CAPITULO VI

METABOLISMO DE COMPUESTOS NITROGENADOS

6.1. DIGESTIN DE PROTENAS Y PPTIDOS

En los hbitats naturales, la protelisis es un proceso importante que produce

aminocidos utilizables como fuente de energa o como subunidades para la
biosntesis.
Muchos gneros de distintos grupos de bacterias son capaces de producir enzimas
proteolticos, generalmente exoenzimas, que difunden al medio exterior. Esta es la
causa que frecuentemente se encuentren altas concentraciones de aminocidos en los
medios en que se desarrollan bacterias.
Las proteasas naturales son ms activas frente a las protenas desnaturalizadas que
frente a las nativas. Muchas proteasas bacterianas han sido cristalizadas. En medio
extracelular tambin se encuentran peptidasas que hidrolizan los fragmentos
oligopeptidos resultantes de la accin de las proteasas. Tambin se ha purificado una
serie de peptidasas bacterianas.
Es caracterstica la actividad proteoltica de los bacilos grampositivos esporgenos, de
algunos estreptococos y micrococos y de los miembros del genero Proteus.
De Bacillus subtilis se ha obtenido cristalizada una proteasa alcalina llamada subtilisina
que ha sido bien caracterizada. De la misma especie se ha aislado otra proteasa que
acta a pH neutro y que contiene zinc. La subtilisina ataca indistintamente los enlaces
peptidicos internos y terminales y, por lo tanto, libera a su vez aminocidos y pptidos.
Al parecer, la clasificacin de varias proteasas bacterianas en endopeptidasas y
exopeptidasas no resulta adecuada.
Las peptidasas pueden localizarse tanto intracelular como extracelularmente. En
lactobacillus casei y E. coli se encuentran peptidasas intracelulares que aparentemente
hidrolizan pequeos pptidos tomados del medio exterior.

235

El transporte activo de pptidos y aminocidos al interior de la clula bacteriana ha sido

conclusivamente demostrado y tiene parecidos con el transporte de azucares. Hay un
grado notable de especialidad.
El esquema general del metabolismo nitrogenado microbiano es el siguiente:
1. Las proteinasas y peptidasas hidrolizan las protenas a pptidos y aminocidos
libres.
2. Los aminocidos se utilizan directamente para la sntesis de protenas y otros
constituyentes celulares microbianos, tales como los constituyentes de la pared
celular y cidos nucleicos.
3. Los aminocidos son tambin catabolizados a AGV y otros cidos, CO2 y
amonaco.
4. La urea es hidrolizada a amonaco por la potente actividad uresica.
5. Los compuestos tales como los nitratos son reducidos a amonaco.
6. El amonaco se utiliza en la sntesis de los componentes celulares microbianos
como las protenas y otros.
La capacidad de degradar anaerobiamente protenas, peptonas, polipptidos y
aminocidos no est distribuida uniformemente por todos los grupos de bacterias. Las
que tienen esta propiedad se llaman bacterias putrefactivas porque a menudo generan
sustancias de olor desagradable.
Una bacteria putrefactiva es la que puede llevar a cabo una degradacin catablica de
un compuesto nitrogenado en condiciones anaerbicas. Ocasionalmente, este mismo
compuesto puede suministrar el carbono y el nitrgeno necesarios para el desarrollo.
Las bacterias putrefactivas son sobre todo especies del gnero Clostridium, como C.
botulinum, C. perfringens, C. sporongenes, C. tetani y C. tetanomorphum. Adems de
ste gnero encontramos otras especies putrefactivas pertenecientes a grupos
taxonmicos distintos, como la de los gneros Fusobacterium, Streptococcus,
Micrococcus y Proteus.

