2. a.

Transposones de DNA
b. Retrotransposones semejantes a virus y los retrotransposones LTR
c. Retrotransposones de poli-A
a. Transposones de DNA
Los transpsones de DNA poseen frecuencias de DNA que actan como sitios de
recombinacin. Los sitios de recombinacin estn situados al lado de los
elementos de transposicin y estn organizados como secuencias repetidas
invertidas. Estas repeticiones terminales invertidas varan en extensin de 25 a
algunos centenares en pares de bases, no son repeticiones exactas de frecuencia
y poseen las secuencias de reconocimiento al recombinarse.
Los transposones de DNA tienen un gen que codifica para su propia transposasa.
Ellos pueden presentar genes adicionales que codifica protenas y regula la
transposicin.
Las secuencias de DNA que flanquean el transposon exhiben un segmento corto
de secuencia duplicada. Estos segmentos se organizan como repeticiones
directas, reciben el nombre de duplicaciones de sitio diana y se generan
duramente el proceso de recombinacin.
Los transposones de DNA se hallan como elementos autnomos y no
autnomos. Donde los primeros son los que portan un par de repeticiones
invertidas terminales y un gen trasposasa , tienen todo lo necesario para promover
su propia transposicin, los transposones no autnomos son ms sencillos , estos
elementos portan solo las repeticiones invertidas terminales, esto es las
secuencias de accin cis necesarias para la transposicin.
b. Retrotransposones semejantes a virus y los retrotransposones LTR
Los retrotransposones similares a virus y los retrovirus tambin portan secuencias
repetidas terminales invertidas que son los sitios de unin y accin de la
recombinasa. Las repeticiones invertidas terminales estn incluidas dentro de
secuencias repetidas mas largas; estas se organizan en los extremos del
elemento en la forma de repeticiones directas recibiendo el nombre de
repeticiones terminales largas o LTR. Los retrotransposones semejantes a
retrovirus codifican dos protenas necesarias para su movilidad: la integrasa
(transposasa) y la transcriptasa inversa.


c. Retrotransposones de poli-A
Los retrotransposones de poli-A no tienen las repeticiones invertidas terminales
que hay en las otras clases de transposones. En cambio, los dos extremos del
elemento tienen secuencias distintas. Un extremo se llama UTR5, mientras el otro
tiene una regin denominada UTR3, seguida por un segmento de pares de bases
A-T que recibe el nombre de secuencia de poli-A. Estos elementos tambin estn
flanqueados por duplicaciones de sitios cortas.
Los retrotransposones portan dos genes, conocidos como ORF1 y ORF2. El
primero codifica una protena de unin al RNA. ORF2 codifica una protena con
actividades tanto de transcriptasa inversa como de endonucleasa.
4. Transposicin replicativa
El primer paso es la transposicin replicativa es la congregacin de la protena
transposasa en los dos extremos del DNA del transposon para generar un
tranposoma.
El paso siguiente es el corte de DNA en los extremos del transposon. Esta
reaccin la cataliza la tranposasa dentro del transposoma. La transposasa
produce un corte en el DNA en cada una de las dos uniones entre la secuencia
transposnica y el DNA flanqueante del husped. Este corte libera dos extremos
DNA OH3 en la secuencia del transposon.
Luego, los extremos OH3 del DNA del transposon se unen al sitio del DNA diana
por la reaccin de transferencia de cadenas del DNA. El intermediario en este
caso es generado por la transferencia de las cadenas del DNA es una molcula de
DNA de ramificacin doble. En este intermediario, los extremos 3 del transposon
estn unidos de modo covalente al sitio diana nuevo, mientras que los extremos
5 de la secuencia transposonica permanecen unidos al DNA flanqueante antiguo.
Las dos ramas de DNA dentro del intermediario tiene la estructura de una horquilla
de replicacin. Despus de la transferencia de las cadenas de DNA, las protenas
de replicacin del DNA de la clula husped pueden congregarse en estas
horquillas. El extremo OH3 en el DNA diana escindido sirve como cebador para
la sntesis de DNA. La replicacin progresada a travs de las secuencias
transposnica y se detiene en la segunda horquilla. Esta reaccin de la replicacin
genera dos copias de DNA del transposon. Estas se encuentran flanqueadas por
las duplicaciones directas cortas del sitio diana.


