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18/08/2014

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Introduo
Bioqumica
Prof. Dr. Edson dos Anjos
Introduo Bioqumica
- O que Bioqumica?
- Termo introduzido por Carl Neuberg em 1903;
- o estudo da qumica da vida;
- Ramo da cincia que faz uma ponte entre a Qumica estudo das
estruturas e interaes entre tomos e molculas e a Biologia que
estuda as estruturas e processos inter e intracelulares presentes nos
seres vivos.
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Introduo Bioqumica
VIDA
- Molculas so desprovidas de vida;
- Seres vivos so formados por molculas;
- Caractersticas peculiares da matria viva: crescimento,
movimento, resposta a estmulos ambientais, auto-replicao
com extrema fidelidade;
- Bioqumica a lgica dos fenmenos biolgicos.
Introduo Bioqumica
CARACTERSTICAS IDENTIFICADORAS DA
MATRIA VIVA
1) Organismos vivos so altamente complexos
(qumicos) e organizados (microscpicos);
2) Todas as estruturas biolgicas desempenham
uma ou mais funes especficas presena de
padres;
3) Os sistemas vivos so altamente eficientes em
processos de transformao de energia;
4) Capacidade marcante de auto-replicao com
altssima fidelidade.
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Introduo Bioqumica
LGICA MOLECULAR DA VIDA
H uma simplicidade bsica na estrutura das
macromolculas;
Todos os organismos vivos utilizam as mesmas
espcies de molculas monomricas e portanto
parecem ter um ancestral comum;
A identidade de cada espcie de organismo
preservada pela posse de distintos conjuntos de
cidos nucleicos (bases nitrogenadas);
Todas as biomolculas possuem uma ou mais
funes na clula. Podemos considerar que existe
um princpio de economia mxima nos seres vivos.
Clulas
Unidades estruturais de todos os organismos vivos
Unicelulares X Pluricelulares
unicelulares
pluricelulares
So unidades envoltas por uma membrana
fosfolipoprotica, semipermevel, contendo todos
os componentes vitais ao seu funcionamento
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PROCARIONTES X EUCARIONTES
Procari otos: possuem um
nucl eoi de que contm uma
ni ca mol cul a de DNA,
si mpl es.
Eucari otos: possuem um
ncl eo bem defi ni do
(membrana nucl ear), contm
o materi al genti co: DNA.
Comparao entre Organismos Procariotos e
Eucariotos
Procariotos Eucariotos
Organismo bactria e cianofcea protista, fungos, plantas e animais
Tamanho da
Clula
geralmente de 1 a 10 micrometros geralmente de 5 a 100 micrometros
Metabolismo aerbico ou anaerbico aerbico
Organelas poucas ou nenhuma
ncleo, mitocndrias, cloroplasto, reticulo
endoplasmtico, complexo de Golgi,
lisossomo, etc.
DNA DNA
Contem longas molculas de DNA contendo
muitas regies no codificantes: protegidos
por uma membrana nuclear
RNA e Protena
Sintetizados no mesmo
compartimento
RNA sintetizado e processado no ncleo,
Protenas sintetizadas no citoplasma.
Citoplasma
ausncia de citoesqueleto: fluxo
citoplasmtico, ausncia de
endocitose e exocitose
citoesqueleto composto de filamentos de
protenas, fluxo citoplasmtico, presena de
endocitose e exocitose
Diviso celular
cromossomos se separa atracado
membrana
cromossomos se separam pela ao do fuso
do citoesqueleto
Organizao
Celular
maioria unicelular
maioria multicelular, com diferenciao de
muitos tipos celulares.
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REINO MONERA
A maioria possui paredes compostas por peptdeoglicanos (com
exceo das arquias);
Maioria utiliza flagelos ou clios para movimentao;
Digesto extracelular nutrientes simples so absorvidos pela clula;
De acordo com a fonte metablica podem ser auttrofos (C de CO
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como
fonte de energia), hetertrofos (C de compostos orgnicos), saprbios
(organismos que se nutrem de matria orgnica em decomposio);
Podem desenvol ver relaes simbiticas, comensalistas (relao
benfica para uma espcies sem prejuzo a outra) ou de parasitismo.