236

Las bacterias putrefactivas son alcalfilas y a su vez tienden a alcalinizar sus medios
de cultivo. Esto ltimo es debido a que o bien se liberan amoniaco con formacin de
cidos dbiles, o bien se liberan bases orgnicas. En este sentido existe una cierta
contraposicin con la fermentacin propiamente dicha que es un proceso acidificante.
Es conocido el hecho de que los organismos fermentadores y los putrefactivos son
antagnicos y que, una vez que se ha desarrollado uno de ellos en un medio,
difcilmente puede desarrollarse alguno del tipo opuesto.
Teniendo en cuenta que las macromolculas proteicas no pueden penetrar dentro de la
clula bacteriana, los microorganismos que se nutren de ellas liberan al medio exterior
enzimas que las hidrolizan transformndolas o bien en aminocidos o bien en pptidos
de bajo peso molecular. Hay dos clases de enzimas proteolticos: las endopeptidasas y
las exopeptidasas. Las primeras pueden romper la cadena polipeptdica en cualquier
punto con una misma probabilidad, en tanto que la segunda slo lo hace por los
extremos. Las exopeptidasas se subdividen en aminopeptidasas, que requieren un
grupo amino terminal y son dependientes de un ion metlico para su actividad, y las
carboxipeptidasas, que hidrolizan pptidos con un carboxilo terminal.
Los aminocidos y varios compuestos heterocclicos, productos de la hidrlisis de
sustancias nitrogenadas ms complejas, son los verdaderos sustratos del catabolismo
fermentativo de los microorganismos putrefactivos.
6.2. DEGRADACIN OXIDATIVA DE LOS AMINOCIDOS

Muchas bacterias aerbicas y anaerbicas facultativas, como las Pseudomonas y las

enterobacterias, son capaces de oxidar protenas y aminocidos en condiciones
aerobias y de utilizarlos como nica fuente de carbono, nitrgeno y energa.
La oxidacin de los aminocidos, as como la de otras sustancias nitrogenadas, suele
producir la liberacin de todo el nitrgeno en forma de amoniaco. Se conocen varios
tipos de desaminacin segn el aminocido y la especie bacteriana. En la respiracin
anaerbica como NO3- o SO42- tiene lugar procesos semejantes y en algunos casos
hay reacciones fermentativas comunes.

237

6.2.1 Aminoacidos Oxidasas

Son flavoprotenas con un potencial redox de -0.004 V que estn implicadas en la

primera etapa de oxidacin de muchos aminocidos, especialmente D-aminocidos.
En los L-aminocidos generalmente hay una reaccin de transaminacin antes de la
reaccin de liberacin de NH3-.
Las L-y D-aminocidos oxidasas catalizan la reaccin.

El iminocido se hidroliza espontneamente.

Existen -D-aminocidos oxidasa que actan sobre varios aminocidos y otras como la
glicina oxidasa que son especficas.
La sntesis de -D-aminocido oxidasas se suprime tan pronto como un segundo
sustrato energtico como glucosa o succinato se halla al alcance de la bacteria.
6.2.2 Deshidrogenasas
La glutamato deshidrogenasa y la alanina deshidrogenasa son dos enzimas ligadas al
NAD+ o al NADP+ que convierten al respectivo sustrato en cido -cetoglutrico y
pirvico y liberan NH3. El oxigeno no es esencial.

238

6.2.3. Fermentaciones de un solo Aminocido

La desaminacin de un aminocido puede ser llevada a cabo por las bacterias por
distintas formas. Existe una desaminacin por instauracin, siendo el producto final el
cido graso insaturado.

Normalmente, en anaerobios y facultativos cuando actan anaerobiamente, se lleva a

cabo una desaminacin reductora:

Los organismos que tienen hidrogenasa y que pueden utilizar el hidrgeno molecular
como reductor, manifiestan preponderadamente este tipo de desaminacin.
El compuesto resultante de la desaminacin puede ser oxidado anaerobiamente. Para
ello requiere un aceptor de electrones estable, el cual puede ser suministrado
independientemente, como en la fermentacin acoplada de aminocidos, o puede
resultar de la misma degradacin metablica del cido orgnico. Tambin puede
producirse hidrgeno. En Clostridium tetanomorphum este hidrgeno puede dar lugar a
una desaminacin reductora.
En general, la fermentacin de aminocidos produce como productos finales cidos
orgnicos, CO2, H2 y NH3.
ARGININA
Una cepa de Mycoplasma aislada de cultivos celulares contaminados ha mostrado la
propiedad de transformar rpidamente la arginina produciendo ATP. La L-arginina es
primero desaminada por una arginina-desaminasa que la convierten citrulina.

