1a Aula

Bioqumica I
C d Q i UFSC Curso de Qumica UFSCar

1. Aula
Introduo Bioqumica
Profa. Dra. Maria Teresa Marques Novo
Departamento de Gentica e Evoluo DGE
Centro de Cincias Biolgicas e da Sade (CCBS)
UFSCar- So Carlos UFSCar So Carlos
Introduo Bioqumica Introduo Bioqumica
Bioqumica: cincia que estuda as bases qumicas
da vida
Clula: unidade estrutural dos sistemas vivos
Bioqumica: estuda os constituintes qumicos da Bioqumica: estuda os constituintes qumicos da
clula viva, bem como reaes e processos que
nela ocorrem nela ocorrem
Compreende: Biologia Celular Biologia Molecular Compreende: Biologia Celular, Biologia Molecular,
Gentica Molecular
Objetivo:
Compreender, ao nvel molecular, os
i i d processos qumicos associados com as
clulas vivas
Para isso isolamento de molc las Para isso: isolamento de molculas,
determinao de sua estrutura e funo
Introduo Bioqumica: Introduo Bioqumica:
Mtodos bioqumicos
Bioqumica: essencial para todas as Cincias da Vida
Bioqumica dos cidos nuclicos: o centro da
gentica
Estratgias de estudo gentico: importantes
para elucidar a bioqumica
Fisiologia e Bioqumica: se sobrepem quase
completamente. completamente.
Imunologia emprega diversas tcnicas
bioqumicas (e vice-versa) bioqumicas (e vice-versa)
Farmacologia: drogas so metabolizadas por
enzimas enzimas
Bioqumica: essencial para todas as Cincias da Vida
Toxicologia: venenos atuam em reaes
bioqumicas ou processos
Patologia (estudo das doenas): estratgicas
bioqumicas para estudar inflamao, injria j
celular, cncer
Microbiologia, zoologia e botnica: utilizam Microbiologia, zoologia e botnica: utilizam
muito as metodologias de Bioqumica
A vida depende de reaes e processos
bioqumicos! Por isto a Bioqumica a bioqumicos! Por isto a Bioqumica a
linguagem comum entre as cincias da vida!!
Bioqumica e as Cincias da Sade
Objetivos das Cincias da Sade: manuteno
da sade e tratamento efetivo de doenas
Bioqumica tem enorme impacto nesses dois Bioqumica tem enorme impacto nesses dois
aspectos
Inter-relaes da bioqumica e medicina: uma
larga rua de duas mos larga rua de duas-mos
Estrutura e funo da hemoglobina: para
elucidar a diferena bioqumica entre a Hb
normal e a Hb da anemia falciforme
Estrutura da clula falciforme: entendimento Estrutura da clula falciforme: entendimento
da estrutura e funo da Hb normal e de
outras protenas outras protenas
Garrot (1900s): mdico ingls- estudou
i t l t i lbi i t pacientes com alcaptonria, albinismo, etc:
de ordem gentica (erros inatos do
metabolismo)
Hipercolesterolemia familiar precoce: doena
gentica que resulta em aterosclerose
Esforos para entender a base gentica da
doena levou ao maior conhecimento dos doena levou ao maior conhecimento dos
receptores celulares e dos mecanismos da
captao de colesterol pelas clulas captao de colesterol pelas clulas
Estudo de oncogenes em clulas de tumor:
i l id t l d mecanismos envolvidos no controle do
crescimento celular normal
A maioria seno todas as doenas so devido a anormalidades de molculas A maioria, seno todas as doenas, so devido a anormalidades de molculas,
reaes qumicas ou processos bioqumicos.
Para se ter sade: adequada ingesto de
vitaminas, minerais, aminocidos, certos
cidos graxos
Bioqumica e Nutrio: estreita relao Bioqumica e Nutrio: estreita relao
Estratgias nutricionais para preveno de
doenas medicina pre enti a doenas: medicina preventiva
A compreenso da nutrio depende em
grande parte de conhecimentos em
bioqumica! q
Aplicaes da Bioqumica em
relao a doenas
Impacto do Projeto Genoma Humano na Bioqumica e Medicina
anos 2000: genoma humano sequenciado, o que
teve tremendo impacto na bioqumica e na teve tremendo impacto na bioqumica e na
medicina.
muitos genes previamente desconhecidos foram
revelados impactos no estudo da evoluo revelados, impactos no estudo da evoluo
humana, busca de genes causadores de doenas.
reas impactadas: protemica, biotecnologia,
f i bi i f ti farmacogenmica, bioinformtica.
