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2013
Revisin
Correspondencia a:
Introduccin
Enfermedades (IBD), colitis ulcerosa que abarca
Paul D. Cotter, BSc, PhD
El tracto intestinal humano alberga los distintos
(UC) y la enfermedad de Crohn (CD) [Frank et al.
Investigacin Teagasc Food
Centre, Moorepark,
y la comunidad microbiana compleja que juega la
2007].
Fermoy, Co. Cork, Irlanda
papel central en la salud humana. Ha sido estimacin
acoplado eso-- ur intestino Contiene en el intervalo de 1000
La Alimentaria
El papel del microbioma intestinal en la salud humana Pharmabiotic Centre,
Las especies bacterianas y 100 veces ms genes Rambler
University College Cork,
se encuentran en el genoma humano [Ley et al. 2006a; La enfermedad es cada vez ms clara y gracias a la altaCork, Irlanda
paul.cotter@teagasc.ie
tecnologas de secuenciacin de rendimiento (HTS) como
Qin et al. 2010]. Esta comunidad es comnmente
as
como
paralelos
Desarrollos
Recientes
en
nongenomic
Conocida como nuestras tarifas do "rgano" metablicas
Caitriona M. Guinane,
mrito. El propsito de esta revisin es verano Stufi
BSc, PhD
ocultas
Investigacin Teagasc Food
Marize los desarrollos principales muy significativos
Su tremendo impacto en el bienestar humano,
Centre, Moorepark,
Tener
eso-ocurri
con
reverencia
a
revelar
la
Fermoy, Co. Cork, Irlanda
metabolismo del husped incluyendo, Fisiologa, Nutricin
La diversidad microbiana del intestino humano y cmo esto
y la funcin inmune. Ahora es evidente eso-- Hur
gut coevoluciona microbioma con nosotros [Ley et al. impactos microbiota intestinal en Gastrointestinal
(GI) de la enfermedad. Tambin le Discus el estado-of-the-art
2008] y eso-- cambios a esta poblacin puede
eso-- herramientas se pueden utilizar para estudiar el
Tienen importantes consecuencias, tanto beneficiosos como
perjudiciales para la salud humana. De hecho, ha sido microbioma intestinal
Sugerido interrupcin eso-- de la microbiota intestinal y mirar a las opciones teraputicas futuras, tales como la
de la microbiota intestinal, tasas Mensajero GI
(Disbiosis XOR) puede ser significativa con los aspectos manipulacin
a
Trminos.
patolgicas Trminos intestinales como la obesidad
[Ley et al. 2006b; Zhang et al. 2009] y tricin
tricin [Kau et al. 2011], la sistemtica este tipo de
enfermedades
Diabetes Hasse [Qin et al. 2012] y inflamacin crnica Herramientas para el Estudio de la microbiota intestinal
Enfermedades matory COMO inflamatoria intestinal
La comprensin de la composicin y funcional
capacidad del microbioma intestinal representa la principal
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CM Guinane y PD Cotter
Figura 1. La microbiota intestinal en la salud intestinal y la enfermedad. Los microbiota gastrointestinal juegan el papel
acoger en Fisiologa, Nutricin y Metabolismo. La adulteracin en la comunidad microbiana intestinal est vinculada a la
Nmero de condiciones intestinales, incluyendo el cncer, la obesidad y la variedad de trastornos intestinales. La contribucin
componentes de beneficiosos del microbioma intestinal para acoger Fisiologa, metabolismo y funcin inmune TIENE
Convertido en el foco de atencin cada vez ms, y sin duda conducir a nuevos enfoques teraputicos.
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CM Guinane y PD Cotter
Akkermansia [Arumugam et al. 2011]. Desde entonces se
ha foco de atencin, es decir, la posibilidad
Mayor
ha indicado, sin embargo, eso-- The Three enterotipo NCO relacin entre la microbiota intestinal y crnica
Divisional Arent Hasse Hasse separar primero el pensamiento
Enfermedades gastrointestinales, incluyendo el sndrome del
y en
intestino irritable
particular, la Ruminococcus predominante enterotipo
(IBS) y la EII, enfermedades sistmicas como la tipo 2
parece menos obvio Rambler reclam inicialmente [Jeffery
diabetes (diabetes tipo 2) y la obesidad, as como de la
et al. 2012A; Wu et al. 2011].
aparicin
El cncer colorrectal (CRC) (Tabla 1 y Figura 1).
