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Strasbourg, le 8 novembre 2013 [files45f_2013.

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CONVENTION RELATIVE LA CONSERVATION DE LA VIE SAUVAGE ET DU MILIEU NATUREL DE L'EUROPE Comit permanent 33e runion Strasbourg, 3-6 dcembre 2013

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Visite sur les lieux

LAPRON DU RHONE (ZINGEL ASPER) DANS LE DOUBS (FRANCE) ET DANS LE CANTON DU JURA (SUISSE)

RAPPORT DE LEXPERT

Document tabli par Mr J-C Philippart, Universit de Lige

This document will not be distributed at the meeting. Please bring this copy. Ce document ne sera plus distribu en runion. Prire de vous munir de cet exemplaire.

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TABLE DES MATIERES


Introduction A. Situation biologique et statut de conservation B. Elments daltration de la qualit de lhabitat de lapron et impact des menaces prsentes par le plaignant. Analyse critique. C. Stratgies de conservations de lapron en France et Suisse et D. Propositions/Recommandations E. Rfrences bibliographiques F. Annexes 28 31 34 3 3 12

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INTRODUCTION
La mission dexpertise a permis de visiter diffrents sites sur le Doubs aussi bien sur le secteur frontire (Maison Monsieur) que sur le secteur jurassien (en amont de St-Ursanne) ainsi que diffrents sites sur la Loue (affluent du Doubs) Ornans et Quingey. Nous avons rencontr un grand nombre de personnes concernes de prs ou de loin par le problme de lapron et appartenant aux Administrations publiques, quelques reprsentants du monde de lenseignement suprieur de la recherche et aux Groupes de dfense de lEnvironnement et de Pcheurs porteurs de la plainte. Conformment au mandat, notre mission a port sur les points suivants: valuer la situation biologique et le statut de conservation de lApron du Rhne dans la rgion du Doubs (France) et dans le canton du Jura (Suisse) ; valuer limpact des menaces pesant sur lespce prsentes par le plaignant, y compris leffet synergique de ces menaces ; discuter avec les autorits comptentes ainsi quavec les ONG concernes et autres acteurs appropris, les stratgies globales de conservation de lApron du Rhne, les dfis existants ainsi que les mesures additionnelles mettre en uvre par les Parties ; dvelopper des propositions/recommandations soumettre aux Parties, afin damliorer la conservation de lespce. Notre rapport comprend 3 parties : Une premire partie (A) prsente succinctement les donnes sur ltat des populations et ltat de conservation de lapron dans deux ensembles gographiquement spars au sein du bassin du Doubs : le Doubs frontire et la boucle jurassienne et, titre de comparaison, la Loue, affluent du Doubs en France. Une deuxime partie (B) propose une analyse critique des principaux facteurs daltration de la qualit de lhabitat de lapron qui, selon le point de vue des plaignants, constituent une menace pour les populations actuelles du Doubs sur le territoire de la Suisse. Cette analyse examine aussi les propositions damnagements cologiquement les plus appropris au sauvetage de lapron. Une troisime partie (C) donne une brve analyse des stratgies et une liste de quelques propositions/recommandations pour amliorer la conservation de lapron.

Nous intervenons dans ce dossier comme scientifique biologiste spcialis en cologie et biodiversit des poissons spcialement concern par les problmes de conservation et beaucoup moins comme expert en gestion et puration des eaux, amnagement durable du territoire ou questions juridiques.

A. SITUATION BIOLOGIQUE ET STATUT DE CONSERVATION


1. Prsentation gnrale de lapron (Zingel asper), famille des Percidae
(sources: (12), (16), (19)) 1.1 Rpartition gographique (fig. 1, 2) Lapron est une espce endmique au bassin du Rhne qui couvre principalement la France et une partie de la Suisse. Selon les dernires tudes (7), on trouve lapron vers le Sud dans les bassins franais de la Durance, de lArdche et de la Drome et vers le Nord dans le bassin franco-helvtique du Doubs. Dans ce bassin du Doubs deux cours deau sont concerns : la Loue, principal affluent du Doubs en France et le Doubs lui-mme dans sa boucle jurassienne. Le linaire de cours deau occup par lapron de nos jours dans lensemble du bassin du Rhne ne reprsente plus quenviron 10 % (240 km) de ce quil tait au dbut des annes 1900 (2200 km). 1.2 Ecologie Lapron occupe un habitat constitu de cours deau frais, dune certaine importance (dbit > 5 m3/s) eau courante, structure gomorphologique diversifie (alternance de radiers et de plats et

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profonds) avec un fond de galets et graviers correspondant typologiquement la zone ombre/zone barbeau selon la classification de Huet. Lapron : est un poisson de petite taille au stade adulte (maximum 22 cm) avec une esprance de vie de 3-4 ans ; se reproduit en mars-avril quand la temprature de leau atteint 11-14C, en dposant ses ufs collants sur un fond de cailloux en eau courante peu profonde (radier) ; se nourrit dinvertbrs (insectes) aquatiques et prsente un comportement benthique plutt nocturne est relativement peu mobile sauf des priodes de lanne o certains individus peuvent effectuer des dplacements substantiels vers lamont (recherche des frayres) et vers laval ; se caractrise par une assez large tolrance aux conditions naturelles du milieu (temprature, pH, degr de minralisation-conductivit) mais est sensible un certain niveau de pollution physicochimique de leau (indice de polluo-sensibilit selon Verneaux (20) de 3,5 sur une gamme de 3 8, juste aprs lombre) ; est une espce dont le dnombrement est difficile par pche llectricit (occupation dhabitats en eau profonde) et ncessite lutilisation de techniques spciales comme la plonge subaquatique pendant le jour ou la nuit et la prospection nocturne pied la lampe frontale en priode deau trs claire et basse.

Dans son habitat vivent aussi des Salmonids comme laTtruite commune et lOmbre commun, des Cyprinids rhophiles comme le Barbeau, la Vandoise (+ Blageon), le Chevaine et lAblette spirlin ainsi que les espces daccompagnement de petite taille comme la Lamproie de Planer, le Chabot, le Vairon et la Loche franche. 1.3 Statut de protection Catgorie UICN CR En danger critique dextinction depuis 1966 ; Convention de Berne du 19 septembre 1979 : Annexe II Espce strictement protge ; Directive Habitat Faune-Flore n 92/43/CEE de lUnion europenne : Annexe II (espces dont la conservation ncessite la dsignation de zones spciales de conservation) et Annexe IV (ncessite une protection stricte) ; Espce menace dextinction au niveau national suisse (OLFP), Degr de priorit :1 (priorit trs leve), interdiction de capture selon lgislation suisse (OLFP) ; Espce protge menace dextinction en France daprs Arrt du 9 juillet 1999.

2.

Elments de prsentation gnrale du Doubs (fig. 3)

Le cours du Doubs (453 km ; source Mouthe, France, 945 m) est constitu par le Haut Doubs franais, le Doubs frontire (43 km) et la boucle jurassienne ou Clos Doubs (29 km) laquelle succde une partie situe entirement sur le territoire franais jusqu son embouchure dans la Sane VerdunsurleDoubs. La figure 4 montre le profil en long du Doubs frontire, fragment par trois importants barrages hydro-lectriques, et celui de la boucle jurassienne. . Dans sa partie aval (sur territoire franais), le Doubs reoit comme affluent la Loue dont la source est une rsurgence alimente par une perte karstique du Haut Doubs.

3.

Etat actuel de conservation de lespce dans le Doubs frontire et jurassien

Une caractrisation dtaille de ltat des populations de lapron est en cours depuis 1994 dans la boucle jurassienne du Doubs et depuis 1997 dans le Doubs et la Loue en France ainsi que dans le Doubs frontire. La liste des travaux est reprise dans les tableaux 1 et 2.

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3.1 Rpartition gographique Si lon considre lensemble des recensements par diffrentes mthodes effectus depuis l999, laire de distribution actuelle de lapron couvre un linaire de rivire d une vingtaine de kilomtres (fig. 4, et fig. 5 a), entre, lamont, la station de Soubey et, laval, la station de Bellefontaine, avec une concentration des observations maximales dans un secteur de 10 km, Saint-Ursanne (voir photo 1 pour illustrer des habitats caractristiques). Cette zone de Saint-Ursanne constitue pour lapron un vritable sanctuaire et vient dailleurs dtre intgre (2012) dans le rseau Emeraude du Conseil de lEurope (site n 2 Saint-Ursanne) pour la Suisse. Des prospections effectues partir de 1999 laval et lamont de ces limites nont rvl aucune capture alors que la prsence de lespce y tait atteste antrieurement des poques relativement rcentes : annes 1989 1995 pour la partie infrieure de la boucle jurassienne entre laval de Bellefontaine et la frontire franco-suisse Brmoncourt (F) ; annes 1988-1995 pour la partie amont de la boucle jurassienne jusqu la limite du Doubs frontire ; annes 1988-1995 pour la partie infrieure du Doubs frontire jusqu proximit de la station de Goumois, point de signalement de lapron historiquement le plus en amont dans le Doubs en 1930 (16)

Daprs ces donnes couvrants la priode 1999-2012, laire actuelle de rpartition gographique de lapron sur le territoire de la Suisse reprsente encore en linaire une vingtaine de km, soit environ 2/3 de ce quelle tait dans les annes 1988-1995, situation qui refltait probablement assez bien la rpartition historique de lespce par rapport ses exigences d habitat. On est donc dans une situation de rgression de laire de distribution surtout par lamont et par laval. La boucle jurassienne du Doubs est le seul milieu aquatique du territoire helvtique qui abrite lapron du Rhne (fig. 5 b). Cest de plus la population la plus septentrionale de lespce, ce qui est en fait une ressource de biodiversit gntique particulirement importante prserver. Il faut signaler que dans le Doubs entre sa sortie de Suisse Brmoncourt et son embouchure dans la Sane, aucun apron na t signal rcemment selon la dernire enqute en 2012 par Bonnaire (5) alors que lespce se rencontrait dans lentiret de la rivire vers 1900 (21). Sa disparition apparemment complte (sous rserve de la redcouverte de poissons la suite de nouvelles campagnes de prospection engages ou programmes en France) des 300 km du Doubs franais daterait du dbut des annes 1980 (21). Cest seulement dans la Loue que lon trouve encore lapron et ltat de cette population est dcrite succinctement dans le tableau 3, dans un but de comparaison avec la situation observe en amont de Brmoncourt. 3.2 Abondance de la population Lors dun recensement intensif par observation visuelle (lampe frontale + plonge) effectu en 2012 (5) dans des stations rparties sur un linaire de 47 km, fut observ un effectif de 52 aprons diffrents sur un linaire cumul prospect de 25,2 km (27 sites) avec une concentration en deux noyaux de populations : i) une grande majorit (n=45) dans un tronon non fragment par des seuils dune dizaine de km en amont du seuil infranchissable de Saint-Ursanne, soit une densit estime 2 individus/ha (quivalent environ 0,8 ind/100 m) et ii) un effectif de 6 aprons dans un court tronon en aval du seuil de Saint-Ursanne, ce qui correspond une densit de 5,7 aprons/ha (quivalent environ 2,4 ind./100 m). Dans le meilleur tronon de la Loue, la densit moyenne en aprons est prs de 10-15 fois plus importante (11 ind/100 m) que dans la boucle jurassienne du Doubs (voir tabl. 3 et fig. 7 et 8). Sur la base des chiffres de ltude de Bonnaire en 2012 (5), la population dapron survivante dans la partie jurassienne du Doubs est estime (marquage-recapture) au minimum 74 individus adultes. Ce chiffre est du mme ordre de grandeur que la valeur basse de la fourchette de 80-160 (2 4 / km en aval de Goumois) donne par lOFEFP en 1999 (16). En termes deffectif dmographique, lapron du Rhne se trouve dans une situation extrmement proccupante en Suisse avec seulement une centaine dindividus adultes en 2012 (si les estimations

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visuelles sont correctes). A cela sajoute le fait que certaines stations de laval ont vu leurs effectifs chuter dramatiquement comme Bellefontaine: 11 observations en 2000+2001 puis 1 en 2004, 2005,2006, 2008 et 2010 et 0 en 2011 (tude Aquarius (1)). En revanche, il semble que les effectifs sont rests relativement stables au cours des 10-15 dernires annes dans la zone de Saint-Ursanne vers lamont. 3.3 Composition par tailles et ges Lors des recensements de 2012 dans les stations de la boucle jurassienne du Doubs, la rpartition des tailles des n=52 aprons diffrents observs la lampe frontale et en plonge tait la suivante : Classes de 0-5 longueur (cm) Nombre daprons 0 (2012) (0) (2009) 5-10 0 (16) 10-15 1 (3) 15-20 47 (4) >20 4 (0) Total 52 23

