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La qumica orgnica o qumica del carbono es la rama de la qumica que estudia una clase
numerosa de molculas que contienen carbonoformando enlaces covalentes carbonocarbono o carbono-hidrgeno y otros heterotomos, tambin conocidos como compuestos
orgnicos.Friedrich Whler es conocido como el padre de la qumica orgnica.
Historia[editar]
Friedrich Whler.Su trabajo sobre la sntesis de la urea es considerado por muchos como el inicio de la
qumica orgnica, y en particular de la sntesis orgnica.
La qumica orgnica se constituy como disciplina en los aos treinta. El desarrollo de nuevos
mtodos de anlisis de las sustancias de origen animal y vegetal, basados en el empleo de
disolventes como el ter o el alcohol, permiti el aislamiento de un gran nmero de sustancias
orgnicas que recibieron el nombre de "principios inmediatos". La aparicin de la qumica
Cronologa[editar]
Artculo principal: Cronologa de la Qumica orgnica
1784: Antoine Lavoisier demuestra que todos los productos vegetales y animales estn
formados bsicamente por carbono e hidrgenoy, en menor
proporcin, nitrgeno, oxgeno y azufre
1816: Michel Eugne Chevreul prepara distintos jabones a partir de diferentes fuentes
de cidos grasos y diversas bases, produciendo as distintas sales de cidos grasos
(ojabones), que no resultaron ser ms que productos orgnicos nuevos derivados de
productos naturales (grasas animales y vegetales).
1828: Friedrich Whler sintetiza a partir de sustancias inorgnicas y con tcnicas normales
de laboratorio, cre la sustancia Urea, la segunda sustancia orgnica obtenida
artificialmente, luego del oxalato de amonio.
Primeros compendios[editar]
La tarea de presentar la qumica orgnica de manera sistemtica y global se realiz mediante
una publicacin surgida en Alemania, fundada por el qumico Friedrich KonradBeilstein (18381906). Su Handbuch der organischen Chemie (Manual de la qumica orgnica) comenz a
publicarse en Hamburgo en 1880 y consisti en dos volmenes que recogan informacin de
unos quince mil compuestos orgnicos conocidos. Cuando la Deutsche chemische
Gesellschaft (Sociedad Alemana de Qumica) trat de elaborar la cuarta re-edicin, en la
segunda dcada del siglo XX, la cifra de compuestos orgnicos se haba multiplicado por diez.
Treinta y siete volmenes fueron necesarios para la edicin bsica, que aparecieron entre
1916 y 1937. Un suplemento de 27 volmenes se public en 1938, recogiendo informacin
aparecida entre 1910 y 1919. En la actualidad, se est editando el Fnftes
Ergnzungswerk (quinta serie complementaria), que recoge la documentacin publicada entre
1960 y 1979. Para ofrecer con ms prontitud sus ltimos trabajos, el Beilstein Institut ha
creado el servicio Beilstein On line, que funciona desde 1988. Recientemente, se ha
comenzado a editar peridicamente un CD-ROM, Beilstein Current Facts in Chemistry, que
selecciona la informacin qumica procedente de importantes revistas. Actualmente, la citada
informacin est disponible a travs de internet.
Natural[editar]
In-vivo[editar]
Los compuestos orgnicos presentes en los seres vivos o "biosintetizados" constituyen una
gran familia de compuestos orgnicos. Su estudio tiene inters en medicina, farmacia,
perfumera, cocina y muchos otros campos ms.