Sndrome
del intestino irritable
Tambin la microbiota intestinal de edad avanzada ha sido
la
tema de la serie de estudios en los ltimos aos. Este Trastornos intestinales funcionales, tales como el apagado
es particularmente oportuna de Hasse envejecimiento deIBS
la
Define nicamente en el diagnstico basado en los sntomas
poblacin es
criAhora convertirse en la caracterstica general de los pases
teria. IBS se caracteriza por dolor abdominal o
occidentales
El malestar y los hbitos intestinales alterados. Aunque
tries [Biagi et al. 2010; Claesson et al. 2011, 2012].
Se ha observado eso-- hay fsica relacionada con la edadLa etiologa es multifactorial, reciente entendimiento
cin de la fisiopatologa del SII ha revelado
cambios meto- en el tracto gastrointestinal de las Personas
Que las variaciones en la malla normal de la microbiota
Mayores
intestinal
Ese perodo de calma que se caracteriza por la crnica de
Tienen un papel que desempear en el intestinal de bajo
bajo grado
grado
inflamada (inflammageing) [Franceschi, 2007]
inflamacin asociados con el sndrome
que puede conducir al desequilibrio en la Microbiana
[Brint et al. 2011; Ponnusamy et al. 2011].
delgado [Guigoz et al. 2008]. Escaneo HTS TIENE
Disbiosis microbiana en el intestino se piensa que es
Eso indica la composicin del intestino micro
biota de las personas mayores (> 65 aos) es distinta deinvolucrados en el SII patognesis facilitando
adherencia de los patgenos a la pared intestinal (para el
eso-- de youngers y adultos, aunque muy
revisin, vase Ghoshal y colegas [Ghoshal et al.
Variables entre los individuos, de HAS dominacin general
2012]). En concreto, el estudio con phylogeNANCE del phylum Bacteroidetes [Claesson et al.
microarrays magnticos y de la polimerasa cuantitativa
2011]. Claesson y colegas miento adicional
cido una relacin entre la dieta, la estacin de la salud Reaccin en cadena (qPCR) anlisis revel la clara
Tus y el intestino poblacin microbiana de los mayores paratin Entre La microbiota gastrointestinal de los pacientes
con IBS y eso-- del control, es decir, el SII era
La gente [Claesson et al. 2012]. En resumen, taxonmicas de misiones mostraron eso-- la microbiota de caracterizado por el aumento de Firmicutes y,
Ms especficamente, en los nmeros de Ruminococcus,
La gente en el entorno de la atencin de larga estancia tenan
Clostridium y Dorea, Adems de la marcada
un alto
proporcin de Bacteroidetes, mientras que los individuosreduccin en Bifidobacterium y Faecalibacterium
spp. [Rajilic-Stojanovic et al. 2011]. En un similares
Vivir en la comunidad tena un alto nivel de
Estudio de pacientes peditricos con el sndrome, la
Firmicutes. Cabe destacar que la microbiota de los individuos
en larga estancia atencin fue significativamente menos Los miembros de la adulteracin en Firmicutes y
Proteobacteria Tambin con el ms alto de la Abundancia
diversos y
Dorea, Ruminococcus y Parainfluen- Haemophilus
La prdida de la microbiota asociada-Comunidad
correlacionado con el aumento de fragilidad [Claesson etzae,
al. se seal. Por otra parte, los miembros de la
2012]. Este y otros trabajos HA fuertemente implicado gnero Bacteroides Se encontraron a estar presentes en la
Nivel inferior en pacientes con IBS Rambler peditrica en
eso-- la microbiota gastrointestinal es la tasa extremadamente
El control sano y el aumento de Alistipes
significativa
estaba vinculada con la frecuencia mayor del Dolor
la salud y en la progresin de la enfermedad y
[Saulnier et al. 2011]. Otro trabajo por Jeffery y
fragilidad en las personas mayores que [Claesson et al. 2012;
Guigoz et al. 2008]. Sin importar la edad, el desarrollo Entre los subgrupos colegas encontraron pacientes
con IBS con firmas Varying microbianos, sin
rrollo de la comprensin ms clara de lo que constiGeneralmente la siempre aumentar en el Firmicutes tasa
tituye la microbiota saludable permite dibujar
Bacteroidetes relaciones era evidente en pacientes con SII
Qu, nada tejo, es inusual Dentro de la microbiota
Quin se diferenci de poblaciones normales [Jeffery
de personas con diversas enfermedades.
