Informe N 2: Flora normal y fisiotaxonoma de bacterias Gram positivo
Autores: Viviana Vives y Claudia Iturriaga
Profesores: Matas Jofr Nicols Villagra Carrera: Ingeniera en Biotecnologa y Bioqumica
Curso: BIO-253
Seccin: 4
Fecha de entrega: 3/5/2011
Resumen En el organismo humano y de muchos animales existen zonas estriles como senos nasales, bronquios, trquea y pulmones, y zonas donde se desarrolla la flora normal del organismo, boca, faringe, odos y nariz, entro otros. La flora normal es beneficiosa en algunos casos, pues las actividades metablicas de algunos microorganismos pueden facilitar la digestin de productos no atacables por los fermentos digestivos, adems de actuar como barrera defensiva impidiendo o dificultando la colonizacin por bacterias exgenas, en especial las patgenas. 1,2 Dentro de la flora normal se encuentra una gran variedad de bacterias Gram positivas como Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes, entre otros 3 . En algunas situaciones puntuales en que el sistema inmune est deprimido o existe una proliferacin anormal de stas bacterias se pueden generar patologas. En este punto es importante poder aislarlas e identificarlas para un correcto tratamiento de la infeccin.
Introduccin Los laboratorios de microbiologa cumplen una funcin de vital importancia para la identificacin de bacterias, en el caso de que se presenten algn tipo de patologa. Para el anlisis e identificacin de una muestra bacteriana se sigue cierto protocolo, de manera que se pueda obtener la informacin necesaria para elaborar el tratamiento adecuado. ste consta principalmente de la siembra y obtencin de un cultivo puro, una observacin macroscpica, microscpica por tinciones y los procesos necesarios para la identificacin fisiotaxonomica, como reacciones metablicas especficas a travs de medios de cultivo selectivos y/o diferenciales y estudios de sensibilidad a agentes microbianos. En el caso de los medios de cultivo es muy importante tener presentes las caractersticas metablicas y/o estructurales de las bacterias, ya que stos permitirn clasificarlas y diferenciarlas entre s. As la eleccin y la interpretacin del cultivo son de vital importancia en el momento de querer identificar microorganismos. Un ejemplo de esto son los medios enriquecidos que constan de los nutrientes esenciales, mas componentes especiales, como sangre el Agar sangre. Otro ejemplo son los medios diferenciales como Agar MacConkey y Citrato de Simmons que permiten establecer si una bacteria desarrolla una determinada funcin metablica o no 4 . El agar corriente y el agar sangre son los medios de cultivo utilizados en este practico. El agar corriente solo nos permite el desarrollo de bacterias con nutrientes esenciales mientras que el agar sangre nos da informacin de cmo es el comportamiento hemoltico de las bacterias ya sea produciendo una hemolisis alfa (destruccin parcial de eritrocitos, color verdosa), beta (destruccin total de la colonia) o gamma (no se produce hemolisis). 5
Para identificar ms especficamente a una bacteria, como gnero y especie, se deben realizar pruebas bioqumicas como la prueba de la catalasa. En el caso de la identificacin de bacterias Gram positivas de la flora bacteriana normal humana, sta prueba es crucial ya que la familia Micrococcaceae se caracteriza por ser catalasa positiva adems de ser cocacceas y agruparse en staphylos (racimos) 6 , mientras que la familia Streptococcaceae se caracteriza por ser catalasa negativa y agruparse en streptos (cadenas) 7 . En el prctico adems se realiz el test de latex como prueba de la coagulasa, que es una enzima presente en Staphylococcus aureus, el test de latex para streptococcus, el test de CAMP que identifica streptococcus con grupo serolgico B y las pruebas de sensibilidad a antimicrobianos o antibiograma en la cual se siembra un csped bacteriano y estudia in vitro el comportamiento de los antimicrobianos frente a la bacteria en estudio El objetivo principal de ste prctico es identificar mediante pruebas bioqumicas y sensibilidad antimicrobiana cocaceas Gram positivo de una muestra problema y de una muestra de flora normal de la boca.
