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Unidad: 01 Semana: 01
BIOQUMICA AMBIENTAL
ORIENTACIONES
El conocimiento de los principios bsicos de la bioqumica ambiental nos da la capacidad de comprender todos los procesos mediados por seres vivos y que ocurren en el entorno. Este tema permite reconocer a los elementos que participan en el flujo de la materia y la energa en la bisfera.
CONTENIDOS TEMTICOS
Definicin de la Bioqumica Ambiental y su relacin con otras ciencias. Flujo de materia y energa en la biosfera: Principales organismos implicados en los ciclos biogeoqumicos y en la biorremediacin: organismos auttrofos y hetertrofos. Ciclo del oxgeno. Produccin y consumo de oxgeno por los seres vivos: fotosntesis y respiracin. Metabolismo energtico aerobio. Fosforilacin oxidativa y sntesis de ATP. Ciclo del carbono I. Relacin con el ciclo del oxgeno. Fijacin biolgica de CO2. Fase lumnica de la fotosntesis. Ciclo de Calvin. Fotorrespiracin. Adaptaciones fotosintticas: va C4.
CONTENIDOS TEMTICOS
Ciclo del carbono II. Ciclo del metano. Metangenos: ruta bioenergtica y ruta biosintticas. Metilotrofos y metanotrofos. Ciclo del nitrgeno. Fijacin biolgica del nitrgeno: complejo enzimtico nitrogenasa. Nitrificacin. Reduccin de nitratos. Asimilacin del amonio y sntesis de aminocidos. Amonificacin y desnitrificacin. Ciclo del azufre y del fsforo. Bacterias del azufre. Reduccin desasimilatoria de sulfatos. Reduccin asimilatoria. Ciclo del fsforo. Ciclo del hierro. Reduccin bacteriana del hierro frrico. Bacterias oxidantes del hierro. Oxidacin bacteriana de la pirita.
CONSUMIDORES
DESCOMPONEDORES
Transformadores
Oxgeno en la atmsfera
CO2, NO2, SO2
Principal forma de produccin: fotosntesis Consumo: respiracin La cantidad producida excede a la consumida en 30 veces Fotlisis: 2H2O + energa > 4H+ + O2 Respiracin: {CH2O} + O2 > CO2 + H2O
El cloroplasto
P680
P700
Fotosntesis C4
Respiracin Celular
Proceso en el que las clulas degradan molculas combustibles para obtener energa. Es una reaccin exergnica: parte de la energa es utilizada por la clula para sintetizar ATP. Otra parte se disipa en forma de calor. Es una combustin biolgica. La respiracin y la combustin son reacciones exergnicas. Es una serie de reacciones de xido-reduccin por las que las molculas combustibles son oxidadas y degradadas liberando energa. La primera etapa, la gluclisis, ocurre en el citoplasma y no requiere la participacin del oxgeno. La segunda etapa depender de la presencia o ausencia de O2 ; en el primer caso es la respiracin aerbica (en mitocondrias), y en el segundo caso la respiracin anaerbica o la fermentacin (en el citoplasma).
La clula
Gluclisis
Reacciones de degradacin de glucosa hasta dos molculas de cido pirvico. Esto ocurre en el citoplasma. Es un proceso anaerobio: no necesita oxgeno
Reactivos
Gluclisis (I)
Gluclisis (II)
Respiracin aerobia
Cuando hay oxgeno, el pirvico es degradado completamente obtenindose dixido de carbono (CO2). El NADH+H+ y otras coenzimas reductoras obtenidas son oxidadas y los electrones transportados hacia el oxgeno (O2), recuperndose el NAD+ y obtenindose H2O. Este proceso se realiza en los eucariotas en las mitocondrias.
Fermentacin
En ausencia de oxgeno el cido pirvico se transforma a CO2 y H2O. Objetivo rcuperara NAD+. En los eucariotas se realiza en el citoplasma. Dos procesos:
o Descarboxilacin. o Oxidacin.