Procariontes: Bactrias e
algas cianofceas;
Caratersticas estruturais comuns das clulas bacterianas
Ri bossomos: so menores do
que os eucari ti cos, mas tem a
mesma funo: sntese protei ca
Nucl eoi de: contm uma ni ca
mol cul a de DNA, simpl es l onga e
ci rcul ar.
Pi l i ou Fmbri as:
produz pontos de
adeso superfci e
de outras cl ul as.
Fl agel os:
propul si onam a
cl ul a no seu
ambi ente.
Alguns gneros de bactrias
Envel ope cel ul ar: a
estrutura vari a com o tipo
de bactri a.
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Estrutura geral de uma
bactria
Parede celular de Gram-positivas:
sem membrana externa (lipdica)
e camada de peptidoglicanos mais
espessa.
Parede celular de Gram-negativas:
membrana externa e camada de
peptdeoglicanos (menor).
Parede Celular das Bactrias
Camada de peptidoglicanos
Membrana
interna
Membrana
externa
Camada de
peptidoglicanos
Membrana interna
Eucariotos
Inclui todos os organismos multicelulares animais, vegetais e
fungos;
Vantagens da compartimentalizao(formaode organelas);
Aumentoda rea de superfciede membranas;
Distribuioespacial de funes celulares;
Maior oportunidade de modificao do RNA no ncleo:
caminhos da evoluo.
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Clulas: unidades estruturais e funcionais de
todos os organismos vivos
Membrana plasmtica: define o contorno da
clula, separando seu contedo do ambiente
(lipdios e protenas), estrutura flexvel (no so
ligadas covalentemente, mudanas na forma e
tamanho):
Protenas de transporte na membrana
(permitem a passagem de determinados ons e
molculas);
Protenas receptoras (transmitem sinais para o
interior da clula);
Enzimas de membrana (participam de
algumas reaes).
Protenas (~50% da constituio): Papel estrutural, translocadores
ou canais de transporte, regulao; reconhecimento, catlise,
receptores de sinais externos;
Membrana Plasmtica
Transporte
ons, nutrientes
ons, nutrientes
Receptoras
enzimticas
Ligantes
Canais de
ons
ons
ons
Substrato
Produto
(sinais intracelulares)
Cadeias de Carboidratos
Protenas
Lipdios
Colesterol
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Introduo Bioqumica
CLULAS
Citoplasma: volume interno envolto pela membrana
plasmtica, ele composto por uma soluo aquosa:
citosol;
Citosol: soluo altamente concentrada que contm
enzimas e as molculas de RNAque as codificam;
Metablitos: molculas orgnicas pequenas
(intermedirios) que formam as macromolculas.
Coenzima A
Coenzimas: compostos essenciais em
muitas reaes catalisadas por
enzimas (ons inorgnicos ou
molculas).
Introduo Bioqumica
CLULAS
Ribossomos: sntese de protenas
Ribossomos
Polissomos livres RER
- permanecem
no citosol
- ncleo
- organelas
- secretadas
Subunidade
Grande Pequena
Ribossomo
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Introduo Bioqumica
CLULAS
Proteassomas: degradam as protenas que a clula
no necessita mais;
Ncleo ou nucleoide: onde armazenado e
replicado o material gentico da clula (genoma);
Genoma: conjunto de genes compostos por DNA
(cido desoxirribonucleico);
Ncleo
CITOESQUELETO
Organizao tubular flexvel de microfilamentos e microtbulos
Mantm a forma celular fornece suporte;
Ancoramento de organelas e enzimas em regies especficas da
clula;
Transporte intracelular movimento entre vesculas e organelas
por protenas motoras;
Contractilidade e movimento;
Direciona a diviso celular.