239

La ornitina-carbamoil-transferasa lleva a cabo la siguiente transformacin de la Lcitrulina con fosfato inorgnico:

La siguiente reaccin del carbamato-quinasa es la que produce ATP:

Esta reaccin a partir de la arginina ha podido ser demostrada en Pseudomonas

fluorescens (lo que permite explicar la capacidad de crecimiento anaerobio en
presencia de arginina de algunos representantes del gnero Pseudomonas), en
Halobacterium salinarium y en Clostridium botulinum. Adems, este ltimo degrada la
ornitina hasta cidos voltiles.
6.3. OXIDACIN DE LA HISTIDINA E HIDROXIPROLINA
6.3. 1. Oxidacin de la Histidina
La utilizacin de la histidina est muy extendida dentro de los microorganismos, y
existen muy pocas diferencias entre la utilizacin aerobia y la anaerobia.

240

La histidina es primero desaminada hasta cido urocnico por la histidina-amonacoliasa (1). La urocanasa (urocanato hidratasa), que presenta fotoactivacin, convierte el
cido urocnico en la imidazolona del cido propinico (2). La ruptura del anillo tiene
lugar va imidazolona propionasa, formndose formiminoglutmico (3). Una segunda
hidrolasa escinde la molcula en cido glutmico y formamida (formiminoglutamasa)
(4). El cido glutmico puede ser desaminado a -cetoglutrico y ste descarboxilado a
succnico dentro del CAT. (Figura N0 6.1).
Figura N0 6.1. Conversin de la Histidina en Acido Succinico.

Fuente: (T. Audesirk y G.Audesirk, 2003).

La formacin genera cido formico y NH3.

241

En las Pseudomonas el cido urocnico es el inductor y el cido succnico es un

inhibidor de retroaccin.

En las enterobacterias tambin es el cido urocnico el

principal inductor, pero la histidina amonaco-liasa se produce en cantidades muy

dependientes de factores ambientales y existe un sistema de control catablico
regulado por la glutamina sintetasa. En Bacillus subtilis el inductor fisiolgico es la
histidina.
Clostridium tetanomorphum convierte la histidina en butirato, acetato, CO2, NH3 y
formamida. La primera reaccin es una desaminacin por insaturacin catalizada por la
L-histidina-amonio-liasa (1) que va seguida por el sistema de la uracanato hidratasa. La
etapa siguiente desde el glutamato es an oscura, pero se supone que est ligada al
tetrahidrofolato (X). La rotura del glutamato es una desaminacin reductora.
Clostridium tetanomorphum crece muy bien sobre glutamato. Su utilizacin comprende
una desaminacion por insaturacin catalizada por la metil aspartato amonio liasa. El
cido citramlico se forma por la mesaconatohidratasa. La citramalatoliasa da lugar a
una reaccin parecida a la de la aldolasa que convierte el citramalato en acetato y
piruvato. El piruvato experimenta una descarboxilacin oxidativa que produce acetilCoA, el cual da lugar a una fermentacin butrica. Esta ltima etapa es la que produce
energa. (Figura N0 6.2).
Figura N0 6.2. Fermentacin del glutamato por Clostridium tetanomorphum.

(1) Glutamato mutasa. (2) Metil aspartatoamonioliasa. (3) Mesaconatohidratasa. (4)

Citramalatoliasa.
Fuente: (M.T. Madigan, J.M. Martinko y J. Parker., 2002).

242

6.3.2. Oxidacin de la Hidroxiprolina

La hidroxiprolina puede ser oxidada por Pseudomonas putida, P. convexa y P.

fluorescens formando -cetoglutarato. La primera reaccin es catalizada por una 2epimerasa que convierte la hidroxiprolina en D-alo-hidroxiprolina (1). El siguiente paso
es una oxigenacin que lleva a la fomacion del 1-pirrolina-4-hidroxi-2-carboxilato (2).
Este compuesto se desamina y forma -cetoglutarato. (Figura N0 6.3).
Figura N0 6.3. Oxidacin de la hidroxiprolina a -cetoglutarato.

