DEPARTAMENTO: BIOLOGA MOLECULAR E INGENIERA

BIOQUMICA
REA ACADMICA: MICROBIOLOGA
PROFESORES:
Teora: Dr. Eduardo Santero Santurino
(esansan@upo.es; extensin 49386)
Prcticas: Dr. Francisca Reyes Ramrez
(freyram@upo.es; extensin 48644)
BIOTECNOLOGA
MICROBIANA
PROGRAMA DE LA ASIGNATURA
CURSO 2006 / 2007
LICENCIATURA EN BIOTECNOLOGA
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CURSO. Asignatura Cuatrimestral.

6 crditos: 4.5 Tericos+1.5 Prcticos
UNIVERSIDAD PABLO DE OLAVIDE
Facultad de Ciencias Experimentales
Licenciatura en Biotecnologa
BIOTECNOLOGA MICROBIANA. CURSO 2009-2010.
OBJETIVOS
Los microorganismos tienen una extraordinaria importancia en Biotecnologa. En primer lugar, muchas enzimas y
productos microbianos son de inters en la industria. En segundo lugar, los microorganismos son utilizados muy
abundantemente como agentes productores, tanto de productos de origen microbiano como de otros orgenes. Por ltimo, la
extraordinaria diversidad de actividades microbianas que puede ser utilizada en procesos biotecnolgicos de inters con
distintas finalidades. Con esta asignatura se pretende que el alumno se familiarice con la importancia real de los
microorganismos en los procesos biotecnolgicos, as como el extraordinario potencial que an queda por desarrollar. Se
presentan las herramientas bsicas que posibilitan la manipulacin gentica de microorganismos enfocadas hacia su
utilizacin en la produccin de sustancias de inters biotecnolgico, as como los diferentes sistemas de expresin gnica,
tanto en procariotas como en eucariotas, su potencialidad y limitaciones, y los productos o actividades microbianas de
inters en procesos biotecnolgicos. Estos conocimientos se desarrollarn desde un punto de vista aplicado concretndose
en procesos de inters actual que tengan utilidad biomdica, inters industrial o para la agricultura o el medio ambiente.
ORGANIZACIN DEL CURSO
El curso est basado fundamentalmente en la imparticin de clases tericas, la realizacin de prcticas y
actividades complementarias. Las actividades complementarias incluyen la presentacin oral en forma de seminario de una
parte del temario de la asignatura por parte de los estudiantes, la realizacin de un trabajo escrito y la elaboracin y
resolucin de cuestiones y problemas, que tendrn carcter voluntario.
CLASES TERICAS
La asignatura Biotecnologa Microbiana presenta inicialmente a los microorganismos como seres vivos
enormemente diversos y peculiares desde todos los puntos de vista en comparacin con los seres macroscpicos. El primer
bloque temtico, Principios de Biotecnologa Microbiana, utiliza la diversidad y peculiaridad de los microorganismos
como hilo conductor para presentar los diversos aspectos de inters biotecnolgico en bloques temticos posteriores. A su
vez, en este primer bloque se presentan otras caractersticas de inters de los microorganismos como la facilidad de su
cultivo y manipulacin, que los hace agentes de produccin biotecnolgica ejemplares.