Metodologa En la primera parte del prctico, se realizaron dos siembras de flora normal obtenida de la boca de un integrante del grupo. La segunda parte consisti en realizar un anlisis macroscpico, tinciones para anlisis microscpico, pruebas bioqumicas y de sensibilidad ante antimicrobianos para la identificacin de una muestra problema. La tercera parte del practico consisti en tomar algunas colonias representativas del cultivo de flora normal realizado en la parte uno e identificarlo mediantes un anlisis macroscpico, tinciones para anlisis microscpico y pruebas bioqumicas. Se utilizaron los siguientes materiales: portaobjetos, agua, cristal violeta, lugol, safranina, agar sangre, agar corriente, agar Mueller-Hinton, trulas estriles, asas de platino, asas de plstico, test de ltex para coagulasa, agua oxigenada 30%, discos de antibitico, papel milimetrado, pinzas, mechero Bunsen y para la observacin de las muestras teidas se utiliz microscopio ptico. 1) Siembra de flora normal. Se humedeci con suero fisiolgico una trula estril y se desliz por la mucosa yugal derecha o mejilla derecha. A continuacin de sembr con movimiento zig-zag en placa de agar corriente. Se repiti el proceso y se sembr en placa de agar sangre. Condiciones de cultivo: por 48 hrs. a 37C 2) Anlisis de muestra problema. N muestra problema: 5 - Agar sangre A la muestra problema se le realizaron los siguientes anlisis: a) Anlisis macroscpico de colonias. b) Anlisis microscpico por tincin de Gram: Se esteriliz el asa, se enfri y se tom una muestra desde el cultivo en para la muestra problema llevndola al portaobjetos, donde previamente se haba colocado una gota de agua, luego se agreg cristal violeta, se esper 3 min., en seguida se agreg lugol, se esper 2 min. y se lav con la solucin de alcohol-cetona y luego agua. Finalmente se agreg safranina al 1%, se lav, se sec y se observ con el microscopio ptico con objetivo 100X. c) Test de catalasa: con un asa de plstico se tom una colonia del cultivo y se mezcl con una gota de agua oxigenada al 30% previamente colocada en un portaobjetos. d) Test de coagulasa: Se tom una tira reactiva del test de ltex para coagulasa, a sta se le agreg una gota de solucin de anticuerpos del test de aglutinacin para Staphylococcus. Luego se tom un par de colonias desde el cultivo con un mondadientes de plstico y se mezcl con el reactivo agitando constantemente. e) Test de susceptibilidad a agentes microbianos: Se mezcl una cantidad importante de colonias bacterianas con un caldo, hasta que la turbidez alcanzara un estndar que haba en el laboratorio. Luego con una trula estril se sembr a los largo de todo el medio de cultivo de Mueller-Hinton 3 veces con movimientos zig-zag. Finalmente se seleccionaron 4 discos de antimicrobianos para Staphylococcus. Eritromicina Penicilina Oxacilina Clindamicina Adems se utiliz un quinto disco correspondiente a la Novobiocina, que adems de dar un halo caracterstico de inhibicin permite identificar una especie de Staphylococcus de otra. Cada disco de antimicrobiano se tom con una pinza previamente esterilizada y enfriada, y se coloc suavemente sobre el cultivo, con su parte protuberante hacia ste. Cabe destacar que adems se analiz la hemlisis del cultivo. 3) Anlisis de siembras de flora bacteriana normal. Se seleccionaron colonias caractersticas o aquellas que se apreciaban en mayor nmero desde ambos cultivos y se les realizaron los procedimientos a;b; y c de la actividad nmero 2. Adems se analiz la hemlisis del cultivo en agar sangre.
En todas las actividades se observaron e interpretaron los resultados.
Fig. 1: Esquema de el procedimiento seguido en el laboratorio para la identificacin de la muestra problema N5. Las figuran en naranjo indican que se fue el resultado obtenido para la muestra problema. Los azules son los valores descartados. Resultados 1) Siembra de flora normal: En ambas siembras, se observan cultivos mixtos, no hay un solo tipo de colonias presentes. Es importante observar que en el agar corriente crecieron slo colonias de tamao pequeo mientras que en el agar sangre hay una gran diferencia de tamao entre las colonias presentes. El anlisis microscpico y macroscpico de las colonias se realiz sobre colonias especficas y no sobre una mezcla de ellas. Agar sangre: Colonias ms grandes
Fig2 Placa de agar sangre para cultivo de flora normal de mucosa yugal derecha. Agar corriente: colonias de tonalidad amarilla.