La population en 2012 tait domine par les sujets de 15-20 cm au milieu de leurs 2e -3e annes de croissance. Une telle structure apparaissait comme un indice de vieillissement par comparaison des situations antrieures caractrises par une plus grande proportion de jeunes individus comme par exemple en 2009 avec 70 % de sujets 1+ de 5-10 cm. Cette variabilit interannuelle de la composition par tailles reflte une irrgularit de lefficacit du recrutement qui est un phnomne tout fait naturel dans les populations de poissons mais dont lamplitude peut tre accentue par les perturbations anthropiques du milieu, avec comme consquence possible de faire tomber la population en-dessous du minimum vital pour garantir la reproduction efficace et lintgrit gntique du stock. 3.4 Rpartition spatiale de la population selon lhabitat Daprs des relevs effectus en 1997 (1) dans un tronon de 24,5 km de la boucle jurassienne du Doubs, on trouve 35 % (8'560 m) de linaire considrs comme un habitat hydro-morphologique (profondeur, vitesse, substrat) potentiellement favorable lapron et 65 % (15'930 m) de linaire comprenant peu dhabitats favorables. 3.5 Gntique de la population Il nexiste ce jour aucune information sur les caractristiques gntiques de la population relique de lapron du Doubs en Suisse. Dans le cadre du Plan National Apron du Rhne lanc en France en 2012 (12), il a t prvue une coopration franco-suisse sur le thme de la gntique impliquant le prlvement dun chantillon dune trentaine dindividus pour la fin 2013 et leur analyse par un laboratoire spcialis franais Aixen-Provence. 3.6 Lapron dans la communaut des poissons En septembre 2011, des dnombrements des poissons par pche llectricit furent effectus dans trois stations de la boucle jurassienne du Doubs situes dans la zone de prsence possible de lapron (3). Les effectifs calculs Saint Ursanne aprs 2 passages (selon De Lury) se montaient 11 aprons par ha pour un effectif total de 4'861 poissons par ha (tab. 4) . Aucun apron n'a en revanche t captur l'amont (Les Roses) et l'aval (Ocourt) parmi un effectif calcul de 18'420 individus par ha, resp. 3'566 individus par ha. Cette proportion dmontre lextrme raret de lapron dans la communaut ichthyenne et souligne aussi, au plan mthodologique, la faible probabilit de le rencontrer dans les habitats prospects.

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Tableau 4. Effectif (abondance et biomasse par ha) estim selon la pche llectricit du 29 septembre 2011 dans le Doubs Saint-Ursanne (De Lury 2 passages ; secteur de 185 m x 42 m = 0,777 ha (source : (3). Le surlignage concerne les espces strictement protges (apron) ou protges (autres) par la Convention de Berne). Espce Nombre/ha Kg/ha ___________________________________________________________________________ Apron 11 0,48 Truite commune Ombre commun Barbeau fluviatile Chevaine Vandoise Blageon Vairon Goujon Gardon Brochet Loche franche Chabot Petite lamproie 313 313 668 120 458 748 1'630 23 3 9 335 228 2 79,04 52,86 352,06 92,65 33,94 19,82 4,96 0,48 0,11 1,74 1,01 4,29 0,01

Total 4'860 643,45 ___________________________________________________________________________ LApron du Rhne, espce endmique rare, menace dextinction en Suisse et strictement protge par la Convention de Berne est prsente dans le Doubs jurassien en mme temps que deux autres espces endmiques protges par la Convention de Berne : la Sofie ou toxostome (Parachondrostoma toxostoma), espce menace dextinction en Suisse; le Blageon (Telestes souffia) espce menace en Suisse;

On trouve aussi lapron en compagnie despces non endmiques statut de protection lev en Europe : la Petite lamproie ou Lamproie de Planer (Lampetra planeri), espce fortement menace en Suisse et protge selon la Convention de Berne ; lOmbre commun (Thymallus thymallus), espce menace en Suisse et protge selon la Convention de Berne ; lAblette spirlin (Alburnodes bipunctatus), espce menace en Suisse et protge selon la Convention de Berne ; le Chabot (Cottus gobio), espce potentiellement menace en Suisse et protge comme espce dintrt communautaire (liste 2) par la Directive Habitat-Faune-Flore de lUE.

La rgression de lapron dans le Doubs jurassien semble sinscrire dans la rgression gnralise de labondance des poissons de ce cours deau ainsi que de la grande majorit des cours deau suisses, surtout de la truite - mise en vidence par ltude Fischnetz en 2004 (22) et qui est surtout marque entre le dbut des annes 1980 et la fin des annes 1990,.

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3.7 Conclusions Avec un effectif dmographique de lordre de grandeur de 100 individus adultes, la population dapron dans la boucle jurassienne du Doubs atteint un niveau critique et pourrait steindre dans les prochaines annes. Indpendamment des mesures prendre pour tenter de rduire les menaces voques au point B qui pourraient conduire une telle situation, il apparat urgent de ragir trs court terme selon les diffrents axes suivants : rappeler aux autorits publiques mais aussi au grand public les obligations inhrentes au haut statut de protection national et international (Convention de Berne) de lespce ; faire du Doubs dans la rgion de Saint-Ursanne et de Tariche une zone de protections maximale sanctuarisation) pour lapron en liaison avec la reconnaissance rcente du Site Emeraude n 2 Saint-Ursanne dsigne pour la prsence de 4 espces de poissons protges (tableau 4). Cette forme maximale de protection (sanctuarisation) devrait impliquer la mise sous statut de rserve intgrale des habitats stratgiques pour lespce comme les frayres, aprs identification et localisation, ainsi que les nurseries et les ventuelles zones de concentration pour lhivernage. Les modalits de cette protection maximale devraient tre prcises mais il pourrait tre utile de sinspirer des Arrts de biotope en France faire de cette partie du Doubs une zone observatoire ou atelier pour effectuer un monitoring intensif selon une mthodologie inspire de celle applique en France dans le Programme National Apron qui a dailleurs prvu un volet de collaboration franco-suisse (OFEV-Aquarius) (Action n 33) quil faut mettre en uvre et renforcer ; au plan du suivi de la population dapron, faire voluer le simple monitoring quelque peu routinier vers une vritable tude de la biologie de la population impliquant le dveloppement de nouvelles mthodes de dnombrement, le recours aux techniques de marquage recapture bases sur lutilisation de marques lectroniques individuelles (puces ou pit-tag), le radiopistage des poissons pour prciser leur mobilit et leur mode lutilisation de lhabitat dans un cours deau localement profond ainsi que la localisation des frayres en vue de leur protection par mise en rserve (cf. Arrts de biotope en France) ; acqurir des connaissances sur la gntique de la population relique dapron du Doubs suisse grce la collaboration franco-suisse amorce dans le cadre du PNA franais ; une fois les rsultats gntiques obtenus, tudier de manire critique et prudente les possibilits de dvelopper, dans un but de conservation, pas (encore) de repeuplement, llevage en captivit de la souche relique de lapron de la boucle jurassienne du Doubs sur le modle des travaux mens lAquarium de Besanon (4) et dj envisags en Jura suisse (23). Mais cette perspective de captive breeding (46) ne doit pas dtourner les gestionnaires de lobjectif prioritaire et urgent qui est le sauvetage de la population sauvage et de son habitat.

Mais avant toute chose, il est ncessaire de rassembler en toute urgence un groupe dexperts scientifiques ichtyologues franais et suisses pour leur soumettre les donnes disponibles sur la population relique dapron du Clos du Doubs et obtenir leur avis sur la meilleure stratgie de conservation mettre en oeuvre chez une espce de poissons dont les effectifs sont tombs aussi bas.

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Tableau 1. Inventaire chronologique des tudes sur ltat des populations de lapron dans le bassin du Doubs en amont de Brmoncourt. De 1985 1994: ralisation de plonges subaquatiques exploratoires pour localiser les sites de prsence de lapron et les tronons de rivire potentiellement favorables. 1994-1998 : avec finalisation en 1999 (Aquarius, 1999) : ralisation dune tude approfondie visant dterminer le statut de lapron dans la boucle jurassienne du Doubs. 1985-1997: ralisation de pches llectricit cibles sur lapron dans un tronon de 12 km entre Clairbief et laval de Saint-Ursanne. Aucun apron captur malgr des conditions de pche favorables. 2000: inventaire piscicole complet par pche lectrique (Fdration Cantonale de Pche) dans la boucle jurassienne Saint-Ursanne. Capture de 6 aprons. 2000-2009 : avec finalisation en 2010 (Aquarius, 2010) : ralisation de monitoring annuel (8 annes) par plonge diurne de lapron dans quatre stations principales de la boucle jurassienne du Doubs, complts par des prospections rgulires ou ponctuelles dans des stations secondaires. 2002: implantation dune station du RHP (Rseau Hydro-biologique et Piscicole) sur le Doubs franais son entre en France Brmoncourt. Aucun apron captur. Juin-juillet 2004: prospection la lampe frontale dans 4 stations totalisant 990 m du Doubs frontire. Aucun apron captur. Septembre 2004: ralisation dinventaires piscicoles intensifs dans le Doubs frontire dans deux stations potentiellement favorables lapron en amont et en aval de Goumois. Aucun apron captur. 2009: ralisation par Boismartel (2009) dun dnombrement des aprons la lampe frontale dans le tronon de 30 km de la boucle jurassienne du Doubs, dans un tronon amont de 39 km du Doubs frontire et dans un tronon aval de 23 km du Doubs en France. Capture de 23 aprons exclusivement dans la boucle jurassienne. 2011 avec finalisation en 2012 (Aquarius, 2012), prsentation pour la priode 2010-2011 des rsultats relatifs la poursuite et lintensification du monitoring de lapron dans la boucle jurassienne du Doubs en 2010-2014. 2012: ralisation par Bonnaire (2012) dun dnombrement nocturne, la lampe et en plonge des aprons dans le tronon de 30 km de la boucle jurassienne du Doubs, dans un tronon amont de 39 km du Doubs frontire et dans un tronon aval de 23 km du Doubs en France. Capture de 52 aprons diffrents dans la boucle jurassienne. Mars 2013: dans le cadre de la mise en uvre du Plan National (franais) dactions en faveur de lApron du Rhne (PNA), publication dun rapport provisoire dactivits 2012 qui prsente des observations relatives spcifiquement la partie frontire du Doubs (en collaboration avec la Suisse).

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Tableau 2. Inventaire chronologique des tudes sur ltat des populations de lapron dans le bassin du Doubs entre la Suisse et lembouchure dans la Sane. 1960-1973 : tudes de Verneaux sur la typologie piscicole des rivires de Franche-Comt ayant impliqu la ralisation de dnombrements par pche llectricit de lapron et des autres espces. 1998-2001: Programme LIFE-Nature APRON I initi et coordonn par Rserves Naturelles de France et cltur par la publication en novembre 2001 dun Guide de Gestion pour la conservation de lapron du Rhne. 1998-1999: ralisation par le CSP (Roche et al. 1999) dune tude piscicole par pche llectricit de la haute et de la moyenne Loue. Capture de 6 aprons dans deux stations et estimation de la population 22-33 individus/km, soit environ 500 individus pour le tronon dune vingtaine de kilomtres apparemment encore colonis par lespce. 2000 et 2001: grce des prospections exploratoires la lampe, confirmation de la prsence de lapron dans les deux stations o des individus de lespce avaient t capturs en 1998 (Richard, 2003). Observation dun seul individus chaque anne dans une des deux stations. 2003: rapport CSP sur lEtat des populations dapron (Zingel asper) en rgion Franche-Comt. Volet 1. Synthse et valorisation des connaissances actuelles sur la prsence de lespce. 2004: dans le cadre du Programme LIFE Apron et du rseau Natura 2000, ralisation de prospections intensives de lapron la lampe dans 13 stations dune longueur totale de 7,5 km sur un tronon de 45,5 km de la moyenne Loue (entre Chencey-Buillon et Chisseysur-Loue). Observation totale maximale de 156 aprons d'une taille suprieure 5 cm sur un linaire de 3,4 km soit une densit de 4,6 aprons/ 100 m avec des valeurs maximales de 21,7 ind. /100 m et de 13,5 ind./100 m2 dans les stations les plus peuples. Dans le cadre du mme programme, ralisation dune prospection infructueuse la lampe dans une unique station de la basse valle du Doubs. 2004-2009: Programme LIFE-Nature APRON II coordonn par le Conservatoire Rhne-Alpes des Espaces Naturels (CREN). 2005-2006: prospection intensive de lapron dans les stations dj tudies en 2004 et dans dautres stations en amont et en aval. 2008-2010: ralisation de prospections intensives (au total n=69 dont 18 en 2008, 42 en 2009 et 9 en 2010) de lapron dans 17 stations dj tudies antrieurement.. Comptabilisation de 864 aprons. 2011: publication par le Ministre franais de lEcologie, du Dveloppement durable, des Transports et du Logement dun projet de Plan National dActions en faveur de lapron du Rhne pour la priode 2012-2016. Pilotage par CEN Rhne-Alpes. Mars 2013: dans le cadre de la mise en uvre du Plan National (franais) dActions en faveur de lApron du Rhne (PNA), publication dun rapport provisoire dactivits 2012 qui prsente des observations relatives spcifiquement la Loue (notamment dans le cadre de lObservatoire de lApron) et diffrents tronons du Doubs dont la partie transfront alire franco-suisse (en collaboration avec la Suisse). Juillet 2013: document de synthse par ONEMA (Huger et Gindre, 2013) (39) des suivis de labondance des populations de lapron sur la moyenne valle de Loue en 2008-2010 et depuis 2004.

