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EPIDEMIOLOGA
CONTENIDO
Epidemiologa,
epidemia,
severidad
Desarrollo y consecuencias socioeconmicas de las enfermedades en las poblaciones de plantas plantas. . Estructura e interaccin de los elementos que intervienen en una epidemia epidemia: : hospedante, patgeno, ambiente, actividades del hombre y de los insectos en funcin del tiempo y el espacio espacio. . Patrones de desarrollo de las epidemias segn el tipo de reproduccin del patgeno, duracin, distribucin espacial y gradiente de dispersin dispersin. .
CONTENIDO
Diferentes vas de dispersin de los patgenos patgenos: : hongos, bacterias y virus virus. . Ciclo de la enfermedad, su importancia en el manejo de la enfermedad. enfermedad . Prediccin y monitoreo de epidemias epidemias. . Anlisis de datos y modelos de prediccin de epidemias epidemias. . Cuantificacin de enfermedades y visin de prdidas en lo socioeconmico. socioeconmico .
ASPECTOS A CONSIDERAR EN EL ESTUDIO DE UNA ENFERMEDAD Sintomatologa Etiologa Patognesis EPIDEMIOLOGA Control
Ciencia que se ocupa de las enfermedades en poblaciones. (Van Der Plank Plank, , 1963).
Estudio de poblaciones de patgenos en poblaciones de plantas, bajo la influencia de factores ambientales y la interferencia del hombre. (Kranz Kranz, , 1974).
EPIDEMIOLOGA
Estudio de la forma cmo los patgenos causan enfermedades en las plantas y los factores que determinan su dispersin. (Dickinson y Lucas, 1987). Estudio de los factores que afectan el desarrollo de las enfermedades en poblaciones de plantas a travs del tiempo. (Rivera Coto, 1999). Dinmica de la enfermedad en cualquier poblacin de plantas, independientemente de la severidad del ataque y rapidez con que se desarrolle. (Fry, 2002). Estudio de las epidemias de las plantas y los factores que las determinan. (Agrios, 2005).
OBJETIVOS DE LA EPIDEMIOLOGA
Analizar los factores que intervienen en el desarrollo de la enfermedad en poblaciones de plantas. Conocer los patrones de desarrollo de la enfermedad en tiempo y espacio. Estimar futuras enfermedades y cuantificar sus prdidas. Establecer estrategias de control.
EPIDEMIOLOGA
INVESTIGACIN PRONSTICO
CONTROL
(Manejo de Enfermedades)
EPIDEMIOLOGA
Cuantitativa
J.E. Van Der Plank, 1963
TRINGULO DE LA ENFERMEDAD
(Agrios, 2005)
Condiciones ambientales
Poblaciones de plantas
PIRMIDE DE LA ENFERMEDAD
TIEMPO
+Tiempo
Condiciones Ambientales
CONO DE LA ENFERMEDAD
Patgeno
Hospedante
Hombre
+Espacio
+ Ente
Bitico
Tiempo
Insectos
Condiciones Ambientales
*PRISMA
tiempo
E P I D E M I A
DESARROLLO Y CONSECUENCIAS SOCIOECONMICAS DE LAS ENFERMEDADES EN LAS POBLACIONES DE PLANTAS Tizn tardo de la papa
Hambruna
Economa de Francia y otros pases europeos basada en la industria vincola Vides europeas susceptibles al fido de las races (Dactylosphaera vitifoliae) Introduccin de varetas americanas resistentes al fido contaminadas con Plasmopara viticola
EPIDEMIA
Fenmeno mediante el cual un patgeno se disemina y afecta extensas reas de poblaciones individuales de plantas en un corto tiempo. (Agrios, 2005). Cualquier incremento o disminucin temporal o espacial de una enfermedad en un rango de intensidad entre 0 y 1 0 y 100%. (Ulacio, 2013).
1
HOSPEDANTES SUSCEPTIBLES
3
CONDICIN AMBIENTAL FAVORABLE
DEBEN COINCIDIR 5
INTERVENCIN DE ENTES BITICOS (hombre y vectores)
4
TIEMPO (necesario) Y DISTRIBUCIN EN EL ESPACIO
SUBCOMPONENTES
(Agrios, 2005).