Fig3 Placa de agar corriente para cultivo de flora normal de mucosa yugal derecha.
2) Anlisis de muestra problema:
Fig4 Placa de agar sangre correspondiente a la muestra problema. a) Anlisis macroscpico: La elevacin de la colonia as como su consistencia no se pudieron reportar debido a que su tamao era muy reducido. Tabla N1: Anlisis macroscpico de MP. Muestra problema Tamao Pequeo Forma Circular Elevacin - Margen Entero Color Blanco Superficie Brillante Densidad Opaca b) Anlisis microscpico: Se observa claramente que la muestra problema corresponde a una coccea, agrupada en racimos o staphilos, tambin podemos confirmar que efectivamente es una bacteria Gram positiva por el color violceo que adquiri luego de la tincin de Gram.
Fig5 Microscopa ptica con aumento 1000X, de una colonia aislada de la muestra problema preparada con tincin de Gram. c) Test de la catalasa: El test de la catalasa, dio resultados muy rpidos. Al momento del contacto de la bacteria con el agua oxigenada, comenzaron a formarse burbujas.
Fig6 8 Resultados posibles para el test de la catalasa en bacterias. El que est encerrado en rojo se considera positivo, o sea que la bacteria posee la enzima. Por lo tanto se considera que el test es positivo para la enzima catalasa. De esta manera si seguimos la Fig.1 podemos descartar que nuestra muestra problema corresponde a un Streptococo, y confirmamos, lo que la microscopa con tincin de Gram nos mostr. La bacteria es un Staphylococo. d) Test de coagulasa: En el caso de ste test, el procedimiento se repiti dos veces de forma que pudiramos asegurarnos de que el resultado obtenido era el correcto.
Fig7 Resultado del test de la coagulasa a travs del test de ltex. En ambas ocasiones el test result negativo para la coagulasa de manera que segn la Fig1 podemos descartar que la muestra problema sea un Staphylococcus aureus. e) Test de susceptibilidad a agentes microbianos: cuando el anlisis con coagulasa deriva en una bacteria no coagulasa, el test de susceptibilidad a antibitico debe contener al antimicrobiano Novobiocina.
Fig8 Test de susceptibilidad a agentes microbianos para la muestra problema N5. En la fig8 se observa claramente que no hubo un crecimiento bacteriano homogneo en toda la extensin del agar. Los valores obtenidos para los antibiticos utilizados se muestran en la siguiente tabla. Tabla N2: Halo de inhibicin de los antimicrobianos utilizados sobre la muestra problema. Halo de inhibicin Novobiocina 30mm. Eritromicina 5mm Penicilina 5mm Oxacilina 5mm Clindomicina 9mm
Todos los halos de inhibicin anteriores se calcularon, con un papel milimetrado, tomando dos mediciones perpendiculares del halo y luego promedindolas. Ejemplo para Clindomicina: mm mm mm MedicinII MedicinI 9 2 8 10 2
En el caso de los antimicrobianos que
presentan un halo de inhibicin igual a 5mm., son aquellos que no formaron halos visibles, y se reporta slo el dimetro del disco. A continuacin se muestra una tabla con los valores estndares que deben tener los halos de inhibicin, para realizar una clasificacin, de cada antibitico utilizado con respecto a Staphylococo. Tabla N3: Valores tericos de halos de inhibicin de los antimicrobianos utilizados sobre la muestra problema para hacer una clasificacin. Halo de inhibi cin Conte nido del disco Sensib le (mm)
Inter medi a (mm)
