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Artculos de Investigacin Cientfica y Tecnolgica
BIOPROSPECCION DE BACTERIAS
PRODUCTORAS DE POLIHIDROXIALCANOATOS
(PHAs) EN EL DEPARTAMENTO DE NARIO
BIOPROSPECTING OF
POLYHYDROXYALKANOATES (PHAs)
PRODUCING BACTERIA IN THE
DEPARTMENT OF NARIO
BIOPROSPECO DE BACTRIAS
PRODUTORAS DE POLIHIDROXIALCANOATOS
(PHAs), NO DEPARTAMENTO DE NARIO
IVAN DARIO OTERO-RAMREZ1, PABLO FERNNDEZ I.2
RESUMEN
Los polihidroxialcanoatos (PHAs), grnulos intracelulares acumulados por bacterias en ambientes con desbalance Carbono/Nitrgeno, Carbono/Fsforo tienen
propiedades fsico-qumicas similares a plsticos convencionales, pero son biodegradables. Sin embargo, los elevados costos de produccin de los PHAs conllevan a la bsqueda de estrategias con la menor inversin posible; por ello, en
esta investigacin se exploraron diferentes ambientes del departamento de Nario
en bsqueda de bacterias productoras de PHAs y se seleccionaron aquellas con
potencial industrial. La deteccin presuntiva de bacterias PHAs a partir de muestras de suelo y agua, se realiz utilizando Rojo Nilo, los aislamientos seleccionados se sometieron a una fermentacin Batch y el polmero obtenido se caracteriz
por cromatografa de gases y cromatografa de gases-espectrometra de masas.
Aquellos aislamientos con mayor acumulacin de polmero se caracterizaron mediante pruebas bioqumicas y la secuencia parcial del gen rRNA 16S.Finalmente,
se evalu la produccin de PHAs utilizando como sustrato aguas residuales domsticas. Se obtuvo 189 aislamientos bacterianos que produjeron desde 0,01gL-1
Correspondencia: pabfdez@gmail.com.
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hasta 5,24gL-1 del homopolimero Poli-3-hidroxibutirato o el copolmero Poli-3-hidroxibutirato-co-3-hidroxivalerato. As mismo, se recuper 0,111gL-1
de Poli-3-hidroxibutirato a partir de las aguas residuales. Desde esta perspectiva las bacterias silvestres productoras de PHAs del departamento de
Nario tienen potencial en procesos ambientales e industriales.
ABSTRACT
The polyhydroxyalkanoates (PHAs) intracellular granules accumulated by
bacterial species in environments with imbalance in Carbon/Nitrogen, Carbon/Phosphorus have similar physicochemical properties to conventional
plastics, but are biodegradable. However, the high cost of PHAs lead to
strategies of production, but with the lowest possible investment, therefore, in this study we explore different environments in Nario department
to search and selecting PHAs producing bacteria with industrial potential.
The presumptive detection of PHAs bacteria isolated from soil and water
samples were performed using the Nile Red dye, isolates selected were
subjected to batch fermentation and the polymer obtained was characterized by gas chromatography and gas chromatography-mass spectrometry.
Those isolates with increased accumulation of polymer were characterized
by biochemical tests and partial sequencing of the16SrRNAgene. Finally,
was evaluated the production of PHAs using as substrate domestic wastewater. 189 bacterial isolates were obtained, which produce from 0,01gL-1
to 5,24 gL-1 of homopolymer poly-3-hydroxybutyrate or poly-3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyvalerate. Likewise, were recovered 0,111gL-1 of Poly3-hydroxybutyrate from wastewater. From this perspective, wild bacteria
producing PHAs isolated in Department of Nario have different potential
to advance environmental and industrial processes.