6. El mecanismo de empalme inverso se presenta en los retrotransposones de
poli-A y retrotransposones similares a virus, consiste en que una RNA polimerasa
celular inicia la transcripcin de una secuencia LINE, el RNA mensajero resultante
se traduce para generar los productos de los ORF codificados que luego se unen
al extremo 3 de su mRNA. Despus el complejo mRNA- protena se une a un sitio
con abundante timina en el DNA diana, las protenas inicias escisin en el DNA
diana, con lo que dejan un OH3del DNA y forman un hibrido RNA-DNA. El
extremo OH3del DNA diana sirve como cebador para la transcripcin inversa del
RNA del elemento para producir cDNA. Los pasos finales de la reaccin de
transposicin comprenden la sntesis de la segunda cadena, el resellado y la
reparacin del DNA para crear un elemento LINE de insercin nueva.
8. El mecanismo de accin del Transposon bacteriano Tn10 es un elemento
compacto de 9kb y codifica un gen para su propia transposasa y genes que le
permiten resistencia contra el antibitico tetraciclina. El Tn1o se transpone por
medio del mecanismo de corte y pegado y utiliza la estrategia de la horquilla de
DNA para cortar las cadenas no transferidas. La secuencia Tn10 tambin tiene un
sitio para la unin IHF. El IHF contribuye con el armado del complejo
transposmico, adecuado necesariamente para la recombinacin.
La expresin del gen de la transposasa se regula mediante: El RNA anti
sentido es uno de los mecanismos por el cual Tn10 controla la expresin del gen
de la transposasa. Cerca de la extremo IS10R hay dos promotores que dirigen la
sntesis de la RNA por la RNA polimerasa de la clula husped. El promotor que
dirige la sntesis de RNA hacia adentro tiene a su cargo la expresin del gen de la
transposasa. El promotor que dirige transcripcin hacia afuera, en cambio, sirve
para regular la expresin de la transposasa mediante la generacin de un RNA
anti sentido de la siguiente manera: los RNA sintetizados desde P
IN
y P
out
se
superponen y en consecuencia, pueden aparearse mediante enlaces de
hidrogeno. Este apareamiento impide la unin de los ribosomas al transcrito de
P
IN
y, por ende, la sntesis de la protena transposasa.
Esto tiene relacin con la duplicacin celular porque las clulas que portan ms
copias de Tn10 transcribirn ms RNA anti sentido, que as u vez limitara la
expresin del gen de la transposasa. En consecuencia, la frecuencia de
transposicin ser muy baja .En cambio, Si en la clula hay una sola copia de
Tn10, la concentracin de RNA anti sentido ser baja, la sntesis de la protena
transposasa ser eficaz y la transposicin se producir con una frecuencia mayor.



10. La falta de regulacin de los transposones tipo Tc1/Mariner, causan la
inactivacin de genes un ejemplo de este es el transposn bella durmiente es un
derivado de la superfamilia de transposones de ADN Tc1/mariner prevalentes
entre los dos genomas de vertebrados e invertebrados. Sin embargo,
transposones de ADN endgenas de esta familia son completamente inactivos en
los genomas de vertebrados. Un transposn Tc1/mariner activa, sintetizado a
partir de la alineacin de transposones inactivos de la subfamilia de salmnidos de
elementos, se "despierta" para formar el transposn llamado La Bella Durmiente.
SB, al igual que otros transposones de ADN, se moviliza a travs de un
mecanismo de cortar y pegar mediante el cual una enzima transposasa, codificada
por el propio transposn, los impuestos especiales y re-integra el transposn en
otros sitios dentro del genoma. La protena SB aminocido 340 repeticiones
terminales invertidas reconoce que flanquean el transposn; se une a estas
secuencias y cataliza la escisin del transposn. SB se integra en sitios aleatorios
en el genoma, aunque algunos estudios reportan muy leves preferencias para las
unidades transcripcionales. Tambin hay una simple exigencia de un TA-
dinucletido en el sitio diana, como todos los transposones Tc1/mariner.

11.