Fuente: (J. Koolman y KH Rhm, 2004).

Los dos epmeros son inductores coordinados de todo el sistema, el cual es insensible
a la represin catablica.
6.3.3. Oxidacin de la Glicina
Las nicas bacterias anaerobias que llevan a cabo una degradacin de la glicina son
Diplococcus glycinophilus, Micrococcus anaerobius y Micrococcus variabilis, en
realidad cepas distintas de Peptococcus anaerobius:

243

Puede liberarse hidrgeno molecular.

La primera reaccin es una xido-reduccin con desprendimiento de CO2, NH3 e
hidrgeno. Requiere fosfato de piridoxal y NAD* como cofactores.

Una segunda molcula de glicina es ahora necesaria para regenerar el tetrahidrofolato,

formndose serina. En realidad, con las dos reacciones, el H4-folato se utiliza para
transferir el grupo metilo de una glicina a otra molcula de glicina para producir serina:

6.3.4. Oxidacin de la Serina

La desaminacin se lleva a cabo por una serina-deshidratasa L-especfica que puede

actuar tambin sobre la L-treonina.
La desaminacin de la serina produce piruvato:

244

El piruvato se reduce a acetato por la rotura fosforoclstica con formacin de acetil

CoA, acetil-fosfato y acetato.
6.4. OXIDACIN DEL TRIPTOFANO Y DE LA TREONINA

6.4.1. Oxidacin del Triptfano

Se distinguen varios grupos de Pseudomonas (Figura N0 6.4) segn la va degradativa
del triptfano utilizada:
Figura N0 6.4. Va degradativa del triptfano de acuerdo a los 4 grupos
representativos.

Fuente: (Pares I.F. y A. Jurez, 1997).

245

El primer grupo metaboliza el triptfano a catecol va cido antranlico. Es

representativo P. fluorescens. (Figura N0 6.5).
Figura N0 6.5. Degradacin del triptfano a cido antranilico y alanina.

Fuente: (C.K. Mathews, K.E. Van Holde y K.B. Ahern, 2002).

El cido antranlico es descarboxilado y desaminado por incorporacin de dos tomos

de oxgeno mediante una dioxoquinasa dando catecol, cuya oxidacin ya ha sido
estudiada.
El segundo grupo de Pseudomonas est representado por P. acidovorans. El D y Ltriptfano es metabolizado por sus respectivas oxigenasas estereoespecficas y la
quinurenina-formamidasa a cido D- o L-quinurnico. ste se convierte en cido 7,8dihidroxiquinurnico, mediante la quinurenato 7,8-hidroxilasa. Los productos finales de
la utilizacin de este intermediario son -cetoglutarato, oxalacetato y amonaco, pero
las etapas individuales de la va no han sido an dilucidadas. (Figura N0 6.6).

246

Figura N0 6.6. Metabolizacin del Triptfano a cido quinurnico dando

finalmente -cetoglutarato, oxalacetato y amonaco.

Fuente: (Pares I.F. y A. Jurez, 1997).

El tercer grupo llamado Aromtico racemasa, degrada el D-Triptfano, va cido

antralitico, como el primer grupo, pero tiene la triptfano racemasa que le hace capaz
de atacar a los dos ismeros
Un cuarto grupo est caracterizado por P. aeuginosa. Los metabolitos de esta va se
conocen, pero hasta el momento no se han descrito las enzimas. Es posible que la 4metilquinazolina sea ulteriormente hidroxilada para permitir el ataque dioxigenasico se

247

han identificado los intermediarios sealados a continuacin pero no se han aislado

las enzimas ni se conocen los productos finales. (Figura N0 6.7).
Figura N0 6.7. Metabolizacin del Triptfano por
desconocen los productos finales.

P. aeuginosa. An se

Fuente: (M.T. Madigan, J.M. Martinko y J. Parker., 2002).

