INTRODUCCION AL ADN

El cido desoxirribonucleico, abreviado como ADN, es un cido nucleico que contiene

instrucciones genticas usadas en el desarrollo y funcionamiento de todos los organismos
vivos conocidos y algunos virus, y es responsable de su transmisin hereditaria. El papel
principal de la molcula de ADN es el
almacenamiento a largo plazo de informacin.
Muchas veces, el ADN es comparado con un plano o
una receta, o un cdigo, ya que contiene las
instrucciones necesarias para construir otros
componentes de las clulas, como las protenas y las
molculas de ARN. Los segmentos de ADN que
llevan esta informacin gentica son llamados genes,
pero las otras secuencias de ADN tienen propsitos
estructurales o toman parte en la regulacin del uso
de esta informacin gentica.
Desde el punto de vista qumico, el ADN es un
polmero de nucletidos, es decir, un polinucletido.
Un polmero es un compuesto formado por muchas
unidades simples conectadas entre s, como si fuera
un largo tren formado porvagones. En el ADN, cada
vagn es un nucletido, y cada nucletido, a su vez,
est formado por un azcar (la desoxirribosa), una base nitrogenada (que puede ser
adeninaA, timinaT, citosinaC o guaninaG ) y un grupo fosfato que acta como
enganche de cada vagn con el siguiente. Lo que distingue a un vagn (nucletido) de otro es,
entonces, la base nitrogenada, y por ello la secuencia del ADN se especifica nombrando slo
la secuencia de sus bases. La disposicin secuencial de estas cuatro bases a lo largo de la
cadena (el ordenamiento de los cuatro tipos de vagones a lo largo de todo el tren) es la que
codifica la informacin gentica: por ejemplo, una secuencia de ADN puede ser
ATGCTAGATCGC... En los organismos vivos, el ADN se presenta como una doble cadena de
nucletidos, en la que las dos hebras estn unidas entre s por unas conexiones denominadas
puentes de hidrgeno.
Para que la informacin que contiene el ADN pueda ser utilizada por la maquinaria celular,
debe copiarse en primer lugar en unos trenes de nucletidos, ms cortos y con unas unidades
diferentes, llamados ARN. Las molculas de ARN se copian exactamente del ADN mediante un
proceso denominado transcripcin. Una vez procesadas en el ncleo celular, las molculas de
ARN pueden salir al citoplasma para su utilizacin posterior. La informacin contenida en el
ARN se interpreta usando el cdigo gentico, que especifica la secuencia de los aminocidos
de las protenas, segn una correspondencia de un triplete de nucletidos (codn) para cada
aminocido. Esto es, la informacin gentica (esencialmente: qu protenas se van a producir
en cada momento del ciclo de vida de una clula) se halla codificada en las secuencias de
nucletidos del ADN y debe traducirse para poder funcionar. Tal traduccin se realiza usando
el cdigo gentico a modo de diccionario. El diccionario "secuencia de nucletido-secuencia
de aminocidos" permite el ensamblado de largas cadenas de aminocidos (las protenas) en el
citoplasma de la clula. Por ejemplo, en el caso de la secuencia de ADN indicada antes
(ATGCTAGATCGC...), la ARN polimerasa utilizara como molde la cadena complementaria de
dicha secuencia de ADN (que sera TAC-GAT-CTA-GCG-...) para transcribir una molcula de
ARNm que se leera AUG-CUA-GAU-CGC-... ; el ARNm resultante, utilizando el cdigo
gentico, se traducira como la secuencia de aminocidos metionina-leucina-cido asprtico-
arginina-...
Las secuencias de ADN que constituyen la unidad fundamental, fsica y funcional de la
herencia se denominan genes. Cada gen contiene una parte que se transcribe a ARN y otra
que se encarga de definir cundo y dnde deben expresarse. La informacin contenida en los
genes (gentica) se emplea para generar ARN y protenas, que son los componentes bsicos
de las clulas, los "ladrillos" que se utilizan para la construccin de los orgnulos u organelos
celulares, entre otras funciones.
Dentro de las clulas, el ADN est organizado en estructuras llamadas cromosomas que,
durante el ciclo celular, se duplican antes de que la clula se divida. Los organismos
eucariotas (por ejemplo, animales, plantas, y hongos) almacenan la mayor parte de su ADN
dentro del ncleo celular y una mnima parte en elementos celulares llamadosmitocondrias, y
en los plastos y los centros organizadores de microtbulos o centrolos, en caso de tenerlos;
los organismos procariotas (bacterias y arqueas) lo almacenan en el citoplasma de la clula, y,
por ltimo, los virus ADN lo hacen en el interior de la cpsida de naturaleza proteica. Existen
multitud de protenas, como por ejemplo las histonas y los factores de transcripcin, que se
unen al ADN dotndolo de una estructura tridimensional determinada y regulando su
expresin. Los factores de transcripcin reconocen secuencias reguladoras del ADN y
especifican la pauta de transcripcin de los genes. El material gentico completo de una
dotacin cromosmica se denomina genoma y, con pequeas variaciones, es caracterstico de
cada especie.
Historia de la gentica

El ADN lo aisl por primera vez, durante el invierno de 1869,
el mdico suizo Friedrich Miescher mientras trabajaba en la
Universidad de Tubinga. Miescher realizaba experimentos
acerca de la composicin qumica del pus de vendas
quirrgicas desechadas cuando not un precipitado de una
sustancia desconocida que caracteriz qumicamente ms
tarde.Lo llam nuclena, debido a que lo haba extrado a
partir de ncleos celulares. Se necesitaron casi 70 aos de
investigacin para poder identificar los componentes y la
estructura de los cidos nucleicos.
En 1919 Phoebus Levene identific que un nucletido est
formado por una base nitrogenada, un azcar y un
fosfato.Levene sugiri que el ADN generaba una estructura
con forma de solenoide (muelle) con unidades de nucletidos
unidos a travs de los grupos fosfato. En 1930 Levene y su
maestro Albrecht Kossel probaron que la nuclena de Miescher es un cido
desoxirribonucleico (ADN) formado por cuatro bases nitrogenadas (citosina (C), timina (T),
adenina (A) y guanina (G)), el azcar desoxirribosa y un grupo fosfato, y que, en suestructura
bsica, el nucletido est compuesto por un azcar unido a la base y al fosfato.
6
Sin embargo,
Levene pensaba que la cadena era corta y que las bases se repetan en un orden fijo. En 1937
William Astbury produjo el primer patrn de difraccin de rayos X que mostraba que el ADN
tena una estructura regular.
La funcin biolgica del ADN comenz a dilucidarse en 1928,
con una serie bsica de experimentos de la gentica moderna
realizados por Frederick Griffith, quien estaba trabajando con
cepas "lisas" (S) o "rugosas" (R) de la bacteria Pneumococcus
(causante de la neumona), segn la presencia (S) o no (R) de
una cpsula azucarada, que es la que confiere virulencia
(vase tambin experimento de Griffith). La inyeccin de
neumococos S vivos en ratones produce la muerte de stos, y
Griffith observ que, si inyectaba ratones con neumococos R
vivos o con neumococos S muertos por calor, los ratones no
moran. Sin embargo, si inyectaba a la vez neumococos R vivos y neumococos S muertos, los
ratones moran, y en su sangre se podan aislar neumococos S vivos. Como las bacterias
muertas no pudieron haberse multiplicado dentro del ratn, Griffith razon que deba
producirse algn tipo de cambio o transformacin de un tipo bacteriano a otro por medio de
una transferencia de alguna sustancia activa, que denomin principio transformante. Esta
sustancia proporcionaba la capacidad a los neumococos R de producir una cpsula azucarada y
transformarse as en virulentas. En los siguientes 15 aos, estos experimentos iniciales se
replicaron mezclando distintos tipos de cepas bacterianas muertas por el calor con otras vivas,
tanto en ratones (in vivo) como en tubos de ensayo (in vitro).
8
La bsqueda del factor
transformante que era capaz de hacer virulentas a cepas que inicialmente no lo eran continu
hasta 1944, ao en el cual Oswald Avery, Colin MacLeod yMaclyn McCarty realizaron un
experimento hoy clsico. Estos investigadores extrajeron la fraccin activa (el factor
transformante) y, mediante anlisis qumicos, enzimticos yserolgicos, observaron que no
contena protenas, ni lpidos no ligados, ni polisacridos activos, sino que estaba constituido
principalmente por "una forma viscosa de cido desoxirribonucleico altamente polimerizado",
es decir, ADN. El ADN extrado de las cepas bacterianas S muertas por el calor lo mezclaron
"in vitro" con cepas R vivas: el resultado fue que se formaron colonias bacterianas S, por lo
que se concluy inequvocamente que el factor o principio transformante era el ADN.
A pesar de que la identificacin del ADN como principio transformante an tard varios aos
en ser universalmente aceptada, este descubrimiento fue decisivo en el conocimiento de la
base molecular de la herencia, y constituye el nacimiento de la gentica molecular.
Finalmente, el papel exclusivo del ADN en la heredabilidad fue confirmado en 1952 mediante
los experimentos de Alfred Hershey y Martha Chase, en los cuales comprobaron que el fago
T2 transmita su informacin gentica en su ADN, pero no en su protena
10
(vase tambin
experimento de Hershey y Chase).
En cuanto a la caracterizacin qumica de la molcula, en 1940 Chargaff realiz algunos
experimentos que le sirvieron para establecer las proporciones de las bases nitrogenadas en
el ADN. Descubri que las proporciones de purinas eran idnticas a las de pirimidinas, la
"equimolecularidad" de las bases ([A]=[T], [G]=[C]) y el hecho de que la cantidad de G+C en
una determinada molcula de ADN no siempre es igual a la cantidad de A+T y puede variar
desde el 36 hasta el 70 por ciento del contenido total. Con toda esta informacin y junto con
los datos de difraccin de rayos X proporcionados por Rosalind Franklin, James Watson y
Francis Crick propusieron en 1953 el modelo de la doble hlice de ADN para representar la
estructura tridimensional del polmero. En una serie de cinco artculos en el mismo nmero de
Nature se public la evidencia experimental que apoyaba el modelo de Watson y Crick. De
stos, el artculo de Franklin y Raymond Gosling fue la primera publicacin con datos de
difraccin de rayos X que apoyaba el modelo de Watson y Crick, y en ese mismo nmero de
Nature tambin apareca un artculo sobre la estructura del ADN de Maurice Wilkins y sus
colaboradores.
15