1. HOSPEDANTE
Monitoreo
Gentica (R, Tl, S, I, E) Tipo de cultivo Ciclo del cultivo Tipo de propagacin Tipo de polinizacin Fenologa Arquitectura Densidad de siembra
Sustrato ideal
2. PATGENO
Gentica: nuevos biotipos
Monitoreo
Mecanismos de penetracin Niveles de virulencia Esporulacin (tipo y cantidad de inculo) Tipo de reproduccin (generaciones) Ecologa Dispersin (tipo) Sobrevivencia (forma y duracin)
DISPERSIN/ SOBREVIVENCIA
MEDIO Semilla (sexual/asexual) Suelo Insectos Restos de cosecha Malezas Nematodos Maquinaria/Implementos agrcolas caros Hongos Cscuta Viento Agua (riego-lluvia) Hombre Viento + Insectos HONGOS D/S D/S D/S D/S D/S D/S D/S D D D BACTERIAS D/S D/S D/S D/S D/S D/S D/S D D D VIRUS D/S D/S D/S D/S D/S D/S D/S D/S D/S D/S D D D D
Hojas
Hojas
Restos de cosecha
Clamidosporas
Rhizomorfo
Esclerocios
Suelo, races
Tallo-Races
Tallo
Transferencia de Inculo
Microesclerocios
Transferencia de inculo
VIRUS
3. CONDICIONES AMBIENTALES
CLIMTICAS -Humedad Humedad relativa -Pluviosidad -Temperatura -Radiacin solar -Velocidad y direccin del viento EDFICAS - Composicin (fsica, qumica y biolgica) - Topografa - Salinidad ALTITUD (msnm)
Monitoreo
4. TIEMPO
POCA DEL AO
Monitoreo
DURACIN Y FRECUENCIA (Temperatura y Pluviosidad) Ej. Roa del manzano (Venturia inaequalis)
Inculo primario: Peritecio Sntomas primarios Inculo secundario, ste para infectar requiere: Temperatura (6-24)C + follaje hmedo, esta condicin la adquiere con 9h a 18-24C. Predecir si hay infeccin Intensidad de la enfermedad (ligera, moderada o severa)
Lineal Aleatorio Abitica (herbicidas) Patgenos y/o vectores del suelo Abitico (Fumigaciones) Patgenos del suelo
Aparicin y duracin
ENFERMEDAD
PATGENESIS
-Perodo de incubacin
PROCESO DE INFECCIN:
-Esporulacin (Hongos)
DISEMINACIN MULTIPLICACIN
SUBCOMPONENTES
- Longevidad
TIPOS DE INCULO
INCULO PRIMARIO: Estructura de sobrevivencia del patgeno. Causa la infeccin primaria.
(Agrios, 2005)
Tipos de Inculo
PARECIDOS A HONGOS/STRAMINIPILA
Inculo Primario Phylum Plasmodiophoromycota Oomycota
Espora/estructura sexual Esporas de resistencia Oospora Micelio Estructuras vegetativas
Inculo Secundario
Espora/estructura asexual Zoosporas Esporangios Zoosporas
Tipos de Inculo
HONGOS VERDADEROS
Inculo Primario Phylum Chytridiomycota Zygomycota Ascomycota
Espora/estructura sexual Esporas de resistencia Zygospora Apotecio Peritecio Cleistotecio Pseudotecio Teliosporas Clamidosporas Esclerocios Rhizomorfos Esclerocios Rhizomorfos Estructuras vegetativas
Inculo Secundario
Espora/estructura asexual Zoosporas Esporangios Esporangiosporas Conidios