Estas vas son caractersticas de la oxidacin del triptfano por los gneros
Pseudomonas

Flavobacterium

son

completamente

distintas

de

las

correspondientes al metabolismo del triptfano se metaboliza por la va del cido

antralico y juega un papel importante durante la esporulacin.

248

En las Pseudomonas que tienen varias posibilidades de oxidar el triptfano hay una
regulacin monocoordinada.
El Triptfano es fermentado lentamente por Clostridium sporogenes con la formacin
de cido indol propinico.
Munchas bacterias producen indol del triptfano, lo cual tiene un gran inters
taxonmico. Esto es debido a la triptofanasa, que lleva a cabo una reaccin de
desaminacin.

La prueba bioqumica que se utiliza para la demostracin del indol se basa en la

reaccin coloreada que se produce en medio cido con p-dimetilaminobenzaldehido. El
indol se extrae del cultivo en agua de peptona con un pequeo volumen de xilol,
aadindose luego el reactivo.

6.4.2. Oxidacin de la Treonina

1.- Pseudomonas.

249

2.- Arthrobacter.

3.-Pseudomonas oxalaticus.
La glicina se transforma en glioxilato el cual, despus de la serie de transformaciones
se incorpora el CAT. (Figura N0 6.8).
Figura N0 6.8. Transformacin de la glicina en glioxilato por P. oxalaticus.

(1) Glicina aminotransferasa; (2) glioxilatocarboligasa; (3) malato sintasa. Cada dos
molculas de glioxilato que se transforman en acetil- CoA permiten la entrada de una
tercera al CAT.
Fuente: (J. Koolman y KH Rhm, 2004).

250

Algunos microorganismos carecen de glioxilato carboligasa, pero disponen de una

serina glioxalato aminotransferasa, que les posibilita sintetizar piruvato a partir de
glicina:

En B. subtilis, el - amino--cetobutirato procedente de la fermentacin de la treonina

se convierte en aminocetona (Figura N0 6.9)
Figura N0 6.9. Transformacin del -amino--cetobutirato en aminocetona por B.
subtilis

(1) Aminoacetona-Carboxilasa ;(2) Aminoacetona-transferasa.

Fuente: (Atlas R.M. y R. Bartha, 2005).

4. Clostridium proponicum lleva a cabo una desaminacin de la treonina a acetobutrico por una treonina-deshhidratasa.

La etapa ulterior forma propinico por descarboxilacin oxidativa con liberacin de

hidrgeno molecular:

251

Clostridium pasteurianum utiliza una serina hidroximetiltransferasa, con lo que rompe la

treonina en glicina y acetaldehdo. El acetaldehdo es reducido posteriormente a etanol
con reoxidacin de NAD*.
Peptococcus aerogenes forma -cetobutrico que luego se reduce a butrico.
6.4.3. Oxidacin de la Lisina

Clostridium sticklandii y otros clostridios utilizan la lisina como nica fuente de carbono
en condiciones anaerobias. La primera reaccin que requiere coenzima B12 como
cofactor, cambia el grupo amino de la posicin 2 a la posicin 3, dando B-lisina; o de la
posicin 6 a la 5, dando 2,5-diaminohexanoato.
Ambos intermediarios se convierten en 3,5-diaminohexanoato que sufre una
desaminacin oxidativa, la cual forma 3-ceto-5-aminohexanoato. Esta reaccin
requiere NAD. (Figura N0 6.10).
Sigue un desdoblamiento que produce acetato -aminobutiril-CoA. La desaminacin
subsiguiente tiene lugar con formacin de butiril-CoA. Finalmente la desacilacin
produce cido butrico y un mol de ATP a partir de ADP y fosfato inorgnico.

252

Figura 6.10. Fermentacin de la lisina por los clostridios.

(1) L-Lisina, 2,3-aminomutasa. (2) -lisina mutasa. (3) 3,5-Diaminohexanoato

deshidrogenasa. (4) Enzima que hidroliza el 3-ceto-5-aminohexanoato. (5)
Desaminasa. (6) Butiril-CoA deshidrogenasa. (7) CoAtransferasa. (8) -cetotiolasa.
(9)Fosfocetolasa acetato quinasa.
Fuente: (C.K. Mathews, K.E. Van Holde y K.B. Ahern, 2002).