Watson, Crick y Wilkins recibieron conjuntamente, en 1962, despus de la muerte de Rosalind
Franklin, el Premio Nobel en Fisiologa o Medicina. Sin embargo, el debate contina sobre
quin debera recibir crdito por el descubrimiento.
Propiedades fsicas y qumicas
Estructura qumica del ADN: dos cadenas de nucletidos conectadas mediante puentes de
hidrgeno, que aparecen como lneas punteadas.
El ADN es un largo polmero formado por unidades repetitivas, los nucletidos. Una doble
cadena de ADN mide de 22 a 26 angstroms (2,2 a 2,6 nanmetros) de ancho, y una unidad (un
nucletido) mide 3,3 (0,33 nm) de largo. Aunque cada unidad individual que se repite es muy
pequea, los polmeros de ADN pueden ser molculasenormes que contienen millones de
nucletidos. Por ejemplo, el cromosoma humano ms largo, el cromosoma nmero 1, tiene
aproximadamente 220 millones de pares de bases.
En los organismos vivos, el ADN no suele existir como una molcula individual, sino como una
pareja de molculas estrechamente asociadas. Las dos cadenas de ADN se enroscan sobre s
mismas formando una especie de escalera de caracol, denominada doble hlice. El modelo de
estructura en doble hlice fue propuesto en 1953 por James Watson y Francis Crick (el
artculo Molecular Structure of Nucleic Acids: A Structure for Deoxyribose Nucleic Acid fue
publicado el 25 de abril de 1953 en Nature), despus de obtener una imagen de la estructura
de doble hlice gracias a la refraccin por rayos X hecha por Rosalind Franklin.
22
El xito de
este modelo radicaba en su consistencia con las propiedades fsicas y qumicas del ADN. El
estudio mostraba adems que la complementariedad de bases poda ser relevante en su
replicacin, y tambin la importancia de la secuencia de bases como portadora de informacin
gentica.Cada unidad que se repite, el nucletido, contiene un segmento de la estructura de
soporte (azcar + fosfato), que mantiene la cadena unida, y una base, que interacciona con la
otra cadena de ADN en la hlice. En general, una base ligada a un azcar se denomina
nuclesido y una base ligada a un azcar y a uno o ms grupos fosfatos reciben el nombre de
nucletido.
Cuando muchos nucletidos se encuentran unidos, como ocurre en el ADN, el polmero
resultante se denominapolinucletido.
Componentes
Estructura de soporte: La estructura de soporte de una hebra de ADN
est formada por unidades alternas de grupos fosfato y azcar
(desoxirribosa).El azcar en el ADN es una pentosa, concretamente, la
desoxirribosa.
cido fosfrico:

Enlace fosfodister. El grupo fosfato(PO
4
3-
) une el carbono 5' del
azcar de unnuclesido con el carbono 3' del siguiente.
Su frmula qumica es H
3
PO
4
. Cada nucletido puede contener uno
(monofosfato: AMP), dos (difosfato: ADP) o tres (trifosfato:ATP)
grupos de cido fosfrico, aunque como monmeros constituyentes de
los cidos nucleicos slo aparecen en forma de nuclesidos monofosfato.
Desoxirribosa:
Es un monosacrido de 5 tomos de carbono (una pentosa) derivado de la ribosa, que forma
parte de la estructura de nucletidos del ADN. Su frmula es C
5
H
10
O
4
. Una de las principales
diferencias entre el ADN y el ARN es el azcar, pues en el ARN la 2-desoxirribosa del ADN
es reemplazada por una pentosa alternativa, la ribosa.
Las molculas de azcar se unen entre s a travs de grupos fosfato, que forman enlaces
fosfodister entre los tomos de carbono tercero (3, tres prima) y quinto (5, cinco prima)
de dos anillos adyacentes de azcar. La formacin de enlacesasimtricos implica que cada
hebra de ADN tiene una direccin. En una doble hlice, la direccin de los nucletidos en una
hebra (3 5) es opuesta a la direccin en la otra hebra (5 3). Esta organizacin de las
hebras de ADN se denomina antiparalela; son cadenas paralelas, pero con direcciones
opuestas. De la misma manera, los extremos asimtricos de las hebras de ADN se denominan
extremo 5 (cinco prima) y extremo 3 (tres prima), respectivamente.
Bases nitrogenadas:
Las cuatro bases nitrogenadas mayoritarias que se encuentran en el ADN son la adenina (A),
la citosina (C), la guanina (G) y latimina (T). Cada una de estas cuatro bases est unida al
armazn de azcar-fosfato a travs del azcar para formar el nucletido completo (base-
azcar-fosfato). Las bases son compuestos heterocclicos y aromticos con dos o ms tomos
de nitrgeno, y, dentro de las bases mayoritarias, se clasifican en dos grupos: las bases
pricas o purinas (adenina y guanina), derivadas de lapurina y formadas por dos anillos unidos
entre s, y las bases pirimidnicas o bases pirimdicas o pirimidinas (citosina y timina),
derivadas de la pirimidina y con un solo anillo.
25
En los cidos nucleicos existe una quinta base
pirimidnica, denominada uracilo(U), que normalmente ocupa el lugar de la timina en el ARN y
difiere de sta en que carece de un grupo metilo en su anillo. El uracilo no se encuentra
habitualmente en el ADN, slo aparece raramente como un producto residual de la degradacin
de la citosina por procesos de desaminacin oxidativa.
Timina:
En el cdigo gentico se representa con la letra T. Es un derivado
pirimidnico con un grupo oxo en las posiciones 2 y 4, y un grupo metil
en la posicin 5. Forma el nuclesido timidina (siempre desoxitimidina,
ya que slo aparece en el ADN) y el nucletido timidilato o timidina
monofosfato (dTMP). En el ADN, la timina siempre se empareja con la
adenina de la cadena complementaria mediante 2 puentes de hidrgeno,
T=A. Su frmula qumica es C
5
H
6
N
2
O
2
y su nomenclatura 2, 4-dioxo, 5-
metilpirimidina.