Bioqumica: organismos vivos vs. inanimados
Organismos vivos: so constitudos de
molculas sem vida, que, quando isoladas , q , q
e examinadas individualmente seguem
todas as leis fsicas e qumicas todas as leis fsicas e qumicas
Os atributos extraordinrios dos seres
vivos no so exibidos por colees vivos no so exibidos por colees
randmicas de molculas.
Ento, o que distingue os organismos
i d bj i i d ? vivos de objetos inanimados?
1. Seu grau de complexidade qumica e
organizao: organizao:
clula: estruturas com milhares de
diferentes molculas
matria inanimada: areia, rochas, gua
do mar: misturas de compostos qumicos do mar: misturas de compostos qumicos
relativamente simples
Os seres vivos contrariam ento as leis da termodinmica sobre o fato de processos
espontneos tendem maior entropia?
2. Organismos vivos retiram, transformam
e usam energia do seu meio-ambiente, e usam energia do seu meio ambiente,
usualmente na forma de nutrientes
qumicos (outros seres vivos) ou luz do qumicos (outros seres vivos) ou luz do
sol. Com essa energia o organismo:
- constri e mantm suas estruturas constri e mantm suas estruturas
complexas (trabalho qumico)
f t b lh i ti t - faz trabalhos mecnico, osmtico, etc.
Ao contrrio, a matria inanimada:
- No usa a energia de maneira dinmica e
i t i t t t f sistmica para manter estrutura ou fazer
trabalho
- Por isto, tende a cair para um estado mais
desorganizado e entrar em equilbrio com o
ambiente
3. Organismos vivos tm capacidade para
auto-replicao e auto-montagem, de auto replicao e auto montagem, de
maneira bem precisa
- Uma nica clula de Escherichia coli: em 24
h pode gerar bilhes de clulas-filhas
idnticas a partir de nutrientes
- Cada clula: milhares de diferentes
molculas sua construo direcionada pelo molculas, sua construo direcionada pelo
material gentico da clula original.
Cristalizao- mundo inanimado: produz mais
t i l id ti t t i i l material idntico em estrutura ao germe original
(mas muito menos complexos que seres vivos!!)
Schrdinger (1944): material gentico das g ( ) g
clulas tem que ter algumas propriedades de
um cristal (antes mesmo de se saber do (
mecanismo de duplicao do DNA!)
Como podem molculas inanimadas conferir
id ?!! vida?!!
Como pode o organismo vivo ser mais que a
soma de suas partes inanimadas?
O estudo da Bioqumica mostra como o conjunto O estudo da Bioqumica mostra como o conjunto
de molculas inanimadas do s.v. interagem g
para manter e perpetuar a vida com base
apenas em leis qumicas que governam o
universo no vivo universo no-vivo.
A diversidade de seres vivos
Bioqumica e a diversidade dos organismos vivos
A Bioqumica explica formas diversas de
vida em termos qumicos unificados:
- org vivos so diversos porm nos nveis qumico e - org. vivos so diversos, porm nos nveis qumico e
celular so muito semelhantes!
- a Bioqumica descreve em termos moleculares as
estruturas, mecanismos e processos qumicos estruturas, mecanismos e processos qumicos
compartilhados por todos os organismos e fornece os
princpios de organizao que fundamentam a vida em
todas as suas formas (Lgica Molecular da Vida)
Elementos qumicos essenciais vida animal e sade
Todas as macromolculas so constitudas
ti d t i l a partir de poucos compostos simples
P t id li Protenas e cidos nuclicos:
molculas informacionais
Exemplos:
-uma nica protena: 1000 ou mais aa.
- DNA: milhes de nucleotdeos
- uma clula: milhares de diferentes protenas
e cidos nuclicos
Lgica Molecular da Vida
1. Todos os s.v. constrem molculas com os
ti d b id d i mesmos tipos de subunidades monomricas
2. A estrutura de uma macromolcula determina
sua funo biolgica especfica g p
3 Cada gnero e espcie definido por seu 3. Cada gnero e espcie definido por seu
conjunto distinto de macromolculas.
Energia e sua relao com a Vida
Energia um tema central da Bioqumica
Clulas e organismos dependem de um suprimento
constante de energia para se opr tendncia natural constante de energia para se opr tendncia natural
de decair para estado de menor energia.
O estoque e a expresso da informao custa energia,
sem esta estruturas ricas em informao se tornariam sem esta, estruturas ricas em informao se tornariam
desordenadas.