Las aplicaciones biotecnolgicas concretas tanto de los productos como de las actividades de los microorganismos,
son el objeto de estudio de los siguientes bloques temticos. En el segundo bloque, Productos microbianos de inters
industrial, se presentan una seleccin de estos productos, empezando por la propia biomasa microbiana en s y pasando por
varios polmeros bacterianos, diversos metabolitos primarios, y finalizando con la produccin de energa por parte de los
microorganismos. El tercer bloque se centra en la Biotecnologa de los alimentos, de importancia vital en el desarrollo
histrico de la humanidad, en el que se incluyen tambin las bebidas fermentadas como el vino o la cerveza, as como el
control microbiolgico de los alimentos. En el cuarto bloque, Agrobiotecnologa, se tratan los aspectos beneficiosos que
pueden tener tanto las bacterias como los hongos, particularmente las micorrizas, en el crecimiento y produccin de cultivos
comerciales, as como la utilizacin de bacterias como vector en ingeniera gentica de plantas y diversos microorganismos
o sus productos en el control microbiolgico de plagas en cultivos comerciales. En el quinto bloque, denominado
Biotecnologa Ambiental se tratan temas de depuracin biolgica de aguas residuales urbanas y el potencial de los
microorganismos en la eliminacin de contaminantes y en biominera. El sexto bloque denominado Biocatlisis, se dedica a
describir los procesos de biotransformacin industriales en los que bien los microorganismos completos o algunas de sus
enzimas como biocatalizadores, poniendo de manifiesto el inters industrial por actividades enzimticas con caractersticas
particulares, y la importancia de la regio- o enantio- selectividad de las enzimas en la sntesis de determinados compuestos
orgnicos. Finalmente, el bloque temtico denominado Biotecnologa microbiana en medicina, se centra en la utilizacin
2
de microorganismos para la formulacin de distintos tipos de vacunas, as como la produccin de otros medicamentos como
los antibiticos.
PRCTICAS
Las clases prcticas estn pensadas como complemento a la docencia terica. Las prcticas se centrarn en un
aspecto concreto: la produccin heterloga por parte de bacterias. Los estudiantes utilizarn estirpes de E. coli para producir
un colorante textil, el ndigo, y en la prctica se enfrentarn con uno de los problemas ms frecuentes en la produccin
heterloga de protenas: la estabilidad del fenotipo productor.
ACTIVIDADES COMPLEMENTARIAS
SEMINARIOS
Los alumnos/as participarn de forma voluntaria en la presentacin de algunos de los temas del temario terico
al resto de sus compaeros/as. Ello incluye la bsqueda bibliogrfica orientada por el profesor, la lectura de ella, la
discusin de las cuestiones que surjan, aclaracin de dudas con el profesor, etc. Finalmente, cada alumno/a realizar una
presentacin oral en formato seminario de un aspecto concreto de uno de los temas del bloque temtico correspondiente.
Los seminarios estarn apoyados por una presentacin en formato PowerPoint o similar, compatible con los ordenadores
disponibles. La duracin de esta presentacin ser de 20 minutos mximo y se realizarn dos seminarios en una misma hora
de clase terica. En la misma semana que imparta un seminario el estudiante ha de facilitar al profesor un extracto del
seminario que va a impartir en formato electrnico (3 pginas mximo a espacio y medio en letra Times o Times New
Roman 12 y con mrgenes de 2,5 cm), en el que incluya los libros y referencias adicionales, as como el documento de
presentacin de las figuras utilizadas durante la exposicin. El profesor ser absolutamente estricto con el formato y con la
fecha de entrega de los documentos. El profesor har este material accesible al resto de los compaeros/as. Tras la
presentacin oral, los estudiantes puntuarn de forma annima la actividad complementaria de cada uno de sus
compaeros/as en funcin de la organizacin del seminario, adecuacin de la cantidad de informacin al tiempo de
exposicin disponible, claridad en la exposicin de los aspectos importantes, etc.
TRABAJOS ESCRITOS
Los estudiantes podrn realizar de forma voluntaria un trabajo escrito sobre algn tema concreto de inters
relacionado con los contenidos de la asignatura. Tanto la eleccin del tema como la bibliografa seleccionada por el propio
estudiante debern estar supervisados por el profesor antes de realizar el trabajo. Las referencias empleadas debern ser
citadas al final del trabajo. La extensin mxima del trabajo ser de 7 pginas mecanografiadas a espacio y medio con letra
tipo Times o Times New Roman, tamao 12 y con mrgenes de 2,5 cm (referencias aparte). Cualquier intento de plagio
detectado en dichos trabajos significar el suspenso inmediato en la asignatura. Los trabajos escritos se entregarn por
correo electrnico a travs de la WebCT al profesor de teora de la asignatura antes de la fecha del examen.