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Tableau 3 : Aperu de ltat de la population de lapron dans la Loue, affluent du Doubs en France Rpartition gographique Dans la Loue, lapron est actuellement considr comme prsent sur un tronon de 48 km compris entre Rurey-Chenecey lamont et Arc et Senans laval (fig. 6). Le linaire encore colonis de nos jours reprsente environ 60 % du linaire de rfrence historique colonis vers 1990 et qui correspondait pratiquement lentiret de la rivire sauf le haut cours (78 km). Entre les prospections de 2007 et celles de 2008-2010, on a enregistr un phnomne trs encourageant de lgre augmentation de laire de distribution (48 km versus 43) vers lamont et vers laval explicable, en partie, par un largissement de la zone prospecte et, en partie, par une dispersion dindividus dans les deux directions partir du noyau principal de population dans un tronon allant de Chouzelot Port Lesneu. Abondance de la population Lors des prospections effectues en 2008-2010 dans 17 stations diffrentes, furent comptabiliss 864 aprons formant des populations observes atteignant des maxima de 95 aprons/100 m (moyenne : 82) 128 aprons/100 m (moyenne : 69) dans les stations les plus accueillantes. La moyenne gnrale tait de 11,4 aprons/100 m pour le tronon de rivire le mieux peupl entre Chauselot et Port Lissey. Les statistiques des prospections les plus rcentes indiquent (fig. 7) une tendance laugmentation des abondances de lapron dans la majorit des stations tudies, ce qui va dans le mme sen s que lextension de laire de rpartition. Nous ne disposons pas actuellement de toutes les informations qui permettent de proposer un chiffre pour leffectif absolu des aprons dans la Loue. Il nous manque une estimation du linaire dhabitat colonis dans le tronon de rivire correspondant laire de rpartition de lespce. Sous rserve de lobtention des informations voques ci-dessus, la population daprons de la Loue serait de lordre de grandeur de 250 500 individus adultes. Structure par tailles et ges de la population Lors des recensements entre les mois de mai et septembre 2004 dans les stations de la moyenne Loue, la rpartition des tailles des aprons observs la lampe frontale tait la suivante: Classes de 0-5 longueur (cm) Nombre (1) daprons 5-10 10-15 15-20 >20 Total

46

82

25

156 +(1)

La population en 2004 tait domine par les sujets de 5-15 cm au milieu de leur premire anne de croissance et au cours de leur deuxime anne. La raret des sujets < 5 cm ne reflte pas ncessairement un dficit de recrutement naturel mais peut sexpliquer par une faible efficacit de la mthode dobservation lgard des poissons de trs petite taille. Caractristiques gntiques Dans le cadre du Plan national dactions en faveur de lapr on du Rhne, a t lance en 2012 une tude gntique des aprons de la Loue. Sept tronons ont t slectionns pour un chantillonnage en 2012 mais, en raison des conditions hydrologiques, seulement 1 tronon a pu tre soumis un prlvement de matriel gntique sur n=30 aprons. Lchantillonnage devrait tre complt en 2013.

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B. ELEMENTS DALTERATION

DE LA QUALITE DE LHABITAT DE LAPRON ET IMPACT DES MENACES PRESENTEES PAR LE PLAIGNANT ANALYSE CRITIQUE Perturbations hydrologiques lies la production hydro-lectrique

1.

Laire de distribution actuelle de lapron dans la partie suisse du Doubs est situe en aval dune chaine de trois usines hydrolectriques sur retenue de puissance moyenne (30 MW pour le Chatelot, 12 MW pour le Refrain et 5 MW pour La Goule) (fig. 4). Le fonctionnement de ces usines hydrolectriques gnre des perturbations hydrologiques et corolairement hydro-cologiques et piscicoles qui ont t analyses par diverses tudes en France et en Suisse (voir (8), (10), EPTB (24); exposs Saint-Ursanne) et ont donn lieu quelques mesures effectives de type administratif et technique mais surtout des projets de mesures techniques damlioration de la gestion des dbits (tab.5). 1.1 Situation dans le Doubs frontire Les perturbations hydrauliques majeures qui se produisent sont de deux types : i) de trs fortes fluctuations artificielles de dbit avec des pics de 30-40 m3/s ltiage (turbinages par cluses + lchers deau des retenues) et des creux (arrts des turbinages + rtention deau dans les retenues) et ii) des conditions de trs bas dbit dans les tronons de cours deau en dbit rsiduel ou rserv court circuits par une drivation deau en conduite force. Suite un changement de gestionnaire de lusine la plus en amont, les dgradations environnementales se sont fortement accentues depuis les annes 2006-2007(14). Les hausses rapides de dbit sont susceptibles dentrainer, par effet de chasse, une dvalaison force des poissons vers des habitats ou micro-habitats moins favorables, sans oublier une accentuation de la drive des invertbrs benthiques reprsentant des ressources alimentaires. Les baisses rapides du dbit qui surviennent en conditions de turbinage normales ou exceptionnelles (incidents techniques, entretiens) provoquent des mortalits directes des poissons par chouage dans les zones peu profondes au niveau des radiers et des berges en pente douce. Ces mortalits piscicoles ont t analyses en dtail dans le Doubs frontire pendant la priode 2008-2013. Elles touchent essentiellement la truite commune, lombre, le chevaine, le vairon, la loche franche et le chabot mais apparemment pas lapron qui nexiste pas dans le milieu concern (il ny a probablement jamais vcu pour des raisons lies la typologie naturelle particulire des lieux et lexistence de seuils naturels (La Goule) empchant toute remonte). En plus de cause des mortalits piscicoles directes, les perturbations hydrauliques du Doubs entranent aussi des pertes de capacit en termes dhabitat pour les invertbrs benthiques (source de nourriture) et les poissons (10) et favorisent le dveloppement de certaines algues. 1.2 Situation dans la boucle jurassienne du Doubs Dans le tronon du Doubs jurassien encore peupl par lapron, les perturbations hydrologiques du milieu tendent sattnuer de lamont vers laval grce lamortissement des cluses et laugmentation du dbit plancher (apports dorigine karstique, petits affluents) ( Courret et Larinier, 2008). Mais selon cette mme tude, le marnage du aux cluses peut engendrer des variations de hauteur deau allant jusqu 80 cm en quelques heures la sortie de Suisse Ocourt. Survenant un moment critique du cycle de vie de lapron (alevins nouvellement clos par ex.), des h ausses artificielles de dbit de cette importance pourraient rduire lefficacit de la reproduction et du recrutement mais on ne dispose daucune information scientifique sur le sujet pourtant essentiel. Il est paradoxal de constater que laire actuelle principale de prsence de lapron entre Soubey et Saint-Ursanne correspond un tronon du Doubs influenc de manire sensible par les perturbations hydrauliques (variations de dbit et de hauteur deau) rsultant des cluses hydro -lectriques. En revanche, lapron semble avoir rgress voire tre disparu dans le tronon Bellefontaine -Ocourt, situ le plus en aval et potentiellement le moins impact par les cluses.

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La question est donc clairement de savoir si et en quoi le rgime hydrologique compltement artificiel et perturb du Doubs dans le tronon occup actuellement ou encore rcemment par lapron, pourrait impacter directement ou indirectement le bon droulement du cycle vital et la dynamique de population de lapron (comparaison avec des situations dans dautres rivires). En tout cas, ce sont dautres facteurs ngatifs qui semblent avoir jou entre Bellefontaine et la frontire franaise. Tableau 5. Inventaire des mesures prises ce jour ou envisages (programmes) pour amliorer la gestion des dbits dans le cours frontire du Doubs exploit pour la production dhydrolectricit.

A. Mesures administratives 5 fvrier 1969: Entre en application dun rglement deau commun pour organiser la gestion coordonne des ouvrages hydrauliques et hydro-lectriques dans le Doubs frontire. 29 juillet 1991 : Mise en vigueur de lAccord franco-suisse du concernant lexercice de la pche et la protection du milieu aquatique. Instauration dune Commission mixte de gestion aide dune Commission technique. 27 mai 1998 : Accord de Mache qui introduit quelques amliorations aux dispositions du rglement deau commun de 1969. 2 juin 2003 : Publication de lAccord Cadre franco-suisse et du Plan dassainissement Doubs Accord volontaire entre les diffrents partenaires concerns pour raliser des travaux damlioration des cosystmes aquatiques du Doubs. 2008: Arrangement administratif li la perspective dapplication de la Directive Cadre sur lEau de lUE la partie franaise du Doubs. 7 juillet 2010 : Les autorits franaises demandent la rvision du rglement deau commun du 5 fvrier 1969 pour la gestion coordonne des ouvrages hydrauliques sur le Doubs frontire. Il sagit pour la France de se mettre en conformit avec les obligations inhrentes la lapplication de la Directive Cadre sur lEau n 2000/60/CE de lUE du 23 octobre 2000, transpose dans le droit franais par la loi du 21 avril 2004. Le bon tat des eaux du Doubs frontire doit tre atteint au plus tard en 2015 pour ltat cologique et en 2021 pour ltat chimique. 2011 : Mise en place dune structure de gouvernance binationale pour le Doubs avec constitution dun groupe de travail Gestion des dbits qui a pour objectif damliorer la gestion quantitative de leau au niveau des trois ouvrages hydro-lectriques concerns et dentreprendre une rvision du Rglement deau commun aux trois ouvrages. Mai 2011: Prsentation des premiers rsultats des travaux dans un Rapport principal du Projet intgr Doubs franco-suisse : Etat des lieux/ diagnostic du bassin versant EPTB Sane-Doubs, 2011. B. Mesures techniques 2005 : Augmentation 2 m3/s (versus 0,25 m3/s antrieurement) du dbit de dotation (dbit rserv dans le bras de rivire court-circuit) au barrage du Chatelot. 2008 : Ralisation par Courret et Larinier (2008) dune tude pour faire le point sur les perturbations hydrauliques dorigine hydrolectrique dans le Doubs frontire et prsentation dune srie de propositions damlioration. 2010 : Dbut des amnagements au barrage du Refrain pour augmenter le dbit rserv de 0,665 m3/s 2 m3/s en 2012 avec la perspective de passer 2,7 m3/s en 2014.

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2011 : Sur la base de ltude de Courret et Larinier (2008), proposition par le Groupe binational "gestion des dbits" de divers assainissements des turbinages afin de garantir un dbit cologique suffisant en aval de la chane des 3 barrages hydro-lectriques et pour diminuer limpact cologique des fluctuations de dbit lies aux cluses. Les modifications porteront sur les lments suivants : la gestion des cluses en termes de nombre (frquence), amplitude et gradient; les dmodulations des cluses par stockage dans certaines retenues; la gestion des dbits en fin de semaine et pendant les week-ends; laccompagnement de la fin de crue ; ajustement des dbits aux besoins rels des poissons (application de mthodes de modlisation hydraulique et de la mthode des micro-habitats).

1.3 Conclusions Apporter une solution efficace et durable au problme de la dgradation hydraulique du Doubs est vraiment essentiel pour amliorer la qualit de lhabitat de la flore et de la faune et spcialement des poissons en gnral et de lapron dans son aire de prsence actuelle et de recolonisation possible dans la partie aval du Doubs frontire (en-dessous du seuil naturel de la Goule). Dans ce contexte, il est ncessaire de: acclrer la mise en place des mesures pour rduire limpact cologique et piscicole des turbinages hydrolectriques par les grandes centrales sur retenue (Chatelot, Refrain, La Goule ) sur le Doubs frontire, conformment aux obligations lgales en matire dassainissement des dbits minimaux et des cluses et aux engagements du Groupe binational "gestion des dbits" ; appliquer dans les meilleurs dlais et de manire coordonne entre les partenaires institutionnels suisses et franais et les producteurs dhydrolectricit les dispositions de rgulation des dbits prconises par le Groupe binational "gestion des dbits et actuellement en cours dexprimentation ou de conception. En cette matire, faire porter les efforts sur la fixation de dbits biologiques minimum-optimum en aval des restitutions des dbits turbins (objectif de minimum 6-8 m3/s la sortie de la chane des 3 centrales) et sur la rduction des variations des dbits lies aux cluses (maximum 5-10 cm/hr pour les gradients de baisse) ; tendre progressivement vers une organisation de la gestion des turbinages sous le contrle et la coordination dun seul intervenant industriel au lieu de trois actuellement.

2.