Citosina: 2-oxo, 4-aminopirimidina.
Citosina:
En el cdigo gentico se representa con la letra C. Es un derivado
pirimidnico, con un grupo amino en posicin 4 y un grupo oxo en
posicin 2. Forma el nuclesido citidina (desoxicitidina en el ADN) y el
nucletido citidilato o (desoxi)citidina monofosfato (dCMP en el ADN,
CMP en el ARN). La citosina siempre se empareja en el ADN con la
guanina de la cadena complementaria mediante un triple enlace, CG. Su frmula qumica es
C
4
H
5
N
3
O y su nomenclatura 2-oxo, 4 aminopirimidina. Su masa molecular es de 111,10
unidades de masa atmica. La citosina se descubri en 1894, al aislarla del tejido del timo de
carnero.

Adenina: 6-aminopurina.
Adenina:
En el cdigo gentico se representa con la letra A. Es un derivado de la purina con un grupo
amino en la posicin Forma el nuclesido adenosina (desoxiadenosina
en el ADN) y el nucletido adenilato o (desoxi) adenosina monofosfato
(dAMP, AMP). En el ADN siempre se empareja con la timina de la
cadena complementaria mediante 2 puentes de hidrgeno, A=T. Su
frmula qumica es C
5
H
5
N
5
y su nomenclatura 6-aminopurina. La
adenina, junto con la timina, fue descubierta en 1885 por el mdico
alemn Albrecht Kossel.

Guanina: 6-oxo, 2-aminopurina.
Guanina:
En el cdigo gentico se representa con la letra G. Es un derivado prico con un grupo oxo en
la posicin 6 y un grupo amino en la posicin 2. Forma el nuclesido (desoxi)guanosina y el
nucletido guanilato o (desoxi)guanosina monofosfato (dGMP,
GMP). La guanina siempre se empareja en el ADN con la citosina
de la cadena complementaria mediante tres enlaces de hidrgeno,
GC. Su frmula qumica es C
5
H
5
N
5
O y su nomenclatura 6-oxo,
2-aminopurina.
Tambin existen otras bases nitrogenadas (las llamadas bases
nitrogenadas minoritarias), derivadas de forma natural o sinttica
de alguna otra base mayoritaria. Lo son por ejemplo la hipoxantina, relativamente abundante
en el tRNA, o la cafena, ambas derivadas de la adenina; otras, como el aciclovir, derivadas de
la guanina, son anlogos sintticos usados en terapia antiviral; otras, como una de las
derivadas del uracilo, son antitumorales.
Las bases nitrogenadas tienen una serie de caractersticas que les confieren unas propiedades
determinadas. Una caracterstica importante es su carcter aromtico, consecuencia de la
presencia en el anillo de dobles enlaces en posicin conjugada. Ello les confiere la capacidad
de absorber luz en la zona ultravioleta del espectro en torno a los 260 nm, lo cual puede
aprovecharse para determinar el coeficiente de extincin del ADN y hallar la concentracin
existente de los cidos nucleicos. Otra de sus caractersticas es que presentan tautomera o
isomera de grupos funcionales, debido a que un tomo de hidrgeno unido a otro tomo puede
migrar a una posicin vecina; en las bases nitrogenadas se dan dos tipos de tautomeras:
tautomera lactama-lactima, donde el hidrgeno migra del nitrgeno al oxgeno del grupo oxo
(forma lactama) y viceversa (forma lactima), y tautomera imina-amina primaria, donde el
hidrgeno puede estar formando el grupo amina (forma amina primaria) o migrar al nitrgeno
adyacente (forma imina). La adenina slo puede presentar tautomera amina-imina, la timina y
el uracilo muestran tautomera doble lactama-lactima, y la guanina y citosina pueden presentar
ambas. Por otro lado, y aunque se trate de molculas apolares, las bases nitrogenadas
presentan suficiente carcter polar como para establecer puentes de hidrgeno, ya que tienen
tomos muy electronegativos (nitrgeno y oxgeno) que presentan carga parcial negativa, y
tomos de hidrgeno con carga parcial positiva, de manera que se forman dipolos que
permiten que se formen estos enlaces dbiles.
Se estima que el genoma humano haploide tiene alrededor de 3.000 millones de pares de
bases. Para indicar el tamao de las molculas de ADN se indica el nmero de pares de bases,
y como derivados hay dos unidades de medida muy utilizadas, la kilobase (kb), que equivale a
1.000 pares de bases, y la megabase (Mb), que equivale a un milln de pares de bases.
Apareamiento de bases


Un par de bases CG con trespuentes de hidrgeno.


Un par A=T con dos puentes de hidrgeno. Los puentes de hidrgeno se muestran como lneas
discontinuas.
La dble hlice de ADN se mantiene estable mediante la formacin de puentes de hidrgeno
entre las bases asociadas a cada una de las dos hebras. Para la formacin de un enlace de
hidrgeno una de las bases debe presentar un "donador" de hidrgenos con un tomo de
hidrgeno con carga parcial positiva (-NH
2
o -NH) y la otra base debe presentar un grupo
"aceptor" de hidrgenos con un tomo cargadoelectronegativamente (C=O o N). Los puentes
de hidrgeno son uniones ms dbiles que los tpicos enlaces qumicos covalentes, como los
que conectan los tomos en cada hebra de ADN, pero ms fuertes que interacciones
hidrfobas individuales, enlaces de Van der Waals, etc. Como los puentes de hidrgeno no son
enlaces covalentes, pueden romperse y formarse de nuevo de forma relativamente sencilla.
Por esta razn, las dos hebras de la doble hlice pueden separarse como una cremallera, bien
por fuerza mecnica o por altatemperatura.
28
La doble hlice se estabiliza adems por el efecto
hidrofbico y el apilamiento, que no se ven influidos por la secuencia de bases del ADN.
Cada tipo de base en una hebra forma un enlace nicamente con un tipo de base en la otra
hebra, lo que se denominacomplementariedad de las bases. As, las purinas forman enlaces
con las pirimidinas, de forma que A se enlaza slo con T, y C slo con G. La organizacin de
dos nucletidos apareados a lo largo de la doble hlice se denomina apareamiento de bases.
Este emparejamiento corresponde a la observacin ya realizada por Erwin Chargaff (1905-
2002),
30
que mostr que la cantidad de adenina era muy similar a la cantidad de timina, y que
la cantidad de citosina era igual a la cantidad de guanina en el ADN. Como resultado de esta
complementariedad, toda la informacin contenida en la secuencia de doble hebra de la hlice
de ADN est duplicada en cada hebra, lo cual es fundamental durante el proceso de replicacin
del ADN. En efecto, esta interaccin reversible y especfica entre pares de bases
complementarias es crtica para todas las funciones del ADN en los organismos vivos.
18

Como se ha indicado anteriormente, los dos tipos de pares de bases forman un nmero
diferente de enlaces de hidrgeno: A=T forman dos puentes de hidrgeno, y CG forman tres
puentes de hidrgeno (ver imgenes). El par de bases GC es por tanto ms fuerte que el par
de bases AT. Como consecuencia, tanto el porcentaje de pares de bases GC como la longitud
total de la doble hlice de ADN determinan la fuerza de la asociacin entre las dos hebras de
ADN. Las dobles hlices largas de ADN con alto contenido en GC tienen hebras que
interaccionan ms fuertemente que las dobles hlices cortas con alto contenido en AT.
31
Por
esta razn, las zonas de la doble hlice de ADN que necesitan separarse fcilmente tienden a
tener un alto contenido en AT, como por ejemplo la secuencia TATAAT de la caja de Pribnow
de algunos promotores.
32
En el laboratorio, la fuerza de esta interaccin puede medirse
buscando la temperatura requerida para romper los puentes de hidrgeno, la temperatura de
fusin (tambin denominado valor T
m
, del ingls melting temperature). Cuando todas las pares
de bases en una doble hlice se funden, las hebras se separan en solucin en dos hebras
completamente independientes. Estas molculas de ADN de hebra simple no tienen una nica
forma comn, sino que algunas conformaciones son ms estables que otras.
33

Otros tipos de pares de bases



Par de bases A=T de tipo Watson-Crick. En azul el
donador de hidrgenos y en rojo el aceptor.