Carbohidratos[editar]
Los carbohidratos estn compuestos fundamentalmente de carbono (C), oxgeno (O) e
hidrgeno (H). Son a menudo llamados "azcares" pero esta nomenclatura no es del todo
correcta. Tienen una gran presencia en el reino vegetal
(fructosa, celulosa, almidn, alginatos), pero tambin en el animal (glucgeno, glucosa). Se
suelen clasificar segn su grado de polimerizacin en:
Lpidos[editar]
Los lpidos son un conjunto de molculas orgnicas, la mayora biomolculas, compuestas
principalmente por carbono e hidrgeno y en menor medida oxgeno, aunque tambin pueden
contener fsforo, azufre y nitrgeno. Tienen como caracterstica principal el
ser hidrfobas (insolubles en agua) y solubles en disolventes orgnicos como la bencina,
elbenceno y el cloroformo. En el uso coloquial, a los lpidos se les llama
incorrectamente grasas, ya que las grasas son slo un tipo de lpidos procedentes
de animales. Los lpidos cumplen funciones diversas en los organismos vivientes, entre ellas
la de reserva energtica (como los triglicridos), la estructural (como los fosfolpidos de
las bicapas) y la reguladora (como las hormonas esteroides). (ver artculo "lpido")
Protenas[editar]
Las protenas son polipptidos, es decir estn formados por la polimerizacin de pptidos, y
estos por la unin de aminocidos. Pueden considerarse as "poliamidas naturales" ya que
el enlace peptdico es anlogo al enlace amida. Comprenden una familia muy importante de
molculas en los seres vivos pero en especial en el reino animal. Ejemplos de protenas son
el colgeno, las fibronas, o la seda de araa.
cidos nucleicos[editar]
Los cidos nucleicos son polmeros formados por la repeticin
de monmeros denominados nucletidos, unidos mediante enlaces fosfodister. Se forman,
as, largas cadenas; algunas molculas de cidos nucleicos llegan a alcanzar pesos
moleculares gigantescos, con millones de nucletidos encadenados. Estn formados por la
molculas de carbono,hidrgeno, oxgeno, nitrgeno y fosfato.Los cidos nucleicos almacenan
la informacin gentica de los organismos vivos y son los responsables de la transmisin
hereditaria. Existen dos tipos bsicos, el ADN y el ARN. (ver artculo "cidos nucleicos")
Molculas pequeas[editar]
Estructura de la testosterona. Una hormona, que se puede clasificar como "molcula pequea" en el argotqumico-orgnico.
que aparecen en pequeas cantidades en los seres vivos pero no por ello su importancia es
menor. A ellas pertenecen distintos grupos de hormonas como la testosterona, el estrgeno u
otros grupos como los alcaloides. Las molculas pequeas tienen gran inters en la industria
farmacutica por su relevancia en el campo de la medicina.
Ex-vivo[editar]
Son compuestos orgnicos que han sido sintetizados sin la intervencin de ningn ser vivo, en
ambientes extracelulares y extravirales.
Procesos geolgicos[editar]
Sello alemn de 1964 conmemorativo del la descripcin de la estructura del benceno por Friedrich August
Kekul en 1865.
El petrleo es una sustancia clasificada como mineral en la cual se presentan una gran
cantidad de compuestos orgnicos. Muchos de ellos, como el benceno, son empleados por el
hombre tal cual, pero muchos otros son tratados o derivados para conseguir una gran cantidad
de compuestos orgnicos, como por ejemplo los monmeros para la sntesis de materiales
polimricos o plsticos.
Procesos atmosfricos[editar]
Procesos de sntesis planetaria[editar]
En el ao 2000 el cido frmico, un compuesto orgnico sencillo, tambin fue hallado en la
cola del cometa Hale-Bopp.2 ,3 Puesto que la sntesis orgnica de estas molculas es inviable
bajo las condiciones espaciales este hallazgo parece sugerir que a la formacin del sistema
solar debi anteceder un periodo de calentamiento durante su colapso final.3
Sinttico[editar]
Desde la sntesis de Whler de la urea un altsimo nmero de compuestos orgnicos han sido
sintetizados qumicamente para beneficio humano. Estos incluyen frmacos, desodorantes,
Hidrocarburos[editar]
El compuesto ms simple es el metano, un tomo de carbono con cuatro de hidrgeno
(valencia = 1), pero tambin puede darse la unin carbono-carbono, formando cadenas de
distintos tipos, ya que pueden darse enlaces simples, dobles o triples. Cuando el resto de
enlaces de estas cadenas son con hidrgeno, se habla de hidrocarburos, que pueden ser:
Los radicales son fragmentos de cadenas de carbonos que cuelgan de la cadena principal. Su
nomenclatura se hace con la raz correspondiente (en el caso de un carbono met-, dos
carbonos et-, tres carbonos prop-, cuatro carbonos but-, cinco carbonos pent-, seis carbonos
hex-, y as sucesivamente...) y el sufijo -il. Adems, se indica con un nmero, colocado
delante, la posicin que ocupan. El compuesto ms simple que se puede hacer con radicales
es el 2-metilpropano. En caso de que haya ms de un radical, se nombrarn por orden
alfabtico de las races. Por ejemplo, el 2-etil, 5-metil, 8-butil, 10-docoseno.