Cloisonnement du milieu par des obstacles physiques la remonte des poissons

Les tudes menes en France ont mis en vidence la grande sensibilit de lapron, poisson faibles capacits de nage, la fragmentation de son milieu de vie par des obstacles physiques dune certaine structure en termes de type et de hauteur de chute et de vitesse de courant. Le dcloisonnement des rivires par arasement des anciens seuils ou construction douvrages de franchissement adapts lapron est considr par les gestionnaires suisses et franais comme une mesure primordiale pour rtablir la libre remonte des gniteurs vers des frayres et assurer un brassage gntique maximal dans la population. Le cours du Doubs est fragment par plusieurs barrages-retenues et seuils artificiels qui constituent, pour la plupart, des obstacles infranchissables par les poissons en remonte et qui sont actuellement dpourvus dun ouvrage de franchissement. Lamnagement de ces obstacles pour permettre la libre circulation de lapron doit tre envisag de manire diffrente selon les tronons de rivire considrs et en fonction de la prsence actuelle ou possible dans le future de lespce. 2.1 Partie amont du Doubs frontire Les trois grands barrages rigs sur le Doubs frontire se situent en dehors de laire de distribution actuelle et potentielle de lapron. Ces obstacles bloquent totalement la libre circulation des

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poissons et leur quipement avec une passe poissons est actuellement envisag en termes de cotsbnfice (communication OFEV). 2.2 Partie aval du Doubs frontire La partie du Doubs frontire en aval du barrage de La Goule nest actuellement plus peuple par lapron mais elle comprend des habitats potentiels qui pourraient tre recoloniss lavenir aprs lamlioration des conditions hydrologiques et physico-chimiques. Ce milieu est barr par trois petits obstacles valeur patrimoniale (tab 6) dont la franchissabilit devrait terme tre amliore grce un arasement total ou partiel ou grce la construction dune passe migratoire, dans le cadre de la mise en uvre de la Directive de lUnion Europenne sur lEau en France applique un tronon de cours deau qui vient dtre propos sur la liste 2 de ceux qui doivent tre quips dun ouvrage de franchissement dans les 5 ans aprs la parution officielle de larrt. Cependant ce nest actuellement pas une zone prioritaire pour lapron. 2.3 Partie aval de la boucle jurassienne du Doubs Laire principale de distribution actuelle et potentielle de lapron est directement concerne par trois seuils (Saint-Ursanne, Bellefontaine et Ocourt) exploitation hydrolectrique effective (SaintUrsanne) ou potentielle (projets Bellefontaine et Ocourt ; tabl. 7 ; photo 3) qui ncessitent un amnagement appropri prioritaire urgent afin de contribuer la protection de lespce dans la partie jurassienne du Doubs sur un linaire de bons habitats de prs de 30 km. En ce qui concerne les dispositions lgales en matire de protection des eaux, le Canton du Jura a retenu le seuil de Saint-Ursanne dans sa planification des mesures dassainissement de la force hydraulique, notamment au bnfice de la libre circulation des poissons en gnral et de lapron en particulier. Dans ce cas, les amnagements doivent tre raliss par le concessionnaire de lexploitation hydrolectrique avec remboursement par un fond spcial (Swissgrid) . Quant aux projets de nouvelles installations hydrolectriques aux seuils de Bellefontaine et d'Ocourt, ils sont considrs comme de nouvelles installations selon la loi fdrale sur la pche et ne peuvent pas bnficier d'un remboursement par Swissgrid pour les mesures dassainissement. En ce qui concerne les dispositions lgales relatives lnergieet spcialement lnergie renouvelable dorigine hydrolectrique, le Canton du Jura na pas encore finalis de planification stratgique, ce qui implique que tous les nouveaux projets hydrolectriques sont gels. Mais cette disposition ne concerne pas les nouveaux dveloppements envisags aux seuils de Bellefontaine et Ocourt o des tudes de projet avaient t autorises antrieurement. Dans ce double contexte de protection de la faune et de dveloppement de lhydrolectricit, la Rpublique et Canton du Jura a rcemment dfini les conditions techniques de base homognes dassainissement, en faveur de la libre circulation de lapron, des seuils de Saint -Ursanne, Bellefontaine et Ocourt (30). En cette matire, les associations de protection de lenvironnement sont totalement opposes de nouveaux dveloppements hydrolectriques sur le Doubs, ce qui cre une forte situation conflictuelle et un affrontement hydrolectricit/protection de la nature et sauvegarde de lapron. (a) Cas du seuil de Saint-Ursanne (photo 3) Le projet le plus avanc est celui de Saint-Ursanne (Moulin Grillon) o lon soriente vers une passe plots disperss et macro-rugosits (30) inspir de lexpertise franaise (13) et spcialement de louvrage considr comme efficace construit en 2009 sur la Loue au seuil de Quingey (photo 2). Ce dispositif a t propos aprs refus par la commune dune premire option consistant en un chenal de contournement. Il ressort de notre visite des lieux que le projet de passe technique est nouveau remis en cause (en faveur dune rivire de contournement) par les milieux environnementalistes et par la commune (changement de majorit politique) au nom de la prservation de lintgration paysagre de louvrage dans un site de grande valeur cologique. Mais ladministratio n cantonale semble bien dcide laisser voluer le dossier dans sa forme actuelle jusqu ltape de lenqute publique. Dans lintrt de lapron, nous estimons quil est impratif de trouver rapidement une solution approprie pour rtablir la libre circulation piscicole vers lamont et disposer sur le site dune station de pigeage qui permettra dassurer une forme de monitoring de lapron dans ce tronon du Doubs

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qui se trouve depuis 2012 dans un site Emeraude et devrait idalement tre intgr dans une zone sanctuaire et laboratoire. Le fait que le seuil du Moulin Grillon Saint-Ursanne fait lobjet dune exploitation hydrolectrique soulve aussi le problme de limpact ngatif possible de lutilisation de leau pour la production hydrolectrique sur les fractions dvalantes des populations de poissons en gnral et de lapron en particulier. Cette activit hydrolectrique doit tre considre ses niveaux dintensit actuelle et future en cas daccroissement de la puissance de linstallation. Cette question est analyse au point 2.3. (b) Cas du seuil de Bellefontaine Ancien site industriel (mtallurgie) puis de production dhydro-lectricit au fil de leau jusqu 1972, Bellefontaine reprsente aujourdhui un milieu de valeur cologique exceptionnelle et un habitat potentiel pour lapron signal en aval du seuil jusquen 2010. Pour ladministration, il existe une obligation lgale de renaturation et dassainissement du seuil mais en mme temps, il est considr comme candidat une valorisation conomique pour la production dhydrolectricit. Pour les associations de dfense de lenvironnement, en revanche, il est exclu denvisager une rhabilitation hydro-lectrique du site. Lucchina (2012) (15) a rcemment procd une analyse critique de laven ir du site de Bellefontaine en considrant trois options: i) un dmantlement, ii) un assainissement impliquant lamnagement dune passe aprons et autres poissons sur le seuil et iii) un amnagement global portant sur le dveloppement de la production dhydrolectricit et le rtablissement de la libre circulation des poissons vers lamont. Option dmantlement du seuil Dans une perspective de conservation de lapron, nous estimons que la meilleure solution est certainement l'arasement du seuil car il va supprimer un obstacle infranchissable (qui par ailleurs, se trouve dans un trs mauvais tat structurel) et, en mme temps, rtablir un habitat lotique dans la zone dinfluence du seuil en amont. Mais la mise en oeuvre dune telle option soulve quelques problmes environnementaux. Dune part, le site abrite dautres espces de grande valeur cologique qui risquent de ptir du retour du milieu un tat naturel originel. On pourrait donc se retrouver dans une situation trs dlicate de concurrence entre les espces protger ! Face une telle situation, il ne serait pas illogique de considrer que lapron endmique est prioritaire sur toutes les autres espces. Dautre part, larasement du seuil risquerait de dstabiliser les berges en amont et de favoriser la remise en suspension des sdiments accumuls depuis longtemps dans le plan deau en amont du seuil et qui pourraient prsenter une certaine toxicit (mtaux lourds, HPA, solvants). Option ouvrage de franchissement seul le seuil comme Moulin il sera Cette option, aussi trs bonne pour lapron et les autres poissons, consisterait quiper dun chenal de contournement rustique ou dune passe technique plots et macro -rugosits mis en oeuvre depuis 2009 sur la Loue au seuil de Quingey et prconis pour le seuil du Grillon Saint Ursanne. Quelle que soit la technique de franchissement slectionne, ncessaire de procder quand mme un minimum de travaux de consolidation du seuil. Option micro centrale hydrolectrique et ouvrage de franchissement

Loption du couplage de la construction dune nouvelle microcentrale hydrolectrique et dun ouvrage de franchissement la remonte par les poissons est de loin la moins bonne pour lapron et les autres poissons. A la difficult dassurer de manire optimale la remonte des poissons au niveau du seuil qui sera maintenu, renforc et ventuellement rehauss, elle ajouterait tous les problmes inhrents la dvalaison des poissons. Et en cette matire, on ne pourrait la limite quadmettre lutilisation dune technologie Fish friendly voire Apron friendly pour ce qui concerne la prise deau concevoir sur le modle des prconisations par Larinier et Gomez (14) en France et /ou la type de turbine, idalement le modle VLH ou le modle Vis dArchimde . Cf Standard Greenhydro et Label Naturemade star.

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(c) Cas du seuil dOcourt (photo 3) Dans une perspective de conservation de lapron, la meilleure solution pour rtablir la libre circulation piscicole au niveau du seuil dOcourt est certainement, comme Bellefontaine, le dmantlement de louvrage. En cas de maintien du seuil, la solution alternative est la construction dune rivire de contournement ou dune passe technique plots disperss et macro -rugosits. Le dveloppement dune production hydrolectrique sur le site nest pas une option retenir pour les raisons voques prcdemment mais si cela devait quand mme se faire ce serait dans des conditions extrmement strictes dichtyophagie de la prise deau et/ou de la turbine par rapport la sensibilit de lapron (voir point 3). Tableau 6. Caractristiques des seuils sur la partie aval du Doubs frontire la limite amont de laire de distribution potentielle de lapron du Rhne

Seuil de Theusseret Goumois (CH) - Charmauvilliers (F) Hauteur de chute : 3,1 m Ancienne usine hydrolectrique arrte en 1972 Considr comme franchissable par les espces bonnes nageuses Prsence de lapron en aval signale pour la dernire fois en 1930 Seuil du moulin du Plain Pommerats (CH) - Indevilliers (F) Hauteur de chute : 1,15 au total sous la forme de plusieurs chutes successives Obstacle considr comme franchissable par des poissons bons nageurs Degr durgence damnagement moyen selon EPTB, 2011 Seuil du Moulin Jeannotat Indevilliers (F) - Pommerats (CH) Hauteur de chute : 0,6 sous la forme dun enrochement dgrad sur une partie de la largeur Obstacle considr comme potentiellement franchissable par les poissons Degr durgence damnagement moyen selon EPTB, 2011 Tableau 7. Caractristiques des seuils sur la partie aval de la boucle jurassienne dans laire de distribution effective de lapron du Rhne Seuil du Moulin Grillon Saint-Ursanne (photo 2) Hauteur de chute : 2,4 m Dbit de dotation actuel : 1,5 m3/s Dbit dquipement selon concession : jusqu 6.5 m3/s Productible : 1,3 GWh Mise en service : 1909 Autorisation provisoire dexploitation accorde le 15 fvrier 1999 Concessionnaire et exploitant : Moulin-Grillon SA Prsence de lapron en aval tablie par les dernires observations en 2012 et existence lamont dun long tronon sans obstacle trs accueillant pour lapron (populations estime n=64 individus adultes par Bonnaire (2012). Seuil de Bellefontaine l'aval de Saint-Ursanne Hauteur de chute: 3,0 m Usine hydrolectrique dsaffecte en 1972 avec perspectives de rhabilitation

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Productible estim : 8 GWh Premier projet propos jug non satisfaisant par les autorits Autorisation : aucune demande introduite Concessionnaire et exploitant : FMB/BKW Energie SA et Energie du Jura SA (SDJ) Prsence de lapron en aval : dernire observations d1 apron en 2010 (Aquarius, 2012) Le seuil du Moulin du Doubs Ocourt (photo 1) Hauteur de chute : 2,3 m Alimentation dun ancien moulin Procdure de demande de concession hydraulique en cours Productible estim : 2,2 GWh Autorisation : aucune demande introduite Concessionnaire et exploitant : Moulin Grillon SA Prsence de lapron en aval : dernires observations avant 2000 (Aquarius 2012)

2.4 Conclusion Il existe une priorit biologique absolue de rtablir la libre circulation de lapron aux niveaux des seuils de Saint-Ursanne, Bellefontaine et Ocourt. Lespace de libert de lapron en amont du seuil de Saint-Ursanne est actuellement denviron 30 km jusqu'au seuil infranchissanble de la Goule sur le Doubs frontire. Cet espace de libert serait accru de 4,8 km avec lamnagement du seuil de Saint Ursanne, Il serait en plus accru de 1,7 km et denviron 5 km avec lamnagement des seuils de Bellefontaine et Ocourt respectivement. En tout, on pourrait donc accroitre de 1/4 lespace de libert actuelle de lapron tout en favorisant la mobilit dune autre espce, le toxostome (prsent mais de plus en plus en aval dOcourt) strictement protge par la Convention de Berne et dautres espces protges comme lAblette spirlin (prsente en aval dOcourt) et le Blageon beaucoup plus abondant et rpandu, y compris dans le Doubs frontire. La priorit absolue est toutefois lamnagement du seuil de St Ursanne car il sagit en plus dans ce cas de reconnecter une population dapron de laval avec celle de lamont.