Basidiomycota
Uredosporas
Tipos de Inculo
BACTERIAS VIRUS
Clula
Completa
Partcula
FUENTES DE INCULO
Reconocimiento
Prepenetracin
CICLO SECUNDARIO
Inculo terciario Sntomas secundarios
Inculo Primario
CICLO PRIMARIO
Periodo de latencia
Inculo secundario
Fuente de Inculo 1rio estructuras de resistencia
ENFERMEDADES
CARACTERSTICAS
MONOCCLICA Pocos Lento y escaso Lento Meses-aos Meses-aos -Hongos y Bacterias del suelo -Virus
POLICCLICA Numerosos Rpido y abundante Rpido Das- semanas Das-semanas -Hongos areos -Bacterias - Virus
ENFERMEDADES
MONOCCLICA POLICCLICA
CONTROL
CICLO SECUNDARIO
Sntoma primario Fuente de inculo 2rio
Inculo 2rio
CICLO PRIMARIO
Inculo 1rio Fuente de Inculo 1rio
Inculo 1rio
CONTROL
Inculo 2rio
CICLO SECUNDARIO
Inculo 1rio
CICLO PRIMARIO
CONTROL
CICLO PRIMARIO CICLO SECUNDARIO
Sntoma primario
Inculo 2rio Fuente de inculo 2rio Inculo 1rio Fuente de Inculo 1rio
Sntoma secundario
CONTROL
CICLO PRIMARIO
Sntoma primario
TIPOS DE EPIDEMIAS
EXPLOSIVA TARDGRADA
Enfermedad
Enfermedad
50%
Tiempo ( meses )
0
Tiempo ( das )
TIPOS DE EPIDEMIAS ENDMICA Ocurre de manera frecuente, ao tras ao, de lenta diseminacin y las prdidas econmicas estn en funcin del cultivo.
Enfermedad
50%
Aos
MEDICIN DE ENFERMEDADES
La caracterizacin temporal y espacial de las epidemias requiere de mediciones cuantitativas.
INCIDENCIA Enfermedades que afecten toda la planta. Ej. Marchitez, pudriciones, Virosis - Menor error de medicin - Eficiente (rpido y fcil) - Inadecuado para estimar prdidas - Inapropiado para enfermedades con sntomas puntuales SEVERIDAD Enfermedades que afecten parte de la planta. Ej. Manchas foliares, Royas, cancros - Flexibles para propsitos analticos Desventajas - Mayor error de medicin - Menos eficiente - Requiere de transformaciones matemticas
Ventajas
MEDICIN DE ENFERMEDADES
SEVERIDAD
CUANTIFICACIN DE ENFERMEDADES
ndice de Intensidad (Infeccin): Proporcin del tejido enfermo (severidad) en relacin al total de la superficie; se expresa en porcentaje. g: grado de severidad
II=(gxf)/(NxG) x100
f: frecuencia en cada grado. N: Poblacin evaluada G: Grado ms alto establecido % de infeccin 0 hasta 20 20,5- 40 40,5- 60 60,5- 80 80,5- 100
f 25 72 85 90 60 30 =362
g 0 1 2 3 4 5
Descripcin Sana Infeccin muy ligera Infeccin ligera Infeccin moderada Infeccin severa Infeccin muy severa
Grados de severidad
II= (0x25+1x72+2x85+3x90+4x60+5x30)/(362x5) x100 II= (927/1810)x100= 51,21% Momento del muestreo la poblacin de MAZ (FASE DE FLORACIN) mostraba 51,21% de infeccin moderada DE ROYA.