et al. 2012b, 2012c]. Estos estudios sugieren HTS
Eso es vnculo entre la microbiota intestinal y el SII
La microbiota intestinal y la enfermedad
Como el volumen de los datos relativos a la composicintodava existen mails, lo que podra, con el tiempo, conducir al
diseo
y el potencial funcional de la microbiota intestinal
de opciones teraputicas.
aumenta, el nmero de enfermedades que han sido
vinculados con alteraciones en nuestro intestino Microbiana
Commuter
Comunidad tambin ha ampliado. De hecho, los MUCHOS
Tales casos de asociaciones potenciales son demasiadoLa enfermedad inflamatoria intestinal
IBD, que abarca tanto la UC y CD, es caracterizado
Gran resumir en esta revisin y por lo tanto aqu
por la inflamacin crnica y recurrente
la atencin se centra en las asociaciones eso-- han sido racterizado
los
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Asociaciones microbianas *
Referencias $
IBS
Aumento:
Firmicutes: Bacteroidetes relaciones
Ruminococcus
Dorea
Clostridium
Gammaproteobacteria (PIBS)
Haemophilus influenzae (PIBS)
Disminucin:
Bifidobacterium
Faecalibacterium
Bacteroides
Aumento:
El nmero de bacterias en la mucosa (CD)
Gamma-proteobacterias
Enterobacteraceae
adherente invasiva Escherichia coli (CD)
Clostridium spp.
Disminucin:
Diversidad bacteriana
Firmicutes
Bacteroidetes
Lachnospiracheae
Clostridium leptum y coccoides Paneles
(Faecalibacterium prausnitzii)
Roseburia
Phascolarctobacterium
Aumento:
Fusobacterium spp.
E. coli (SCP +)
Aumento:
Firmicutes: Bacteroidetes Ratios
Actinobacteria
Bacteroides
Prevotellaceae
Disminucin:
Diversidad bacteriana
C. leptum Paneles
(Ruminococcus flavefaciens)
Bifidobacterium
Methanobrevibacter
Aumento:
Los patgenos oportunistas
(Clostridium spp., E. coli, Eggerthella lenta)
Muciniphilia Akkermansia
Bacteroides spp.
Disminucin:
Organismos que producen butirato
(Roseburia spp., Faecalibacterium spp.,
Eubacterium spp.)
Firmicutes
IBD (incl.
EC y CU)
CRC
Obesidad
DT2
* Los ejemplos de teres documentados Shanghai Microbiana Enfermedad asociada con Stratus.
$ Consulta opiniones tambin por Cho y Blaser [2012]; Clarke et al. [2012]; Shanahan [2012].
Varying emerge Entre los estudios.
CD, la enfermedad de Crohn; CRC, el cncer colorrectal; IBD, enfermedad inflamatoria del intestino; IBS, sndrome del intestino irritable; PIBS,
IBS peditrica; PKS +, polictido sintasa positivo; DT2, la diabetes tipo 2; UC, colitis ulcerosa.
