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Estacin 8:

De los datos al conocimiento


Palabras claves:
Simulacin, Modelamiento, Datos, Procesamiento

Tabla de contenidos

Estacin 8: De los datos al conocimiento

Pontificia Universidad Catlica del Per

Introduccin
1.
Almacenamiento de la marea de datos
2.
Una nebulosa planetaria en la computadora
3.
Dando forma a las teoras sobre metales
4.
Pulso lser para movilizar gas
5.
Estirar una protena
6.
Dinmica de flujo en la cabeza
7.
Herpes en la computadora
Informacin adicional
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Preguntas motivadoras

simular en las computadoras?


Cmo surge la complejidad?
Hay lmites para la percepcin de nuestro
mundo?
El cmputo por demanda, a la vuelta de la
esquina?
Podemos predecir el comportamiento de los
sistemas complejos?
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Qu porcin de nuestro mundo podemos

Introduccin
Introduccin

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En la investigacin, las preguntas


"cmo" y "por qu" se estn
volviendo cada vez ms
complejas. La brecha entre la
descripcin terica de la
naturaleza y las preguntas
actuales en el mbito de la
experimentacin contina
creciendo. Mediante el
modelamiento y la simulacin, las
computadoras ayudan a cerrar
esta brecha.
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Los modelos sirven como


la
base
que
refleja
aspectos de la realidad.
Son el cimiento de las
simulaciones con las que
los
cientficos
imitan
cambios especficos de
parmetros
individuales.
Las imgenes visuales
juegan un papel importante
en ambos casos, haciendo
que los resultados sean
ms comprensibles.

Actualmente
Los cientficos pueden describir el comportamiento de los
tomos y molculas en computadoras y calcular no solo las
reacciones qumicas bsicas, sino que, ajustando la escala,
tambin las propiedades macroscpicas de los slidos
mediante la integracin de la mecnica cuntica a los
modelos de cmputo.
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En el futuro
Se podr examinar el comportamiento de cadenas completas
de seales de las clulas y bioprocesos complejos. No
obstante, se requerir procesar y analizar grandes volmenes
de datos.
La minera de datos y la biologa computacional seguirn
cobrando creciente importancia.
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La investigacin moderna
enfrenta el reto de
manejar cantidades de
datos que aumentan
rpidamente. En las
ciencias de la vida, el
anlisis automatizado de
arreglos genticos ya
produce anualmente
datos en el orden de los
pentabytes (1015 bytes).
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1. Almacenamiento de la marea de
datos

El mayor acelerador del mundo, el Gran Colisionador de


Hadrones, generar 1018 bytes al ao, es decir un
quintrilln de bytes o un exabyte de datos. Se registrar
varios miles de millones de interacciones de las partculas
elementales cada segundo.

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Si hubiese que almacenar los datos de dichas


mediciones en CD-ROM durante un ao, se necesitara
ms de 15 millones de CD. En comparacin, la mayor
biblioteca del mundo, la Biblioteca de Congreso de
los Estados Unidos, cuenta actualmente con textos en
el rango de 20 terabytes (1012 bytes).

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2. Una nebulosa planetaria en la


computadora

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La creacin de una estructura


tridimensional de una nebulosa
planetaria remota es un asunto
difcil porque solo podemos ver la
galaxia desde un ngulo en la
Tierra.

Sin embargo, en el caso de ciertas galaxias, las


computadoras pueden aproximar sus formas
tridimensionales a partir de fotografas
bidimensionales.

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Cuando se moldea una plancha


de aluminio para darle la forma
de una taza, el resultado tiene el
aspecto parecido al de un
cenicero.
Sin embargo, simulaciones
simples en computadora
muestran que los bordes estn
pulidos. La razn de esta
discrepancia es que el metal
est compuesto por varias
estructuras cristalinas que
responden diferenciadamente al
molde.
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3. Dando forma a las teoras sobre


metales

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Para reflejar este


hecho, los cientficos
del Instituto Max Planck
de Investigacin sobre
el Hierro han
desarrollado una
tcnica estadstica que
refleja la estructura
cristalina en los
clculos.

As, es posible generar simulaciones realistas que


requieren relativamente pocos datos.
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En este experimento se
dirige un impulso intenso
de lser de solo cinco
femtosegundos
de duracin hacia un gas
de helio o hidrgeno,
eliminando los electrones
de los tomos del gas y
creando un plasma que
se acelera.
Un femtosegundo es la milbillonsima parte de un segundo.
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4. Pulso lser para movilizar gas

El aspecto prctico de este acelerador es que se


puede colocar encima de un banco normal de
laboratorio.

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El experimento se simul antes de realizar la


aceleracin para comprobar la teora.
Los cientficos determinaron que la compleja
interaccin entre fotones, electrones e iones
result exactamente igual que en la
simulacin.

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5. Estirar una protena


Las protenas

Ya que su forma
determina su
funcionalidad, los
cientficos se interesan
en las propiedades
mecnicas de las
protenas.
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Constantemente se doblan
y se aplastan en las
clulas.

Para encontrar esta informacin, recurren a la


espectroscopa de fuerza que les permite
medir y simular su energa en la
computadora.

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Con las imgenes resultantes, los cientficos


pueden reconocer:
Los estados estables de las protenas
(valles de energa) que determinan la
medida en que las protenas espiraladas
de cierto largo se autoenroscan.
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Cuando se abre un crneo para realizar un


procedimiento quirrgico, el cerebro se desplaza y, por
tanto, vara tambin el tiempo necesario para la ciruga
puesto que las imgenes de resonancia magntica
obtenidas antes del procedimiento quirrgico ya no son
vlidas.
Gracias a un tomgrafo especial, ahora los cirujanos
pueden producir nuevas imgenes durante el
procedimiento quirrgico tal que coinciden con la nueva
posicin del cerebro. Para dichas simulaciones de flujo
se requiere computadoras rpidas.
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6. Dinmica de flujo en la cabeza

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Dinmica del flujo del cerebro


durante una operacin

Los cientficos del


Instituto Max
Planck de
Cognicin y
Neurociencias no
simulan el
desplazamiento de
la posicin del
cerebro en la sala
de operaciones
sino que utilizan
una red de
computadoras de
alta capacidad.
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7. El herpes en la computadora

Sin
embargo,
estn
conformados por estructuras complejas anidadas unas
dentro de otras. Estas capas fueron visibilizadas por
primera vez en el Instituto Max Planck de Bioqumica y el
Instituto Nacional de Salud.
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El espesor de los virus es


inferior a una milsima del
dimetro de un cabello
humano.

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Se crearon modelos digitales


mediante la manipulacin hbil
de imgenes de tomografa de
electrones escaneando el virus
a temperaturas
extremadamente bajas.

Ahora, los cientficos pueden


comprender mejor la
interaccin entre los virus y
los componentes de las
clulas.
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Los analistas genticos y los bilogos de


sistemas cooperan con los estadgrafos y
cientficos de cmputo, as como con los
astrofsicos para analizar datos astronmicos y
fsicos, esta etapa del desarrollo cientfico
requiere indudablemente de la estrecha
colaboracin interdisciplinaria.

Las investigaciones continan..


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Interdisciplinariedad en la ciencia