253

6.4.4. Oxidacin de la Ornitina

Clostridium sticklandii fermenta la onitina por una va parecida a la de la lisina. No tiene

lugar la segunda desaminacin, formndose acetato y alanina:

Clostridium botulinum tiene un sistema de fermentar la ornitina completamente

diferente, que lleva a la formacin de 5-aminovalerato. (Figura N0 6.11).
Figura N0 6.11. Fermentacion de la ornitina por Clostridium botulinum

Fuente: (Frenchel, T.G.M. y T.H. Blackburn.1998)

254

6.4.5. Oxidacin de la Cistena y Metionina

La fermentacin de la cistena por Proteus vulgaris y otras bacterias origina SH2, NH3 y
piruvato.

La metionina da metilmercaptano (CH3SH), NH3 y alfa-cetobutirato:

Tanto el SH2 como el metilmercaptano contribuyen al olor putrefacto de las protenas

en descomposicin.

Los dos cetoacidos son ulteriormente descarboxilados oxidativamente a cidos

monocarboxlicos.
6.5. FERMENTACIONES DE AMINOCIDOS

6.5.1. Reaccin de Stickland

Muchos Clostridium que crecen con hidrolizados de protenas o con mezclas de
aminocidos obtienen su energa de una reaccin de oxido+reduccin acoplada entre
dos aminocidos o entre un aminocido y un compuesto ternario.
La reaccin acoplada entre dos aminocidos se denomina reaccin de stickland y se
caracteriza porque los aminocidos por separado no se descomponen en forma

255

apreciable, en tanto que la apropiada pareja de aminocidos lo hace con gran rapidez.
Uno de los miembros es oxidado mientras que el otro es reducido.

Los aminocidos que actan como reductores pueden dividirse en tres grupos:

Aminocidos alifticos que son ms reducidos que los cetocidos (alanina,

leucina, isoleucina, norleucina y valina)

Aminocidos alifticos con el mismo grado de oxidacin que los cetocidos

(serina, treonina, cistena, metionina, arginina, citrulina y ornitina)

Otros aminocidos, generalmente menos oxidados que los cetoacidos

(histidina, fenilalanina, triptfano, tirosina, aspartato y glutamato)

256

Las bacterias que utilizan la reaccin de stickland son clostridios proteoliticos, entre los
que se encuentran:

La va oxidativa puede comprender este sistema de trasaminacin. El mecanismo de la

reaccin de Stickland se representa en las Figuras N0 6.12 y Figura N0 6.13.
Figura N0 6.12. Reaccin de Stickland

. (1) Sistema de la L-aminoacido deshidrogenasa.

(2)

Sistema de la 2-cetoacido

deshidrogenasa. Requiere lipoamida, TPP y HS CoA. Si R es un grupo metilo y R un

atomo de hidrogeno, entonces el esquema representa la fermentacin conjunta de la
glicina y de la alamanina que proporciona acetato y CO segn la siguiente
estequiometria:
Fuente: (Frioni L. 1999)

257

Figura 6.13. Fermentacin de la alanina y Glicina

Fuente: (J. Koolman y KH Rhm, 2004).

La reduccin de la prolina o de la hidroxiprolina convierte el compuesto cclico en otro

lineal sin formacin de NH.

258

6.5.2. Reaccin de Fermentacin de un Aminocido junto a un Cetocido

Clostridium propionicum usa la reaccin de Stickland para metabolizar la -alanina a

cido propionico, utilizando el piruvato como oxidante. El conjunto del sistema
degradativo se presenta en la Figura N0 6.14.
Un sistema degradativo similar se encuentra en Clostridium aminobutyricum que
convierte -aminobutrico. Como en el caso anterior tambin se produce acetato.
Figura N0 6.14. Fermentacin de la Alanina y Piruvato

Fuente: (T. Audesirk y G.Audesirk, 2003).

