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24-05-2014

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Qumica y aplicaciones de los elementos
qumicos en bioinorgnica.
Dra. Kareen Brown A.
*La Qumica Bioinorgnica es una rama de la qumica que
estudia el rol biolgico de los metales. Incluyendo el estudio
tanto de fenmenos naturales como el comportamiento de las
metaloprotenas, as como de metales introducidos
artificialmente, incluso aquellos que son elementos no
esenciales, en medicina y toxicologa. Muchos procesos
biolgicos como la respiracin, dependen de molculas que
caen en el campo de estudio de la qumica inorgnica. Esta
disciplina incluye tambin el estudio de modelos inorgnicos
que imitan el comportamiento de las metaloprotenas.

*Como mezcla de la bioqumica y la qumica inorgnica, la
qumica bioinorgnica es importante en el estudio de las
protenas transportadoras de metales, unin al sustrato y
activacin, qumica de la transferencia de tomos y grupos
funcionales, as como las propiedades de los metales en la
qumica biolgica.

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La Qumica Bioinorgnica es una rama interdisciplinaria de
la Qumica, que se ocupa de una amplia gama de
problemas ubicados en la interfase entre la qumica y las
ciencias biolgicas.


Bioinorgnica
Microbiologa
Qumica orgnica
Farmacologa
Bioqumica
Qumica Inorgnica
Fisiologa
Medicina
*En la actualidad, se han llegado a reconocer como elementos
esenciales para los organismos, 27 elementos y presentan
en la tabla peridica de los bioelementos.
*A parte de los elementos C, H, N y O, que son constituyentes
bsicos y caractersticos de los compuestos orgnicos,
todos los dems son elementos que podemos llamar
inorgnicos
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Elemento o metal esencial
*Elemento en el cual su ingesta insuficiente produce deficiencias
funcionales, las que pueden revertirse cuando el elemento
recupera su nivel fisiolgico ptimo.
*El organismo no puede crecer ni completar su ciclo vital sin ese
elemento.
*El elemento debe poseer una influencia directa sobre el
organismo y estar involucrado en sus procesos metablicos.
*El efecto de un elemento esencial no puede ser logrado
totalmente por ningn otro elemento.
*Se debe enfatizar que el normal funcionamiento de los
organismos vivos requiere un balance y un equilibrio
delicado entre los diferentes elementos que ellos
necesitan. Esto significa que un elemento esencial puede
transformarse en un elemento txico, cuando se
sobrepasan ciertos lmites de concentracin.
*Los organismos pasan por diferentes etapas cuando la
concentracin de un elemento esencial pasa de deficiente
a excesiva.
*Cuando se incorpora un exceso del elemento, el mismo
comienza a tener efectos txicos y finalmente letales.
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*Todos los elementos pueden ser divididos en tres grandes
grupos de acuerdo a su abundancia en los sistemas biolgicos.
Elemento g/ 70 Kg de peso
Constituyentes
mayoritarios
O
C
N
H
Ca
P
S
K
Na
Cl
Mg
45.5000
12.600
2.100
7.000
1.050
700
175
140
105
105
35
Elementos traza Fe
Zn
Si
Cu
F
Br
4,2
2,3
1,4
0,1
0,8
0,2
Elementos ultramicro
traza
I
Mn, V, Si
As, B, Ni
Cr, Mo
Co
0,03
0,02
0,01
0,005
0,003
S
u
p
e
r
v
i
v
e
n
c
i
a

D
e
f
i
c
i
e
n
c
i
a

Rango ptimo
T
o
x
i
c
i
d
a
d

L
e
t
a
l
i
d
a
d

R
e
s
p
u
e
s
t
a

Elemento esencial (dosis)
Efecto de la dosis de un elemento esencial sobre la respuesta fisiolgica
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ELEMENTOS QUMICOS






