BLOQUE 1: BASE MOLECULAR Y FSICO-QUMICA DE LA VIDA
ACTIVIDADES SOBRE PROTENAS
ACTIVIDADES TEMA 4
1. Cules son las unidades estructurales de las protenas?
Escribe su frmula general. Cul es el carbono a? Cuntos esteroismeros tiene? Las unidades estructurales de las protenas son los aminocidos, que son compuestos orgnicos de baja masa molecular, que se caracterizan por tener un grupo amino y un grupo carboxilo .El carbono a es el que est unido al grupo amino y al grupo carboxilo a su vez. Todos a excepcin de la glicina presentan un carbono asimtrico. Esto permite diferenciar dos estereoismeros segn la conformacin espacial de la molcula. Si tienen el grupo amino a la derecha son D-aminocidos y si este se sita a la izquierda son Laminocidos. Los aminocidos proteicos son todos L-aminocidos. Los estereoismeros son imgenes especulares o enantimeros. 2. Qu significa que un aminocido es anftero? A qu es debida esa propiedad en ellos? Los aminocidos son sustancias anfteras porque en disolucin acuosa se comportan como cidos o como bases dependiendo del pH de la disolucin. Esto se debe a la presencia simultnea del grupo carboxilo y del grupo amino. En un medio neutro, los aminocidos estn ionizados formando iones dipolares. El carboxilo pierde un protn y se carga negativamente. El amino lo gana y queda con una carga positiva. En un medio cido, hay muchos protones H+ y pH es bajo. El carboxilo capta un protn, el aminocido se comporta pues como una base y queda con una carga positiva. Y en un medio bsico, hay pocos protones H+ y el pH es alto. El amino libera un protn, el aminocido se comporta como un cido y queda con una carga negativa .El pH al que un aminocido se queda neutro se denomina punto isoelctrico. 3. Un aminocido tiene un punto isoelctrico de 6,5, Qu carga presentar si el pH del medio es de 6,5? Y si es cuatro? Y si es 10? En el punto isoelctrico del aminocido tiene carga neta nula, es decir, que en este caso el aminocido a pH 6.5 tendr carga cero ya que el pH coincide con el punto isoelctrico. El comportamiento de los aminocidos en lo que respecta a su carga en funcin del pH es el siguiente: a valores de pH por debajo de su punto isoelctrico (carcter cido) el aminocido tendr carga positiva, mientras que a valores de pH por encima de su punto isoelctrico (carcter bsico) el aminocido tendr carga negativa. Por tanto, si el pH es 4, tiene carga positiva, y si el pH es 10 tiene carga negativa.
BLOQUE 1: BASE MOLECULAR Y FSICO-QUMICA DE LA VIDA
ACTIVIDADES SOBRE PROTENAS
4. Explica cmo se unen dos aminocidos, el tipo de enlace que
se forma y la direccin de dicho enlace. El enlace peptdico es el enlace que une los aminocidos para formar las protenas. Se forma entre el grupo carboxilo de un aminocido y grupo amino del siguiente liberndose una molcula de agua. Es un enlace covalente de tipo amida. Estos enlaces se rompen por hidrlisis y los pptidos y protenas se desdoblan en los aminocidos que los componen. La hidrlisis se realiza por mtodos qumicos (lcalis, cidos, etc.) o mediante enzimas proteolticos (proteasas).El enlace peptdico se estabiliza porque los tomos de C, O y N comparten pares de electrones y entonces pueden aparecer 2 formas resonantes del enlace. El enlace peptdico tiene carcter de doble enlace. Este hecho impide que se efecten torsiones o giros, alrededor del enlace peptdico, lo que hace que los tomos de C, O y N, se encuentren siempre en el mismo plano, con las mismas distancias y ngulos. Con lo cual los giros para formar los distintos tipos de estructuras se producen siempre a nivel del carbono a. Los radicales de los aminocidos quedan colocados hacia arriba y hacia abajo alternativamente. 5. Desarrolla la frmula H2N-LYS-GLU-ALA-COOH
6.