3.

Entrainement des poissons dans les turbines hydrolectriques

3.1 Nature du phnomne Lentrainement forc des poissons dans les turbines des centrales hydrolectriques es t lunanimit reconnu comme un facteur de mortalit des poissons au moment de leurs mouvements de dvalaison. Le problme se pose non seulement chez les espces amphihalines comme le Saumon atlantique (ainsi que la Truite de mer) au stade juvnile et lAnguille europenne au stade pr-adulte mais aussi chez les espces qui effectuent des migrations uniquement au sein de leau douce. Pour ce qui concerne lichtyofaune du Doubs, ces espces sont la Truite de rivire, lOmbre commun, le Barbeau fluviatile, le Chevaine, la Vandoise (et probablement le Blageon), le Toxostome et videmment aussi lapron. Daprs les connaissances actuelles, les mouvements de dvalaison chez cette espce devraient concerner plusieurs catgories de poissons : des adultes, qui aprs avoir effectu une migration vers lamont pour la reproduction au niveau dune frayre, cherchent retourner dans leur habitat dorigine (dvalaison post-reproduction) ; des poissons qui se dispersent naturellement vers laval, soit des juvniles partir des frayres et des nurseries, soit des sujets partir de noyaux de populations tabli en amont du cours deau ; des poissons de toutes tailles qui sont entrains vers laval lors des pisodes de fortes eaux naturelles (crues) ou artificielles (fortes cluses).

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3.2 Expression dans le Doubs jurassien En pratique, les risques de mortalit des aprons par passage dans les turbines hydrolectriques existent potentiellement sur le site de la microcentrale du Moulin Grillon Saint-Ursanne (6,5 m3/s prlev,) qui se situe entre deux noyaux de populations, avec une possibilit relle que limportant site de lamont alimente le site de laval en aprons dvalants. Un tel flux de dvalants risque dtre augment lavenir, toutes autres conditions gales, en cas de construction dune passe poissons pour la remonte. ! Dans le contexte dmographique catastrophique de lapron o chaque individu compte, il est urgent de prendre en compte limpact possible du turbinage au Moulin Grillon et dtudier en dtail le problme pour ensuite mettre en oeuvre des solutions appropries : arrt pur et simple du turbinage et/ou interdiction dun accroissement de son intensit; amlioration de la prise deau dans le but de la rendre ichtyocompatible au sens des propositions de Gomes et Larinier (2008)(14). 3.3 Conclusion Comme biologiste soucieux de lavenir de la biodiversit, nous estimons que la protection absolue de lapron endmique exclut tout autre dveloppement hydrolectrique sur le Doubs jurassien, notamment aux seuils de Bellefontaine et Ocourt. Si cette option radicale nest pas juridiquement applicable, il est impratif de viser un impact zro de linstallation hydrolectrique grce la mise en oeuvre des meilleures technologies de protection disponibles en cette matire, en loccurrence : i) une prise deau ichyocompatible au sens de Gomes et Larinier (2008) et/ou ii) une turbine ichtyocompatible du type VLH (Very Low Head de la socit franaise MJ2 Technologies), la Vis dArchimde ou un autre dispositif. Il est ncessaire de tenir compte du fait que de telles mesures seront aussi utiles pour les autres espces de poissons qui ncessitent une protection. Notre position concernant lhydrolectricit dans le Doubs jurassien rejoint celle des milieux environnementalistes et des pcheurs et soppose celle des autorits publiques. Mais il y va de la survie dune espce de poisson unique en Suisse et strictement protge par la Convention de Berne.

4.

Altrations du rgime thermique dans le sens dun rchauffement

4.1 Rgime thermique actuel (2002-2012) Le rgime thermique du Doubs Ocourt se caractrise par des tempratures moyennes mensuelles infrieures 20C (ligne bleue sur la fig. 8) ce qui correspond bien un milieu poissons Salmonids. Mais certaines annes apparaissent des tempratures moyennes mensuelles extrmes de lordre de grandeur de 21,2C-22,4C (juillet-aot 2003). Pour de plus courtes dures, les extrmes sont encore plus marqus : 23,5C en moyenne dcadaire (dbut aot 2003), 24,8 C en moyenne horaire (6 aot 2003) et 26,12C en maximum horaire (6 aot 2003).
Moy

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Temprature Doubs (C)

20 15 10 5 0 1 2 3 4 5 6 7 Mois 8 9 10 11 12

Figure. 8. Moyennes mensuelles pour la priode 2002-2012 des tempratures journalires moyennes (ligne bleue) et maximale (ligne rouge) du Doubs Ocourt daprs des relevs en continu (source: bafu.admin.ch)

T-PVS/Files (2013) 45 4.2 Effets dun rchauffement gnralis

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Plusieurs rapports signalent que depuis les annes 1970, la temprature du Doubs tend augmenter, notamment pendant la priode estivale (de mai en septembre) pour laquelle on dispose de longues sries dobservations sur les tempratures hebdomadaires maximales du mois le plus chaud. Daprs une tude du rseau Fischnetz en 2004 (22), la moyenne de cet indicateur Saint -Ursanne (147 km de la source, en pleine zone apron) a connu une augmentation de 2,3C entre 1970-1971 et 1999-2002 mais les valeurs de rfrence absolues ne sont pas connues. Les relevs la station OFEV dOcourt de 2003 2010 ne mettent pas en vidence un quelconque rchauffement qui, sil a eu lieu, tait probablement dj bien marqu au dbut des annes 2003. Le rchauffement du Doubs est certainement, comme dans dautres rivires, une consquence du rchauffement climatique global. Mais ce facteur sen ajoutent dautres de nature anthropognique locale et en rapport avec lutilisation et la gestion du bassin versant : apports deau plus chaude par les gouts et les stations dpuration ; rchauffement de leau favoris au niveau des retenues de tous types et importances (grandes retenues hydrolectriques ; retenues en amont des seuils danciens moulins) ; impact de la production dhydrolectricit travers le rchauffement de leau dans les tronons de rivire court-circuits avec dbit rsiduel ou pendant les pisodes de faibles dbits planchers aux cluses ; autres voir (22).

La communaut des poissons du Doubs est originellement constitue despces de poissons deau froide et fraiche dont lapron fait partie. Toute forme de rchauffement du milieu nest pas favorable ces espces mais il est actuellement impossible de quantifier linfluence ventuelle de ce facteur sur les dynamiques de populations despces aux tolrances thermiques trs variables . Dautant plus que le rchauffement de leau peut aussi se rpercuter sur dautres variables environnemental es naturelles qui constituent la composante physico-chimique de lhabitat du poisson : le taux de saturation en oxygne dissous et lquilibre de la raction de dissociation NH4+/NH3. Lanalyse de cette question pour lapron devrait utilement faire lobjet dune tude spcifique base sur des relevs en continu de la temprature raliser idalement Ocourt pour bnficier des longues sries dobservations et dans une station avec petits loggers autonomes installer le temps dune tude en amont de Saint -Ursanne, en plein dans la zone apron . En pratique, le contrle du rchauffement du Doubs est une tche difficile et de longue haleine qui doit porter sur des actions globales visant freiner le rchauffement climatique rgional et, plus marginalement sur des actions locales portant sur : lamlioration de la gestion des cluses hydrolectriques ; la suppression des petites retenues artificielles qui ont le plus dimpact au point de vue thermique; le contrle de la vgtation algale qui forme un fond de rivire sombre qui absorbe plus le rayonnement solaire quun fond de graviers clairs ; la limitation des apports directs la rivire deau dgout rchauffe ; la prservation et le dveloppement de la ripisylve pour produire de lombre.

4.3 Chocs thermiques dans la zone dinfluence des cluses hydrolectriques Lors des cluses, les turbines restituent la rivire de grands volumes deau prlevs en profondeur du lac de retenue et plus basse temprature. A dautres moments, il y a surverse aux barrages deau de surface rchauffe en t. Cela gnre des variations brusques de la temprature qui peuvent atteindre de 5 8C dans le cours suprieur du Doubs frontire. Mais ce choc thermique tend sattnuer progressivement vers laval. Daprs les donnes analyses par Degiorgi et al. (10), un cart horaire maximum de 4,8 C aux Graviers nest plus que 3,3 C La Goule lentre dans le cours jurassien et tombe 1,3C Saint-Ursanne dans la zone apron.

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Il est peu probable que des carts artificiels aussi faibles puissent influencer significativement la biologie de lapron mais cest quand mme un type de perturbation du milieu aquatique quil faut prendre en compte dans une analyse multifactorielle. Cela implique la mise en place dun programme de relev en continu (mini logger) de la temprature de leau dans la zone apron vers lamont de Saint-Ursanne. 4.4 Conclusion On doit esprer que ces perturbations du rgime thermique du Doubs seront attnues grce aux mesures de meilleure gestion du dbit en cours dtude dans le cadre du Projet intgr Doubs francosuisse (24).

5.

Colmatage des fonds de gravier (photo 4)

5.1 Nature du phnomne et consquences Le type de fond recherch par lapron au moment de sa reproduction et pendant ses phases de rsidence est constitu dun mlange de cailloux et de graviers propres bien percols par leau courante. Plusieurs rapports signalent quen beaucoup dendroits du Doubs, ce micro -habitat est souvent altr cause de son colmatage par des algues benthiques Diatomes et filamenteuses qui, de plus, favorisent mcaniquement la fixation des particules de fins sdiments provenant des rejets directs en rivire et de lrosion des sols dans le bassin versant. Au maximum de leur dveloppement au printemps et en t, quand le dbit est faible, ces vgtaux exercent une intense activit de respiration et de photosynthse qui gnre des cycles journaliers de loxygne dissous et du C02 dissous, du pH et de la concentration en azote ammoniacal sous la forme de NH4+ non toxique et de NH3 gazeux trs toxique pour les poissons des doses relativement faibles. En cas de fort dveloppement de la vgtation aquatique, ces cycles journaliers pourraient atteindre une trs grande amplitude et faire apparatre certains moments de la journe des conditions de vie perturbatrices ou ltales pour les organismes les plus sensibles : dficit doxygne dissous en fin de nuit, pH trs alcalin et haute concentration en ammoniac NH3 en fin de journe. Une analyse dtaille de ces mcanismes simpose pour tenter de comprendre ce qui peut se passer. En fin de saison, les algues benthiques dveloppes sur le fond de la rivire ainsi que les algues planctoniques ou flottantes qui proviennent des retenues hydrolectriques meurent et leur dcomposition s'effectue sur place et en aval. Il en rsulte une consommation doxygne dissous au dtriment de la concentration de cet lment dans le milieu et une production de matires azotes et spcialement dammoniac oxydable en nitrites et nitrates. Le dveloppement excessif de la vgtation benthique en rivire et planctoniques ou flottantes dans les retenues provient fondamentalement de la richesse de leau en sels minraux nutritifs dorigine terrigne naturelle en terrain calcaire (calcium, phosphate) et en nutriments azots et phosphors (milieu eutrophe ou polytrophe), souvent dorigine exogne (pandages agricoles, apport deaux uses domestiques et industrielles non pures ou pures sans traitement tertiaire). Le problme du colmatage des fonds a t analys rcemment dans le cas de la Loue (28) et lexpertise acquise dans ce cours deau pourrait certainement tre applique au Doubs. Dans le cours infrieur du Doubs, le colmatage des fonds par les algues benthiques a aussi pu tre favoris par des altrations du rgime hydrologique qui se sont produites depuis les annes 1970, savoir : i) une rduction du dbit moyen pendant ltiage, qui via la diminution de la profondeur, a augment lensoleillement sur le fond et ii) une rarfaction des crues morphognes capables de restructurer les substrats et dliminer une grande partie des fines. 5.2 Moyens de lutte mettre en oeuvre Le colmatage des fonds a pu en premier lieu rduire la superficie de bons micro-habitats benthiques disponibles pour lapron et/ou diminuer leur qualit moyenne. Il a pu aussi altrer la production de macro-invertbrs constituant les ressources alimentaires de lespce. Toutefois, vu lextrme raret de lapron dans la partie concerne du Doubs, il est difficile dimagine r que la disponibilit quantitative en fonds de gravier propres soit vraiment un facteur limitant pour lespce.

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Pour lutter contre le colmatage des fonds au bnfice de la survie de lapron et de sa restauration naturelle dans le Doubs, les principaux moyens sont : fondamentalement la rduction de leutrophisation de leau par la limitation de lexcs de nutriments (phosphore, azote) imports ; lamlioration de la gestion des dbits pour rduire les altrations hydrologiques qui contribuent au colmatage (blocage des matriaux grossiers dans les retenues + transfert accru des fines) ; envisager lorganisation, des moments adquats, de lchers artificiels deau des barrages pour gnrer des crues morphognes susceptibles de d-colmater les fonds et de les nettoyer en liminant les fins sdiments et en rendant le substrat plus fonctionnel pour lapron et notamment pour sa reproduction. Cest aussi une question de gestion des dbits exprimenter en tenant compte des capacits de rtention des barrages.