CUESTIONES
Cada estudiante podr redactar de forma voluntaria el enunciado de hasta 4 cuestiones/problemas, a los que debe
acompaar la respuesta que considere correcta de forma argumentada y la razn por la que considera de inters esa cuestin
que ha enunciado. En su caso, dicha cuestin/ problema NO PUEDE ESTAR RELACIONADA con el seminario o con el
trabajo que haya realizado o vaya a realizar. Las cuestiones se presentarn por correo electrnico a travs de la WebCT al
menos dos semanas antes de la fecha del examen terico. El profesor se compromete a hacer estas cuestiones accesibles al
resto de los estudiantes y a incluir en el examen de teora algunas de estas cuestiones que considere particularmente
relevantes. Esta actividad tambin es puntuable en funcin del inters de la cuestin presentada.
EVALUACIN
Evaluacin de los exmenes de teora, prcticas y actividades complementarias.
La evaluacin de los competencias y conocimientos tericos adquiridos por el alumno se llevar a cabo mediante un
examen final, calificado de 0 a 8, un seminario calificado de 0 a 2 puntos, un trabajo escrito voluntario, calificado de 0 a 1
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punto, y la presentacin de cuestiones/problemas resueltos, calificada de 0 a 1 punto. Se considerarn aprobados los
contenidos tericos cuando la calificacin del examen terico correspondiente sea mayor o igual a 4 y la suma de todas las
calificaciones sea mayor o igual que 5.
La asistencia a las clases prcticas es obligatoria, y las faltas de asistencia no justificadas se penalizarn en la calificacin,
pudiendo conllevar incluso el suspenso en la asignatura. La evaluacin de los conocimientos prcticos adquiridos se llevar
a cabo por medio de 1 cuestionario, calificados de 0 a 10, que el alumno contestar junto con el examen de teora.
La calificacin numrica de la asignatura (CN) ser: CN = (CP+3CT)/4, siempre que CT sea 5 y CP sea 3,5. En caso
contrario, la calificacin global ser Suspenso. Las calificaciones de Aprobado, Notable y Sobresaliente se asignarn de
acuerdo con la normativa vigente. Se adjudicar la calificacin de Matrculas de honor a aquellos alumnos que, habiendo
obtenido Sobresaliente, presenten la mayor calificacin numrica.
Convocatorias de septiembre y diciembre.
Aquellos alumnos que no hayan aprobado la teora o la prctica en la primera convocatoria podrn presentarse en las
convocatorias de septiembre o diciembre, con las limitaciones que recoge la normativa universitaria. Las calificaciones de
teora y de las actividades complementarias se mantendrn hasta la convocatoria de diciembre (inclusive). Una vez
aprobadas, las calificaciones de las prcticas se mantendrn de forma indefinida. Aquellos alumnos que no hayan aprobado
las prcticas en la convocatoria de diciembre tendrn que repetir las sesiones para poderse examinar de nuevo.
PROGRAMA DE CLASES TERICAS
Bloque I.- Principios de Biotecnologa Microbiana.
1. Diversidad Microbiana.
2. Metagenmica.
3. Microorganismos de inters industrial.
4. Produccin heterloga de protenas.
Bloque II.- Productos microbianos de inters industrial:
5. Biomasa.
6. Polmeros.
7. Metabolitos primarios
8. Energa.
Bloque III.- Biotecnologa de los alimentos.
9. Bebidas
10. Productos lcteos
11. Otros alimentos fermentados.
12. Control microbiolgico de los alimentos
Bloque IV.- Agrobiotecnologa.
13. Rhizobium y PGPRs.
14. Agrobacterium.
15. Micorrhizas.
16. Plaguicidas naturales.
Bloque V.- Biotecnologa Ambiental.
17. Depuracin de residuos urbanos.
18. Biodegradacin de contaminantes orgnicos.
19. Biorremediacin.
20. Biominera
Bloque VI.- Biocatlisis.
21. Enzimas microbianas de inters.
22. Optimizacin del biocatalizador y del proceso.
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Bloque VII.- Biotecnologa Microbiana en Medicina.