Qu tripptidos diferentes se pueden formar con
BLOQUE 1: BASE MOLECULAR Y FSICO-QUMICA DE LA VIDA
ACTIVIDADES SOBRE PROTENAS los aminocidos Ala, Ser y Gly, sin que haya ningn aminocido repetido? Ala- Ser- Gly Gly- Ser- Ala Ser- Ala-Gly Ser- Gly- Ala Ala-Gly- Ser Gly-Ala Ser Se pueden formar 6 tripptidos, cada uno diferente. 7. Define la estructura primaria de las protenas , indica que tipo de enlace la caracteriza y nombra los grupos qumicos que participan en el mismo Es la secuencia lineal de aminocidos que forma la protena. Nos indica el nmero y tipos de aminocidos que la componen y el orden en que estos se disponen. Esta estructura viene determinada genticamente pues est definida en los genes y de ella dependen los dems niveles estructurales. Podemos afirmar que no tiene entidad real pues a medida que la protena se sintetiza se va replegando adoptando estructuras superiores. Hay una extremo inicial que va a corresponder a un grupo amino, y extremo final que va a corresponder al grupo carboxilo, los enlaces son peptdicos, dnde reaccionan el grupo carboxilo de un aminocido con el grupo amino del segundo aminocido. 8. Qu enlaces mantienen la estructura secundaria en a hlice? La estructura secundaria en a-hlice, se forma al enrollarse la estructura primaria helicoidalmente sobre s misma en el sentido de las agujas del reloj. Los enlaces que mantienen la estructura secundaria en a-hlice estable son la formacin de puentes de hidrgeno entre el grupo NH, de un enlace peptdico y el grupo CO, de otro enlace peptdico que se encuentra en el cuarto aminocido que sigue la cadena lineal. 9. Describe la estructura terciaria y cuaternaria de las protenas indicando los tipos de enlaces que las estabilizan. La estructura terciaria es la disposicin que adopta en el espacio la estructura secundaria. Nos indica la configuracin tridimensional de la protena, la cual recibe el nombre de conformacin. Existen dos tipos de conformaciones: La globular y la fibrosa. La estructura terciaria se mantiene gracias a diferentes tipos de enlaces que se establecen entre los radicales de los aminocidos. Estos enlaces son: las interacciones electrostticas, los puentes de hidrgeno, las fuerzas de Van der Waals, las interacciones hidrofbica y los puentes disulfuro.
BLOQUE 1: BASE MOLECULAR Y FSICO-QUMICA DE LA VIDA
ACTIVIDADES SOBRE PROTENAS La estructura cuaternaria es la que se presenta en las protenas que estn formadas por varias subunidades o protmeros que pueden ser iguales o diferentes. Las distintas subunidades se unan entre s mediante enlaces similares a los que mantienen la estructura terciaria pero estos tienen lugar entre radicales laterales de aminocidos pertenecientes a cadenas diferentes. 10. De qu depende la actividad biolgica y la especificidad de una protena? La actividad biolgica de las protenas depende de su estructura espacial, de tal forma que si esta se altera, la protena deja de ser funcional y la especificidad se refiere a su funcin, cada una lleva a cabo una determinada funcin y lo realiza porque posee una determinada estructura primaria y una conformacin espacial propia; por lo que un cambio en la estructura de la protena puede significar una prdida de la funcin. 11. Qu enlaces se rompen cundo se somete una protena a una temperatura elevada? Cmo se denomina ese proceso? Qu repercusin tiene en la funcionalidad de la protena? Se rompen los enlaces que forman la estructura terciaria y cuaternaria y en ocasiones tambin la secundaria, la prdida de la estructura conlleva a la prdida de la funcin biolgica. Este proceso se denomina desnaturalizacin, que puede ser reversible si los factores que la producen actan con poca intensidad o durante poco tiempo, o irreversibles que se produce cuando actan los factores con mucha intensidad o durante mucho tiempo. 