5.3 Conclusion Le d-colmatage des fonds ncessite des actions de grande ampleur qui implique, comme la restauration de la qualit de leau, une amlioration de la gestion cologique globale de leau dans tout le bassin. Elles ne peuvent tre envisages que sur le moyen et le long terme dans le cadre dune planification de la gestion de leau par les pouvoirs publics au niveau national et binational (Suisse France) dans le cas du Doubs. Tout ce quon peut demander en cette matire est une prise en compte systmatique de lexigence de protection de lapron dans toutes les politiques publiques et ralisations qui y sont associes.

6.

Altration de la qualit chimique de leau

6.1 Source des informations Ltat de la qualit chimique du Doubs dans la partie de son cours qui correspond lhabitat actuel et potentiel de lapron en Suisse (de Goumois Ocourt) peut tre apprci grce aux informations fournies par plusieurs rapports et tudes produits durant la dernire dcennie : le Plan sectoriel des eaux pour le canton du Jura (32,34) qui prsente un bilan de la situation (tabli daprs des analyses couvrant la priode 2004-2008) ; le diagnostic pluridisciplinaire des eaux de surface du bassin du Doubs neuchtelois (25) ; une synthse de ltat des lieux pour le Doubs franco-suisse tablie dans le cadre du Projet intgr Doubs franco-suisse (24) et reprenant des donnes collectes lors de la mise en oeuvre en France de la Directive Cadre sur lEau de lUnion europenne ; les rsultats de programmes danalyses spciales sur : i) les toxiques dans les sdiments et les vgtaux bioaccumulateurs (33), ii) les PCB dans les eaux en Suisse (2010) et iii) ltat des populations de poissons dans les cours deau jurassiens (22) et spcialement dans le Doubs (3).

6.2 Niveau de la pollution organique et de leutrophisation Dans la situation de 2008, les paramtres (charge en azote, carbone et phosphore) de la pollution organique dorigine domestique, agro-industrielle et agricole rvlent, selon lindicateur utilis par les services publics une qualit bonne trs bonne avec deux tendances majeures : dabord, une amlioration progressive depuis plusieurs annes grce la prise de mesures dpuration des eaux et, ensuite, une tendance gnrale une amlioration de lamont (par ex Goumois o sont concentres les principales sources de pollution organique par les apports du Haut-Doubs en France et des localits (50'000 habitants) de la Chaux-de- Fonds et du Locle en Suisse (Canton de Neuchtel), vers laval (par ex. Ocourt). Ce bilan plutt optimiste selon la mthodologie utilise doit toutefois tre quelque peu tempr par deux constats : dune part, les apprciations de la qualit chimique du Doubs sont souvent bases sur un petit nombre danalyses au cours dune anne alors que pour caractriser la qualit chimique de leau apte la vie des poissons Salmonids et non Salmonids il serait judicieux de disposer dans au moins une station de relevs beaucoup plus frquents et idalement en continu comme cela se fait

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des points frontires sur des grands cours deau internationaux (Rhin, Meuse). Il existe un projet de ce type Ocourt mais il faudrait sassurer que seront bien pris en compte tous les paramtres importants pour mesurer la qualit hydro-biologique et piscicole de leau, notamment la temprature, loxygne dissous, les matires azotes (ammonium-ammoniaque, nitrites), les substances minrales et labsence de toxiques chimiques divers ; dautre part, cette apprciation de la qualit chimique de leau ne tient pas toujours suffisamment compte de certaines formes de pollution par divers micropolluants toxiques parfois absents ou peu abondants dans leau mais fort concentrs dans les sdiments ou dans les organismes vivants fixs (algues, bryophytes) par le mcanisme de la bio-accumulation (voir point 2.6.3).

6.3 Micropolluants toxiques Une tude ralise en 2002-2003 (33) a rvl plusieurs problmes de pollution par des substances chimiques considres comme potentiellement toxiques pour la biocnose : Mtaux lourds : pollution des sdiments trs forte Saint-Ursanne (Cu et Pb) et moyenne dans dautres stations entre Soubey et Ocourt. Solvants organiques : pollution des sdiments forte Saint-Ursanne (tolune, xylne, solvants chlors) et faible Tariche (tolune) HPA : pollution des sdiments trs forte Saint-Ursanne et moyenne forte dans les autres stations Pesticides : contamination des algues et bryophytes benthiques gnralise par le lindane et lendosulfan (organochlors aujourdhui interdits dutilisation) et par lanthraquinone SaintUrsanne aval.

Il apparat que les sdiments et les vgtaux benthiques bio-accumulateurs du Doubs en aval de Saint-Ursanne sont fortement touchs par une contamination en micropolluants (dorigine rcente ou historique) susceptibles dtre toxiques pour les poissons en gnral et pour lapron en particulier. On ne peut pas exclure que ce cocktail de polluants a pu contribuer au dclin rcent de lapron vers Bellefontaine et Ocourt. Une vrification de cette hypothse simpose pour autant quelle soit techniquement possible compte tenu des rsultats danalyses disponibles. En revanche, aucune contamination par les PCB et les dioxines n'a t dcele dans la chaire des poissons analyss du Doubs jurassien. 6.4 Conclusions Les tudes menes en France dans le cadre du programme LIFE Apron nont pas mis en vidence un lien statistique quelconque entre la prsence de lapron et le niveau de qualit organique et minrale gnral de leau tabli daprs les analyses faites en routine. Mais on a quand mme observ une tendance de lapron occuper les secteurs les moins pollus en HPA. Dautres polluants connus ou inconnus doivent sans doute avoir un effet sur la biologie de lapron et spcialement sur sa reproduction. Quoi quil en soit, des mesures radicales doivent tre envisages dans les Plans sectoriels des eaux pour viter tout rejet direct dans le Doubs, de manire rgulire ou intermittente-accidentelle, de substances aussi dangereuses que les mtaux lourds et des solvants organiques comme le tolune et le xylne, utiliss dans des processus industriels bien identifiables et localisables (cf. substances dangereuses et prioritaires dangereuses dans lUE). Les HPA et les pesticides ont une origine beaucoup plus diffuse et la rduction de leur prsence dans les eaux de surface ncessite des mesures gnrales lchelle du bassin versant et portant sur la prvention et lassainissement. Une attention particulire doit aussi tre accorde aux nouveaux micropolluants comme les mdicaments provenant des eaux traites en station dpuration et les nouvelles molcules de pesticides utiliss dans lagriculture et lindustrie du bois. Dans ce contexte, il apparat indispensable de rassembler des informations dans la zone apron via un monitoring des micropolluants dans leau et les sdiments, grce notamment lutilisation de mthodes nouvelles dchantillonnage en continu (par ex le POCIS = accumulation sur membranes) et de recherche des nouvelles molcules polluantes. Cela doit faire partie dun volet dtude cotoxicologique de lApron du Doubs.

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7.

Altration de la qualit hydro-biologique de leau en termes de macrofaune benthique

Pour la situation de 2008, ltude RCJU-ENV (32) de la communaut des macro-invertbrs benthiques indique, selon la mthodologie standard utilise, une trs bonne qualit (IBGN = 17-19/20) dans les stations du Doubs jurassien, sans que lon atteigne toutefois une note maximale de rfrence 20/20 attendue dans un milieu potentiellement de grande valeur gomorphologique comme le Doubs. Il existe donc manifestement un certain dficit de qualit biologique de leau en termes de macro invertbrs benthiques. Une analyse cologique dtaille voque dans ltude (32) a rvl quentre 1970 et 2000, la communaut des invertbrs a connu une volution de sa biodiversit caractrise, dune part, par la perte de 25 % des espces originelles cologiquement les plus sensibles et, dautre part, par lapparition de nouvelles espces cologiquement moins sensibles. De plus, de nombreux tmoignages font tat dune diminution de labondance absolue des populations d invertbrs mais il existe peu de donnes quantitatives sur ce sujet difficile approcher. Dans ce contexte, il parat ncessaire de complter le monitoring en routine de la qualit de leau au moyen de mthodes du type Indice biotiques-IBGN bas sur la composition de la faune des invertbrs benthiques par de vritables tudes cologiques des communauts qui prennent en compte les caractristiques quantitatives (abondance des organismes) sur le modle de ce qui se fait avec les poissons.

8.

Impact des prdateurs, des pathognes et des toxines naturelles

8.1 Prdateurs La Truite commune est certainement un prdateur potentiel des jeunes aprons de moins de 15 cm mais la probabilit de ce type dinteraction est probablement moindre quavec le chabot, la loche franche et le vairon nettement plus abondants numriquement. Lors de la rencontre apron sur la Loue, un interlocuteur a voqu la possibilit que la forte diminution de la population de truite commune pouvait tre un facteur favorable au maintien des effectifs de lapron dans cette rivire, voire leur augmentation ! Parmi les autres prdateurs possibles de lapron, il faut signaler le Silure glane (espce nocturne comme lapron) qui est prsent dans le bassin du Doubs franco-suisse mais en effectifs apparemment trs faibles. Des dispositions devraient tre prises pour viter lexpansion de cette espce dans le milieu, notamment la faveur de la prsence de retenues artificielles, de laugmentation de la temprature des eaux et de lamnagement dchelles poissons. Limpact possible du cormoran doit aussi tre envisag. 8.2 Pathognes De fortes mortalits de poissons Salmonids (truite et ombre) mais aussi de Cyprinids (barbeau et vandoise) ont t observes dans le Doubs frontire et jurassien entre 2009 et 2011. Aucun apron na t dcouvert mort ou malade ce qui ne signifie rien compte tenu de la grande raret de lespce. La maladie sest dclare en mai 2010, juste aprs la reproduction des Cyprinids. Daprs des tudes effectues en 2010 chez la Truite commune (26), ces mortalits taient associes une saprolgniose due un agent, Saprolegnia parasitica, jusqualors inconnu dans le bassin. Daprs une tude de lUniversit de Neuchtel en 2012 (12), il sagit dune forme clonale de lespce, gntiquement peu diversifie et probablement dinstallation rcente dans le milieu suite une introduction par une voie actuellement inconnue (tourisme aquatique, oiseaux migrateurs, repeuplement en truites ?). Le dveloppement dune telle atteinte parasitaire chez les poissons du Doubs a peut -tre pu tre favorise par un affaiblissement des dfenses immunitaires cause de divers stress environnementaux mais il a fallu un agent dclencheur (hausse de temprature par ex.) quil serait utile didentifier. Lapparition dune nouvelle pathologie ltale pour les poissons du Doubs est un facteur important pour lavenir de lapron vu les faibles effectifs de la population relique. Un indispensable suivi scientifique est actuellement assur par la sous-commission technique franco-suisse de la pche

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8.3 Toxines naturelles produites par des algues cyanophyces Parmi les causes des fortes mortalits de poissons enregistres en 2010 et 2011 dans la Loue (et aussi dans le Doubs) on a incrimin le dveloppement massif dalgues bleues Cyanophyces responsables de la production de substances toxiques pour la faune. Une expertise effectue en dbut 2012 (45) na pas formellement tabli une telle relation de cause effet. Elle a soulign que les deux phnomnes, mortalit des poissons et efflorescence algale, taient probablement la consquence dune mauvaise qualit gnrale de leau de la rivire rsultant de la conjonction de plusieurs facteurs dfavorables : dbit, temprature, oxygne dissous, pH, ammoniac, nitrites, nitrates et phosphates causes d deutrophisation, micropolluants divers, pathognes. 9. Conclusion gnrale Comme on pouvait sy attendre, lanalyse qui prcde ne met pas en vidence le rle dterminant de facteurs bien identifis dans la rarfaction et localement la rgression de lapron dans le Doubs. On a affaire un ensemble de perturbations anthropiques de lcosystme (perturbation des d bits, rchauffement de leau, eutrophisation de leau, contamination des sdiments par des micropolluants, cloisonnement par des barrages et seuils, dveloppement de pathognes) qui peuvent agir simultanment de manire complexe et parfois sans doute en synergie : les baisses de dbit favorisent le rchauffement et concentrent la pollution-eutrophisation, avec un effet favorable sur le dveloppement algal et une contribution au colmatage des fonds ; laltration de la qualit de leau favorise lmergence de maladies qui touchent les poissons ; les barrages et seuils empchent les poissons de recoloniser les secteurs lamont aprs une dvalaison force suite une crue violente ou au passage dune vague de pollution.

Un autre facteur important prendre en compte est le fait que la plupart des perturbations qui affectent la partie du Doubs encore occupe par lapron viennent de lamont, quil sagisse des variations de dbit et de hauteur deau gnres par le fonctionnement des barrages hydrolectriques ou des apports de substances polluantes venant du haut bassin en France et des villes du Canton de Neuchtel. Do la difficult dapporter des solutions rapides au problme. Concernant la population mme de lapron, il faut rappeler quelle pourrait ne pl us comprendre quune centaine dindividus adultes, pour autant que soient valides les mthodes de dnombrement utilises. Une telle petite population est peut-tre gntiquement appauvrie et moins rsistante quune autre aux conditions environnementales. Elle risque aussi dtre potentiellement plus impacte par dventuels pisodes de mortalit directe due des vagues de hautes tempratures estivales, des pisodes de pollution accidentelle (usine, accident routier) par des produits toxiques ou des maladies. Finalement quand on analyse toutes les menaces possibles sur lapron, il apparat que la seule mortalit certaine, directe et quantifiable est celle associe au passage des poissons dans les turbines hydrolectriques, do la ncessit de prendre des mesures en cette matire dans la zone apron, mme si le nombre dindividus concerns est probablement actuellement trs faible au seuil de St Ursanne.

