombas inicas).
Queremos estudiar de forma muy sencilla el flujo de iones a travs de la membrana:
a) Potencial de equilibrio en membranas pasivas. Frmula de Nernst
Equilibrio en una membrana semipermeable,
que deja pasar unos iones y no otros.
Dadas las concentraciones a cada lado,
cul es la V que se genera, en el equilibrio?
4. Sistemas Biolgicos
V Na
+
K
+
Cl
-
otros otros+
Ext 0mV 145 5 125 30 5 mols/m3
Int -70mV 15 150 9 156 0 mols/m3
Interior y exterior son neutros, pero sobre las
paredes de la membrana hay un exceso de carga
- El Na
+
tiende a entrar.
- Para saber qu hace el K
+
hay que comparar con el potencial de Nernst y
determinar cul de los dos mecanismos gana. (k
B
=8.6210
-5
eV/K, T = 310 K)
Las membranas biolgicas no estn en equilibrio Es necesario
un transporte constante de iones bombas inicas
Condiciones elctricas de la membrana celular
Dos mecanismos intervienen en el flujo de iones:
- Diferencia de concentraciones
- Fuerzas elctricas
Nernst V= 91 mV ?
b) Canales regulados por el voltage
Los canales de les membranas son muy
especficos: Na, K, Ca, H,
Adems, estos canales se abren o se cierran
en funcin del voltage a travs de la membrana
(importancia en el impulso nervioso/potencial de
accin)
4. Sistemas Biolgicos
4. Sistemas Biolgicos
c) Permeabilitat duna membrana cellular. Canals regulats pel voltatge.

Imaginem una protena globular amb un canal que la travessa diametralment. Quan el canal s
parallel al pla de la membrana, est tancat (i), i quan el canal s perpendicular al pla de la
membrana, el canal est obert (ii). La molcula t un moment dipolar elctric p, perpendicular a
la direcci del canal, que interacciona amb el camp elctric de la membrana (H= pE).
Suposem equilibri trmic:






(a) Avalueu el nombre relatiu de canals oberts i tancats quan el potencial de membrana
val V (el gruix de la membrana val d). Per tal de simplificar el clcul, imagineu que la
molcula noms pot estar en dues posicions: amb el dipol parallel o amb el dipol
perpendicular al pla de la membrana (casos (i) i (ii)).
(b) Si cada canal obert deixa passar ions segons la llei dOhm, amb una certa resistncia
R, avalueu com variar el corrent inic a travs dun conjunt de N canals a mesura que
V varia. Feu un esqueix de la grfica I-V.




p
p
(i) (ii)
d
E
4. Sistemas Biolgicos
4.3 Curva de saturacin de la mioglobina. Isoterma de Langmuir
Qu fraccin de molculas de mioglobina han adsorbido un O
2
?
4. Sistemas Biolgicos
4. Sistemas Biolgicos
Curva de saturacin de la hemoglobina.