259

6.6. DESCARBOXILACION DE AMINOCIDOS

Cierto nmero de bacterias catalizan la descarboxilacion de algunos aminocidos

segn la reaccin:

Los aminocidos ms frecuentes descarboxilados de esta forma son la histidina, la

arginina, la omitina, la lisina, el triptfano y el glutamato. La descarboxilacin de la
lisina genera cadaverina, substancia bsica de olor muy desagradable:

La reaccin de descarboxilacin se lleva a cabo principalmente en medio relativamente

acido.
Las bases producidas tienden a elevar el pH.
Las reacciones de descarboxilacin de aminocidos han sido utilizadas por su
significacin taxonmica.
6.7. OXIDACIN DE PURINAS Y PIRIMIDINAS

La hidrlisis extracelular de cidos nucleicos injeridos ocurre a travs de las acciones

coordinadas de endonucleasas, de fosfodiesterasas y de nuclesidofosforilasas. Las
endonucleasas degradan el ADN y el ARN en los sitios internos dando lugar a la
produccin de oligonucletidos. Los oligonucletidos son posteriormente digeridos por
las fosfodiesterasas que actan desde sus extremos hacia el interior de estos,
liberando nuclesidos libres. Las bases son hidrolizadas desde los nuclesidos por la
accin de las fosforilasas que producen ribosa-1-fosfato y bases libres.

260

Si los nuclesidos y/o las bases no son reutilizadas las bases de purina se degradan
tambin a cido rico y las pirimidinas a -aminoisobutirato, NH3 y CO2.
6.8. FERMENTACIN DE PURINAS Y PIRIMIDINAS

6.8.1. Fermentacin de la Purina

La llevan a cabo un nmero limitado de especies de Clostridium y Micrococcus. C.

acidi-uruci fermenta rpidamente el cido rico, la xantina y algunas otras purinas a
NH, CO, Acetato y cantidades muy pequeas de glicocola y formiato.

Otras purinas fermentadas se convierten probablemente en xantina antes de que se

abra el anillo. Las etapas de la fermentacin se resean en la figura 6.15.

La fermentacin implica la apertura del ciclo hexagonal, seguida por la conversin del
anillo de la imidazolona en el compuesto lineal formiminoglicina. Esta ltima se
convierte en glicina, cido frmico y NH.

El cido frmico se halla bajo una forma activada unido al cido tetrahidroflico. Este
complejo se reduce y la glicina se condensa con el formaldehdo para formar serina.
Luego este aminocido es desaminado y reestructurado para formar piruvato, el cual
finalmente produce acetato y CO.

Durante la oxidacin del piruvato se genera probablemente fosfato de alta energa bajo
la forma de acetil-P, el cual producir ATP. (Figura N0 6.15).

261

Figura N0 6.15. Etapas de la Degradacin de la Xantina

Fuente: (Pares I.F. y A. Jurez, 1997).

La oxidacin purinica que ms se conoce es la del acido rico. En el gnero

Pseudomonas hay una primera etapa comn a varias especies que conduce a la
formacin del acido alantoico.

262

La primera reaccin es catalizada por la uratooxidasa y la segunda por la alantoinasa

El grupo

Pseudomonas aeruginosa, P.fluorescens y P. putida convierte el

acidoalantico en acido (-) ureidoglicolico y urea en una sola etapa con la alantoicasa.
Una segunda molcula de urea es liberada por la accin de la (-)-ureidoglicolatoliasa,
dando adems glioxilato

Pseudomonas

acidodovorans

no

tiene

alantoicasa

pero

posee

una

alantoatoaminohidrolasa que transforma el acidoalantoico en acido (+) ureidoglicolico, NH3 y CO2. Se ha postulado que en esta conversin la ureidoglicina es un
intermediario. El acido (+) ureidoatoliasa. Es la misma va utilizada por streptococus
alantoicus para la degradacin de la (+-) alantoina. (Figura N0 6.16).

263

Figura N0 6.16. Conversin de Acido alantoico en acido (+) ureido-glicolico, NH3

y CO2 por Pseudomonas acidodovorans.