C. LES STRATEGIES DE CONSERVATION DE LAPRON EN FRANCE ET EN SUISSE


1. Elments de discussion des stratgies de conservation de lapron
1.1 Actions de lEtat franais Dans la partie franaise du bassin du Rhne et spcialement dans le Doubs et son affluent la Loue, la stratgie de conservation de lapron sinscrit dans Plan National Apron (PNA) 2012 -2016 lanc en 2011 par le Ministre de lEnergie, du Dveloppement durable, des Transports et du Logement. Ce PNA venait dans le prolongement dun vaste programme dtudes et dactions initi par Rserves Naturelles de France (RNF) et cofinanc par lUnion Europenne sous le nom de LIFE APRON I et LIFE APRON II. Ces programmes faisaient eux-mmes suite des initiatives plus limites stimules par lentre en vigueur de la Directive Habitat -Faune-Flore n 92/43/CEEde lUE reconnaissant lapron le statut despce dintrt communautaire des Annexe 2 (dsignation de zones spciales de conservation) et 4 (protection totale).

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Le PNA franais poursuit six objectifs spcifiques: Amliorer les connaissances sur lespce et tudier les impacts potentiels des us ages anthropiques ; Permettre laccroissement des populations et le brassage gntique en dcloisonnant les cours deau ; Conserver ou restaurer les habitats favorables lespce ; Sassurer de la bonne prise en compte de lespce dans les politiques publiques, documents de planification et outils juridiques ; Communiquer, informer et sensibiliser un large public ; Coordonner les actions, relayer les informations et favoriser la coopration.

Le PNA comprend 36 actions (15 dans un volet Etude, 12 dans un volet Actions et 9 dans un volet Communication). Il est pilot-coordonn par la DREAL Rhne-Alpes avec la collaboration de divers autres partenaires. Dans le bassin du Doubs, de nombreuses actions spcifiques apron ont t ralises, sont en cours ou programmes dans les prochaines annes. Elles concernent principalement lanimation dun Observatoire Apron sur la Loue pour surveiller les populations connues dapron et leur environnement puis rechercher et suivre leur extension. Dans ce cadre sont organiss de nouveaux dnombrements la lampe ainsi que des suivis de lefficacit de la passe aprons du Quingey construite en 2009 et des analyses gntiques. Il est aussi prvu de raliser des recensements par plonge subaquatique dans le Doubs en France en aval du barrage de Grosbois (site Natura 2000) proximit du Jura suisse et dans sa boucle jurassienne (avec lOFEV et le bureau dtudes Aquarius) ainsi que dans la basse valle du Doubs (site Natura 2000) prs de sa confluence avec la Sane. Les suivis 2004-2010 des populations de la Loue rvlent, comme indiqu dans le rapport technique, une tendance laccroissement dmographique des poissons et leur extension gographique, ce qui est un indice dvolution encourageante du programme de conservation et une validation par les rsultats de la justesse de la stratgie adopte. Parmi les autres actions intressantes du PNA, il faut encore souligner : i) le programme de construction dchelles poissons sur plusieurs autres barrages, ii) la poursuite des t ests de reproduction en captivit laquarium de Besanon en vue de la production de jeunes destins des repeuplements de rintroduction exprimentaux ailleurs en France et iii) lamlioration de la coopration entre la France et la Suisse sur la thmatique de la protection de lapron du Rhne, dans le cadre du Projet intgr Doubs franco-suisse (partage et valorisation des donnes, changes, mutualisation et retours dexpriences). Comme un objectif du PNA est de sassurer de la bonne prise en compte de lapron dans les politiques publiques, documents de planification et outils juridiques, on peut esprer quil en est et en sera bien ainsi dans les Plans de Gestion de lEau labors par les Pouvoirs publics franais dans le cadre de lapplication de la Directive Cadre sur lEau de lUnion europenne (recherche du Bon tat en matires de qualit chimique, biologique et hydro-morphogique des cours deau et de continuit cologique-libre circulation des poissons) et pour ce qui concerne la protection de la Nature, de la Directive Habitat-Faune-Flore et de Natura 2000. La mise en uvre de ces programmes UE dans le bassin du Doubs a constitu une occasion dassocier toutes les parties prenantes dans un projet de sauvetage de la rivire Loue et de son potentiel cologique, piscicole et halieutique (cf. les Assises de la Loue). Du fait quelles concernent aussi le Haut-Doubs et le Doubs frontire (chance 2015 pour le bon tat cologique et 2021 pour le bon tat chimique), les dispositions et mesures relatives latteinte du Bon tat des cours deau en France devraient avoir aussi des rpercussions sur les parties suisses : Doubs frontire et, en aval, boucle jurassienne. Suite une demande de la France en juillet 2010, a t mise en place une structure de gouvernance binationale qui a dbouch sur un Projet intgr franco-suisse pilot par lEPTB Sane-Doubs.

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En pratique, le PNA sur la Loue et le Doubs ne tourne sans doute pas aussi bien que ne laffirment les autorits officielles et les ONG ne manquent pas de formuler des critiques. Pour ce qui concerne ltat des populations de lapron et de son habitat, elles voquent notamment trois problmes : i) une diminution rcente des effectifs sur la base dune analyse des comptages 2004-2013 dans une mme station (voir 47) , ii) dans le mme temps, une rduction de leffort de suivi des populations rsultant du manque de moyen financiers et iii) la dgradation du milieu aquatique de la Loue sous la forme , dune part, dune pollution par lazote et le phosphore lie lintensification de lagriculture dans le bassin et , dautre part, dune artificialisation (chenalisation) dun secteur de 40 km de rivire susceptible dtre recolonis par lapron. De manire plus gnrale, elles voquent linsuffisance des efforts dans diffrents domaines, le manque de vision globale systmique et la lenteur excessive des ralisations compte tenu de la gravit de ltat de dgradation de la Loue et de sa perte de valeur cologique (biodiversit) piscicole et halieutique. Cest une situation que lon connat hlas dans beaucoup de cours deau des rgions moyennement peuples et consacres lagriculture et llevage, et cela dautant plus que lon est dans un systme karstique particulirement sensible. Comme signal dans une expertise sur la Loue (45), cette situation est le rsultat dune transformation, amorce dans les annes 1980, des modes de vie et des pratiques agricoles qui a impliqu lutilisation de pesticides (notamment pour la culture du mais) et de fertilisants, le rejet la rivire des eaux uses domestiques traites ou non et des apports croissants de polluants produits par la circulation automobile (HPA), sans oublier le rchauffement gnral des eaux et la rduction des dbits. Soumis de telles pressions les poissons quelque peu exigeants tendent rgresser. Dans un tel contexte premire vue dfavorable, il est rjouissant de constater que lapron narrive pas trop mal sen sortir puisquil semble en augmentation dans la Loue. Nous en prenons acte comme un lment dun petit succs acquis contre lrosion de la biodiversit et comme en encouragement aux gestionnaires continuer dans le sens de ce quils ont fait jusqu prsent, moyennant les redirections ventuelles commandes par les avis scientifiques autoriss. Cest pourquoi, dans cette affaire de lapron nous ne pouvons pas, par soui de pragmatisme, relayer toutes les revendications des ONG qui visent un changement radical de socit et dconomie locale, notamment au point de vue de lagriculture et de llevage. De tels changements sont sans doute ncessaires amorcer mais peuvent difficilement tre envisags concrtement court terme. Mais lobjectif du sauvetage de lapron peut constituer un bon point de dpart. 1.2 Actions de la Confdration helvtique En Suisse, le problme de la protection de lapron intresse les pouvoirs publics depuis 1984 mais a surtout t pose avec la publication en 1999 par lOffice fdral de lEnvironnement et des Forts (OFEFP) dun document (16) Concept de protection de lapron : recensement des effectifs dans le Doubs prsentant des observations commences ds 1985. Dans ce document de base taient analyses les causes de la rarfaction de lespce (seulement 24 poissons/km et un total de 80-160 individus en aval de Goumois) et proposes des mesures de protection : rtablissement de la libre circulation sur le linaire, diminution des brusques variations des niveaux deau, examen de lopportunit dun repeuplement de soutien avec des poissons l evs en captivit et mise en place dun programme de monitoring de la population. Au cours des annes suivantes, cest essentiellement ces actions de monitoring qui ont t excuts et dveloppes amliores dans le cadre dune collaboration entre lAdministration cantonale et un bureau dtude spcialis (1, 2, 29). A la fin des annes 2000, la proccupation spcifique pour lapron sest manifeste lors de ltude de projets dassainissement de seuils dans le cours infrieur du Doubs jurassien (30), puis de lexamen de la faisabilit de llevage pour le repeuplement (23). En 2012, le site de St-Ursanne a t officiellement inscrit dans la liste des sites Emeraude du Conseil de lEurope, notamment parce quil abrite lapron et dautres espces de poissons protges (toxostome, blageon, petite lamproie, chabot). En 2012, a t officialise comme Action 33 du PNA franais une coopration franco-suisse sur la thmatique de la protection de lapron dans le cadre du Projet intgr Doubs franco-suisse pilot par lEPTB SaneDoubs. Deux membres, l'un de lOffice fdral de lEnvironnement et l'autre de

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lOffice de lEnvironnement du Canton du Jura ont t intgrs au Conseil Scientifique et Technique du PNA. Au plan scientifique, cette collaboration internationale a permis un tudiant de lUniversit de Tours deffectuer un dnombrement de 52 aprons dans la boucle jurassienne du Doubs. Au terme de 20 annes dune certaine proccupation pour lapron dans la boucle jurassienne du Doubs, la situation de lespce semble stre progressivement dgrade au point quil ne survivrait plus quune centaine dindividus adultes et que la population serait au bord de lextinction. Dans le contexte du Doubs helvtique, les ONG ont dpos leur plainte aprs avoir constat que la protection de lapron et de son habitat dans le Doubs jurassien ntait pas suffisamment assure et que, mis part des tudes et oprations de monitoring, peu de ralisations concrtes significatives avaient t engages. Cela est exact mme si les autorits publiques commencent rsorber leur retard en matire de gestion quantitative des eaux (laboration des Plans sectoriels des eaux) et organiser une coopration internationale avec la France travers un projet adopt en janvier 2012 Projet intgr Doubs franco-suisse relatif au Doubs frontire (gestion des dbits, de la qualit de la rivire et de leau, de la pche) et, depuis janvier 2002 galement, une implication dans le Plan National Apron franais via lAction 33. Toutefois, loccasion de cette affaire de lapron, les rclamations des ONG portent aussi, comme en France, sur des aspects beaucoup plus larges de la gestion de leau et de lamnagement du territoire (intensification de lagriculture par exemple) lchelle de lensemble du bassin du Doubs couvrant plusieurs Cantons suisses (Neuchtel et Jura) et deux pays, France et Suisse dont lun est soumis des rglementations de lUE et lautre pas. Il sagit dun niveau dapproche global que nous estimons sortir de la problmatique immdiate du sauvetage urgent de lapron, essentiellement dans le Canton du Jura. Dans ltat actuel du dossier, nous avons dgag une srie de propositions/recommandations selon cinq axes principaux et qui sadressent essentiellement aux autorits su isses dont relve la conservation de la population relique dapron dans le Clos du Doubs jurassien : Assurer la cohrence des politiques environnementales relatives lapron et son habitat Amliorer lapproche scientifique du problme Dvelopper et valoriser les indispensables cooprations internationales franco-suisses Mener bien en urgence des actions concrtes prioritaires Souvrir aux approches innovantes en dveloppement durable et conservation des espces

D. PROPOSITIONS ET RECOMMANDATIONS
Recommandation n1: Assurer la cohrence des politiques environnementales relatives lapron et son habitat
Attirer lattention des autorits sur le fait quavec une population relique apparente dune centaine dindividus adultes rpartis sur un linaire de 20 km dans la boucle du Doubs jurassien, lapron du Rhne, patrimoine exceptionnel de biodiversit de la Confdration helvtique et de l Europe, est gravement menac dextinction en Suisse et par l-mme potentiellement la partie aval du tronon frontire. A ce titre, ce poisson mrite une attention prioritaire urgente sous la forme : dune activation de tous les outils lgaux de conservation qui le concernent au niveau national et international notamment linscription lannexe II de la Convention de Berne et lappartenance au site Emeraude de St-Ursanne et ; lexcution dactions gnrales dj planifies dassainissements de lenvironnement (qualit de leau, dbit, seuils et barrage) favorables son habitat.