O papel da energia no metabolismo
As clulas desenvolveram mecanismos
lt t fi i t altamente eficientes para:
acoplar a energia obtida da luz do sol ou de nutrientes com
seus vrios processos consumidores de energia seus vrios processos consumidores de energia
Tal energia possibilita que os organismos vivos
t j ilb i i ! no estejam em equilbrio com o meio!
O papel da energia no metabolismo
S aps morte (degradao): p ( g )
ser vivo entra em
equilbrio com o meio!
Composio molecular dos s.v.
P ti t t t t Praticamente constante no tempo, porm as
molculas de um organismo so sintetizadas e
d d d i d i degradadas por reaes qumicas de maneira
contnua (as molculas no so estticas)
Essa renovao contnua requer constante fluxo q
de massa e energia atravs do sistema. Ex:
Composio molecular dos s.v.
Os s.v. transformam energia e matria
Clulas vivas e organismos devem fazer trabalho para
permanecer vivos e se reproduzir
Tipos de trabalho: Qumico, mecnico, osmtico
Organismos vivos: so sistemas abertos, pois trocam
t i i i matria e energia com o meio
P 2 t t i ti E i d bi t Possuem 2 estratgias para retirar Energia do ambiente:
1) oxidam compostos qumicos
2) absorvem energia da luz do sol
Bioenergtica
A clula armazena energia qumica na forma de ATP:
+E
ADP + Pi ATP (Trifosfato de adenosina) ( )
Bioenergtica
Nos org. vivos qual o segredo para possibilitar
que reaes desfavorveis (endergnicas, G> 0) q ( g )
ocorram?
A clula consegue ACOPLAR:
d i (G> 0) reaao endergnica (G> 0) com uma
reao exergnica (G< 0),
Este acoplamento central s trocas Este acoplamento central s trocas
energticas nos sistemas vivos!!!
Bioenergtica
O ACOPLAMENTO se d via um
intermedirio compartilhado, em geral o fosfato, intermedirio compartilhado, em geral o fosfato,
originrio da molcula de ATP!
Bioenergtica
Bioenergtica
A quebra do ATP, composto carregador principal
de energia qumica em todas as clulas
a reao exergnica que direciona muitos a reao exergnica que direciona muitos
processos endergnicos nas clulas
Ex: glicose + ATP ___ glicose 6-fosfato +ADP
glicose + Pi____ glicose 6-fosfato (end.)
Bioenergtica
Bioenergtica
Anabolismo:
Sntese
Catabolismo:
Degradao
Sntese
(endergnico)
(exergnico)
Conector: ATP
Enzimas e suas vias metablicas
Enzimas so biocatalisadores que aumentam
muito a velocidade de reaes qumicas
especficas sem serem consumidas
Elas diminuem a barreira de energia entre
reagente e produto) reagente e produto).
D i i t li f i d Dois ou mais reagentes se ligam superfcie da
enzima de maneira muito prxima e com
i t f orientao que favorece a reao
Tambm h distoro do reagente ao se ligar
enzima, favorecendo a reao
Biocatalizadores so em geral protenas Biocatalizadores so, em geral, protenas.
Exceo: Ribozimas
Cada enzima cataliza uma reao especfica (com
l ) algumas excees)
Cada reao na clula catalizada por uma enzima
diferente
Portanto, milhares de diferentes enzimas so requeridas
d l l para cada clula
C id d b i l ti t b i d Capacidade para abaixar seletivamente barreiras de
ativao devido a:
multiciplidade de enzimas - multiciplidade de enzimas,
- especificidade (discrimina reagentes),
susceptibilidade regulao (notar importncia da - susceptibilidade regulao (notar importncia da
existncia de barreiras!)
As milhares de reaes catalizadas por enzimas nas clulas so
organizadas em reaes consecutivas (VIAS) nas quais o organizadas em reaes consecutivas (VIAS), nas quais o
produto de uma reao se torna o reagente na prxima.
Regulao de via metablica
O surgimento da Clula
O aparecimento da clula se deu provavelmente pela
formao de uma membrana oleosa que permitiu acumular q p
molculas e ons
(em tipos e concentraes diferentes do meio-ambiente)
Membrana celular
A Clula: do nvel estrutural ao molecular
A Clula
O Vrus: acelular
A Clula Procaritica
A Clula Eucaritica
I t d Bi i Introduo Bioqumica
A Clula Eucaritica
A Clula Eucaritica
Clula animal
Clula vegetal
A Clula Eucaritica
A Clula Eucaritica
A Clula Eucaritica
A Clula Eucaritica
A Clula Eucaritica
A Clula Eucaritica

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