RESUMO
Polihidroxialcanoatos (PHAs) so grnulos intracelulares acumulados
por bactrias em ambientes com desequilbrio de Carbono / Nitrognio,
Carbono /Fsforo, estes compostos tm propriedades fsico-qumicas
semelhantes a os plsticos convencionais, mas so biodegradveis. No
entanto, os altos custos de produo dos PHAs levam a estratgias no
processo de produo com o menor investimento possvel, portanto,
no presente estudo, foram explorados diferentes ambientes em Nario,
na procura de bactrias produtoras de PHAs com potencial de aproveitamento industrial. A deteco presuntiva de bactrias produtoras de
PHAs isoladas a partir de amostras de solo e gua foi realizada utilizando
o corante Vermelho do Nilo, os isolados selecionados foram submetidos
a uma fermentao em lotes (Batch), e o polmero obtido foi caracterizado por cromatografia em fase gasosa e espectrometria de massa-cromatografia gasosa. Os isolados com maior acmulo foram caracterizados por provas bioqumicas e pelo sequenciamento parcial do gene 16S
rRNA. Finalmente, foi avaliada a produo de PHAs usando como meio
de cultura guas residuais domesticas. Foram obtidos 189 isolamentos
bacterianos, os quais produzem desde 0,01gL-1 at 5,24gL-1 do homopolmero Poli-3-hidroxibutirato ou do copolmero Poli-3-hidroxibutirato-co-
PALABRAS CLAVES:
Suelos de Nario, Laguna de la
Cocha, Ro Pasto, Polihidroxibutirato, Polihidroxivalerato,
KEYWORDS:
Soils of Nario, Laguna de la
Cocha, Ro Pasto, Polyhydroxybutyrate, Polyhydroxyvalerate,
PALAVRAS CHAVE:
Solos de Nario, Laguna de la
Cocha, Ro Pasto, Polihidroxibutirato, Polihidroxivalerato,
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INTRODUCCIN
Los polihidroxialcanoatos (PHAs) son grnulos intracelulares que se acumulan en diferentes especies bacterianas bajo estrs nutricional generado por exceso
en una fuente de carbono y dficit de otros nutrientes
como nitrgeno, fsforo y magnesio [1]. Estos biopolmeros tienen propiedades fsicas, qumicas y mecnicas similares a los plsticos de origen petroqumico,
[2,3] por lo tanto, exhiben un amplio rango de aplicacin en la industria, la medicina, la farmacologa y la
agricultura;sin embargo, al contrario de los polmeros
convencionales como el polipropileno o el polietileno,
los PHAs se sintetizan desde recursos renovables [4,
5] son biodegradables, insolubles en agua, no txicos
y exhiben propiedades termoplsticas [6, 7].
Dentro del grupo de microorganismos productores de
PHAs se destacan algunas bacterias Gram negativas
(las ms utilizadas a escala industrial) como Wautersiaeutropha, Methylobacterium Organophyllum,
Pseudomonas Oleovoransy recombinantes de Escherichiacoli, as como tambin se reportan algunas Gram
positivas de los gneros Clostridium, Streptomyces,
Staphylococcus, Corynebacterium, Nocardia, Rhodococcus[8] y Bacillus[9, 10, 11, 12, 13].
Aunque las ventajas de los PHAs son evidentes, el costo de produccin de estos biopolmeros es elevado;1kg
de PHAs cuesta entre 3.5 a 5 euros, comparado con
1 euro por kg de polipropileno [14]. Por esta razn, en
los ltimos aos han surgido varias alternativas para
mejorar la produccin de PHAs con la menor inversin
posible; en este orden de ideas, es oportuno realizar
un screening de bacterias silvestres productoras de
PHAs, pues si bien es cierto que las concentraciones
naturales de este polmero bacteriano son significativamente bajas; se ha reportado que la microbiota de
muestras ambientales puede ser inducida para mejorar significativamente su produccin modificando el
sustrato o la estrategia de alimentacin empleada [15,
16]. Al respecto, Foster et al., [17], propone que el
estrs generado por el ambiente puede aumentar de
14 a 40 veces la produccin de PHAs.
MTODO
Muestreo
En el desarrollo de este estudio se exploraron diferentes suelos del departamento de Nario y ambientes
acuticos como la Laguna de la Cocha y el ro Pasto.
Las muestras de suelo se colectaron a 15cm de profundidad en sentido horizontal a la superficie.Los municipios muestreados fueron:El Rosario, Chachag,
El Tabln, Buesaco, Guaitarilla, Imus, Guachucal,
Cumbal, La Florida, Sandona, Iles, Tuquerres, Ospina,
Cumbal, Matituy y Pasto.
Para las muestras de ambientes acuticos,en la Laguna de la Cocha se ubicaron tres puntos de muestreo
alrededor de la corota, de cada sitio se tom un litro
de agua a 10 cm de la superficie. Por otra parte, en
el cauce principal del ro Pasto se ubicaron cinco estaciones de muestreo cuando este hace su recorrido
por la ciudad; en cada estacin se definieron parcelas
de cinco metros de longitud con un ancho determinado por el cauce del ro y se colect una muestra
compuesta, superficial hasta conformar cinco rplicas
cada una con litro y medio de agua [18, 19].
Todas las muestras se refrigeraron y se llevaron al laboratorio de Biotecnologa Microbiana de la Universidad de Nario en el menor tiempo posible.