LA MATERIA VIVA
BIOELEMENTOS
PIIMARIOS
ENLACES QUMICOS
INORGNICO
SALES MINERALES
OLIGOELEMENTOS
SECUNDARIOS
BIOMOLCULAS
AGUA
GLCIDOS
LPIDOS
PROTENAS
ACID.NUCLICOS
ORGNICO
DINMICA
ENERGTICA
ESTRUCTURAL
Est formada por
Por su abundancia son
Si su proporcin es muy pequea son
Establecen
Formando
de tipo de funcin
son
son
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*Los elementos biolgicos en cantidad esenciales para
cualquier forma de vida son C, N, H y O (los cuatro elementos
ms abundantes en los sistemas biolgicos) junto con Na, K,
Mg, Ca, P, S y Cl.
*Los elementos fundamentales que forman los bloques de
construccin de las biomolculas (por ejemplo aminocidos,
pptidos, carbohidratos, protenas, lpidos y cidos nucleicos)
son C, N, H y O adems del P que desempea un papel en ATP
y ADN y el S que es la clave en la capacidad de coordinacin
de los residuos de la cistena en las protenas.
*Entre las funciones de los elementos menos abundantes, pero
esenciales, estn:
a) Na, K y Cl (Control osmtico y la accin nerviosa)
b) Mg
2+
, Procesos de sntesis de clorofila y enzimas que
involucran la hidrlisis de fosfatos.
c) Ca
2+
, funciones estructurales (huesos, dientes, conchas) y
efectos desencadenantes (msculos)

Los metales traza son: V, Cr, Mn, Fe, Co, Ni, Cu, Zn y Mo.
No metales traza incluyen: B, Si, Se, F
2
y I
2


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metal Masa/mg Funcin biolgica
V 0.11 Enzimas (nitrogenasas, haloperoxidasas)
Cr 14 Metabolismo de la glucosa en mamiferos*
Mn 12 Enzimas (fosfatasas, superxidos dismutasa mitocondrial,
glicosil transferasa, actividad fotorredox en el fotosistema
Fe 4200 Sistemas de transferencia electrnica (protenas Fe-S,
citocromos); almacenamiento y transporte de O
2

(hemoglobina, mioglobina, hemeritrina); almacenamiento de
Fe (ferritina, transferritina); protenas de transporte de Fe
(siderforos); en enzimas (nitrogenasas, hidrogenasas,
oxidasas, reductasas)
Co 3 Coenzima de la vitamina B
12
Ni 15 Enzimas (ureasa, algunas hidrogenasas)
Cu 72 Sistemas de transferencia electrnica (protena azules de
cobre); almacenamiento y transporte de O
2
(hemocianina);
protenas de transporte de Cu (ceruloplasmina)
Zn 2300 Acta como cido de Lewis, funciones estructurales
Mo 5 Enzimas (nitrogenasas, reductasas, hidroxilasas)
Metales y Biologa: clasificacin de acuerdo a la funcin
Enzimas
Transporte y almacenamiento
de protenas
Sistemas aproteicos Metales en medicina
Transp.de
electrones
Almacenaje
Transporte
A. estructurales
Coordinacin
de O
2
Foto-redox Transp. de
metales
Teraputicas
Inter. con
cidos nucleicos
Diagnosis
Citocromo (Fe)
Hierro-azufre (Fe)
Cobre azul (Cu)
Ferritina (Fe)
Transferrina (Fe)
Ceruloplasmina (Cu)
Mioglobina (Fe)
Hemoglobina (Fe)
Hemeritrina (Fe)
Hemocianina (Cu)
Clorofila (Mg)
Fotosistema II
(Mg, Mn)
Sideroforas (Fe)
Metalochaperonas

Apoptosis (Mn, Zn)
Diabetes (V)
Alzheimer (Zn, Fe, Al)
Anticancer (Pt; Ru)
ADN/proteinas (Zn)
Hidrolasas oxidoreductosas Isomerasas y sintetasas
carbopeptidasas (Zn)
aminopeptidasas (Mg, Mn, Cu)
fosfatasas (Mg, Zn, Cu, Fe)
oxidasas (Fe, Cu, Mo)
Peroxidasas (Fe, Mn, V)
Dehidrogenasas (Fe, Cu, Mo, Ni; Zn)
Hidrolasas (Fe, Cu; Mo)
Oxigenasa (Fe)
Superxido dismutasa (Cu, Zn, Mn)
Nitrogenasa (Fe, Mo
Hidrogenasa (Fe, Ni)