23. Fundamentos de inmunologa.
24. Vacunas.
25. Antibiticos.
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PROGRAMA DE PRCTICAS:
PRODUCCIN DE METABOLITOS POR MICROORGANISMOS MODIFICADOS
GENTICAMENTE
OBJETIVOS
Iniciar al alumno en el manejo y modificacin gentica de microorganismos para la produccin de metabolitos con un
posible uso industrial.
CONTENIDOS
1. Adquisicin de nuevos fenotipos mediante transferencia de informacin gentica por transformacin.
2. Anlisis de los microorganismos modificados mediante tcnicas de biologa molecular
. !omparacin de la eficiencia de distintas opciones para la superproduccin de protenas con actividades
en"imticas de inters
#. Aislamiento y cuantificacin del metabolito producido
BIBLIOGRAFA Y PGINAS WEB DE INTERS.
BIBLIOGRAFA BSICA
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ISBN-10: 0-8493-5334-3. ISBN-13: 978-0-8493-5334-5.
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0521842107. ISBN-13: 978-0521842105
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BIBLIOGRAFA COMPLEMENTARIA
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!ambridge Jniversity (ress
DIRECCIONES DE INTERS EN INTERNET (son direcciones generales desde las cuales se puede seguir
buscando. Si te interesa navega desde ellas)
http://www.asm.org/
La pgina de la Sociedad Americana de Microbiologa (ASM). Se puede encontrar informacin interesante y
buenas fotos y videos sobre temas de microbiologa.
http://www.sfam.org.uk/resources.php
Lista de enlaces a fuentes de informacin de microbiologa de la pgina de la Sociedad de Microbiologa aplicada
del Reino Unido. Desde aqu se puede llegar a muchsima informacin de microbiologa en internet.
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http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
La pgina principal del National Centre for Biotecnology Information. Desde aqu se puede llegar a mucha
informacin e incluye enlaces a bsquedas bibliogrficas y otras bases de datos.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/
Lugar de acceso gratuito a Medline, la mayor base de datos de trabajos cientficos de contenido biolgico o
biomdico. El primer lugar donde uno debe acudir si quiere buscar bibliografa cientfica sobre cualquier tema.
http://umbbd.msi.umn.edu/
La base de datos sobre rutas de biodegradacin de distintos compuestos xenobiticos de la Universidad de
Minnesota (UM-BBD). 100 rutas de degradacin de compuestos. Estupendos enlaces con bases de datos de gran
inters en biodegradacin y metabolismo global: microorganismos degradadores, rutas metablicas generales,
compuestos qumicos, etc. Pulsa Useful Internet Resources.
http://metacyc.org/
Base de datos no redundante de rutas metablicas caracterizadas experimentalmente. 900 rutas metablicas de
otros tantos organismos, junto con informacin de los compuestos asociados, enzimas y sus genes.
http://www.semicro.es/
Pgina de la Sociedad Espaola de Microbiologa. Tiene enlaces con otros muchos sitios con informacin
interesante de temas microbiolgicos.
RECURSOS EN EL SERVIDOR DE LA UPO
Toda la informacin relativa a la asignatura se publicar en el servidor WebCT de la UPO, incluyendo las presentaciones
Powerpoint de los temas, bibliografa adicional, los protocolos y calendarios de las prcticas, las convocatorias de examen y
las calificaciones obtenidas.
TUTORAS
Las tutoras se llevarn a cabo a demanda, sin horario preestablecido y previa cita. El profesorado de la asignatura entiende
que las tutoras son una herramienta fundamental de aprendizaje y de comunicacin y recomienda a los alumnos que no se
cohban a la hora de hacer uso de las mismas. No se darn cita para tutoras en las 24 horas anteriores a la realizacin de
ningn examen de la asignatura. Los telfonos y correos electrnicos de contacto de los profesores se indican en la primera
pgina, aunque se recomienda utilizar el servicio de correo electrnico de la plataforma WebCT.
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