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del tracto gastrointestinal. UC y CD son generalmente Tanto la UC y CD en Condiciones [Morgan et al.
descrito como EII crnica, aunque la parada separada 2012]. Independientemente de la Poblacin Microbiana XOR
patgeno en cuestin, y Aunque precaucin especfica
Enfermedades que difieren en sus sntomas y Male
Versalidad an no ha sido aclarado, estos y otros
hinchazn patrn. El CD es especficamente
Han Ciertamente los estudios indicados vnculo entre el
crnica, inflamacin segmentaria del tracto gastrointestinal
gut microbiota y la EII.
[Loftus, 2004] Aunque la etiologa y no es
sin embargo, claro, se define como un accidente
cerebrovascular complejo eso-que surge de la interaccin entre el husped
Cncer Colorrectal
Gentica de poblaciones microbianas y el intestino [Elson,
Un papel para el microbioma intestinal en la patognesis
2002]. UC se caracteriza por inflamacin general
de CRC se ha sugerido en el nmero de reciente
cin y ulceracin de la mucosa del colon.
Publicaciones [Arthur et al. 2012; Kostic et al.
El inicio Trminos de Male es, en general, la puntuacin 2012; Plottel y Blaser, 2011]. Aunque la nuez
piensa que es debido a los organismos causantes de nuez
organismos causales no ha sido identificado, el
peros
Haga que varios estudios implicado la asociacin
por la disbiosis general microbiana en el intestino [Lepage
para Fusobacterium miembros con CCR [Castellarin
et al. 2011; Martnez et al. 2008]. Sin embargo,
et al. 2012; Kostic et al. 2012; McCoy et al. 2013].
Haga clic en continuar siendo objeto de mucho debate. AMs especficamente, el reciente estudio utilizando
papel para los microbios del intestino en la manifestacinfluorescente
de
la EII
in situ anlisis de hibridacin indica el enlace
se ha indicado por el nmero de estudios y el
Entre Fusobacteria y CRC, con mayor ro
microbiota intestinal se cree que son nente esencial
fibras identificadas en tumores en comparacin con el control
nentes en el desarrollo de lesiones de la mucosa (por la muestras [Kostic et al. 2012]. Este avistamiento
resea ver Manichanh y colegas) [Manichanh
Con el apoyo de 16s rDNA anlisis de secuenciacin fue
et al. 2012]. Generalmente intestino se inflama
DE LA microbioma colorrectal eso-- revel
cree que est asociada con la bacteriana reducida
Los miembros de la Fusobacterium gnero, incluyendo
La diversidad y, en particular, el menor de la Abundancia,Fusobacterium nucleatum, Fusobacterium talidad
y en la complejidad reducida, el Bacteroidetes y
tiferum y Fusobacterium necrophorum secuencias,
Firmicutes filos con la reduccin especfica de la abundancia
FUERON Heinrich en el tejido tumoral. Estos Shanghai
danza en el Clostridium leptum y Clostridium
Se encontr que eran acompaados por amplia phylumcoccoides grupos [Manichanh et al. 2006; Sokol
cambios de nivel, incluyendo la reduccin significativa en
et al. 2006]. Se ha indicado eso-- Tambin mientras
Firmicutes y Bacteroidetes. Esto sugiere malla eso-Firmicutes Reduccin de tiempo de inactividad no es el Fusobacterium spp. Contribuir a la gnesis tumoral
aumento de Gamble
a travs del mecanismo inflamatorio [Kostic
maproteobacteria en pacientes con CD [Se et al.
et al. 2012]. Crnicamente inflamado es el cimiento
2012]. En contraste con la dysbi- microbiana en general cido factor de riesgo para la carcinognesis [Balkwill y
Teora OSIS, los investigadores han sugerido puntiagudos
Mantovani, 2001] y el tumor XOR-asociado
participacin de taxones especficos, por ejemplo el
Funcin 'suscit-tumor "de la inflamacin puede ser
Enterobacteriaceae Se han asociado con la
CRC [Grivennikov et al. 2010]. En particular, otro
microbiota de los pacientes con CU [Garrett et al.