Vitamina B-12 (Co)
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Principios de Qumica Bioinorgnica
Nociones fundamentales sobre la Qumica de las protenas
Pptidos y aminocidos
Estructura de las protenas

Qumica de coordinacin de los metales de transicin
Naturaleza del metal de transicin
Aspectos estructurales y geomtricos

Coordinacin de protenas a metales de transicin
Modos de coordinacin
Coordinacin directa a aminocidos
Coordinacin va-cofactores

Usos de tcnicas de Qumica bioinorgnica
Espectroscopia UV-vis
Espectroscopia Vibracional (IR o Raman)
EXAFS
EPR
Resonancia paramagntica RMN
Mssbauer
*Los aminocidos (aa) son molculas orgnicas pequeas con un grupo
amino (NH
2
) y un grupo carboxilo (COOH). La gran cantidad de protenas
que se conocen estn formadas nicamente por 20 aa diferentes.
*Desde el punto de vista biolgico, los nicos aminocidos importantes son
los llamados -aminocido de configuracin L, es decir, son aminocidos
en la cul el grupo NH
2
est unido al C vecino al grupo carboxilo y adems
desde el punto de vista ptico, son levorotarios.
*Todos los aminocidos tiene la misma formula general:

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Estructura de las protenas
Estructura primaria: secuencia de aminocidos unidos entre s
a travs de uniones peptdicas (estructura esqueleto covalente).

Estructura secundaria: est determinada por la conformacin de
la cadena polipeptdica. Las conformaciones ms
comunes son -helice (puentes de hidrgeno N-H y
C=O de las uniones peptdicas).

Estructura Terciaria: se refiere al plegamiento especfico
de las cadenas polipeptdicas que ya tienen una estructura secundaria,
reordenamiento estructural espacial y tridimensional de motivos
pre-organizados. Las estructuras comunes son globular y fibrilar.

Estructura cuaternaria: organizacin a travs de las subunidades.


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*Los aminocidos se encuentran unidos linealmente por medio de
uniones peptdicas. Estas uniones se forman por la reaccin de
sntesis (va deshidratacin) entre el grupo carboxilo del primer
aminocido con el grupo amino del segundo aminocido.
Qumicamente son macromolculas, polmeros de
aminocidos (ms de 100) dispuestos en una secuencia
lineal, sin ramificaciones. Una secuencia de menos de 100
aminocidos se denomina pptido.
Con la posibilidad de que 20 aminocidos diferentes
puedan ser ordenados en cualquier orden para conformar
polipptidos de cientos de aminocidos, tienen el
extraordinario potencial de producir una gran cantidad de
variantes en su conformacin. Esta variedad permite a las
protenas funciones tan refinadas como las de las enzimas
que permiten el metabolismo celular.
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*Enzimas: Protenas altamente especializadas, que
catalizan diversas reacciones qumicas implicadas en los
procesos vitales. Las enzimas se nombran agregando el
sufijo asa al nombre del sustrato, osea el compuesto sobre
el cual acta la enzima. Por ejemplo la fosfatasa cataliza
la hidrlisis de los steres fosfricos.
*Metaloenzimas: enzima que contiene un catin metlico
como grupo prosttico y cuya participacin es esencial
para el proceso cataltico.
*Cofactores: enzimas cuya actividad depende tanto de sus
estructura proteca como de un cofactor. Un cofactor
puede ser simplemente un ion metlico como Mg(II), Zn(II)
o Fe(II), que cuando est fuerte y permanece unido a la
protena es un grupo prosttico.
Holoenzimas: una enzima catalticamente activa y completa, con
su coenzima o cofactor recibe el nombre de holoenzima.
apoenzima + cofactor = holoenzima
Nucleotidos: son biomolculas importantes, constituyentes de los
cidos nucleicos. Un nucleotido est formada por una base
orgnica (purnica o pirimidnica), una pentosa y un grupo fosfato
(mono, di o tri- fosfato).
cidos nucleicos: polmeros constitudos por nucletidos, unidos
por puentes fosfatos


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Qumica de coordinacin de los metales de
transicin