12. Por qu son importantes las protenas en los problemas de rechazo de rganos? Las protenas de los seres vivos son caractersticas de cada especie y en algunos casos incluso varan de unos individuos a otros. Esta especificidad es la propiedad responsable de los rechazos en transfusiones y trasplantes pues al introducir una protena de un organismo en otro esta acta como una molcula extraa y el organismo que la recibe reacciona contra ella. 13. Las protenas se pueden clasificar en holoprotenas y heteroprotenas. Cules son los constituyentes de cada uno? Las holoprotenas estn formadas exclusivamente por aminocidos, mientras que las heteroprotenas estn formadas por aminocidos y otras molculas no proteicas llamadas grupo prosttico. 14. De qu nivel estructural depende la funcin biolgica de una protena? La funcin biolgica de una protena depende de su estructura terciaria, que le confiere una conformacin espacial a la que debe su 4
BLOQUE 1: BASE MOLECULAR Y FSICO-QUMICA DE LA VIDA
ACTIVIDADES SOBRE PROTENAS funcin, cualquier cambio en su disposicin puede provocar la prdida de su actividad biolgica. 15. Indica cul de las siguientes funciones biolgicas no puede ser desempeada por una protena: constituyente de las membranas biolgicas, almacenamiento de informacin gentica, catlisis de reacciones metablicas, transporte de sustancias a travs de las membranas. La funcin biolgica que no puede ser desempeada por una protena es el almacenamiento de la informacin gentica, que la realiza los cidos nucleicos (ADN) .Las protenas desempean la regulacin gentica, a travs de las histonas, que son las protenas que estn asociadas al ADN y actan activando y desactivando los genes. 16. Qu es un grupo prosttico? Nombra algunos ejemplos Un grupo prosttico es el componente no aminoacdico que forma parte de la estructura de las heteroprotenas o protenas conjugadas, estando unido covalentemente a la apoprotena.Ejemplos de grupo prostticos son la hemocianina, que es un pigmento que al unirse a aminocidos, forma las cromoprotenas, una molcula de glcido que se une a la parte proteica formando glicoprotenas, una molcula de cido graso, que forma lipoprotenas , una molcula de cido fosfrico que forma fosfoprotenas y una molcula de cido nucleico que forma nucleoprotenas. 17. Cuando se aada un cido a la leche se corta. Qu proceso se ha producido? A qu sustancia de la leche le ha pasado? Por qu precipita? Dentro del sistema proteico de la leche tenemos las llamadas "protenas del lactosuero" que son todas solubles, las ms importantes son la alfa- lactoalbminas que es la ms abundante y la beta- lactoglobulinas que es la que gobierna el comportamiento del lactosuero.Tienen una conformacin globular en donde las cadenas polippticas tienen una distribucin uniforme de los grupos hidrofbicos, polares y los cargados al pH Natural de la leche lo cual hace que las molculas puedan plegarse intramolecular adoptando una forma esfrica en donde los grupos hidrofbicos quedan hacia adentro y los polares hacia afuera. Los grupos que estn involucrados en las asociaciones intramolecular son grupos SH y SS.La conformacin que adoptan es afectada por la fuerza inica (PH) de la leche De cualquier manera, por ms que se modifique el pH, en ningn momento estas protenas se insolubilizan, solo cambian de estado. Si se tiene la leche a pH normal pero se la comienza a calentar, provoca una desnaturalizacin de las protenas, se rompen los puentes s-s y las molculas se despliegan, con esto estoy facilitando interacciones intermoleculares sobre todo hidrofbicas. 5
BLOQUE 1: BASE MOLECULAR Y FSICO-QUMICA DE LA VIDA
ACTIVIDADES SOBRE PROTENAS Por accin del pH las casenas podran provocar la coagulacin, por accin de la temperatura podra desestabilizarlas pero no llega a coagularla. Si se desestabiliza las casenas por accin de la temperatura y luego bajo el pH, favoreciendo la asociacin intermolecular, provoca la precipitacin de las protenas.