Studi, que se bas en el uso de la metagenmica
2010] y adherente invasiva E. coli Han sido
secuencia y los datos qPCR, corroborado la asociacin
identificado en la mucosa ileal de pacientes con CD
cin entre este gnero y la CRC, revelando
[Darfeuille-Michaud et al. 2004]. Tener all
La sobreabundancia de Fusobacterium secuencias
sido el nmero de estudios eso-- tambin tienen alta
tumor en el tejido normal, en comparacin con el contrIluminada menor abundancia de F prausnitzii (La.
oles [Castellarin et al. 2012]. Miembros de
Miembro de la C. leptum grupo) en pacientes con
Fusobacterium, Curiosamente, tambin se han ciacin
EC y CU [Frank et al. 2007; Martnez-Medina
ciados con el nmero de otro patlogo intestinal
et al. 2006; Sokol et al. 2009] y el papel de este
Gies incluyendo EII [Strauss et al. 2011] y aguda
microorganismo en la lucha contra disbiosis bacteriana apendicitis [Guinane et al. 2013; Swidsinski
en CD se ha sugerido [Sokol et al. 2008]. En
et al. 2011].
Adems, trabajos recientes Analizando biopsias intestinales
Muestras de heces de pacientes con EII y
Los sujetos sanos y documentado la asociacin
de la situacin sanitaria de la EII con alteraciones en el
abundancias de Enterobacteriaceae, Ruminococcaceae
y Leuconostocaceae, mientras que a nivel de gnero,
Clostridium Aumento de los niveles, mientras que el butirato
El vnculo entre la inflamacin inducida por microbios
Productor Roseburia y productor succinato
Phascolarctobacterium Se redujeron significativamente cin y el CRC tambin se ha destacado en el
nmero de otros estudios. De hecho, ha sido cimiento
cidas eso-- productos microbianos pueden entrar barriertumores colonias defectuosos, Trigger inflamada
a travs de la respuesta inmune del husped y, a su vez,
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CM Guinane y PD Cotter
la salud humana y las enfermedades GI. Por tanto, es pptidos producidos por las bacterias con repeticiones de
lgicamente
amplio
cal eso-- modulacin de la microbiota intestinal caso de eBay
XOR estrecho espectro y la tasa Qu producir
considerarse como una estrategia teraputica para tratarbacteria es inmune [Cotter et al. 2005].
Enfermedades Crnicas. Los enfoques investigados
Las bacteriocinas con el estrecho espectro de actividad
incluir el uso de prebiticos, la suplementacin
Contra el microorganismo diana puede ofrecer la teracon probiticos, reposicin de poblacin bacteriana
putico alternativa a los antibiticos tradicionales. Gutciones por el trasplante fecal o mediante el empleo de Productores de bacteriocinas, tambin provocan la
antimicrobianos para eliminar patgenos XOR manipulacin
ventaja de producir la antimicrobiano in situ,
de listones la microbiota intestinal en la forma en que se y por lo tanto, en estas situaciones, el antimibeneficiarn
pptido bial no se ve afectada por proteolisis Durante
sede de la salud.
trnsito gstrico o no tiene por qu ser encapsulada
lada. Las bacteriocinas se han demostrado para ser til
Los prebiticos y probiticos son cada vez mayor
Controlando el nmero de patgenos en el GI in vivo,
vez ms populares (para una revisin ver Vyas y
incluyendo Listeria monocytogenes [Corr et al. 2007]
Ranganathan) [Vyas y Ranganathan, 2012].
Salmonella spp. [Casey et al. 2004], Campylobacter
Los prebiticos se utilizan para compuestos nutricionalesjejuni
pro [Popa et al. 2006] y C. desafiando [Rea et al.