Naturaleza del metal de transicin
Aspectos estructurales y geomtricos
Propiedades generales de los cationes metlicos
En principio los iones di y tri-valentes utilizados en los sistemas
biolgicos pueden manejarse como cidos , vale decir que
potencialmente pueden actuar de aceptores electrnicos por va
.
Para los cationes divalentes, la acidez sigue el orden de la serie
de Irving y Williams:
Mg< Mn< Fe< Co < Ni < Cu > Zn
Por otra parte, las variaciones de acidez tambin estn
fuertemente influenciadas por los ligandos en los sistemas
biolgicos. Por ejemplo: Fe(II) se incorpora a la porfirina o el
Co(II) a la corrina, disminuye la acidez , generndose un mayor
poder donor .
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*La aparicin de sta capacidad donora es fundamental para la
realizacin de ciertas funciones, por ejemplo: la interaccin del
hierro porfirnico con la molcula de O
2
para su activacin y
transporte

Desde otro punto de vista, podemos clasificar tambin a los
cationes utilizando el concepto ms general de cidos y bases
duros y blandos, que resulta muy til para el manejo de las
interacciones metal-ligando.
Clasificacin:
*cidos duros: H
+
, Na
+
, K
+
, Mg
2+
, Ca
2+
, Co
3+
y Fe
3+
*cidos intermedios: Zn
2+
, Cu
2+
, Ni
2+
, Fe
2+
, Mn
2+
y Co
2+

De acuerdo a la regla de Pearson, stos cidos tendern a
coordinarse a bases duras, tales como tomos de oxgeno (H
2
O),
grupos carboxilato, restos de fosfatos o funciones alcohlicas o de
nitrgeno (grupos imidazol, uniones peptdicas, bases nuclicas).
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Esto significa que los organismos vivos son desde ste punto de
vista sistemas duros, por el contrario elementos txicos y
contaminantes inorgnicos: Tl
+
, Cd
2+
, Hg
2+
o Pb
2+
, son sistemas
blandos y muestran tendencia por ligandos blandos (grupos
tiolato, sulfuro y seleniuro)

Ligandos Biolgicos para iones metlicos.

Las biomolculas contienen tomos o grupos de tomos
disponibles para interactuar con centros metlicos.
Las cadenas laterales de protenas, contienen toda una serie
de grupos con gran afinidad por los centros metlicos
(carboxilatos, grupos OH, N-imidazolnico).
Las bases nucleicas tienen gran capacidad de coordinacin,
grupos fosfatos y las pentosas de los nucletidos son ligandos
apropiados para muchos centros metlicos.
Sistemas biolgicos constituidos por macrociclos
tetrapirrlicos (quelantes tetradentados, porfirinas).
Estructura de la
Fe-protoporfirina IX
porfirina
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Espectros de complejos de metales de transicin
El espectro de los complejos de metales de transicin pueden tener varios orgenes:

a) Espectros asociados principalmente con los ligandos:
Frecuentemente se encuentran molculas orgnicas como ligandos de complejos
de metales de transicin y si en particular estas molculas tienen un sistema de
electrones- poseen entonces unos espectros caractersticos localizados en la
regin del ultravioleta. El espectro esta formado, por intensas bandas debidas
a transiciones permitidas *- .
a) Espectros implicando transiciones electrnicas entre el ion central y los ligandos
llamados espectros de transferencia de carga:
A causa de la proximidad entre el tomo central y los ligandos, existe la posibili-
dad de nuevas transiciones que implican la transferencia de un electrn del ligando
al tomo central o viceversa.
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c) Espectros asociados principalmente con el ion central, influen
ciado por la presencia de los ligandos, llamados espectros d-d.
Estas transiciones son prohibidas por la regla de Laporte, por lo
mismo son bandas muy dbiles en intensidad. Las bandas aparecen
en la regin visible del espectro. La geometra de los complejos
tiene un gran efecto sobre el espectro, no slo en el nmero y
posicin de sus bandas sino tambin por las intensidades.