Proporcin de la enfermedad
0,50
PUNTO DE INFLEXIN
FASE LOGSTICA
0,05
FASE LOGARTMICA
Tiempo
MODELOS MATEMTICOS
PATGENOS POLICCLICOS
PRODUCCIN DE INCULOS
q
pendiente= qk
qt+t =qt+qt+k(T) q =q e kt q0
t
1,
x
pendiente=xr(1-x)
ln [1/(1-x)]
Pendiente= QR
ln [x/(1-x)]
Pendiente= r
r m= ln 1/(1-x)
r= ln x/(1-x)
DETERMINACIN DE LA TASA DE PROGRESO DE LA ENFERMEDAD (r) x = xo.ert lnx = r.t+ln.xo r = (1/t) (lnxln xo) Ecuacin logstica R = [1/(tf-to) (lnx/1-n) lnx/(1-xo)] Otra forma de determinar (r) Regresin lineal rm = ln/(1-x) r = lnx/(1-x)
Transformacin
7
t 10 20 30 40 50 60
ln (1/(1-x)
l n[ 1 / ( 1 x ) ]
6 5 4 3 2 1 0
10
20
30
40 t
50
60
70
rm = 0.076/57
r = 0.0013 UFC/da
0.47 UFC/ao
Transformacin t 10 20 30 40 50 60 70 x .01 .04 .15 .31 .65 .88 .94 ln (1/(1-x) -4.60 -3.18 -1.73 -0.80 0.62 1.99 2.75
l n[ x / ( 1 x ) ] 7 6 5 4 3 2 1 0 10 20 30 40 t 50 60 70
r = 0,12 UFC/da
43.8 UFC/ao
TASA DE PROGRESO DE ENFERMEDAD (r) sugiere Medidas de control Si r tiene un valor bajo: *Rotacin de cultivo *Fumigacin del suelo antes de la siembra *Destruccin de restos de cosecha *Uso de material de siembra certificado *Eliminacin de plantas enfermas, malezas y material silvestre. *Destruccin de hospedante alternos *Arado profundo y quema de rastrojo Si r tiene un valor alto: *Tratamiento qumico a la semilla y al suelo. * Seleccin de variedades resistentes.
MODELOS
Evaluacin de la cantidad de inculo inicial (considerando su fuente de inculo) Monitoreo de la condiciones climticas favorables para el inculo secundario (temperatura, humedad relativa y tiempo) Prediccin basada de la cantidad de inculo primario y secundario Permite decidir tipo de control y su aplicacin El anlisis matemtico permite: Obtener conclusiones de la dinmica de enfermedad Prediccin de comportamiento de enfermedades futuro. Estrategias para el control a aplicar Evitar o minimizar el riesgo de prdidas en el cultivo.
la a
CARACTERSTICAS DE LOS MODELOS Poseer metas bien definidas Vlidos y precisos Simples y lgicos Matemticamente correctos Con habilidad para predecir
(Kranz y Royle, 1978)
SIMULACIN DE EPIDEMIAS
EPIDEM EPICORN EPIVEN EPIDEMIC LAWSS BLITECAST Tizn temprano del tomate por Alternaria solani Tizn del sur del maz por Drechslera maydis Roa del manzano por Venturia inaequalis Roya amarilla del trigo por Puccinia striiformis Mildi polvoriento en uva por Uncinula necator
Tizn tardo de la papa por Phytophthora infestans
Ejemplo de Modelo
Modelo desarrollado utilizando Modelado Emprico Universidad Estatal de Pennsylvania y Ohio (EEUU)
Produccin de mapas de riesgo de la enfermedad fusariosis de la espiga de trigo (Fusarium graminearum) con resolucin para la regin del orden de los 20 km, disponibles mediante Internet.
(De Wolf et al., 2005)
Herramienta de uso pblico a travs de Internet, para la prediccin de la fusariosis de la espiga de trigo (Fusarium graminearum).
La interfaz grfica (diseada por el Centro de Informtica Ambiental del Estado de Pennsylvania) muestra los mapas de riesgo diario de la enfermedad para 23 estados al este de las Montaas Rocosas.
SISTEMAS PREDICTIVOS
Computadoras con sensores que monitorean y obtienen datos en el campo de: *Temperatura (C) *Humedad Relativa (%) *Tiempo de roco *Precipitaciones (mm) Las enfermedades que poseen programas de prediccin se les analiza los datos automticamente y se les estima: *Intensidad *Frecuencia *Severidad Con el fin de evitar la infeccin o en su defecto aplicar medidas de control.
BACTERIAS
VIRUS
Combinacin: Patrn susceptible (Citrus aurantium) + presencia del fido (Toxoptera citricida) + Condiciones ambientales favorables origin necrosis en el floema provocando la muerte de la planta.
EPIDEMIOLOGA
Requiere: Recoleccin de informacin edafo-agroclimtica de la zona en produccin Trabajo en campo Clculos matemticos
GRACIAS