Resist ente (mm) Novobi ocina 30m m. 5g 16 - 16 Eritromi cina 5mm 15 g 23 14- 22 13 Penicili na 5mm 10 U 29 - 28 Oxacilin a 5mm 1 g 13 11- 12 10 Clindo micina 9mm 2 g 21 15- 20 14 Los valores destacados en rojo son los que se obtuvieron. De esta manera podemos determinar que la muestra problema es, resistente a todos los antibiticos y sensible a Novobiocina. Si seguimos el anlisis con la Fig. 1 podemos decir que la muestra problema corresponde a un Staphylococcus Coagulasa negativo no Saprophyticus. f) Anlisis de la hemlisis: Se observ el cultivo de la muestra problema que se muestra en la Fig. 4 y se determin que este produjo unas hemlisis . 3) Anlisis de siembras de flora bacteriana normal. a) Anlisis macroscpico: Se observ una colonia representativa de cada uno de los cultivos obtenidos de la flora normal. Cultivo en agar sangre: Tabla N4, Anlisis macroscpico de cultivo de flora normal en agar sangre. Muestra problema Tamao Grande Forma Irregular Elevacin Elevada Margen Ondulado Color Crema Superficie Cremosa Densidad Opaca Adems como se muestra en la Fig 2, el cultivo presenta una clara hemlisis , caracterizada por el halo verdusco a su alrededor. Cabe destacar que la colonia tena una consistencia firme, como fibrosa, al tomarla con el asa se tomaba la colonia completa y era difcil separarla. Cultivo en agar corriente: La elevacin de la colonia as como su consistencia no se pudieron reportar debido a que su tamao era muy reducido. Tabla N5 Anlisis macroscpico de cultivo de flora normal en agar corriente. Muestra problema Tamao Pequeo Forma Circular Elevacin - Margen Entero Color Amarillo Superficie Cremosa Densidad Transparente
b) Anlisis microscpico: Se realizaron 2 veces las tinciones de Gram para ambas colonias seleccionadas. En ninguna de las ocaciones pudo obtenerse una microscopa clara de la tincin. El resultado era, las colonias teidas, de un fuerte color rosado, pero al observar al microscopio, slo se observaba una mancha del mismo color. En el caso de la colonia seleccionada desde el agar corriente se pudo observar una pequea cantidad de bacterias con forma de cocaceas. Con respecto a la agrupacin no se puede asumir que tiene una o la otra ya que eran muy pocas bacterias con una organizacin al parecer en cadena.
Fig9Microscopa ptica con aumento 1000X, de una colonia aislada del cultivo en agar corriente para flora normal preparada con tincin de Gram. En ambos casos se observaba algo como esto luego de hacer el frotis, para la tincin de Gram, a simple vista.
Fig 10, aspecto de los portaobjetos con la tincin de Gram. En el caso de la colonia proveniente del agar sangre, al ser esta muy difcil de separar, quedaban grandes porciones de bacterias al mezclarla con la gota de agua. Se consider que ambas colonias eran Gram negativas por el color rosado que se pudo observar, y que la bacteria del agar corriente es una cocacea, pero el que sean Gram negativas es una suposicin ya que no pudo observarse correctamente. c) Test de la catalasa: El test de la catalasa, dio resultados muy rpidos. Al momento del contacto de la bacteria proveniente del cultivo en agar sangre con el agua oxigenada, comenzaron a formarse burbujas. Considerndose positivo para sta. Para la colonia obtenida del agar corriente no se present reaccin de manera que asumimos es catalasa negativa, o en otras palabras no contiene a la enzima.
No se realizaron mas ensayos para los cultivos ya que no haba prueba alguna de que se trataran de cocaceas en ambos casos y de si fueran Gram positivas o Gram negativas de manera clara.
Discusiones: Actividad 2, identificacin de la muestra problema: La informacin obtenida en los resultados es: Catalasa positiva Coagulasa negativa Sensible a Novobiocina Segn estos parmetros y un posterior anlisis bibliogrfico podemos decir que la muestra problema probablemente corresponda a un Staphylococcus epidermidis. Ya que se caracteriza por ser coagulasa negativo y Novobiocina sensible. No fermenta el manitol ni tolera el cloruro de sodio. 9
Tabla N6 comparacin de muestra problema con caractersticas de S.epidermidis. MP S.epidermidis Color blanco blanco grisceo Tamao en cultivo pequeo pequeo Catalasa positivo positivo Coagulasa negativo negativo Sensibilidad a Novobiocina presenta presenta Hemlisis no presenta
En el caso de la muestra problema se obtiene una hemlisis , pero este anlisis fue realizado por nosotras de manera que puede ser errneo. La bacteria S.epidermidis no presenta hemlisis.