Alquino
Hidroxilo
ter
Amina
Aldehido
Cetona
Carboxilo
ster
Amida
Azo
Nitro
Sulfxido
Monmero de lacelulosa.
Oxigenados[editar]
Son cadenas de carbonos con uno o varios tomos de oxgeno. Pueden ser:
Aldehdos: Los aldehdos son compuestos orgnicos caracterizados por poseer el grupo
funcional -CHO. Se denominan como los alcoholes correspondientes, cambiando la
terminacin -ol por -al:
2-Butanona o metil-etil-cetona
los radicales a los cuales est unido (por ejemplo: metilfenil cetona). Cuando el grupo
carbonilo no es el grupo prioritario, se utiliza el prefijo oxo- (ejemplo: 2-oxopropanal).
El grupo funcional carbonilo consiste en un tomo de carbono unido con un doble enlace
covalente a un tomo de oxgeno. El tener dos tomos de carbono unidos al grupo carbonilo,
es lo que lo diferencia de los cidos carboxlicos, aldehdos, steres. El doble enlace con el
oxgeno, es lo que lo diferencia de los alcoholes y teres. Las cetonas suelen ser menos
reactivas que los aldehdos dado que los grupos alqulicos actan como dadores de electrones
por efecto inductivo.
teres: Los teres presentan el grupo ter(-O-) en su estructura. Suelen tener bajo punto
de ebullicin y son fcilmente descomponibles. Por ambos motivos, los teres de baja
masa molecular suelen ser peligrosos ya que sus vapores pueden ser explosivos.
Nitrogenados[editar]
Aminas: Las aminas son compuestos orgnicos caracterizados por la presencia del grupo
amina (-N<). Las aminas pueden ser primarias (R-NH2), secundarias (R-NH-R") o
terciarias (R-NR-R"). Las aminas suelen dar compuestos ligeramente amarillentos y con
olores que recuerdan a pescado u orina.
Amidas: Las amidas son compuestos orgnicos caracterizados por la presencia del grupo
amida (-NH-CO-) en su estructura. Las protenas o polipptidos son poliamidasnaturales
formadas por enlaces peptdicos entre distintos aminocidos.
Isocianatos: Los isocianatos tienen el grupo isocianato (-N=C=O). Este grupo es muy
electrfilo, reaccionando fcilmente con el agua para descomponerse mediante
latransposicin de Hofmann dar una amina y anhdrico carbnico, con los hidroxilos para
dar uretanos, y con las aminas primarias o secundarias para dar ureas.
Cclicos[editar]
Son compuestos que contienen un ciclo saturado. Un ejemplo de estos son los norbornanos,
que en realidad son compuestos bicclicos, los terpenos, u hormonas como
elestrgeno, progesterona, testosterona u otras biomolculas como el colesterol.
Aromticos[editar]
El Furano (C4H4O) es un ejemplo de compuesto aromtico. Estructura tridimensional del Furano mostrando la
nube electrnica de electrones .
Ismeros[editar]
Ya que el carbono puede enlazarse de diferentes maneras, una cadena puede tener diferentes
configuraciones de enlace dando lugar a los llamados ismeros, molculas tienen la misma
frmula qumica pero distintas estructuras y propiedades.