(a) Lancer un Plan dAction Apron pour le Doubs helvtique Le Plan devrait tre inspir du PNA franais et constituant une actualisation du Concept de Protection de lApron produit en 1999 par lOFEFP et qui implique les administrations mais aussi les milieux scientifiques, les pcheurs et les ONG spcialises.

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(b) Acclrer la mise en place de mesures pour rduire limpact cologique et piscicole des turbinages hydrolectriques par les grandes centrales sur retenue (Chatelot + Refrain+ La Goule) sur le Doubs frontire, conformment aux obligations lgales en matire dassainissement des dbits minimaux et des cluses et aux engagements du Groupe binational "gestion des dbits" avec prise en compte des deux aspects. 1) Appliquer dans les meilleurs dlais et de manire coordonne entre les partenaires institutionnels suisses et franais et les producteurs dhydrolectricit les dispositions de rgulation des dbits prconises par le Groupe binational "gestion des dbits" et actuellement en cours dexprimentation ou de conception. En cette matire, faire porter les efforts sur la fixation de dbits biologiques minimum-optimum en aval de la restitution des dbits turbins (objectif de minimum 6-8 m3/s la sortie de la chane des 3 centrales) et sur la rduction des variations des dbits lies aux cluses (maximum 5-10 cm/hr pour les gradients de baisse). 2) Tendre progressivement vers une organisation de la gestion des turbinages sous le contrle et la coordination dun seul intervenant industriel au lieu de trois actuellement. Une telle mesure ncessitera probablement un certain temps sorganiser et entretemps, il est prioritaire de rgler le problme dune meilleure gestion cologique des turbinages. (c) Acclrer lapplication des dispositions lgales diverses dassainissement pour amliorer les diffrentes composantes de leau du Doubs dans son bassin versant, au bnfice de toutes les espces de poissons, y compris de lapron dans son aire de distribution. Sur la base des annonces faites par les Cantons de Neuchtel et du Jura la runion de Saint-Ursanne ainsi que par la France dans le Projet intgr franco-suisse ; Il sagit de mesures de grande ampleur qui relvent des politiques de gestion des eaux de surface en Suisse et en France (Directive Cadre sur lEau de lUE), par rapport laffectation du territoire (population, agriculture, industrie) et en tenant compte des spcificits et des sensibilits hydrocologiques particulires des rgions karstiques. En cette matire, on ne peut que formuler des recommandations gnrales et demander des dates chances pour leur mise en uvre : appliquer un programme de rnovation des anciennes STEPs ; accrotre la lutte contre leutrophisation (excs de nitrates et de phosphates gnrateurs de prolifrations algales) dorigine diffuse (agriculture) et plus ponctuelle (rejets de STEP) ; strictement contrler le rejet direct en rivire de toxiques chimiques industriels et agricoles divers; amliorer les pratiques agricoles et sylvicoles en matire dutilisation de pesticides ; assainir les eaux urbaines sortant des stations dpuration pour les micropolluants tels que les mtaux lourds, les pesticides, les rsidus de mdicament et les perturbateurs endocriniens ; assainir les stockages de produits dangereux dans les milieux karstiques.

Recommandation n 2 : Amliorer lapproche scientifique du problme


(a) Collecter, synthtiser et analyser scientifiquement les connaissances actuelles sur lapron du Doubs jurassien Il sagit dorganiser dans lesprit et sur le modle des programmes LIFE I et LIF E II APRON et du Plan National Apron en France et la lumire des connaissances acquises sur les populations franaises, une valuation scientifique de ltat de la population relique de la boucle jurassienne du Doubs, comme base au dveloppement dune nouvelle stratgie dtudes et dactions en faveur de lapron et de son habitat. Plusieurs modalits dorganisation peuvent tre envisages. (b) Constituer un comit scientifique dexperts de lapron suisses et franais, par exemple sur le modle de ce qui a t fait en France, pour dfinir une stratgie efficace de sauvetage du trs menac et emblmatique Saumon atlantique Loire-Allier. Ce comit regrouperait des membres des administrations concernes, des milieux scientifiques (Universit, Instituts de recherche), des bureaux dtude spcialiss, des pcheurs et des associations environnementalistes spcialises. Pourrait tre organis au sein de la structure binationale existante Projet intgr Doubs franco -suisse via un volet franco-suisse du PNA.

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(c) Raliser un travail de synthse et danalyse scientifique dun maximum de rsultats disponibles et produire des conclusions dgageant les lments dune stratgie adapte dtudes et daction en faveur de lapron, compte tenu des faibles effectifs de la population survivants. Ces travaux devraient donner lieu une restitution au grand public lors dun colloque et sous la forme dune publication. Cf. Les assises de la Loue en France. (d) Raliser prioritairement des tudes complmentaires sur le terrain et/ou collecter des avis dexperts (cf. point 1) sur certains sujets cruciaux de la biologie de lapron en vue de lancer des actions de protection et de conservation. (e) Poursuivre le suivi rgulier de la population dapron en le faisant faire voluer du simple monitoring quelque peu routinier vers une vritable tude de la biologie de la population impliquant le dveloppement de nouvelles mthodes de dnombrement, le recours aux techniques de marquagerecapture bases sur lutilisation de marques lectroniques individuelles (puces ou pit-tag), le radiopistage des poissons pour prciser leur mobilit et leur mode lutilisation de lhabitat dans un cours deau localement profond ainsi que la localisation des frayres. Un tel programme devra tre dfini par le comit dexpert Apron mettre en place. (f) Acqurir des connaissances sur la gntique de la population relique dapron du Doubs suisse grce la collaboration franco-suisse amorce dans le cadre du PNA franais. Etablir le degr de particularit et dunicit de cette population par rapport la population voisine de la Loue (affluent du Doubs) et des autres rivires franaises. Une fois obtenus les rsultats gntiques, tudier de manire critique les possibilits de dvelopper, dans un but de conservation, pas (encore) de repeuplement, llevage en captivit (46) de la souche relique de lapron de la boucle suisse du Doubs sur le modle des travaux mens lAquarium de Besanon (4) et dj envisags en Jura suisse (23). (g) Organiser dans au moins une station au sein de la zone de prsence de lapron Saint-Ursanne et en amont de ce lieu un relev en continu des principaux paramtres environnementaux qui dfinissent la qualit de lhabitat de lapron aux points de hydraulique (dbit et hauteur deau), physico-chimique ( temprature, pH, oxygne dissous, saturation en oxygne, ammonium-ammoniac, nitrites, nitrates, conductivit lectrique, matires en suspension), hydro-biologique (algues, macroinvertbrs benthiques, poissons) Ltat de la population dapron devra tre tudie en parallle et lon procdera des observations co-toxicologiques. (i) Faire de cette partie du Doubs St Ursanne un site laboratoire -atelier pour effectuer un monitoring dmographique intensif selon une mthodologie inspire de celle applique en France dans le Programme National Apron qui a dailleurs prvu un volet de collaboration franco -suisse (OFEVAquarius) (Action n 33) quil faut mettre en uvre et renforcer.

Recommandation n3: Dvelopper et valoriser les indispensables cooprations internationales entre la Suisse et la France
(a) Poursuive et intensifier la collaboration franco-suisse sous la forme dune participation dune quipe helvtique au PNA dans le cadre du Plan Intgr Doubs franco-suisse et qui porte sur un volet technique impliquant la ralisation dtudes sur lapron dans le Doubs jurassien (dnombrement, gntique) et un volet dchange crois dinformations et dexpriences sur la conservation -gestion de cette espce. Avec le PNA et les programmes LIFE Apron I et II qui lont prcd, la France dispose dun niveau dexpertise considrable sur la question et la Suisse ne pourra jamais une acqurir une telle expertise dans tous les domaines, do lavantage dune collaboration. (b) Poursuivre et dvelopper la collaboration franco-suisse sur les questions relatives la gestion de leau et du milieu aquatique (qualit de leau, rgulation des turbinages hydrolectriques, pche, biodiversit) dans la partie frontire du Doubs dans le cadre du Projet Intgr Doubs franco-suisse.

Recommandation n4 : Excuter de manire urgente des mesures concrtes de protection de lapron et de son habitat
(a) Accorder un statut de protection maximal (sanctuarisation) au tronon du Doubs jurassien (de Saint Ursanne la rgion de Soubey) qui abrite une population dapron relique au bord de lextinction. Cette zone biologiquement hyperprotge pourrait correspondre au site Emeraude n 2 (Saint-Ursanne, 2012 ha) rcemment (30/11/2012) intgr au rseau de la Convention de Berne. Ce

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statut devrait permettre dappliquer la zone occupe par lapron des mesures de protection maximales, comme par exemple ne plus accepter aucune intervention dfavorable lespce et son habitat. Au sein dune telle zone, dlimiter des zones de rivire en rserve intgrale par exemple pour protger des habitats importants pour la reproduction (frayres), le grossissement des alevins (nurseries) et les zones dabris (refuge). A envisager sur le modle des Arrts de biotope en France. (b) Mettre en uvre des mesures dassainissement de petits seuils potentiellement dfavorables la libre circulation de lapron vers lamont. En priorit absolue, excuter lchelle spcifique apron prvue pour le seuil de Saint-Ursanne. Ensuite, prvoir un assainissement des deux seuils de laval Bellefontaine et Ocourt, idalement par dmantlement (moyennant des prcautions pour viter la pollution par les boues charges en micropolluants accumules dans le fond des retenues) et ventuellement par amnagement dune passe spcifique apron. (c) Prendre des mesures nergiques pour limiter limpact de la production locale de microlectricit dans le Clos du Doubs selon deux modalits : i) exclure tout amnagement hydro-lectrique des seuils de Bellefontaine et dOcourt et si cela est juridiquement impossible ne tolrer la construction que douvrages totalement ichtyo-compatibles au point de vue de la prise deau et/ou de la turbine et ii) imposer une amlioration de la microcentrale existante Saint-Ursanne pour la rendre 100 % ichtyo-compatibles (grille fine 1 cm + exutoire de dvalaison efficace ; turbine ichtyocompatible) vis--vis des poissons dvalants en gnral et des aprons en particulier. (d) Limiter strictement les dversements ponctuels de substances polluantes toxiques (mtaux lourds, solvants, pesticides, hydrocarbures) lis des activits industrielles locales, (usine signale St-Ursanne) afin de supprimer tout risque de mortalit directe des aprons et de dgradation long terme de leur habitat (contamination des sdiments).

E. REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES
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F. ANNEXES FIGURES

Fig. 1. Deux aprons, un adulte et un juvnile, en position sur un fond de cailloux et de gravier dans le Doubs (photo Bonnaire, 2012).

Figure 2 . Aire de rpartition gographique de lapron dans le bassin du Rhne en 2009 (traits rouges) et au dbut du sicle dernier (traits jaunes) (source : PNA)

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Figure 3. Cours du Doubs international montrant, dans lencadr en trait rouge, le tronon de prsence effective ou potentielle de lapron

Figure 4. Profil en long du Doubs frontire et jurassien indiquant la position des barrages hydrolectriques et des seuils de St Ursanne, Bellefontaine et Ocourt (source : rf. (32)). Le linaire de prsence actuelle de lapron (trait vert) va de laval du seuil de Bellefontaine jusqu Soubey soit environ 25 km. Historiquement, lapron tait prsent (trait rouge) en amont de Soubey jusqu Goumois et en aval du seuil de Ocourt.

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Figure 5 a. Synthse des observations 2000-2011 des aprons dans la boucle jurassienne du Doubs dans le cadre du monitoring ralis par lOffice Fdral de lEnvironnement Suisse (source : OFEV 2013 ; rf 29). Maximum dobservations dans un tronon de 5-6 km dans la rgion de St Ursanne vers lamont.

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Figure 5b. Carte de distribution de lapron en Suisse qui reprend les observations dans la boucle jurassienne du Doubs

Figure 6. Nombre moyen daprons observs en 2008-2010 par 100 m linaire dans des stations de la Loue moyenne (source : Huger et Gindre, 2013- rf 39)

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Figure 7. Abondance de lapron dans les stations de la Loue suivies depuis 2004 (source : Huger et Gindre, 2013- rf 39)

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F. ANNEXE PHOTOS

Photo 1. Vue en dbut juillet 2013 de deux habitats du Doubs peupls par lapron dans la Rgion de Saint-Ursanne.

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Photo 2. Le site du seuil de Quingey sur la Loue en France en dbut juillet 2013 (au-dessus) quip depuis 2009 avec, vue de laval, une passe migratoire plots adapte lapron (endessous).

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Photo 3. Le seuil de Saint-Ursanne (au-dessus) et de Ocourt (en-dessous) sur le Doubs Jurassien en dbut juillet 2013. En arrire-fond droite sur le seuil de St-Ursanne se situe la prise deau dune petite centrale hydrolectrique au fil de leau.

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Photo 4. Le substrat du Doubs dans deux stations de la rgion de Saint-Ursanne en dbut juillet 2013. Au-dessus : substrat fortement recouvert de vgtation algale dfavorable lapron. Endessous : substrat caillouteux hauteur du pont ancien de Saint Ursanne (les poissons visibles sont des chevaines).

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