Aislamiento presuntivo de bacterias productoras de
PHAs
De cada una de las muestras de suelo se tomaron diez
gramos,se maceraron y se re-suspendieron ennoventa mililitros de agua destilada estril. A continuacin se
15
El perfil bioqumico de los aislamientos seleccionados se estableci mediante pruebas API 50CHB. Este
procedimiento se inicio activando los aislamientos en
caldo nutritivo, despus de 24h de incubacin a 30C
se realiz la inoculacin en las galeras API como lo indica el fabricante (BIOMEREUX).Los resultados fueron
evaluados a las 24 y 48h de incubacin a 30C.
Para la caracterizacin molecular la extraccin de DNA
bacteriano se realiz con el protocolo de Rivera et al.,
[26] modificando las gravedades (g) en la centrifugacin. Para verificar la integridad del DNA se prepararon geles de agarosa al 1% [27]. Como marcador
de tamao molecular se utiliz lambda Hind III y las
condiciones de corrida fueron 60V, 73mA, 37w por 2
horas y 15 minutos. El gel fue visualizado en el fotodocumentador Benchtop 3UV Transilluminator.
La amplificacin del gen 16S rRNA se realiz con los
primers 27F 5 AGA GTT TGA TCM TGG CTC AG 3
[28] y 1041R 5 CGG TGT GTA CAA GAC CC 3 [29]
los cuales amplifican un fragmento aproximado de
1500 pb. El volumen de PCR por reaccin fue de 50
16
Tratamiento estadstico
Para establecer si existen diferencias estadsticamente significativas en la cantidad de bacterias totales y
acumuladoras de PHAs presentes en los ambientes
muestreados; as como en la produccin de PHAs por
los aislados seleccionados se aplic la prueba no paramtrica de Kruskal Wallis.
RESULTADOS
Al analizar la cantidad de bacterias productoras de
PHAs presentes en las muestras analizadas se encontraron diferencias estadsticamente significativas con
un p<0,001. Se diferenciaron un total de 189 aislamientos bacterianos detectados como positivos para
la acumulacin de PHAsal emitir fluorescencias naranja o rosada cuando se exponan las placas de petri
a luz ultravioleta. De estos aislamientos el 71% (134)
fueron obtenidos de los diferentes suelos del departamento de Nario, el 6% (11) de la Lagua de la Cocha
y el 23% (44) del ro Pasto. El 51% (96) corresponden
a bacterias Gram negativas, el 49% (93) a bacterias
Gram positivas y con respecto a la morfologa microscpica se encontraron Bacilos, cocos, estafilococos,
diplococos, cocobacilos y bacterias filamentosas.
Al evaluar la acumulacin de PHAs por los aislamientos obtenidos se encontr que existen diferencias estadsticamente significativas con un p valor =
0,0015 en la produccin del biopolmero. La cantidad
de polmero recuperada fue de 0,01 g L-1 a 0,88 g L-1
en muestras de suelo y desde 0,88 g L-1 hasta 5,24 g
L-1 en muestras provenientes de ambientes acuticos
(Laguna de la Cocha y ro Pasto). As mismo, los anlisis por cromatografa de gases indican que el 83% de
las muestras evaluadas forman un pico con tiempo de
retencin similar al ster de metilo 3-hidroxibutirato y
el 17% de las muestras forman dos picos con tiempo
de retencin similares a los ster de metilo 3-hidroxibutirato: 3-hidroxivalerato. (Figura1a y 1b).
Posteriormente, mediante anlisis de cromatografa
de gases acoplado a espectrometra de masas (GCMS) se identific que los PHAs sintetizados por los
aislamientos evaluados son: 3 metil hidroxibutirato y
el copolmero 3 metilhidroxibutirato co- 3 metil hidroxivalerato (Figura 1c y 1d). Por lo tanto, se seleccionaron el aislamiento FBL2 como mejor productor
del copolmero P(3HB-co-3HV) y elaislamiento E1M10
RP como mejor productor del homopolimero P(3HB).
17
18
CONCLUSIONES
A partir de la microbiota silvestre presente en diferentes ambientes del Departamento de Nario se logr
obtener biopolmeros de inters industrial como el
poli-3-hidroxibutirato (hasta 5,24 g L-1) y el copolmero poli-3-hidroxibutirato : poli-3-hidroxivalerato (hasta
0,3 g L-1).
Algunas de las bacterias silvestres productoras de
PHAs del departamento de Nario fueronBacillus
mycoides FLB 2 y Bacillus subtilis E1M10 RP reportadas como microorganismos potencial en la produccin industrial de este biopolmero.
Es posible obtener polihidroxibutirato a partir de aguas
residuales y utilizando bacterias silvestres del departamento de Nario.
AGRADECIMIENTOS
A Edith Mariela Burbano Ph.D. docente programa de
Biologa, Universidad de Nario, por su apoyo y asesora especialmente en los mtodos moleculares.
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