Staphylococcus epidermidis es una bacteria que habita normalmente en la piel, es un patgeno oportunista de baja A continuacin se muestra una figura comparativa de diferentes cultivos de S.epidermidis encontrados en la bibliografa y el cultivo de la muestra problema. A 10 , B y C 11 , la figura D corresponde a la muestra problema.
incidencia y que requiere un umbral bastante grande en la baja de las defensas para producir alguna patologa, est asociado comnmente a infecciones intrahospitalarias. 12,13
Posee una hemolisina diferente de las de S. aureus, denominada "psilon." 14
En la actividad e, de la parte 2, del test de antimicrobioanos, se explica el crecimiento no homogneo de la bacteria debido a que no se sembr correctamente la cantidad de veces ni de la forma ptima.
Actividad 3, identificacin de de una colonia a partir del cultivo de flora normal en agar corriente y agar sangre: Como se dijo en los resultados no se obtuvieron las tinciones de Gram para ninguno de los dos salvo que para la colonia del agar corriente se identific que era una cocacea y que ambas tal vez eran Gram negativas debido a la coloracin aparente del frotis. Sera muy difcil identificar a la bacteria con tan pocos datos pero es importante mencionar que la colonia tomada de cultivo hecho en agar sangre presenta hemlisis de manera que podemos disminuir el grupo de bacterias posibles. La cavidad oral es uno de los hbitats microbianos ms complejos y heterogneos del cuerpo. 15
En ella habitan streptococos de la variedad viridans que se caracterizan por producir hemlisis del tipo . 16
Algunos de ellos son: Streptococcus mitis Streptococcus mutans Streptococcus sanguis Streptococcus pneumoniae, se caracteriza por tener hemlisis Todas las bacterias mencionadas son catalasa negativo, al realizar la prueba de la catalasa para esta colonia se obtuvo un resultado positivo de manera que no debera ser ninguna de stas a menos que la prueba haya sido mal realizada. Otra opcin es que la bacteria sea del gnero Neisseria, ya que stas si presentan una prueba de catalasa positiva 17 y en el caso de Neisseria meningitidis en los seres humanos son las membranas mucosas, su hbitat natural, especficamente de la nasofaringe 18 la cual es comnmente colonizada sin produccin de sntomas de la enfermedad. sta no produce hemlisis 19 de manera que tampoco es probable que se encuentre en el cultivo. No puede ser Staphilococcus epidermidis ya que ste no presenta hemlisis. En ltimo caso nos encontramos con un microorganismo anaerobio denominado fusobacterium que debe su nombre a su forma alargada y delgada con extremos en forma de huso 20 . Esta es tipo de bacteria Gram negativa anaerbica que se encuentra normalmente en la boca. 21
Es importante considerar que los cultivos eran mixtos y que de ninguna manera se encontraba puro, lo que hace ms difcil su deteccin. Adems de que se pueden haber cometido errores durante los anlisis. Para la muestra en agar corriente la nica informacin obtenida es que se trataba de una coccea que al parecer era negativa, para tincin de Gram y la prueba de la catalasa. Existen muchas especies bacterianas Gram negativas que se desarrollan en la boca desde que somos bebs. 21 Sin una mayor informacin no es posible identificar stos cultivos.
Con respecto a las tinciones, podemos atribuir la no obtencin de las tinciones de Gram a un mal procedimiento de la tincin, a que se hayan lavado las bacterias al no realizar correctamente el frotis o que se haya lavado todo el colorante con un reactivo no adecuado, por ejemplo lavar con agua en vez de mezcla alcohol-acetona primero.
Conclusiones
Se llevaron a cabo todas las actividades y pruebas bioqumicas para la identificacin de cocceas Gram positivas, a partir de esto podemos concluir que: La bacteria de la muestra problema es un Staphylococcus coagulasa negativo, no saprophyticus. Segn stas caractersticas la muestra podra corresponder a Staphylococcus epidermidis. La flora normal de la boca presenta una heterogeneidad muy amplia, aun as es posible realizar pruebas bioqumicas para la identificacin de muestras.
Bibliografa
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