Bioqumica
La bioqumica es una ciencia que estudia la composicin qumica de los seres vivos,
especialmente las protenas, carbohidratos, lpidos ycidos nucleicos, adems de otras
pequeas molculas presentes en las clulas y las reacciones qumicas que sufren estos
compuestos (metabolismo) que les permiten obtener energa (catabolismo) y generar
biomolculas propias (anabolismo). La bioqumica se basa en el concepto de que todo ser vivo
contiene carbono y en general las molculas biolgicas estn compuestas principalmente de
carbono,hidrgeno, oxgeno, nitrgeno, fsforo y azufre.
Es la ciencia que estudia la base qumica de las molculas que componen las clulas y
los tejidos, que catalizan las reacciones qumicasdel metabolismo celular como la digestin,
la fotosntesis y la inmunidad, entre otras muchas cosas.
Podemos entender la bioqumica como una disciplina cientfica integradora que aborda el
estudio de las biomolculas y biosistemas. Integra de esta forma las leyes qumico-fsicas y la
evolucin biolgica que afectan a los biosistemas y a sus componentes. Lo hace desde un
punto de vista molecular y trata de entender y aplicar su conocimiento a amplios sectores de
la Medicina (terapia gentica yBiomedicina), la agroalimentacin, la farmacologa.
Constituye un pilar fundamental de la biotecnologa, y se ha consolidado como una disciplina
esencial para abordar los grandes problemas y enfermedades actuales y del futuro, tales
como el cambio climtico, la escasez de recursos agroalimentarios ante el aumento de
poblacin mundial, el agotamiento de las reservas de combustibles fsiles, la aparicin de
1 Historia
2 Ramas de la bioqumica
6 Vase tambin
7 Referencias
8 Enlaces externos
Historia[editar]
La historia de la bioqumica moderna como la conocemos hoy en da es prcticamente
moderna; desde el siglo XIX se comenz a direccionar una buena parte de la biologa y
laqumica a la creacin de una nueva disciplina integradora: la qumica fisiolgica o la
bioqumica. Pero la aplicacin de la bioqumica y su conocimiento, probablemente comenz
hace 5000 aos con la produccin de pan usando levaduras en un proceso conocido
como fermentacin.
Es difcil abordar la historia de la bioqumica, en cuanto que, es una mezcla compleja de
qumica orgnica y biologa, y en ocasiones, se hace complicado discernir entre lo
exclusivamente biolgico y lo exclusivamente qumico orgnico y es evidente que la
contribucin a esta disciplina ha sido muy extensa. Aunque es cierto que existen datos
experimentales que son bsicos en la bioqumica.
Se suele situar el inicio de la bioqumica en los descubrimientos en 1828 de Friedrich
Whler que public un artculo acerca de la sntesis de urea, probando que los compuestos
orgnicos pueden ser creados artificialmente, en contraste con la creencia, comnmente
aceptada durante mucho tiempo, de que la generacin de estos compuestos era posible slo
en el interior de los seres vivos.
En 1833, Anselme Payen asla la primera enzima, la diastasa, aunque se desconoce en su
alimentacin.
A mediados del siglo XIX, Louis Pasteur, demostr los fenmenos de isomera qumica
existente entre las molculas de cido tartrico provenientes de los seres vivos y las
sintetizadas qumicamente en el laboratorio. Tambin estudi el fenmeno de la fermentacin
y descubri que intervenan ciertas levaduras, y por tanto no era exclusivamente un fenmeno
qumico como se haba defendido hasta ahora (entre ellos el propio Liebig); as Pasteur
escribi: la fermentacin del alcohol es un acto relacionado con la vida y la organizacin de
las clulas de las levaduras, y no con la muerte y la putrefaccin de las clulas. Adems
desarroll un mtodo de esterilizacin de la leche, el vino y la cerveza (pasteurizacin) y
contribuy enormemente a refutar la idea de la generacin espontnea de los seres vivos.