La mitocondria
La mitocondria
Ciclo de Krebs
Balance del ciclo: Acetil-CoA + 3 NAD+ + FAD 2 CO2 + 3NADH + FADH2 + ATP Balance de una molcula de glucosa: 1 glucosa + 38 ADP + 38 Pi 6 CO2 + 38 ATP 2 de los NADH son formados en el citoplasma durante la gliclisis
Fosforilacin oxidativa
Es la sntesis de ATP por transferencia de electrones hacia el O2. Se caracteriza por:
1. Los protones pasan por la membrana, desde la matriz de la mitocondria al espacio intermembranal. La continua produccin de protones crea un gradiente. 2. La ATP sintetasa es un complejo proteico que permite la re-entrada de protones. 3. La sntesis de ATP se produce por el flujo de protones a travs de la membrana:
ADP + Pi ATP
Generalidades
Su ciclo puede subdividirse en: ciclo geolgico y ciclo biolgico. Geolgico: constituido por reservorios de carbono: atmsfera, biosfera terrestre, ocanos y sedimentos. Los movimientos entre reservorios ocurren debido a varios procesos qumicos, fsicos, geolgicos y biolgicos. Carbono en atmsfera:
En forma de dixido de carbono (CO2). En la atmsfera hay 750 gigatoneladas de carbono. La atmsfera es el almacn de carbono ms pequeo. Tiene el mayor porcentaje de circulacin de carbono a causa de procesos bioqumicos.
Generalidades
Carbono en ocanos:
36000 gigatoneladas de carbono: ion bicarbonato. 0.05% del carbono total de la Tierra. El carbono se intercambia entre atmsfera y ocano. CO2 en el ocano: CO2 + H2O H2CO3 (cido carbnico)
Para el control de cambios de pH en los ocanos: H2CO3 H+ + HCO3 El Bicarbonato puede combinarse con el calcio
Generalidades
Carbono en bisfera
1900 gigatoneladas de carbono Los auttrofos usan dixido de carbono del aire o del agua El carbono se transfiere cuando los hetertrofos se alimentan de otros organismos o de sus partes. La mayor parte del carbono deja la biosfera por respiracin. Cuando el oxgeno est presente, se produce la respiracin aerbica: C6H12O6 + 6O2 6CO2 + 6H2O En ausencia de oxgeno, la respiracin anaerobia libera metano que sigue hacia la atmsfera o la hidrsfera La combustin de biomasa tambin puede transferir carbono a la atmsfera. El almacenamiento de carbono en la biosfera est bajo la influencia de varios procesos en escalas de tiempo diferentes
o El carbono puede ser almacenado hasta varios cientos de aos en los rboles y hasta miles de aos en los suelos.
http://www.bigelow.org/foodweb/carbon_cycle.jpg
Generalidades
El nitrgeno es base para la sntesis de protenas y cidos nucleicos. Es de la atmsfera terrestre Usado por bacterias fijadoras del nitrgeno
Complejo Nitrogenasa
Es responsable de la reaccin de fijacin de N Aparece en la atmsfera libre de oxgeno. Azotobacter usa oxgeno, inactivando a la nitrogenasa Las cianofitas (azul-verdes) fijan nitrgeno en heteroquistes Rhizobium infecta races de plantas leguminosas Forman ndulos Las cianobacterias son los principales microorganismos fijadores de nitrgeno en el agua. Ejemplos: Anabaena, Nostoc, Calothrix.
Complejo Nitrogenasa
El amonaco es asimilado como aminocidos, forma protenas y participa en sntesis de nucletidos (2 en la figura siguiente). El nitrgeno orgnico de plantas y animales muertos mas excrementos regresa al entorno y se mineraliza (3, figura) por microorganismos (Clostridium, Acetobacter), con desaminacin de los aminocidos La mineralizacin ocurre aerbica o anaerbicamente En el proceso de nitrificacin: el amonaco se oxida hasta nitrito (Nitrosomonas) y luego hasta nitrato (Nitrobacter) (4 y 5, figura). El nitrato puede usarse como receptor de electrones en la respiracin anaerobia, reducindose hasta nitrgeno (6, figura). Esto ocurre en condiciones anaerbicas (Bacillus, Pseudomonas) Se puede reducir una vez ms hasta amonaco y de all se puede convertir en nitrgeno orgnico (7, figura).
Ciclo (continuacin)
La va final: anammox (oxidacin de amonaco anaerbico) Ocurre por bacterias Gram-negativas (Planctomycetes). Reaccin:
CISTEINA
PIRUVATO
Tambin puede ocurrir en forma abitica en condiciones neutras hasta alcalinas (la mayor parte de Hierro en la bisfera en forma oxidada).
Si se compara con otros elementos en la torre de oxidorreduccin: debajo del O2 y el NO3 La reduccin del hierro genera ms energa que la del sulfato o el CO2.
Cu2+ + Fe Fe2+ + Cu
(iones decobre removidos de la solucin por precipitacin en presencia de hierro)
Torre Redox
GRACIAS