Microscopia de fluorescencia
(fibroblastos)
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Principais Componentes do
Citoesqueleto
Membrana
plasmtica
Microfilamentos
Mitocndria
Filamentos
intermedirios
RE
Microtbulos
Vescula
Microfilamentos: protena actina - pode estar
polimerizada em uma extremidade e
despolimerizadaemoutra extremidade;
Filamentos Intermedirios: protenas fibrosas:
Fornecem reforo estrutural fora mecnica
e resistncia;
Ancoramentode organelas;
Determinam a posio das organelas.
Actina
Microfilamentos
Queratina
Filamentos intermedirios
Principais Componentes do
Citoesqueleto
Microtbulos: protena tubulina:
Mantm a forma das clulas;
Ancoramentode organelas
Caminhos para o trafego de vesculas.
Membrana
plasmtica
Microfilamentos
Mitocndria
Filamentos
intermedirios
RE
Microtbulos
Vescula
Mitocrotubulos
Centrossoma
Ncleo
Filamentos
intermedirios
actina
Filamentos
Lamina nuclear
-tubulina
Microtubulos
-tubulina
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Complexo de Golgi
Conjunto de cisternas dilatadas e vesculas associadas cada
conjunto tem uma face convexa (cis) e uma fase cncava (trans)
Aps a sntese, as protenas so transferidas para o Complexo de
Golgi, embaladas em grnulos e podem ter diferentes destinos:
- formar lisossomos;
- serem secretadas para o meio externo;
- ou participar da biognese de membranas.
TRANS
CIS
Retculo
Endoplasmtico
(sntese de
protenas)
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Lisossomos
A maioria das vesculas
endocticas tm como destino final
a fuso de elementos do sistema
lisossmico (digesto do material);
Contm enzimas hidrolticas
digerem uma grande variedade de
molculas;
~ 50 hidrolases pH 5,0;
Possuem receptores que
reconhecem membranas de
organelas-alvo ou vesculas
endocticas;
Funo heterofgica e
autofgica.
Alimento
Vesculas de
Transporte
(contmenzimas
hidrolticas
inativas)
Membrana
Plasmtica
Lisossomo
CG
RE
Rugoso
Digesto
Vacolo do
alimento
Fagocitose
da partcula
Lisossomo
fagocitando
uma
organela
danificada
Mitocndrias
Funo: transporte de eltrons (respirao celular).
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Componentes de Clulas Vegetais
Os peroxissomos ou microcorpos so pequenas vesculas que
contm enzimas oxidativas. Possuem, tambm, quase toda a
catalase da clula, enzima que degrada a gua oxigenada.
Membrana
Celular
Vacolo
Ncleo e
Nuclolo
Retculo
endoplasmtico
Complexo de Golgi
Citoesqueleto
Mitocndria
Microcorpos ou
Peroxissomos
Parede
Celular
Cloroplastos
Cloroplastos
Dupla membrana;
Membrana interna
interiorizada, formando formas
achatados tilacides;
Conjunto de tilacides
granum;
Todos os componentes esto
envolvidos na fotossntese;
Estroma ou matriz: fixao de
CO
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, sntese de
monossacardeos, cidos graxos
e protenas;
Pigmentos: clorofila,
carotenides (presentes na
membrana.)
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Vacolos
Entre seus papi s na funo da cl ul a vegetal:
Armazenamento de sai s minerai s, nutri entes,
protenas, pi gmentos,
Auxi li a no crescimento das pl antas, e
desempenha um papel estrutural importante para
a pl anta.
A importnci a estrutural do vacol o est
rel aci onada com a sua capaci dade de control ar a
presso de turgescnci a.
A presso de turgescnci a determi na a ri gi dez
da clul a e est associ ada com a di ferena entre
a presso osmti ca no i nteri or e no exteri or da
cl ul a.