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Funciones biolgicas en las que participan los iones metlicos
Las funciones generales ms importantes asociadas con
metales son las siguientes:

1.- Funciones estructurales
2.- Activacin y transporte de oxgeno
3.- Transporte de electrones
4.- Funciones catalticas en procesos redox
5.- Funciones catalticas en procesos cido-base
A parte de los grupos anteriormente mencionados, se han
encontrado otros sistemas que tambin contienen metales:

a) Sistemas que participan en la captacin, el transporte y la
acumulacin de metales. Varios de ellos son muy bien
conocidos en el caso del hierro y del cobre.
b) Sistemas que participan en procesos fotoqumicos, como la
clorofila, que contiene magnesio.
c) Sistemas que participan en procesos o mecanismos de
detoxificacin, como las metalotionenas.
d) Sistemas catinicos que ejercen funciones de control ,
regulacin y transmisin. (cationes alcalinos, alcalinos trreos)
y que aparecen involucrados en procesos tales, como el
control de presin osmtica, contraccin muscular y la
transmisin del impulso nervioso.
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Tcnicas espectroscpicas
Espectroscopia
Vibracional: IR y Raman
Espectroscopa Uv-Vis
Espectroscopia
Mssbauer
Espectroscopia de
resonancia magntica
nuclear RMN
Espectroscopa de
resonancia de espn
electrnico: EPR
Difraccin de
electrones: EXAFS
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*Los estudios por difraccin de rayos-X constituyen un
mtodo totalmente seguro de conocer la estructura y la
geometra completa de un compuesto qumico.
*Para el caso de biomolculas existen una serie de
complicaciones debidas, por un lado, al gran tamao de los
sistemas y adems por el hecho de que un elevado nmero
de los tomos presentes son tomos livianos.
*La resolucin de los mtodos difractomtricos
a veces no es suficiente como para extraer con-
clusiones precisas sobre detalle del entorno
metal-protena y adems por su difcil cristalizacin.

Por stas razones, la qumica bioinorgnica ha trabajado con
otra metodologa de anlisis estructural.


Mtodos Difractomtricos
* Espectrocopa (extented X-ray analysis fine structure).
*Aporta informacin valiosa y muy precisa sobre las distancias de
enlace metal-ligando, la geometra del centro metlico y del
estado de oxidacin del metal involucrado, con la ventaja
adicional que no se requiere de muestras cristalinas.
*Se trata de un mtodo de anlisis de estructura local, cuya
informacin est asociada a una difraccin de electrones. Para
una metaloprotena, la fuente de electrones y el detector es el
propio tomo metlico a investigar.
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La espectroscopia de absorcin en el ultravioleta y el visible, tambin
llamada espectroscopia electrnica.
Este mtodo se basa en las bandas de absorcin observadas en los
espectros electrnicos que pueden estar asociadas a:
1.-transiciones del tipo d-d entre niveles energticos delocalizados
esencialmente sobre el ion metlico.
2.- bandas de transferencias de carga que involucran tanto a orbitales
del metal como del ligando.
3.- transiciones internas de los ligandos transiciones electrnicas entre
O.M del ligando.
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*La espectroscopia infrarroja se basa en el hecho de que
las molculas tienen frecuencias a las cuales rotan y
vibran, es decir, los movimientos de rotacin y vibracin
moleculares tienen niveles de energa discretos (modos
normales vibracionales).

*Para que un modo vibracional en una molcula sea activa
al IR, debe estar asociada con cambios en el dipolo
permanente.
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Espectro IR experimental
Tcnica espectroscpica usada en qumica y fsica de la
materia condensada para estudiar modos de baja frecuencia
como los vibratorios, rotatorios. Para que una molcula sea
activa en Raman, la vibracin tiene que cambiar la
polarizabilidad de la molcula para que sea activa.
La espectroscopia infrarroja proporciona una informacin
similar, pero complementaria.
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ste mtodo, es una tcnica de esctroscopa nuclear
basada en la absorcin resonante de rayos . Si bien se
aplica a un nmero limitado de elementos es una
herramienta valiosa en el estudio de metalobiomolculas,
especialmente de aquellas conteniendo hierro, yodoy
potasio y entre los de inters bio-mdico o farmacolgico el
oro, estao, platino y rutenio.
Un espectro de absorcin Mssbauer del
57
Fe,
una divisin Zeeman. Divisin de un pico
sencillo, en tpicamente seis picos no
degenerados, como resultado de la interaccin
entre el ncleo y cualquier campo magntico
circundante.

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