Par de bases A=T de tipo Watson-Crick reverso. En
azul el donador de hidrgenos y en rojo el aceptor.
Ntese que la pirimidina ha sufrido un giro de 180
sobre el eje del carbono 6.



Existen diferentes tipos de pares de bases que se pueden formar segn el modo como se
forman los puentes de hidrgeno. Los que se observan en la doble hlice de ADN son los
llamados pares de bases Watson-Crick, pero tambin existen otros posibles pares de bases,
como los denominados Hoogsteen y Wobble u oscilante, que pueden aparecer en
circunstancias particulares. Adems, para cada tipo existe a su vez el mismo par reverso, es
decir, el que se da si se gira la base pirimidnica 180 sobre su eje.
Watson-Crick (pares de bases de la doble hlice): los grupos de la base prica que
intervienen en el enlace de hidrgeno son los que corresponden a las posiciones 1 y 6
(N aceptor y -NH
2
donador si la purina es una A) y los grupos de la base pirimidnica,
los que se encuentran en las posiciones 3 y 4 (-NH donador y C=O aceptor si la
pirimidina es una T). En el par de bases Watson-Crick reverso participaran los grupos
de las posiciones 2 y 3 de la base pirimidnica (ver imgenes).
Hoogsteen: en este caso cambian los grupos de la base prica, que ofrece una cara
diferente (posiciones 6 y 7) y que forman enlaces con los grupos de las pirimidinas de
las posiciones 3 y 4 (como en Watson-Crick). Tambin puede haber Hoogsteen
reversos. Con este tipo de enlace pueden unirse A=U (Hoogsteen y Hoogsteen reverso)
y A=C (Hoogsteen reverso).
Wobble u oscilante: este tipo de enlace permite que se unan guanina y citosina con un
doble enlace (G=T). La base prica (G) forma enlace con los grupos de las posiciones 1
y 6 (como en Watson-Crick) y la pirimidina (T) con los grupos de las posiciones 2 y 3.
Este tipo de enlace no funcionara con A=C, ya que quedaran enfrentados los 2
aceptores y los 2 donadores, y slo se podra dar en el caso inverso. Encontramos
pares de bases de tipo oscilante en el ARN, durante el apareamiento de codn y
anticodn. Con este tipo de enlace pueden unirse G=U (oscilante y oscilante reverso) y
A=C (oscilante reverso).
En total, en su forma tautomrica mayoritaria, existen 28 posibles pares de bases
nitrogenadas: 10 posibles pares de bases purina-pirimidina (2 pares Watson-Crick y 2 Watson
Crick reverso, 1 par Hoogsteen y 2 pares Hoogsteen reverso, 1 par oscilante y 2 pares
oscilante reverso), 7 pares homo purina-purina (A=A, G=G), 4 pares A=G y 7 pares
pirimidina-pirimidina. Esto sin contar con los pares de bases que pueden formarse si tambin
tenemos en cuenta las otras formas tautomricas minoritarias de las bases nitrogenadas;
stos, adems, pueden ser responsables de mutaciones puntuales por sustitucin de tipo
transicin.
Estructura
El ADN es una molcula bicatenaria, es decir, est formada por dos cadenas dispuestas de
forma antiparalela y con las bases nitrogenadas enfrentadas. En su estructura tridimensional,
se distinguen distintos niveles:
34

35

Estructura primaria:
Secuencia de nucletidos encadenados. Es en estas cadenas donde se encuentra la
informacin gentica, y dado que el esqueleto es el mismo para todos, la diferencia de la
informacin radica en la distinta secuencia de bases nitrogenadas. Esta secuencia presenta un
cdigo, que determina una informacin u otra, segn el orden de las bases.
Estructura secundaria:
Es una estructura en doble hlice. Permite explicar el almacenamiento de la informacin
gentica y el mecanismo de duplicacin del ADN. Fue postulada por Watson y Crick,
basndose en la difraccin de rayos X que haban realizado Franklin y Wilkins, y en la
equivalencia de bases de Chargaff, segn la cual la suma de adeninas ms guaninas es igual a
la suma de timinas ms citosinas.
Es una cadena doble, dextrgira o levgira, segn el tipo de ADN. Ambas cadenas son
complementarias, pues la adenina y la guanina de una cadena se unen, respectivamente, a la
timina y la citosina de la otra. Ambas cadenas son antiparalelas, pues el extremo 3 de una se
enfrenta al extremo 5 de la homloga.
Existen tres modelos de ADN. El ADN de tipo B es el ms abundante y es el que tiene la
estructura descrita por Watson y Crick.

Estructura terciaria: Se refiere a cmo se almacena el ADN en un espacio reducido, para
formar los cromosomas. Vara segn se trate de organismos procariotas o eucariotas:
En procariotas el ADN se pliega como una sper-hlice, generalmente en forma circular y
asociada a una pequea cantidad de protenas. Lo mismo ocurre enorgnulos celulares como
las mitocondrias y en los cloroplastos.
En eucariotas, dado que la cantidad de ADN de cada cromosoma es muy grande, el
empaquetamiento ha de ser ms complejo y compacto; para ello se necesita la presencia de
protenas, como las histonas y otras protenas de naturaleza no histnica (en los
espermatozoides estas protenas son las protaminas).
Estructura cuaternaria: La cromatina presente en el ncleo tiene un grosor de 300 , pues la
fibra de cromatina de 100 se enrolla formando una fibra de cromatina de 300 . El
enrollamiento de los nucleosomas recibe el nombre de solenoide. Dichos solenoides se
enrollan formando la cromatina del ncleo interfsico de la clula eucariota. Cuando la clula
entra en divisin, el ADN se compacta ms, formando as los cromosomas.
Estructuras en doble hlice

De izquierda a derecha, las estructuras de ADN A, B y Z.
El ADN existe en muchas conformaciones.
27
Sin
embargo, en organismos vivos slo se han observado
las conformaciones ADN-A, ADN-By ADN-Z. La
conformacin que adopta el ADN depende de su
secuencia, la cantidad y direccin de
superenrollamiento que presenta, la presencia de
modificaciones qumicas en las bases y las
condiciones de la solucin, tales como la
concentracin de iones de metales ypoliaminas. De las
tres conformaciones, la forma "B" es la ms comn en
las condiciones existentes en las clulas. Las dos dobles hlices alternativas del ADN difieren
en su geometra y dimensiones.
La forma "A" es una espiral que gira hacia la derecha, ms amplia que la "B", con una
hendidura menor superficial y ms amplia, y una hendidura mayor ms estrecha y profunda. La
forma "A" ocurre en condiciones no fisiolgicas en formas deshidratadas de ADN, mientras
que en la clula puede producirse en apareamientos hbridos de hebras ADN-ARN, adems de
en complejos enzima-ADN.
Los segmentos de ADN en los que las bases han sido modificadas por metilacin pueden sufrir
cambios conformacionales mayores y adoptar la forma "Z". En este caso, las hebras giran
alrededor del eje de la hlice en una espiral que gira a mano izquierda, lo opuesto a la forma
"B" ms frecuente. Estas estructuras poco frecuentes pueden ser reconocidas por protenas
especficas que se unen a ADN-Z y posiblemente estn implicadas en la regulacin de la
transcripcin.