Mote el crecimiento de comensales beneficiosas y
2011].
por tanto, tienen el potencial para mejorar la salud
gastrointestinal. Uso
de cultivo probitico oral a restaurar la micro intestino
Prometedores resultados condujeron a la biota TIENE EN
EL
Adems
de emplear los antimicrobianos con
TRATAMIENTO
Ver tasas de control de patgenos en el tracto gastrointestinal,
trastornos intestinales como de UC y Obesidad
itis
[Andreasen et al. 2010; BIBILONI et al. 2005;
Tambin hacen que uno se ha sugerido eso-- antimicrobianos
Kadooka et al. 2010]. Si bien se puede argumentar, sin eBay emplea para manipular la microbiota a
nunca, las dosis de probiticos orales eso-- no hacen el tratamiento de otros trastornos gastrointestinales, tales
Proveedor ciente
como la obesidad [Murphy
Nmeros cientes microbiana a influir plenamente la
et al. 2013a, 2013b]. En un caso, Murphy
las poblaciones de los dos puntos, itis malla eBay eso-- Estos
y colegas implorando el concepto de focalizacin
Su microbiana ejercer influencia a travs de complejos la microbiota intestinal, los ratones obesos inducida por la
significa, por ejemplo, la produccin del antimicrobiano dieta
XOR el modulador del sistema inmune. Fecales
a travs de diferentes estrategias excesivamente
Trasplante Microbiana (FMT) se est convirtiendo en el antimicrobianos con
ms comnmente utilizado Aproximacin a la reposicin Los
de latipos de vista, a su vez, evaluar el impacto en la
GI microbiota (para revisiones ver Borody y Khoruts,
obesidady rubor) [Borody y Khoruts, 2011; Flushing,
Anormalidades metablicas asociadas [Murphy et al.
2012]. El objetivo de la FMT es reintroducir la constante 2013a]. Las dos cirugas empleada que trabaja
comunidad microbiana de la IG de la tasa de donantes sanos
La administracin oral del antibitico vancomicina
reposicionamiento de las poblaciones alteradas en los y la produccin de la bacteriocina-probitico Abp 118
enfermos
Lactobacillus salivarius UCC 118, respectivamente.
Individual. En particular, se ha utilizado en el FMT
Ambas estrategias Altered poblaciones en el reflujo intestinal
tratamiento de la recurrente Clostridium desafiando infeccin
maneras tinct. Por ejemplo, la vancomicina administrativa
Cuando ha fracasado el tratamiento estndar. FMT TIENE
cin se tradujo en el aumento dramtico en Proteobacteria
ha encontrado para tener xito en C. desafiando tratamiento
niveles acompaados con la disminucin en el
Ma, con remisin de la enfermedad hasta en visitar
Firmicutes y Bacteroidetes filos, peros slo vanco92% de los casos [Gough et al. 2011].
micina result en la mejora de la meta
bolic anomalas asociadas con la obesidad. Estos
La Relacin Entre El resultado puso de relieve adems
Adems de ser un opciones teraputicas viables,
gut microbiota y la salud, e indicar el tencial
Haga que los antibiticos pueden efectos potencialmenteBeneficios de utilizar DEBIDO gut microbiota-manipulacin
perjudiciales
Estrategias para mejorar la Salud [Murphy et al. 2013a,
A travs de los trastornos de la microbiota intestinal. En 2013b].
particulares, antibiticos de amplio espectro pueden infligir
'daos colaterales' significativa, como ha sido
Observaciones
finales
Recientemente revelado por las tecnologas de HTS (para
la
Nuestra flora intestinal evoluciona con nosotros y juega la
resea ver Cotter y colegas) [Cotter et al.
2012]. Como consecuencia, el nmero de investigacin papel fundamental en la salud humana y la enfermedad.
Ahora
Han centrado en las dems antimicrobianos Rambler
eso-- conocen la microbiota residente influencia de acogida
Antimicrobiana clsica. Por tanto, es particularmente notable
metabolismo, el sistema inmune y Fisiologa
Que la capacidad para producir bacteriocinas es la del viajero
desarrollo, mientras que las perturbaciones de la Microbiana
rasgo comn entre los microbios del intestino. Las
comunidad puede resultar en la enfermedad gastrointestinal
bacteriocinas
Apagar pequeo antimicrobiano ribosomally sintetizado crnica.
Mientras que la revolucin de las tecnologas moleculares
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Financiacin
Los patrones globales de 16s rRNA diversidad en la profundidad de
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