Fundamentos Qumicos Construo de macromolculas
(protenas, cidos nucleicos e polissacardeos).
Os compostos orgni cos de peso molecular < 500 u (aminoci dos,
nucl eotdeos e monossacardeos), servem como subunidades monomri cas de
protenas, ci dos nucl ei cos e pol i ssacardeos, respecti vamente;
Uma nica molcula protei ca: 1.000 ou + aminoci dos, e o DNA: mil hes de
nucl eotdeos;
Ex.: Cada cl ul a da bactri a Escherichia coli = 6.000
di ferentes ti pos de compostos orgni cos (3.000 protenas,
sendo mai s ci dos nucl ei cos e centenas de carboi dratos e
l i pdeos);
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Fundamentos Qumicos Construo de macromolculas
(protenas, cidos nucleicos e polissacardeos).
Aminocidos
(20 tipos dif.)
Desoxirribonucleotdeos
(4 tipos dif.)
Sequencias lineares
coordenas
S= N
L
S= nmeros de sequencias
diferentes
N= num. de diferentes
subunidades
L= comprimento da sequencia
linear
O nmero de
sequenci as dif erentes
possvei s para um
segmento de 8
subunidades =
26
8
ou 2,1x10
11
4
8
ou 65.536
20
8
ou 2,56 x 10
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Letras do al fabeto
(26 ti pos di f.)
Fundamentos Qumicos Construo de macromolculas
(protenas, cidos nucleicos e polissacardeos).
A mai oria dos constituintes molecul ares dos si stemas vivos
composta de tomos de C unidos coval entemente a outros
tomos (C, H, O e N);
Elementos principais
Elementos-trao
Dos mai s de 90 el ementos qumicos que ocorrem
naturalmente, apenas 30 so essenciais para os organismos
vivos.
CHNO: 99% da massa da maioria das clulas.
Elementos principai s: componentes estruturais as clulas e
tecidos, so requeridos na dieta em grandes quantidades;
Elementos-trao: quantidades requeridas muito pequenas.
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Fundamentos Qumicos Construo de macromolculas
(protenas, cidos nucleicos e polissacardeos).
A mai oria dos constituintes molecul ares dos si stemas vivos
composta de tomos de C unidos coval entemente a outros
tomos (C, H, O e N);
Elementos principais
Elementos-trao
Elementos principai s: componentes estruturais as clulas e
tecidos, so requeridos na dieta em grandes quantidades;
Elementos-trao: quantidades requeridas muito pequenas.
Fundamentos Qumicos Construo de macromolculas
(protenas, cidos nucleicos e polissacardeos).
A geometri a do carbono tetradri ca;
A l i gao si mpl es C-C tem rotao l i vre;
Li gaes dupl as so mai s curtas e no permi tem rotao;
Todos os substituintes l i gados aos C da dupl a li gao esto nos mesmos
pl anos.
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Fundamentos Qumicos Construo de macromolculas
(protenas, cidos nucleicos e polissacardeos).
Ligaes covalentes:
Ligaes inicas:
ou
Alguns grupos funcionais comuns de biomolculas
Meti l a
Eti l a
Feni l a
Carboni l a
(al dedo)
Carboni l a
(cetona)
Carboxi l a
Hi droxi l a
(l cool )
ter
Ani dri do (2 c.
Carboxl i cos)
ster
Imi dazol
Sul fi dri la
Ami na
Ami da
Guani dina
Anidrido Misto (ac.
carboxlico e ac.
fosfrico, tambm
chamado de
fosfato de acila)
Fosfori l a
Ti oster
Di ssul feto
Fosfoani dri do
Fundamentos Qumicos Construo de macromolculas
(protenas, cidos nucleicos e polissacardeos).
Acetil-coenzima A
(Acetil-CoA)
Vri os grupos funci onai s em uma mesma bi omol cul a
A Aceti l -CoA uma carregadora de grupos aceti l em
al gumas reaes enzi mti cas