Estructuras en cudruplex
Estructura de un ADN en cudruplex formada por repeticiones en
los telmeros. La conformacin de la estructura de soporte del
ADN difiere significativamente de la tpica estructura en hlice.
En los extremos de los cromosomas lineales existen regiones
especializadas de ADN denominadas telmeros. La funcin
principal de estas regiones es permitir a la clula replicar los
extremos cromosmicos utilizando la enzima telomerasa, puesto
que las enzimas que replican el resto del ADN no pueden copiar los extremos 3' de los
cromosomas.Estas terminaciones cromosmicas especializadas tambin protegen los extremos
del ADN, y evitan que los sistemas de reparacin del ADN en la clula los procesen como ADN
daado que debe ser corregido.
44
En las clulas humanas, los telmeros son largas zonas de
ADN de hebra sencilla que contienen algunos miles de repeticiones de una nica secuencia
TTAGGG.
Estas secuencias ricas en guanina pueden estabilizar los extremos cromosmicos mediante la
formacin de estructuras de juegos apilados de unidades de cuatro bases, en lugar de los
pares de bases encontrados normalmente en otras estructuras de ADN. En este caso, cuatro
bases guanina forman unidades con superficie plana que se apilan una sobre otra, para formar
una estructura cudruple-G estable. Estas estructuras se estabilizan formando puentes de
hidrgeno entre los extremos de las bases y la quelatacin de un metal inico en el centro de
cada unidad de cuatro bases.
47
Tambin se pueden formar otras estructuras, con el juego
central de cuatro bases procedente, o bien de una hebra sencilla plegada alrededor de las
bases, o bien de varias hebras paralelas diferentes, de forma que cada una contribuye con una
base a la estructura central.
Adems de estas estructuras apiladas, los telmeros tambin forman largas estructuras en
lazo, denominadas lazos telomricos o lazos-T (T-loops en ingls). En este caso, las hebras
simples de ADN se enroscan sobre s mismas en un amplio crculo estabilizado por protenas
que se unen a telmeros.
48
En el extremo del lazo T, el ADN telomrico de hebra sencilla se
sujeta a una regin de ADN de doble hebra porque la hebra de ADN telomrico altera la doble
hlice y se aparea a una de las dos hebras. Esta estructura de triple hebra se denomina lazo
de desplazaiento o lazo D (D-loop).
Hendiduras mayor y menor
Animacin de la estructura de una seccin de ADN. Las bases
se encuentran horizontalmente entre las dos hebras en
espiral. Versin ampliada
Doble hlice: a) Dextrgira, b) Levgira.
La doble hlice es una espiral dextrgira, esto es, cada una
de las cadenas de nucletidos gira a derechas; esto puede
verificarse si nos fijamos, yendo de abajo a arriba, en la
direccin que siguen los segmentos de las hebras que quedan en primer plano. Si las dos
hebras giran a derechas se dice que la doble hlice es dextrgira, y si giran a izquierdas,
levgira (esta forma puede aparecer en hlices alternativas debido a cambios
conformacionales en el ADN). Pero en la conformacin ms comn que adopta el ADN, la doble
hlice es dextrgira, girando cada par de bases respecto al anterior unos 36.
50

Cuando las dos hebras de ADN se enrollan una sobre la otra (sea a derechas o a izquierdas),
se forman huecos o hendiduras entre una hebra y la otra, dejando expuestos los laterales de
las bases nitrogenadas del interior (ver la animacin). En la conformacin ms comn que
adopta el ADN aparecen, como consecuencia de los ngulos formados entre los azcares de
ambas cadenas de cada par de bases nitrogenadas, dos tipos de hendiduras alrededor de la
superficie de la doble hlice: una de ellas, la hendidura o surco mayor, que mide 22 (2,2 nm)
de ancho, y la otra, la hendidura o surco menor, que mide 12 (1,2 nm) de ancho. Cada vuelta
de hlice, que es cuando sta ha realizado un giro de 360 o lo que es lo mismo, de principio
de hendidura mayor a final de hendidura menor, medir por tanto 34 , y en cada una de esas
vueltas hay unos 10,5pb.
Hendiduras mayor y menor de la doble hlice.
La anchura de la hendidura mayor implica que los
extremos de las bases son ms accesibles en
sta, de forma que la cantidad de grupos
qumicos expuestos tambin es mayor lo cual
facilita la diferenciacin entre los pares de bases
A-T, T-A, C-G, G-C. Como consecuencia de
ello, tambin se ver facilitado el reconocimiento
de secuencias de ADN por parte de diferentes protenas sin la necesidad de abrir la doble
hlice. As, protenas como los factores de transcripcin que pueden unirse a secuencias
especficas, frecuentemente contactan con los laterales de las bases expuestos en la
hendidura mayor.Por el contrario, los grupos qumicos que quedan expuestos en la hendidura
menor son similares, de forma que el reconocimiento de los pares de bases es ms difcil; por
ello se dice que la hendidura mayor contiene ms informacin que la hendidura menor.
Sentido y antisentido

Una secuencia de ADN se denomina "sentido" (en ingls, sense) si su secuencia es la misma
que la secuencia de un ARN mensajero que se traduce en una protena. La secuencia de la
hebra de ADN complementaria se denomina "antisentido" (antisense). En ambas hebras de
ADN de la doble hlice pueden existir tanto secuencias sentido, que codifican ARNm, como
antisentido, que no lo codifican. Es decir, las secuencias que codifican ARNm no estn todas
presentes en una sola de las hebras, sino repartidas entre las dos hebras. Tanto en
procariotas como en eucariotas se producen ARNs con secuencias antisentido, pero la funcin
de esos ARNs no est completamente clara. Se ha propuesto que los ARNs antisentido estn
implicados en la regulacin de la expresin gnica mediante apareamiento ARN-ARN: los
ARNs antisentido se aparearan con los ARNm complementarios, bloqueando de esta forma su
traduccin.
En unas pocas secuencias de ADN en procariotas y eucariotas (este hecho es ms frecuente
en plsmidos y virus), la distincin entre hebras sentido y antisentido es ms difusa, debido a
que presentan genes superpuestos. En estos casos, algunas secuencias de ADN tienen una
funcin doble, codificando una protena cuando se lee a lo largo de una hebra, y una segunda
protena cuando se lee en la direccin contraria a lo largo de la otra hebra. En bacterias, esta
superposicin puede estar involucrada en la regulacin de la transcripcin del gen,
56
mientras
que en virus los genes superpuestos aumentan la cantidad de informacin que puede
codificarse en sus diminutos genomas.
Superenrollamiento


Estructura de molculas de ADN lineales con los extremos fijos y superenrolladas. Por
claridad, se ha omitido la estructura en hlice del ADN.
El ADN puede retorcerse como una cuerda en un proceso que se denomina superenrollamiento
del ADN(supercoiling, en ingls). Cuando el ADN est en un estado "relajado", una hebra
normalmente gira alrededor del eje de la doble hlice una vez cada 10,4 pares de bases, pero
si el ADN est retorcido las hebras pueden estar unidas ms estrechamente o ms
relajadamente.
58
Si el ADN est retorcido en la direccin de la hlice, se dice que el
superenrollamiento es positivo, y las bases se mantienen juntas de forma ms estrecha. Si el
ADN se retuerce en la direccin opuesta, el superenrollamiento se llama negativo, y las bases
se alejan. En la naturaleza, la mayor parte del ADN tiene un ligero superenrollamiento
negativo que es producido por enzimas denominadas topoisomerasas. Estas enzimas tambin
son necesarias para liberar las fuerzas de torsin introducidas en las hebras de ADN durante
procesos como la transcripcin y lareplicacin.
Modificaciones qumicas


citosina 5-metil-citosina timina
Estructura de la citosina con y sin el grupo metilo. Tras la desaminacin, la 5-metil-citosina
tiene la misma estructura que la timina.
Modificaciones de bases del ADN