En 1869 se descubre la nuclena y se observa que es una sustancia muy rica en fsforo. Dos
aos ms tarde, Albrecht Kossel concluye que la nuclena es rica en protenas y contiene las
bases pricas adenina y guanina y las pirimidnicas citosina y timina. En 1889 se aslan los
dos componentes mayoritarios de la nuclena:
Protenas (70 %)
En 1878 el fisilogo Wilhelm Khne acu el trmino enzima para referirse a los componentes
biolgicos desconocidos que producan la fermentacin. La palabra enzima fue usada
despus para referirse a sustancias inertes tales como la pepsina.
En 1897 Eduard Buchner comenz a estudiar la capacidad de los extractos de levadura para
fermentar azcar a pesar de la ausencia de clulas vivientes de levadura. En una serie de
experimentos en la Universidad Humboldt de Berln, encontr que el azcar era fermentado
inclusive cuando no haba elementos vivos en los cultivos de clulas de levaduras. Llam a la
enzima que causa la fermentacin de la sacarosa, zimasa. Al demostrar que las enzimas
podran funcionar fuera de una clula viva, el siguiente paso fue demostrar cul era la
naturaleza bioqumica de esos biocatalizadores. El debate fue extenso, muchos como el
bioqumico alemn Richard Willsttter discrepaban de que la protena fuera el catalizador
enzimtico, hasta que en 1926, James B. Sumner demostr que la enzima ureasa era una
protena pura y la cristaliz. La conclusin de que las protenas puras podan ser enzimas fue
definitivamente probada en torno a 1930 por John Howard Northrop y Wendell Meredith
Stanley, quienes trabajaron con diversas enzimas digestivas como la pepsina, la tripsina y la
quimotripsina.
En 1903 Mijal Tswett inicia los estudios de cromatografa para separacin de pigmentos.
En torno a 1915 Gustav Embden y Otto Meyerhof realizan sus estudios sobre la gluclisis.
En 1920 se descubre que en las clulas hay ADN y ARN y que difieren en el azcar que forma
parte de su composicin: desoxirribosa o ribosa. El ADN reside en el ncleo. Unos aos ms
tarde, se descubre que en los espermatozoides hay fundamentalmente ADN y protenas, y
posteriormente Feulgen descubre que hay ADN en los cromosomas con su tincin especfica
para este compuesto.
En 1925 Theodor Svedberg demuestra que las protenas son macromolculas y desarrolla la
tcnica de ultracentrifugacin analtica.
En 1928, Alexander Fleming descubre la penicilina y desarrolla estudios sobre la lisozima.
Richard Willsttter (en torno 1910) estudia la clorofila y comprueba la similitud que hay con
la hemoglobina. Posteriormente Hans Fischer en torno a 1930, investiga la qumica de
las porfirinas de las que derivan la clorofila o el grupo porfirnico de la hemoglobina. Consigui
sintetizar hemina y bilirrubina. Paralelamente Heinrich Otto Wieland formula teoras sobre las
deshidrogenaciones y explica la constitucin de muchas otras sustancias de naturaleza
compleja, como la pteridina, las hormonas sexuales o los cidos biliares.
En la dcada de 1940, Melvin Calvin concluye el estudio del ciclo de Calvin en
la fotosntesis y Albert Claude la sntesis del ATP en las mitocondrias.
En torno a 1945 Gerty Cori, Carl Cori, y Bernardo Houssay completan sus estudios sobre
el ciclo de Cori.
En 1953 James Dewey Watson y Francis Crick, gracias a los estudios previos
con cristalografa de rayos X de ADN de Rosalind Franklin y Maurice Wilkins, y los estudios
de Erwin Chargaff sobre apareamiento de bases nitrogenadas, deducen la estructura de doble
hlice del ADN. En 1957, Matthew Meselson y Franklin Stahl demuestran que la replicacin
del ADN es semiconservativa.
En la segunda mitad del siglo XX, comienza la autntica revolucin de la bioqumica y la
biologa molecular moderna, especialmente gracias al desarrollo de las tcnicas
experimentales ms bsicas como la cromatografa, la centrifugacin, la electroforesis, las
tcnicas radioisotpicas y la microscopa electrnica, y las tcnicas ms complejas como
la cristalografa de rayos X, la resonancia magntica nuclear, la PCR (Kary Mullis), el
desarrollo de la inmuno-tcnicas.