Fuente: Frenchel, T.G.M. y T.H. Blackburn. 1998

En E.coli y Arthobacter alantoicus se utiliza una tercera va en la cual el cido alantoico

es transformado a (-)-ureidoglicolato con la liberacin de dos molculas de NH3 y un
mol de CO2 por la accin de la alantoamido hidrolasa. El acido (-)- ureido-glicolico se
transforma en acido glioxilico y urea como en los casos anteriores.
6.8.2 Fermentacin de la Pirimidina

Las pirimidinas son probablemente fermentadas pasando previamente a cido

orotico. La realizan cepas de Clostridium oroticum y Peptococcus aerogenes.

Clostridium oroticum fermenta el cido ortico lentamente con formacin de NH, CO

y uno o ms cidos dicarboxlicos de cuatro carbonos. En extractos libres de clulas, el
cido ortico se transforma en L- asprtico acompaado de una pequea cantidad de
2,5-carboximetilhidantona, compuesto este ltimo que se forma espontneamente por
hidratacin del cido ureido succnico (Figura N0 6.17).

264

Figura N0 6.17 Fermentacin del cido ortico por Clostridium orotium

Fuente: (Pares I.F. y A. Jurez, 1997).

Peptococcus aerogenes puede fermentar el uracilo, la citosina y la timina. En estos
ltimos dos casos se acumula uracilo. Adems se produce CO, H, acetato, lactato y
NH.

El uracilo se transforma en acido barbitrico por una reaccin monooxigenasa. La

barbiturasa hidroliza el barbitrico a urea y acido malonico. La degradacin del uracilo
ha sido estudiada en Mycobacterium

El acido malonico se convierte en acetato mas CO2. Tambin en Mycobacterium se ha

comprobado que la timina se oxida a acido 5-metilbarbiturico.

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6.9. FIJACIN DEL NITRGENO

El nitrgeno es un elemento requerido para el crecimiento por todos los sistemas
biolgicos. Aunque es extremadamente comn (80% por volumen) en la atmsfera en
forma de gas (N2) es generalmente inaccesible biolgicamente debido a su alta energa
de activacin.
En toda la naturaleza solamente las bacterias especializadas son capaces de la fijacin
de nitrgeno, convirtindolo en amonaco (NH3) que es asimilado fcilmente por todos
los organismos. Estas bacterias, por lo tanto, son muy importantes ecolgicamente y
son a menudo esenciales para la supervivencia de ecosistemas enteros. Esto es
especialmente cierto en el ocano, en donde las cyanobacterias fijadoras de nitrgeno
son menudo las nicas fuentes de nitrgeno. Tambin es muy importante en el suelo,
existiendo simbiosis especializadas entre legumbres y bacterias fijadores de nitrgeno,
imprescindibles para el crecimiento de estas plantas. (Figura N0 6.18).
La fijacin de nitrgeno se puede encontrar en casi todos los linajes bacterianos y
clases fisiolgicas pero no es una caracterstica universal. Puesto que la enzima
nitrogenasa, responsable de la fijacin de nitrgeno, es muy sensible al oxgeno que la
inhibir irreversiblemente, todos los organismos fijadores de nitrgeno deben tener un
cierto mecanismo para mantener la concentracin de oxgeno baja. Las posibilidades
incluyen:

Heterocistos en los agregados o filamentos celulares de cyanobacteria (por

ejemplo Anabaena) en donde una clula no realiza la fotosntesis sino que
solamente fija el nitrgeno para sus socias que a cambio la proveen de energa.

Ndulos en las races de las plantas (por ejemplo, Rhizobium), en donde la

planta le proporciona oxgeno a la bacteria a travs de molculas de
leghemoglobina.

Forma de vida anaerobia (por ejemplo, Clostridium pasteurianum).

Metabolismo muy rpido (por ejemplo, Azotobacter vinelandii).

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La produccin y actividad de la nitrogenasa se regula muy en detalle, tanto porque la

fijacin de nitrgeno es un proceso extremadamente costoso energticamente (se
requieren 16-24 ATPs por N2 fijado) como por la sensibilidad extrema de la nitrogenasa
al oxgeno.

Figura N 6.18. Alternativas de la Fijacin del Nitrgeno.

Fuente: (Barea, J.M.1997)

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