La expresin de los genes est influenciada por la forma en la que el ADN est empaquetado
en cromosomas, en una estructura denominada cromatina. Las modificaciones de bases pueden
estar implicadas en el empaquetamiento del ADN: las regiones que presentan una expresin
gnica baja o nula normalmente contienen niveles altos de metilacin de las basescitosina. Por
ejemplo, la metilacin de citosina produce 5-metil-citosina, que es importante para la
inactivacin del cromosoma X. El nivel medio de metilacin vara entre organismos: el gusano
Caenorhabditis elegans carece de metilacin de citosina, mientras que los vertebrados
presentan un nivel alto - hasta 1% de su ADN contiene 5-metil-citosina. A pesar de la
importancia de la 5-metil-citosina, sta puede desaminarse para generar una base timina. Las
citosinas metiladas son por tanto particularmente sensibles a mutaciones. Otras modificaciones
de bases incluyen la metilacin de adenina en bacteriasy la glicosilacin de uracilo para
producir la "base-J" en kinetoplastos.
Dao del ADN
Molcula de Benzopireno, mutgeno presente por ejemplo en
el humo del tabaco, ligada una hlice de ADN.
66

El ADN puede resultar daado por muchos tipos de
mutgenos, que cambian la secuencia del ADN: agentes
alquilantes, adems deradiacin electromagntica de alta
energa, como luz ultravioleta y rayos X. El tipo de dao
producido en el ADN depende del tipo de mutgeno. Por
ejemplo, la luz UV puede daar al ADN produciendo dmeros
de timina, que se forman por ligamiento cruzado entre
basespirimidnicas.
67
Por otro lado, oxidantes tales como
radicales libres o el perxido de hidrgeno producen
mltiples daos, incluyendo modificaciones de bases, sobre
todo guanina, y roturas de doble hebra (double-strand
breaks). En una clula humana cualquiera, alrededor de 500
bases sufren dao oxidativo cada da. De estas lesiones oxidativas, las ms peligrosas son las
roturas de doble hebra, ya que son difciles de reparar y pueden producir mutaciones
puntuales, inserciones y deleciones de la secuencia de ADN, as como translocaciones
cromosmicas.
Muchos mutgenos se posicionan entre dos pares de bases adyacentes, por lo que se
denominan agentes intercalantes. La mayora de los agentes intercalantes son molculas
aromticas y planas, como el bromuro de etidio, la daunomicina, la doxorubicina y la
talidomida. Para que un agente intercalante pueda integrarse entre dos pares de bases, stas
deben separarse, distorsionando las hebras de ADN y abriendo la doble hlice. Esto inhibe la
transcripcin y la replicacin del ADN, causando toxicidad y mutaciones. Por ello, los agentes
intercalantes del ADN son a menudo carcingenos: el benzopireno, las acridinas, la aflatoxina
y el bromuro de etidio son ejemplos bien conocidos. Sin embargo, debido a su capacidad para
inhibir la replicacin y la transcripcin del ADN, estas toxinas tambin se utilizan en
quimioterapia para inhibir el rpido crecimiento de las clulas cancerosas.
El dao en el ADN inicia una respuesta que activa diferentes mecanismos de reparacin que
reconocen lesiones especficas en el ADN, que son reparadas en el momento para recuperar la
secuencia original del ADN. Asimismo, el dao en el ADN provoca una parada en elciclo
celular, que conlleva la alteracin de numerosos procesos fisiolgicos, que a su vez implica
sntesis, transporte y degradacin de protenas (vase tambin Checkpoint de daos en el
ADN). Alternativamente, si el dao genmico es demasiado grande para que pueda ser
reparado, los mecanismos de control inducirn la activacin de una serie de rutas celulares
que culminarn en la muerte celular.
Funciones biolgicas
Las funciones biolgicas del ADN incluyen el almacenamiento de informacin (genes y
genoma), la codificacin de protenas (transcripcin y traduccin) y su autoduplicacin
(replicacin del ADN) para asegurar la transmisin de la informacin a las clulas hijas durante
la divisin celular.
Genes y genoma.
El ADN se puede considerar como un almacn cuyo contenido es la informacin (mensaje)
necesaria para construir y sostener el organismo en el que reside, la cual se transmite de
generacin en generacin. El conjunto de informacin que cumple esta funcin en un
organismo dado se denomina genoma, y el ADN que lo constituye, ADN genmico.
El ADN genmico (que se organiza en molculas de cromatina que a su vez se ensamblan en
cromosomas) se encuentra en el ncleo celular de los eucariotas, adems de pequeas
cantidades en las mitocondrias y cloroplastos. En procariotas, el ADN se encuentra en un
cuerpo de forma irregular denominado nucleoide.
El ADN codificante
ARN polimerasa T7 (azul) produciendo un ARNm (verde) a partir de un molde de ADN
(naranja).La informacin gentica de un genoma est
contenida en los genes, y al conjunto de toda la
informacin que corresponde a un organismo se le
denomina su genotipo. Un gen es una unidad de herencia
y es una regin de ADN que influye en una
caracterstica particular de un organismo (como el color
de los ojos, por ejemplo). Los genes contienen un
"marco de lectura abierto" (open reading frame) que
puede transcribirse, adems de secuencias reguladoras,
tales como promotores yenhancers, que controlan la
transcripcin del marco de lectura abierto.
Desde este punto de vista, las obreras de este mecanismo son las protenas. Estas pueden ser
estructurales, como las protenas de los msculos, cartlagos, pelo, etc., o funcionales, como la
hemoglobina o las innumerables enzimas del organismo. La funcin principal de la herencia es
la especificacin de las protenas, siendo el ADN una especie de plano oreceta para
producirlas. La mayor parte de las veces la modificacin del ADN provocar una disfuncin
proteica que dar lugar a la aparicin de alguna enfermedad. Pero en determinadas ocasiones,
las modificaciones podrn provocar cambios beneficiosos que darn lugar a individuos mejor
adaptados a su entorno.
Las aproximadamente treinta mil protenas diferentes en el cuerpo humano estn constituidas
por veinte aminocidos diferentes, y una molcula de ADN debe especificar la secuencia en
que se unen dichos aminocidos.
En el proceso de elaborar una protena, el ADN de un gen se lee y se transcribe a ARN. Este
ARN sirve como mensajero entre el ADN y la maquinaria que elaborar las protenas y por eso
recibe el nombre de ARN mensajero o ARNm. El ARN mensajero sirve de molde a la
maquinaria que elabora las protenas, para que ensamble los aminocidos en el orden preciso
para armar la protena.
El dogma central de la biologa molecular estableca que el flujo de actividad y de informacin
era: ADN ARN protena. No obstante, en la actualidad ha quedado demostrado que este
"dogma" debe ser ampliado, pues se han encontrado otros flujos de informacin: en algunos
organismos (virus de ARN) la informacin fluye de ARN a ADN; este proceso se conoce como
"transcripcin inversa o reversa", tambin llamada "retrotranscripcin". Adems, se sabe que
existen secuencias de ADN que se transcriben a ARN y son funcionales como tales, sin llegar
a traducirse nunca a protena: son los ARN no codificantes, como es el caso de los ARN
interferentes.
El ADN no codificante
El ADN del genoma de un organismo puede dividirse conceptualmente en dos: el que codifica
las protenas (los genes) y el que no codifica. En muchas especies, slo una pequea fraccin
del genoma codifica protenas. Por ejemplo, slo alrededor del 1,5% del genoma humano
consiste en exones que codifican protenas (20.000 a 25.000 genes), mientras que ms del
90% consiste en ADN no codificante.
El ADN no codificante (tambin denominado ADN basura o junk DNA) corresponde a
secuencias del genoma que no generan una protena (procedentes de transposiciones,
duplicaciones, translocaciones y recombinaciones de virus, etc.), incluyendo los intrones.
Hasta hace poco tiempo se pensaba que el ADN no codificante no tena utilidad alguna, pero
estudios recientes indican que eso es inexacto. Entre otras funciones, se postula que el
llamado "ADN basura" regula la expresin diferencial de los genes.
79
Por ejemplo, algunas
secuencias tienen afinidad hacia protenas especiales que tienen la capacidad de unirse al ADN
(como los homeodominios, los complejos receptores de hormonas esteroides, etc.), con un
papel importante en el control de los mecanismos de trascripcin y replicacin. Estas
secuencias se llaman frecuentemente "secuencias reguladoras", y los investigadores suponen
que slo se ha identificado una pequea fraccin de las que realmente existen. La presencia de
tanto ADN no codificante en genomas eucariticos y las diferencias en tamao del genoma
entre especies representan un misterio que es conocido como el "enigma del valor de C".
Recientemente, un grupo de investigadores de la Universidad de Yale ha descubierto una
secuencia de ADN no codificante que sera la responsable de que los seres humanos hayan
desarrollado la capacidad de agarrar y/o manipular objetos o herramientas.
Por otro lado, algunas secuencias de ADN desempean un papel estructural en los
cromosomas: los telmeros y centrmeros contienen pocos o ningn gen codificante de
protenas, pero son importantes para estabilizar la estructura de los cromosomas. Algunos
genes no codifican protenas, pero s se transcriben en ARN: ARN ribosmico, ARN de
transferencia y ARN de interferencia (ARNi, que son ARN que bloquean la expresin de genes
especficos). La estructura de intrones y exones de algunos genes (como los
deinmunoglobulinas y protocadherinas) son importantes por permitir los cortes y empalmes
alternativos del pre-ARN mensajero que hacen posible la sntesis de diferentes protenas a
partir de un mismo gen (sin esta capacidad no existira el sistema inmune, por ejemplo).
Algunas secuencias de ADN no codificante representan pseudogenes que tienen valor
evolutivo, ya que permiten la creacin de nuevos genes con nuevas funciones.
35
Otros ADN no
codificantes proceden de la duplicacin de pequeas regiones del ADN; esto tiene mucha
utilidad, ya que el rastreo de estas secuencias repetitivas permite estudios de filogenia.
Transcripcin y traduccin