Desde 1950 a 1975 , se conocen en profundidad y detalle aspectos del metabolismo celular
inimaginables hasta ahora (fosforilacin oxidativa (Peter Dennis Mitchell), ciclo de la
urea y ciclo de Krebs (Hans Adolf Krebs), as como otras rutas metablicas), se produce toda
una revolucin en el estudio de los genes y su expresin; se descifra el cdigo
gentico (Francis Crick, Severo Ochoa, Har Gobind Khorana, Robert W. Holley y Marshall
Warren Nirenberg), se descubren las enzimas de restriccin (finales de 1960, Werner
Arber, Daniel Nathans y Hamilton Smith), la ADN ligasa (en 1972, Mertz y Davis) y finalmente
en 1973 Stanley Cohen y Herbert Boyer producen el primer ser vivo recombinante, naciendo
as la ingeniera gentica, convertida en una herramienta poderossima con la que se supera
la frontera entre especies y con la que podemos obtener un beneficio hasta ahora impensable.
De 1975 hasta principios del siglo XXI, comienza a secuenciarse el ADN (Allan Maxam, Walter
Gilbert y Frederick Sanger), comienzan a crearse las primeras industrias
biotecnolgicas (Genentech), se aumenta la creacin de frmacos y vacunas ms eficaces, se
eleva el inters por las inmunologa y las clulas madres y se descubre la
enzimatelomerasa (Elizabeth Blackburn y Carol Greider). En 1989 se utiliza
la biorremediacin a gran escala en el derrame del petrolero Exxon Valdez en Alaska.
Se clonan los primeros seres vivos, se secuencia el ADN de decenas de especies y se publica
el genoma completo del hombre (Craig Venter, Celera Genomics y Proyecto Genoma
Humano), se resuelven decenas de miles de estructuras proteicas y se publican en PDB, as
como genes, en GenBank. Comienza el desarrollo de la bioinformtica y la computacin de
sistemas complejos, que se constituyen como herramientas muy poderosas en el estudio de
los sistemas biolgicos. Se crea el primer cromosoma artificial y se logra la primera bacteria
con genoma sinttico (2007, 2009, Craig Venter). Se fabrican las nucleasas con dedos de
zinc. Se inducen artificialmente clulas, que inicialmente no eran pluripotenciales, a clulas
madre pluripotenciales (Shin'ya Yamanaka). Comienzan a darse los primeros pasos.
Ramas de la bioqumica[editar]
los elementos esenciales del centro activo y de aquellos que no participan, as como los
efectos catalticos que ocurren en la modificacin de dichos elementos; en este sentido,
utilizan frecuentemente tcnicas como la mutagnesis dirigida.
Inmunologa: rea de la biologa, la cual se interesa por la reaccin del organismo frente
a otros organismos como las bacterias y virus. Todo esto tomando en cuenta la reaccin y
funcionamiento del sistema inmune de los seres vivos. Es esencial en esta rea el
desarrollo de los estudios de produccin y comportamiento de los anticuerpos.
Biologa Molecular: es la disciplina cientfica que tiene como objetivo el estudio de los
procesos que se desarrollan en los seres vivos desde un punto de vista molecular. As
como la bioqumica clsica investiga detalladamente los ciclos metablicos y la integracin
y desintegracin de las molculas que componen los seres vivos, la Biologa molecular
pretende fijarse con preferencia en el comportamiento biolgico de las macromolculas
(ADN, ARN, enzimas, hormonas, etc.) dentro de la clula y explicar las funciones
biolgicas del ser vivo por estas propiedades a nivel molecular.
Centrifugacin
Cromatografa
Electroforesis
Tcnicas radioisotpicas
Citometra de flujo
Inmunoprecipitacin
ELISA
Microscopio electrnico
Cristalografa de rayos X
Espectrometra de masas
Fluorimetra
Severo Ochoa
Eladio Viuela
Margarita Salas
Mariano Barbacid