En un gen, la secuencia de nucletidos a lo largo de una hebra de ADN se transcribe a un ARN
mensajero (ARNm) y esta secuencia a su vez se traduce a una protena que un organismo es
capaz de sintetizar o "expresar" en uno o varios momentos de su vida, usando la informacin
de dicha secuencia.
La relacin entre la secuencia de nucletidos y la secuencia de aminocidos de la protena
viene determinada por el cdigo gentico, que se utiliza durante el proceso de traduccin o
sntesis de protenas. La unidad codificadora del cdigo gentico es un grupo de tres
nucletidos (triplete), representado por las tres letras iniciales de las bases nitrogenadas (por
ej., ACT, CAG, TTT). Los tripletes del ADN se transcriben en sus bases complementarias en
el ARN mensajero, y en este caso los tripletes se denominancodones (para el ejemplo anterior,
UGA, GUC, AAA). En el ribosoma cada codn del ARN mensajero interacciona con una
molcula de ARN de transferencia (ARNt o tRNA) que contenga el triplete complementario,
denominado anticodn. Cada ARNt porta el aminocido correspondiente al codn de acuerdo
con el cdigo gentico, de modo que el ribosoma va uniendo los aminocidos para formar una
nueva protena de acuerdo con las "instrucciones" de la secuencia del ARNm. Existen 64
codones posibles, por lo cual corresponde ms de uno para cada aminocido (por esta
duplicidad de codones se dice que el cdigo gentico es un cdigo degenerado: no es
unvoco); algunos codones indican la terminacin de la sntesis, el fin de la secuencia
codificante; estos codones de terminacin o codones de parada son UAA, UGA y UAG (en
ingls, nonsense codons ostop codons).
Replicacin del ADN
La replicacin del ADN es el proceso
por el cual se obtienen copias o
rplicas idnticas de una molcula de
ADN. La replicacin es fundamental
para la transferencia de la
informacin gentica de una
generacin a la siguiente y, por ende,
es la base de la herencia. El
mecanismo consiste esencialmente
en la separacin de las dos hebras de
la doble hlice, las cuales sirven de
molde para la posterior sntesis de
cadenas complementarias a cada una de ellas, que llevar por nombre ARNm. El resultado final
son dos molculas idnticas a la original. Este tipo de replicacin se denomina
semiconservativa debido a que cada una de las dos molculas resultantes de la duplicacin
presenta una cadena procedente de la molcula "madre" y otra recin sintetizada.
Hiptesis sobre la duplicacin del ADN
En un principio, se propusieron tres hiptesis:
Semiconservativa: Segn el experimento de Meselson-Stahl, cada hebra sirve de molde
para que se forme una hebra nueva, mediante la complentariedad de bases, quedando al
final dos dobles hlices formadas por una hebra antigua (molde) y una nueva hebra
(copia).
Conservativa: Tras la duplicacin quedaran las dos hebras antiguas juntas y, por otro
lado, las dos hebras nuevas formando una doble hlice.
Dispersiva: Segn esta hiptesis, las hebras resultantes estaran formadas por
fragmentos en doble hlice ADN antiguo y ADN recin sintetizado.

Interacciones ADN-protena
Todas las funciones del ADN dependen de sus interacciones con protenas. Estas
interacciones pueden ser inespecficas, o bien la protena puede unirse de forma especfica a
una nica secuencia de ADN. Tambin pueden unirse enzimas, entre las cuales son
particularmente importantes las polimerasas, que copian la secuencia de bases del ADN
durante la transcripcin y la replicacin.
Protenas que unen ADN
Interacciones inespecficas
Las protenas estructurales que se unen al ADN son
ejemplos bien conocidos de interacciones inespecficas
ADN-protenas. En los cromosomas, el ADN se
encuentra formando complejos con protenas
estructurales. Estas protenas organizan el ADN en una
estructura compacta denominada cromatina. En
eucariotas esta estructura implica la unin del ADN a un
complejo formado por pequeas protenas bsicas
denominadas histonas, mientras que en procariotas
estn involucradas una gran variedad de protenas.
82

83

Las histonas forman un complejo de forma cilndrica denominado nucleosoma, en torno al cual
se enrollan casi dos vueltas de ADN de doble hlice. Estas interacciones inespecficas quedan
determinadas por la existencia de residuos bsicos en las histonas, que forman enlaces inicos
con el esqueleto de azcar-fosfato del ADN y, por tanto, son en gran parte independientes de
la secuencia de bases.
84
Estos aminocidos bsicos experimentan modificaciones qumicas de
metilacin, fosforilacin yacetilacin,
85
que alteran la fuerza de la interaccin entre el ADN y
las histonas, haciendo al ADN ms o menos accesible a losfactores de transcripcin y por
tanto modificando la tasa de transcripcin.
86

Otras protenas que se unen a ADN de manera inespecfica en la cromatina incluyen las
protenas del grupo de alta movilidad(HMG, High Mobility Group) que se unen a ADN plegado o
distorsionado.
87
Estas protenas son importantes durante el plegamiento de los nucleosomas,
organizndolos en estructuras ms complejas para constituir los cromosomas
88
durante el
proceso decondensacin cromosmica. Se ha propuesto que en este proceso tambin
intervendran otras protenas, formando una especie de "andamio" sobre el cual se organiza la
cromatina; los principales componentes de esta estructura seran la enzima topoisomerasaII
(topoIIalpha) y la condensina 13S.
89
Sin embargo, el papel estructural de la topoIIalpha en la
organizacin de los cromosomas an es discutido, ya que otros grupos argumentan que esta
enzima se intercambia rpidamente tanto en los brazos cromosmicos como en los cinetocoros
durante la mitosis.
90

Interacciones especficas
Un grupo bien definido de protenas que unen ADN es el conformado
por las protenas que se unen especficamente a ADN monocatenario
o ADN de hebra sencilla (ssDNA). En humanos, la protena A de
replicacin es la mejor conocida de su familia y acta en procesos en
los que la doble hlice se separa, como la replicacin del ADN,
larecombinacin o la reparacin del ADN.
91
Estas protenas parecen
estabilizar el ADN monocatenario, protegindolo para evitar que
forme estructuras de tallo-lazo (stem-loop) o que sea degradado
por nucleasas.
El factor de transcripcin represor del fago lambda unido a su ADN
diana mediante un motivo hlice-giro-hlice (helix-turn-helix).
Sin embargo, otras protenas han evolucionado para unirse
especficamente a secuencias particulares de ADN. La especificidad de la interaccin de las
protenas con el ADN procede de los mltiples contactos con las bases de ADN, lo que les
permite "leer" la secuencia del ADN. La mayora de esas interacciones con las bases ocurre
en la hendidura mayor, donde las bases son ms accesibles.
Las protenas especficas estudiadas con mayor detalle son las encargadas de regular la
transcripcin, denominadas por ello factores de transcripcin. Cada factor de transcripcin se
une a una secuencia concreta de ADN y activa o inhibe la transcripcin de los genes que
presentan estas secuencias prximas a sus promotores. Los factores de transcripcin pueden
efectuar esto de dos formas:
En primer lugar, pueden unirse a la polimerasa de ARN responsable de la transcripcin, bien
directamente o a travs de otras protenas mediadoras. De esta forma. se estabiliza la unin
entre la ARN polimerasa y el promotor, lo que permite el inicio de la transcripcin.
En segundo lugar, los factores de transcripcin pueden unirse a enzimas que modifican las
histonas del promotor, lo que altera la accesibilidad del molde de ADN a la ARN polimerasa.
Como los ADN diana pueden encontrarse por todo el genoma del organismo, los cambios en la
actividad de un tipo de factor de transcripcin pueden afectar a miles de genes.En
consecuencia, estas protenas son frecuentemente las dianas de los procesos de transduccin
de seales que controlan las respuestas a cambios ambientales o diferenciacin y desarrollo
celular.
Enzimas que modifican el ADN
Nucleasas y ligasas
Las nucleasas son enzimas que cortan las hebras de ADN
mediante la catlisis de la hidrlisis de los enlaces
fosfodister. Las nucleasas que hidrolizan nucletidos a
partir de los extremos de las hebras de ADN se
denominanexonucleasas, mientras que las endonucleasas
cortan en el interior de las hebras. Las nucleasas que se
utilizan con mayor frecuencia en biologa molecular son las
enzimas de restriccin, endonucleasas que cortan el ADN
por determinadas secuencias especficas. Por ejemplo, la enzima EcoRV, que se muestra a la
izquierda, reconoce la secuencia de 6 bases 5-GAT|ATC-3, y hace un corte en ambas
hebras en la lnea vertical indicada, generando dos molculas de ADN con los extremos romos.
Otras enzimas de restriccin generan sin embargo extremos cohesivos, ya que cortan de
forma diferente las dos hebras de ADN. En la naturaleza, estas enzimas protegen a las
bacterias contra las infecciones de fagos, al digerir el ADN de dicho fago cuando entra a
travs de la pared bacteriana, actuando como un mecanismo de defensa. En biotecnologa,
estas nucleasas especficas de la secuencias de ADN se utilizan en ingeniera gentica para
clonar fragmentos de ADN y en la tcnica de huella gentica.
Las enzimas denominadas ADN ligasas pueden reunir hebras de ADN cortadas o rotas.
99
Las
ligasas son particularmente importantes en la replicacin de la hebra que sufre replicacin
discontinua en el ADN, ya que unen los fragmentos cortos de ADN generados en la horquilla
de replicacin para formar una copia completa del molde de ADN. Tambin se utilizan en la
reparacin del ADN y en procesos de recombinacin gentica.
Topoisomerasas y helicasas
Las topoisomerasas son enzimas que poseen a la vez actividad nucleasa y ligasa. Estas
protenas varan la cantidad de ADN superenrollado. Algunas de estas enzimas funcionan
cortando la hlice de ADN y permitiendo que una seccin rote, de manera que reducen el
grado de super enrollamiento. Una vez hecho esto, la enzima vuelve a unir los fragmentos de
ADN.
59
Otros tipos de enzimas son capaces de cortar una hlice de ADN y luego pasar la
segunda hebra de ADN a travs de la rotura, antes de reunir las hlices. Las topoisomerasas
son necesarias para muchos procesos en los que interviene el ADN, como la replicacin del
ADN y la transcripcin.
Las helicasas son unas protenas que pertenecen al grupo de los motores moleculares. Utilizan
energa qumica almacenada en los nuclesidos trifosfatos, fundamentalmenteATP, para
romper puentes de hidrgeno entre bases y separar la doble hlice de ADN en hebras simples.
Estas enzimas son esenciales para la mayora de los procesos en los que las enzimas
necesitan acceder a las bases del ADN.
Polimerasas
Las polimerasas son enzimas que sintetizan cadenas de nucletidos a partir de nuclesidos
trifosfatos. La secuencia de sus productos son copias de cadenas de polinucletidos
existentes, que se denominan moldes. Estas enzimas funcionan aadiendo nucletidos al grupo
hidroxilo en 3' del nucletido previo en una hebra de ADN. En consecuencia, todas las
polimerasas funcionan en direccin 5 --> 3.En los sitios activos de estas enzimas, el
nuclesido trifosfato que se incorpora aparea su base con la correspondiente en el molde: esto
permite que la polimerasa sintentice de forma precisa la hebra complementaria al molde.
Las polimerasas se clasifican de acuerdo al tipo de molde que utilizan:
En la replicacin del ADN, una ADN polimerasa dependiente de ADN realiza una copia
de ADN a partir de una secuencia de ADN. La precisin es vital en este proceso, por lo
que muchas de estas polimerasas tienen una actividad de verificacin de la lectura
(proofreading). Mediante esta actividad, la polimerasa reconoce errores ocasionales en
la reaccin de sntesis, debido a la falta de apareamiente entre el nucletido errneo y
el molde, lo que genera un desacoplamiento (mismatch). Si se detecta un
desacoplamiento, se activa una actividad exonucleasa en direccin 3 --> 5 y la base
incorrecta se elimina. En la mayora de los organismos las ADN polimerasas funcionan
en un gran complejo denominado replisoma, que contiene mltiples unidades accesorias,
como helicasas.
Las ADN polimerasas dependientes de ARN son una clase especializada de polimerasas
que copian la secuencia de una hebra de ARN en ADN. Incluyen la transcriptasa
inversa, que es una enzima viral implicada en la infeccin de clulas por retrovirus, y la
telomerasa, que es necesaria para la replicacin de los telmeros.La telomerasa es una
polimerasa inusual, porque contiene su propio molde de ARN como parte de su
estructura.
La transcripcin se lleva a cabo por una ARN polimerasa dependiente de ADN que copia
la secuencia de una de las hebras de ADN en ARN. Para empezar a transcribir un gen,
la ARN polimerasa se une a una secuencia del ADN denominada promotor, y separa las
hebras del ADN. Entonces copia la secuencia del gen en un transcrito deARN mensajero
hasta que alcanza una regin de ADN denomimada terminador, donde se detiene y se
separa del ADN. Como ocurre con las ADN polimerasas dependientes de ADN en
humanos, la ARN polimerasa II (la enzima que transcribe la mayora de los genes del
genoma humano) funciona como un gran complejo multiproteico que contiene mltiples
subunidades reguladoras y accesorias.